5EICA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with ayc
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
b'IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding Motifs in the CBP Bromodomain: An Analysis of 20 Crystal Structures of Complexes with Small Molecules.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 37
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eicA00
4YY4A 1F68A 5FE1A 3MXFA 2D9EA 4LDFA 4O77A 5L96A 4O7FA 4QR3A 5A81A 1WUMA 5DKCA 5CQ8A 1WUGA 4MR3A 2F6NA 4O76A 4X2IA 5C85A 4TU6A 3ZYUA 4QSXA 5E73A 2G4AA 5D3SA 4A9JA 3O34A 4A9KA 4NR7A 4BW3A 4MENA 3JVMA 5EK9A 4A9HA 4LC2A 5EWWA 1N72A 5EPBA 4UYDA 5DLZA 5ETBA 4CFKA 5I80A 4KCXA 5DFCA 4QUTA 4MR6A 4UYEA 5CUCA 5A85A 5LKZA 2YEKA 5FDZA 4Z1QA 3Q2EA 5ENFA 3SVGA 3LXJA 5CQ7A 5CUGA 3MUKA 4QBMA 5DKHA 4QY4A 5FE7A 4IOOA 3HMEA 4UYFB 4WHUA 5IGLA 4MR4A 4NRBA 5LKXA 5CU8A 3S92A 2D82A 3Q2FA 5G4RA 4QSWA 5IBNA 5L8UA 5FH8A 2R10A 4PS5A 4IORA 2LSPB 3P1CA 5DYXA 5H1VA 3SVHA 4NR9A 4WHWA 4C66A 5KTXA 2DATA 4YYIA 5IIDA 4YYNA 5LKTA 3MB4A 5E9VA 5EWDA 3FKMX 1X0JA 4UYHA 4A9OA 4LYIA 4YBTA 3P1DA 5CQ4A 4LZRA 4A9EA 3U5OA 5FBXA 3O37A 3U5JA 5D3LA 4QYDA 5L99A 4A9IA 3AADA 4MEQA 5EPRA 4YK0A 5CQAA 5G4SA 4N4IA 5D3PA 4IR3A 5A5NA 3UVWA 2YW5A 4PTBA 4LRGA 4TZ2A 4TT2A 4UITA 5EPSA 4TZ8A 4YYHA 2OUOA 5F3AA 4NQMA 3LQJA 2L84A 2E7NA 4TYLA 5A5QA 4UIWA 2R0YA 3P5OA 3UVDA 5F25A 4QR4A 4O7BA 4TT4A 5FB1A 4YYMA 4HBYA 4LZ2A 5KHMA 4PCEA 4QEVA 4YYJA 4NYXA 4HXRA 4YYGA 4XYAA 4TTEA 5CFWA 4QSTA 4QSSA 5BT4A 4QSPA 5CQ5A 5FE4A 5KTWA 4NYWA 5HRVA 5J0DA 4UIUA 4NR5A 4J1PA 5I89A 4TQNA 2YQDA 5ENJA 5FG5A 4O70A 3IU5A 5E3GA 4YADA 2DVRA 4HBVA 5JWMA 5DYCA 5FH7A 4DONA 2YEMA 1E6IA 5LJ2A 5A5RA 5I40A 5KO4A 5EU1A 4BHWA 3U5KA 5E9IA 5FG6A 3RCWA 5II1A 4Z1SA 4OUFA 4A9LA 5IG6A 4QNSA 4OGJA 5E9MA 4QEUA 4CFLA 2DVVA 5I29A 4YBMA 5ENEA 2GRCA 2DWWA 4Z6IA 4NRCA 4LYSA 4ZC9A 4YH4A 5HQ5A 5I83A 3GG3A 4TS8A 4UIZA 4HXMA 5E7DA 4QSVA 3P1FA 5TB6A 5COIA 4UYFA 5E9YA 3G0JA 4NR6A 4ALHA 2RFJA 3I3JA 5D3JA 3D7CA 5ENBA 3LQHA 1EQFA 4NXJA 4QSUA 4QC3A 5E0RA 4UIVA 4ZQLA 5F1LA 2RS9B 4NR4A 4TT6A 4PKLA 3HMFA 2DVSA 5FE2A 4NQNA 5LJ1A 2WP2A 2YYNA 5HM0A 5TCMA 5BT5A 4YH3A 2MJVB 4HXLA 5D26A 5ENCA 4J0SA 5D3HA 3UV5A 5JI8A 5FE6A 5DBMA 4F3IA 3HMHA 3K2JA 2FSAA 5C7NA 2R0VA 5HENA 2N9GA 5DFBA 5EWHA 5II2A 3U5PA 5L97A 5C87A 5F61A 3AQAA 5CS8A 4CUTA 4Z93A 4Z6HA 4BW4A 4YY6A 4LR6A 5E9KA 4XUAA 4MEOA 4O7EA 2E3KA 5EVAA 5CRMA 4A9FA 4IR6A 5EM3A 5KU3A 4TU4A 5DW2A 5A7CA 4YYDA 3JVJA 5EISA 1JSPB 5A82A 4CUPA 5FE5A 4FLPA 4MEPA 5ENIA 5AMFA 5LKUA 5HQ6A 4J3IA 4RVRA 4Q0NA 2YELA 5EV9A 4N4GA 5D0CA 4QR5A 5EI4A 4O74A 5CQ3A 3U5NA 5FE3A 5LVRA 5CY9A 4YATA 2OO1A 4CUQA 4CURA 5HQ7A 3UW9A 3QZSA 3QZTA 4N4FA 5D3RA 5DY7A 4IR5A 5C8GA 3UV2A 2RNYA 5CUDA 4YABA 5I86A 5CTLA 5A5PA 4HXKA 5A5SA 4A9NA 4Q0OA 5E3DA 4HXNA 5DKDA 3G0LA 5F62A 4QZSA 3O36A 5HFQA 2I8NA 5HRWA 2NXBA 4HXSA 3MULA 4BW2A 5BT3A 5I88A 5F36A 4QEWA 4LYWA 5C89A 3U5MA 4NUEA 5HCLA 4BW1A 3ONIA 4N4HA 5CUAA 5ETDA 5FE9A 4OGIA 5EQ1A 5KTUA 4NRAA 4KV1A 4ZW1A 5D7XA 2RNWA 5ACYA 2KTBB 3LJWA 4UIXA 4QB3A 4HXOA 2F6JA 3MQMA 2YDWA 4QYLA 3NXBA 5IGMA 2RI7A 3P1EA 4CUSA 3SVFA 2DVQA 1ZS5A 5L8TA 4YAXA 3TLPA 4CLBA 5D3TA 4O7CA 5HRXA 2H60A 5CP5A 5F1HA 4NUCA 4XY9A 5A5OA 5FG4A 2RNXA 3O33A 4NYVA 3LQIA 5ENHA 2RO1A 4HBXA 4IOQA 3QZVA 5H1TA 2DKWA 4O78A 5DYAA 2OSSA 5H85A 3MB3A 4XUBA 5DW1A 4HBWA 5HFRA 5HJCA 5DLXA 4IR4A 4C67A 5LVQA 5L98A 5I7XA 4A9MA 5FE0A 4MR5A 4CUUA 4N3WA 5D24A 5EGUA 5CUEA 5LUUA 3DWYA 5CPEA 5FFWA 5HEMA 5CZGA 5I1QA 2E7OA 4J0RA 5DYUA 5EWCA 5IGKA 3UV4A 2WP1A 5K29A 4NUDA 1JM4B 5FB0A 4UIYA 5EA1A 4UYGA 4YC9A 5CQ6A 5F63A 5DFDA 4PY6A 5DX4A 4YBSA 4CL9A 2I7KA 2L85A 3IU6A 4O75A 4YYKA 5F2PA 2R0SA 5FE8A 5ENGA 5D3NA 5CGPA 4KV4A 2L5EA 4QSQA 5HELA 5A83A 5EP7A 5AD3A 5EICA 5FH6A 3S91A 4O72A 4ALGA 3UVYA 5CRZA 5IGNA 4E96A 4AKNA 3JVKA 4NR8A 5E9LA 3JVLA 4WIVA 4QUUA 4Y03A 5E74A 4BJXA 5H1UA 5C4QA 5AMEA 4O7AA 5AD2A 4NS5A 4QC1A 3O35A 5EWVA 4O71A 5LJ0A 4LZSA 4PCIA 5FFVA 5I7YA 5D25A 4XY8A 3UVXA 4GPJA 5CQTA 5HLSA 3U5LA 4QSRA 5CUBA 5F60A 4HXPA 3DAIA 5FFYA 5F5ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YY4A 1F68A 5FE1A 3MXFA 2D9EA 4LDFA 4O77A 5L96A 4O7FA 4QR3A 5A81A 1WUMA 5DKCA 5CQ8A 1WUGA 4MR3A 2F6NA 4O76A 4X2IA 5C85A 4TU6A 3ZYUA 4QSXA 5E73A 2G4AA 5D3SA 4A9JA 3O34A 4A9KA 4NR7A 4BW3A 4MENA 3JVMA 5EK9A 4A9HA 4LC2A 5EWWA 1N72A 5EPBA 4UYDA 5DLZA 5ETBA 4CFKA 5I80A 4KCXA 5DFCA 4QUTA 4MR6A 4UYEA 5CUCA 5A85A 5LKZA 2YEKA 5FDZA 4Z1QA 3Q2EA 5ENFA 3SVGA 3LXJA 5CQ7A 5CUGA 3MUKA 4QBMA 5DKHA 4QY4A 5FE7A 4IOOA 3HMEA 4UYFB 4WHUA 5IGLA 4MR4A 4NRBA 5LKXA 5CU8A 3S92A 2D82A 3Q2FA 5G4RA 4QSWA 5IBNA 5L8UA 5FH8A 2R10A 4PS5A 4IORA 2LSPB 3P1CA 5DYXA 5H1VA 3SVHA 4NR9A 4WHWA 4C66A 5KTXA 2DATA 3ERRA 4YYIA 5IIDA 4YYNA 5LKTA 3MB4A 5E9VA 5EWDA 3FKMX 1X0JA 4UYHA 4A9OA 4LYIA 4YBTA 3P1DA 5CQ4A 4LZRA 4A9EA 3U5OA 5FBXA 3O37A 3U5JA 5D3LA 4QYDA 5L99A 4A9IA 3AADA 4MEQA 5EPRA 4YK0A 5CQAA 5G4SA 4N4IA 5D3PA 4IR3A 5A5NA 3UVWA 2YW5A 4PTBA 4LRGA 4TZ2A 4TT2A 4UITA 5EPSA 4TZ8A 4YYHA 2OUOA 5F3AA 4NQMA 3LQJA 4AI6A 2L84A 2E7NA 4TYLA 5A5QA 4AKIA 4UIWA 2R0YA 3P5OA 3UVDA 5F25A 4QR4A 4O7BA 4TT4A 5FB1A 4YYMA 4HBYA 4LZ2A 5KHMA 4PCEA 4QEVA 4YYJA 4NYXA 4HXRA 2EJNA 4YYGA 4XYAA 4TTEA 5CFWA 4QSTA 4QSSA 1ZKRA 5BT4A 4QSPA 5CQ5A 5FE4A 5KTWA 4NYWA 5HRVA 5J0DA 4UIUA 4NR5A 4J1PA 5I89A 4TQNA 2YQDA 5ENJA 5FG5A 4O70A 3IU5A 5E3GA 4YADA 2DVRA 4HBVA 5JWMA 5DYCA 5FH7A 4DONA 2YEMA 1E6IA 5LJ2A 5A5RA 5I40A 5KO4A 5EU1A 4BHWA 3U5KA 5E9IA 5FG6A 3RCWA 5II1A 4Z1SA 4OUFA 4A9LA 5IG6A 4QNSA 4OGJA 5E9MA 4QEUA 4CFLA 2DVVA 5I29A 4YBMA 5ENEA 2GRCA 2DWWA 4Z6IA 4NRCA 4LYSA 4ZC9A 4YH4A 5HQ5A 5I83A 3GG3A 4TS8A 4UIZA 4HXMA 5E7DA 4QSVA 3P1FA 5TB6A 5COIA 4UYFA 5E9YA 3G0JA 4NR6A 4ALHA 2RFJA 3I3JA 5D3JA 3D7CA 5ENBA 3LQHA 1EQFA 4NXJA 4QSUA 4QC3A 5E0RA 4UIVA 4ZQLA 5F1LA 2RS9B 4NR4A 4TT6A 4PKLA 3HMFA 2DVSA 5FE2A 4NQNA 5LJ1A 2WP2A 2YYNA 5HM0A 5TCMA 5BT5A 4YH3A 2MJVB 4HXLA 5D26A 5ENCA 4J0SA 5D3HA 3UV5A 5JI8A 5FE6A 4AKGA 5DBMA 4F3IA 3HMHA 3K2JA 2FSAA 5C7NA 2R0VA 5HENA 2N9GA 5DFBA 5EWHA 5II2A 3U5PA 5L97A 3VKHA 5C87A 5F61A 3AQAA 5CS8A 4CUTA 4Z93A 4Z6HA 4BW4A 4YY6A 4LR6A 5E9KA 4XUAA 4MEOA 4O7EA 2E3KA 5EVAA 5CRMA 4A9FA 4IR6A 5EM3A 5KU3A 3D1DA 4TU4A 5DW2A 5A7CA 4YYDA 3JVJA 5EISA 1JSPB 5A82A 4CUPA 5FE5A 4FLPA 4MEPA 5ENIA 5AMFA 5LKUA 5HQ6A 4J3IA 4RVRA 4Q0NA 2YELA 5EV9A 4N4GA 5D0CA 4QR5A 5EI4A 4O74A 5CQ3A 3U5NA 5FE3A 5LVRA 5CY9A 4YATA 2OO1A 4CUQA 4CURA 5HQ7A 3UW9A 3QZSA 3QZTA 4N4FA 5D3RA 5DY7A 4IR5A 5C8GA 3UV2A 2RNYA 5CUDA 4YABA 5I86A 5CTLA 5A5PA 4HXKA 5A5SA 4A9NA 4Q0OA 5E3DA 4HXNA 5DKDA 3G0LA 5F62A 4QZSA 3O36A 5HFQA 2I8NA 5HRWA 2NXBA 4HXSA 3MULA 4BW2A 5BT3A 5I88A 5F36A 4QEWA 4LYWA 5C89A 3U5MA 4NUEA 5HCLA 4BW1A 3ONIA 4N4HA 5CUAA 5ETDA 5FE9A 4OGIA 5EQ1A 5KTUA 4NRAA 4KV1A 4ZW1A 5D7XA 2RNWA 5ACYA 2KTBB 3LJWA 4UIXA 4QB3A 4HXOA 2F6JA 3MQMA 2YDWA 4QYLA 1PUOA 3NXBA 5IGMA 2RI7A 3VKGA 3P1EA 4CUSA 3SVFA 2DVQA 1ZS5A 5L8TA 4YAXA 3TLPA 4CLBA 5D3TA 4O7CA 5HRXA 2H60A 5CP5A 5F1HA 4NUCA 4XY9A 5A5OA 5FG4A 2RNXA 3O33A 4NYVA 3LQIA 5ENHA 2RO1A 4HBXA 4IOQA 3QZVA 5H1TA 2DKWA 4O78A 5DYAA 2OSSA 5H85A 3MB3A 4XUBA 5DW1A 4HBWA 5HFRA 5HJCA 5DLXA 4IR4A 4C67A 5LVQA 5L98A 5I7XA 4A9MA 5FE0A 4MR5A 4CUUA 4N3WA 5D24A 5EGUA 5CUEA 5LUUA 3DWYA 5CPEA 5FFWA 5HEMA 5CZGA 5I1QA 2E7OA 4J0RA 5DYUA 5EWCA 5IGKA 3UV4A 2WP1A 5K29A 4NUDA 1JM4B 5FB0A 4UIYA 5EA1A 4UYGA 4YC9A 5CQ6A 5F63A 5DFDA 4PY6A 5DX4A 4YBSA 4CL9A 2I7KA 2L85A 3IU6A 4O75A 4YYKA 5F2PA 2R0SA 5FE8A 5ENGA 5D3NA 5CGPA 4KV4A 2L5EA 4QSQA 5HELA 5A83A 5EP7A 5AD3A 5EICA 5FH6A 3S91A 4O72A 4ALGA 3UVYA 5CRZA 5IGNA 4E96A 4AKNA 3JVKA 4NR8A 5E9LA 3JVLA 4WIVA 4QUUA 4Y03A 5E74A 4BJXA 5H1UA 5C4QA 5AMEA 4O7AA 5AD2A 4NS5A 3D1BA 3O35A 4QC1A 5EWVA 4O71A 5LJ0A 4LZSA 4PCIA 5FFVA 5I7YA 5D25A 4XY8A 3UVXA 4GPJA 5CQTA 4AKHA 5HLSA 3U5LA 4QSRA 5CUBA 5F60A 4HXPA 3DAIA 5FFYA 5F5ZA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4YY4 A;  1F68 A;  5FE1 A;  3MXF A;  2D9E A;  4LDF A;  4O77 A;  5L96 A;  4O7F A;  4QR3 A;  5A81 A;  1WUM A;  5DKC A;  5CQ8 A;  1WUG A;  4MR3 A;  2F6N A;  4O76 A;  4X2I A;  5C85 A;  4TU6 A;  3ZYU A;  4QSX A;  5E73 A;  2G4A A;  5D3S A;  4A9J A;  3O34 A;  4A9K A;  4NR7 A;  4BW3 A;  4MEN A;  3JVM A;  5EK9 A;  4A9H A;  4LC2 A;  5EWW A;  1N72 A;  5EPB A;  4UYD A;  5DLZ A;  5ETB A;  4CFK A;  5I80 A;  4KCX A;  5DFC A;  4QUT A;  4MR6 A;  4UYE A;  5CUC A;  5A85 A;  5LKZ A;  2YEK A;  5FDZ A;  4Z1Q A;  3Q2E A;  5ENF A;  3SVG A;  3LXJ A;  5CQ7 A;  5CUG A;  3MUK A;  4QBM A;  5DKH A;  4QY4 A;  5FE7 A;  4IOO A;  3HME A;  4UYF B;  4WHU A;  5IGL A;  4MR4 A;  4NRB A;  5LKX A;  5CU8 A;  3S92 A;  2D82 A;  3Q2F A;  5G4R A;  4QSW A;  5IBN A;  5L8U A;  5FH8 A;  2R10 A;  4PS5 A;  4IOR A;  2LSP B;  3P1C A;  5DYX A;  5H1V A;  3SVH A;  4NR9 A;  4WHW A;  4C66 A;  5KTX A;  2DAT A;  4YYI A;  5IID A;  4YYN A;  5LKT A;  3MB4 A;  5E9V A;  5EWD A;  3FKM X;  1X0J A;  4UYH A;  4A9O A;  4LYI A;  4YBT A;  3P1D A;  5CQ4 A;  4LZR A; 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