5CQ8A

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 4'-hydroxyacetophenone (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 4'-Hydroxyacetophenone (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cq8A00
5C7NA 4XUBA 5E7DA 5LJ0A 4NYWA 3SVGA 5C4QA 5ETBA 5CUBA 4LYIA 4Q0NA 5KTXA 4QSWA 5HRXA 5KU3A 4N4GA 3UVXA 2F6NA 4UYEA 2DVVA 4QEVA 5CFWA 4MR6A 3HMHA 5F2PA 3UW9A 4Q0OA 4UIVA 3U5LA 4A9NA 5FE2A 4E96A 4NR6A 3UV5A 5IGLA 2OUOA 4MR4A 4QR3A 5I7XA 3JVJA 3MULA 5ENHA 4QUUA 2NXBA 4UYFA 4A9HA 3LQJA 5LJ1A 4NR9A 5KO4A 4UYFB 2R0VA 5HCLA 4HXLA 4XYAA 5LKTA 1JM4B 5HENA 5D3SA 3SVHA 4TQNA 4QB3A 5ENCA 2OO1A 3K2JA 5DX4A 5I1QA 2R0SA 4QBMA 2MJVB 5DYAA 2DVQA 2L5EA 4IOOA 3IU6A 4LRGA 2YEMA 4X2IA 5FBXA 3MUKA 5LVQA 4UIWA 1ZS5A 2RS9B 5CQ3A 3JVLA 4YYNA 5CQAA 5I29A 2DVSA 1E6IA 3QZTA 4TYLA 5I7YA 5EWWA 4ZW1A 3TLPA 4UITA 5A82A 4WIVA 3O35A 4Z1SA 4J0RA 5D3HA 5ENJA 4YYMA 5EWCA 4MENA 5E3DA 3SVFA 5CUEA 5HLSA 2DATA 3G0LA 4MEQA 5EA1A 4LZSA 4CUQA 4LYSA 4IR6A 4UYDA 3UVWA 5F1HA 5EK9A 5LKXA 4A9IA 5DYXA 2L84A 2RNYA 2WP1A 5D26A 5FG6A 4O7CA 4PCIA 5A83A 5IIDA 4TS8A 4PCEA 3DWYA 5DYUA 3UV4A 3O33A 3IU5A 4NUDA 4UIXA 5EWHA 3U5NA 4XY8A 5CQ5A 4NRBA 2R0YA 4PS5A 5A5PA 3ONIA 4YYKA 5FE1A 4OUFA 5CQ7A 2DKWA 3LQIA 5D3JA 4O70A 5CRMA 4BW4A 3UVDA 4IOQA 5A5OA 4LR6A 4LC2A 5FG4A 2YELA 4QSPA 4XY9A 3NXBA 5FB1A 4LZRA 5E9LA 4UIZA 5CQ6A 5A81A 4A9MA 4IR5A 5C87A 4QSVA 4NR5A 1JSPB 4KV1A 5AMFA 4TZ2A 4N4IA 4CUSA 5CZGA 4O7BA 5C89A 5A5SA 5K29A 4QSUA 4HXMA 2LSPB 5HELA 4Z93A 5D3PA 5CRZA 4CURA 5AMEA 5II1A 4J0SA 4O72A 4QSTA 4TZ8A 5DKCA 5F36A 3UVYA 5LKZA 2RO1A 5ENBA 3QZVA 5HJCA 4YBSA 4O77A 5D24A 5EVAA 5IGKA 2WP2A 3Q2EA 5KTUA 4BJXA 5I80A 4Z6IA 4IR4A 2R10A 5F25A 5H1VA 4QSXA 5A5RA 3HMFA 5FG5A 4O7AA 2E7NA 4HXPA 5KTWA 4O75A 5HRWA 5LUUA 5FE7A 5I40A 4O7EA 4A9FA 4AKNA 4YC9A 5E0RA 4QR5A 4A9EA 5HFQA 5L97A 4N4FA 4NYVA 3O37A 5CUAA 4TU6A 5A5QA 4QYDA 5HFRA 4CFKA 4QEUA 5A5NA 5ENFA 4MR5A 5CUCA 4O76A 5I88A 4RVRA 4QSQA 5E9VA 4A9JA 5CPEA 5JWMA 4HBXA 5TCMA 4YAXA 4BW3A 3P1CA 5CU8A 4HXRA 5F63A 5H1TA 3MB4A 4IR3A 4UIYA 4NR7A 4QSSA 3MXFA 4PTBA 5EPRA 4HBVA 4NYXA 4IORA 5FH6A 4BHWA 2FSAA 5J0DA 5L99A 5CQ4A 5CQTA 5F1LA 2RFJA 3P5OA 4QC3A 2D82A 3U5MA 4CUTA 5F60A 5FB0A 3U5OA 4O78A 5KHMA 4UYGA 5CP5A 5EWDA 5CGPA 5F3AA 5EICA 5FFWA 4HXSA 5CY9A 1WUGA 4QEWA 5HRVA 5FE8A 2RNXA 2E7OA 5A85A 5D3NA 4HBWA 5FE9A 4F3IA 4UYHA 4Z1QA 3GG3A 4KV4A 3JVMA 2DVRA 5ENGA 5IG6A 5D3RA 5L8UA 4HBYA 5EV9A 4XUAA 2E3KA 3LQHA 5EPBA 5EQ1A 4J3IA 5CQ8A 5FE6A 4O7FA 5EWVA 4BW2A 5D3LA 5HM0A 5E74A 5E3GA 5ACYA 5F62A 2G4AA 4CUUA 4CLBA 4O74A 4CL9A 2OSSA 5E9MA 4BW1A 5I86A 5CTLA 4YATA 5F61A 5CUGA 3RCWA 5H1UA 4ALGA 3G0JA 4YYIA 2I7KA 4C67A 3S92A 3FKMX 1N72A 4TT2A 4YK0A 5DBMA 4YY6A 4PY6A 4YY4A 5EP7A 3O36A 4TTEA 2F6JA 4N3WA 5FE3A 3LXJA 4WHUA 5DW2A 3O34A 4PKLA 5CS8A 2KTBB 5H85A 5DLXA 4NXJA 5I83A 3U5PA 5LKUA 4Y03A 4YH3A 2DWWA 5I89A 5DFCA 4YADA 3D7CA 4TT6A 4YYHA 4NRAA 5FE0A 2N9GA 2I8NA 2RNWA 3Q2FA 5DKHA 1EQFA 2GRCA 4CFLA 5A7CA 2YW5A 3LJWA 2D9EA 5HQ6A 5HQ5A 5ENIA 2L85A 5DLZA 4NQNA 5L96A 4O71A 2YDWA 3U5KA 4YBTA 1F68A 4QNSA 2YYNA 3U5JA 4NUCA 4A9OA 4LDFA 4LZ2A 5G4SA 4C66A 5L8TA 5D0CA 1WUMA 4YBMA 4MEPA 3MQMA 5ETDA 4MEOA 5EM3A 4A9KA 3P1FA 5LJ2A 4ZQLA 4DONA 4NQMA 4OGJA 4ALHA 4CUPA 5D25A 2YQDA 5FDZA 4FLPA 3DAIA 5EI4A 5FFYA 5G4RA 5F5ZA 4ZC9A 4MR3A 5TB6A 5DKDA 4NUEA 4QYLA 5BT3A 4NS5A 4UIUA 5FH8A 5EU1A 4GPJA 4N4HA 5D3TA 5DFBA 4TU4A 4NR8A 5E73A 5E9KA 4YYJA 5ENEA 4WHWA 5EGUA 3AADA 3I3JA 2RI7A 4HXKA 3HMEA 3QZSA 3P1DA 4NRCA 4QC1A 4YYGA 5C8GA 5JI8A 5D7XA 5EPSA 4TT4A 2YEKA 4QZSA 5EISA 5FE5A 5HQ7A 3JVKA 1X0JA 2H60A 4YH4A 3S91A 5II2A 5AD3A 5DFDA 5FFVA 3AQAA 5BT4A 4Z6HA 5DYCA 5AD2A 5DY7A 4LYWA 5CUDA 4J1PA 4A9LA 5C85A 4OGIA 4QY4A 4KCXA 5L98A 5BT5A 5IGMA 3P1EA 5FE4A 5IBNA 4YYDA 5IGNA 4HXNA 3UV2A 4NR4A 4QR4A 5COIA 5E9YA 3MB3A 4QUTA 5FH7A 3ZYUA 4YABA 4HXOA 5HEMA 5DW1A 5LVRA 5E9IA 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C7NA 4XUBA 5E7DA 5LJ0A 4NYWA 3SVGA 5C4QA 5ETBA 5CUBA 4LYIA 4Q0NA 5KTXA 4QSWA 5HRXA 5KU3A 4N4GA 3UVXA 3VKGA 2F6NA 4UYEA 2DVVA 4QEVA 5CFWA 4MR6A 3HMHA 5F2PA 3UW9A 4Q0OA 4UIVA 3U5LA 4A9NA 5FE2A 4E96A 4NR6A 3UV5A 5IGLA 2OUOA 3VKHA 4MR4A 4QR3A 5I7XA 3JVJA 3MULA 5ENHA 4QUUA 2NXBA 4UYFA 4A9HA 3LQJA 5LJ1A 4NR9A 5KO4A 4UYFB 2R0VA 5HCLA 4HXLA 4XYAA 5LKTA 1JM4B 5HENA 4AKHA 5D3SA 3SVHA 4TQNA 4QB3A 5ENCA 2OO1A 3K2JA 5DX4A 5I1QA 2R0SA 4QBMA 2MJVB 5DYAA 2DVQA 2L5EA 4IOOA 3IU6A 4LRGA 2YEMA 4X2IA 5FBXA 3MUKA 3ERRA 5LVQA 4UIWA 1ZS5A 2RS9B 5CQ3A 3JVLA 4YYNA 5CQAA 5I29A 2DVSA 1E6IA 3QZTA 4TYLA 5I7YA 5EWWA 4ZW1A 3TLPA 4UITA 5A82A 4WIVA 3O35A 4Z1SA 4J0RA 5D3HA 5ENJA 4YYMA 5EWCA 4MENA 5E3DA 3SVFA 5CUEA 5HLSA 2DATA 3G0LA 4MEQA 3D1BA 5EA1A 4LZSA 4CUQA 4LYSA 4IR6A 4UYDA 3UVWA 5F1HA 5EK9A 5LKXA 4A9IA 5DYXA 2L84A 2RNYA 2WP1A 5D26A 5FG6A 4O7CA 4PCIA 5A83A 5IIDA 4TS8A 4PCEA 3DWYA 5DYUA 3UV4A 3O33A 3IU5A 4NUDA 4UIXA 5EWHA 3U5NA 4XY8A 5CQ5A 4NRBA 2R0YA 4PS5A 5A5PA 3ONIA 4AKIA 4YYKA 5FE1A 4OUFA 5CQ7A 2DKWA 3LQIA 5D3JA 4O70A 5CRMA 4BW4A 4AKGA 3UVDA 4IOQA 5A5OA 4LR6A 4LC2A 5FG4A 2YELA 1ZKRA 4QSPA 3NXBA 4XY9A 4LZRA 5FB1A 5E9LA 4UIZA 5CQ6A 5A81A 4A9MA 4IR5A 5C87A 4QSVA 4NR5A 1JSPB 4KV1A 5AMFA 4TZ2A 4N4IA 4CUSA 5CZGA 4O7BA 5C89A 5A5SA 5K29A 4QSUA 4HXMA 2LSPB 5HELA 4Z93A 5D3PA 1PUOA 5CRZA 4CURA 5AMEA 5II1A 4J0SA 4O72A 4QSTA 4TZ8A 4AI6A 5DKCA 5F36A 3UVYA 5LKZA 2RO1A 5ENBA 3QZVA 5HJCA 4YBSA 4O77A 5D24A 5EVAA 5IGKA 2WP2A 3Q2EA 5KTUA 4BJXA 5I80A 4Z6IA 4IR4A 2R10A 5F25A 5H1VA 4QSXA 5A5RA 3HMFA 5FG5A 4O7AA 2E7NA 4HXPA 5KTWA 4O75A 5HRWA 5LUUA 5FE7A 5I40A 4O7EA 4A9FA 4AKNA 4YC9A 5E0RA 4QR5A 4A9EA 5HFQA 5L97A 4N4FA 4NYVA 3O37A 5CUAA 4TU6A 5A5QA 4QYDA 5HFRA 4CFKA 4QEUA 5A5NA 5ENFA 4MR5A 5CUCA 4O76A 5I88A 4RVRA 4QSQA 5E9VA 4A9JA 5CPEA 5JWMA 4HBXA 5TCMA 4YAXA 4BW3A 3P1CA 5CU8A 4HXRA 5F63A 5H1TA 3MB4A 4IR3A 4UIYA 4NR7A 4QSSA 3MXFA 4PTBA 5EPRA 4HBVA 2EJNA 4NYXA 4IORA 5FH6A 4BHWA 2FSAA 5J0DA 5L99A 5CQ4A 5CQTA 5F1LA 2RFJA 3P5OA 4QC3A 2D82A 3U5MA 4CUTA 5F60A 5FB0A 3U5OA 4O78A 5KHMA 4UYGA 5CP5A 5EWDA 5CGPA 5F3AA 5EICA 5FFWA 4HXSA 5CY9A 1WUGA 4QEWA 5HRVA 5FE8A 2RNXA 2E7OA 5A85A 5D3NA 4HBWA 5FE9A 4F3IA 4UYHA 4Z1QA 3GG3A 4KV4A 3JVMA 2DVRA 5ENGA 5IG6A 5D3RA 5L8UA 4HBYA 5EV9A 4XUAA 2E3KA 3LQHA 5EPBA 5EQ1A 4J3IA 5CQ8A 5FE6A 4O7FA 5EWVA 4BW2A 5D3LA 5HM0A 5E74A 5E3GA 5ACYA 5F62A 2G4AA 4CUUA 4CLBA 4O74A 4CL9A 2OSSA 5E9MA 4BW1A 5I86A 5CTLA 4YATA 5F61A 5CUGA 3RCWA 5H1UA 4ALGA 3G0JA 4YYIA 2I7KA 4C67A 3S92A 3FKMX 1N72A 4TT2A 4YK0A 5DBMA 4YY6A 4PY6A 4YY4A 5EP7A 3O36A 4TTEA 2F6JA 4N3WA 5FE3A 3LXJA 4WHUA 5DW2A 3O34A 4PKLA 5CS8A 2KTBB 5H85A 5DLXA 4NXJA 5I83A 3U5PA 5LKUA 4Y03A 4YH3A 2DWWA 5I89A 5DFCA 4YADA 3D7CA 4TT6A 4YYHA 4NRAA 5FE0A 2N9GA 2I8NA 2RNWA 3Q2FA 5DKHA 1EQFA 2GRCA 4CFLA 5A7CA 2YW5A 3LJWA 2D9EA 5HQ6A 5HQ5A 5ENIA 2L85A 5DLZA 4NQNA 5L96A 4O71A 2YDWA 3U5KA 4YBTA 1F68A 4QNSA 2YYNA 3U5JA 4NUCA 4A9OA 4LDFA 4LZ2A 5G4SA 4C66A 5L8TA 5D0CA 1WUMA 4YBMA 4MEPA 3MQMA 5ETDA 4MEOA 5EM3A 4A9KA 3P1FA 5LJ2A 4ZQLA 4DONA 4NQMA 4OGJA 4ALHA 4CUPA 5D25A 2YQDA 5FDZA 4FLPA 3DAIA 5EI4A 5FFYA 5G4RA 5F5ZA 4ZC9A 4MR3A 5TB6A 5DKDA 4NUEA 4QYLA 5BT3A 4NS5A 4UIUA 5FH8A 5EU1A 4GPJA 4N4HA 5D3TA 5DFBA 4TU4A 4NR8A 5E73A 5E9KA 4YYJA 5ENEA 4WHWA 5EGUA 3AADA 3I3JA 2RI7A 4HXKA 3HMEA 3QZSA 3P1DA 4NRCA 4QC1A 4YYGA 5C8GA 5JI8A 5D7XA 5EPSA 4TT4A 2YEKA 4QZSA 5EISA 5FE5A 5HQ7A 3JVKA 1X0JA 2H60A 4YH4A 3S91A 5II2A 5AD3A 5DFDA 5FFVA 3AQAA 5BT4A 4Z6HA 5DYCA 5AD2A 5DY7A 4LYWA 5CUDA 4J1PA 4A9LA 5C85A 4OGIA 4QY4A 4KCXA 5L98A 5BT5A 5IGMA 3P1EA 5FE4A 5IBNA 4YYDA 5IGNA 4HXNA 3UV2A 4NR4A 4QR4A 5COIA 5E9YA 3MB3A 4QUTA 5FH7A 3ZYUA 4YABA 4HXOA 5HEMA 3D1DA 5DW1A 5LVRA 5E9IA 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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