4IR6A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-{1-[2-(methylsulfonyl)phenyl]-7-phenoxyindolizin-3-yl}ethanone (gsk2838097a)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 39
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir6A00
5F61A 5FH8A 2DWWA 5E9MA 5ETBA 1N72A 5A81A 3FKMX 5A82A 5H1UA 5EWWA 5FE3A 3DWYA 5FFYA 3MULA 5E73A 4CUTA 4IOOA 5E3DA 5LUUA 4TZ2A 5CQTA 5ENCA 5A5OA 5CQ3A 5H1VA 2NXBA 4NUCA 2RNXA 5I88A 5IGMA 4Y03A 5EWCA 5IGKA 4FLPA 5K29A 4CUUA 3MXFA 5HJCA 5CUCA 4YYKA 4YATA 2YW5A 5ENHA 4NS5A 4UYEA 5DYCA 4A9NA 4YYGA 4CUQA 5DBMA 3JVKA 5L8UA 3UVYA 2R0YA 4HXSA 4NYWA 5G4RA 4CLBA 5DFDA 4QSWA 2YEKA 4UYFB 4O7CA 4O71A 4QSQA 4QZSA 4Z93A 3ZYUA 3SVFA 5HQ6A 4J1PA 4NQMA 4BJXA 3P5OA 4PKLA 4IOQA 4O74A 5DYAA 5HFQA 4IR3A 4CUPA 4UYGA 3I3JA 5F36A 2DVRA 4NR4A 5D24A 5II2A 3UW9A 4NYVA 5JI8A 4NR7A 2OUOA 5D0CA 5I83A 3UV2A 1E6IA 5CGPA 1WUMA 4UITA 2DKWA 3U5NA 4QSRA 5LKXA 4CUSA 1X0JA 2G4AA 5HRVA 4BW4A 4A9IA 4QB3A 4QR5A 4YY4A 5L8TA 4TT4A 4A9HA 3QZTA 4PCIA 4A9LA 5I7XA 5DKCA 5LJ1A 4PS5A 4O7AA 4Z1SA 4QC3A 4UYDA 5HRXA 2DATA 3ONIA 2WP2A 3U5PA 5C8GA 2I8NA 4QR4A 5F63A 4A9OA 5ENIA 4KV4A 5CS8A 4HXLA 3S92A 2YYNA 5COIA 3MUKA 5HCLA 4O75A 5D3SA 5EPRA 5EISA 5D3NA 5II1A 5I40A 3LQHA 4NR8A 4C67A 4MEQA 4IORA 5DW1A 3IU5A 4N4FA 4YYIA 5D26A 4QSPA 4QUUA 2E3KA 4WHUA 5ENJA 3S91A 4A9EA 3UVXA 3P1CA 5C87A 5CUEA 4O7EA 2DVSA 4IR5A 5DKHA 4N3WA 4A9MA 5C89A 5FE9A 4NRAA 5DX4A 5CQ6A 5EI4A 5HQ7A 4MEOA 3O35A 4LDFA 4QR3A 4TT2A 5D3JA 5FE6A 3AADA 5FDZA 4Z6HA 4TZ8A 5ACYA 2RNYA 4ALHA 4XY9A 4N4GA 4LZRA 5DY7A 5E9KA 5LVRA 4LRGA 5CP5A 2DVVA 5FG5A 4NR6A 2YEMA 5BT4A 4YADA 4HBYA 4Z6IA 4YBTA 4LYSA 4LYIA 4TTEA 3JVJA 2GRCA 5TCMA 3JVLA 3SVGA 4OUFA 5KTXA 5I86A 3Q2FA 4WIVA 2I7KA 5LKUA 3NXBA 4QC1A 5H85A 5E0RA 3G0JA 5FE8A 5EPBA 5KU3A 5L96A 5I29A 2L5EA 5F25A 5JWMA 1EQFA 5E7DA 5D3PA 5E3GA 4YAXA 5FG4A 5AD2A 4QSTA 5I1QA 5IIDA 5C4QA 3O37A 4NRBA 5KTUA 5A7CA 4ZC9A 5G4SA 5DLXA 5ENEA 3U5KA 5CFWA 5F60A 5CQ5A 4QSXA 4DONA 4LC2A 5CY9A 4CURA 4NRCA 5DFBA 4E96A 5F1HA 5HRWA 5FB1A 2D82A 4UIVA 5LJ2A 2RNWA 4YYMA 5EVAA 4NXJA 4KV1A 5CQ7A 3G0LA 2H60A 4QUTA 5H1TA 4YYHA 5D3LA 4BW1A 2OSSA 5IGLA 1JM4B 4YYDA 4YH3A 4MEPA 3UVWA 5EWHA 4CFKA 2RI7A 5IG6A 4J0SA 5AMFA 4YK0A 4QBMA 5DYUA 5L99A 5C7NA 3QZVA 1F68A 4NUEA 4IR4A 1ZS5A 3P1EA 5FFVA 3O34A 4AKNA 2E7OA 4NR5A 5HELA 2R0VA 4CFLA 4NQNA 5F62A 3LJWA 3U5JA 4LZSA 4N4HA 2L85A 5DKDA 3Q2EA 5CUDA 5EPSA 5C85A 5DW2A 5I7YA 2DVQA 5FBXA 4O78A 5KTWA 5CU8A 5E74A 3U5OA 3GG3A 5EICA 5EP7A 5HM0A 5EK9A 4J0RA 5EQ1A 5CQ4A 5E9IA 4TU4A 5A5NA 4J3IA 3LXJA 1WUGA 5HFRA 4HBWA 5CUAA 5BT5A 3U5LA 5D3RA 2F6NA 5FG6A 3P1DA 5CUGA 5LJ0A 4LR6A 4TYLA 4YH4A 3AQAA 5FE7A 2F6JA 4QYLA 5DYXA 3JVMA 2D9EA 4HBXA 4OGIA 4UIYA 4NR9A 4RVRA 4LYWA 4O76A 5HLSA 5CPEA 4O72A 5FB0A 5FFWA 4TT6A 5HQ5A 4X2IA 5DFCA 5FH7A 3MQMA 3U5MA 5FH6A 5TB6A 3P1FA 5F2PA 4YBMA 4BW3A 3O33A 2YELA 4TU6A 2R0SA 4PTBA 4YYJA 4XYAA 4HXMA 4O7BA 4OGJA 5CQ8A 3D7CA 5CTLA 5D25A 4CL9A 4HXNA 5HENA 4XY8A 5KHMA 5EU1A 5EWDA 4YY6A 4ZW1A 4MR4A 5F3AA 4QYDA 3SVHA 5I80A 4TQNA 3DAIA 5A5SA 2N9GA 5FE0A 4HXPA 4A9FA 2RFJA 4A9JA 5L98A 3MB4A 4UIUA 5L97A 4QEWA 2LSPB 5CUBA 5I89A 4ALGA 5A5QA 2RO1A 5CQAA 5E9YA 5ENFA 5A5RA 5HEMA 4HXKA 2RS9B 4NYXA 5KO4A 2WP1A 4MR5A 4A9KA 2YDWA 4UIZA 1JSPB 5A5PA 2OO1A 5EGUA 5FE5A 4HXOA 4N4IA 4KCXA 5EWVA 5LKTA 4QSUA 4C66A 5D3TA 5FE4A 2YQDA 5AD3A 4O77A 4HXRA 4QSSA 5EA1A 5BT3A 5AMEA 3LQIA 4YABA 5FE2A 3IU6A 4UIXA 5D3HA 4UIWA 2KTBB 4GPJA 5ENGA 4MR3A 2E7NA 4TS8A 4QSVA 3HMHA 4Q0NA 5A83A 3QZSA 5IBNA 3HMEA 4UYHA 4XUAA 4QY4A 5F1LA 5IGNA 5J0DA 4PCEA 2R10A 5A85A 3UV4A 5D7XA 3K2JA 4WHWA 4QEUA 4O7FA 4F3IA 3MB3A 4Z1QA 2L84A 4ZQLA 5EV9A 5LKZA 3TLPA 3LQJA 4PY6A 4MR6A 4BHWA 5F5ZA 4UYFA 4NUDA 3RCWA 4LZ2A 4MENA 2FSAA 3HMFA 4YBSA 5E9VA 4QNSA 5ENBA 3O36A 5LVQA 5CRZA 4QEVA 4YC9A 4YYNA 5E9LA 4Q0OA 4BW2A 3UV5A 5CRMA 3UVDA 4IR6A 2MJVB 5EM3A 4HBVA 5ETDA 4XUBA 5FE1A 5DLZA 5CZGA 4O70A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F61A 5FH8A 2DWWA 5E9MA 5ETBA 1N72A 5A81A 3FKMX 5A82A 5H1UA 5EWWA 5FE3A 3DWYA 5FFYA 3MULA 5E73A 4CUTA 4IOOA 5E3DA 5LUUA 4TZ2A 5CQTA 5ENCA 5A5OA 5CQ3A 5H1VA 2NXBA 4NUCA 2RNXA 5I88A 5IGMA 4Y03A 5EWCA 5IGKA 4FLPA 5K29A 4CUUA 3MXFA 5HJCA 5CUCA 4YYKA 4YATA 2YW5A 5ENHA 4NS5A 4UYEA 5DYCA 4A9NA 4YYGA 4CUQA 5DBMA 3JVKA 5L8UA 3UVYA 2R0YA 4HXSA 4NYWA 5G4RA 4CLBA 5DFDA 4QSWA 2YEKA 4AKGA 4UYFB 4O7CA 4O71A 4QSQA 4QZSA 4Z93A 3ZYUA 3SVFA 5HQ6A 4J1PA 4NQMA 4BJXA 3P5OA 4PKLA 4IOQA 4O74A 5DYAA 5HFQA 4IR3A 4CUPA 4UYGA 3I3JA 5F36A 2DVRA 4NR4A 5D24A 5II2A 3UW9A 3VKHA 4NYVA 5JI8A 4NR7A 2OUOA 5D0CA 5I83A 3UV2A 1E6IA 5CGPA 1WUMA 4UITA 2DKWA 3U5NA 4QSRA 5LKXA 4CUSA 1X0JA 2G4AA 5HRVA 4BW4A 4A9IA 4QB3A 4QR5A 4YY4A 5L8TA 4TT4A 4A9HA 3QZTA 4PCIA 4A9LA 5I7XA 5DKCA 5LJ1A 4PS5A 4O7AA 4Z1SA 4QC3A 4UYDA 5HRXA 2DATA 3ONIA 2WP2A 3U5PA 5C8GA 2I8NA 4QR4A 5F63A 4A9OA 5ENIA 4KV4A 5CS8A 4HXLA 3S92A 2YYNA 5COIA 3MUKA 5HCLA 4O75A 5D3SA 5EPRA 5EISA 5D3NA 5II1A 5I40A 3LQHA 4NR8A 4C67A 4MEQA 4IORA 5DW1A 3IU5A 4N4FA 4YYIA 5D26A 4QSPA 4QUUA 2E3KA 4WHUA 5ENJA 3S91A 4A9EA 3UVXA 3P1CA 5C87A 5CUEA 4O7EA 2DVSA 4IR5A 5DKHA 4N3WA 4A9MA 5C89A 5FE9A 4NRAA 5DX4A 5CQ6A 5EI4A 5HQ7A 4MEOA 3O35A 4LDFA 4QR3A 4TT2A 5D3JA 5FE6A 3AADA 5FDZA 4Z6HA 4TZ8A 5ACYA 3VKGA 2RNYA 4ALHA 4XY9A 4N4GA 1PUOA 4LZRA 5DY7A 5E9KA 5LVRA 4LRGA 5CP5A 2DVVA 5FG5A 4NR6A 2YEMA 5BT4A 4YADA 4HBYA 4Z6IA 4YBTA 4LYSA 4LYIA 4TTEA 3JVJA 2GRCA 5TCMA 3JVLA 3SVGA 4OUFA 5KTXA 5I86A 3Q2FA 4WIVA 2I7KA 5LKUA 3NXBA 4QC1A 5H85A 5E0RA 3G0JA 5FE8A 5EPBA 5KU3A 5L96A 5I29A 2L5EA 5F25A 5JWMA 1EQFA 5E7DA 5D3PA 5E3GA 4YAXA 5FG4A 5AD2A 4QSTA 5I1QA 5IIDA 5C4QA 3O37A 4NRBA 5KTUA 5A7CA 4ZC9A 5G4SA 5DLXA 5ENEA 3U5KA 5CFWA 5F60A 5CQ5A 4QSXA 4DONA 4LC2A 5CY9A 4CURA 4NRCA 5DFBA 4E96A 5F1HA 5HRWA 5FB1A 2D82A 4UIVA 5LJ2A 2RNWA 4YYMA 3D1BA 5EVAA 4AKIA 4NXJA 4KV1A 5CQ7A 3G0LA 2H60A 4QUTA 5H1TA 4YYHA 5D3LA 4BW1A 2OSSA 5IGLA 1JM4B 4YYDA 4YH3A 4MEPA 3UVWA 5EWHA 4CFKA 2RI7A 5IG6A 4J0SA 5AMFA 4YK0A 4QBMA 5DYUA 5L99A 5C7NA 3QZVA 1F68A 4NUEA 4IR4A 1ZS5A 3P1EA 5FFVA 3O34A 4AKNA 2E7OA 4NR5A 5HELA 2R0VA 4CFLA 4NQNA 5F62A 3LJWA 3U5JA 4LZSA 4N4HA 2L85A 5DKDA 3Q2EA 5CUDA 5EPSA 5C85A 5DW2A 3ERRA 5I7YA 2DVQA 5FBXA 4O78A 5KTWA 5CU8A 5E74A 3U5OA 3GG3A 5EICA 5EP7A 5HM0A 5EK9A 4J0RA 5EQ1A 5CQ4A 5E9IA 4TU4A 5A5NA 4J3IA 3LXJA 1WUGA 5HFRA 4HBWA 5CUAA 5BT5A 3U5LA 5D3RA 2F6NA 5FG6A 3P1DA 5CUGA 5LJ0A 4LR6A 4TYLA 4YH4A 3AQAA 5FE7A 2F6JA 4QYLA 5DYXA 3JVMA 2D9EA 4HBXA 4OGIA 4UIYA 4NR9A 4RVRA 4LYWA 4O76A 5HLSA 5CPEA 4O72A 5FB0A 5FFWA 4TT6A 5HQ5A 4X2IA 5DFCA 5FH7A 3MQMA 3U5MA 5FH6A 5TB6A 3P1FA 5F2PA 4YBMA 4BW3A 3O33A 2YELA 4TU6A 2R0SA 4PTBA 4YYJA 4XYAA 4HXMA 4O7BA 4OGJA 5CQ8A 3D7CA 5CTLA 5D25A 4CL9A 4HXNA 5HENA 4XY8A 5KHMA 5EU1A 5EWDA 4YY6A 4ZW1A 1ZKRA 4MR4A 5F3AA 4QYDA 3SVHA 5I80A 4TQNA 3DAIA 2EJNA 5A5SA 2N9GA 5FE0A 4HXPA 4A9FA 4AI6A 2RFJA 4A9JA 5L98A 3MB4A 4UIUA 5L97A 4QEWA 2LSPB 5CUBA 5I89A 4ALGA 5A5QA 2RO1A 5CQAA 5E9YA 5ENFA 5A5RA 5HEMA 4HXKA 2RS9B 4NYXA 5KO4A 2WP1A 4MR5A 4A9KA 2YDWA 4UIZA 1JSPB 5A5PA 2OO1A 3D1DA 5EGUA 5FE5A 4HXOA 4N4IA 4KCXA 5EWVA 5LKTA 4QSUA 4C66A 5D3TA 5FE4A 2YQDA 5AD3A 4O77A 4HXRA 4QSSA 5EA1A 5BT3A 5AMEA 3LQIA 4YABA 5FE2A 3IU6A 4UIXA 5D3HA 4UIWA 2KTBB 4GPJA 5ENGA 4MR3A 2E7NA 4TS8A 4QSVA 3HMHA 4Q0NA 5A83A 3QZSA 5IBNA 3HMEA 4UYHA 4XUAA 4QY4A 5F1LA 5IGNA 5J0DA 4PCEA 2R10A 5A85A 3UV4A 5D7XA 3K2JA 4WHWA 4QEUA 4O7FA 4F3IA 3MB3A 4Z1QA 2L84A 4ZQLA 5EV9A 5LKZA 3TLPA 3LQJA 4PY6A 4MR6A 4BHWA 5F5ZA 4UYFA 4NUDA 3RCWA 4LZ2A 4MENA 2FSAA 3HMFA 4YBSA 5E9VA 4QNSA 5ENBA 3O36A 5LVQA 5CRZA 4QEVA 4YC9A 4YYNA 5E9LA 4Q0OA 4BW2A 4AKHA 3UV5A 5CRMA 3UVDA 4IR6A 2MJVB 5EM3A 4HBVA 5ETDA 4XUBA 5FE1A 5DLZA 5CZGA 4O70A
chains in the Genus database with same CATH topology
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