4O70A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with dinaciclib
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o70A01
5EV9A 4CLBA 4Z1QA 5FH8A 5F1LA 5EVAA 5C85A 2YW5A 4YH3A 5EK9A 3UV4A 4YYHA 5I1QA 4O7FA 5FFVA 4NR7A 5D3NA 2F6NA 2YEKA 4UIZA 5CUEA 4ZQLA 3U5PA 5CP5A 4UIUA 3P5OA 4KCXA 2DVRA 5F2PA 4HXSA 5D3JA 4LZRA 4A9EA 4HXOA 5L97A 2E7NA 5E3GA 5EQ1A 4PS5A 3S92A 5L8UA 5D26A 2I8NA 2RS9B 4YK0A 5AMEA 3JVLA 5FE3A 3UV5A 5E73A 5E0RA 5LJ2A 4YH4A 5CTLA 4QEWA 5A5PA 2YQDA 5FFWA 4FLPA 4IOOA 4QY4A 5HCLA 3NXBA 5F60A 5E9MA 2RNXA 4N4HA 4TS8A 5HQ6A 5FDZA 4QNSA 4TT4A 4NR8A 4GPJA 4MR4A 4NYVA 5E3DA 5I86A 4QUTA 5D3TA 4TYLA 2E3KA 5KHMA 5FG4A 2KTBB 5L8TA 5DYUA 4HBXA 2OSSA 5IGLA 5CGPA 5CUBA 5A82A 2WP2A 4Y03A 4CL9A 5I7YA 4UYDA 5CQ6A 4XUBA 1WUGA 5C7NA 5ENJA 5HRWA 3HMFA 3LQJA 3QZSA 4KV1A 4CUTA 3QZTA 4YBTA 4O75A 4O78A 4O74A 5ENFA 3MQMA 4YC9A 5CPEA 5DW2A 4OGIA 4A9OA 4OGJA 4Z93A 5HJCA 2NXBA 4NYWA 5DBMA 5E9KA 4TU6A 4O77A 5FB0A 3MB4A 5E74A 4HBYA 4YYJA 5CU8A 5FE1A 2I7KA 3G0LA 5A5NA 5EM3A 3AQAA 5CQ4A 4QYDA 5HQ5A 4YADA 4QEVA 5CQ7A 5BT3A 5I7XA 4IR5A 4YYMA 2R10A 5EP7A 5E9VA 4NUDA 4E96A 2DVSA 4BW3A 5FG6A 4A9FA 4UYGA 4MEQA 4UYFB 5CZGA 5K29A 5F61A 5DFBA 5HM0A 3MUKA 5LJ0A 5CRMA 4AKNA 4PCIA 3O37A 5EPRA 2DWWA 5FE2A 4QBMA 4LR6A 5DKDA 4TQNA 2LSPB 2WP1A 3MB3A 4BW2A 4TT6A 5IIDA 4NXJA 5FE9A 4UIVA 5FB1A 3ONIA 4F3IA 4CUPA 5FE0A 2YEMA 5ENEA 5HELA 3GG3A 2RI7A 5HLSA 3SVGA 5DYAA 5IG6A 5CRZA 4NS5A 3TLPA 4TU4A 4YY6A 1E6IA 3SVFA 5FBXA 5G4RA 5DLZA 5LJ1A 5D3PA 2RNYA 4N4GA 4O7EA 5JWMA 2L5EA 4HXMA 5E7DA 4A9MA 4RVRA 5EGUA 5ETBA 4YATA 4XUAA 5L98A 1JM4B 5COIA 3UV2A 3O33A 4PKLA 2DATA 4TTEA 5DFDA 4UYEA 5H1VA 5KTWA 4KV4A 4QSXA 4XY9A 4A9NA 4J0SA 5ENBA 4NR9A 4J1PA 4O76A 3I3JA 3JVJA 4YYNA 4NUCA 5CFWA 5DW1A 4YYIA 5FE5A 3MULA 4QB3A 5C87A 4QUUA 4CUSA 5D3LA 4PCEA 3O36A 4QSTA 4XYAA 4IORA 5AD2A 2GRCA 4LC2A 5DFCA 4NRBA 4O7AA 3U5MA 3IU6A 5EA1A 5TCMA 5DLXA 2R0YA 1ZS5A 1N72A 3QZVA 5FH6A 5HRXA 4Q0OA 4C66A 4J3IA 2DVQA 4ZW1A 4LDFA 2FSAA 3DAIA 4NR5A 4CURA 5G4SA 3LJWA 5HFRA 4Z6HA 5CUDA 4HXLA 5ENHA 4J0RA 3UVYA 4ZC9A 5II1A 4UYHA 5A83A 5EWVA 4UYFA 5DYCA 3UW9A 4O7CA 5CUAA 4NRCA 5F25A 4QEUA 4O70A 4HBWA 3RCWA 4LYWA 4X2IA 5HENA 2F6JA 3U5JA 3UVXA 4IOQA 4NQNA 5DX4A 4IR3A 5H1TA 3SVHA 4CUUA 4ALGA 2DVVA 4QSSA 2DKWA 5D3HA 5ENGA 5A5SA 5FH7A 3JVMA 5CQ5A 4A9JA 4QSUA 4TZ2A 5FE4A 5I89A 4PY6A 4NR6A 4N3WA 4ALHA 5C8GA 4UIWA 3S91A 5F5ZA 4XY8A 5EPSA 5LVQA 5DY7A 4NYXA 4YYGA 1F68A 4MR3A 5A81A 5EPBA 5HRVA 4MENA 5DYXA 5IGNA 5F63A 5F3AA 4TZ8A 4IR4A 4A9IA 5CUGA 4LRGA 4A9LA 2H60A 4LZ2A 5ETDA 5KTUA 4QSPA 3UVWA 4CFKA 5E9LA 5FE6A 4Z6IA 3K2JA 4BW4A 3O35A 3U5LA 4HXKA 4BHWA 4QSRA 5I80A 4QC3A 5LKZA 5IBNA 4HBVA 3LQHA 5D25A 4Z1SA 5II2A 4YABA 5E9IA 4C67A 5A7CA 2OUOA 4YAXA 4OUFA 4LYSA 5H1UA 2YDWA 4QSVA 4QSQA 2G4AA 4O7BA 4QR5A 4HXNA 5JI8A 5D3SA 4A9HA 2R0VA 5LUUA 2R0SA 5AD3A 4Q0NA 1X0JA 4YBSA 5ACYA 2RO1A 4DONA 5EWCA 5CUCA 5C89A 4N4FA 3Q2EA 4LZSA 4BW1A 2RNWA 5AMFA 3LQIA 4NR4A 3U5OA 4MEOA 5LKTA 5EICA 4N4IA 4MR6A 4YYDA 5CQTA 3LXJA 5IGMA 3HMHA 4NUEA 4O71A 4LYIA 3FKMX 5FE8A 3DWYA 4WHWA 4HXPA 5LKUA 5DKHA 4QZSA 2RFJA 4NRAA 5FE7A 4A9KA 4YY4A 5EWWA 5EWHA 5CS8A 5CQ8A 4QSWA 5L99A 2YELA 5J0DA 3ZYUA 5I40A 3UVDA 5F36A 5A5RA 4O72A 5EISA 5LKXA 5A5QA 3P1FA 3HMEA 5HEMA 4WHUA 5D24A 2L84A 5I83A 2D82A 4UIXA 3D7CA 3JVKA 4CUQA 4WIVA 2MJVB 4PTBA 5EI4A 5IGKA 4NQMA 5BT4A 5KTXA 3AADA 4BJXA 5FG5A 3U5NA 4QR4A 3O34A 4YYKA 2D9EA 2N9GA 3MXFA 1EQFA 5HFQA 4IR6A 5D3RA 5D7XA 5DKCA 3Q2FA 5LVRA 5BT5A 5H85A 5CQAA 2OO1A 1JSPB 5EU1A 3G0JA 5L96A 1WUMA 3P1DA 5ENIA 5F1HA 3P1EA 3U5KA 5TB6A 5A5OA 4QYLA 5KO4A 3P1CA 5D0CA 4CFLA 2L85A 5E9YA 4QR3A 5HQ7A 5I29A 2YYNA 5CY9A 4HXRA 4MR5A 4TT2A 5EWDA 4QC1A 4YBMA 4UITA 5CQ3A 4UIYA 5F62A 4MEPA 5ENCA 5FFYA 5A85A 5I88A 5C4QA 5KU3A 2E7OA 3IU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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