2E7NA

Solution structure of the second bromodomain from human bromodomain-containing protein 3
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
GSSGSSGGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Dna binding protein
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
publication title Solution structure of the second Bromodomain from human Bromodomain-containing protein 3
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 28
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2e7nA00
2R0SA 2YQDA 4UIXA 4UIVA 5I80A 5CRZA 4DONA 2DVQA 4HXPA 5IGLA 5FE8A 3DWYA 4O71A 5CQ5A 2YEKA 4QR4A 5CQ3A 4UIWA 5ENFA 5IGMA 4UIUA 5HELA 2RNYA 4F3IA 4CL9A 4O7CA 5DLXA 5D3SA 4J0RA 4N4IA 5F60A 5CQTA 4MR5A 4WIVA 4CLBA 5I86A 3JVKA 4CUUA 5FDZA 3IU5A 5I1QA 4NR7A 4OGJA 5FH7A 5EVAA 5H1UA 4NQMA 2YW5A 3S92A 5F25A 2L5EA 4KV1A 5E9KA 5ACYA 2L85A 4NRCA 4NR9A 4UIZA 5A5SA 4YABA 5LKTA 4QEUA 4CUPA 3LJWA 3AQAA 4N4FA 5EP7A 5FE5A 3HMFA 4HBVA 4NUCA 5LJ0A 5KTWA 3HMHA 4IOQA 3I3JA 2LSPB 2I7KA 5II2A 4UYGA 5F2PA 3P1EA 5FG5A 5FE1A 4LZ2A 4O7EA 2WP2A 4QB3A 2RFJA 5HRVA 2YEMA 4XUBA 4J1PA 4HXMA 4FLPA 3QZVA 5DKHA 5CUCA 4QYLA 2RI7A 4C67A 4BW1A 5CQ8A 5I7YA 4NYVA 5D26A 4Q0NA 3O37A 5CUGA 5I83A 5IIDA 5FE3A 4E96A 5HRWA 5TB6A 5DLZA 5F1LA 5D3LA 4Z1SA 3O35A 4YBMA 4CUQA 4NRAA 5LKXA 1JSPB 3MB3A 4PTBA 4QZSA 5DYUA 3P5OA 5F5ZA 4HBYA 5L8TA 4NR4A 3RCWA 2F6NA 5ENEA 3LQIA 4YYMA 5A5RA 2DATA 4NUDA 5FE7A 2RNXA 3UVXA 4IR5A 3HMEA 5DKDA 4NUEA 2R0YA 4N4GA 4QEVA 5KHMA 2YYNA 3O36A 4XUAA 2OO1A 4MR3A 5ENJA 5E9MA 3QZSA 5CUAA 4OGIA 5L98A 4OUFA 5AMEA 4QSRA 5DFCA 5EQ1A 2H60A 4IOOA 4Z1QA 4HXSA 5EK9A 5CRMA 5FG4A 5FFVA 5J0DA 2RNWA 4A9MA 1N72A 4O75A 5A82A 4QEWA 4A9KA 5DY7A 4MEOA 3LXJA 5E9VA 5LVQA 4QSSA 5CFWA 4A9LA 3O34A 5E9LA 2DVVA 4J3IA 5EM3A 5L97A 2WP1A 4CUTA 4LDFA 2D9EA 4O74A 5CZGA 5D3NA 5D3TA 5A85A 3UV5A 4A9IA 4YYHA 5A5OA 2YELA 4X2IA 4C66A 5F63A 4IR6A 5IGKA 3UVDA 4PKLA 4TTEA 5HQ5A 4QR5A 4HXNA 5EPSA 5JI8A 5LUUA 5I40A 4BW3A 2OSSA 2MJVB 4IORA 5CTLA 4YBSA 4NXJA 4BW2A 4NRBA 5DYXA 5D7XA 4TT4A 4O77A 2YDWA 3FKMX 4XY8A 3UVYA 4YC9A 4YY4A 4IR3A 4YYKA 5I7XA 4TZ2A 5EWWA 5IGNA 5DYCA 5DW1A 2FSAA 4A9HA 5IG6A 3SVFA 4KV4A 4YBTA 5CP5A 4YYNA 2GRCA 5CQ4A 5CQ6A 3K2JA 3S91A 4CFLA 4HXRA 5F1HA 5F62A 2I8NA 4QYDA 4WHWA 2D82A 4MENA 4CUSA 4O7FA 4UYDA 2NXBA 5F61A 5LVRA 5AMFA 4WHUA 5H1VA 5LJ1A 3MB4A 3ONIA 4TU4A 4HXLA 4MR4A 4UIYA 4N3WA 4YAXA 4PY6A 5CUBA 4QSUA 5EI4A 4TT2A 2F6JA 4AKNA 5H1TA 4YH4A 4YYIA 4TQNA 3AADA 4LZSA 5I89A 4QSVA 5EWDA 5E73A 4HXKA 5D25A 4BHWA 3LQHA 4NQNA 5ENGA 5DX4A 5HFQA 5HM0A 5G4RA 4O70A 3MULA 4A9JA 1E6IA 5A5NA 4YYJA 1ZS5A 3D7CA 3QZTA 4UYEA 5II1A 4GPJA 5CQ7A 4NS5A 4NR6A 4TU6A 5A81A 3TLPA 5CPEA 5CU8A 4Y03A 5D3JA 5LKZA 5ETBA 3G0LA 3UW9A 5EPBA 3ZYUA 4LRGA 2N9GA 5HQ7A 4XYAA 1X0JA 5FE4A 5FB0A 4CURA 3MUKA 4PCEA 4N4HA 4QY4A 5EA1A 4O78A 5D3HA 4TYLA 5C8GA 4NR8A 4UITA 5DFDA 5L96A 5EV9A 5HRXA 5LKUA 1WUGA 5ENBA 4A9NA 1JM4B 3U5NA 5FE0A 4LR6A 5HENA 4QSTA 2DVRA 5D0CA 2DWWA 5D24A 4UYFA 3DAIA 5L99A 4QSPA 5JWMA 4Q0OA 3U5OA 3LQJA 5C89A 3JVMA 5L8UA 4XY9A 4TT6A 3NXBA 5CGPA 4QR3A 5E74A 5TCMA 5ENCA 5DYAA 5BT4A 4LC2A 2E7NA 5H85A 5E7DA 3U5MA 5A83A 3Q2EA 5A7CA 2E3KA 2R10A 4LYSA 4QSWA 4QNSA 5FH6A 4YADA 2RS9B 5K29A 4HXOA 5HCLA 1WUMA 5KU3A 4HBWA 3MXFA 5I29A 5CUDA 5FFYA 5C85A 4J0SA 4Z93A 4Z6IA 5I88A 3JVJA 5EPRA 4KCXA 4YYGA 2OUOA 4UYHA 4Z6HA 5HLSA 2G4AA 4HBXA 1F68A 5FH8A 4MEPA 4PCIA 4LYWA 4TS8A 5E0RA 5EWCA 5KTXA 2DVSA 1EQFA 4YY6A 5C87A 5FB1A 3UVWA 5EGUA 5E3DA 5A5QA 2L84A 4ALHA 5DBMA 5E9YA 5FBXA 5BT3A 4NYXA 4QSQA 5C4QA 4MR6A 5KTUA 3G0JA 3IU6A 4UYFB 5FE2A 5DKCA 5F3AA 5EWVA 4O7AA 5DFBA 2KTBB 5EICA 5FE9A 3U5LA 4PS5A 4YK0A 5CQAA 5C7NA 3U5KA 4NR5A 4CFKA 5KO4A 5CY9A 4BJXA 3UV2A 3Q2FA 4ZW1A 5BT5A 5IBNA 3SVHA 4O76A 5FG6A 5A5PA 5LJ2A 5DW2A 5ETDA 5HFRA 4QUTA 4O72A 5EU1A 5AD2A 4YATA 3U5JA 5HQ6A 5D3PA 5COIA 4YH3A 4IR4A 4LZRA 4YYDA 4LYIA 2R0VA 4A9FA 3MQMA 5ENIA 4BW4A 5E9IA 5AD3A 4NYWA 3SVGA 3P1DA 3U5PA 4A9OA 2DKWA 5FFWA 4O7BA 5HJCA 4QBMA 4A9EA 4QUUA 5EWHA 3JVLA 4ALGA 2E7OA 2RO1A 4ZQLA 5ENHA 3GG3A 5CS8A 4QC1A 5CUEA 5F36A 5E3GA 5HEMA 5EISA 4ZC9A 4MEQA 5G4SA 5D3RA 4QSXA 3P1FA 4TZ8A 4QC3A 3UV4A 3O33A 5FE6A 3P1CA 4RVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R0SA 2YQDA 4UIXA 4UIVA 5I80A 5CRZA 4DONA 2DVQA 4HXPA 5IGLA 5FE8A 3DWYA 4O71A 5CQ5A 2YEKA 4QR4A 5CQ3A 4UIWA 5ENFA 5IGMA 4UIUA 5HELA 2RNYA 4F3IA 4CL9A 4O7CA 5DLXA 5D3SA 4J0RA 4N4IA 5F60A 5CQTA 4MR5A 4WIVA 4CLBA 5I86A 3JVKA 4CUUA 5FDZA 3IU5A 5I1QA 4NR7A 4OGJA 5FH7A 5EVAA 5H1UA 4NQMA 2YW5A 3S92A 5F25A 2L5EA 4KV1A 5E9KA 5ACYA 2L85A 4NRCA 4NR9A 4UIZA 5A5SA 4YABA 5LKTA 4QEUA 4CUPA 3LJWA 3AQAA 4N4FA 5EP7A 5FE5A 3HMFA 4HBVA 4NUCA 5LJ0A 5KTWA 3HMHA 4IOQA 3I3JA 2LSPB 2I7KA 3D1DA 5II2A 4UYGA 5F2PA 3P1EA 5FG5A 5FE1A 4LZ2A 4O7EA 3ERRA 2WP2A 4QB3A 2RFJA 5HRVA 2YEMA 4XUBA 4AKHA 4J1PA 4HXMA 4FLPA 3QZVA 5DKHA 5CUCA 4QYLA 2RI7A 4C67A 4BW1A 5CQ8A 5I7YA 4NYVA 5D26A 4Q0NA 3O37A 5CUGA 5I83A 5IIDA 5FE3A 4E96A 5HRWA 1ZKRA 5TB6A 5DLZA 5F1LA 5D3LA 4Z1SA 3O35A 4YBMA 4CUQA 4NRAA 5LKXA 1JSPB 3MB3A 4PTBA 4QZSA 5DYUA 3P5OA 5F5ZA 4HBYA 5L8TA 4NR4A 3RCWA 2F6NA 5ENEA 3LQIA 4YYMA 5A5RA 2DATA 4NUDA 5FE7A 2RNXA 3UVXA 4IR5A 3HMEA 5DKDA 4NUEA 2R0YA 4N4GA 4QEVA 5KHMA 2YYNA 3O36A 4XUAA 2OO1A 4MR3A 5ENJA 5E9MA 3QZSA 5CUAA 4OGIA 5L98A 4OUFA 5AMEA 3VKGA 4QSRA 5DFCA 5EQ1A 2H60A 4IOOA 4Z1QA 4HXSA 5EK9A 5CRMA 5FG4A 5FFVA 5J0DA 2RNWA 4A9MA 1N72A 4O75A 5A82A 4QEWA 4A9KA 5DY7A 4MEOA 3LXJA 5E9VA 5LVQA 4QSSA 5CFWA 4A9LA 3O34A 5E9LA 2DVVA 4J3IA 5EM3A 5L97A 2WP1A 3D1BA 4CUTA 4LDFA 2D9EA 4O74A 5CZGA 5D3NA 5D3TA 5A85A 3UV5A 4A9IA 4YYHA 5A5OA 2YELA 4X2IA 4C66A 5F63A 4IR6A 5IGKA 3UVDA 4PKLA 4TTEA 5HQ5A 4QR5A 4HXNA 5EPSA 5JI8A 5LUUA 5I40A 4BW3A 2OSSA 2MJVB 4IORA 5CTLA 4YBSA 4NXJA 4BW2A 4NRBA 5DYXA 5D7XA 4TT4A 4O77A 2YDWA 4AKIA 3FKMX 4XY8A 3UVYA 4YC9A 4YY4A 4IR3A 4YYKA 5I7XA 4TZ2A 5EWWA 5IGNA 5DYCA 5DW1A 2FSAA 4A9HA 5IG6A 3SVFA 4KV4A 4YBTA 5CP5A 4YYNA 2GRCA 5CQ4A 5CQ6A 3K2JA 3S91A 4CFLA 4HXRA 5F1HA 5F62A 2I8NA 4QYDA 4WHWA 2D82A 4MENA 2EJNA 4CUSA 4O7FA 4UYDA 2NXBA 5F61A 5LVRA 5AMFA 4WHUA 5H1VA 5LJ1A 3MB4A 3ONIA 4TU4A 4HXLA 4MR4A 4UIYA 4N3WA 4YAXA 4PY6A 5CUBA 4QSUA 5EI4A 4TT2A 2F6JA 4AKNA 5H1TA 4YH4A 4YYIA 4TQNA 3AADA 4LZSA 5I89A 4QSVA 5EWDA 5E73A 4HXKA 5D25A 4BHWA 3LQHA 4NQNA 5ENGA 5DX4A 5HFQA 5HM0A 5G4RA 4O70A 3MULA 4A9JA 1E6IA 5A5NA 4YYJA 1ZS5A 3D7CA 3QZTA 4UYEA 5II1A 4GPJA 5CQ7A 4NS5A 4NR6A 4TU6A 5A81A 3TLPA 5CPEA 5CU8A 4Y03A 5D3JA 5LKZA 5ETBA 3G0LA 3UW9A 5EPBA 3ZYUA 4LRGA 2N9GA 5HQ7A 4XYAA 1X0JA 5FE4A 5FB0A 4CURA 3MUKA 4PCEA 4N4HA 4QY4A 5EA1A 4O78A 5D3HA 4TYLA 5C8GA 3VKHA 4NR8A 4UITA 5DFDA 5L96A 5EV9A 5HRXA 5LKUA 1WUGA 5ENBA 4A9NA 1JM4B 3U5NA 5FE0A 4LR6A 5HENA 1PUOA 4QSTA 2DVRA 5D0CA 2DWWA 5D24A 4UYFA 3DAIA 5L99A 4QSPA 5JWMA 4Q0OA 3U5OA 3LQJA 5C89A 3JVMA 5L8UA 4XY9A 4TT6A 3NXBA 5CGPA 4QR3A 5E74A 5TCMA 5ENCA 5DYAA 5BT4A 4LC2A 2E7NA 5H85A 5E7DA 3U5MA 5A83A 3Q2EA 5A7CA 2E3KA 2R10A 4LYSA 4QSWA 4QNSA 5FH6A 4YADA 2RS9B 5K29A 4HXOA 5HCLA 1WUMA 5KU3A 4HBWA 3MXFA 5I29A 5CUDA 5FFYA 5C85A 4J0SA 4Z93A 4Z6IA 5I88A 3JVJA 5EPRA 4KCXA 4YYGA 2OUOA 4UYHA 4Z6HA 5HLSA 2G4AA 4HBXA 1F68A 5FH8A 4MEPA 4PCIA 4LYWA 4TS8A 5E0RA 5EWCA 5KTXA 2DVSA 1EQFA 4YY6A 5C87A 5FB1A 3UVWA 4AKGA 5EGUA 5E3DA 5A5QA 2L84A 4ALHA 5DBMA 5E9YA 5FBXA 5BT3A 4NYXA 4QSQA 5C4QA 4MR6A 5KTUA 3G0JA 3IU6A 4UYFB 5FE2A 5DKCA 5F3AA 5EWVA 4O7AA 5DFBA 2KTBB 5EICA 5FE9A 4AI6A 3U5LA 4PS5A 4YK0A 5CQAA 5C7NA 3U5KA 4NR5A 4CFKA 5KO4A 5CY9A 4BJXA 3UV2A 3Q2FA 4ZW1A 5BT5A 5IBNA 3SVHA 4O76A 5FG6A 5A5PA 5LJ2A 5DW2A 5ETDA 5HFRA 4QUTA 4O72A 5EU1A 5AD2A 4YATA 3U5JA 5HQ6A 5D3PA 5COIA 4YH3A 4IR4A 4LZRA 4YYDA 4LYIA 2R0VA 4A9FA 3MQMA 5ENIA 4BW4A 5E9IA 5AD3A 4NYWA 3SVGA 3P1DA 3U5PA 4A9OA 2DKWA 5FFWA 4O7BA 5HJCA 4QBMA 4A9EA 4QUUA 5EWHA 3JVLA 4ALGA 2E7OA 2RO1A 4ZQLA 5ENHA 3GG3A 5CS8A 4QC1A 5CUEA 5F36A 5E3GA 5HEMA 5EISA 4ZC9A 4MEQA 5G4SA 5D3RA 4QSXA 3P1FA 4TZ8A 4QC3A 3UV4A 3O33A 5FE6A 3P1CA 4RVRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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