5KTUA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to pyrazolopiperidine scaffold
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
ELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ktuA00
4TQNA 5CZGA 5I1QA 5C87A 4N4HA 3RCWA 5I29A 5KTWA 5EWWA 5CPEA 4UIYA 4LC2A 5D7XA 5HQ5A 5LJ1A 5LVRA 4QUUA 5D3LA 3U5PA 4MEQA 2RO1A 3S92A 4KV1A 5C89A 5DYUA 5IGKA 4A9KA 5ENGA 4QSWA 5HRVA 4CURA 5E9YA 4QYDA 4A9HA 4A9EA 1F68A 4LYIA 4TS8A 3I3JA 5E9VA 5HLSA 2DVVA 5HRWA 5E9MA 4NQMA 4O70A 4MEPA 5FG4A 4HBXA 2DVQA 4IR5A 5EM3A 4Z1SA 5AMFA 5FH7A 4HXNA 3UV4A 2NXBA 4IR3A 5FE2A 4RVRA 3LQHA 4N4GA 5E73A 5IBNA 3UVDA 2L5EA 5D3PA 4HXLA 5DFCA 5E9IA 5LVQA 4QSUA 5CQ4A 4BHWA 3O37A 5D0CA 5F63A 4QEWA 4PCIA 4IOQA 4HXMA 2DKWA 4HBWA 3SVHA 5EGUA 4Q0NA 2R0VA 5J0DA 4NRCA 4HBYA 5TB6A 2L84A 3MB3A 5A7CA 4TTEA 3UV2A 4WHWA 5F36A 5EWVA 3P1EA 4QC3A 4J0SA 4O7EA 4YYJA 4QUTA 5A82A 4UITA 3JVMA 5ENJA 4QR5A 3LQJA 3O35A 4IOOA 4QB3A 5IG6A 2YELA 5FE5A 5LJ0A 4LR6A 5EQ1A 2N9GA 4O7AA 4LYWA 3HMEA 4O7FA 4QNSA 2D9EA 5F1LA 3P1CA 5G4RA 5COIA 4MENA 2FSAA 1JM4B 4HXKA 3G0JA 3UVWA 5FE3A 4A9LA 3LXJA 3QZTA 4NYXA 4UYDA 5I83A 4HBVA 4YBTA 3UVXA 4PS5A 4NR7A 5HJCA 4CUTA 2I8NA 3K2JA 5CFWA 2R10A 5DKHA 5L8UA 3U5JA 3U5NA 4NR9A 5KTXA 3MUKA 3O36A 3JVLA 5BT5A 5K29A 5EP7A 5CQTA 5KHMA 3U5MA 5C7NA 5H85A 5II2A 4LZRA 3QZSA 4QEVA 2RNWA 4OGIA 5HQ7A 4F3IA 2DWWA 2R0YA 4O76A 5AD3A 3U5OA 4QR4A 4X2IA 5ENIA 5A5QA 3O34A 3SVFA 4UYFA 5IIDA 5L99A 5L96A 5FDZA 5D25A 4QZSA 4QSVA 4OGJA 5D3NA 4UYFB 4XY8A 3LJWA 5ACYA 5A5NA 4A9MA 4YADA 4C67A 4WHUA 1ZS5A 5D3HA 5E3DA 5CQ5A 5F1HA 2WP2A 3JVJA 3MQMA 4QSQA 5DLXA 5DYXA 4BW3A 5DFBA 5FB0A 4CL9A 5FE6A 5A81A 4IR4A 4YATA 4PTBA 5CQAA 5EWCA 5FH8A 5DKDA 5EV9A 5CTLA 5FFYA 3LQIA 5KO4A 2MJVB 4BJXA 2E7OA 5FB1A 5EA1A 5DY7A 5CQ6A 5CUEA 5JWMA 4CUQA 4YH4A 2YQDA 4QBMA 4QSSA 5CUGA 3Q2EA 5EPSA 4NS5A 5LKZA 4UYGA 5HM0A 2RS9B 5EVAA 3GG3A 4YYDA 4TYLA 5I86A 5II1A 2G4AA 4Z6HA 5LKTA 5CP5A 5C85A 4O7CA 5LJ2A 4YBMA 3SVGA 2YW5A 5FFWA 3UVYA 5KTUA 3UV5A 5ENEA 4BW1A 4PY6A 5ENBA 4J1PA 5D24A 3U5LA 5A5RA 5DW2A 4NYVA 4QSXA 5ETBA 5CQ7A 4UIWA 5CRZA 5AMEA 4NRAA 5CGPA 4YH3A 5DX4A 4XYAA 5D3TA 4MR6A 4O77A 4YBSA 5LUUA 3ONIA 2I7KA 4UIUA 5EU1A 4Q0OA 5FG6A 4UIXA 5LKXA 4TZ2A 4YYIA 5I7YA 5F2PA 5IGLA 3O33A 2WP1A 5EISA 5EICA 5A5PA 5A83A 2D82A 3UW9A 4MR5A 4N3WA 1EQFA 3NXBA 4NR6A 3HMHA 4CUUA 5F62A 4UIZA 5L98A 2LSPB 4GPJA 4QR3A 4MR3A 4ZW1A 3S91A 4UYEA 3AADA 5I88A 3P1FA 4CFLA 2F6NA 5FE8A 4BW4A 5I7XA 5FE4A 4IORA 5FE0A 5CY9A 5HEMA 4LDFA 4TT6A 5G4SA 4HXRA 2YEKA 4YYKA 2YEMA 3FKMX 5HELA 4TU4A 4KCXA 5CUAA 1E6IA 3DWYA 3MB4A 2R0SA 4LZ2A 5EPRA 4YABA 5IGMA 3DAIA 5BT4A 4PKLA 5I80A 5E9KA 4TU6A 5F25A 2DATA 5FE7A 4NR8A 4YYGA 4LRGA 4MR4A 4NUDA 4QEUA 5CS8A 4ZC9A 5A85A 4Y03A 5EPBA 4A9OA 4XUBA 5FH6A 4O74A 3ZYUA 2RNYA 2F6JA 5FE1A 5EWDA 4QSTA 5HCLA 3MULA 4FLPA 5E0RA 4YAXA 4A9NA 4YYMA 4LYSA 5CQ8A 5HENA 2YYNA 5ENHA 4E96A 2E7NA 4O72A 4O7BA 5H1VA 3MXFA 5ETDA 4NXJA 4Z1QA 5F5ZA 4NR5A 4NUEA 3QZVA 4UIVA 5FG5A 4YYNA 2RI7A 1JSPB 4CUSA 5CUCA 4LZSA 4HXOA 5F61A 4J0RA 4PCEA 5ENCA 2DVRA 5D3RA 4QSRA 5A5SA 5E74A 4YY4A 3JVKA 5E7DA 5AD2A 4O71A 5D26A 2YDWA 4YYHA 4XUAA 4IR6A 5DKCA 5H1UA 5C4QA 5LKUA 4C66A 3Q2FA 5DW1A 4TZ8A 4TT2A 4NUCA 5EWHA 4N4FA 4QSPA 4NYWA 4AKNA 5EI4A 2DVSA 4YC9A 4A9FA 5DLZA 5HFQA 4DONA 5FFVA 3P1DA 5HRXA 3U5KA 5EK9A 5DYCA 5H1TA 4ZQLA 5FBXA 2H60A 5BT3A 4CLBA 3HMFA 4O75A 5CUDA 4QYLA 4Z6IA 2KTBB 4MEOA 1X0JA 3TLPA 5DBMA 5HFRA 1N72A 5E3GA 1WUGA 3IU6A 5CU8A 5C8GA 3G0LA 4A9IA 4HXPA 5I40A 5D3JA 4UYHA 5ENFA 5TCMA 2E3KA 4CFKA 2RFJA 5IGNA 5E9LA 3P5OA 4OUFA 5DFDA 4J3IA 5CRMA 5DYAA 5I89A 3AQAA 4CUPA 2OO1A 5CUBA 1WUMA 3D7CA 4TT4A 5L97A 4ALHA 4A9JA 4Z93A 2OSSA 5L8TA 2GRCA 4NRBA 4KV4A 4QY4A 2RNXA 5F60A 4YY6A 4QC1A 5D3SA 4ALGA 5HQ6A 3IU5A 4NQNA 4YK0A 5CQ3A 4HXSA 5JI8A 4O78A 4BW2A 2L85A 5KU3A 4XY9A 5A5OA 5FE9A 5F3AA 2OUOA 4NR4A 4WIVA 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TQNA 5CZGA 5I1QA 5C87A 4N4HA 3RCWA 5I29A 5KTWA 5EWWA 5CPEA 4UIYA 4LC2A 5D7XA 5HQ5A 5LJ1A 5LVRA 4QUUA 5D3LA 3U5PA 4MEQA 2RO1A 3S92A 4KV1A 5C89A 5DYUA 5IGKA 4A9KA 5ENGA 4QSWA 5HRVA 4CURA 5E9YA 4QYDA 3ERRA 4A9HA 4A9EA 1F68A 4LYIA 4TS8A 3I3JA 5E9VA 5HLSA 2DVVA 5HRWA 5E9MA 4NQMA 4O70A 4MEPA 5FG4A 4HBXA 2DVQA 4IR5A 5EM3A 4Z1SA 5AMFA 5FH7A 4HXNA 3UV4A 2NXBA 4IR3A 3D1BA 4RVRA 3LQHA 4N4GA 5E73A 5FE2A 5IBNA 3UVDA 2L5EA 5D3PA 4HXLA 5DFCA 5E9IA 5LVQA 4QSUA 5CQ4A 4BHWA 3O37A 5D0CA 5F63A 4QEWA 4PCIA 4IOQA 4HXMA 2DKWA 4HBWA 3SVHA 5EGUA 4Q0NA 2R0VA 5J0DA 4NRCA 4HBYA 5TB6A 2L84A 3MB3A 5A7CA 4TTEA 3UV2A 4WHWA 5F36A 5EWVA 3P1EA 4QC3A 4J0SA 4O7EA 4YYJA 4QUTA 5A82A 4UITA 3JVMA 5ENJA 4QR5A 3LQJA 3O35A 4IOOA 4QB3A 5IG6A 2YELA 5FE5A 4AKGA 5LJ0A 4LR6A 5EQ1A 2N9GA 4O7AA 4LYWA 3HMEA 4O7FA 4QNSA 2D9EA 5F1LA 3P1CA 5G4RA 5COIA 4MENA 2FSAA 1JM4B 4HXKA 3G0JA 3UVWA 5FE3A 4A9LA 3LXJA 3QZTA 4NYXA 4UYDA 5I83A 4HBVA 4YBTA 3UVXA 4PS5A 4NR7A 5HJCA 4CUTA 2I8NA 3K2JA 5CFWA 2R10A 5DKHA 5L8UA 3U5JA 3U5NA 4NR9A 5KTXA 3MUKA 3O36A 3JVLA 5BT5A 5K29A 5EP7A 5CQTA 5KHMA 3U5MA 5C7NA 5H85A 5II2A 4LZRA 3QZSA 4QEVA 2RNWA 4OGIA 5HQ7A 4F3IA 2DWWA 2R0YA 4O76A 5AD3A 3U5OA 4QR4A 4X2IA 5ENIA 5A5QA 3O34A 3SVFA 4UYFA 5IIDA 5L99A 5L96A 5FDZA 5D25A 4QZSA 4QSVA 4OGJA 5D3NA 4UYFB 4XY8A 3LJWA 5ACYA 5A5NA 4A9MA 4YADA 4C67A 4WHUA 1ZS5A 5D3HA 5E3DA 5CQ5A 5F1HA 2WP2A 3JVJA 3MQMA 4QSQA 5DLXA 5DYXA 4BW3A 5DFBA 5FB0A 4CL9A 5FE6A 5A81A 4IR4A 4YATA 4PTBA 5CQAA 5EWCA 5FH8A 5DKDA 5EV9A 5CTLA 5FFYA 3LQIA 5KO4A 2MJVB 4BJXA 2E7OA 5FB1A 5EA1A 5DY7A 5CQ6A 5CUEA 5JWMA 4CUQA 4YH4A 2YQDA 4QBMA 4QSSA 5CUGA 3Q2EA 5EPSA 4NS5A 5LKZA 4UYGA 5HM0A 2RS9B 5EVAA 3GG3A 4YYDA 4TYLA 5I86A 5II1A 2G4AA 4Z6HA 5LKTA 5CP5A 5C85A 4O7CA 5LJ2A 4YBMA 3SVGA 2YW5A 5FFWA 3UVYA 5KTUA 3UV5A 5ENEA 4BW1A 4PY6A 5ENBA 4J1PA 5D24A 3U5LA 5A5RA 5DW2A 4NYVA 4QSXA 5ETBA 5CQ7A 4UIWA 3D1DA 5CRZA 5AMEA 4NRAA 5CGPA 4YH3A 5DX4A 4XYAA 5D3TA 4MR6A 4O77A 4YBSA 5LUUA 3ONIA 2I7KA 4UIUA 5EU1A 4Q0OA 5FG6A 4UIXA 5LKXA 4TZ2A 4YYIA 5I7YA 5F2PA 5IGLA 3O33A 2WP1A 5EISA 5EICA 5A5PA 5A83A 2D82A 3UW9A 4MR5A 4N3WA 1EQFA 3NXBA 4NR6A 3HMHA 4CUUA 5F62A 4UIZA 5L98A 2LSPB 4GPJA 4QR3A 4MR3A 4ZW1A 3S91A 4UYEA 3AADA 5I88A 3P1FA 4CFLA 2F6NA 5FE8A 4BW4A 5I7XA 5FE4A 4IORA 5FE0A 5CY9A 5HEMA 4LDFA 4TT6A 5G4SA 4HXRA 2YEKA 4YYKA 2YEMA 3FKMX 5HELA 4TU4A 4KCXA 5CUAA 1E6IA 3DWYA 1PUOA 3MB4A 2R0SA 4LZ2A 5EPRA 4YABA 5IGMA 3DAIA 5BT4A 4PKLA 5I80A 5E9KA 4TU6A 5F25A 2DATA 5FE7A 4NR8A 4YYGA 4LRGA 4MR4A 4NUDA 4QEUA 5CS8A 4ZC9A 5A85A 4Y03A 5EPBA 4A9OA 4XUBA 5FH6A 4O74A 3ZYUA 2RNYA 2F6JA 5FE1A 5EWDA 4QSTA 5HCLA 3MULA 4FLPA 5E0RA 4YAXA 4A9NA 4YYMA 2EJNA 4LYSA 5CQ8A 5HENA 2YYNA 5ENHA 4E96A 2E7NA 4O72A 4O7BA 5H1VA 3MXFA 5ETDA 4NXJA 4Z1QA 5F5ZA 4NR5A 4NUEA 3QZVA 4UIVA 5FG5A 4YYNA 4AI6A 2RI7A 1JSPB 4CUSA 5CUCA 4LZSA 4HXOA 5F61A 4J0RA 4PCEA 5ENCA 2DVRA 5D3RA 4QSRA 5A5SA 5E74A 4YY4A 3JVKA 5E7DA 5AD2A 4O71A 5D26A 2YDWA 4YYHA 4XUAA 4IR6A 5DKCA 5H1UA 5C4QA 5LKUA 4C66A 3Q2FA 5DW1A 4TZ8A 4TT2A 4NUCA 5EWHA 4N4FA 4QSPA 4NYWA 4AKNA 5EI4A 2DVSA 4YC9A 4A9FA 5DLZA 5HFQA 4DONA 5FFVA 3P1DA 5HRXA 3U5KA 5EK9A 5DYCA 5H1TA 4ZQLA 5FBXA 2H60A 5BT3A 4CLBA 3HMFA 4O75A 5CUDA 4QYLA 4Z6IA 2KTBB 4MEOA 1X0JA 3TLPA 5DBMA 4AKHA 3VKHA 5HFRA 1N72A 5E3GA 1WUGA 3IU6A 5CU8A 5C8GA 3G0LA 4A9IA 4HXPA 5I40A 5D3JA 4UYHA 5ENFA 5TCMA 2E3KA 4CFKA 2RFJA 5IGNA 5E9LA 3P5OA 4OUFA 5DFDA 4J3IA 5CRMA 5DYAA 5I89A 3AQAA 4CUPA 2OO1A 5CUBA 1WUMA 3D7CA 4TT4A 5L97A 4ALHA 4A9JA 4Z93A 2OSSA 5L8TA 2GRCA 4NRBA 4KV4A 4QY4A 2RNXA 5F60A 4YY6A 4QC1A 5D3SA 4ALGA 3VKGA 5HQ6A 3IU5A 4NQNA 4YK0A 5CQ3A 4HXSA 5JI8A 4O78A 4BW2A 2L85A 1ZKRA 5KU3A 4XY9A 5A5OA 5FE9A 5F3AA 2OUOA 4AKIA 4NR4A 4WIVA 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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