5KTUA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to pyrazolopiperidine scaffold
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'ELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ktuA00
3D7CA 2DVVA 5AMFA 4NQMA 3UV4A 5HQ6A 5H85A 5D3HA 4QEVA 4NR7A 4TU6A 3Q2EA 2DWWA 5A85A 4QC3A 4PCEA 4QEUA 4QYDA 4IOOA 4J1PA 4MR6A 5II1A 5ENIA 4IR5A 4QYLA 4O7BA 2KTBB 5IGLA 5A5QA 4QSVA 4ALHA 5A5NA 5I83A 4MEOA 5D25A 5E3DA 5L99A 5LVQA 3O35A 4LYWA 2DATA 4DONA 4HXLA 4QNSA 5IIDA 5HQ7A 5DW1A 5HCLA 3O33A 4LRGA 4QEWA 5FFYA 4QR5A 5EISA 5LKZA 4PCIA 4BW3A 4XUAA 3LJWA 5DKDA 5CUGA 4YYGA 4MR5A 4LDFA 5FDZA 4LYIA 5D0CA 4O7CA 5A5PA 5ENBA 5ENGA 5F1HA 4ZC9A 4HXSA 4NYVA 4TTEA 5EWVA 3U5PA 5EWCA 2E7NA 5COIA 4TS8A 4LZSA 5F25A 4BW4A 5A7CA 4A9HA 4LYSA 5E9MA 5H1UA 5DKCA 2N9GA 5DYXA 5CQ3A 5DFCA 4QR3A 4J0SA 4OUFA 5FFVA 3JVMA 4NUCA 4YH4A 5G4SA 5I29A 4HXOA 5KTWA 5H1TA 2RI7A 2YW5A 4HBXA 5DBMA 4YYJA 2E3KA 3LQIA 5F60A 5FE7A 4UYFA 3LQHA 5EPSA 5D7XA 5LKXA 2YYNA 4TQNA 5F61A 4MEPA 4HXPA 5EWHA 4KV1A 2OUOA 3MB3A 4QSPA 4YH3A 5EA1A 5IGKA 4A9KA 4TT4A 3DAIA 4YK0A 5FE4A 4Z6IA 4NXJA 5EU1A 4O7AA 5CQ6A 4ALGA 4NYXA 4YABA 3P1CA 5EPRA 5KU3A 4OGIA 2OO1A 4KV4A 4KCXA 5HQ5A 4A9JA 4YC9A 5L98A 4A9IA 5C87A 4Y03A 5C7NA 3MULA 5LKUA 2R0VA 4OGJA 3AQAA 2R0SA 5ETDA 5CUBA 5ENCA 4YYMA 2R10A 3JVLA 5A5RA 3UVXA 5CY9A 5FFWA 2YQDA 2L84A 4N4FA 4QY4A 5CRZA 5E74A 2G4AA 3MQMA 1F68A 5CPEA 4TU4A 5FH6A 5FE6A 4YYHA 1WUMA 5ENJA 4N3WA 2RNYA 5CZGA 3U5KA 5FE3A 4PS5A 5CQ4A 4CUQA 3LXJA 4UYDA 3QZTA 5BT3A 2RO1A 5CUAA 4QB3A 4A9MA 3HMFA 5C89A 5LVRA 5F2PA 5CP5A 5C4QA 4UIWA 4CLBA 5FB0A 2DVQA 5CUCA 2R0YA 4MR4A 5HELA 5E0RA 2NXBA 5DYCA 4TZ2A 5EI4A 4TZ8A 3IU5A 5A82A 4WHUA 5EVAA 5F1LA 1EQFA 3UV2A 4UIVA 2WP1A 5ENFA 5CFWA 5I88A 5EICA 5HJCA 3U5LA 4YBSA 5JWMA 5C85A 4Z1QA 4FLPA 5DLXA 4UYHA 1JSPB 2FSAA 4YY6A 4YYDA 5HLSA 3I3JA 4CUTA 2D9EA 4BW1A 4YATA 4NRBA 2YEMA 5FE1A 5CQAA 5EGUA 2YELA 3UVYA 4O75A 5EWWA 4CFKA 4N4GA 5ETBA 3SVGA 5I7YA 5DW2A 3HMEA 4HBVA 5TB6A 4O74A 4YY4A 4NUDA 4HXNA 5LUUA 4E96A 3MXFA 4O78A 4Q0OA 4LR6A 5DYAA 5E9YA 4F3IA 5ENEA 3K2JA 3S91A 3QZSA 4UIZA 2DVRA 4IR3A 4IORA 5D3SA 4NUEA 3Q2FA 3MB4A 3P1FA 4QSQA 5DX4A 4ZW1A 4BHWA 5EP7A 4QSWA 3UVDA 4A9NA 3HMHA 4MR3A 2RNXA 4UYEA 4WHWA 5EPBA 4HXKA 2YDWA 5D3JA 4NR6A 5F62A 4C67A 5LJ0A 3O36A 5A5OA 5LJ2A 5FE9A 5AD2A 5F5ZA 5K29A 4Z1SA 4J0RA 5KTUA 4IR4A 5CU8A 2I7KA 4A9FA 5E3GA 5F3AA 4IOQA 3ZYUA 4X2IA 5FE8A 5G4RA 5F63A 3NXBA 5J0DA 1WUGA 4Z6HA 5I40A 4NR8A 5D26A 4BJXA 4Q0NA 1ZS5A 4XYAA 2RNWA 3DWYA 4CUSA 5D3NA 5JI8A 5DY7A 2DKWA 5LJ1A 2LSPB 5FG5A 4NR4A 4CUPA 5D3RA 4Z93A 4QSTA 3SVFA 5HRVA 2MJVB 3UV5A 4TT2A 4MENA 3QZVA 3IU6A 4C66A 5BT5A 4NRCA 3U5MA 3P1DA 4O70A 4UIYA 5D24A 2RFJA 4YBMA 5I80A 2D82A 4YADA 5HFQA 5IG6A 4XY8A 4A9OA 4NYWA 5CUEA 5DKHA 4NQNA 4A9LA 5E9KA 5FE0A 3U5NA 4NS5A 5EQ1A 5EV9A 4IR6A 2RS9B 3P5OA 4HXMA 2DVSA 4RVRA 3ONIA 4CFLA 3SVHA 4QUUA 5IGNA 5CQTA 5I7XA 5ENHA 5FB1A 5AMEA 5CGPA 5L8UA 4O7EA 4A9EA 3G0JA 5DYUA 4UIUA 1JM4B 4N4HA 2E7OA 5CQ8A 4NRAA 5TCMA 5FG6A 5I1QA 4YYNA 4TYLA 4CL9A 5BT4A 4XUBA 5D3PA 3LQJA 4CUUA 4PTBA 4QSXA 5IGMA 4QC1A 4MEQA 4QBMA 4O77A 4XY9A 3O34A 2YEKA 5EM3A 3JVJA 4QSSA 4HBWA 5FG4A 5HM0A 5L97A 3S92A 5ACYA 3MUKA 5II2A 5E73A 3AADA 5HEMA 4AKNA 4HXRA 5FBXA 5CS8A 5HENA 5KO4A 4UITA 4O72A 2WP2A 5FH7A 5KTXA 3U5JA 2F6NA 5FE5A 5AD3A 3TLPA 4QUTA 2F6JA 4NR5A 5DFBA 5FH8A 5EK9A 5E9IA 5E7DA 5L96A 4LC2A 5C8GA 4QZSA 5CUDA 4PKLA 5LKTA 5IBNA 5I86A 1E6IA 5E9VA 5A5SA 4LZRA 2I8NA 3O37A 4CURA 4QR4A 4YAXA 2L85A 4O7FA 4QSUA 5L8TA 2H60A 5E9LA 3P1EA 5CRMA 5D3LA 4ZQLA 5A83A 4J3IA 4HBYA 5F36A 5D3TA 4O71A 1X0JA 5H1VA 3JVKA 5HRXA 4O76A 4TT6A 4LZ2A 4YYKA 5A81A 4UIXA 3UVWA 4YBTA 4QSRA 2GRCA 2OSSA 3UW9A 5HFRA 4BW2A 5FE2A 3G0LA 3GG3A 3RCWA 4UYFB 5CQ7A 2L5EA 4YYIA 3U5OA 5I89A 4N4IA 5KHMA 4UYGA 4NR9A 5HRWA 5CTLA 4WIVA 5DFDA 3FKMX 4PY6A 1N72A 4GPJA 5EWDA 5DLZA 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7CA 2DVVA 5AMFA 4NQMA 3UV4A 5HQ6A 5H85A 5D3HA 4QEVA 4NR7A 4TU6A 3Q2EA 2DWWA 5A85A 4QC3A 4PCEA 4QEUA 4QYDA 4IOOA 4J1PA 4MR6A 5II1A 5ENIA 4IR5A 4QYLA 4O7BA 2KTBB 5IGLA 5A5QA 4QSVA 4ALHA 5A5NA 5I83A 4MEOA 5D25A 5E3DA 5L99A 5LVQA 3O35A 4LYWA 2DATA 4DONA 4HXLA 4QNSA 5IIDA 5HQ7A 5DW1A 5HCLA 3O33A 4LRGA 4QEWA 5FFYA 4QR5A 5EISA 5LKZA 4PCIA 4BW3A 4XUAA 3LJWA 5DKDA 5CUGA 4YYGA 4MR5A 4LDFA 5FDZA 4LYIA 5D0CA 4O7CA 5A5PA 5ENBA 5ENGA 5F1HA 4ZC9A 4HXSA 4NYVA 4TTEA 5EWVA 3U5PA 5EWCA 2E7NA 5COIA 4TS8A 4LZSA 5F25A 4BW4A 5A7CA 4A9HA 4LYSA 5E9MA 5H1UA 5DKCA 2N9GA 5DYXA 5CQ3A 5DFCA 4QR3A 4J0SA 4OUFA 5FFVA 3JVMA 4NUCA 4YH4A 5G4SA 5I29A 4HXOA 5KTWA 5H1TA 2RI7A 2YW5A 4HBXA 5DBMA 4YYJA 2E3KA 3LQIA 5F60A 5FE7A 4UYFA 3LQHA 5EPSA 5D7XA 5LKXA 2YYNA 4TQNA 5F61A 4MEPA 4HXPA 5EWHA 4KV1A 4AKIA 2OUOA 3MB3A 4QSPA 4YH3A 5EA1A 5IGKA 4A9KA 4TT4A 3DAIA 4YK0A 5FE4A 4AI6A 4Z6IA 4NXJA 5EU1A 4O7AA 5CQ6A 4ALGA 4NYXA 4YABA 3P1CA 5EPRA 5KU3A 4OGIA 2OO1A 4KV4A 4KCXA 5HQ5A 4A9JA 4YC9A 5L98A 4A9IA 5C87A 4Y03A 5C7NA 3MULA 5LKUA 2R0VA 4OGJA 3AQAA 2R0SA 5ETDA 5CUBA 5ENCA 4YYMA 2R10A 3JVLA 4AKHA 5A5RA 3UVXA 5CY9A 5FFWA 2YQDA 2L84A 4N4FA 4QY4A 5CRZA 5E74A 2G4AA 3MQMA 1F68A 5CPEA 1ZKRA 4TU4A 5FH6A 5FE6A 4YYHA 1WUMA 5ENJA 4N3WA 2RNYA 5CZGA 3U5KA 5FE3A 4PS5A 5CQ4A 4CUQA 3LXJA 4UYDA 3QZTA 5BT3A 2RO1A 5CUAA 4QB3A 4A9MA 3HMFA 5C89A 5LVRA 2EJNA 5F2PA 5CP5A 3ERRA 5C4QA 4UIWA 4CLBA 5FB0A 2DVQA 5CUCA 2R0YA 4MR4A 1PUOA 5HELA 5E0RA 2NXBA 5DYCA 4TZ2A 5EI4A 4TZ8A 3IU5A 5A82A 4WHUA 5EVAA 5F1LA 1EQFA 3UV2A 4UIVA 2WP1A 5ENFA 5CFWA 5I88A 5EICA 5HJCA 3U5LA 4YBSA 5JWMA 5C85A 4Z1QA 4FLPA 5DLXA 4UYHA 1JSPB 2FSAA 4YY6A 4YYDA 5HLSA 3I3JA 4CUTA 2D9EA 4BW1A 4YATA 4NRBA 2YEMA 5FE1A 5CQAA 5EGUA 2YELA 3UVYA 4O75A 5EWWA 4CFKA 4N4GA 5ETBA 3SVGA 5I7YA 5DW2A 3HMEA 4HBVA 5TB6A 4O74A 4YY4A 4NUDA 4HXNA 5LUUA 4E96A 3MXFA 4O78A 4Q0OA 4LR6A 5DYAA 5E9YA 4F3IA 5ENEA 3K2JA 4AKGA 3S91A 3QZSA 4UIZA 2DVRA 4IR3A 4IORA 5D3SA 4NUEA 3Q2FA 3MB4A 3P1FA 4QSQA 5DX4A 4ZW1A 4BHWA 5EP7A 4QSWA 3UVDA 4A9NA 3HMHA 4MR3A 2RNXA 4UYEA 4WHWA 5EPBA 4HXKA 2YDWA 5D3JA 4NR6A 5F62A 4C67A 5LJ0A 3O36A 5A5OA 5LJ2A 5FE9A 5AD2A 5F5ZA 5K29A 4Z1SA 4J0RA 5KTUA 4IR4A 5CU8A 2I7KA 4A9FA 5E3GA 5F3AA 4IOQA 3ZYUA 4X2IA 5FE8A 5G4RA 5F63A 3NXBA 5J0DA 1WUGA 4Z6HA 5I40A 4NR8A 5D26A 4BJXA 4Q0NA 1ZS5A 4XYAA 2RNWA 3DWYA 4CUSA 5D3NA 5JI8A 5DY7A 2DKWA 5LJ1A 2LSPB 5FG5A 4NR4A 4CUPA 5D3RA 4Z93A 4QSTA 3SVFA 5HRVA 2MJVB 3UV5A 4TT2A 4MENA 3QZVA 3IU6A 4C66A 5BT5A 4NRCA 3U5MA 3P1DA 4O70A 4UIYA 5D24A 2RFJA 4YBMA 5I80A 2D82A 4YADA 5HFQA 5IG6A 4XY8A 4A9OA 4NYWA 5CUEA 5DKHA 4NQNA 4A9LA 5E9KA 5FE0A 3U5NA 4NS5A 5EQ1A 5EV9A 4IR6A 2RS9B 3P5OA 4HXMA 2DVSA 4RVRA 3ONIA 4CFLA 3SVHA 4QUUA 5IGNA 5CQTA 5I7XA 5ENHA 5FB1A 5AMEA 5CGPA 5L8UA 4O7EA 4A9EA 3G0JA 5DYUA 4UIUA 1JM4B 4N4HA 2E7OA 5CQ8A 4NRAA 5TCMA 5FG6A 5I1QA 4YYNA 3D1DA 4TYLA 4CL9A 5BT4A 4XUBA 5D3PA 3LQJA 4CUUA 4PTBA 4QSXA 5IGMA 4QC1A 4MEQA 4QBMA 4O77A 4XY9A 3O34A 2YEKA 5EM3A 3JVJA 4QSSA 4HBWA 5FG4A 5HM0A 5L97A 3S92A 5ACYA 3MUKA 5II2A 5E73A 3AADA 5HEMA 4AKNA 4HXRA 5FBXA 5CS8A 5HENA 5KO4A 4UITA 4O72A 2WP2A 5FH7A 5KTXA 3U5JA 2F6NA 5FE5A 5AD3A 3TLPA 4QUTA 2F6JA 4NR5A 5DFBA 5FH8A 5EK9A 5E9IA 5E7DA 5L96A 4LC2A 5C8GA 4QZSA 5CUDA 4PKLA 5LKTA 5IBNA 5I86A 1E6IA 5E9VA 5A5SA 4LZRA 2I8NA 3O37A 4CURA 4QR4A 4YAXA 2L85A 4O7FA 4QSUA 5L8TA 2H60A 5E9LA 3P1EA 5CRMA 5D3LA 4ZQLA 5A83A 4J3IA 4HBYA 5F36A 5D3TA 4O71A 1X0JA 5H1VA 3JVKA 5HRXA 4O76A 4TT6A 4LZ2A 4YYKA 5A81A 4UIXA 3UVWA 4YBTA 4QSRA 2GRCA 2OSSA 3VKHA 3UW9A 5HFRA 4BW2A 5FE2A 3G0LA 3GG3A 3RCWA 4UYFB 5CQ7A 2L5EA 4YYIA 3U5OA 5I89A 4N4IA 3VKGA 5KHMA 4UYGA 4NR9A 5HRWA 5CTLA 4WIVA 5DFDA 3FKMX 4PY6A 1N72A 4GPJA 3D1BA 5EWDA 5DLZA 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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