4O70A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with dinaciclib
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o70A01
5LKUA 3U5JA 5IIDA 5C89A 1JSPB 4NS5A 5FE5A 5I83A 4YYIA 4O76A 5HEMA 4CUPA 2L5EA 4QC1A 4F3IA 3O35A 5A5SA 5ENBA 4Z1QA 3JVMA 5KHMA 3MB4A 4BW1A 5CS8A 3LQHA 5TB6A 4QUUA 5DX4A 5DYAA 4OUFA 5TCMA 4HBXA 4NR7A 5LJ1A 4MR4A 2FSAA 2YYNA 4KV1A 5F1HA 5FH6A 3HMFA 1ZS5A 4IR4A 5HRWA 2R0SA 5ENHA 5ENIA 4E96A 4Z6HA 4N4HA 2DKWA 5C85A 1E6IA 3SVGA 4YAXA 5HFQA 4TTEA 5DLXA 4OGIA 4CUSA 4MEQA 2YDWA 3DWYA 5F5ZA 4O7FA 3D7CA 5EU1A 4HXSA 4NRBA 3K2JA 4HBVA 5CZGA 5E9VA 5CQ6A 2R10A 4MEOA 5DW2A 5CUDA 3G0LA 2OO1A 4O72A 5A85A 5CPEA 4LYWA 4IOOA 4LR6A 5H85A 5FFYA 5F62A 5H1UA 4YATA 4NYWA 2R0VA 1WUGA 4QSPA 3HMEA 4YYMA 4QEVA 3U5PA 4QSWA 3O36A 5A82A 5FFVA 5FB1A 5FE2A 3JVKA 4AKNA 4HXMA 3FKMX 2DVVA 5DBMA 4QSTA 5D3JA 1EQFA 5CP5A 5EISA 5II2A 4QYLA 2RNWA 4WHWA 4N4IA 4O71A 2NXBA 4XUBA 2RI7A 5EWDA 5DKCA 4QBMA 5LJ0A 3U5KA 2L84A 4A9IA 5L8UA 5D7XA 5CQ4A 4LZ2A 4CFLA 5EGUA 4LYSA 4TU4A 4QEUA 5EI4A 5ETBA 4CLBA 4NRCA 2I8NA 5HJCA 4A9JA 2YELA 1F68A 2LSPB 3QZTA 3UVWA 4Z1SA 5D25A 5CUCA 4Z6IA 5I29A 4PY6A 5DKDA 4YY4A 4O77A 4QUTA 5CUAA 5FE8A 4LYIA 4YYNA 5EPBA 4UYDA 5DFBA 4O7CA 2OUOA 4TU6A 4UITA 2RFJA 4A9NA 2DATA 4QYDA 3IU5A 4HXPA 4PTBA 5L99A 4YH4A 5H1TA 3AADA 4YYDA 4NXJA 3JVLA 5CQ8A 2RS9B 5CUBA 3UVYA 3U5NA 4KV4A 5D3RA 5EVAA 3ONIA 4YH3A 4HBWA 5EM3A 5HQ7A 4QR4A 2L85A 5E3GA 5CY9A 5FE1A 5HELA 3UV2A 5J0DA 5CRMA 2E7NA 4HXKA 4CFKA 4UYGA 4DONA 5AD3A 2RNYA 5ENFA 4UYFB 3P5OA 5CQ7A 5E9IA 4MR5A 4X2IA 3U5LA 4UYFA 5AMEA 5EK9A 3S91A 4UYHA 5EA1A 5CQTA 5I7YA 4Q0OA 5IG6A 3NXBA 4N4FA 3P1DA 4YBTA 5EPSA 4O78A 4WIVA 3U5MA 4IR5A 4QSUA 4LRGA 5EV9A 4N3WA 5FE9A 5IGNA 4Q0NA 5ENGA 4BW4A 2GRCA 4NUEA 3I3JA 4TYLA 5EQ1A 2D82A 5F61A 3QZVA 4NQMA 3SVHA 5ACYA 4QSQA 5E73A 4O74A 4IOQA 5FH7A 3LQJA 5KU3A 5LVRA 4NRAA 4BW2A 3LQIA 4NR6A 5E9LA 3SVFA 4J3IA 5EWVA 5BT4A 4HXRA 4UIWA 4J1PA 5JI8A 3LJWA 4Z93A 2R0YA 5F25A 1WUMA 4YABA 5D3PA 5FE4A 3UW9A 5FB0A 5A5NA 5AD2A 2RNXA 4XUAA 4PCIA 5F60A 5I40A 3O33A 5DYUA 5DW1A 5L96A 4YK0A 5F2PA 4A9FA 5A81A 2E3KA 5IGMA 5G4RA 4YBSA 4NYVA 3RCWA 3P1CA 4ZC9A 4J0RA 5CQ5A 4UIZA 5D3SA 4C67A 5EP7A 5FE3A 5I89A 2I7KA 2N9GA 4HBYA 5L8TA 4BJXA 5LKXA 5FH8A 5C4QA 5HQ6A 4TZ2A 5COIA 5ENJA 5II1A 3Q2EA 4PKLA 5G4SA 5KTUA 4QZSA 5KO4A 3MUKA 5DLZA 4CUQA 5IGKA 5E7DA 4NR9A 2MJVB 4RVRA 3IU6A 2DWWA 3DAIA 5KTWA 5L98A 3P1FA 5H1VA 5A5RA 2G4AA 4LZRA 4QSSA 4GPJA 5D24A 4YY6A 5EWCA 3UV5A 5HLSA 5DFDA 4HXOA 4CUUA 2DVQA 5F63A 4J0SA 5HRXA 5DFCA 5A5OA 3ZYUA 4QC3A 4NYXA 4QR3A 4QR5A 5HQ5A 5EICA 5DYXA 5C87A 3UVXA 2YQDA 4UIXA 5A5QA 4HXNA 5CUEA 2WP1A 5HCLA 5EWHA 5A7CA 5ENEA 5IBNA 4QY4A 3U5OA 4BW3A 2H60A 5D3LA 5IGLA 5CU8A 4TQNA 3S92A 3Q2FA 5FG4A 4UYEA 4PS5A 4A9HA 4YYHA 4NR5A 5ENCA 5I80A 5I88A 4O7AA 4KCXA 5BT5A 4TT2A 4BHWA 5HM0A 5CTLA 3UV4A 4XYAA 5FE6A 5D3NA 4QEWA 3G0JA 2D9EA 4TT4A 5F1LA 4XY9A 4QSRA 3MULA 4FLPA 4CL9A 5LKTA 4IORA 4TZ8A 5HRVA 5I1QA 2E7OA 5DKHA 3QZSA 2OSSA 4ZQLA 3UVDA 3JVJA 3MXFA 4UIUA 5A83A 5I7XA 5AMFA 5FDZA 5CUGA 5EPRA 5I86A 5E9YA 4NR4A 5E3DA 3HMHA 5FG6A 5CGPA 4MR3A 4WHUA 5F3AA 4HXLA 2WP2A 5HFRA 2F6JA 2YEKA 4YBMA 4O7EA 4A9OA 5FG5A 5C8GA 4QB3A 5CFWA 4CURA 4PCEA 3MB3A 3TLPA 4UIVA 5E0RA 2YW5A 4N4GA 4YYJA 5D3HA 3O34A 4O7BA 5EWWA 4QNSA 2YEMA 4NR8A 4O70A 4C66A 4NUCA 4XY8A 5FE0A 4IR3A 5CQ3A 5FFWA 4MENA 5K29A 4ZW1A 5DY7A 5E9MA 4NQNA 2F6NA 5E74A 5DYCA 4UIYA 4Y03A 4LZSA 5FBXA 5ETDA 4OGJA 5CRZA 3MQMA 3P1EA 4A9MA 2DVSA 5BT3A 2KTBB 4MEPA 4NUDA 4A9LA 5LVQA 3GG3A 5F36A 5D3TA 5CQAA 5L97A 4LDFA 5LJ2A 5D0CA 5FE7A 5LUUA 2DVRA 4IR6A 5C7NA 1X0JA 4ALHA 5HENA 5JWMA 3O37A 5E9KA 4O75A 4CUTA 3LXJA 4YYKA 5A5PA 1JM4B 4QSXA 4MR6A 4YC9A 3AQAA 4ALGA 5KTXA 5D26A 4LC2A 1N72A 4TS8A 4QSVA 4A9KA 4TT6A 5LKZA 2RO1A 4A9EA 4YADA 4YYGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LKUA 3U5JA 5IIDA 5C89A 1JSPB 4NS5A 5FE5A 5I83A 4YYIA 4O76A 5HEMA 4CUPA 2L5EA 4QC1A 4F3IA 3O35A 5A5SA 5ENBA 4Z1QA 3JVMA 5KHMA 3MB4A 4BW1A 5CS8A 3LQHA 5TB6A 4QUUA 5DX4A 5DYAA 1PUOA 4OUFA 5TCMA 4HBXA 4NR7A 5LJ1A 4MR4A 2FSAA 2YYNA 4KV1A 5F1HA 5FH6A 3HMFA 1ZS5A 4IR4A 5HRWA 2R0SA 5ENHA 5ENIA 4E96A 4AKHA 4Z6HA 4N4HA 2DKWA 5C85A 1E6IA 3SVGA 4YAXA 5HFQA 4TTEA 5DLXA 4OGIA 4CUSA 4MEQA 2YDWA 3DWYA 5F5ZA 4O7FA 3D7CA 5EU1A 4HXSA 4NRBA 3K2JA 4HBVA 5CZGA 3VKGA 5E9VA 5CQ6A 2R10A 4MEOA 5DW2A 5CUDA 3G0LA 2OO1A 4O72A 5A85A 5CPEA 4LYWA 4IOOA 4LR6A 5H85A 5FFYA 5F62A 5H1UA 4YATA 4NYWA 2R0VA 1WUGA 4QSPA 3HMEA 4YYMA 4QEVA 3U5PA 4QSWA 3O36A 5A82A 5FFVA 5FB1A 5FE2A 3JVKA 4AKNA 4HXMA 3FKMX 4AI6A 2DVVA 5DBMA 4QSTA 5D3JA 1EQFA 5CP5A 5EISA 1ZKRA 5II2A 4QYLA 2RNWA 4WHWA 4N4IA 4O71A 2NXBA 4XUBA 2RI7A 5EWDA 5DKCA 4QBMA 5LJ0A 3U5KA 2L84A 4A9IA 5L8UA 5D7XA 5CQ4A 4LZ2A 4CFLA 5EGUA 4LYSA 4TU4A 4QEUA 5EI4A 5ETBA 4CLBA 4NRCA 2I8NA 5HJCA 4A9JA 2YELA 1F68A 2LSPB 3QZTA 3UVWA 4Z1SA 5D25A 5CUCA 4Z6IA 5I29A 4PY6A 5DKDA 4YY4A 4O77A 4QUTA 5CUAA 5FE8A 4LYIA 4YYNA 5EPBA 4UYDA 5DFBA 4O7CA 2OUOA 4TU6A 4UITA 2RFJA 4A9NA 2DATA 4QYDA 3IU5A 4HXPA 4PTBA 5L99A 4YH4A 5H1TA 3AADA 4YYDA 4NXJA 3JVLA 5CQ8A 2RS9B 5CUBA 3UVYA 3U5NA 4KV4A 5D3RA 5EVAA 3ONIA 4YH3A 4HBWA 5EM3A 5HQ7A 4QR4A 2L85A 5E3GA 5CY9A 5FE1A 5HELA 3UV2A 5J0DA 5CRMA 2E7NA 4HXKA 4CFKA 4UYGA 4DONA 5AD3A 2RNYA 5ENFA 4UYFB 3P5OA 5CQ7A 5E9IA 4MR5A 4X2IA 3U5LA 3VKHA 4UYFA 5AMEA 5EK9A 3S91A 4UYHA 5EA1A 5CQTA 5I7YA 3ERRA 4Q0OA 5IG6A 3NXBA 4N4FA 3P1DA 4YBTA 5EPSA 4O78A 4WIVA 3U5MA 4IR5A 4QSUA 4LRGA 5EV9A 4N3WA 5FE9A 5IGNA 4Q0NA 5ENGA 4BW4A 2GRCA 4NUEA 3I3JA 4TYLA 5EQ1A 2D82A 5F61A 3QZVA 4NQMA 3SVHA 5ACYA 4QSQA 5E73A 4AKGA 4O74A 4IOQA 5FH7A 3LQJA 5KU3A 5LVRA 4NRAA 4BW2A 3LQIA 4NR6A 5E9LA 3SVFA 4J3IA 2EJNA 5EWVA 5BT4A 4HXRA 4UIWA 4J1PA 5JI8A 3LJWA 4Z93A 2R0YA 5F25A 1WUMA 4YABA 5D3PA 5FE4A 3UW9A 5FB0A 5A5NA 5AD2A 2RNXA 4XUAA 4PCIA 5F60A 5I40A 3O33A 5DYUA 5DW1A 5L96A 4YK0A 5F2PA 4A9FA 5A81A 2E3KA 5IGMA 5G4RA 4YBSA 4NYVA 3RCWA 3P1CA 4ZC9A 4J0RA 5CQ5A 4UIZA 5D3SA 4C67A 5EP7A 5FE3A 5I89A 2I7KA 2N9GA 4HBYA 5L8TA 4BJXA 5LKXA 5FH8A 5C4QA 5HQ6A 4TZ2A 5COIA 5ENJA 5II1A 3Q2EA 4PKLA 5G4SA 5KTUA 4QZSA 5KO4A 3MUKA 5DLZA 4CUQA 5IGKA 5E7DA 4NR9A 2MJVB 4RVRA 3IU6A 2DWWA 3DAIA 5KTWA 5L98A 3P1FA 5H1VA 5A5RA 2G4AA 4LZRA 4QSSA 4GPJA 5D24A 4YY6A 5EWCA 3UV5A 5HLSA 5DFDA 4HXOA 4CUUA 2DVQA 5F63A 4J0SA 5HRXA 5DFCA 5A5OA 3ZYUA 4QC3A 4NYXA 4QR3A 4QR5A 5HQ5A 5EICA 5DYXA 5C87A 3UVXA 2YQDA 4UIXA 5A5QA 4HXNA 5CUEA 2WP1A 3D1BA 5HCLA 5EWHA 5A7CA 5ENEA 5IBNA 4QY4A 3U5OA 4BW3A 2H60A 3D1DA 5D3LA 5IGLA 5CU8A 4TQNA 3S92A 3Q2FA 5FG4A 4UYEA 4PS5A 4A9HA 4YYHA 4NR5A 5ENCA 5I80A 5I88A 4O7AA 4KCXA 5BT5A 4TT2A 4BHWA 5HM0A 5CTLA 3UV4A 4XYAA 5FE6A 5D3NA 4QEWA 3G0JA 2D9EA 4TT4A 5F1LA 4XY9A 4QSRA 3MULA 4FLPA 4CL9A 5LKTA 4IORA 4TZ8A 5HRVA 5I1QA 2E7OA 5DKHA 3QZSA 2OSSA 4ZQLA 3UVDA 3JVJA 3MXFA 4UIUA 5A83A 5I7XA 5AMFA 5FDZA 5CUGA 5EPRA 5I86A 5E9YA 4NR4A 5E3DA 3HMHA 5FG6A 5CGPA 4MR3A 4WHUA 5F3AA 4HXLA 2WP2A 5HFRA 2F6JA 2YEKA 4YBMA 4O7EA 4A9OA 5FG5A 5C8GA 4QB3A 5CFWA 4CURA 4PCEA 3MB3A 3TLPA 4UIVA 5E0RA 2YW5A 4N4GA 4YYJA 5D3HA 3O34A 4O7BA 5EWWA 4QNSA 2YEMA 4NR8A 4O70A 4C66A 4NUCA 4XY8A 5FE0A 4IR3A 5CQ3A 5FFWA 4MENA 5K29A 4ZW1A 5DY7A 5E9MA 4NQNA 2F6NA 5E74A 5DYCA 4UIYA 4Y03A 4LZSA 5FBXA 5ETDA 4OGJA 5CRZA 3MQMA 3P1EA 4A9MA 2DVSA 5BT3A 2KTBB 4MEPA 4AKIA 4NUDA 4A9LA 5LVQA 3GG3A 5F36A 5D3TA 5CQAA 5L97A 4LDFA 5LJ2A 5D0CA 5FE7A 5LUUA 2DVRA 4IR6A 5C7NA 1X0JA 4ALHA 5HENA 5JWMA 3O37A 5E9KA 4O75A 4CUTA 3LXJA 4YYKA 5A5PA 1JM4B 4QSXA 4MR6A 4YC9A 3AQAA 4ALGA 5KTXA 5D26A 4LC2A 1N72A 4TS8A 4QSVA 4A9KA 4TT6A 5LKZA 2RO1A 4A9EA 4YADA 4YYGA
chains in the Genus database with same CATH topology
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