2L85A

Solution nmr structures of cbp bromodomain with small molecule of hbs
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSHMRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords CREB-binding protein
publication title A Small Molecule Binding to the Coactivator CREB-Binding Protein Blocks Apoptosis in Cardiomyocytes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 33
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2011-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2l85A00
5CQAA 2G4AA 5DX4A 5KU3A 5EK9A 2RNXA 4MR5A 5FE6A 4CFKA 3HMEA 5A5QA 4YYMA 2LSPB 5DKDA 5KTXA 4HXNA 3QZTA 5F3AA 5FH8A 3ONIA 4O72A 3U5OA 5FE7A 5LJ2A 5C4QA 5D26A 3S91A 4TZ2A 4YYDA 3LQIA 4QSUA 4J1PA 4O7EA 4LR6A 5LKZA 2R0VA 1F68A 4NR4A 4PKLA 4HXSA 5HRWA 3Q2EA 4O75A 2YYNA 4UYHA 2R0SA 5E9IA 4WIVA 4A9JA 1E6IA 2R10A 4NUEA 4XY8A 5DYAA 4O76A 4PS5A 4CUTA 2RO1A 5HRXA 5ACYA 4MR6A 2YEMA 4HXMA 2DVQA 1ZS5A 4UIYA 5ENIA 4NYVA 5HENA 4C66A 3U5MA 5BT3A 5I88A 4NR7A 4MEQA 5CQTA 5CQ3A 4NUCA 2MJVB 5E9VA 5IGMA 5L8TA 5CP5A 4TT6A 5H1VA 5HRVA 4HXRA 5ENGA 4QR4A 5AMFA 3JVMA 4BW3A 4LDFA 3JVLA 4YC9A 4IR5A 3O37A 5FH7A 4CUUA 4HBXA 4LYIA 5EQ1A 2YQDA 5CGPA 4QSRA 5CQ4A 4LYWA 5I1QA 4ZW1A 4Y03A 5AMEA 3TLPA 3GG3A 4Q0NA 5D24A 5I40A 2KTBB 5EVAA 3U5LA 5IBNA 4QSPA 4UIZA 2N9GA 5D3NA 4KCXA 5A7CA 5IG6A 2DKWA 4A9MA 5A82A 4LZSA 5A83A 3LXJA 5EP7A 5K29A 5A81A 4Z6HA 5EPRA 4Z6IA 3JVKA 3MXFA 5EI4A 4QNSA 3G0JA 4NR5A 4YBSA 4QSTA 5KTUA 2GRCA 5HEMA 5ENJA 4O7CA 5LJ0A 4DONA 5DY7A 4NR6A 4YYJA 4CL9A 5F1HA 5E73A 4ALGA 2R0YA 5DFCA 5FG6A 4F3IA 2YEKA 4BW2A 4HBVA 4YH3A 2YELA 4BHWA 5FH6A 5CFWA 5IGKA 3RCWA 4HXPA 4Z1QA 2I7KA 4NUDA 4XUAA 3HMHA 4QC1A 4MEPA 5FB1A 4C67A 4A9FA 5D3JA 4PCEA 4IR3A 5KO4A 4BW4A 5ETDA 4UYFA 2DVSA 5FE3A 5KTWA 5ENEA 4PY6A 5G4SA 5EWWA 5HM0A 3LJWA 4LC2A 4NS5A 4O70A 5A5PA 4NQMA 2NXBA 5D25A 5DW1A 4PCIA 5HLSA 5LKUA 4OGIA 4QR5A 4YAXA 4QEUA 5E9KA 1JSPB 5KHMA 4YK0A 4QUTA 4QEVA 5E9LA 5L96A 5IGNA 5A5RA 5D3SA 3HMFA 5FG4A 5L98A 4OGJA 5I80A 3MQMA 3P1EA 3DWYA 5L99A 2DVRA 4TU6A 5ENHA 4E96A 5CQ6A 4QEWA 2E7NA 5EWCA 2YDWA 5CU8A 5TCMA 4QYDA 3U5KA 5JI8A 2L5EA 2L84A 3UV5A 5BT4A 3U5JA 5E0RA 3G0LA 4MENA 4O7BA 3IU5A 5I86A 5COIA 4ZC9A 2WP1A 5DW2A 5FE8A 5FE2A 4TZ8A 4WHWA 4UYFB 4BJXA 5CTLA 5E74A 3I3JA 4N4HA 5CUEA 5HJCA 4J0RA 4CURA 5CZGA 4QSWA 1N72A 2D82A 4NYXA 4YYKA 3UVWA 5E7DA 2F6JA 4O77A 2RS9B 5FDZA 3S92A 4UYDA 4TTEA 5FE0A 5DFDA 5G4RA 3AADA 5D0CA 3UV4A 2FSAA 5F60A 5ENBA 5BT5A 4QYLA 3SVHA 4O7FA 5D7XA 3P1FA 4TU4A 3UVXA 4TQNA 5D3TA 4GPJA 5F63A 5H1TA 4NXJA 5C7NA 3AQAA 4Q0OA 4CUPA 5DYXA 1X0JA 3P5OA 4HXLA 4YH4A 4QB3A 5ETBA 5A85A 2WP2A 2OUOA 5FFYA 4TT4A 4QY4A 5A5NA 5DLZA 4IR6A 1EQFA 5C8GA 4QZSA 4YYNA 3UW9A 5EPBA 4OUFA 2RFJA 3O33A 5A5OA 4Z93A 4YYGA 3UVDA 4HXOA 1JM4B 5LJ1A 5C85A 5EWVA 5II1A 5IGLA 4CUQA 2D9EA 5CUCA 2RNYA 2H60A 2F6NA 5EU1A 4PTBA 5F62A 5DFBA 5LUUA 4J3IA 5CUAA 4LRGA 3O36A 4YYIA 3P1CA 4NR9A 5A5SA 1WUMA 5E9MA 4A9LA 4IOOA 5D3HA 3MUKA 5I29A 5DYCA 5HFQA 5C89A 4LZ2A 4NRAA 3LQHA 5FB0A 5CUBA 5LKXA 3LQJA 1WUGA 4MR3A 4A9EA 5FE5A 5DYUA 5J0DA 3QZVA 5I7XA 5HFRA 5I89A 3FKMX 4LYSA 3NXBA 4YADA 4UITA 4HBYA 4UYEA 5EM3A 2RI7A 4UIWA 4FLPA 5L8UA 4UIXA 5CPEA 2OSSA 3MB4A 4HXKA 3ZYUA 4NQNA 4QSXA 5HQ7A 3Q2FA 4IOQA 4IR4A 4YBTA 4QBMA 5DBMA 4Z1SA 4N3WA 5H1UA 3P1DA 4N4FA 4UIUA 3D7CA 5EISA 3SVFA 4O71A 5DLXA 4UYGA 5E9YA 5LVQA 4QSSA 5FFVA 5D3RA 5H85A 4YY4A 4NR8A 4CFLA 4QSVA 5EPSA 2E7OA 3U5NA 4CLBA 2YW5A 5LKTA 4ALHA 5JWMA 2RNWA 5D3PA 5F25A 5CRZA 5ENFA 4A9IA 4A9KA 5ENCA 4WHUA 5CUDA 4NRCA 5FE4A 4CUSA 4O7AA 5EWHA 4A9NA 5F5ZA 4UIVA 4YYHA 5I7YA 4N4IA 4AKNA 3MULA 4QC3A 5E3GA 5AD3A 4QSQA 4BW1A 2E3KA 5D3LA 5CS8A 2DATA 4YATA 5AD2A 5HCLA 4O74A 4A9HA 5E3DA 5F2PA 4LZRA 5EV9A 5CQ5A 4YY6A 5EGUA 5TB6A 3SVGA 5I83A 2DWWA 4KV4A 2OO1A 5FE9A 3QZSA 4RVRA 4NRBA 4X2IA 5CY9A 4O78A 5DKCA 5F1LA 5FBXA 3K2JA 4MR4A 5EICA 4ZQLA 5HELA 2L85A 5F36A 5EA1A 5II2A 5L97A 4XY9A 5HQ5A 4XYAA 3IU6A 3DAIA 3O34A 4IORA 4XUBA 5FFWA 4TS8A 4YBMA 2I8NA 4YABA 4QR3A 3O35A 3UVYA 4QUUA 4KV1A 3JVJA 5C87A 5CUGA 4A9OA 4N4GA 4HBWA 5CQ7A 5LVRA 4TT2A 5IIDA 3U5PA 4MEOA 5DKHA 2DVVA 5F61A 5CRMA 5FE1A 5HQ6A 4NYWA 4J0SA 4TYLA 5CQ8A 5EWDA 5FG5A 3UV2A 3MB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CQAA 2G4AA 5DX4A 5KU3A 5EK9A 2RNXA 3VKHA 4MR5A 5FE6A 4CFKA 3HMEA 5A5QA 4YYMA 2LSPB 5DKDA 5KTXA 4HXNA 3QZTA 5F3AA 5FH8A 3ONIA 4O72A 3U5OA 5FE7A 5LJ2A 5C4QA 5D26A 3S91A 4TZ2A 4YYDA 3LQIA 4QSUA 4J1PA 4O7EA 4LR6A 5LKZA 2R0VA 1F68A 4NR4A 4PKLA 4HXSA 5HRWA 3Q2EA 4O75A 2YYNA 4UYHA 2R0SA 3ERRA 5E9IA 4WIVA 4A9JA 1E6IA 2R10A 4NUEA 4XY8A 5DYAA 4O76A 4PS5A 4CUTA 2RO1A 5HRXA 5ACYA 4MR6A 2YEMA 3D1BA 4HXMA 2DVQA 1ZS5A 4UIYA 5ENIA 4NYVA 1PUOA 5HENA 4C66A 3U5MA 5BT3A 5I88A 4NR7A 4MEQA 5CQTA 5CQ3A 4NUCA 2MJVB 5E9VA 5IGMA 5L8TA 5CP5A 4TT6A 5H1VA 5HRVA 4HXRA 5ENGA 4QR4A 5AMFA 3JVMA 4BW3A 4LDFA 3JVLA 4YC9A 4IR5A 3O37A 5FH7A 4CUUA 4HBXA 4LYIA 5EQ1A 2YQDA 5CGPA 4QSRA 5CQ4A 4LYWA 5I1QA 4ZW1A 4Y03A 5AMEA 3TLPA 3GG3A 4Q0NA 5D24A 5I40A 2KTBB 5EVAA 3U5LA 5IBNA 4QSPA 4UIZA 2N9GA 5D3NA 4KCXA 5A7CA 5IG6A 2DKWA 4A9MA 5A82A 4LZSA 5A83A 3LXJA 5EP7A 5K29A 5A81A 4Z6HA 5EPRA 4Z6IA 3JVKA 3MXFA 5EI4A 4QNSA 3G0JA 4NR5A 4YBSA 4QSTA 5KTUA 2GRCA 5HEMA 5ENJA 4O7CA 5LJ0A 4DONA 5DY7A 4NR6A 4YYJA 4CL9A 5F1HA 5E73A 4ALGA 2R0YA 5DFCA 5FG6A 4F3IA 2YEKA 4BW2A 4HBVA 4YH3A 2YELA 4BHWA 5FH6A 5CFWA 5IGKA 3RCWA 4HXPA 4Z1QA 2I7KA 4NUDA 4XUAA 3HMHA 4QC1A 4MEPA 5FB1A 4C67A 4A9FA 5D3JA 4PCEA 4IR3A 5KO4A 4BW4A 5ETDA 4UYFA 2DVSA 5FE3A 5KTWA 5ENEA 4PY6A 5G4SA 5EWWA 5HM0A 3LJWA 4LC2A 4NS5A 4O70A 5A5PA 4NQMA 2NXBA 5D25A 5DW1A 4PCIA 5HLSA 5LKUA 4OGIA 4QR5A 4YAXA 4QEUA 5E9KA 1JSPB 5KHMA 4YK0A 4QUTA 4QEVA 5E9LA 5L96A 5IGNA 5A5RA 5D3SA 3HMFA 5FG4A 5L98A 4OGJA 5I80A 3MQMA 3P1EA 3DWYA 5L99A 2DVRA 4TU6A 5ENHA 4E96A 5CQ6A 4QEWA 2E7NA 5EWCA 2YDWA 5CU8A 5TCMA 4QYDA 3U5KA 5JI8A 4AI6A 2L5EA 2L84A 3UV5A 5BT4A 3U5JA 5E0RA 3G0LA 4MENA 4O7BA 3IU5A 5I86A 5COIA 4ZC9A 2WP1A 5DW2A 5FE8A 5FE2A 4TZ8A 4WHWA 4UYFB 4BJXA 5CTLA 5E74A 3I3JA 4N4HA 5CUEA 5HJCA 4J0RA 4CURA 5CZGA 4QSWA 1N72A 2D82A 4NYXA 4YYKA 3UVWA 5E7DA 2F6JA 4O77A 2RS9B 5FDZA 3D1DA 4UYDA 3S92A 4TTEA 5FE0A 5DFDA 5G4RA 3AADA 5D0CA 3UV4A 2FSAA 5F60A 5ENBA 5BT5A 4QYLA 3SVHA 4O7FA 5D7XA 3P1FA 4TU4A 3UVXA 4TQNA 5D3TA 4GPJA 5F63A 5H1TA 4NXJA 5C7NA 3AQAA 4Q0OA 4CUPA 5DYXA 1X0JA 3P5OA 4HXLA 4AKHA 4YH4A 4QB3A 5ETBA 5A85A 2WP2A 2OUOA 5FFYA 4TT4A 4QY4A 5A5NA 5DLZA 4IR6A 1EQFA 5C8GA 4QZSA 4YYNA 3UW9A 5EPBA 4OUFA 2RFJA 3O33A 5A5OA 4Z93A 4YYGA 3UVDA 4HXOA 1JM4B 5LJ1A 5C85A 5EWVA 5II1A 5IGLA 4CUQA 2D9EA 5CUCA 2RNYA 2H60A 2F6NA 5EU1A 4PTBA 5F62A 2EJNA 5DFBA 5LUUA 4J3IA 5CUAA 4LRGA 3O36A 4YYIA 3P1CA 4NR9A 5A5SA 1WUMA 5E9MA 4A9LA 4IOOA 5D3HA 3MUKA 5I29A 5DYCA 5HFQA 5C89A 4LZ2A 4NRAA 3LQHA 5FB0A 5CUBA 5LKXA 1ZKRA 3LQJA 1WUGA 4MR3A 4A9EA 5FE5A 5DYUA 5J0DA 3QZVA 5I7XA 5HFRA 5I89A 3FKMX 4LYSA 3NXBA 4YADA 4UITA 4HBYA 4UYEA 5EM3A 2RI7A 4UIWA 4FLPA 5L8UA 4UIXA 5CPEA 2OSSA 3MB4A 4HXKA 3ZYUA 4NQNA 4QSXA 5HQ7A 3Q2FA 4IOQA 4IR4A 4YBTA 4QBMA 5DBMA 4Z1SA 4N3WA 4AKIA 5H1UA 3P1DA 4N4FA 4UIUA 3D7CA 5EISA 3SVFA 4O71A 5DLXA 4UYGA 5E9YA 5LVQA 4QSSA 5FFVA 5D3RA 5H85A 4YY4A 4NR8A 4CFLA 4QSVA 5EPSA 2E7OA 3U5NA 4CLBA 2YW5A 5LKTA 4ALHA 5JWMA 2RNWA 5D3PA 5F25A 5CRZA 5ENFA 4A9IA 4A9KA 5ENCA 4WHUA 5CUDA 4NRCA 5FE4A 4CUSA 4O7AA 5EWHA 4A9NA 5F5ZA 4UIVA 4YYHA 5I7YA 4N4IA 4AKNA 3MULA 4QC3A 5E3GA 5AD3A 4QSQA 4BW1A 2E3KA 5D3LA 5CS8A 2DATA 4YATA 5AD2A 5HCLA 3VKGA 4O74A 4A9HA 5E3DA 5F2PA 4LZRA 5EV9A 5CQ5A 4YY6A 5EGUA 5TB6A 3SVGA 4AKGA 5I83A 2DWWA 4KV4A 2OO1A 5FE9A 3QZSA 4RVRA 4NRBA 4X2IA 5CY9A 4O78A 5DKCA 5F1LA 5FBXA 3K2JA 4MR4A 5EICA 4ZQLA 5HELA 2L85A 5F36A 5EA1A 5II2A 5L97A 4XY9A 5HQ5A 4XYAA 3IU6A 3DAIA 3O34A 4IORA 4XUBA 5FFWA 4TS8A 4YBMA 2I8NA 4YABA 4QR3A 3O35A 3UVYA 4QUUA 4KV1A 3JVJA 5C87A 5CUGA 4A9OA 4N4GA 4HBWA 5CQ7A 5LVRA 4TT2A 5IIDA 3U5PA 4MEOA 5DKHA 2DVVA 5F61A 5CRMA 5FE1A 5HQ6A 4NYWA 4J0SA 4TYLA 5CQ8A 5EWDA 5FG5A 3UV2A 3MB3A
chains in the Genus database with same CATH topology
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