4QC1A

Crystal structure of human baz2b bromodomain in complex with an acetylated histone 3 peptide (h3k14ac)
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
SMDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 38
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qc1A00
5I7XA 4NR6A 5LKXA 5CQ7A 3UVXA 5HRXA 4QSUA 5K29A 4J3IA 4LZSA 4YY6A 4CUPA 4Z6IA 5I40A 5F5ZA 2DVRA 2RO1A 5EPBA 4KV4A 3HMEA 3S92A 5HENA 4ALGA 5E9VA 5I1QA 5KTWA 5AMEA 4NYXA 5HQ5A 2YELA 5CQTA 3ZYUA 2OUOA 4UYDA 4ZQLA 5HFQA 5F2PA 3SVFA 4NUCA 4TQNA 5EWVA 4ZW1A 4NYWA 5D7XA 5DYAA 4YK0A 5A85A 2L84A 2L5EA 3Q2FA 2RNWA 5DYUA 3K2JA 4KCXA 4YYGA 5H1UA 4QSPA 5E9IA 3AQAA 5COIA 4O7BA 5L96A 4BW4A 5DLZA 5FE8A 4MR4A 5A5SA 5EISA 4OUFA 2DVVA 5HEMA 5C8GA 4O71A 4QR3A 4TS8A 4QEUA 4PTBA 4YYHA 3NXBA 5I88A 4A9LA 4NR7A 5A5OA 4J0RA 2H60A 5EVAA 5EA1A 5D25A 5D3HA 4E96A 2OO1A 5ACYA 5LJ1A 4MR5A 4FLPA 4NRAA 4O74A 5DW2A 5E7DA 4QSTA 4O7CA 4QR4A 4HBYA 4YATA 5CQ4A 4CURA 4BW2A 4O7AA 5HJCA 5CUDA 3JVLA 5C7NA 5E3DA 4A9FA 4HXPA 5E9YA 5TB6A 5IGLA 5CFWA 5FG5A 4HBXA 3LQHA 5ETDA 5CS8A 3TLPA 2OSSA 5D3RA 4HBVA 4BJXA 2L85A 5A5NA 2R0SA 3UVDA 4YC9A 5CRZA 4QSRA 5E9MA 3UVYA 5HCLA 2DWWA 4QC3A 5F36A 5E74A 3SVGA 4HXMA 3O35A 2I8NA 4OGJA 4RVRA 5KTXA 5EPSA 2RNXA 4YYMA 4MEPA 4HXRA 5FE2A 4QC1A 4PCEA 2E7NA 5CUGA 3U5LA 4HBWA 2WP1A 2RNYA 5J0DA 3G0LA 5DKHA 5CUEA 4XY9A 5A5QA 5CPEA 4UYHA 5CU8A 4NRCA 4WHUA 3U5KA 5LVQA 2D9EA 5A81A 1WUMA 4HXNA 4QUTA 2I7KA 4LYWA 4QR5A 4X2IA 5FFYA 4NUDA 3UV5A 5HRWA 4N4HA 4NQNA 3G0JA 3U5OA 4LDFA 5DKDA 5ENCA 4A9EA 5EU1A 4YBTA 5E9LA 5CZGA 3MB3A 1E6IA 5LVRA 4NYVA 4LRGA 5A7CA 2GRCA 5ETBA 5C85A 5EICA 5G4SA 5DX4A 5ENFA 5I89A 4ALHA 5EWCA 3LQJA 5EPRA 5FFVA 2RFJA 4UYGA 4QYLA 5DFBA 4BW3A 5D3LA 3U5NA 5L99A 4QSVA 5CQ3A 4PY6A 5DKCA 4LYIA 5II2A 5H85A 5D3PA 4NXJA 5FH8A 4AKNA 5EK9A 4A9NA 1F68A 4UIXA 2N9GA 4YH3A 4UYFA 5LKTA 5D24A 3P5OA 4TU6A 4CLBA 5ENEA 4Z6HA 4CUUA 4YADA 4A9MA 4IOOA 2F6JA 2G4AA 5DY7A 2E3KA 4QEWA 4PCIA 4NR4A 4CUQA 4IR4A 5IIDA 4NRBA 3I3JA 4YABA 5AD2A 4UIUA 2KTBB 2F6NA 5CUCA 3FKMX 5FE3A 4UIZA 4IR6A 5FE7A 3UV2A 2WP2A 4TT6A 3IU6A 2R0VA 5CUAA 5A82A 4A9OA 5TCMA 4QY4A 5FE1A 4Z1SA 3P1CA 4TZ2A 5JWMA 5FG4A 5D3NA 4CFKA 5FB1A 3MB4A 5I83A 4XY8A 3O34A 5LJ0A 5ENJA 4NS5A 5HFRA 4PS5A 5CQAA 5DLXA 5C89A 2NXBA 4IR3A 2YYNA 2YDWA 5FG6A 5FH6A 5FE9A 2RI7A 5FDZA 4QSWA 5HQ6A 2E7OA 5HM0A 5F61A 5FBXA 4Q0OA 5IGKA 1WUGA 4CFLA 4YH4A 1JSPB 3GG3A 3O36A 3U5JA 5BT4A 4MENA 4N3WA 5ENHA 4OGIA 4C67A 5I86A 4O77A 5F62A 4XUBA 4NR8A 5A5PA 5L8UA 4HXLA 4IR5A 5DFDA 5ENIA 4IORA 4QSQA 4CUSA 5KHMA 3MQMA 5LJ2A 4YYKA 5CQ6A 1X0JA 4J0SA 5CY9A 3QZTA 5JI8A 4QNSA 4C66A 3D7CA 5FE4A 5F1LA 4Z1QA 4O7EA 5IG6A 5FE6A 2DKWA 4TTEA 4QZSA 5F1HA 5LKUA 4O7FA 5L8TA 4YBMA 5FE5A 5CQ8A 4QEVA 5EWWA 5II1A 3IU5A 4CUTA 4NR5A 5EI4A 4Q0NA 4TU4A 2MJVB 5F25A 5F60A 5EGUA 3QZVA 5DBMA 1EQFA 5CQ5A 5KO4A 4KV1A 4UYEA 5FE0A 5AD3A 4UYFB 5LKZA 3MULA 5L97A 4A9HA 5D0CA 3MUKA 5HLSA 4LZ2A 4BHWA 3JVKA 4QB3A 4IOQA 3JVMA 5CTLA 4HXKA 5EWDA 3U5MA 1JM4B 3RCWA 2YQDA 5KU3A 5D3SA 5DFCA 5DYXA 4MEOA 4MR6A 5ENBA 4TT4A 5HELA 1ZS5A 2LSPB 4YY4A 5HQ7A 3QZSA 2R0YA 4N4IA 5ENGA 5EWHA 5CRMA 4HXOA 4TT2A 5H1VA 3UW9A 4NUEA 5G4RA 5H1TA 4TYLA 4UITA 4LR6A 2RS9B 4YBSA 5E3GA 5C87A 4YAXA 4F3IA 2D82A 3LQIA 4XUAA 4YYIA 5C4QA 4A9IA 4O76A 2DVSA 5L98A 4Y03A 3S91A 5FH7A 4O78A 4O72A 4QUUA 5CUBA 3MXFA 4UIWA 5CGPA 1N72A 5D3TA 5EQ1A 4ZC9A 5IBNA 5E73A 3AADA 4WIVA 5LUUA 3O37A 3HMHA 4NQMA 5I80A 5DW1A 4MEQA 4QSXA 4WHWA 5AMFA 5HRVA 5FFWA 4TZ8A 5D26A 2DATA 5IGMA 4YYDA 4N4GA 3SVHA 5BT3A 4A9KA 4YYNA 3JVJA 4QSSA 5EM3A 4XYAA 3P1EA 5EP7A 4BW1A 3DWYA 3ONIA 4O75A 4MR3A 3P1FA 5E9KA 4PKLA 4QBMA 4QYDA 4A9JA 3DAIA 2DVQA 5A83A 4UIVA 4J1PA 2YEKA 5CP5A 2YW5A 3Q2EA 4NR9A 4YYJA 5I29A 5F63A 4HXSA 3LXJA 3LJWA 5KTUA 3O33A 3UV4A 5A5RA 3P1DA 4LZRA 3UVWA 2FSAA 4DONA 4LC2A 4CL9A 3HMFA 4LYSA 3U5PA 4N4FA 2R10A 4Z93A 5DYCA 2YEMA 5F3AA 5D3JA 4O70A 5IGNA 5FB0A 5E0RA 5EV9A 4UIYA 5I7YA 4GPJA 5BT5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I7XA 4NR6A 5LKXA 5CQ7A 3UVXA 5HRXA 4QSUA 5K29A 4J3IA 4LZSA 4YY6A 4CUPA 4Z6IA 5I40A 5F5ZA 4AKIA 2DVRA 2RO1A 5EPBA 4KV4A 3HMEA 3S92A 5HENA 4ALGA 5E9VA 5I1QA 5KTWA 5AMEA 4NYXA 5HQ5A 2YELA 5CQTA 3ZYUA 2OUOA 4UYDA 4ZQLA 5HFQA 5F2PA 3SVFA 4NUCA 4TQNA 5EWVA 4ZW1A 4NYWA 5D7XA 5DYAA 4YK0A 5A85A 2L84A 2L5EA 3Q2FA 2RNWA 5DYUA 3ERRA 3K2JA 4KCXA 4YYGA 5H1UA 4QSPA 5E9IA 3VKHA 3AQAA 5COIA 4O7BA 5L96A 4BW4A 5DLZA 5FE8A 4MR4A 3D1BA 5A5SA 5EISA 4OUFA 2DVVA 5HEMA 5C8GA 4O71A 4QR3A 4TS8A 4QEUA 4PTBA 4YYHA 3NXBA 5I88A 4A9LA 4NR7A 5A5OA 4J0RA 2H60A 5EVAA 5EA1A 5D25A 5D3HA 4AKHA 4E96A 2OO1A 5ACYA 5LJ1A 4MR5A 4FLPA 4NRAA 4O74A 5DW2A 5E7DA 4QSTA 4O7CA 4QR4A 4HBYA 4YATA 5CQ4A 4CURA 4BW2A 4O7AA 5HJCA 1ZKRA 5CUDA 3JVLA 5C7NA 5E3DA 4A9FA 4HXPA 5E9YA 5TB6A 5IGLA 5CFWA 5FG5A 4HBXA 3LQHA 5ETDA 5CS8A 3TLPA 2OSSA 5D3RA 4HBVA 4BJXA 2L85A 5A5NA 2R0SA 3UVDA 4YC9A 5CRZA 4QSRA 5E9MA 3UVYA 5HCLA 2DWWA 4QC3A 5F36A 5E74A 3SVGA 4HXMA 3O35A 2I8NA 4OGJA 4RVRA 5KTXA 5EPSA 2RNXA 4YYMA 4MEPA 4HXRA 5FE2A 4QC1A 4PCEA 2E7NA 5CUGA 3U5LA 4HBWA 2WP1A 2RNYA 5J0DA 3G0LA 5DKHA 5CUEA 4XY9A 5A5QA 5CPEA 4UYHA 5CU8A 4AKGA 4NRCA 4WHUA 3U5KA 5LVQA 2D9EA 5A81A 1WUMA 4HXNA 4QUTA 2I7KA 4LYWA 4QR5A 4X2IA 5FFYA 4NUDA 3UV5A 5HRWA 4N4HA 4NQNA 3G0JA 3U5OA 4LDFA 5DKDA 5ENCA 4A9EA 5EU1A 4YBTA 5E9LA 5CZGA 3MB3A 1E6IA 5LVRA 4NYVA 4LRGA 5A7CA 2GRCA 5ETBA 5C85A 5EICA 5G4SA 5DX4A 5ENFA 5I89A 4ALHA 5EWCA 1PUOA 3LQJA 5EPRA 5FFVA 2RFJA 4UYGA 4QYLA 5DFBA 4BW3A 5D3LA 3U5NA 5L99A 4QSVA 5CQ3A 4PY6A 5DKCA 4LYIA 5II2A 5H85A 5D3PA 4NXJA 5FH8A 4AKNA 5EK9A 4A9NA 1F68A 4UIXA 2N9GA 4YH3A 4UYFA 5LKTA 5D24A 3P5OA 4TU6A 4CLBA 5ENEA 4Z6HA 4CUUA 4YADA 4A9MA 4IOOA 2F6JA 2G4AA 5DY7A 2E3KA 4QEWA 4PCIA 4NR4A 4CUQA 4IR4A 5IIDA 4NRBA 3I3JA 4YABA 5AD2A 4UIUA 2KTBB 2F6NA 5CUCA 3FKMX 5FE3A 4UIZA 4IR6A 5FE7A 3UV2A 2WP2A 4TT6A 3IU6A 2R0VA 5CUAA 5A82A 4A9OA 5TCMA 4QY4A 5FE1A 4Z1SA 3P1CA 4TZ2A 5JWMA 5FG4A 5D3NA 4CFKA 5FB1A 3MB4A 5I83A 4XY8A 3O34A 5LJ0A 5ENJA 4NS5A 5HFRA 4PS5A 5CQAA 5DLXA 5C89A 2NXBA 4IR3A 2YYNA 2YDWA 5FG6A 5FH6A 5FE9A 2RI7A 5FDZA 4QSWA 5HQ6A 2E7OA 5HM0A 5F61A 5FBXA 4Q0OA 5IGKA 1WUGA 4CFLA 4YH4A 1JSPB 3GG3A 3O36A 3U5JA 5BT4A 4MENA 4N3WA 5ENHA 4OGIA 4C67A 5I86A 4O77A 5F62A 4XUBA 4NR8A 5A5PA 5L8UA 4HXLA 4IR5A 5DFDA 5ENIA 4IORA 4QSQA 4CUSA 5KHMA 3MQMA 5LJ2A 4YYKA 5CQ6A 1X0JA 4J0SA 5CY9A 3QZTA 5JI8A 4QNSA 4C66A 3D7CA 5FE4A 5F1LA 4Z1QA 4O7EA 5IG6A 5FE6A 2DKWA 4TTEA 4QZSA 5F1HA 5LKUA 4O7FA 5L8TA 4YBMA 5FE5A 5CQ8A 4QEVA 5EWWA 5II1A 3IU5A 4CUTA 4NR5A 5EI4A 4Q0NA 4TU4A 2MJVB 5F25A 5F60A 5EGUA 3QZVA 5DBMA 1EQFA 5CQ5A 5KO4A 4KV1A 4UYEA 5FE0A 5AD3A 4UYFB 5LKZA 3MULA 5L97A 4A9HA 5D0CA 3MUKA 5HLSA 4LZ2A 4BHWA 3JVKA 4QB3A 4IOQA 3JVMA 5CTLA 4HXKA 5EWDA 3U5MA 1JM4B 3RCWA 2YQDA 5KU3A 5D3SA 5DFCA 5DYXA 4MEOA 4MR6A 5ENBA 4TT4A 5HELA 1ZS5A 2LSPB 4YY4A 5HQ7A 3QZSA 2R0YA 4N4IA 5ENGA 5EWHA 5CRMA 4HXOA 4TT2A 5H1VA 3UW9A 4NUEA 5G4RA 5H1TA 4TYLA 4UITA 4LR6A 2RS9B 4YBSA 5E3GA 5C87A 4YAXA 4F3IA 2D82A 3LQIA 4XUAA 4YYIA 5C4QA 4A9IA 4O76A 2DVSA 5L98A 4Y03A 3S91A 5FH7A 4O78A 4O72A 4QUUA 5CUBA 3MXFA 4UIWA 5CGPA 1N72A 5D3TA 5EQ1A 4ZC9A 5IBNA 5E73A 3AADA 4WIVA 5LUUA 3O37A 3HMHA 4NQMA 5I80A 5DW1A 4MEQA 4QSXA 4WHWA 5AMFA 5HRVA 5FFWA 4TZ8A 5D26A 2DATA 5IGMA 4YYDA 4N4GA 3SVHA 5BT3A 4A9KA 4YYNA 2EJNA 3JVJA 4QSSA 5EM3A 4XYAA 3P1EA 5EP7A 4BW1A 3DWYA 3VKGA 3ONIA 4O75A 4MR3A 3P1FA 5E9KA 4PKLA 4QBMA 4QYDA 4A9JA 3DAIA 2DVQA 5A83A 4UIVA 4J1PA 2YEKA 5CP5A 2YW5A 3Q2EA 4NR9A 4YYJA 5I29A 5F63A 4HXSA 3LXJA 3LJWA 5KTUA 3O33A 3UV4A 5A5RA 3P1DA 4LZRA 3UVWA 2FSAA 4DONA 4LC2A 4CL9A 3HMFA 4LYSA 4AI6A 3U5PA 4N4FA 2R10A 4Z93A 5DYCA 2YEMA 5F3AA 5D3JA 4O70A 5IGNA 5FB0A 5E0RA 5EV9A 4UIYA 5I7YA 3D1DA 4GPJA 5BT5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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