4Z1SA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 with benzotriazolo-diazepine scaffold
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
GSTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Discovery of Benzotriazolo[4,3-d][1,4]diazepines as Orally Active Inhibitors of BET Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4z1sA01
3G0JA 2OUOA 5ENGA 5E3DA 2R0VA 5EWCA 3MB4A 4UIVA 5BT3A 5HQ7A 5A85A 3MB3A 5II1A 5LKTA 5LUUA 2R0YA 5FB0A 5EICA 5C8GA 4TT6A 5G4RA 5K29A 4CUPA 5F61A 1WUMA 5FE6A 5EVAA 3DWYA 4O76A 3UW9A 4UIWA 1E6IA 4YC9A 4YYDA 2F6JA 5FE1A 2LSPB 4XYAA 5CQTA 5I86A 5HFQA 4J3IA 4A9LA 5FG4A 4LZRA 3JVMA 5F25A 5ETDA 4O7EA 3U5KA 2RI7A 4YAXA 4O71A 4TT2A 4YYNA 4PY6A 5ENIA 3O35A 5A81A 5KTWA 2RNYA 4NUDA 5BT5A 4QYDA 5I29A 2L84A 5A82A 5ACYA 3UVXA 5HENA 3ONIA 3ZYUA 3MULA 2DVQA 2WP1A 4QC1A 4QR5A 4NS5A 4O78A 4QC3A 4XUBA 5HQ5A 5C87A 4NUCA 5FB1A 5C89A 5FFWA 4QBMA 5KU3A 1EQFA 5FE0A 4CUTA 5AMFA 4C66A 3SVHA 4CUQA 3G0LA 5CQ3A 4HXMA 5EGUA 4A9JA 4HBYA 4YH4A 5COIA 2OSSA 3NXBA 5FE2A 3IU5A 4CL9A 5FDZA 5CUEA 5I89A 4HBVA 4YYHA 5DFCA 5EQ1A 5LJ2A 5IIDA 3K2JA 4QSQA 5E9MA 5EPSA 4CLBA 5ENCA 3U5OA 3O34A 5EA1A 4MEOA 5A7CA 4CFLA 4KV4A 2RNXA 4CURA 4UYFA 2I8NA 5FE8A 4OGJA 4N4HA 5I83A 2DATA 3Q2FA 2YQDA 3U5PA 5L98A 5LVQA 5HEMA 5DKDA 4J0SA 5D7XA 4PS5A 4YBMA 4MR5A 5LKZA 2MJVB 5JWMA 4HBXA 5D3SA 4ZQLA 5D3LA 5FBXA 5EWHA 5D3HA 5D24A 3LJWA 5F3AA 5DFBA 5FFYA 4O70A 3GG3A 5CUDA 4UIYA 3U5NA 5EPBA 2D82A 4TYLA 5EV9A 4TTEA 3O36A 4BW4A 4TU6A 3UV4A 5FE7A 4NR6A 5A5PA 5DBMA 5F1HA 4LDFA 3TLPA 4Z1SA 5LJ0A 4ALHA 4XY9A 5IGLA 4A9IA 2E3KA 5L99A 3AQAA 4NYXA 5LVRA 2DKWA 4A9OA 4QR3A 5CQ4A 4HBWA 5DW1A 4ZW1A 4O7FA 5DY7A 5CRMA 3UV5A 3SVFA 4YATA 4UYGA 5ENJA 4E96A 5DYUA 5IGNA 4QYLA 5E9LA 4UITA 4LRGA 4QEVA 4QUTA 3P1CA 4KCXA 5CQ7A 4QEWA 4PCEA 3LQHA 4Q0OA 3JVLA 5AD2A 2DVVA 3UVWA 3P5OA 3MUKA 5FFVA 5CTLA 5FG6A 5HRVA 5AMEA 5DFDA 4UIZA 5E73A 4BW1A 2RFJA 4UYEA 4C67A 2YELA 2L5EA 5FE3A 3LXJA 5F36A 4CFKA 5FE4A 3MQMA 4O77A 5L8TA 5LKUA 4BW3A 5EK9A 5EI4A 5L96A 4MEPA 4XY8A 4O74A 3HMHA 5D3PA 5CU8A 5LKXA 4HXLA 4NUEA 4QSRA 4X2IA 5D3RA 4OGIA 3UVDA 4NRBA 5CUAA 5CGPA 2N9GA 4YBSA 5ENEA 5II2A 3O33A 5A5OA 4YH3A 2R10A 3HMEA 5EPRA 4IORA 4PTBA 2DVRA 4HXRA 4UIXA 5H85A 4MEQA 4QSXA 4LZSA 5D26A 5A5SA 4TZ2A 5DYCA 4Z1QA 4LYIA 5C7NA 3HMFA 5HCLA 4NQNA 4QSTA 4RVRA 4TZ8A 3S91A 5CZGA 4QSUA 5FG5A 4HXKA 3Q2EA 5I40A 2OO1A 4N4FA 2DWWA 5I1QA 4IR5A 2I7KA 4UIUA 4YBTA 4NXJA 4YY6A 5F1LA 5CS8A 4N3WA 4IR4A 4NYVA 2FSAA 4J1PA 5A5RA 4NRAA 4A9NA 4YYJA 5FE9A 5FH8A 3QZVA 5H1VA 4F3IA 5D0CA 4TT4A 2RNWA 5ETBA 5A5QA 5ENBA 2F6NA 5CY9A 3UV2A 3U5JA 5E74A 4QY4A 4LZ2A 2YW5A 4NR8A 5CUGA 4MR6A 4TU4A 5TB6A 2KTBB 5CP5A 5EU1A 4LYWA 4AKNA 5DKHA 5D3NA 5E9IA 4A9MA 4Q0NA 2H60A 4Z6HA 5I7YA 4PCIA 4IR6A 4Z93A 5I88A 5I7XA 2R0SA 5F62A 3MXFA 5J0DA 4NRCA 3LQJA 4O7CA 4HXSA 5CUCA 2WP2A 4LR6A 2NXBA 5IGKA 5A83A 1WUGA 5HRXA 4LC2A 4UYDA 4WIVA 5JI8A 5EISA 5TCMA 4MR4A 5CQ5A 2DVSA 5AD3A 4WHWA 4GPJA 5C85A 4O7AA 4NR5A 4NQMA 2L85A 5EWVA 4DONA 4NYWA 4O75A 5IGMA 3I3JA 4A9HA 4YYKA 4BW2A 5CUBA 5EWDA 5H1TA 4IR3A 5EM3A 4QEUA 5FH6A 3O37A 5L8UA 5KO4A 5F63A 5KTXA 4TS8A 5E9VA 3JVKA 2E7NA 3P1DA 3UVYA 5DLZA 2RO1A 4QZSA 2GRCA 5HJCA 4HXPA 5E7DA 5F5ZA 3S92A 5HRWA 5LJ1A 4QSPA 4HXNA 3LQIA 5E9KA 3DAIA 2YDWA 4YABA 5HLSA 4J0RA 4N4GA 2D9EA 5CPEA 5D25A 4NR4A 5KHMA 5E9YA 1JM4B 5IG6A 4NR9A 4PKLA 5L97A 4FLPA 4QB3A 4QR4A 4CUUA 4QSWA 4TQNA 4HXOA 4ALGA 5HFRA 4A9KA 5EWWA 4CUSA 3D7CA 4YYIA 5DX4A 5I80A 3QZSA 3AADA 4UYHA 4Y03A 5CFWA 3U5LA 5F60A 4BJXA 5FH7A 5G4SA 5F2PA 4YY4A 5C4QA 5D3JA 4QSVA 3P1FA 4WHUA 3FKMX 4MR3A 1N72A 4KV1A 4O7BA 3RCWA 4YYMA 3IU6A 2G4AA 4OUFA 4XUAA 3U5MA 3P1EA 5BT4A 4UYFB 5ENFA 5DLXA 4A9EA 5CRZA 4YYGA 4N4IA 4Z6IA 2E7OA 5D3TA 4BHWA 5CQ8A 5H1UA 5EP7A 5CQAA 5A5NA 5DKCA 4ZC9A 4QUUA 4IOQA 5KTUA 5E3GA 4QNSA 4A9FA 5DYAA 1F68A 1JSPB 4IOOA 4O72A 4YADA 5DW2A 5HM0A 2YEMA 1X0JA 4NR7A 3JVJA 5DYXA 2RS9B 5ENHA 5IBNA 4LYSA 3SVGA 1ZS5A 4YK0A 5HELA 5FE5A 5HQ6A 5CQ6A 4MENA 5E0RA 4QSSA 2YYNA 2YEKA 3QZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G0JA 2OUOA 5ENGA 5E3DA 2R0VA 5EWCA 3MB4A 4UIVA 5BT3A 5HQ7A 5A85A 3MB3A 5II1A 5LKTA 5LUUA 2R0YA 5FB0A 5EICA 5C8GA 4TT6A 5G4RA 5K29A 4CUPA 5F61A 1WUMA 5FE6A 5EVAA 3DWYA 4O76A 3UW9A 4UIWA 1E6IA 4YC9A 4YYDA 1ZKRA 2F6JA 5FE1A 2LSPB 4XYAA 5CQTA 5I86A 5HFQA 4J3IA 4A9LA 5FG4A 4LZRA 3JVMA 5F25A 5ETDA 4O7EA 3U5KA 2RI7A 4YAXA 4O71A 4TT2A 4YYNA 4PY6A 5ENIA 3O35A 5A81A 5KTWA 3ERRA 2RNYA 4NUDA 5BT5A 4QYDA 5I29A 2L84A 5A82A 5ACYA 3UVXA 5HENA 3ONIA 3ZYUA 3MULA 2DVQA 2WP1A 4QC1A 4QR5A 4NS5A 4O78A 4QC3A 4XUBA 5HQ5A 5C87A 4NUCA 5FB1A 5C89A 5FFWA 4QBMA 5KU3A 1EQFA 5FE0A 4CUTA 5AMFA 4C66A 3SVHA 4CUQA 3G0LA 3D1DA 5CQ3A 4HXMA 5EGUA 4A9JA 3VKGA 4HBYA 4YH4A 5COIA 2OSSA 3NXBA 5FE2A 3IU5A 4CL9A 5FDZA 5CUEA 5I89A 4HBVA 4YYHA 5DFCA 5EQ1A 5LJ2A 5IIDA 3K2JA 4QSQA 5E9MA 5EPSA 4CLBA 5ENCA 3U5OA 3O34A 5EA1A 4MEOA 5A7CA 4CFLA 4KV4A 2RNXA 4CURA 4UYFA 2I8NA 5FE8A 4OGJA 4N4HA 5I83A 2DATA 3Q2FA 2YQDA 3U5PA 5L98A 5LVQA 5HEMA 5DKDA 4J0SA 5D7XA 4PS5A 4YBMA 4MR5A 5LKZA 2MJVB 5JWMA 4HBXA 5D3SA 4ZQLA 5D3LA 5FBXA 4AKIA 5EWHA 5D3HA 5D24A 3LJWA 5F3AA 5DFBA 5FFYA 4O70A 3GG3A 5CUDA 4UIYA 3U5NA 5EPBA 2D82A 4TYLA 5EV9A 4TTEA 3O36A 4BW4A 4TU6A 3UV4A 5FE7A 4NR6A 5A5PA 5DBMA 5F1HA 4LDFA 3TLPA 4Z1SA 5LJ0A 4ALHA 4XY9A 5IGLA 4A9IA 2E3KA 5L99A 3AQAA 4NYXA 5LVRA 2DKWA 4A9OA 4QR3A 5CQ4A 4HBWA 5DW1A 4ZW1A 4O7FA 5DY7A 5CRMA 3UV5A 3SVFA 4YATA 3D1BA 4UYGA 5ENJA 4E96A 5DYUA 5IGNA 4QYLA 5E9LA 4UITA 4LRGA 4QEVA 4QUTA 3P1CA 4KCXA 5CQ7A 4QEWA 4PCEA 3LQHA 4Q0OA 3JVLA 5AD2A 2DVVA 3UVWA 3P5OA 3MUKA 5FFVA 5CTLA 5FG6A 5HRVA 5AMEA 5DFDA 4UIZA 5E73A 4BW1A 2RFJA 4UYEA 4C67A 2YELA 2L5EA 5FE3A 3LXJA 5F36A 4CFKA 5FE4A 3MQMA 4O77A 5L8TA 5LKUA 4BW3A 5EK9A 5EI4A 5L96A 4MEPA 4XY8A 4O74A 3HMHA 5D3PA 5CU8A 5LKXA 4HXLA 4NUEA 4QSRA 4X2IA 5D3RA 4OGIA 3UVDA 4NRBA 5CUAA 5CGPA 2N9GA 4YBSA 5ENEA 5II2A 3O33A 5A5OA 4YH3A 2EJNA 2R10A 3HMEA 5EPRA 4IORA 4PTBA 2DVRA 4HXRA 4UIXA 5H85A 4MEQA 4QSXA 4LZSA 5D26A 5A5SA 4TZ2A 5DYCA 4Z1QA 4LYIA 5C7NA 3HMFA 5HCLA 4NQNA 4QSTA 4RVRA 4TZ8A 3S91A 5CZGA 4QSUA 5FG5A 4HXKA 3Q2EA 5I40A 2OO1A 4N4FA 2DWWA 5I1QA 4IR5A 2I7KA 4UIUA 4YBTA 4NXJA 4YY6A 5F1LA 5CS8A 4N3WA 4IR4A 4NYVA 2FSAA 4J1PA 5A5RA 4NRAA 4A9NA 4YYJA 5FE9A 5FH8A 3QZVA 5H1VA 4F3IA 5D0CA 4TT4A 2RNWA 5ETBA 5A5QA 5ENBA 2F6NA 5CY9A 3UV2A 3U5JA 5E74A 4QY4A 4LZ2A 2YW5A 4NR8A 5CUGA 4MR6A 4TU4A 5TB6A 2KTBB 5CP5A 5EU1A 4LYWA 4AKNA 5DKHA 5D3NA 5E9IA 4A9MA 4Q0NA 2H60A 4Z6HA 5I7YA 4PCIA 4IR6A 4Z93A 5I88A 5I7XA 2R0SA 4AI6A 5F62A 3MXFA 5J0DA 4NRCA 3LQJA 4O7CA 4HXSA 5CUCA 2WP2A 4LR6A 2NXBA 5IGKA 5A83A 1WUGA 5HRXA 4LC2A 4UYDA 4WIVA 5JI8A 5EISA 5TCMA 4MR4A 5CQ5A 2DVSA 5AD3A 4WHWA 4GPJA 5C85A 4O7AA 4NR5A 4NQMA 2L85A 5EWVA 4DONA 4NYWA 4O75A 5IGMA 3I3JA 4A9HA 4YYKA 4BW2A 5CUBA 5EWDA 5H1TA 4IR3A 5EM3A 4QEUA 5FH6A 3VKHA 3O37A 5L8UA 5KO4A 5F63A 5KTXA 4TS8A 5E9VA 3JVKA 2E7NA 3P1DA 3UVYA 5DLZA 2RO1A 4QZSA 2GRCA 5HJCA 4HXPA 5E7DA 5F5ZA 3S92A 5HRWA 5LJ1A 4QSPA 4HXNA 3LQIA 5E9KA 3DAIA 2YDWA 4YABA 5HLSA 4J0RA 4N4GA 2D9EA 5CPEA 5D25A 4NR4A 5KHMA 5E9YA 1JM4B 5IG6A 4NR9A 4PKLA 5L97A 4FLPA 4QB3A 4QR4A 4CUUA 4QSWA 4TQNA 4HXOA 4ALGA 5HFRA 4A9KA 5EWWA 4CUSA 4AKGA 3D7CA 4YYIA 5DX4A 5I80A 4AKHA 3QZSA 3AADA 4UYHA 4Y03A 5CFWA 3U5LA 5F60A 4BJXA 5FH7A 5G4SA 5F2PA 4YY4A 5C4QA 5D3JA 4QSVA 3P1FA 4WHUA 3FKMX 4MR3A 1N72A 4KV1A 4O7BA 3RCWA 4YYMA 3IU6A 2G4AA 4OUFA 4XUAA 3U5MA 3P1EA 5BT4A 4UYFB 5ENFA 5DLXA 4A9EA 5CRZA 4YYGA 4N4IA 4Z6IA 2E7OA 5D3TA 4BHWA 5CQ8A 5H1UA 5EP7A 5CQAA 5A5NA 5DKCA 4ZC9A 4QUUA 4IOQA 5KTUA 5E3GA 4QNSA 4A9FA 5DYAA 1F68A 1JSPB 4IOOA 4O72A 4YADA 5DW2A 5HM0A 2YEMA 1X0JA 4NR7A 3JVJA 5DYXA 2RS9B 5ENHA 5IBNA 4LYSA 3SVGA 1ZS5A 1PUOA 4YK0A 5HELA 5FE5A 5HQ6A 5CQ6A 4MENA 5E0RA 4QSSA 2YYNA 2YEKA 3QZTA
chains in the Genus database with same CATH topology
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