4NR6A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an oxazepin ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an oxazepin ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr6A00
5C8GA 5EA1A 4HBXA 5ENGA 3U5JA 5AMEA 5KTWA 5FB1A 5G4SA 5A7CA 2YYNA 2RO1A 5E9KA 4YK0A 5CUBA 2RNWA 5F1LA 4QZSA 4UYDA 4LDFA 4NYVA 2YEMA 5EISA 5FH7A 4ZQLA 4HBYA 5J0DA 4PTBA 4AKNA 5C85A 4A9EA 1WUMA 3Q2FA 1EQFA 4PY6A 4O77A 3GG3A 2N9GA 4TU6A 4C66A 5FE1A 5BT5A 5CFWA 5D0CA 5FB0A 4QC1A 4UIUA 4QSTA 3MB3A 5F5ZA 5I40A 3LQJA 5FE8A 5KTUA 5II2A 3UV5A 5E0RA 4QSSA 4DONA 4NR9A 4Z6IA 5KTXA 5LKZA 2GRCA 3MXFA 3FKMX 5H1TA 4UIXA 5ETDA 4F3IA 4O76A 4NQNA 4NR6A 5TCMA 2YELA 4IORA 5ENFA 5CZGA 4BHWA 5C87A 5LUUA 5ETBA 5FH6A 2WP1A 5D25A 2MJVB 2OUOA 4HXKA 4XY9A 2F6NA 4BW1A 5IG6A 4QSXA 4HXMA 4QY4A 4TT2A 5I80A 2L84A 5DY7A 4CUUA 3Q2EA 3D7CA 4N4IA 5HEMA 3HMHA 1X0JA 5LVRA 4QSVA 3SVFA 3S91A 2KTBB 5ENJA 5CP5A 4WHWA 4YBMA 4CL9A 3O33A 2RS9B 3LJWA 3QZTA 4NR5A 3G0JA 5E9LA 5HENA 2YQDA 5ENBA 5EM3A 4O70A 2OO1A 4QSPA 5FE5A 4O7FA 4PCIA 3AADA 4Y03A 4YAXA 5CQ7A 2DATA 5BT3A 4A9LA 4NR7A 3U5NA 5DKDA 4N4GA 5CS8A 5CY9A 5E3DA 4CUQA 4QYDA 5EQ1A 5F36A 4NRBA 4MR5A 4YADA 4TT6A 5CQAA 5A5SA 4NRAA 4TZ8A 4YBTA 2DKWA 5LJ2A 4A9IA 4CUPA 5D24A 1ZS5A 4YBSA 5HQ6A 5D3JA 5EI4A 4A9MA 4O78A 4XUAA 5C89A 4YATA 5DLXA 2D82A 4UIVA 3JVMA 4QUTA 4O7CA 5D3RA 2YEKA 5A5QA 4NXJA 5FDZA 5I7XA 4O71A 4YH4A 5L96A 5D3SA 5CUDA 5CQ5A 4YABA 3LXJA 3JVLA 2DVRA 2F6JA 5IGNA 2G4AA 5DFCA 4LC2A 5K29A 5DW2A 2YDWA 4A9NA 4O72A 4IR6A 5FFWA 5LKXA 4HXSA 5FE4A 3UVXA 5EU1A 2H60A 4CLBA 4NUCA 3HMFA 4PS5A 5CQ4A 4Z1SA 2FSAA 3UVYA 3UVDA 4E96A 3UW9A 5EPBA 5HELA 4N4FA 5F2PA 5EP7A 3O34A 3P1FA 4TQNA 4CFLA 1N72A 5F60A 2OSSA 5HJCA 4NR4A 1E6IA 5FG4A 4HXLA 4O7BA 5DFBA 4LZ2A 5CPEA 2RNYA 4MEQA 5I7YA 4O7AA 4IR5A 4YYJA 2L5EA 4TS8A 5CGPA 3DAIA 4PKLA 5C4QA 3RCWA 3K2JA 5D3LA 5E3GA 5FH8A 4UYFB 3MUKA 4QSWA 5I88A 4Z6HA 4CURA 3ONIA 4TYLA 5G4RA 5KHMA 4YYMA 4KV4A 2R0YA 4BW4A 3O37A 5TB6A 4YYHA 5A5OA 4UIWA 4FLPA 3HMEA 4QEUA 3MQMA 5LKUA 5EWCA 3SVGA 4HBWA 5I29A 4N4HA 5DYCA 2RI7A 4QR3A 2E7NA 4ZW1A 4YH3A 4HXPA 4IOQA 5CRZA 5D3TA 4QUUA 4WIVA 5IIDA 3P1CA 4QB3A 3DWYA 4MENA 5CU8A 3P1EA 4KCXA 1JSPB 3P1DA 5LKTA 4HXOA 4XYAA 3UV4A 3MULA 5FFYA 5F61A 5ENEA 4MEPA 4MEOA 5D3PA 1F68A 4C67A 5DW1A 5ACYA 5FG5A 4A9OA 5C7NA 4A9KA 5H1UA 5A5RA 4HBVA 4QNSA 4NYXA 5KO4A 4Z1QA 5CUGA 5ENHA 5FE6A 5F1HA 5FE3A 5D3HA 5EK9A 4HXRA 4CFKA 5CQ3A 4O74A 2NXBA 5E9YA 3MB4A 1JM4B 2RFJA 4N3WA 4QEVA 3UVWA 5FE9A 5DYXA 5CRMA 4UYGA 2R0VA 2YW5A 2WP2A 5E9VA 5EWHA 4UYHA 4UIYA 4TU4A 5FBXA 5A83A 5ENIA 3O36A 4UYFA 5COIA 4MR4A 5AMFA 5HRVA 3U5MA 5F25A 4J1PA 2DVQA 4QSQA 5ENCA 5EICA 5FE2A 5LJ0A 4NYWA 5CQTA 5BT4A 5CTLA 4KV1A 5EWVA 3IU5A 4YC9A 4Q0NA 3QZSA 2R10A 4TT4A 5L98A 5EPSA 4QSUA 4QC3A 4OUFA 3QZVA 5IGLA 3O35A 5F63A 4YYGA 4O7EA 2DVVA 5EVAA 5II1A 4A9FA 3LQHA 5HFRA 5DKHA 4WHUA 2E3KA 4RVRA 5CUAA 5I89A 4OGJA 5HCLA 4YYIA 5A85A 3TLPA 4ZC9A 4LRGA 4LYIA 5FE7A 4LYSA 4TTEA 2I7KA 4QSRA 4BW2A 4NUEA 5HRXA 4J3IA 4MR3A 5D7XA 5HQ5A 3NXBA 4CUSA 5A5PA 5AD3A 4OGIA 3U5LA 5AD2A 3IU6A 4NR8A 3G0LA 2I8NA 2D9EA 4XUBA 4CUTA 5LVQA 2R0SA 5D3NA 5KU3A 5DX4A 5E74A 5IGKA 2RNXA 5E9MA 4J0RA 4YYKA 4LYWA 4QEWA 5A81A 4IR3A 2L85A 5DBMA 5L97A 4ALHA 3ZYUA 4NRCA 5L8TA 5HFQA 5D26A 5EPRA 3SVHA 4UIZA 5A5NA 2E7OA 4NUDA 4PCEA 4YYDA 3I3JA 4LZRA 5JI8A 4HXNA 3P5OA 4IR4A 4BW3A 4MR6A 5FG6A 5F3AA 5H85A 4Q0OA 5JWMA 4ALGA 4O75A 4YY6A 4BJXA 4NS5A 3AQAA 3U5KA 3JVKA 4LR6A 5HLSA 3U5OA 4QR5A 5CUEA 4IOOA 4Z93A 5I1QA 5I86A 4TZ2A 5L99A 5DYAA 5A82A 5E73A 5EGUA 5CUCA 5EWDA 4X2IA 4QR4A 5F62A 5I83A 4YY4A 1WUGA 4NQMA 5DFDA 5DLZA 5LJ1A 3LQIA 5HQ7A 5FE0A 5E7DA 5HRWA 4QBMA 5EWWA 2DWWA 5E9IA 5HM0A 3U5PA 4A9HA 5EV9A 4LZSA 5DYUA 4J0SA 4QYLA 5DKCA 5IBNA 5FFVA 3JVJA 5H1VA 5IGMA 4GPJA 3UV2A 4A9JA 5L8UA 5CQ8A 4YYNA 2LSPB 5CQ6A 4UITA 4UYEA 4XY8A 2DVSA 3S92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C8GA 5EA1A 4HBXA 5ENGA 3U5JA 5AMEA 5KTWA 5FB1A 5G4SA 5A7CA 2YYNA 2RO1A 5E9KA 4YK0A 5CUBA 2RNWA 5F1LA 4QZSA 4UYDA 4LDFA 4NYVA 2YEMA 5EISA 5FH7A 4ZQLA 4HBYA 5J0DA 4PTBA 4AKNA 5C85A 4A9EA 1WUMA 3Q2FA 1EQFA 4PY6A 4O77A 3GG3A 2N9GA 4TU6A 4C66A 5FE1A 5BT5A 5CFWA 5D0CA 5FB0A 4QC1A 4AKHA 4UIUA 4QSTA 3MB3A 5F5ZA 5I40A 3LQJA 5FE8A 5KTUA 5II2A 3UV5A 5E0RA 4AI6A 4QSSA 4DONA 4NR9A 4Z6IA 5KTXA 5LKZA 2GRCA 3MXFA 3FKMX 5H1TA 4UIXA 5ETDA 4F3IA 4O76A 4NQNA 4NR6A 5TCMA 2YELA 4IORA 5ENFA 5CZGA 4BHWA 5C87A 5LUUA 5ETBA 5FH6A 2WP1A 5D25A 2MJVB 2OUOA 4HXKA 4XY9A 2F6NA 4BW1A 5IG6A 4QSXA 4HXMA 4QY4A 3ERRA 4TT2A 5I80A 2L84A 5DY7A 4CUUA 3Q2EA 3D7CA 4N4IA 5HEMA 3HMHA 1X0JA 5LVRA 4QSVA 3SVFA 3S91A 2KTBB 5ENJA 5CP5A 4WHWA 4YBMA 4CL9A 3O33A 2RS9B 3LJWA 3QZTA 4NR5A 3G0JA 5E9LA 5HENA 2YQDA 5ENBA 5EM3A 4O70A 2OO1A 4QSPA 5FE5A 1ZKRA 4O7FA 4PCIA 3AADA 4Y03A 4YAXA 5CQ7A 2DATA 5BT3A 4A9LA 4NR7A 3U5NA 5DKDA 4N4GA 5CS8A 5CY9A 5E3DA 4CUQA 4QYDA 5EQ1A 5F36A 4NRBA 4MR5A 4YADA 4TT6A 5CQAA 5A5SA 4NRAA 4TZ8A 4YBTA 2DKWA 5LJ2A 4A9IA 4CUPA 5D24A 1ZS5A 4YBSA 5HQ6A 5D3JA 5EI4A 4A9MA 4O78A 4XUAA 5C89A 4YATA 5DLXA 2D82A 4UIVA 3JVMA 4QUTA 4O7CA 5D3RA 2YEKA 5A5QA 4NXJA 5FDZA 5I7XA 4O71A 4YH4A 5L96A 5D3SA 5CUDA 5CQ5A 4YABA 4AKGA 3LXJA 3JVLA 2DVRA 2F6JA 5IGNA 2G4AA 5DFCA 4LC2A 5K29A 5DW2A 2YDWA 4A9NA 4O72A 4IR6A 5FFWA 5LKXA 4HXSA 5FE4A 3UVXA 5EU1A 2H60A 4CLBA 4NUCA 3HMFA 4PS5A 5CQ4A 4Z1SA 2FSAA 3UVYA 2EJNA 3UVDA 4E96A 3UW9A 5EPBA 5HELA 4N4FA 5F2PA 5EP7A 3O34A 3P1FA 4TQNA 4CFLA 1N72A 5F60A 2OSSA 5HJCA 4NR4A 1E6IA 5FG4A 4HXLA 4O7BA 5DFBA 4LZ2A 5CPEA 2RNYA 4MEQA 5I7YA 3VKGA 4O7AA 4IR5A 4YYJA 2L5EA 4TS8A 5CGPA 3DAIA 4PKLA 5C4QA 3RCWA 3K2JA 5D3LA 5E3GA 5FH8A 4UYFB 3MUKA 4QSWA 5I88A 4Z6HA 4CURA 3ONIA 4TYLA 5G4RA 4AKIA 5KHMA 4YYMA 4KV4A 2R0YA 4BW4A 3O37A 5TB6A 4YYHA 5A5OA 4UIWA 4FLPA 3HMEA 4QEUA 3MQMA 5LKUA 5EWCA 3SVGA 4HBWA 5I29A 4N4HA 5DYCA 2RI7A 4QR3A 2E7NA 4ZW1A 4YH3A 4HXPA 4IOQA 5CRZA 5D3TA 4QUUA 4WIVA 5IIDA 3P1CA 4QB3A 3DWYA 4MENA 5CU8A 3P1EA 4KCXA 1JSPB 3P1DA 5LKTA 3VKHA 4HXOA 4XYAA 3UV4A 3MULA 5FFYA 5F61A 5ENEA 4MEPA 4MEOA 5D3PA 1F68A 4C67A 5DW1A 5ACYA 5FG5A 4A9OA 5C7NA 4A9KA 5H1UA 5A5RA 4HBVA 4QNSA 4NYXA 5KO4A 4Z1QA 5CUGA 5ENHA 5FE6A 5F1HA 5FE3A 5D3HA 5EK9A 4HXRA 4CFKA 5CQ3A 4O74A 2NXBA 5E9YA 3MB4A 1JM4B 2RFJA 4N3WA 4QEVA 3UVWA 5FE9A 5DYXA 5CRMA 4UYGA 2R0VA 2YW5A 2WP2A 5E9VA 5EWHA 4UYHA 4UIYA 4TU4A 5FBXA 5A83A 5ENIA 3O36A 4UYFA 5COIA 4MR4A 5AMFA 5HRVA 3U5MA 5F25A 4J1PA 2DVQA 4QSQA 5ENCA 5EICA 5FE2A 5LJ0A 4NYWA 5CQTA 5BT4A 5CTLA 4KV1A 5EWVA 3IU5A 4YC9A 4Q0NA 3QZSA 2R10A 4TT4A 5L98A 5EPSA 4QSUA 4QC3A 4OUFA 3QZVA 5IGLA 3D1BA 3O35A 5F63A 4YYGA 4O7EA 2DVVA 5EVAA 5II1A 4A9FA 3LQHA 5HFRA 5DKHA 4WHUA 2E3KA 4RVRA 5CUAA 5I89A 4OGJA 5HCLA 4YYIA 5A85A 3TLPA 4ZC9A 4LRGA 4LYIA 5FE7A 4LYSA 4TTEA 2I7KA 4QSRA 4BW2A 4NUEA 5HRXA 4J3IA 4MR3A 5D7XA 5HQ5A 3NXBA 4CUSA 5A5PA 5AD3A 4OGIA 3U5LA 5AD2A 3IU6A 4NR8A 3G0LA 2I8NA 2D9EA 4XUBA 4CUTA 5LVQA 2R0SA 5D3NA 5KU3A 5DX4A 5E74A 3D1DA 5IGKA 2RNXA 5E9MA 4J0RA 4YYKA 4LYWA 4QEWA 5A81A 1PUOA 2L85A 4IR3A 5DBMA 5L97A 4ALHA 3ZYUA 4NRCA 5L8TA 5HFQA 5D26A 5EPRA 3SVHA 4UIZA 5A5NA 2E7OA 4NUDA 4PCEA 4YYDA 3I3JA 4LZRA 5JI8A 4HXNA 3P5OA 4IR4A 4BW3A 4MR6A 5FG6A 5F3AA 5H85A 4Q0OA 5JWMA 4ALGA 4O75A 4YY6A 4BJXA 4NS5A 3AQAA 3U5KA 3JVKA 4LR6A 5HLSA 3U5OA 4QR5A 5CUEA 4IOOA 4Z93A 5I1QA 5I86A 4TZ2A 5L99A 5DYAA 5A82A 5E73A 5EGUA 5CUCA 5EWDA 4X2IA 4QR4A 5F62A 5I83A 4YY4A 1WUGA 4NQMA 5DFDA 5DLZA 5LJ1A 3LQIA 5HQ7A 5FE0A 5E7DA 5HRWA 4QBMA 5EWWA 2DWWA 5E9IA 5HM0A 3U5PA 4A9HA 5EV9A 4LZSA 5DYUA 4J0SA 4QYLA 5DKCA 5IBNA 5FFVA 3JVJA 5H1VA 5IGMA 4GPJA 3UV2A 4A9JA 5L8UA 5CQ8A 4YYNA 2LSPB 5CQ6A 4UITA 4UYEA 4XY8A 2DVSA 3S92A
chains in the Genus database with same CATH topology
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