3UVWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k5ack8ac)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvwA01
3HMFA 3UV5A 5LUUA 4J3IA 2RFJA 4N4GA 2YELA 4UIWA 5F1LA 2MJVB 5DY7A 5COIA 2F6NA 5IBNA 5CFWA 5A5PA 5JI8A 5FE4A 5FE6A 2YEMA 4QYDA 4QEWA 3DAIA 4NS5A 5HM0A 4CL9A 5CQ7A 2RNXA 5F61A 4QUUA 5BT3A 5H85A 4OUFA 4BW3A 4IR5A 4CURA 5CP5A 4ZQLA 4YYKA 5A5RA 5DYUA 3O33A 1ZS5A 5D3NA 1JSPB 3MB4A 3QZTA 4A9JA 4UYDA 3K2JA 5FDZA 5ACYA 5FH6A 3Q2EA 4YYNA 5E9MA 5DFBA 4LYIA 4QSSA 5DX4A 4Y03A 5AMEA 4TZ8A 4MR6A 5D3SA 5DLZA 5HQ5A 4TT4A 4PCEA 5EVAA 5DFDA 4QEVA 4KCXA 3TLPA 4BW1A 4IORA 4LYWA 5EICA 5CUGA 5D25A 3P1FA 5KTXA 5E7DA 5FH7A 4WHUA 5EU1A 5FE1A 5L98A 2F6JA 5E3GA 4NQMA 5D0CA 3JVLA 4C66A 4BW2A 5HQ6A 5FH8A 3JVKA 5F1HA 4UYGA 2DVSA 5CQ4A 5EPBA 5E9IA 4HXKA 3QZSA 4O78A 2D9EA 4IOOA 4YBTA 4CUQA 2RNWA 3P1CA 3AQAA 1WUMA 5H1VA 4QSPA 4O7EA 5EK9A 5EPRA 5FG5A 4YBMA 5I88A 5E9YA 5LKXA 2L5EA 5D3LA 2DVVA 4IOQA 5I29A 5FB1A 5E9LA 5TB6A 4YY4A 3S91A 3O37A 5LKTA 4DONA 4UIXA 4QC3A 4Z6IA 4KV4A 4QEUA 2I8NA 5DKCA 4WHWA 3GG3A 4NRCA 4HXLA 4HXRA 4N4FA 5AMFA 1F68A 5H1TA 5I83A 5ENGA 1E6IA 5FB0A 2KTBB 3SVFA 3P5OA 5ENHA 4TT6A 4YBSA 3FKMX 5FBXA 5IIDA 4PCIA 4OGJA 5IG6A 5BT5A 5D3TA 4HXOA 4HXSA 4CUUA 5C7NA 5EPSA 5CTLA 3ONIA 4YY6A 5ENCA 5ENIA 4E96A 5DBMA 2R0SA 4NUDA 3G0LA 4CFLA 5D24A 3P1DA 3ZYUA 3LQHA 5ENBA 4PKLA 4QYLA 4UYEA 2OO1A 3UVXA 4A9MA 4TT2A 4ALGA 1JM4B 5AD2A 4LDFA 5CQ6A 4QNSA 4F3IA 4IR6A 3SVGA 5A5NA 4MEPA 2YEKA 2L84A 3U5PA 2E7NA 5FE5A 2RO1A 5E74A 4XY8A 4YAXA 3P1EA 4AKNA 5LKZA 5JWMA 4YH3A 4YK0A 5IGKA 4O7AA 3D7CA 2R0VA 5ETBA 2R10A 5L8TA 5FE2A 2RS9B 4MENA 5F5ZA 4YYJA 5L8UA 4UIZA 5HEMA 5FE9A 2FSAA 5AD3A 3LQJA 4UYFA 3MQMA 5D7XA 5E3DA 5DLXA 4NR5A 3UW9A 4A9OA 4MEOA 5DYXA 1X0JA 5D3JA 2R0YA 5CUDA 5HENA 4NRAA 4PTBA 4ZC9A 2L85A 5CPEA 4NR6A 5I7YA 4N4IA 3LXJA 4NRBA 5LJ1A 4XYAA 3O34A 5FFWA 5IGMA 3AADA 3U5NA 3LJWA 4UITA 3HMHA 5C87A 4X2IA 2DVRA 2DKWA 5EWVA 4HXNA 5EP7A 4GPJA 5KHMA 5C85A 3UVWA 4XY9A 4ALHA 4IR4A 2E7OA 2H60A 4TS8A 5A85A 4QR5A 5LVRA 5I86A 5A7CA 5LKUA 5EQ1A 4NYXA 4O74A 5F36A 4NR4A 4PY6A 4Q0OA 4MEQA 5HLSA 2NXBA 3QZVA 3SVHA 5F2PA 4BW4A 3UV2A 4A9IA 4HBXA 5I7XA 4NYVA 5H1UA 2LSPB 5CQ8A 3UV4A 4OGIA 3MXFA 4TTEA 4MR4A 4NR9A 3HMEA 3O36A 3G0JA 5D26A 4UIVA 5DW1A 4O7CA 5LJ0A 4Z1QA 4NR8A 5CQAA 4ZW1A 4NUCA 4QSTA 4Z1SA 5CZGA 5DYAA 4QSRA 5C4QA 5L96A 4NQNA 5I40A 5CS8A 4CUSA 4TZ2A 5BT4A 5HRWA 4O77A 5DKDA 5FE3A 5LJ2A 4QSXA 5EISA 4QC1A 5HFQA 5J0DA 4YATA 4O7FA 5ENJA 5HRXA 5ETDA 5HJCA 5II1A 5EGUA 5FE7A 4BJXA 4LRGA 4QSUA 5EWCA 4O70A 4J0RA 4HBYA 5IGNA 5FFVA 4A9LA 4YH4A 5F3AA 4YC9A 3I3JA 4YADA 4QSWA 4UYHA 5CRZA 5DFCA 2DATA 5DW2A 4QB3A 5HQ7A 4A9KA 1EQFA 4YYGA 5EI4A 5HRVA 2YW5A 5E73A 5CUBA 4J0SA 5ENFA 2YYNA 5F60A 4QSQA 5G4SA 3S92A 5CY9A 4XUBA 4QY4A 2E3KA 3LQIA 4A9FA 2RNYA 3NXBA 4CUTA 5G4RA 5HELA 5EWHA 5A5SA 5I89A 5FG4A 4A9EA 4PS5A 2YDWA 2I7KA 5CRMA 5DKHA 5EV9A 4UIYA 4N4HA 4KV1A 4XUAA 3IU5A 5ENEA 4HXMA 3RCWA 4A9NA 4YYIA 3U5LA 5L99A 5CUAA 5EA1A 5KTWA 4UYFB 5CQ5A 3UVDA 5A5QA 5KTUA 5A5OA 3MB3A 4TYLA 4QUTA 2WP1A 4TU4A 2WP2A 5D3HA 4A9HA 4Q0NA 5KU3A 4BHWA 4TU6A 5FFYA 3Q2FA 5F63A 4QZSA 1WUGA 3JVJA 2DVQA 3U5MA 4N3WA 5CQ3A 4O76A 2D82A 4HBVA 4NYWA 4J1PA 2RI7A 3U5KA 5EWWA 4HXPA 4YYDA 3JVMA 3MULA 4O71A 5IGLA 4CFKA 4IR3A 2OUOA 4LZSA 5II2A 4NR7A 4LZRA 3U5JA 5L97A 3DWYA 4QSVA 4MR3A 5CUEA 4WIVA 5D3PA 4Z6HA 5DYCA 4YYMA 4LYSA 5E9VA 2GRCA 4UIUA 3UVYA 1N72A 4O72A 4QR4A 5I80A 4C67A 4LR6A 4LC2A 4NUEA 5C89A 5F62A 5EWDA 2G4AA 5F25A 4HBWA 5A81A 3O35A 4MR5A 5A83A 5FE8A 4Z93A 2YQDA 5D3RA 5A82A 2N9GA 5CGPA 5FG6A 5E9KA 5CQTA 4FLPA 4LZ2A 3MUKA 4YYHA 5K29A 5C8GA 5CU8A 4CUPA 4O75A 5TCMA 4QR3A 3IU6A 5EM3A 5LVQA 2DWWA 5I1QA 3U5OA 5FE0A 4YABA 4QBMA 5E0RA 4RVRA 4CLBA 5CUCA 5HCLA 4TQNA 4NXJA 2OSSA 5KO4A 4O7BA 5HFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HMFA 4AI6A 3UV5A 5LUUA 4J3IA 2RFJA 4N4GA 2YELA 4UIWA 5F1LA 2MJVB 5DY7A 5COIA 2F6NA 5IBNA 5CFWA 5A5PA 5JI8A 5FE4A 5FE6A 2YEMA 4QYDA 4QEWA 3DAIA 4NS5A 5HM0A 4CL9A 5CQ7A 2RNXA 5F61A 4QUUA 5BT3A 5H85A 4OUFA 4BW3A 4IR5A 4CURA 5CP5A 4ZQLA 4YYKA 5A5RA 5DYUA 3O33A 1ZS5A 5D3NA 1JSPB 3MB4A 3QZTA 4A9JA 4UYDA 3K2JA 5FDZA 5ACYA 5FH6A 3Q2EA 4YYNA 5E9MA 5DFBA 4LYIA 4QSSA 5DX4A 4Y03A 5AMEA 4TZ8A 4MR6A 5D3SA 5DLZA 5HQ5A 4TT4A 4PCEA 5EVAA 5DFDA 4QEVA 4KCXA 3TLPA 4BW1A 4IORA 4LYWA 5EICA 5CUGA 5D25A 3P1FA 5KTXA 5E7DA 5FH7A 4WHUA 5EU1A 5FE1A 5L98A 2F6JA 5E3GA 4NQMA 5D0CA 3JVLA 4C66A 4BW2A 5HQ6A 5FH8A 3JVKA 5F1HA 4UYGA 2DVSA 5CQ4A 3VKGA 5EPBA 5E9IA 4HXKA 3QZSA 4O78A 2D9EA 4IOOA 4YBTA 4CUQA 2RNWA 3P1CA 3AQAA 1WUMA 5H1VA 4QSPA 4O7EA 5EK9A 5EPRA 5FG5A 4YBMA 5I88A 5E9YA 5LKXA 2L5EA 5D3LA 2DVVA 4IOQA 5I29A 5FB1A 5E9LA 5TB6A 4YY4A 3S91A 3O37A 5LKTA 4DONA 4UIXA 4QC3A 4Z6IA 4KV4A 4QEUA 2I8NA 5DKCA 4WHWA 3GG3A 4NRCA 4HXLA 4HXRA 4N4FA 5AMFA 1F68A 5H1TA 5I83A 5ENGA 1E6IA 5FB0A 2KTBB 3SVFA 3P5OA 5ENHA 4TT6A 4YBSA 3FKMX 5FBXA 5IIDA 4PCIA 4OGJA 5IG6A 5BT5A 5D3TA 4HXOA 4HXSA 4CUUA 5C7NA 5EPSA 5CTLA 3ONIA 4YY6A 5ENCA 5ENIA 4E96A 5DBMA 4AKIA 2R0SA 4NUDA 3G0LA 4CFLA 5D24A 3P1DA 3ZYUA 3LQHA 5ENBA 4PKLA 4QYLA 4UYEA 2OO1A 3UVXA 4A9MA 4TT2A 4ALGA 1JM4B 5AD2A 4LDFA 5CQ6A 4QNSA 4F3IA 4IR6A 3SVGA 5A5NA 4MEPA 2YEKA 2L84A 3U5PA 2E7NA 5FE5A 2RO1A 5E74A 4XY8A 4YAXA 3P1EA 4AKNA 5LKZA 5JWMA 4YH3A 4YK0A 5IGKA 4O7AA 3D7CA 2R0VA 3D1BA 5ETBA 2R10A 5L8TA 5FE2A 2RS9B 4MENA 5F5ZA 4YYJA 5L8UA 4UIZA 5HEMA 5FE9A 2FSAA 5AD3A 3LQJA 4UYFA 3MQMA 5D7XA 5E3DA 5DLXA 4NR5A 3UW9A 4A9OA 4MEOA 5DYXA 1X0JA 5D3JA 2R0YA 5CUDA 5HENA 4NRAA 4PTBA 4ZC9A 2L85A 5CPEA 4NR6A 5I7YA 4N4IA 3LXJA 4NRBA 5LJ1A 4XYAA 3O34A 5FFWA 5IGMA 3AADA 3U5NA 3LJWA 4UITA 3HMHA 5C87A 4X2IA 2DVRA 2DKWA 5EWVA 4HXNA 5EP7A 4GPJA 5KHMA 5C85A 3UVWA 4XY9A 4ALHA 4IR4A 2E7OA 2H60A 4TS8A 5A85A 4QR5A 5LVRA 5I86A 5A7CA 5LKUA 3D1DA 5EQ1A 4NYXA 4O74A 5F36A 4NR4A 4AKHA 4PY6A 4Q0OA 4MEQA 5HLSA 2NXBA 3QZVA 3SVHA 5F2PA 4BW4A 3UV2A 4A9IA 4HBXA 5I7XA 4NYVA 5H1UA 2LSPB 5CQ8A 3UV4A 4OGIA 3MXFA 4TTEA 4MR4A 4NR9A 3HMEA 3O36A 3G0JA 5D26A 4UIVA 5DW1A 4O7CA 5LJ0A 4Z1QA 4NR8A 5CQAA 4ZW1A 4NUCA 4QSTA 4Z1SA 5CZGA 5DYAA 4QSRA 5C4QA 5L96A 4NQNA 5I40A 5CS8A 4CUSA 4TZ2A 5BT4A 5HRWA 4O77A 5DKDA 5FE3A 5LJ2A 4QSXA 5EISA 4QC1A 5HFQA 5J0DA 4YATA 4O7FA 5ENJA 5HRXA 5ETDA 5HJCA 5II1A 5EGUA 5FE7A 4BJXA 4LRGA 4QSUA 5EWCA 4O70A 4J0RA 4HBYA 5IGNA 5FFVA 4A9LA 4YH4A 5F3AA 4YC9A 2EJNA 3I3JA 4YADA 4QSWA 4UYHA 5CRZA 5DFCA 2DATA 5DW2A 4QB3A 5HQ7A 4A9KA 1EQFA 4YYGA 5EI4A 5HRVA 2YW5A 5E73A 5CUBA 4J0SA 5ENFA 2YYNA 5F60A 4QSQA 5G4SA 3S92A 5CY9A 4XUBA 4QY4A 2E3KA 3LQIA 4A9FA 2RNYA 3NXBA 4CUTA 5G4RA 5HELA 5EWHA 5A5SA 5I89A 5FG4A 4A9EA 4PS5A 2YDWA 3ERRA 2I7KA 5CRMA 5DKHA 5EV9A 4UIYA 4N4HA 4KV1A 4XUAA 3IU5A 5ENEA 4HXMA 3RCWA 4A9NA 4YYIA 3U5LA 5L99A 5CUAA 5EA1A 5KTWA 4UYFB 5CQ5A 3UVDA 5A5QA 5KTUA 5A5OA 3MB3A 4TYLA 4QUTA 2WP1A 4TU4A 2WP2A 5D3HA 4A9HA 4Q0NA 5KU3A 4BHWA 4TU6A 5FFYA 3Q2FA 5F63A 4AKGA 4QZSA 1WUGA 3JVJA 2DVQA 3U5MA 1ZKRA 4N3WA 5CQ3A 1PUOA 4O76A 2D82A 4HBVA 4NYWA 4J1PA 2RI7A 3U5KA 5EWWA 4HXPA 4YYDA 3JVMA 3MULA 4O71A 5IGLA 4CFKA 4IR3A 2OUOA 4LZSA 5II2A 4NR7A 4LZRA 3U5JA 5L97A 3DWYA 4QSVA 4MR3A 5CUEA 4WIVA 5D3PA 4Z6HA 5DYCA 4YYMA 4LYSA 5E9VA 2GRCA 4UIUA 3UVYA 1N72A 4O72A 4QR4A 5I80A 4C67A 4LR6A 4LC2A 4NUEA 5C89A 5F62A 5EWDA 2G4AA 5F25A 4HBWA 5A81A 3O35A 4MR5A 5A83A 5FE8A 4Z93A 2YQDA 5D3RA 5A82A 2N9GA 5CGPA 5FG6A 5E9KA 5CQTA 4FLPA 4LZ2A 3MUKA 4YYHA 5K29A 5C8GA 5CU8A 4CUPA 4O75A 5TCMA 4QR3A 3IU6A 5EM3A 5LVQA 2DWWA 3VKHA 5I1QA 3U5OA 5FE0A 4YABA 4QBMA 5E0RA 4RVRA 4CLBA 5CUCA 5HCLA 4TQNA 4NXJA 2OSSA 5KO4A 4O7BA 5HFRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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