4NYWA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with a dihydroquinoxalinone ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords CREB-binding protein
publication title Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nywA00
2R0VA 3O37A 3UVYA 5ENCA 5A83A 5HRVA 5E7DA 5KU3A 5I40A 4YH3A 4YY6A 4NR4A 5CQ6A 4X2IA 5E9MA 4NR6A 4NUCA 3HMEA 4CUQA 4QSWA 5EWHA 2E3KA 4YYIA 4LYIA 4RVRA 5IG6A 4HXKA 4Q0OA 4J1PA 4A9JA 4YAXA 2OUOA 2YEKA 5H1TA 4OGJA 4TT6A 3U5PA 4IR4A 3LQHA 4A9EA 5CP5A 4N4GA 4QSRA 5BT5A 3P1EA 5C8GA 4IOOA 4O75A 4CFKA 2L85A 5FH8A 4KV4A 3O36A 3IU6A 5IBNA 5DFCA 4TTEA 2L5EA 4NYWA 4A9FA 4TT4A 5I7XA 5G4SA 4TZ8A 3AADA 5HJCA 5LJ1A 5DW2A 4O76A 4MEPA 5LKTA 5DY7A 1WUGA 5BT4A 3QZTA 5L97A 2RNWA 4UIYA 3P1CA 5F60A 2RO1A 2DVVA 4QEVA 5C87A 5E0RA 4ALHA 4CUTA 4NRAA 4HXLA 4YYJA 4O70A 4CFLA 5D26A 1X0JA 3QZVA 4WHUA 5CS8A 5HELA 3SVGA 2MJVB 3LQIA 2DVQA 2RS9B 4NRBA 5F36A 5FE0A 3G0JA 4Z1SA 5HQ7A 5I86A 4CURA 5I7YA 4YADA 2R0YA 5ENBA 5FFYA 2H60A 5I1QA 5EQ1A 4NYXA 4MEQA 5L8UA 4N4FA 5CQAA 5I83A 5F2PA 2YDWA 5IGMA 3ONIA 4N3WA 4A9MA 4UYDA 5LKUA 5IGLA 1F68A 4TZ2A 3JVMA 2YQDA 4UIXA 5EWDA 5FFVA 4QSQA 5D3TA 5II2A 4PKLA 5HM0A 3LJWA 3UVWA 3U5LA 4J0SA 5IGKA 3IU5A 4XY9A 2I7KA 2WP1A 4UYFA 5FE4A 4O74A 5HENA 3MUKA 4A9LA 5CQ8A 4TQNA 5L99A 3UW9A 4LZRA 5CUAA 4NR8A 1E6IA 4YC9A 5FE6A 5DKHA 2NXBA 4Y03A 5KTUA 5CTLA 5E9VA 1ZS5A 4PCEA 3Q2FA 4O71A 4IR5A 4UIUA 4NR9A 2F6NA 5L96A 4CL9A 3UV4A 4N4IA 4QYDA 2D9EA 5AD2A 4MR3A 5F25A 4TS8A 5FG5A 2RNXA 4QSUA 2F6JA 3JVJA 5EU1A 5FG4A 4DONA 5A7CA 5ACYA 5K29A 4LRGA 4O7EA 5EWVA 4UIWA 4QC1A 5ENJA 5FH7A 4OUFA 5A85A 4YH4A 4YATA 5KTWA 2WP2A 4MR6A 4NUEA 5AMEA 5E3GA 2D82A 4QEUA 3I3JA 4QC3A 5AD3A 4XUBA 5DFBA 5F62A 4ZC9A 5CUDA 2YEMA 4CUSA 4LZSA 5DKCA 5H1UA 3AQAA 5HCLA 5HRWA 5FE5A 4QB3A 5DLZA 2RFJA 4O7FA 5A5OA 5LKXA 5CUCA 3MXFA 2I8NA 3LXJA 4YBTA 5I88A 3JVKA 5D0CA 5CFWA 4NR5A 4TU6A 5LJ0A 5EWCA 4IR6A 4PS5A 4NQMA 4YBSA 3O33A 4UITA 5II1A 5AMFA 5EK9A 4HBXA 5CU8A 4Z6HA 3FKMX 3P1DA 4NR7A 4NRCA 5A81A 3JVLA 5CQ3A 4QSVA 5LUUA 4A9OA 5DX4A 5EV9A 3MULA 1EQFA 4NUDA 5DYCA 4BHWA 4MEOA 5CUEA 1JSPB 5J0DA 5EICA 5ETDA 3UV2A 4YYMA 4Z1QA 2R10A 3DAIA 5FB0A 4LYSA 4A9NA 4A9HA 5DW1A 5FG6A 5CQTA 4ZW1A 2OSSA 4O72A 2YYNA 3NXBA 4MENA 3P1FA 5F63A 2KTBB 5F1HA 5D3SA 2FSAA 5A5SA 5E3DA 4MR5A 3LQJA 4LC2A 4UYFB 5A5NA 4QR5A 1N72A 4YYNA 4UYGA 5EPSA 5TB6A 4TT2A 2LSPB 4CLBA 4LR6A 5F3AA 5L8TA 5KTXA 4YBMA 4QYLA 5F61A 3GG3A 5HLSA 4BW4A 5EM3A 4BW1A 5FB1A 5EVAA 5FE8A 4MR4A 4HBVA 5IIDA 2DVSA 5CQ7A 3UVXA 4F3IA 1JM4B 4IORA 5DYAA 4NXJA 4FLPA 4QR3A 4UIVA 4HXSA 5COIA 2RNYA 4CUUA 3U5JA 5D3PA 4PCIA 5CY9A 4QNSA 4YK0A 4XUAA 5I89A 5L98A 5CZGA 5HFQA 5FDZA 4Z6IA 4J0RA 5LVQA 5EWWA 5JWMA 4UIZA 3K2JA 3MB4A 3TLPA 4BW2A 5D3LA 4QSSA 4KCXA 5I80A 3S91A 5E73A 5E9KA 5LVRA 4QR4A 5EPBA 5ENIA 5CUBA 5LKZA 4XY8A 3RCWA 4QZSA 4HBWA 2DATA 4E96A 4QBMA 2OO1A 5EGUA 4YYHA 4NS5A 5ENGA 5DYUA 3P5OA 4UYEA 4TU4A 4CUPA 4YYKA 3O34A 5D3HA 4O77A 3U5MA 2GRCA 5FH6A 2DKWA 4HXNA 4ZQLA 4O7AA 5CQ4A 4HXOA 4O7CA 5A5RA 4O7BA 5HEMA 5I29A 4GPJA 5FBXA 4QSXA 3MB3A 3SVFA 2E7NA 5F1LA 5DKDA 5LJ2A 3QZSA 4QUUA 5CRZA 4OGIA 5ENFA 4N4HA 3D7CA 3U5NA 3UV5A 5HRXA 5DBMA 4LZ2A 5D25A 4WHWA 4IOQA 4HXPA 3ZYUA 5ETBA 4NQNA 2N9GA 3G0LA 2L84A 4YY4A 5HFRA 5FE3A 5CGPA 4A9IA 5CQ5A 5EP7A 4ALGA 5KHMA 4HBYA 2DVRA 5G4RA 5FE9A 4IR3A 4QY4A 2YW5A 5CRMA 3Q2EA 4PTBA 5HQ6A 3SVHA 3U5OA 5DLXA 5D3JA 2G4AA 2E7OA 5FE2A 5E9IA 4Z93A 4XYAA 5DYXA 4HXRA 4Q0NA 1WUMA 4TYLA 5H1VA 3DWYA 5EI4A 4BW3A 5KO4A 5E9YA 5ENEA 4QSTA 4YABA 5C7NA 5DFDA 5H85A 5CUGA 5C85A 4AKNA 3O35A 5FE7A 4KV1A 4O78A 5D3NA 2YELA 5FFWA 5BT3A 5CPEA 4A9KA 5EISA 5TCMA 5C4QA 4YYGA 2RI7A 4QEWA 3MQMA 5F5ZA 5D3RA 3UVDA 3HMFA 5ENHA 4J3IA 5JI8A 5C89A 2DWWA 5D24A 4UYHA 5E9LA 3S92A 3U5KA 5IGNA 4NYVA 4WIVA 5EA1A 5A82A 3HMHA 5HQ5A 5FE1A 4C66A 4PY6A 4C67A 4HXMA 4LDFA 2R0SA 4LYWA 4QSPA 4BJXA 5EPRA 4YYDA 5A5PA 5D7XA 4QUTA 5E74A 5A5QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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