5DKHA

Crystal structure of the bromodomain of human brm (smarca2) in complex with a hydroxyphenyl propenone inhibitor 17
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L2
publication title Crystal structure of the bromodomain of human BRM (SMARCA2) in complex with a hydroxyphenyl propenone inhibitor 17
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.6.4.-:
pdb deposition date 2015-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5dkhA00
5D3SA 3JVJA 5A82A 5FG6A 5K29A 3MULA 4YC9A 4WHUA 5LKZA 3HMEA 5EWCA 5AMEA 5A5RA 5LKTA 4KCXA 4QEUA 5A5NA 4O70A 4QC3A 5L8UA 1X0JA 5I86A 2RFJA 5CQ6A 4NXJA 5KU3A 3U5LA 4HXLA 5EPRA 5E0RA 4LZRA 4QBMA 5ACYA 4LR6A 5C7NA 2R10A 4A9MA 4LZ2A 2DVVA 3UV4A 5KO4A 4YADA 2F6NA 4A9HA 5EV9A 5DX4A 5JI8A 5FH8A 5E9LA 4PTBA 5CGPA 2DWWA 4O74A 4YH3A 4A9FA 4E96A 5AD3A 3AQAA 4QR5A 2WP2A 2LSPB 4QSRA 3UW9A 5HRXA 2OSSA 4YYDA 4ALHA 5F25A 4GPJA 4A9NA 3TLPA 4A9KA 5H85A 5DFDA 5CQAA 4C66A 5CTLA 5D7XA 3MXFA 4O78A 5ENGA 4QSWA 4HBWA 5CP5A 5L8TA 5DYCA 5F61A 5D0CA 4XYAA 5D25A 4F3IA 5ENBA 3SVFA 4A9EA 2DVQA 4CUQA 4O7AA 4TZ2A 5A5OA 2E3KA 5FE0A 3U5PA 4UYFA 2WP1A 5J0DA 4TQNA 5FE4A 5HM0A 4O7EA 5HEMA 5CQ3A 2DVRA 3S92A 4NUCA 3UVYA 4LYWA 4MR4A 4FLPA 5A5PA 4YYGA 3AADA 5FB1A 4ZQLA 4O7CA 3MB3A 5IG6A 4UYFB 3LQHA 4BHWA 4NR6A 5FG5A 5D26A 4HXPA 4A9OA 4XUAA 4UYDA 4QEVA 5F3AA 4O7FA 5C4QA 1F68A 4YAXA 4PS5A 4Z6IA 4Z6HA 5EWWA 4CUSA 4NR9A 4CUPA 4UYEA 5D3PA 5FE8A 4YYIA 4NS5A 5FBXA 4CLBA 5DW2A 3UVXA 4XY9A 4NRAA 3GG3A 5E3GA 5F62A 1ZS5A 5FE6A 1N72A 5CUGA 4A9LA 4QSSA 5EP7A 4UYGA 2R0YA 2DKWA 4N4FA 5FE2A 5FFYA 5C8GA 1WUGA 2RO1A 5COIA 5C85A 4J0SA 4QNSA 3G0JA 1WUMA 2L85A 5EPSA 5A7CA 5FE9A 5FB0A 5IIDA 5A81A 4QZSA 4YK0A 5CFWA 2DVSA 2RNWA 5EA1A 5EM3A 2I7KA 4HBYA 4LYSA 4IOQA 3JVLA 4QR3A 5EGUA 4LRGA 5F1HA 4QUTA 5DKDA 4XUBA 5IBNA 2D9EA 4BW3A 4YY6A 5E7DA 5HCLA 5LVRA 3QZSA 5DYUA 5BT3A 5LJ2A 5E9MA 5E9KA 4TU6A 2G4AA 4IOOA 5ENCA 2R0VA 4MR5A 5D3RA 3UV2A 3HMHA 5HENA 3QZVA 5EWHA 5FE1A 2KTBB 5CQ8A 4BW2A 4XY8A 5EPBA 4TU4A 5HRWA 3I3JA 4UIZA 4YYMA 5D3JA 5KTWA 3LJWA 4HXKA 4NRCA 4O71A 3JVKA 4LC2A 5TCMA 5HQ6A 4PCEA 4Q0OA 2YW5A 2L84A 5LJ1A 5ENHA 4J1PA 4OGIA 5I1QA 4QSVA 5L99A 3O34A 5FFVA 4IR5A 2OO1A 5CUEA 5CPEA 5I7YA 5IGKA 2R0SA 5G4RA 4YATA 5DLZA 2D82A 4UIUA 2F6JA 4ALGA 5CQ4A 5EWVA 2RI7A 2RNXA 4BW1A 3RCWA 5HFRA 4ZC9A 4N4IA 4LDFA 3O36A 5KTUA 4OUFA 4WHWA 4LYIA 3U5MA 5FG4A 4QEWA 4NYXA 4MEPA 4HBVA 4ZW1A 4IORA 3FKMX 4TT6A 4CL9A 4LZSA 5CUDA 5DBMA 5I83A 5E3DA 5F5ZA 4KV1A 4CFKA 5ENEA 3MQMA 5ENJA 4IR3A 4CUTA 5E9IA 2E7OA 3LQIA 4TT2A 5HQ7A 5D3TA 3DAIA 2H60A 5KHMA 4NR4A 2OUOA 5EICA 5C87A 3SVGA 5I88A 2FSAA 2NXBA 5CUBA 4CFLA 4MEOA 4UIYA 3UV5A 4CURA 5H1TA 3G0LA 4PY6A 3SVHA 5FE3A 5ENIA 4Y03A 4HXRA 3NXBA 5DYAA 5D3HA 2YYNA 4YYHA 5F63A 3ONIA 5CQ5A 3U5KA 3UVWA 4MR6A 4IR4A 3U5JA 4NUEA 5DLXA 5I89A 4QYLA 4HXMA 5HJCA 4AKNA 5E9YA 3P1EA 4J0RA 1E6IA 5KTXA 3ZYUA 4UIVA 4C67A 4QSUA 5AMFA 3K2JA 3U5NA 4MENA 3S91A 4X2IA 4WIVA 4TYLA 5LKXA 5DKHA 4YYJA 4BW4A 5F36A 2RNYA 4CUUA 4NRBA 5DYXA 5A5QA 5CRZA 3MUKA 5II1A 4O75A 5EWDA 5CRMA 5ETBA 5ETDA 3P5OA 5LVQA 3MB4A 5EVAA 2L5EA 4TT4A 5CQ7A 4DONA 5I29A 5EK9A 4QYDA 4NYVA 4QSQA 4Z93A 3P1DA 3QZTA 5HFQA 4O77A 5I80A 5EQ1A 3P1CA 5CY9A 5CUCA 4IR6A 5A83A 4N4HA 4UITA 3D7CA 5FH6A 4Z1SA 5FE7A 5DFCA 4TS8A 4HBXA 2RS9B 5L97A 5F2PA 4YBSA 5IGLA 4QUUA 5H1UA 5CU8A 4MEQA 5FE5A 4YH4A 5FH7A 4UYHA 5E9VA 4NQNA 2YQDA 2YELA 5A5SA 5CS8A 2YDWA 4QSXA 4YY4A 5LUUA 5EI4A 4QSTA 4N4GA 4Z1QA 5BT4A 5E74A 5H1VA 5LKUA 3Q2EA 4TTEA 2DATA 3LXJA 4HXSA 4QSPA 5HRVA 4NR8A 5BT5A 5AD2A 4NR5A 4O72A 5DFBA 4J3IA 4HXOA 4KV4A 4OGJA 4QB3A 5D3NA 4A9IA 5ENFA 5HELA 5C89A 5DKCA 4O7BA 4TZ8A 5IGMA 3Q2FA 5TB6A 4PKLA 5L96A 3HMFA 4PCIA 5II2A 5A85A 5L98A 5LJ0A 3IU6A 3LQJA 4N3WA 2I8NA 5F1LA 5D24A 3O33A 4YYKA 4NR7A 5HQ5A 5G4SA 2YEMA 4RVRA 5CQTA 5EU1A 4YABA 5HLSA 3P1FA 2YEKA 3IU5A 1EQFA 5FFWA 5F60A 5IGNA 4MR3A 2MJVB 5DY7A 3DWYA 5CUAA 5EISA 4HXNA 2GRCA 5FDZA 4Q0NA 4QY4A 3U5OA 4YBMA 2E7NA 4NYWA 5E73A 4NUDA 5I7XA 4BJXA 1JM4B 4QR4A 5D3LA 5JWMA 5I40A 5DW1A 4O76A 4UIXA 3JVMA 4QC1A 4A9JA 4YYNA 3O35A 4YBTA 4UIWA 2N9GA 1JSPB 3O37A 3UVDA 5CZGA 4NQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AKGA 5D3SA 3JVJA 5A82A 5FG6A 5K29A 3MULA 4YC9A 4WHUA 5LKZA 3HMEA 5EWCA 5AMEA 5A5RA 5LKTA 4KCXA 4QEUA 5A5NA 4O70A 4QC3A 5L8UA 1X0JA 5I86A 2RFJA 5CQ6A 4NXJA 5KU3A 3U5LA 4HXLA 5EPRA 5E0RA 4LZRA 4QBMA 5ACYA 4LR6A 5C7NA 2R10A 3D1DA 4A9MA 4LZ2A 2DVVA 3UV4A 5KO4A 4YADA 2F6NA 4A9HA 5EV9A 3VKHA 5DX4A 5JI8A 1ZKRA 5FH8A 5E9LA 4PTBA 5CGPA 2DWWA 4O74A 4YH3A 4A9FA 4E96A 5AD3A 3AQAA 4QR5A 2WP2A 2LSPB 4QSRA 3UW9A 5HRXA 2OSSA 4YYDA 4ALHA 5F25A 1PUOA 4GPJA 4A9NA 3TLPA 4A9KA 5H85A 5DFDA 5CQAA 4C66A 5CTLA 5D7XA 3MXFA 4O78A 5ENGA 4QSWA 4HBWA 5CP5A 5L8TA 5DYCA 5F61A 5D0CA 4XYAA 5D25A 4F3IA 5ENBA 3SVFA 4AKIA 4A9EA 2DVQA 4CUQA 4O7AA 4TZ2A 5A5OA 2E3KA 5FE0A 3U5PA 4UYFA 2WP1A 5J0DA 4TQNA 5FE4A 5HM0A 4O7EA 5HEMA 5CQ3A 2DVRA 3S92A 4NUCA 3UVYA 4LYWA 4MR4A 4FLPA 5A5PA 4YYGA 3AADA 5FB1A 4ZQLA 4O7CA 3MB3A 5IG6A 4UYFB 3LQHA 4BHWA 4NR6A 5FG5A 5D26A 4HXPA 4A9OA 4XUAA 4UYDA 4QEVA 5F3AA 4O7FA 5C4QA 1F68A 4YAXA 4PS5A 4Z6IA 4Z6HA 5EWWA 4CUSA 4NR9A 4CUPA 4UYEA 5D3PA 5FE8A 4YYIA 4NS5A 5FBXA 4CLBA 5DW2A 3UVXA 4XY9A 4NRAA 3GG3A 5E3GA 5F62A 1ZS5A 5FE6A 1N72A 5CUGA 4A9LA 4QSSA 5EP7A 4UYGA 2R0YA 2DKWA 4N4FA 5FE2A 5FFYA 5C8GA 1WUGA 2RO1A 5COIA 5C85A 4J0SA 4QNSA 3G0JA 1WUMA 2EJNA 2L85A 5EPSA 5A7CA 5FE9A 5FB0A 5IIDA 5A81A 4QZSA 4YK0A 5CFWA 2DVSA 2RNWA 5EA1A 5EM3A 2I7KA 4HBYA 4LYSA 4IOQA 3JVLA 4QR3A 5EGUA 4LRGA 5F1HA 4QUTA 5DKDA 4XUBA 5IBNA 2D9EA 4BW3A 4YY6A 5E7DA 5HCLA 5LVRA 3QZSA 5DYUA 5BT3A 5LJ2A 5E9MA 5E9KA 4TU6A 2G4AA 4IOOA 5ENCA 2R0VA 4MR5A 5D3RA 3UV2A 3HMHA 5HENA 3QZVA 5EWHA 5FE1A 2KTBB 5CQ8A 4BW2A 4XY8A 5EPBA 4TU4A 5HRWA 3I3JA 4UIZA 4YYMA 5D3JA 5KTWA 3LJWA 4HXKA 4NRCA 4O71A 3JVKA 4LC2A 5TCMA 5HQ6A 4PCEA 4Q0OA 2YW5A 2L84A 5LJ1A 5ENHA 4J1PA 4OGIA 5I1QA 4QSVA 5L99A 3O34A 5FFVA 4IR5A 2OO1A 5CUEA 5CPEA 5I7YA 5IGKA 2R0SA 5G4RA 4YATA 5DLZA 2D82A 4UIUA 2F6JA 4ALGA 5CQ4A 5EWVA 2RI7A 2RNXA 4BW1A 3RCWA 5HFRA 4ZC9A 4AI6A 4N4IA 4LDFA 3O36A 5KTUA 4OUFA 4WHWA 4LYIA 3U5MA 5FG4A 4QEWA 4NYXA 4MEPA 4HBVA 4ZW1A 4IORA 3FKMX 4TT6A 4CL9A 4LZSA 5CUDA 5DBMA 5I83A 5E3DA 5F5ZA 4KV1A 4CFKA 5ENEA 3MQMA 5ENJA 4IR3A 4CUTA 5E9IA 2E7OA 3LQIA 4TT2A 5HQ7A 5D3TA 3DAIA 2H60A 5KHMA 4NR4A 2OUOA 5EICA 5C87A 3SVGA 5I88A 2FSAA 2NXBA 5CUBA 4CFLA 4MEOA 4UIYA 3UV5A 4CURA 5H1TA 3G0LA 4PY6A 3SVHA 5FE3A 5ENIA 4Y03A 4HXRA 3NXBA 5DYAA 5D3HA 2YYNA 4YYHA 5F63A 3ONIA 5CQ5A 3U5KA 3UVWA 4MR6A 4IR4A 3U5JA 4NUEA 5DLXA 5I89A 4QYLA 4HXMA 5HJCA 4AKNA 5E9YA 3P1EA 4J0RA 1E6IA 5KTXA 3ZYUA 4UIVA 4C67A 4QSUA 5AMFA 3K2JA 3U5NA 4MENA 3S91A 4X2IA 4WIVA 4TYLA 5LKXA 5DKHA 4YYJA 4BW4A 5F36A 2RNYA 4CUUA 4NRBA 5DYXA 5A5QA 5CRZA 3MUKA 5II1A 4O75A 5EWDA 5CRMA 5ETBA 5ETDA 3P5OA 5LVQA 3MB4A 5EVAA 2L5EA 4TT4A 5CQ7A 4DONA 5I29A 5EK9A 4QYDA 4NYVA 4QSQA 4Z93A 3P1DA 3QZTA 5HFQA 4O77A 5I80A 5EQ1A 3P1CA 5CY9A 5CUCA 4IR6A 5A83A 4N4HA 4UITA 3ERRA 3D7CA 5FH6A 4Z1SA 5FE7A 5DFCA 4TS8A 4HBXA 2RS9B 5L97A 5F2PA 4YBSA 5IGLA 4QUUA 5H1UA 5CU8A 4MEQA 5FE5A 4YH4A 5FH7A 4UYHA 5E9VA 4NQNA 2YQDA 2YELA 5A5SA 5CS8A 2YDWA 4QSXA 4YY4A 5LUUA 5EI4A 4QSTA 4N4GA 4Z1QA 5BT4A 5E74A 5H1VA 5LKUA 3Q2EA 3D1BA 4TTEA 2DATA 3LXJA 4HXSA 4QSPA 5HRVA 4NR8A 5BT5A 5AD2A 4NR5A 4O72A 5DFBA 4J3IA 4HXOA 4KV4A 4OGJA 4QB3A 5D3NA 4A9IA 5ENFA 5HELA 5C89A 5DKCA 4O7BA 4TZ8A 5IGMA 3Q2FA 5TB6A 4PKLA 5L96A 3HMFA 4PCIA 5II2A 5A85A 5L98A 5LJ0A 3IU6A 3LQJA 4N3WA 2I8NA 5F1LA 5D24A 3O33A 4YYKA 4NR7A 5HQ5A 5G4SA 2YEMA 3VKGA 4RVRA 5CQTA 5EU1A 4YABA 5HLSA 3P1FA 2YEKA 3IU5A 1EQFA 5FFWA 5F60A 5IGNA 4MR3A 2MJVB 5DY7A 3DWYA 5CUAA 5EISA 4AKHA 4HXNA 2GRCA 5FDZA 4Q0NA 4QY4A 3U5OA 4YBMA 2E7NA 4NYWA 5E73A 4NUDA 5I7XA 4BJXA 1JM4B 4QR4A 5D3LA 5JWMA 5I40A 5DW1A 4O76A 4UIXA 3JVMA 4QC1A 4A9JA 4YYNA 3O35A 4YBTA 4UIWA 2N9GA 1JSPB 3O37A 3UVDA 5CZGA 4NQMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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