4NYWA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with a dihydroquinoxalinone ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nywA00
4FLPA 5F1LA 2WP2A 4YYKA 4HXKA 3UV5A 5LJ0A 4CUUA 4HXRA 1WUMA 4QSQA 5KO4A 1F68A 5FE3A 5D3RA 4BW3A 5DKDA 5CRZA 4NR4A 4O72A 4YBSA 3U5OA 5L98A 2OO1A 5KHMA 4N4IA 3NXBA 5F5ZA 5CUDA 5EI4A 4QR4A 4A9MA 4XUBA 5A5PA 4HXSA 5HJCA 5CQTA 4IOQA 5IGMA 3P1DA 4ALGA 4NYXA 5D3LA 4YAXA 4PCIA 4YY6A 4YABA 5HRVA 4YYHA 4OGIA 4TT2A 4HXMA 5A5OA 4QEUA 5C7NA 4CFLA 4UITA 4LYWA 4BW1A 5FBXA 5FG6A 5HM0A 2E7NA 5L8TA 5FFVA 5HLSA 4NS5A 4A9FA 5I7XA 3HMFA 5EWDA 4E96A 5D24A 4GPJA 2WP1A 5ENJA 4HBWA 3UVDA 5HQ6A 4KCXA 4IR4A 3MB3A 4CUSA 2E7OA 5DX4A 3IU6A 5CP5A 4QSRA 5G4SA 4O76A 5F25A 4YADA 5E9IA 3O34A 3RCWA 2LSPB 4N4HA 4UIVA 4NR7A 4A9KA 4LZRA 4BJXA 2RNXA 4QEVA 5BT5A 4QBMA 4QYDA 2R0VA 4MEQA 4O7EA 5EQ1A 4Z1QA 5FE2A 5DKCA 5LKZA 4TTEA 5A5NA 5E9MA 4UIUA 5FB0A 5A82A 1WUGA 4F3IA 5D3PA 4PCEA 4QY4A 5DKHA 4Q0NA 4RVRA 5AD3A 4YATA 4QR5A 5FH7A 3SVGA 4MEOA 3QZVA 5C8GA 4IR3A 5C85A 5CQ3A 5IGKA 5TCMA 5LVRA 4O7FA 4UYGA 4LZ2A 3U5KA 5A5SA 2YQDA 3DWYA 4PY6A 5LUUA 5A5QA 5F1HA 4O74A 3LXJA 4XY9A 5DFBA 4UYFA 4CUQA 3UVYA 3MB4A 5HEMA 2R0YA 5ETDA 4O75A 5ENFA 1E6IA 1ZS5A 5FG4A 5HELA 5CQ7A 1JSPB 2G4AA 4XUAA 1N72A 5E9VA 5EPRA 4N3WA 4TS8A 4QC1A 5CS8A 5D3JA 5EA1A 2DVSA 5JWMA 4YC9A 4QEWA 3S91A 4BW4A 5FE0A 5FE8A 4QNSA 5A5RA 5DLZA 4HXPA 5HRWA 5HFRA 4N4GA 4NYVA 4XY8A 4TU6A 5F63A 4A9IA 4QSVA 5I83A 3DAIA 4WIVA 5KTXA 5ENEA 5AMEA 4NR6A 5II1A 2DATA 5E73A 4QSSA 3G0LA 2RNWA 4TU4A 4N4FA 4LC2A 5I7YA 5AMFA 3P1FA 3MQMA 5ENIA 5E0RA 4CFKA 3D7CA 4YYDA 2D82A 5IBNA 5CPEA 2E3KA 5L99A 2YYNA 3P1EA 4NRAA 4J3IA 3UVWA 2YW5A 4A9OA 5ENBA 4QSUA 4J0RA 4YH3A 5HQ5A 5G4RA 5KTWA 4ZC9A 5COIA 3JVJA 4KV4A 5FE5A 1X0JA 5CU8A 4UYEA 3JVLA 4X2IA 4Y03A 4KV1A 3UW9A 5EWHA 3P5OA 5DW1A 5EK9A 4NXJA 2YEKA 4O7CA 4QC3A 4QB3A 5ENGA 4NYWA 4CL9A 3P1CA 5A85A 3SVFA 5CUBA 5HFQA 3ZYUA 5KTUA 2NXBA 3S92A 3HMHA 4UYFB 5L8UA 4LDFA 4MR5A 3Q2EA 5EICA 3AADA 4PKLA 4YYJA 4O7AA 5LJ1A 4MR4A 4HXOA 5IIDA 5H85A 4UYHA 4IR5A 5DY7A 5LKXA 2F6NA 4LZSA 5CQ4A 5K29A 2RFJA 4UIWA 4PS5A 5DYXA 5F3AA 5L97A 4A9NA 3MULA 2L84A 4QSXA 2H60A 4LR6A 4MENA 4UIZA 5E7DA 2DVRA 3AQAA 5EPSA 4YH4A 3Q2FA 3JVKA 5ACYA 5I86A 4QYLA 3UVXA 3ONIA 2OSSA 4IR6A 4TZ2A 2DVQA 5E9KA 4ZQLA 5A7CA 5I80A 2RS9B 3UV4A 4YY4A 2YEMA 4HXNA 4Z6IA 5EVAA 4C67A 5CUEA 5FE6A 5EWWA 5FG5A 5DW2A 5EP7A 2RO1A 5HQ7A 4TQNA 3LQHA 4NR9A 5FE9A 3IU5A 4TZ8A 4MR6A 5H1VA 4NRCA 4O78A 5FE1A 4NUCA 5LJ2A 3U5NA 5BT3A 2DVVA 5D3HA 5JI8A 2MJVB 4CUPA 2R0SA 3O35A 3U5LA 5DYUA 5E9YA 4AKNA 5ETBA 5F61A 4QSPA 5EU1A 3K2JA 2L5EA 4HXLA 3GG3A 5I29A 4O7BA 4NUDA 5CUAA 4NQMA 5C87A 2RI7A 4LRGA 5LVQA 5LKUA 4A9JA 2L85A 4TT4A 5TB6A 4Z1SA 4QZSA 5IGLA 5CTLA 4YYGA 4CUTA 4UIXA 5E74A 4O70A 3U5PA 5E3DA 5ENCA 5EISA 3MUKA 4YBTA 2D9EA 5FH6A 4YYMA 4J0SA 5F60A 5FFWA 4WHWA 5I40A 5CRMA 5IG6A 4UIYA 4TYLA 2YDWA 5DFCA 3I3JA 4CURA 5D25A 5HENA 4IORA 4CLBA 3LQIA 4YYNA 3O33A 3MXFA 5DFDA 4NR5A 4QUUA 5ENHA 5EPBA 5E3GA 2KTBB 5D3NA 5FFYA 5FH8A 5FE7A 5FB1A 5D3SA 5I1QA 2GRCA 4TT6A 4QUTA 5DYCA 3LJWA 5CUCA 5I89A 5L96A 5CFWA 3JVMA 5FDZA 4IOOA 4YBMA 5C89A 5F2PA 5F36A 4WHUA 4HBVA 4BHWA 5EGUA 3QZSA 5CQAA 3SVHA 3TLPA 5C4QA 5DLXA 2RNYA 5FE4A 4ZW1A 4O71A 4YYIA 4Q0OA 4NUEA 5CY9A 5HRXA 4QSWA 3QZTA 4A9HA 4NRBA 4NR8A 4J1PA 4HBYA 4DONA 3G0JA 3LQJA 4MR3A 5EM3A 2OUOA 3FKMX 5DYAA 5II2A 2I8NA 5KU3A 2I7KA 4MEPA 4Z93A 4A9EA 2FSAA 4C66A 5D0CA 5J0DA 5CGPA 4PTBA 2R10A 5LKTA 4UYDA 4Z6HA 5D26A 5D7XA 5EWCA 4LYSA 2N9GA 5D3TA 5H1TA 3U5JA 5BT4A 5CQ6A 5DBMA 4XYAA 5CZGA 5I88A 5CQ5A 5F62A 5CQ8A 5EV9A 3O36A 5A83A 4O77A 3O37A 1JM4B 5CUGA 1EQFA 5AD2A 5E9LA 4YK0A 5H1UA 4ALHA 4OUFA 4HBXA 4QR3A 3U5MA 2F6JA 4QSTA 3HMEA 4BW2A 5EWVA 5HCLA 5IGNA 4NQNA 4OGJA 3UV2A 5A81A 2DWWA 4LYIA 4A9LA 2YELA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLPA 5F1LA 2WP2A 4YYKA 4HXKA 3UV5A 5LJ0A 4CUUA 4HXRA 1WUMA 4QSQA 5KO4A 1F68A 5FE3A 5D3RA 1PUOA 4BW3A 5DKDA 5CRZA 4NR4A 4O72A 4YBSA 3U5OA 5L98A 2OO1A 5KHMA 4N4IA 3NXBA 5F5ZA 5CUDA 5EI4A 4QR4A 4A9MA 4XUBA 5A5PA 4HXSA 5HJCA 5CQTA 4IOQA 5IGMA 3P1DA 4ALGA 4NYXA 5D3LA 4YAXA 4PCIA 4YY6A 4YABA 5HRVA 4YYHA 4OGIA 4TT2A 4HXMA 5A5OA 4QEUA 5C7NA 4CFLA 4UITA 4LYWA 4BW1A 5FBXA 5FG6A 5HM0A 2E7NA 5L8TA 5FFVA 5HLSA 3VKGA 4NS5A 4A9FA 5I7XA 3HMFA 5EWDA 4E96A 5D24A 4GPJA 2WP1A 5ENJA 4HBWA 3UVDA 5HQ6A 4KCXA 4IR4A 3MB3A 4CUSA 2E7OA 5DX4A 4AKHA 3IU6A 5CP5A 4QSRA 5G4SA 4O76A 5F25A 4YADA 5E9IA 3O34A 3RCWA 2LSPB 4N4HA 4UIVA 4NR7A 4A9KA 4LZRA 4BJXA 2RNXA 4QEVA 5BT5A 4QBMA 4QYDA 2R0VA 4MEQA 4O7EA 5EQ1A 4Z1QA 5FE2A 5DKCA 5LKZA 4TTEA 5A5NA 5E9MA 4UIUA 5FB0A 5A82A 1WUGA 4F3IA 5D3PA 4PCEA 4QY4A 5DKHA 4Q0NA 4RVRA 5AD3A 4YATA 4QR5A 5FH7A 3SVGA 4MEOA 3QZVA 5C8GA 4IR3A 5C85A 5CQ3A 5IGKA 5TCMA 5LVRA 4O7FA 4UYGA 4LZ2A 3U5KA 5A5SA 2YQDA 3DWYA 4PY6A 5LUUA 5A5QA 5F1HA 4O74A 3LXJA 4XY9A 5DFBA 4UYFA 4CUQA 3UVYA 3MB4A 5HEMA 2R0YA 5ETDA 4O75A 5ENFA 1E6IA 1ZS5A 5FG4A 5HELA 5CQ7A 1JSPB 2G4AA 4XUAA 1N72A 5E9VA 5EPRA 4N3WA 4TS8A 4QC1A 5CS8A 5D3JA 5EA1A 2DVSA 5JWMA 4YC9A 4QEWA 3S91A 4BW4A 5FE0A 5FE8A 4QNSA 5A5RA 5DLZA 4HXPA 5HRWA 5HFRA 4N4GA 4NYVA 4XY8A 4TU6A 5F63A 4A9IA 4QSVA 5I83A 3DAIA 4AKGA 4WIVA 5KTXA 5ENEA 5AMEA 4NR6A 5II1A 2DATA 5E73A 4QSSA 3G0LA 2RNWA 4TU4A 4N4FA 4LC2A 5I7YA 5AMFA 3P1FA 3MQMA 5ENIA 5E0RA 4CFKA 3D7CA 4YYDA 2D82A 5IBNA 3D1DA 5CPEA 2E3KA 5L99A 2YYNA 3P1EA 4NRAA 4J3IA 3UVWA 2YW5A 4A9OA 5ENBA 4QSUA 4J0RA 4YH3A 5HQ5A 5G4RA 5KTWA 4ZC9A 5COIA 3JVJA 4KV4A 5FE5A 1X0JA 5CU8A 4UYEA 3JVLA 4X2IA 4Y03A 4KV1A 3UW9A 5EWHA 3P5OA 5DW1A 5EK9A 4NXJA 2YEKA 4O7CA 4QC3A 4QB3A 5ENGA 4NYWA 4CL9A 3P1CA 5A85A 3SVFA 5CUBA 5HFQA 3ZYUA 5KTUA 2NXBA 3S92A 3HMHA 4UYFB 5L8UA 4LDFA 4MR5A 3Q2EA 5EICA 3AADA 4PKLA 4YYJA 4O7AA 5LJ1A 4MR4A 4HXOA 5IIDA 5H85A 4UYHA 4IR5A 5DY7A 5LKXA 2F6NA 4LZSA 5CQ4A 5K29A 2RFJA 4UIWA 4PS5A 5DYXA 5F3AA 5L97A 4A9NA 3MULA 2L84A 4QSXA 2H60A 4LR6A 4MENA 4UIZA 1ZKRA 5E7DA 2DVRA 3AQAA 5EPSA 4YH4A 3Q2FA 3JVKA 5ACYA 5I86A 4QYLA 3UVXA 3ERRA 3ONIA 2OSSA 4IR6A 4TZ2A 2DVQA 5E9KA 4ZQLA 5A7CA 5I80A 2RS9B 3UV4A 4YY4A 2YEMA 4HXNA 4Z6IA 5EVAA 4C67A 5CUEA 5FE6A 5EWWA 5FG5A 5DW2A 5EP7A 2RO1A 5HQ7A 4TQNA 3LQHA 4NR9A 5FE9A 3IU5A 4TZ8A 4MR6A 5H1VA 4NRCA 4O78A 5FE1A 4NUCA 5LJ2A 3U5NA 5BT3A 2DVVA 5D3HA 5JI8A 2MJVB 4CUPA 2R0SA 3O35A 3U5LA 5DYUA 5E9YA 4AKNA 5ETBA 5F61A 4QSPA 3D1BA 5EU1A 3K2JA 2L5EA 4HXLA 3GG3A 5I29A 4O7BA 4NUDA 5CUAA 4NQMA 5C87A 2RI7A 4LRGA 5LVQA 5LKUA 4A9JA 2L85A 4TT4A 5TB6A 4Z1SA 4QZSA 5IGLA 5CTLA 4YYGA 4CUTA 4UIXA 5E74A 4O70A 3U5PA 5E3DA 5ENCA 5EISA 3MUKA 4YBTA 2D9EA 5FH6A 4YYMA 4J0SA 5F60A 5FFWA 4WHWA 5I40A 5CRMA 5IG6A 4UIYA 4TYLA 2YDWA 5DFCA 3I3JA 4CURA 5D25A 5HENA 4IORA 4CLBA 3LQIA 4YYNA 3O33A 3MXFA 5DFDA 4NR5A 4QUUA 5ENHA 5EPBA 5E3GA 2KTBB 5D3NA 5FFYA 5FH8A 5FE7A 5FB1A 5D3SA 5I1QA 2GRCA 4TT6A 4QUTA 5DYCA 3LJWA 5CUCA 5I89A 5L96A 5CFWA 3JVMA 5FDZA 4IOOA 4YBMA 5C89A 5F2PA 5F36A 4WHUA 4HBVA 4BHWA 5EGUA 3QZSA 3VKHA 5CQAA 3SVHA 3TLPA 5C4QA 5DLXA 2RNYA 5FE4A 4ZW1A 4O71A 4YYIA 4Q0OA 4NUEA 5CY9A 5HRXA 4QSWA 3QZTA 4A9HA 4NRBA 4NR8A 4J1PA 4AKIA 4HBYA 4DONA 3G0JA 3LQJA 4MR3A 5EM3A 2OUOA 3FKMX 5DYAA 5II2A 2I8NA 5KU3A 2I7KA 4MEPA 4Z93A 4A9EA 2FSAA 4C66A 5D0CA 5J0DA 5CGPA 4PTBA 4AI6A 2R10A 5LKTA 4UYDA 4Z6HA 5D26A 5D7XA 5EWCA 4LYSA 2N9GA 5D3TA 5H1TA 3U5JA 5BT4A 5CQ6A 5DBMA 4XYAA 5CZGA 5I88A 5CQ5A 5F62A 2EJNA 5CQ8A 5EV9A 3O36A 5A83A 4O77A 3O37A 1JM4B 5CUGA 1EQFA 5AD2A 5E9LA 4YK0A 5H1UA 4ALHA 4OUFA 4HBXA 4QR3A 3U5MA 2F6JA 4QSTA 3HMEA 4BW2A 5EWVA 5HCLA 5IGNA 4NQNA 4OGJA 3UV2A 5A81A 2DWWA 4LYIA 4A9LA 2YELA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FLP A;  5F1L A;  2WP2 A;  4YYK A;  4HXK A;  3UV5 A;  5LJ0 A;  4CUU A;  4HXR A;  1WUM A;  4QSQ A;  5KO4 A;  1F68 A;  5FE3 A;  5D3R A;  4BW3 A;  5DKD A;  5CRZ A;  4NR4 A;  4O72 A;  4YBS A;  3U5O A;  5L98 A;  2OO1 A;  5KHM A;  4N4I A;  3NXB A;  5F5Z A;  5CUD A;  5EI4 A;  4QR4 A;  4A9M A;  4XUB A;  5A5P A;  4HXS A;  5HJC A;  5CQT A;  4IOQ A;  5IGM A;  3P1D A;  4ALG A;  4NYX A;  5D3L A;  4YAX A;  4PCI A;  4YY6 A;  4YAB A;  5HRV A;  4YYH A;  4OGI A;  4TT2 A;  4HXM A;  5A5O A;  4QEU A;  5C7N A;  4CFL A;  4UIT A;  4LYW A;  4BW1 A;  5FBX A;  5FG6 A;  5HM0 A;  2E7N A;  5L8T A;  5FFV A;  5HLS A;  4NS5 A;  4A9F A;  5I7X A;  3HMF A;  5EWD A;  4E96 A;  5D24 A;  4GPJ A;  2WP1 A;  5ENJ A;  4HBW A;  3UVD A;  5HQ6 A;  4KCX A;  4IR4 A;  3MB3 A;  4CUS A;  2E7O A;  5DX4 A;  3IU6 A;  5CP5 A;  4QSR A;  5G4S A;  4O76 A;  5F25 A;  4YAD A;  5E9I A;  3O34 A;  3RCW A;  2LSP B;  4N4H A;  4UIV A;  4NR7 A;  4A9K A;  4LZR A;  4BJX A;  2RNX A;  4QEV A;  5BT5 A;  4QBM A;  4QYD A;  2R0V A;  4MEQ A;  4O7E A;  5EQ1 A;  4Z1Q A; 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