4NR6A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an oxazepin ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an oxazepin ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr6A00
4O77A 1EQFA 4YY4A 4BW1A 3O36A 4XUBA 4ZQLA 5I80A 4A9JA 5EGUA 4AKNA 5G4SA 4QEVA 3P1FA 5EA1A 4LZRA 4TZ8A 4IR5A 3I3JA 4HXOA 4HBVA 4YBSA 5F1LA 5CQ3A 5LVRA 4CUSA 5EP7A 5AMFA 5HM0A 1ZS5A 3UW9A 4HXLA 4A9NA 5IIDA 4BW2A 4PCEA 2I8NA 5EU1A 4YYMA 5FH8A 4QSTA 3U5MA 5BT3A 4QEUA 4MR5A 5EV9A 4HBWA 5FH6A 5DKCA 5F61A 4O75A 5ACYA 4XUAA 2YQDA 5DYUA 5HQ5A 5E3DA 3MQMA 4YADA 5I1QA 3UV4A 3DWYA 3NXBA 4O70A 5DFDA 4NRAA 5LJ1A 4A9EA 3K2JA 4X2IA 4UYEA 4O7CA 4A9FA 4TZ2A 4TT2A 4QSXA 5LKZA 2LSPB 4QSVA 5F60A 5EWCA 4PTBA 5DLZA 5LKXA 2F6NA 2E7NA 5F62A 5H1VA 4MENA 2MJVB 3JVMA 5A7CA 3U5KA 4YH3A 5FFYA 4NR5A 2YDWA 5G4RA 2N9GA 4QSSA 5C87A 5KO4A 5KTXA 3UVYA 4CL9A 3LQHA 4TQNA 5I89A 5F25A 3HMEA 5CQ7A 4CUPA 4NR8A 5AD2A 4A9HA 2NXBA 5FE3A 4NQNA 4LR6A 5FE7A 3UV5A 3UV2A 5F63A 4ZW1A 5CP5A 4C67A 2L5EA 4O74A 5FFVA 3U5NA 5ENJA 3RCWA 2YYNA 5IG6A 5F1HA 3SVFA 4NQMA 5TCMA 5EWVA 3LXJA 4HXMA 4J1PA 5E7DA 4NR4A 4ALGA 5C8GA 4QYDA 5L99A 5D26A 4UYHA 4WIVA 5CGPA 5EQ1A 2YEKA 4N4IA 4IOQA 5DKDA 4HXPA 5DYXA 4BHWA 4A9LA 4NXJA 3G0LA 4PY6A 5FG5A 5I40A 4N3WA 5LVQA 5H1TA 4MR3A 5IGMA 5CUDA 5A5PA 4OGJA 3O34A 5HELA 4TU4A 4LZSA 4YABA 3QZTA 5J0DA 4O72A 4QR3A 5I29A 4PKLA 5I7XA 5K29A 5DFCA 5A85A 4XYAA 2R0VA 5CFWA 5AMEA 5DX4A 3UVDA 4CURA 5L98A 4YH4A 4Z6IA 5FFWA 5FG4A 3P1EA 2H60A 3JVKA 5JI8A 5E0RA 5EICA 1WUGA 5CQAA 5FG6A 4TTEA 3MB3A 4QUTA 5A5SA 5CQ8A 5LJ0A 4MR6A 2DVSA 5EISA 5ENCA 5A83A 5D3LA 5HENA 5FE1A 4YYKA 3O37A 4QSPA 5H85A 5FB0A 4NR7A 4MEPA 4NR9A 4QR5A 5E9VA 2YELA 4CLBA 4KV4A 4NRCA 4UYFB 4Q0OA 4TU6A 2RNXA 5E74A 4LC2A 5DLXA 1JM4B 5L97A 2DVQA 2DWWA 4WHUA 2E7OA 5L8UA 4A9MA 2OUOA 5ETDA 5KTWA 5FE9A 4UIZA 3HMHA 5EWDA 4Y03A 5HRXA 4MR4A 4YYDA 3ONIA 4ZC9A 5IGLA 4MEOA 3JVLA 2KTBB 4IR4A 3U5JA 3UVWA 5KHMA 2GRCA 5HRVA 4A9IA 4TT6A 4Q0NA 5CUAA 5CQ5A 4A9KA 1N72A 1X0JA 5CUGA 4ALHA 5D3SA 4CFLA 4QSRA 5CTLA 2R0YA 5F2PA 5BT5A 5TB6A 4UIUA 5HQ6A 4UIVA 2WP1A 5C85A 4O7FA 4PS5A 4NUCA 5F3AA 3IU6A 5IBNA 5C7NA 4TYLA 4YYNA 5IGKA 5HFRA 3AQAA 3IU5A 5D25A 5D3JA 4NYVA 5CZGA 4QSWA 4MEQA 5CPEA 5KU3A 4UIXA 5F36A 3LQJA 5EPRA 5KTUA 2RS9B 3AADA 4YATA 4LZ2A 2E3KA 4YYGA 4UITA 4YYIA 5CU8A 5E9KA 4HXNA 2D9EA 5D3NA 5ENGA 4IR6A 4UYDA 5EWWA 5DKHA 2DVRA 4UIYA 4N4GA 5ETBA 5LUUA 3SVHA 3QZSA 4BW3A 5FE4A 3O35A 5CQ6A 3Q2FA 4RVRA 5EWHA 1JSPB 2L85A 5ENHA 4O71A 4CUUA 3TLPA 5FE8A 5CUEA 4WHWA 5HQ7A 5E9IA 4YY6A 3MUKA 5D0CA 5CS8A 5EM3A 5L96A 4QSQA 3D7CA 5LKTA 5HCLA 2RNYA 4N4FA 3P1CA 4LYSA 5HRWA 4YYHA 1F68A 5DW2A 4LRGA 4QC1A 5IGNA 4BW4A 5BT4A 5II1A 5D24A 2YW5A 4J3IA 4NS5A 5COIA 5E3GA 5FE2A 5CQ4A 4DONA 4NYXA 4TT4A 2WP2A 4QEWA 3P1DA 5CY9A 1WUMA 3P5OA 4TS8A 5DYCA 2RI7A 5DBMA 5E9LA 5CQTA 3UVXA 4QR4A 4NUEA 5L8TA 4O7EA 5D3PA 4J0RA 5CUBA 3U5LA 5D3HA 5ENIA 3JVJA 4LYWA 2G4AA 3Q2EA 5A5OA 3DAIA 4F3IA 5C89A 4YBMA 2DVVA 4XY9A 4LDFA 4HXSA 5A5NA 4KCXA 4QNSA 4Z93A 5HEMA 5HFQA 3LJWA 3O33A 2YEMA 4QC3A 5EI4A 5FE0A 5I88A 5D3TA 2RNWA 4O7AA 4C66A 4XY8A 4UIWA 2L84A 4QB3A 2RO1A 4CUQA 4O76A 5CRZA 2F6JA 3U5OA 5DYAA 3ZYUA 5A5QA 2R10A 5JWMA 4Z6HA 5ENEA 5II2A 5FDZA 4BJXA 3HMFA 3MULA 5E9MA 5LJ2A 5CUCA 5FE5A 4A9OA 5A5RA 4QYLA 3SVGA 5LKUA 2RFJA 4J0SA 4KV1A 5D7XA 2OSSA 3MXFA 5ENBA 5EPBA 3U5PA 4NUDA 2DKWA 5A81A 5CRMA 2FSAA 4QBMA 4HXKA 5F5ZA 3QZVA 5FH7A 5DW1A 3FKMX 5ENFA 5A82A 5EVAA 4PCIA 4IR3A 5FB1A 5FE6A 4UYFA 4HXRA 4GPJA 4Z1QA 5EPSA 4O7BA 3GG3A 5FBXA 4CFKA 4NYWA 3G0JA 4UYGA 5E9YA 5I7YA 4N4HA 5HJCA 5E73A 1E6IA 4O78A 2I7KA 2D82A 4NRBA 4CUTA 4IOOA 4YBTA 5DFBA 2DATA 3MB4A 4OUFA 4YYJA 2OO1A 5AD3A 4HBYA 4YC9A 3S91A 5EK9A 4LYIA 4NR6A 5H1UA 4E96A 4QZSA 3S92A 4HBXA 4YAXA 5D3RA 3LQIA 5I86A 5DY7A 5C4QA 4YK0A 4QUUA 5HLSA 5I83A 4FLPA 4IORA 4QSUA 4Z1SA 4OGIA 4QY4A 2R0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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