3UVWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k5ack8ac)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/protein binding
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvwA01
5EWDA 4A9OA 4NR9A 4TZ8A 5A5OA 2DKWA 5A82A 4QYLA 3NXBA 3SVHA 3QZSA 4MEOA 5A83A 2LSPB 5CQ8A 5EISA 4IR6A 2DATA 5D3TA 5ENFA 4HXNA 4YATA 5E9KA 4AKNA 5CUAA 4NUCA 5DYCA 5ENGA 5DKCA 5D0CA 2RNXA 4YC9A 5LKTA 4WHWA 3U5LA 4QEWA 5F36A 4HBVA 4QSTA 4J3IA 3MUKA 3IU6A 4TZ2A 2F6NA 4TTEA 5F3AA 5HRWA 5HJCA 5E3GA 4GPJA 3TLPA 4MR5A 4YYJA 4HXKA 2L5EA 5A85A 3JVKA 2R10A 4YAXA 5E9IA 4O75A 3JVLA 5CUDA 5F1LA 4QYDA 4O78A 4J0RA 4TU6A 4PKLA 4QSXA 5FE2A 1ZS5A 5E0RA 4BW4A 4QEVA 4NRAA 3G0LA 2RNYA 5CQ6A 1E6IA 2RNWA 5EVAA 4QUUA 5HCLA 4IOQA 2NXBA 5EI4A 5FBXA 4UIXA 5FE9A 5CUEA 5HQ5A 5L8UA 5EICA 4J1PA 5CRMA 4C66A 5KTWA 5DY7A 2N9GA 3HMEA 3UV2A 4MR6A 1WUGA 4UIVA 5JI8A 4Y03A 4OGIA 3Q2FA 5CQ3A 5I86A 5DW1A 4NRCA 5DYAA 4KCXA 4CLBA 3UV4A 5HENA 4TS8A 2YEMA 5CRZA 4Z6HA 4QC3A 4NR8A 4O77A 5D3LA 5DYXA 3U5JA 3O36A 4XY8A 3S92A 4PTBA 3JVJA 2WP2A 4ALHA 4UIYA 5D24A 4YBMA 4YBSA 5CZGA 5L99A 1WUMA 5F5ZA 3U5MA 4YYHA 3D7CA 3DAIA 5D3SA 4ZW1A 5A5SA 3GG3A 4CFLA 3ZYUA 3U5NA 4MEQA 4XUBA 2OUOA 3S91A 4NQNA 3LQHA 5IG6A 5CY9A 5EWHA 4Z93A 4FLPA 4QZSA 4CL9A 4CUTA 3DWYA 4BW3A 5CQ7A 5TCMA 3UVYA 2L84A 4UYEA 5C87A 4O7AA 5KO4A 5LJ1A 4O7FA 4TT4A 1F68A 5HQ6A 5ENHA 4KV4A 5EQ1A 5D3HA 2OSSA 5ETDA 5L96A 4NRBA 4MR4A 4N3WA 5A5NA 5FH7A 4O7BA 5CUGA 2RO1A 5CQTA 4NR6A 4RVRA 3MULA 5COIA 3G0JA 4YYGA 4UYGA 5D25A 4YYMA 2WP1A 5CQ4A 3Q2EA 5EK9A 3P5OA 4XY9A 2G4AA 5EPRA 5F61A 5F60A 3IU5A 2DVRA 5FH6A 5IGMA 5D3PA 4LZRA 4PS5A 5AMFA 5FE7A 4Q0NA 4TYLA 3SVGA 5BT3A 4KV1A 5AD2A 5LJ0A 4NR4A 5D3RA 5DFDA 4A9JA 4QY4A 2OO1A 4CFKA 4F3IA 3HMFA 5L98A 4HBXA 5HRXA 5LKUA 3U5PA 4Q0OA 5DBMA 5D7XA 5L97A 3SVFA 4BHWA 1EQFA 4TT2A 5EP7A 5I88A 3MQMA 4A9EA 5IGNA 4IR3A 4WIVA 5II1A 4QSUA 4MENA 4PY6A 2E7NA 4UIUA 5I40A 3P1CA 3UVXA 5F1HA 5F2PA 5I7XA 5FG5A 4A9KA 4CURA 3UVWA 5DFBA 5FG4A 3O33A 4O7EA 3UVDA 5CQAA 5G4SA 5HELA 4QC1A 4N4GA 5FDZA 4QUTA 3FKMX 4UYDA 4QSVA 3LJWA 4CUPA 2R0YA 5KTXA 4NUEA 5C8GA 5KHMA 5EWVA 5IGLA 4X2IA 5CUBA 2DWWA 4HBWA 5F25A 2R0VA 2MJVB 4QSQA 4LC2A 4LDFA 3U5OA 4CUSA 5LKXA 5DLZA 4O70A 2D82A 5FE0A 5HQ7A 5E9LA 4DONA 4N4HA 4QBMA 4Z1SA 5BT4A 5E9VA 1X0JA 2YEKA 3I3JA 5E9MA 2D9EA 5FFVA 3U5KA 4A9MA 3P1DA 5I80A 4UITA 2YDWA 5EWCA 2YELA 3LXJA 5CPEA 4UYFA 5DYUA 4YBTA 4XUAA 4NXJA 5H85A 3K2JA 4YYNA 4YY6A 3HMHA 3UV5A 2I7KA 4A9NA 5C7NA 5DKHA 5ACYA 5KU3A 5TB6A 3O35A 5HRVA 4QSRA 2H60A 3QZVA 5ENCA 5C89A 4XYAA 5EU1A 5E3DA 2DVQA 2E3KA 4LYSA 5DFCA 4LYWA 2RFJA 4YYIA 5C85A 3AADA 5FB1A 5EPBA 4TQNA 5EPSA 5FE3A 4A9HA 3O34A 5HEMA 4UYFB 2I8NA 4HXRA 5FE4A 4QR3A 4PCIA 5CS8A 4NQMA 5DLXA 5FE1A 5CQ5A 4TU4A 5EA1A 5E74A 5H1VA 4UYHA 4HXOA 3MB3A 5DKDA 5DW2A 5FE5A 4IOOA 5L8TA 5HFQA 5I89A 4HXSA 4YYDA 4QR4A 5CUCA 4HBYA 5EV9A 4PCEA 5E7DA 4IORA 4C67A 5CP5A 5HFRA 5CFWA 4NR7A 2F6JA 4NS5A 5E9YA 3AQAA 3JVMA 4NYXA 2GRCA 2YQDA 3LQJA 4ZQLA 4LZSA 4ZC9A 2KTBB 5LVQA 4YADA 3RCWA 4J0SA 4YYKA 3MB4A 5ETBA 3LQIA 5AD3A 4ALGA 4QB3A 5BT5A 5LUUA 4OUFA 5H1UA 4CUQA 5A5PA 3O37A 5EWWA 5FFYA 4LR6A 5ENBA 5A5QA 5CGPA 4WHUA 4LRGA 5IIDA 3P1EA 5D26A 5HLSA 2DVVA 5F63A 4Z1QA 5A7CA 5D3JA 5D3NA 5IGKA 5ENJA 2DVSA 5I7YA 5II2A 4O74A 4A9LA 4CUUA 5A5RA 5FE6A 4YK0A 4O71A 2FSAA 4QSWA 5LVRA 3P1FA 4HXLA 4QR5A 4UIZA 5DX4A 5FFWA 2RI7A 4TT6A 4BW1A 4UIWA 4YH4A 5I83A 5ENIA 4QSSA 2YYNA 5I1QA 5AMEA 5E73A 4YABA 4Z6IA 5CU8A 5FB0A 2R0SA 4LYIA 5A81A 5FG6A 4O72A 5FH8A 5K29A 3MXFA 4HXMA 4QEUA 5ENEA 4HXPA 2E7OA 4O76A 5KTUA 3ONIA 3QZTA 4MEPA 5H1TA 5EGUA 1JSPB 1N72A 5EM3A 4N4FA 5LKZA 4YH3A 4A9IA 2RS9B 4IR4A 5HM0A 4NYVA 4QNSA 4IR5A 4QSPA 4NYWA 5CTLA 4BW2A 4E96A 4LZ2A 5F62A 5JWMA 5J0DA 4OGJA 5IBNA 4A9FA 4MR3A 4BJXA 5I29A 2YW5A 3UW9A 5LJ2A 5C4QA 2L85A 4N4IA 5G4RA 4O7CA 1JM4B 5FE8A 4NUDA 4NR5A 4YY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EWDA 4A9OA 4NR9A 4TZ8A 5A5OA 2DKWA 5A82A 4QYLA 3NXBA 3SVHA 3QZSA 4MEOA 5A83A 2LSPB 5CQ8A 5EISA 4IR6A 2DATA 5D3TA 5ENFA 4HXNA 4YATA 5E9KA 4AKNA 5CUAA 4NUCA 5DYCA 5ENGA 5DKCA 5D0CA 2RNXA 4YC9A 5LKTA 4WHWA 3U5LA 4QEWA 5F36A 4HBVA 4QSTA 4J3IA 3MUKA 3IU6A 4TZ2A 2F6NA 4TTEA 5F3AA 5HRWA 5HJCA 5E3GA 4GPJA 3TLPA 4MR5A 4YYJA 4HXKA 2L5EA 5A85A 3JVKA 2EJNA 2R10A 4YAXA 5E9IA 4O75A 3JVLA 5CUDA 5F1LA 4QYDA 4O78A 4J0RA 4TU6A 4PKLA 4QSXA 5FE2A 4AKIA 1ZS5A 5E0RA 4BW4A 4QEVA 4NRAA 3G0LA 2RNYA 5CQ6A 1E6IA 2RNWA 5EVAA 4QUUA 5HCLA 4IOQA 2NXBA 5EI4A 5FBXA 4UIXA 5FE9A 5CUEA 5HQ5A 5L8UA 5EICA 4J1PA 5CRMA 4C66A 5KTWA 5DY7A 2N9GA 3HMEA 3UV2A 4MR6A 1WUGA 4UIVA 5JI8A 4Y03A 4OGIA 3Q2FA 5CQ3A 5I86A 5DW1A 4NRCA 5DYAA 4KCXA 4CLBA 3UV4A 5HENA 4TS8A 1PUOA 2YEMA 5CRZA 4Z6HA 4QC3A 4NR8A 4O77A 5D3LA 5DYXA 3U5JA 3O36A 4XY8A 3S92A 4PTBA 3JVJA 2WP2A 4ALHA 4UIYA 5D24A 4YBMA 4YBSA 5CZGA 5L99A 1WUMA 5F5ZA 3U5MA 4YYHA 3D7CA 3DAIA 5D3SA 4ZW1A 5A5SA 3GG3A 4CFLA 3ZYUA 3U5NA 4MEQA 4XUBA 2OUOA 3S91A 3VKHA 4NQNA 3LQHA 5IG6A 5CY9A 5EWHA 4Z93A 4FLPA 4QZSA 4CL9A 4CUTA 3DWYA 4BW3A 5CQ7A 5TCMA 3UVYA 2L84A 4UYEA 5C87A 4O7AA 5KO4A 5LJ1A 4O7FA 4TT4A 1F68A 5HQ6A 5ENHA 4KV4A 5EQ1A 5D3HA 2OSSA 5ETDA 5L96A 4NRBA 4MR4A 4N3WA 5A5NA 5FH7A 4O7BA 5CUGA 2RO1A 5CQTA 4NR6A 4RVRA 3MULA 5COIA 3G0JA 4YYGA 4UYGA 5D25A 4YYMA 2WP1A 5CQ4A 3Q2EA 5EK9A 3P5OA 4XY9A 2G4AA 5EPRA 5F61A 3VKGA 5F60A 3IU5A 2DVRA 5FH6A 5IGMA 5D3PA 4LZRA 4PS5A 5AMFA 5FE7A 4Q0NA 4TYLA 3SVGA 5BT3A 4KV1A 5AD2A 5LJ0A 4NR4A 5D3RA 5DFDA 4A9JA 3D1BA 4QY4A 2OO1A 4CFKA 4F3IA 3HMFA 5L98A 4HBXA 5HRXA 5LKUA 3U5PA 4Q0OA 4AKGA 5DBMA 5D7XA 5L97A 3SVFA 4BHWA 1EQFA 3D1DA 4TT2A 5EP7A 5I88A 3MQMA 4A9EA 5IGNA 4IR3A 4WIVA 5II1A 4QSUA 4MENA 4PY6A 2E7NA 4UIUA 5I40A 3P1CA 3UVXA 5F1HA 5F2PA 5I7XA 5FG5A 4A9KA 4CURA 3UVWA 5DFBA 5FG4A 3O33A 4O7EA 3UVDA 5CQAA 5G4SA 5HELA 4QC1A 4N4GA 5FDZA 4QUTA 3FKMX 4UYDA 4QSVA 3LJWA 4CUPA 2R0YA 5KTXA 4NUEA 5C8GA 5KHMA 5EWVA 5IGLA 4X2IA 5CUBA 2DWWA 4HBWA 5F25A 2R0VA 2MJVB 4QSQA 4AI6A 4LC2A 4LDFA 3U5OA 4CUSA 5LKXA 5DLZA 4O70A 2D82A 5FE0A 5HQ7A 5E9LA 4DONA 4N4HA 4QBMA 4Z1SA 5BT4A 5E9VA 1X0JA 2YEKA 3I3JA 1ZKRA 2D9EA 5E9MA 5FFVA 3U5KA 4A9MA 3P1DA 5I80A 4UITA 2YDWA 5EWCA 2YELA 3LXJA 5CPEA 4UYFA 5DYUA 4YBTA 4XUAA 4NXJA 3ERRA 5H85A 3K2JA 4YYNA 4YY6A 3HMHA 3UV5A 2I7KA 4A9NA 5C7NA 5DKHA 5ACYA 5KU3A 5TB6A 3O35A 5HRVA 4QSRA 2H60A 3QZVA 5ENCA 5C89A 4XYAA 5EU1A 5E3DA 2DVQA 2E3KA 4LYSA 5DFCA 4LYWA 2RFJA 4YYIA 5C85A 3AADA 5FB1A 5EPBA 4TQNA 5EPSA 5FE3A 4A9HA 3O34A 5HEMA 4UYFB 2I8NA 4HXRA 5FE4A 4QR3A 4PCIA 5CS8A 4NQMA 5DLXA 5FE1A 5CQ5A 4TU4A 5EA1A 5E74A 5H1VA 4UYHA 4HXOA 3MB3A 5DKDA 5DW2A 5FE5A 4IOOA 5L8TA 5HFQA 5I89A 4HXSA 4YYDA 4QR4A 5CUCA 4HBYA 5EV9A 4PCEA 5E7DA 4IORA 4C67A 5CP5A 5HFRA 5CFWA 4NR7A 2F6JA 4NS5A 5E9YA 3AQAA 3JVMA 4NYXA 2GRCA 2YQDA 3LQJA 4ZQLA 4LZSA 4ZC9A 2KTBB 5LVQA 4YADA 3RCWA 4J0SA 4YYKA 3MB4A 5ETBA 3LQIA 5AD3A 4ALGA 4QB3A 5BT5A 5LUUA 4OUFA 5H1UA 4CUQA 5A5PA 3O37A 5EWWA 5FFYA 4LR6A 5ENBA 5A5QA 5CGPA 4WHUA 4LRGA 5IIDA 3P1EA 5D26A 5HLSA 2DVVA 5F63A 4Z1QA 5A7CA 5D3JA 5D3NA 5IGKA 5ENJA 2DVSA 5I7YA 5II2A 4O74A 4AKHA 4A9LA 4CUUA 5A5RA 5FE6A 4YK0A 4O71A 2FSAA 4QSWA 5LVRA 3P1FA 4HXLA 4QR5A 4UIZA 5DX4A 5FFWA 2RI7A 4TT6A 4BW1A 4UIWA 4YH4A 5I83A 5ENIA 4QSSA 2YYNA 5I1QA 5AMEA 5E73A 4YABA 4Z6IA 5CU8A 5FB0A 2R0SA 4LYIA 5A81A 5FG6A 4O72A 5FH8A 5K29A 3MXFA 4HXMA 4QEUA 5ENEA 4HXPA 2E7OA 4O76A 5KTUA 3ONIA 3QZTA 4MEPA 5H1TA 5EGUA 1JSPB 1N72A 5EM3A 4N4FA 5LKZA 4YH3A 4A9IA 2RS9B 4IR4A 5HM0A 4NYVA 4QNSA 4IR5A 4QSPA 4NYWA 5CTLA 4BW2A 4E96A 4LZ2A 5F62A 5JWMA 5J0DA 4OGJA 5IBNA 4A9FA 4MR3A 4BJXA 5I29A 2YW5A 3UW9A 5LJ2A 5C4QA 2L85A 4N4IA 5G4RA 4O7CA 1JM4B 5FE8A 4NUDA 4NR5A 4YY4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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