3NXBA

Crystal structure of the bromodomain of human cecr2
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
DDDFTAMYKVLDVVKAHKDSWPFLEPVDESYAPNYYQIIKAPMDISSMEKKLNGGLYCTKEEFVNDMKTMFRNCRKYNGESSEYTKMSDNLERCFHRAMMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cat eye syndrome critical region protein 2
total genus 38
structure length 101
sequence length 101
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3nxbA00
2DVQA 5DFDA 5DYXA 4TU6A 5FFYA 3Q2FA 4ZQLA 2R0YA 4NUCA 4YYDA 4A9NA 5AMEA 4CUQA 5EP7A 4QB3A 4LYSA 4O70A 5LVRA 4HXRA 4TT2A 5LJ2A 4NXJA 5I7XA 5E3DA 5FB0A 4O7EA 4BJXA 3K2JA 5EWVA 5FE4A 5LKXA 5BT3A 5I7YA 4N4GA 2YELA 5CGPA 4YYHA 5TCMA 4XUAA 4UYFA 5I88A 5CP5A 4QR3A 4PTBA 5G4RA 5FE8A 4PCIA 4WHWA 3DWYA 4A9IA 4CURA 2DVVA 5A85A 3MB3A 4Y03A 2I8NA 5F36A 5ENCA 4ALGA 4BW1A 4DONA 5FH6A 4HXPA 3DAIA 4C66A 5CUGA 4NR5A 5K29A 5FE3A 5BT5A 4J3IA 5FFWA 5JI8A 4YYNA 4OUFA 4QEWA 5D3JA 4XUBA 5CPEA 3O34A 4TZ2A 4UYGA 5A5RA 5I89A 3U5JA 4MR6A 5HRXA 4NR9A 2L5EA 4WHUA 5ENHA 4HBVA 4YY4A 5CQ5A 3P1CA 5D3LA 5L97A 4YH3A 4F3IA 2E7OA 5CUDA 4XY9A 4NUEA 5DKCA 5I83A 5FE2A 2D82A 4QNSA 5F5ZA 3LQHA 4LC2A 3LQIA 4QSUA 5FDZA 4CFLA 2RNYA 5DW2A 4NR4A 5L96A 4KV4A 4TZ8A 5BT4A 4LZRA 5J0DA 4UIYA 5IBNA 4HBYA 4HXMA 5FG4A 5A5PA 4LZSA 5EM3A 4GPJA 5HRWA 5A7CA 5H85A 5A83A 5HFQA 4TU4A 4QSTA 4A9EA 4YBSA 4E96A 3O37A 3SVFA 5DKDA 5F1HA 3HMEA 4YH4A 4NUDA 5AMFA 3MQMA 2WP2A 4UIUA 5ENBA 3QZSA 4YAXA 4QSRA 2F6NA 5DKHA 1JM4B 5CQ6A 5CY9A 3MB4A 5IGLA 2H60A 4IR6A 5I29A 5F61A 4LZ2A 5CQ4A 4UYDA 4A9LA 5E74A 5FE7A 5IG6A 2DATA 3ONIA 4TS8A 5CUEA 5EPBA 4BW4A 4UIWA 3RCWA 2OUOA 4QBMA 5F1LA 5DYUA 4LR6A 4A9FA 4LYIA 5E9KA 5ETDA 4ZW1A 4HXSA 5FG6A 5LVQA 2FSAA 3FKMX 2DKWA 4QC1A 3D7CA 3ZYUA 4J0RA 4MEQA 1EQFA 3LJWA 2F6JA 3O35A 5DW1A 5HLSA 3U5NA 4QUTA 1F68A 4YY6A 2R10A 4YYIA 5CQ3A 4RVRA 4HXLA 4TYLA 3S92A 5KTUA 2E7NA 3AQAA 5HEMA 5EWHA 2MJVB 4YABA 5FE6A 4NS5A 4QSPA 5LJ1A 4FLPA 3UVYA 5C4QA 4UIXA 4QYDA 4LYWA 3O36A 2DVSA 4NRCA 5E9YA 4CL9A 4YYJA 5EQ1A 4UITA 5DLZA 5I86A 4MEPA 4QYLA 5HCLA 5IIDA 3G0LA 5D7XA 5E9VA 5EVAA 2RNWA 5E0RA 4IOQA 5CFWA 2DWWA 4YYKA 4MR3A 3UV4A 4UYFB 3JVJA 1N72A 3P1FA 4O74A 4PCEA 4HXOA 5E9MA 5F62A 2L85A 5L8TA 2YQDA 4NRBA 4IR3A 4WIVA 4XYAA 5CTLA 3SVGA 3UV2A 4A9JA 5HQ7A 2YEMA 3GG3A 4UYEA 2R0SA 4UYHA 5DLXA 5IGMA 4UIVA 4OGIA 5ACYA 5CQ8A 2RI7A 5I1QA 4NR8A 4IR5A 4Z93A 4QR5A 4NR7A 4CFKA 4QR4A 4ZC9A 5EPSA 5EPRA 4O7BA 3JVMA 5CUCA 5D0CA 5D3NA 5H1VA 4PY6A 5IGKA 3U5LA 2RO1A 5F2PA 3O33A 3UVWA 3NXBA 4X2IA 5FH7A 5FE0A 5ENIA 3TLPA 3HMFA 3U5OA 2I7KA 5D26A 5A81A 3AADA 2WP1A 5EWCA 5G4SA 3S91A 5D3HA 4BW3A 4YC9A 4QSVA 4QEUA 5CUAA 2YEKA 5L99A 4BW2A 5LJ0A 4TT6A 5ENGA 3UVDA 5A5NA 4A9HA 5D25A 4Z6IA 4O76A 1WUGA 5D3TA 5CUBA 5EWDA 5CS8A 4Q0OA 3SVHA 4HXNA 2YW5A 2R0VA 3U5MA 5CRZA 5LUUA 5CQTA 4LRGA 5E73A 5C7NA 4QUUA 1WUMA 5JWMA 5KO4A 4NRAA 4TTEA 5D3SA 5CRMA 5COIA 2YYNA 4MEOA 4MR4A 3IU6A 3JVKA 5FH8A 4Z1SA 5HM0A 5HJCA 3P5OA 5F25A 5L98A 4O7FA 4O72A 5FE5A 5LKTA 5FG5A 4AKNA 5DYCA 5EU1A 3QZVA 2OSSA 3UVXA 3P1DA 2RS9B 4IR4A 4QSSA 5II2A 3LXJA 5A5SA 5A5QA 4PS5A 4O7AA 4CUSA 5ENFA 5E9LA 5TB6A 4CUPA 4YBTA 4Z1QA 4KCXA 5KHMA 5C8GA 5KTWA 5DBMA 4YBMA 5HFRA 4N4HA 4J0SA 4O75A 4CLBA 2KTBB 5ETBA 4O7CA 2GRCA 1X0JA 5ENEA 3G0JA 5CQAA 1E6IA 5E7DA 4HBWA 4BHWA 4CUTA 4KV1A 5FE1A 4YYMA 5AD2A 4QSXA 4Z6HA 3MUKA 5HRVA 5II1A 3U5KA 5EK9A 2NXBA 3JVLA 3LQJA 5DFBA 1ZS5A 3UW9A 2N9GA 4N3WA 5HQ5A 5EICA 4QY4A 5I80A 3HMHA 1JSPB 5H1TA 5HENA 5DY7A 5FB1A 5F3AA 5FFVA 5HQ6A 4OGJA 5A82A 2D9EA 4QEVA 5E9IA 2OO1A 4N4IA 2RFJA 4TT4A 4A9OA 5LKUA 4NYXA 4QZSA 4PKLA 5FBXA 3UV5A 3U5PA 3IU5A 5D24A 4QSQA 2LSPB 5L8UA 3QZTA 5FE9A 5EA1A 2YDWA 4TQNA 3Q2EA 3MULA 4QC3A 4NYWA 2L84A 4IORA 5EV9A 5EISA 4N4FA 4MR5A 5DYAA 4CUUA 5CU8A 5CQ7A 3MXFA 5ENJA 5EGUA 5D3RA 4UIZA 4O71A 5EI4A 5DX4A 4ALHA 5I40A 4C67A 2DVRA 2RNXA 5F63A 2G4AA 4IOOA 4HBXA 4XY8A 5CZGA 4NQNA 4J1PA 4A9KA 5C87A 4O78A 5A5OA 4O77A 4QSWA 5F60A 4YYGA 5D3PA 4NR6A 5AD3A 5KTXA 4NYVA 5H1UA 4HXKA 4A9MA 5C85A 4Q0NA 5DFCA 5IGNA 4MENA 3I3JA 3P1EA 5EWWA 4YK0A 5KU3A 4YATA 4YADA 4NQMA 5E3GA 4LDFA 5C89A 5LKZA 5HELA 2E3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DVQA 5DFDA 5DYXA 4TU6A 5FFYA 3Q2FA 4ZQLA 2R0YA 4NUCA 4YYDA 4A9NA 5AMEA 4CUQA 5EP7A 4QB3A 4LYSA 4O70A 5LVRA 4HXRA 4TT2A 5LJ2A 4NXJA 5I7XA 5E3DA 5FB0A 4O7EA 4BJXA 3K2JA 5EWVA 5FE4A 5LKXA 5BT3A 5I7YA 4N4GA 2YELA 5CGPA 4YYHA 5TCMA 4XUAA 4UYFA 5I88A 5CP5A 4QR3A 4PTBA 5G4RA 5FE8A 4PCIA 4WHWA 3DWYA 4A9IA 4CURA 2DVVA 5A85A 3MB3A 4Y03A 2I8NA 5F36A 5ENCA 4ALGA 4BW1A 4DONA 5FH6A 4HXPA 3DAIA 4C66A 5CUGA 4NR5A 5K29A 5FE3A 5BT5A 4J3IA 5FFWA 5JI8A 4YYNA 4OUFA 4QEWA 5D3JA 4XUBA 5CPEA 3O34A 4TZ2A 4UYGA 5A5RA 5I89A 3U5JA 4MR6A 5HRXA 4NR9A 2L5EA 4WHUA 5ENHA 4HBVA 4YY4A 5CQ5A 3P1CA 5D3LA 5L97A 4YH3A 4F3IA 2E7OA 5CUDA 4XY9A 4NUEA 5DKCA 5I83A 5FE2A 2D82A 4AKGA 4QNSA 5F5ZA 3LQHA 4LC2A 3LQIA 4QSUA 5FDZA 4CFLA 2RNYA 5DW2A 4NR4A 5L96A 4KV4A 4TZ8A 5BT4A 4LZRA 5J0DA 4UIYA 5IBNA 4HBYA 4AKIA 4HXMA 5FG4A 5A5PA 4LZSA 5EM3A 4GPJA 5HRWA 5A7CA 5H85A 5A83A 5HFQA 4TU4A 4QSTA 4A9EA 4YBSA 4E96A 3O37A 3SVFA 5DKDA 5F1HA 3HMEA 4YH4A 4NUDA 5AMFA 3MQMA 2WP2A 4UIUA 5ENBA 3QZSA 4YAXA 4QSRA 2F6NA 5DKHA 1JM4B 5CQ6A 5CY9A 3MB4A 5IGLA 2H60A 4IR6A 5I29A 3VKHA 5F61A 4LZ2A 5CQ4A 4UYDA 4A9LA 5E74A 5FE7A 5IG6A 2DATA 3ONIA 4TS8A 5CUEA 5EPBA 4BW4A 4UIWA 3RCWA 2OUOA 4QBMA 5F1LA 5DYUA 4LR6A 4A9FA 4LYIA 5E9KA 5ETDA 4ZW1A 4HXSA 5FG6A 5LVQA 2FSAA 3FKMX 2DKWA 4QC1A 2EJNA 3D7CA 3ZYUA 4J0RA 4MEQA 1EQFA 3LJWA 2F6JA 3O35A 5DW1A 5HLSA 3U5NA 4QUTA 1F68A 4YY6A 2R10A 4YYIA 5CQ3A 4RVRA 4HXLA 4TYLA 3S92A 5KTUA 2E7NA 3AQAA 5HEMA 5EWHA 2MJVB 4YABA 5FE6A 4NS5A 4QSPA 5LJ1A 4FLPA 3UVYA 5C4QA 4UIXA 4QYDA 4LYWA 3O36A 2DVSA 4NRCA 3D1BA 5E9YA 4AKHA 4CL9A 4YYJA 5EQ1A 4UITA 5DLZA 5I86A 4MEPA 4QYLA 5HCLA 5IIDA 3G0LA 5D7XA 5E9VA 5EVAA 2RNWA 5E0RA 4IOQA 5CFWA 2DWWA 4YYKA 4MR3A 3UV4A 4UYFB 3JVJA 1N72A 3P1FA 4O74A 4PCEA 4HXOA 5E9MA 5F62A 2L85A 5L8TA 2YQDA 4NRBA 4IR3A 4WIVA 4XYAA 5CTLA 3SVGA 3UV2A 4A9JA 5HQ7A 2YEMA 3GG3A 4UYEA 2R0SA 4UYHA 5DLXA 5IGMA 4UIVA 4OGIA 5ACYA 5CQ8A 2RI7A 5I1QA 4NR8A 4IR5A 4Z93A 4QR5A 4NR7A 4CFKA 4QR4A 4ZC9A 5EPSA 5EPRA 4O7BA 3JVMA 5CUCA 5D0CA 5D3NA 5H1VA 4PY6A 5IGKA 3U5LA 2RO1A 5F2PA 3O33A 3UVWA 3NXBA 4X2IA 5FH7A 5FE0A 5ENIA 3TLPA 3HMFA 3U5OA 2I7KA 5D26A 5A81A 3AADA 2WP1A 5EWCA 5G4SA 3S91A 5D3HA 4BW3A 4YC9A 4QSVA 4QEUA 5CUAA 2YEKA 5L99A 4BW2A 5LJ0A 4TT6A 5ENGA 3UVDA 5A5NA 4A9HA 5D25A 4Z6IA 4O76A 1WUGA 5D3TA 5CUBA 5EWDA 5CS8A 4Q0OA 3SVHA 4HXNA 2YW5A 2R0VA 3U5MA 5CRZA 5LUUA 1PUOA 5CQTA 4LRGA 5E73A 5C7NA 4QUUA 1WUMA 5JWMA 5KO4A 4NRAA 4TTEA 5D3SA 5CRMA 5COIA 2YYNA 4MEOA 4MR4A 3IU6A 3JVKA 5FH8A 4Z1SA 5HM0A 5HJCA 3P5OA 5F25A 5L98A 4O7FA 4O72A 5FE5A 5LKTA 5FG5A 4AKNA 5DYCA 5EU1A 3QZVA 2OSSA 3UVXA 3P1DA 2RS9B 4IR4A 4QSSA 5II2A 3LXJA 5A5SA 5A5QA 4PS5A 4O7AA 4CUSA 5ENFA 5E9LA 5TB6A 4CUPA 4YBTA 4Z1QA 4KCXA 5KHMA 5C8GA 5KTWA 5DBMA 4YBMA 5HFRA 4N4HA 4J0SA 4O75A 4CLBA 2KTBB 5ETBA 4O7CA 2GRCA 1X0JA 1ZKRA 5ENEA 3G0JA 5CQAA 1E6IA 5E7DA 4HBWA 4BHWA 4CUTA 4KV1A 5FE1A 4YYMA 5AD2A 4QSXA 4Z6HA 3MUKA 5HRVA 5II1A 3U5KA 5EK9A 2NXBA 3JVLA 3LQJA 5DFBA 1ZS5A 3UW9A 2N9GA 4N3WA 5HQ5A 5EICA 4QY4A 5I80A 3HMHA 1JSPB 5H1TA 5HENA 3ERRA 5DY7A 5FB1A 5F3AA 5FFVA 5HQ6A 4OGJA 5A82A 2D9EA 4QEVA 5E9IA 2OO1A 4N4IA 2RFJA 4TT4A 4A9OA 5LKUA 4NYXA 4QZSA 4PKLA 4AI6A 5FBXA 3UV5A 3U5PA 3IU5A 5D24A 4QSQA 2LSPB 5L8UA 3QZTA 5FE9A 5EA1A 2YDWA 4TQNA 3Q2EA 3MULA 4QC3A 3VKGA 4NYWA 2L84A 4IORA 5EV9A 5EISA 4N4FA 4MR5A 5DYAA 4CUUA 5CU8A 5CQ7A 3MXFA 5ENJA 5EGUA 5D3RA 4UIZA 4O71A 5EI4A 5DX4A 4ALHA 5I40A 4C67A 2DVRA 2RNXA 5F63A 2G4AA 4IOOA 4HBXA 4XY8A 5CZGA 4NQNA 4J1PA 4A9KA 5C87A 4O78A 5A5OA 4O77A 4QSWA 5F60A 4YYGA 5D3PA 4NR6A 5AD3A 5KTXA 4NYVA 5H1UA 4HXKA 4A9MA 3D1DA 5C85A 4Q0NA 5DFCA 5IGNA 4MENA 3I3JA 3P1EA 5EWWA 4YK0A 5KU3A 4YATA 4YADA 4NQMA 5E3GA 4LDFA 5C89A 5LKZA 5HELA 2E3KA
chains in the Genus database with same CATH topology
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