5EISA

First domain of human bromodomain brd4 in complex with inhibitor 3-(4-chlorobenzyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Exploring Selective Inhibition of the First Bromodomain of the Human Bromodomain and Extra-terminal Domain (BET) Proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eisA01
5E9KA 5HELA 3NXBA 5CUAA 4PTBA 5DKHA 5F5ZA 4NR7A 4QEWA 4LZSA 3UVXA 4TQNA 3P1FA 4NR6A 4HXOA 5IBNA 5E9VA 5EK9A 5EVAA 5KTXA 4XYAA 5K29A 5FH7A 5DLZA 5HFRA 5FDZA 4IR4A 5JI8A 4IOQA 5CRMA 5HRXA 5A5SA 5D3SA 3U5KA 4IR3A 4QSUA 5ENHA 4YH3A 5IIDA 5IGLA 4TZ8A 4UIWA 5A5OA 3AADA 5E9LA 4MEQA 5DY7A 2E3KA 2RI7A 5D7XA 4CLBA 2G4AA 5A81A 2L85A 5HENA 5H1TA 2MJVB 5E9MA 5ETBA 5TB6A 5LJ1A 4BW1A 5ENFA 2YELA 4QC3A 2DWWA 2RS9B 4QUUA 4UIYA 4O74A 5EM3A 4O7FA 4QY4A 5FB0A 4BW2A 2DVQA 4NYXA 4QEVA 4LRGA 3P1EA 5C8GA 2YEKA 5EWDA 5D3TA 3AQAA 4CUUA 2RNXA 5DW1A 5IGKA 3LQIA 3IU6A 4TU4A 5E73A 4YYJA 4KV4A 4F3IA 4TTEA 5DLXA 4J3IA 4Z6IA 3O36A 5F3AA 4YATA 5C7NA 4HXRA 4BW3A 4NR9A 3UW9A 3LQHA 4NXJA 4UYHA 5HRVA 5I89A 5COIA 5DFBA 5EGUA 4O76A 2DKWA 4Z1QA 3MB3A 3HMEA 5F2PA 2RFJA 3HMHA 5BT3A 3K2JA 5A7CA 5CFWA 4IORA 3P1CA 5E9YA 3DAIA 5JWMA 3S92A 4N4GA 5CQ3A 3U5OA 5HFQA 4YYHA 4UIZA 2YDWA 1WUMA 4O71A 4GPJA 5D24A 4TU6A 3LJWA 5BT4A 2YW5A 2YEMA 5LVRA 4QSXA 5DYAA 5CY9A 5E3DA 5I80A 5E74A 4CUSA 5D3RA 5FE5A 4UYGA 5CQ5A 4N4FA 4NQMA 5LVQA 5EP7A 4O78A 4NR5A 4PKLA 4NUCA 2RO1A 5II1A 5E9IA 3LQJA 4CURA 4O7CA 5CPEA 4QBMA 3LXJA 4A9IA 5J0DA 4XY9A 5CQAA 5I29A 5FG4A 4QSSA 5ENCA 5DYXA 1WUGA 4N4HA 4QC1A 5ENIA 5A82A 4QSTA 5L98A 2FSAA 4PCEA 3JVMA 2N9GA 1ZS5A 4LYWA 4KV1A 4IR6A 4PCIA 2R0SA 4QR5A 3ZYUA 3S91A 5D3JA 5LKZA 2L84A 5LKUA 4UIUA 5C4QA 5EQ1A 4YBSA 5FG5A 5CP5A 4A9JA 4LR6A 5A5NA 4IR5A 3GG3A 4QSVA 3U5JA 4ZW1A 5C87A 4NQNA 2RNYA 3SVFA 2R10A 3Q2FA 5D26A 5CQ4A 4UITA 5L8UA 5C89A 2KTBB 4IOOA 5F63A 4BJXA 2RNWA 5D25A 4QSRA 4O7BA 4O72A 5LUUA 2H60A 5EWCA 5KU3A 5L97A 4WHWA 5EV9A 3IU5A 4Q0OA 3O34A 2OSSA 4HXKA 5I7YA 4N4IA 3MQMA 4C67A 4Z93A 4YADA 5HRWA 4LZRA 2GRCA 2YYNA 5EA1A 5HQ7A 4Q0NA 4QZSA 5ENJA 4UYDA 5I86A 5EWWA 3O37A 5I7XA 5EI4A 5HEMA 4A9OA 5DW2A 5CUEA 5G4RA 3UV4A 2L5EA 5I88A 5LJ2A 5FBXA 3G0LA 4TT6A 2WP1A 3SVGA 3MXFA 5II2A 4NYWA 3MB4A 5AD2A 4HXMA 4HXSA 5E0RA 4QB3A 5H1UA 3FKMX 4HBYA 4O7AA 5CQTA 4YC9A 5KHMA 4A9HA 4C66A 4YYMA 4NRAA 2R0YA 4MEOA 4QSWA 5A5PA 5FH8A 4UYFB 4FLPA 4QNSA 5ENBA 5C85A 3UV5A 4O77A 4MR4A 4NRBA 5ENGA 4AKNA 2I8NA 3SVHA 4PY6A 2I7KA 5D3PA 3U5MA 3HMFA 4HBVA 4LZ2A 4MR5A 5L99A 4LYSA 5FE8A 5CQ7A 4A9MA 5IG6A 4J1PA 4NUEA 4UIXA 3UVDA 3JVKA 4MR3A 1JM4B 3QZSA 4QUTA 2D82A 5F36A 5FB1A 5CGPA 4CFKA 2F6JA 5HCLA 5A85A 5KO4A 2WP2A 4QYDA 5FFVA 4O75A 4CUTA 5I40A 2D9EA 3UVYA 4N3WA 5IGMA 4J0SA 5CUBA 5F1LA 5FE0A 5DBMA 5DX4A 5F61A 5DYCA 5E7DA 5DFCA 5EICA 4A9FA 1E6IA 4TT2A 4Z6HA 5A5RA 4HBXA 2F6NA 5FE1A 5CUDA 3ONIA 2R0VA 4YYGA 5LKXA 4NS5A 4YAXA 5A5QA 4QEUA 3QZVA 5F60A 1EQFA 4WHUA 4WIVA 3G0JA 4A9LA 3P1DA 5HQ5A 4LYIA 4OUFA 3U5NA 4CUQA 4A9NA 2E7NA 5FFWA 5FH6A 5F62A 4YBMA 5E3GA 3QZTA 5FE9A 4J0RA 5L8TA 3UVWA 5ACYA 4HXNA 2DVRA 4QYLA 2OUOA 5CUGA 4MR6A 5FE6A 5DKCA 5KTWA 4HXPA 5FE7A 4Z1SA 4LC2A 5HM0A 5CS8A 2DVVA 3Q2EA 4UYFA 5D3LA 1X0JA 4O7EA 4TT4A 4YYNA 5IGNA 5F25A 4QR3A 4MEPA 1JSPB 3JVJA 3O33A 3TLPA 3JVLA 5EPRA 5L96A 4NUDA 4UIVA 5A83A 5FE2A 4TS8A 4LDFA 4CL9A 2NXBA 5LKTA 4NYVA 4X2IA 4NRCA 5EPBA 3U5PA 4YY4A 5AD3A 5BT5A 4OGIA 5DFDA 4XUBA 5LJ0A 4XY8A 5CUCA 5ENEA 3MUKA 4O70A 2OO1A 5EWVA 5D3NA 4NR8A 5AMEA 5G4SA 5CZGA 5CQ8A 4ALGA 5CRZA 3P5OA 5EISA 4YY6A 4YYDA 4QSQA 2DVSA 4YH4A 4ZQLA 4MENA 4Y03A 5FG6A 4BW4A 4YABA 5TCMA 4ALHA 4YYIA 4A9KA 5CQ6A 4ZC9A 5I83A 4QSPA 3RCWA 4HXLA 4YYKA 4DONA 5EPSA 3O35A 4XUAA 5I1QA 5FE3A 5ETDA 5CU8A 4E96A 1F68A 3D7CA 1N72A 4YK0A 5HJCA 2E7OA 5AMFA 4PS5A 4CFLA 2LSPB 4HBWA 4UYEA 5HQ6A 4KCXA 4YBTA 4QR4A 4CUPA 3I3JA 4BHWA 4NR4A 5EWHA 4TYLA 5EU1A 5DYUA 3MULA 5D0CA 2DATA 3U5LA 5H85A 4RVRA 5FFYA 3UV2A 4A9EA 5CTLA 5H1VA 5FE4A 4TZ2A 5F1HA 5D3HA 5DKDA 2YQDA 3DWYA 5HLSA 5KTUA 4OGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E9KA 5HELA 3NXBA 5CUAA 4PTBA 5DKHA 5F5ZA 4NR7A 4QEWA 4LZSA 3UVXA 4TQNA 3P1FA 4NR6A 4HXOA 5IBNA 5E9VA 5EK9A 5EVAA 5KTXA 4XYAA 5K29A 5FH7A 5DLZA 5HFRA 5FDZA 4AKIA 4IR4A 5JI8A 4IOQA 5CRMA 5HRXA 5A5SA 5D3SA 3U5KA 4IR3A 4QSUA 5ENHA 4YH3A 5IIDA 5IGLA 4TZ8A 4UIWA 5A5OA 3AADA 5E9LA 4MEQA 5DY7A 2E3KA 2RI7A 5D7XA 4CLBA 2G4AA 5A81A 2L85A 4AKGA 5HENA 5H1TA 2MJVB 5E9MA 5ETBA 5TB6A 5LJ1A 4BW1A 5ENFA 2YELA 4QC3A 2DWWA 2RS9B 4QUUA 4UIYA 4O74A 5EM3A 4O7FA 4QY4A 5FB0A 4BW2A 2DVQA 4NYXA 4QEVA 4LRGA 3P1EA 5C8GA 2YEKA 5EWDA 5D3TA 3AQAA 4CUUA 2RNXA 5DW1A 5IGKA 3LQIA 3IU6A 4TU4A 5E73A 4YYJA 3ERRA 4KV4A 4F3IA 4TTEA 5DLXA 4J3IA 4Z6IA 3O36A 5F3AA 4YATA 5C7NA 4HXRA 4BW3A 4NR9A 3UW9A 3LQHA 4NXJA 4UYHA 5HRVA 5I89A 5COIA 5DFBA 5EGUA 4O76A 2DKWA 4Z1QA 3MB3A 3HMEA 5F2PA 2RFJA 3HMHA 5BT3A 3K2JA 5A7CA 5CFWA 4IORA 3P1CA 5E9YA 3DAIA 5JWMA 3S92A 4N4GA 5CQ3A 3U5OA 5HFQA 4YYHA 4UIZA 2YDWA 1WUMA 4O71A 4GPJA 5D24A 4TU6A 3LJWA 5BT4A 2YW5A 2YEMA 5LVRA 4QSXA 5DYAA 5CY9A 5E3DA 5I80A 5E74A 4CUSA 5D3RA 5FE5A 4UYGA 5CQ5A 4N4FA 4NQMA 5LVQA 5EP7A 4O78A 4NR5A 4PKLA 4NUCA 2RO1A 5II1A 5E9IA 3LQJA 4CURA 4O7CA 5CPEA 4QBMA 3LXJA 4A9IA 5J0DA 4XY9A 5CQAA 5I29A 5FG4A 4QSSA 5ENCA 5DYXA 1WUGA 4N4HA 4QC1A 5ENIA 5A82A 4QSTA 5L98A 2FSAA 4PCEA 3JVMA 2N9GA 1ZS5A 4LYWA 3D1BA 4KV1A 4IR6A 4PCIA 2R0SA 4QR5A 3ZYUA 3S91A 5D3JA 5LKZA 2L84A 5LKUA 4UIUA 5C4QA 5EQ1A 4YBSA 5FG5A 5CP5A 4A9JA 4LR6A 5A5NA 4IR5A 3GG3A 4QSVA 3U5JA 4ZW1A 5C87A 4NQNA 2RNYA 3SVFA 2R10A 3Q2FA 5D26A 5CQ4A 4UITA 5L8UA 5C89A 2KTBB 4IOOA 5F63A 4BJXA 2RNWA 5D25A 4QSRA 4O7BA 4O72A 5LUUA 2H60A 5EWCA 5KU3A 5L97A 4WHWA 5EV9A 3IU5A 4Q0OA 3O34A 2OSSA 4HXKA 5I7YA 4N4IA 3MQMA 4C67A 4Z93A 4YADA 5HRWA 4LZRA 2GRCA 2YYNA 5EA1A 5HQ7A 4Q0NA 4QZSA 5ENJA 4UYDA 5I86A 5EWWA 3O37A 5I7XA 5EI4A 5HEMA 4A9OA 5DW2A 5CUEA 5G4RA 3UV4A 2L5EA 5I88A 5LJ2A 5FBXA 3G0LA 4TT6A 2WP1A 3SVGA 3MXFA 5II2A 4NYWA 3MB4A 5AD2A 4HXMA 4HXSA 5E0RA 4QB3A 5H1UA 4AKHA 3FKMX 4HBYA 4O7AA 5CQTA 4YC9A 5KHMA 4A9HA 4C66A 4YYMA 4NRAA 2R0YA 4MEOA 4QSWA 5A5PA 5FH8A 4UYFB 4FLPA 4QNSA 5ENBA 5C85A 3UV5A 4O77A 4MR4A 4NRBA 5ENGA 4AKNA 2I8NA 3SVHA 4PY6A 1PUOA 2I7KA 5D3PA 3U5MA 3HMFA 4HBVA 4LZ2A 4MR5A 5L99A 4LYSA 5FE8A 5CQ7A 4A9MA 5IG6A 4J1PA 4NUEA 4UIXA 3UVDA 3JVKA 4MR3A 1JM4B 3QZSA 4QUTA 2D82A 5F36A 5FB1A 5CGPA 4CFKA 2F6JA 5HCLA 5A85A 5KO4A 2WP2A 4QYDA 5FFVA 4O75A 4CUTA 5I40A 2D9EA 3UVYA 4N3WA 5IGMA 4J0SA 5CUBA 5F1LA 5FE0A 5DBMA 5DX4A 5F61A 5DYCA 5E7DA 5DFCA 5EICA 4A9FA 1E6IA 4TT2A 4Z6HA 5A5RA 4HBXA 2F6NA 5FE1A 5CUDA 3ONIA 2R0VA 2EJNA 4YYGA 5LKXA 4NS5A 4YAXA 5A5QA 4QEUA 3QZVA 5F60A 1EQFA 4WHUA 4WIVA 3G0JA 4A9LA 3VKHA 3P1DA 5HQ5A 4LYIA 4OUFA 3U5NA 4CUQA 4A9NA 2E7NA 5FFWA 5FH6A 5F62A 4YBMA 5E3GA 3QZTA 5FE9A 4J0RA 5L8TA 3UVWA 5ACYA 4HXNA 2DVRA 4QYLA 2OUOA 5CUGA 4MR6A 5FE6A 5DKCA 5KTWA 4HXPA 5FE7A 4Z1SA 4LC2A 5HM0A 5CS8A 2DVVA 3Q2EA 4UYFA 5D3LA 1X0JA 4O7EA 4TT4A 4YYNA 5IGNA 5F25A 4QR3A 4MEPA 1JSPB 3JVJA 3O33A 3TLPA 1ZKRA 3JVLA 5EPRA 5L96A 4NUDA 4UIVA 5A83A 5FE2A 4TS8A 4LDFA 4CL9A 2NXBA 5LKTA 4NYVA 4X2IA 4AI6A 4NRCA 5EPBA 3U5PA 4YY4A 5AD3A 5BT5A 4OGIA 5DFDA 4XUBA 5LJ0A 4XY8A 5CUCA 5ENEA 3MUKA 4O70A 2OO1A 5EWVA 5D3NA 4NR8A 5AMEA 5G4SA 5CZGA 5CQ8A 4ALGA 5CRZA 3P5OA 5EISA 4YY6A 4YYDA 4QSQA 2DVSA 4YH4A 4ZQLA 4MENA 4Y03A 5FG6A 4BW4A 4YABA 5TCMA 4ALHA 4YYIA 4A9KA 5CQ6A 4ZC9A 5I83A 4QSPA 3RCWA 4HXLA 4YYKA 4DONA 5EPSA 3O35A 4XUAA 5I1QA 5FE3A 5ETDA 5CU8A 4E96A 1F68A 3D7CA 1N72A 4YK0A 5HJCA 2E7OA 5AMFA 4PS5A 4CFLA 3D1DA 2LSPB 4HBWA 4UYEA 5HQ6A 4KCXA 4YBTA 4QR4A 4CUPA 3I3JA 4BHWA 4NR4A 5EWHA 4TYLA 5EU1A 5DYUA 3MULA 5D0CA 2DATA 3U5LA 5H85A 4RVRA 5FFYA 3VKGA 3UV2A 4A9EA 5CTLA 5H1VA 5FE4A 4TZ2A 5F1HA 5D3HA 5DKDA 2YQDA 3DWYA 5HLSA 5KTUA 4OGJA
chains in the Genus database with same CATH topology
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