3UVWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k5ack8ac)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/protein binding
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvwA01
4UIUA 3QZSA 4NR6A 4NS5A 5CQTA 5F1HA 3LXJA 4Z1SA 4QZSA 5JWMA 4YBSA 4YYIA 4UYDA 4WHWA 4PY6A 4A9IA 5E9KA 5FG4A 2D9EA 4QUUA 4MR3A 4TU6A 5ETBA 5CQ5A 3MXFA 4MR6A 2I8NA 5DFDA 1JSPB 4XYAA 2LSPB 5D3NA 5BT4A 5K29A 5FE3A 5A5OA 5FE7A 5ENHA 2RNWA 4OGIA 3U5JA 5CQ8A 4CFKA 3S91A 5CU8A 4UYEA 4QSSA 3U5LA 5CUCA 4NR9A 5HLSA 4YY6A 5LJ1A 1F68A 4O7CA 4O74A 4Z6IA 4QSRA 4HXPA 2YQDA 5F62A 4A9NA 4O70A 5FG5A 5DX4A 4XY9A 5I40A 5FFYA 4HXNA 5A5NA 3O33A 5FFWA 5TB6A 5D3TA 5D3JA 5H85A 5IG6A 5LUUA 2NXBA 4A9MA 5EV9A 4Z93A 4QSUA 4A9OA 5CQAA 3ZYUA 4GPJA 5EI4A 5ACYA 4HBWA 5L97A 5HCLA 3S92A 5CRMA 5CGPA 4YYNA 4J0RA 5DKDA 5F63A 4ZC9A 4Y03A 5J0DA 3P1EA 5CUDA 2H60A 4A9EA 5CQ4A 5EVAA 5EK9A 4HXRA 4IR5A 1JM4B 4QEUA 4BW4A 5HRVA 5F5ZA 2D82A 5HJCA 4YYKA 4PKLA 5E9IA 5E74A 5LKZA 4J3IA 5D3LA 5L99A 4LR6A 4NUCA 5H1VA 4XY8A 5KTXA 5A5SA 5CUEA 3SVGA 3K2JA 5C87A 4YBMA 2YELA 2DVVA 4X2IA 5E7DA 5CUBA 3HMHA 4QEVA 2L5EA 4KV1A 5A81A 1WUGA 5CQ7A 5E3DA 4ALHA 4NXJA 5A5PA 4TTEA 3HMFA 3SVHA 5DYAA 5A85A 5ETDA 5FH6A 4NR8A 3P5OA 5EP7A 3JVLA 5IGMA 5EWDA 4UIYA 3MUKA 4QSVA 4CFLA 5D3RA 5DKCA 5JI8A 4QYLA 4BJXA 5FG6A 5EPBA 2E7OA 5LJ0A 2RO1A 3AADA 3U5PA 4QC3A 4CUQA 5FE2A 5CZGA 5FBXA 4CUTA 3LQHA 5ENBA 4BW1A 5LKUA 3MQMA 5CRZA 5DY7A 2KTBB 2E3KA 3O35A 3JVKA 5FE1A 3JVJA 4QC1A 4NQNA 5II2A 5I29A 1N72A 1X0JA 2F6NA 4O75A 5AMEA 4BHWA 5ENIA 2WP1A 5FE0A 5EWHA 4HXKA 2R0SA 5DLXA 5DBMA 4NR5A 2MJVB 4NR7A 2R0YA 4UIZA 4O72A 5E9MA 5ENJA 4HXLA 2G4AA 4F3IA 4IORA 3UVWA 4DONA 3D7CA 5EU1A 1ZS5A 3HMEA 4LC2A 3Q2FA 4MR5A 2DKWA 5H1TA 1E6IA 5C8GA 4UIXA 4O7FA 5DYUA 3O37A 3P1CA 4QSQA 5D7XA 3UV5A 3RCWA 4A9JA 5EWCA 5FB0A 3G0JA 4QBMA 3UV2A 5F60A 5G4SA 2RS9B 4FLPA 5KU3A 4QSXA 4LYSA 4CUUA 3U5NA 4TT2A 4UYFB 4ZQLA 2OO1A 5AD2A 3U5KA 5H1UA 2GRCA 4TQNA 2OUOA 4O7BA 4QR4A 5HEMA 4MR4A 4NYXA 5LKXA 5E3GA 2RFJA 4O76A 3Q2EA 4QSWA 5EISA 3FKMX 5EPSA 5HQ6A 4TT6A 2I7KA 5D26A 5HQ5A 4UITA 5DFBA 5TCMA 2DATA 4YH4A 5L96A 4IOQA 5CPEA 5FE8A 5ENCA 4IR4A 4WIVA 4XUBA 4IOOA 3MULA 4A9LA 4O7EA 4YK0A 3UV4A 4BW3A 5LVRA 5I89A 3LJWA 4Z1QA 5IGKA 4IR3A 4N4FA 5ENFA 5FE4A 3MB3A 4LYWA 4UYHA 2F6JA 4QR3A 5FH7A 2RNXA 5A83A 4QB3A 4YC9A 2YYNA 5EWVA 3I3JA 5IGNA 1EQFA 4HXMA 4ALGA 4A9KA 3QZVA 5FH8A 5C7NA 4LRGA 2YEKA 5A7CA 5CP5A 5IIDA 4NRCA 2L85A 3UVDA 3SVFA 2WP2A 4C66A 2DVSA 4XUAA 4TS8A 5C85A 4OGJA 5EICA 5ENEA 5ENGA 4E96A 5DFCA 4RVRA 5D3SA 5D24A 4HBVA 4O7AA 5I88A 4NUEA 5E9YA 3UVYA 4QUTA 4O71A 4YAXA 5FFVA 2YEMA 4QEWA 4O78A 2OSSA 4QY4A 5DW2A 4OUFA 5BT3A 5F36A 5BT5A 5I7XA 3IU6A 4Q0OA 4UIWA 4MENA 4TYLA 4HXOA 3MB4A 5AMFA 4UYGA 5F25A 5HFQA 2DVRA 3LQIA 4J0SA 5E9VA 4YABA 4CLBA 4NQMA 4LZRA 4PS5A 3ONIA 5IBNA 4LYIA 5A5QA 4C67A 5FE6A 5HRWA 5D25A 4YADA 2RNYA 4YATA 4J1PA 4HXSA 5HELA 4YYDA 4TZ8A 1WUMA 5I7YA 5A5RA 4YBTA 5D0CA 3QZTA 5IGLA 4HBXA 4MEOA 5A82A 5D3HA 5CUAA 3NXBA 5L8TA 2N9GA 5KTUA 4TU4A 4YYMA 3U5OA 3AQAA 4AKNA 2FSAA 5FDZA 4YH3A 5CQ6A 5DW1A 5HM0A 5HFRA 5L98A 4MEPA 4PCEA 4QSPA 4UYFA 4LZ2A 5F3AA 5I86A 4HBYA 4PCIA 3UVXA 4YYJA 5G4RA 5LJ2A 4QSTA 5EQ1A 3G0LA 5CTLA 4NR4A 4NYWA 3DAIA 4UIVA 5II1A 2L84A 3UW9A 4CUSA 4KV4A 4N4IA 5C4QA 3IU5A 4O77A 4WHUA 4CL9A 5KO4A 5CFWA 4QYDA 5EGUA 3LQJA 3P1FA 5DYXA 5D3PA 5CQ3A 5HRXA 4YY4A 5FE9A 4BW2A 5KTWA 4N3WA 5HENA 5EM3A 2DWWA 4CUPA 5I80A 5CUGA 2YW5A 4QNSA 4N4HA 4LZSA 5E0RA 2RI7A 5C89A 3GG3A 3JVMA 5DLZA 5E73A 5EA1A 5LKTA 2R10A 2YDWA 4NYVA 4NRBA 5COIA 5EWWA 4A9HA 4IR6A 3O36A 5EPRA 5F1LA 4Q0NA 4KCXA 2DVQA 4PTBA 5FB1A 5F61A 4TT4A 2R0VA 4QR5A 4ZW1A 4NRAA 5AD3A 5DKHA 5FE5A 5CY9A 5CS8A 4LDFA 4MEQA 4YYGA 5LVQA 4A9FA 4CURA 4TZ2A 3TLPA 3U5MA 5I83A 5L8UA 3P1DA 5F2PA 5I1QA 4NUDA 5HQ7A 3DWYA 3O34A 5E9LA 5KHMA 4N4GA 4Z6HA 5DYCA 4YYHA 2E7NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UIUA 3QZSA 4NR6A 4NS5A 5CQTA 5F1HA 3LXJA 4Z1SA 4QZSA 5JWMA 4YBSA 4YYIA 4UYDA 4WHWA 4PY6A 4A9IA 5E9KA 5FG4A 2D9EA 4QUUA 4MR3A 4TU6A 5ETBA 5CQ5A 3MXFA 4MR6A 2I8NA 3VKGA 5DFDA 1JSPB 4XYAA 2LSPB 5D3NA 5BT4A 5K29A 5FE3A 5A5OA 5FE7A 5ENHA 2RNWA 4OGIA 3U5JA 5CQ8A 4CFKA 3S91A 5CU8A 4UYEA 4QSSA 3U5LA 5CUCA 4NR9A 5HLSA 4YY6A 5LJ1A 1F68A 4O7CA 4O74A 4Z6IA 4QSRA 4HXPA 2YQDA 5F62A 4A9NA 4O70A 5FG5A 5DX4A 4XY9A 5I40A 5FFYA 4HXNA 5A5NA 3O33A 5FFWA 5TB6A 5D3TA 5D3JA 5H85A 5IG6A 5LUUA 2NXBA 4A9MA 5EV9A 4Z93A 4QSUA 4A9OA 5CQAA 3ZYUA 4GPJA 5EI4A 5ACYA 4HBWA 5L97A 5HCLA 3S92A 5CRMA 5CGPA 4YYNA 4J0RA 5DKDA 5F63A 4ZC9A 4Y03A 5J0DA 3P1EA 5CUDA 2H60A 4A9EA 5CQ4A 3ERRA 5EVAA 5EK9A 4HXRA 4IR5A 1JM4B 4QEUA 4BW4A 5HRVA 5F5ZA 2D82A 5HJCA 4YYKA 4PKLA 5E9IA 5E74A 5LKZA 3D1DA 4J3IA 5D3LA 5L99A 4LR6A 4NUCA 5H1VA 4XY8A 5KTXA 5A5SA 5CUEA 3SVGA 3K2JA 5C87A 4YBMA 2YELA 2DVVA 4X2IA 5E7DA 5CUBA 3HMHA 4QEVA 2L5EA 4KV1A 5A81A 1WUGA 5CQ7A 5E3DA 4ALHA 4NXJA 5A5PA 4TTEA 3HMFA 3SVHA 5DYAA 5A85A 5ETDA 5FH6A 4NR8A 3P5OA 5EP7A 3JVLA 5IGMA 5EWDA 4UIYA 3MUKA 4QSVA 4CFLA 5D3RA 5DKCA 5JI8A 4QYLA 4BJXA 5FG6A 5EPBA 2E7OA 5LJ0A 2RO1A 3AADA 3U5PA 4QC3A 4CUQA 5FE2A 5CZGA 5FBXA 4CUTA 3LQHA 5ENBA 4BW1A 5LKUA 3MQMA 5CRZA 5DY7A 2KTBB 2E3KA 3O35A 3JVKA 5FE1A 3JVJA 4AI6A 4QC1A 4NQNA 5II2A 5I29A 1N72A 1X0JA 2F6NA 4O75A 5AMEA 4BHWA 5ENIA 2WP1A 5FE0A 5EWHA 4HXKA 2R0SA 5DLXA 5DBMA 4NR5A 2MJVB 4NR7A 2R0YA 4UIZA 4O72A 5E9MA 5ENJA 4HXLA 2G4AA 4F3IA 4IORA 3UVWA 4DONA 3D7CA 5EU1A 1ZS5A 3HMEA 4LC2A 1ZKRA 3Q2FA 4MR5A 2DKWA 5H1TA 1E6IA 5C8GA 4UIXA 4O7FA 5DYUA 3O37A 3P1CA 4QSQA 5D7XA 3UV5A 3RCWA 4A9JA 5EWCA 5FB0A 3G0JA 4QBMA 3UV2A 5F60A 5G4SA 2RS9B 4FLPA 5KU3A 4QSXA 4LYSA 4CUUA 3U5NA 4TT2A 4UYFB 4ZQLA 2OO1A 5AD2A 3U5KA 5H1UA 2GRCA 4TQNA 2OUOA 4O7BA 4QR4A 5HEMA 4MR4A 4NYXA 5LKXA 5E3GA 2RFJA 4O76A 3Q2EA 4QSWA 5EISA 3FKMX 5EPSA 5HQ6A 4TT6A 2I7KA 5D26A 5HQ5A 4UITA 5DFBA 5TCMA 2DATA 4YH4A 5L96A 4IOQA 5CPEA 5FE8A 5ENCA 4IR4A 4WIVA 4XUBA 4IOOA 3MULA 4A9LA 4O7EA 4YK0A 3UV4A 4BW3A 5LVRA 5I89A 3LJWA 4Z1QA 5IGKA 4IR3A 1PUOA 4N4FA 5ENFA 5FE4A 3MB3A 4LYWA 4UYHA 2F6JA 4QR3A 5FH7A 2RNXA 5A83A 4QB3A 4YC9A 2YYNA 5EWVA 3I3JA 5IGNA 1EQFA 4HXMA 4ALGA 4A9KA 3QZVA 5FH8A 5C7NA 4LRGA 2YEKA 5A7CA 5CP5A 5IIDA 4NRCA 2L85A 3UVDA 3SVFA 2WP2A 4C66A 2DVSA 4XUAA 4TS8A 5C85A 4OGJA 5EICA 5ENEA 5ENGA 4E96A 5DFCA 4RVRA 5D3SA 5D24A 4HBVA 4O7AA 5I88A 4NUEA 5E9YA 3UVYA 4QUTA 4O71A 4YAXA 5FFVA 2YEMA 4QEWA 4O78A 2OSSA 4QY4A 5DW2A 4OUFA 5BT3A 5F36A 3VKHA 5BT5A 5I7XA 3IU6A 4Q0OA 4UIWA 4MENA 4TYLA 4HXOA 3MB4A 5AMFA 4UYGA 5F25A 4AKIA 5HFQA 2DVRA 3LQIA 4J0SA 5E9VA 4YABA 4CLBA 4NQMA 4LZRA 4PS5A 3ONIA 5IBNA 4LYIA 5A5QA 4C67A 5FE6A 5HRWA 5D25A 4YADA 2RNYA 4YATA 4J1PA 4HXSA 5HELA 4YYDA 4TZ8A 1WUMA 5I7YA 5A5RA 4YBTA 5D0CA 3QZTA 5IGLA 4HBXA 4MEOA 5A82A 4AKGA 5D3HA 5CUAA 3NXBA 5L8TA 2N9GA 3D1BA 5KTUA 4TU4A 4YYMA 3U5OA 3AQAA 4AKNA 2FSAA 5FDZA 4YH3A 5CQ6A 5DW1A 5HM0A 5HFRA 5L98A 4MEPA 4PCEA 4QSPA 4UYFA 4LZ2A 5F3AA 5I86A 4HBYA 4PCIA 3UVXA 4YYJA 5G4RA 5LJ2A 4QSTA 5EQ1A 3G0LA 5CTLA 4NR4A 4NYWA 3DAIA 4UIVA 5II1A 2L84A 3UW9A 4CUSA 4KV4A 4N4IA 5C4QA 3IU5A 4O77A 4WHUA 4CL9A 5KO4A 5CFWA 4QYDA 5EGUA 3LQJA 3P1FA 5DYXA 5D3PA 5CQ3A 5HRXA 4YY4A 5FE9A 4BW2A 5KTWA 4N3WA 5HENA 5EM3A 2DWWA 4CUPA 5I80A 5CUGA 2YW5A 4QNSA 4N4HA 4LZSA 5E0RA 2RI7A 5C89A 3GG3A 2EJNA 3JVMA 5DLZA 5E73A 5EA1A 5LKTA 2R10A 2YDWA 4NYVA 4AKHA 4NRBA 5COIA 5EWWA 4A9HA 4IR6A 3O36A 5EPRA 5F1LA 4Q0NA 4KCXA 2DVQA 4PTBA 5FB1A 5F61A 4TT4A 2R0VA 4QR5A 4ZW1A 4NRAA 5AD3A 5DKHA 5FE5A 5CY9A 5CS8A 4LDFA 4MEQA 4YYGA 5LVQA 4A9FA 4CURA 4TZ2A 3TLPA 3U5MA 5I83A 5L8UA 3P1DA 5F2PA 5I1QA 4NUDA 5HQ7A 3DWYA 3O34A 5E9LA 5KHMA 4N4GA 4Z6HA 5DYCA 4YYHA 2E7NA
chains in the Genus database with same CATH topology
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