2D82A

Target structure-based discovery of small molecules that block human p53 and creb binding protein (cbp) association
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSHMRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Target structure-based discovery of small molecules that block human p53 and CREB binding protein association
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 29
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2005-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2d82A00
5EPSA 3DAIA 5LKTA 4NYWA 4LC2A 3S91A 5IIDA 4MEQA 5DFCA 4A9MA 5BT3A 3U5LA 2RFJA 5D25A 4BW3A 5I7XA 5C89A 4J1PA 2L5EA 4J3IA 2RI7A 5CRMA 5FB0A 3TLPA 5ENEA 4HBVA 4YY4A 4MR5A 5EVAA 4O74A 5TCMA 4LR6A 5EWCA 5E7DA 4J0SA 4N3WA 4LDFA 5ENBA 5FE6A 3JVMA 4HBWA 4NYXA 3U5PA 4NUEA 5D3LA 5EGUA 5EP7A 5FE1A 1JM4B 4QSPA 2DATA 3SVGA 5C4QA 5EWVA 3Q2FA 4TS8A 5HRVA 4N4IA 4A9EA 5DY7A 4NR4A 3SVHA 5F61A 4CUTA 4BW4A 5FBXA 4QR3A 5EK9A 4DONA 5ACYA 5TB6A 4LYIA 3UVWA 5A85A 4QSXA 2RS9B 5DYUA 5EICA 5CQTA 5E73A 4WHWA 5I86A 5FE2A 5EISA 4YYIA 5A5SA 5H1VA 4CFLA 5CPEA 5FE7A 4HXOA 3HMFA 4N4FA 5A7CA 4QEVA 5EWHA 3P1EA 2YDWA 5DW1A 4HBXA 3O37A 2WP2A 2RO1A 3P5OA 2N9GA 4YK0A 5K29A 4XY9A 5E9KA 5JWMA 5EWWA 5A5RA 4YYDA 4PTBA 5E9YA 5CQ8A 4UYFA 4NUCA 2D82A 5EPRA 4QNSA 3QZSA 3K2JA 5ENHA 4ALGA 5KTXA 5HCLA 4O76A 5II2A 5CY9A 5E9MA 5DLZA 5FH8A 5ETBA 4XYAA 3Q2EA 4UYFB 5FE8A 5HRXA 4BJXA 3O33A 5DYCA 4TU6A 5A5NA 3RCWA 5D3RA 5DBMA 3D7CA 2DVQA 4GPJA 4UIZA 5F36A 5A5PA 3I3JA 5F25A 5L8TA 5LKZA 5EA1A 4BHWA 4UIWA 3U5MA 5KO4A 4PKLA 5BT5A 2YYNA 5ENCA 5EQ1A 4YATA 4O7FA 5IGNA 4TTEA 3MULA 4A9NA 4AKNA 4YY6A 4Z1QA 3MXFA 5DLXA 4YYKA 5CP5A 4ZQLA 5E9LA 5C8GA 4O7BA 1X0JA 4NR8A 5CUBA 5EM3A 4MR3A 4PY6A 1WUMA 4YABA 5FFWA 2YEMA 5LUUA 2OUOA 4TT4A 5A5OA 5CQ4A 4ALHA 3U5OA 4YYHA 5D3TA 5E74A 2RNYA 4O7AA 1WUGA 3QZTA 5KTUA 2YEKA 5E0RA 4QSTA 4A9LA 5I83A 2RNXA 4YYMA 3P1FA 5L8UA 4XUAA 5AD3A 5F60A 4O78A 5H1UA 5FH6A 5LJ1A 5LKUA 4O7CA 4UIVA 4XY8A 5D3JA 2L85A 5F62A 5DYAA 3LQJA 5FFYA 4UYGA 5J0DA 5I1QA 5HENA 5CZGA 5E3DA 5HJCA 5EPBA 5DFDA 4ZW1A 5AMFA 5HQ5A 5A81A 3UV4A 3ZYUA 2OO1A 4QYLA 5FDZA 4QSRA 5BT4A 4QZSA 4O71A 4F3IA 5CQAA 5I89A 4RVRA 3FKMX 2E7NA 4IR6A 4KV1A 3QZVA 5D26A 4TT6A 5L96A 3JVLA 5DX4A 3ONIA 4A9HA 4NS5A 4Z6IA 4Q0OA 4UYDA 5ENFA 4YYGA 2I8NA 5D3SA 1EQFA 4QY4A 5LJ2A 3S92A 2OSSA 3HMEA 5DKDA 3P1CA 4OUFA 3SVFA 4QSVA 5IBNA 4QUTA 1JSPB 4QBMA 4Y03A 4NR9A 4IORA 5L99A 5F2PA 4YBSA 4QYDA 5AD2A 2DWWA 3MB3A 5CQ3A 5ENJA 4QSQA 4XUBA 4Z93A 5DYXA 4YBMA 4CLBA 5CQ7A 5I29A 5I80A 4IR3A 5FE9A 2H60A 5FB1A 5CTLA 5H1TA 4NR5A 5AMEA 5FE4A 4PCIA 5DFBA 3UVYA 5EI4A 5KHMA 4A9JA 3LQIA 4HXNA 4QUUA 5IGKA 5IGLA 5HLSA 3AADA 4YBTA 4X2IA 5L98A 5HEMA 4HXMA 4ZC9A 5HQ6A 5CS8A 5FG6A 4YYJA 4FLPA 5FE0A 2E3KA 3U5NA 5COIA 2WP1A 3NXBA 3O36A 4NR7A 5D7XA 4CUUA 4NR6A 5CUCA 4NQNA 4WIVA 4QSWA 3AQAA 4O70A 4TQNA 5EWDA 4YC9A 5D3HA 2G4AA 4TZ8A 4UITA 2GRCA 2R10A 3UVDA 2E7OA 5F63A 5A5QA 3DWYA 4QEWA 4HXSA 5DW2A 5D3PA 5FH7A 4E96A 4BW2A 4CUPA 5FE5A 4YAXA 5CUEA 5F5ZA 4MEOA 5ENGA 2F6NA 4Q0NA 5HFRA 2DVVA 2F6JA 4C67A 3UV5A 4O7EA 5F1HA 4BW1A 2R0VA 4IR5A 4YYNA 5CGPA 3LJWA 5F1LA 1E6IA 3HMHA 5FFVA 5C87A 4UYEA 5EV9A 5CQ5A 4UIXA 4O72A 2L84A 4LZRA 4IOOA 3UW9A 5HQ7A 4HXKA 5D3NA 5HELA 4MENA 4IOQA 4NRCA 3MQMA 5ENIA 1F68A 4PS5A 2NXBA 3O35A 4C66A 4LRGA 5A82A 4CUSA 4LYSA 5LVRA 5FG5A 4PCEA 4TZ2A 5LKXA 4NYVA 2YELA 4CFKA 4O77A 4N4GA 3O34A 4MEPA 4NXJA 4TU4A 3GG3A 2KTBB 5ETDA 2R0SA 4QSSA 4Z1SA 3UVXA 5CUAA 4A9FA 5I88A 4MR4A 4NRBA 4YADA 5E3GA 4IR4A 3IU5A 5CUDA 4OGIA 3LXJA 2DVRA 4QR5A 4OGJA 2MJVB 3G0LA 2DKWA 4HXRA 3LQHA 2YQDA 4HXPA 3JVKA 5FE3A 5HRWA 4NQMA 5D24A 5II1A 3MUKA 2DVSA 5CU8A 2LSPB 2FSAA 5HFQA 5L97A 2D9EA 4NRAA 2I7KA 1N72A 4J0RA 4QEUA 5LVQA 5EU1A 4KV4A 5I7YA 5G4RA 5IG6A 4UIYA 4MR6A 5CUGA 4YH4A 4CURA 4O75A 3JVJA 5D0CA 4QSUA 4QC3A 4WHUA 4CUQA 4N4HA 5KU3A 4NUDA 4KCXA 3P1DA 5C7NA 5CFWA 5I40A 3MB4A 3U5KA 4QR4A 5A83A 2R0YA 5E9VA 4HBYA 4A9KA 4QC1A 5HM0A 5KTWA 4HXLA 4TT2A 5CRZA 5FG4A 4TYLA 4Z6HA 5JI8A 1ZS5A 5C85A 5DKHA 4A9IA 4CL9A 4A9OA 4UYHA 4LYWA 3UV2A 4YH3A 5DKCA 4QB3A 2YW5A 4LZ2A 3IU6A 5H85A 5IGMA 4LZSA 4UIUA 2RNWA 3U5JA 5CQ6A 5G4SA 3G0JA 5LJ0A 5F3AA 5E9IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EPSA 3DAIA 5LKTA 4NYWA 4LC2A 3S91A 5IIDA 3VKHA 4MEQA 5DFCA 4A9MA 5BT3A 3U5LA 2RFJA 5D25A 4BW3A 5I7XA 5C89A 4J1PA 2L5EA 4J3IA 2RI7A 5CRMA 5FB0A 3TLPA 5ENEA 4HBVA 4YY4A 4MR5A 5EVAA 4O74A 5TCMA 4LR6A 5EWCA 5E7DA 4J0SA 4N3WA 4LDFA 5ENBA 5FE6A 3JVMA 4HBWA 4NYXA 3U5PA 4NUEA 5D3LA 5EGUA 5EP7A 5FE1A 1JM4B 4QSPA 2DATA 3SVGA 5C4QA 5EWVA 3Q2FA 2EJNA 4TS8A 5HRVA 4N4IA 4A9EA 5DY7A 4NR4A 3SVHA 5F61A 4CUTA 4BW4A 5FBXA 4QR3A 5EK9A 4DONA 5ACYA 5TB6A 4LYIA 3UVWA 5A85A 4QSXA 2RS9B 5DYUA 5EICA 5CQTA 5E73A 4WHWA 5I86A 5FE2A 5EISA 4YYIA 5A5SA 5H1VA 4CFLA 5CPEA 5FE7A 4HXOA 3HMFA 4N4FA 5A7CA 4QEVA 5EWHA 3P1EA 2YDWA 5DW1A 4HBXA 3O37A 2WP2A 4AKGA 2RO1A 3P5OA 2N9GA 4YK0A 5K29A 4AKIA 4XY9A 5E9KA 5JWMA 5EWWA 5A5RA 4YYDA 4PTBA 5E9YA 5CQ8A 4UYFA 4NUCA 2D82A 5EPRA 4QNSA 3QZSA 3K2JA 5ENHA 4ALGA 5KTXA 5HCLA 4O76A 5II2A 5CY9A 5E9MA 5DLZA 5FH8A 5ETBA 4XYAA 3Q2EA 4UYFB 5FE8A 5HRXA 4BJXA 3O33A 5DYCA 4TU6A 5A5NA 3RCWA 5D3RA 5DBMA 3D7CA 2DVQA 4GPJA 4UIZA 5F36A 5A5PA 3I3JA 3D1DA 5F25A 5L8TA 5LKZA 5EA1A 4BHWA 4UIWA 3U5MA 5KO4A 4PKLA 5BT5A 2YYNA 5ENCA 5EQ1A 4YATA 4O7FA 5IGNA 4TTEA 3MULA 4A9NA 4AKNA 4YY6A 3ERRA 3MXFA 4Z1QA 5DLXA 4YYKA 5CP5A 4ZQLA 5E9LA 5C8GA 4O7BA 1X0JA 4NR8A 5CUBA 5EM3A 4MR3A 4PY6A 1WUMA 4YABA 5FFWA 2YEMA 5LUUA 2OUOA 4TT4A 5A5OA 5CQ4A 4ALHA 3U5OA 4YYHA 5D3TA 5E74A 2RNYA 4O7AA 1WUGA 3QZTA 5KTUA 3VKGA 2YEKA 5E0RA 4QSTA 4A9LA 5I83A 2RNXA 4YYMA 3P1FA 1ZKRA 5L8UA 4XUAA 5AD3A 5F60A 4O78A 5H1UA 5FH6A 5LJ1A 5LKUA 4O7CA 4UIVA 4XY8A 5D3JA 2L85A 5F62A 5DYAA 3LQJA 5FFYA 4UYGA 5J0DA 5I1QA 5HENA 5CZGA 5E3DA 5HJCA 5EPBA 5DFDA 4ZW1A 5AMFA 5HQ5A 5A81A 3UV4A 3ZYUA 2OO1A 4QYLA 5FDZA 4QSRA 5BT4A 4QZSA 4O71A 4F3IA 5CQAA 5I89A 4RVRA 3FKMX 2E7NA 4IR6A 4KV1A 3QZVA 5D26A 4TT6A 5L96A 3JVLA 5DX4A 3ONIA 4A9HA 4NS5A 4Z6IA 4Q0OA 4UYDA 5ENFA 4YYGA 2I8NA 5D3SA 1EQFA 4QY4A 5LJ2A 3S92A 2OSSA 3HMEA 5DKDA 3P1CA 4OUFA 3SVFA 4QSVA 5IBNA 4QUTA 1JSPB 4QBMA 4Y03A 4NR9A 4IORA 5L99A 5F2PA 4YBSA 4QYDA 5AD2A 2DWWA 3MB3A 5CQ3A 5ENJA 4QSQA 4XUBA 4Z93A 5DYXA 4YBMA 4CLBA 5CQ7A 5I29A 5I80A 4IR3A 5FE9A 2H60A 5FB1A 5CTLA 5H1TA 4NR5A 5AMEA 5FE4A 4PCIA 5DFBA 3UVYA 5EI4A 5KHMA 4A9JA 3LQIA 4HXNA 4QUUA 5IGKA 5IGLA 5HLSA 3AADA 4YBTA 4X2IA 5L98A 5HEMA 4HXMA 4ZC9A 5HQ6A 5CS8A 5FG6A 4YYJA 4FLPA 5FE0A 2E3KA 3U5NA 5COIA 2WP1A 3NXBA 3O36A 4NR7A 5D7XA 4CUUA 4NR6A 5CUCA 4NQNA 4AI6A 4WIVA 4QSWA 3AQAA 4O70A 4TQNA 5EWDA 4YC9A 5D3HA 2G4AA 4TZ8A 4UITA 2GRCA 2R10A 3UVDA 4AKHA 2E7OA 5F63A 5A5QA 3DWYA 4QEWA 4HXSA 5DW2A 5D3PA 5FH7A 4E96A 4BW2A 4CUPA 5FE5A 4YAXA 5CUEA 5F5ZA 4MEOA 5ENGA 2F6NA 4Q0NA 5HFRA 2DVVA 2F6JA 4C67A 3UV5A 4O7EA 5F1HA 4BW1A 3D1BA 2R0VA 4IR5A 4YYNA 5CGPA 3LJWA 5F1LA 1E6IA 3HMHA 5FFVA 5C87A 4UYEA 5EV9A 5CQ5A 4UIXA 4O72A 2L84A 4LZRA 4IOOA 3UW9A 5HQ7A 4HXKA 5D3NA 5HELA 4MENA 4IOQA 4NRCA 3MQMA 5ENIA 1F68A 4PS5A 2NXBA 3O35A 4C66A 4LRGA 5A82A 4CUSA 4LYSA 5LVRA 5FG5A 4PCEA 4TZ2A 5LKXA 4NYVA 2YELA 4CFKA 4O77A 4N4GA 3O34A 4MEPA 4NXJA 4TU4A 3GG3A 2KTBB 5ETDA 2R0SA 4QSSA 4Z1SA 3UVXA 5CUAA 4A9FA 5I88A 4MR4A 4NRBA 4YADA 5E3GA 4IR4A 3IU5A 5CUDA 4OGIA 3LXJA 2DVRA 4QR5A 4OGJA 2MJVB 3G0LA 2DKWA 4HXRA 3LQHA 2YQDA 4HXPA 3JVKA 5FE3A 5HRWA 4NQMA 5D24A 5II1A 3MUKA 2DVSA 5CU8A 2LSPB 2FSAA 5HFQA 5L97A 2D9EA 4NRAA 2I7KA 1N72A 4J0RA 4QEUA 5LVQA 5EU1A 4KV4A 5I7YA 5G4RA 5IG6A 4UIYA 4MR6A 5CUGA 4YH4A 4CURA 4O75A 3JVJA 5D0CA 4QSUA 4QC3A 4WHUA 4CUQA 4N4HA 5KU3A 4NUDA 4KCXA 3P1DA 5C7NA 5CFWA 5I40A 3MB4A 3U5KA 4QR4A 5A83A 2R0YA 5E9VA 4HBYA 4A9KA 4QC1A 5HM0A 5KTWA 4HXLA 4TT2A 5CRZA 5FG4A 4TYLA 4Z6HA 5JI8A 1ZS5A 5C85A 5DKHA 1PUOA 4A9IA 4CL9A 4A9OA 4UYHA 4LYWA 3UV2A 4YH3A 5DKCA 4QB3A 2YW5A 4LZ2A 3IU6A 5H85A 5IGMA 4LZSA 4UIUA 2RNWA 3U5JA 5CQ6A 5G4SA 3G0JA 5LJ0A 5F3AA 5E9IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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