3S91A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd3 in complex with the inhibitor jq1
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
TNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD3 in complex with the inhibitor JQ1
rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3s91A01
4LZRA 4YH3A 2R0YA 4TZ8A 4MEQA 4Z1SA 5I1QA 4QSTA 4XYAA 3Q2FA 1EQFA 3TLPA 4TZ2A 4TS8A 5EPRA 4CL9A 3U5MA 5I83A 4O7CA 3SVGA 5D3PA 2L5EA 2H60A 3U5JA 4J1PA 5AMFA 2DVVA 4XUBA 5EWDA 4UYFB 5E3GA 5FB0A 2KTBB 4HXSA 5D24A 4UIUA 5CZGA 5DW2A 5HENA 3MUKA 4UITA 4Y03A 5EA1A 4NQMA 5HJCA 5FFWA 4CUQA 4Q0OA 4DONA 4UIZA 4A9OA 2DVRA 5F1HA 4QEWA 5FE7A 2WP2A 1E6IA 5G4RA 5LKZA 4RVRA 5IG6A 5CUBA 4CUSA 5FDZA 3FKMX 5EK9A 4J0RA 5FE5A 4O7EA 5DKDA 2YQDA 5CTLA 4BW4A 5CQ6A 3IU6A 4QSXA 5CUAA 2OUOA 5LKXA 5ENJA 4E96A 3HMFA 4YYMA 3O34A 4MR4A 5AMEA 4O7AA 5D3RA 2L85A 4O76A 5E7DA 4BW3A 5A5NA 5LVQA 4WHUA 5IGKA 5FBXA 5DFBA 3UV2A 5CQ5A 5CU8A 4YY4A 5CQTA 5FG4A 4NR7A 5CPEA 4MR6A 5DBMA 5FE1A 4UYDA 4YYNA 4O77A 2YDWA 4OGJA 4TT4A 5HM0A 4IOOA 5KU3A 4J3IA 4N3WA 4HBWA 5D7XA 4YAXA 3DAIA 5DFDA 1F68A 4NR8A 5H1TA 3O33A 5CP5A 5E9MA 4O72A 4J0SA 4HXKA 4YBTA 5COIA 5G4SA 5C7NA 5EISA 3QZSA 1WUMA 3G0JA 3LQIA 5ENHA 5LVRA 1JSPB 3JVJA 4HXRA 2DKWA 5D3JA 3UVWA 4QYDA 5I86A 4TTEA 4LYIA 5CUGA 5EWHA 5J0DA 4QEVA 4WIVA 5H1VA 4HXNA 4TT2A 5II1A 2YEMA 3NXBA 5D3TA 5KHMA 4CFLA 5FG6A 4IR4A 4QEUA 5DFCA 3MB3A 2R0VA 4XY9A 3QZTA 3U5OA 2G4AA 4QSWA 4A9LA 5EWCA 4PY6A 5FE2A 4IR6A 3UVXA 4HBXA 4BW2A 4NUCA 3AQAA 4ALGA 2RNXA 5I7XA 4F3IA 4N4IA 4PTBA 4PS5A 2E3KA 5CY9A 5II2A 5BT5A 5H1UA 5KO4A 4TYLA 3P5OA 2YW5A 4TT6A 2E7NA 4NRBA 5E73A 4CUPA 2RI7A 5FG5A 5H85A 4A9IA 4O70A 5HQ5A 5CQ4A 4HXPA 4ZC9A 2DVSA 4N4GA 4TQNA 5DY7A 4YC9A 5A5RA 5I88A 5F3AA 5LJ0A 4CURA 4HXMA 5AD3A 5EP7A 4YBSA 4A9EA 4Z1QA 5CS8A 5ENIA 5HFRA 5DX4A 4QC3A 5TCMA 2RNWA 4NRAA 2WP1A 4LYWA 4QR3A 5LUUA 5FE4A 4CFKA 4PCEA 5F61A 5EWWA 5C8GA 4UYGA 5A5SA 5EV9A 4YYHA 5C87A 5C4QA 3K2JA 5DLZA 3O37A 5F63A 4NXJA 4CUUA 5JI8A 4IR5A 5FFVA 5E9VA 3JVKA 5A81A 4YYKA 2RNYA 3DWYA 4O74A 5I7YA 5I40A 4X2IA 3MXFA 5E0RA 5E9LA 4MR3A 5L96A 4QBMA 4Z93A 4TU4A 5KTUA 5KTXA 4PKLA 5KTWA 5ENFA 2I8NA 4O78A 4QNSA 4O7FA 4LDFA 4YH4A 4BHWA 5EPBA 4LC2A 5D25A 4AKNA 4YYGA 4NUDA 3P1CA 3U5NA 4QSUA 4XUAA 5HRWA 5A7CA 4ZW1A 4A9FA 5F36A 3UV5A 5LJ2A 5CUDA 3MB4A 4NR5A 5EICA 5DYCA 5HFQA 4Z6IA 4LRGA 5F25A 3U5LA 5A5QA 4QSPA 5FE3A 2D82A 5D3HA 4TU6A 5EU1A 5EI4A 3QZVA 4N4HA 3LQHA 4HXLA 5EVAA 3Q2EA 5I89A 2OSSA 5DYAA 5TB6A 3LXJA 4QSQA 4LYSA 4A9JA 2D9EA 4PCIA 4FLPA 3D7CA 3UV4A 4WHWA 4HXOA 4LZ2A 4A9KA 2E7OA 3U5PA 4N4FA 5A5PA 4BW1A 4NYVA 4IR3A 4UIXA 4NR9A 4MR5A 4O75A 5IIDA 5EWVA 4UIYA 5L8UA 3UW9A 5CRMA 2RFJA 5ENCA 2RO1A 5L98A 5E74A 5CQ3A 5DLXA 3SVFA 2FSAA 4A9NA 5EPSA 4A9MA 2R0SA 3HMEA 4QSRA 5EQ1A 3P1FA 3RCWA 1ZS5A 3S91A 5L8TA 4YYDA 1X0JA 2DVQA 2YELA 4IORA 5CQ7A 3S92A 4UIVA 5F1LA 4YADA 5CUCA 5JWMA 5HRXA 4Z6HA 4YK0A 4YYIA 4GPJA 5LKTA 5E9IA 3ZYUA 5EGUA 4YYJA 5DKCA 2I7KA 2DWWA 1WUGA 4C67A 5FE0A 5FH8A 4YY6A 5ETBA 2LSPB 3UVDA 1JM4B 4QUTA 5IBNA 4A9HA 4OGIA 5EM3A 2YYNA 4NRCA 5IGLA 3U5KA 3UVYA 4QYLA 5L99A 4O7BA 5F5ZA 3LQJA 5A83A 2GRCA 5IGMA 5E3DA 4HBVA 1N72A 4NS5A 5D0CA 5FE6A 5FH6A 5FE9A 4NR4A 5HQ7A 4YATA 5D3SA 3JVLA 2N9GA 4YBMA 4QZSA 2L84A 5K29A 3O35A 5CRZA 5DYXA 5F2PA 5DKHA 3P1DA 4QB3A 4LR6A 5CFWA 4ZQLA 5E9KA 4KCXA 5C85A 5FB1A 4ALHA 3P1EA 3G0LA 4NR6A 5C89A 2NXBA 2DATA 4MEPA 3I3JA 5D3LA 4NYXA 5D3NA 3SVHA 3MQMA 4Q0NA 5BT4A 3JVMA 4NYWA 5HRVA 4QUUA 4QSSA 4C66A 5I80A 4HBYA 5CUEA 5HCLA 3MULA 4KV4A 5ENBA 4MENA 4UYFA 4QR4A 4UYHA 5DW1A 5HLSA 4YABA 3HMHA 3LJWA 2YEKA 2MJVB 5DYUA 4QSVA 4BJXA 4QC1A 3ONIA 5HELA 4UYEA 5CQ8A 5E9YA 3IU5A 5IGNA 2R10A 4NUEA 4CLBA 5F60A 5CGPA 5A82A 4XY8A 4MEOA 4CUTA 4O71A 5ENGA 3AADA 5A5OA 4QR5A 4IOQA 5D26A 5ACYA 4NQNA 5I29A 4OUFA 2F6JA 3O36A 5CQAA 2OO1A 5HQ6A 5LJ1A 4LZSA 5FE8A 5FFYA 3GG3A 5ETDA 5F62A 5FH7A 5A85A 5LKUA 4KV1A 5HEMA 4QY4A 2F6NA 4UIWA 5ENEA 5AD2A 5L97A 5BT3A 2RS9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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