4BJXA

N-terminal bromodomain of human brd4 with gsk1324726a (i-bet726)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Bet Inhibition Silences Expression of Mycn and Bcl2 and Induces Cytotoxicity in Neuroblastoma Tumor Models.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Dna binding protein
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4bjxA01
2F6JA 4IR3A 4UYFA 4NRCA 5IGMA 4A9KA 3JVJA 4QUTA 3MUKA 4N4HA 4A9NA 4YH4A 4YBMA 4F3IA 3QZTA 3Q2FA 4XYAA 5ENJA 2RO1A 4A9JA 4YY4A 4YYIA 4OUFA 5E74A 5FG6A 5D3HA 5A5QA 5I40A 3HMEA 5HELA 5IGNA 4QYLA 4NQMA 4XUAA 4BW2A 5FFWA 5EWWA 3DAIA 4ALHA 5J0DA 5FE1A 4MR5A 4N4GA 5DFBA 5I89A 5AD3A 4TT2A 4CUPA 5DBMA 5D24A 5IBNA 3G0LA 5CQ4A 4CUTA 5AMEA 5FH7A 4C67A 4NUDA 4LZRA 5DY7A 5CUDA 5ENCA 5HLSA 5A5SA 4MENA 4O70A 4UIXA 3JVLA 5ACYA 5LJ2A 4PY6A 3JVMA 5E9YA 2E7OA 4TTEA 5CRZA 2OSSA 5E9IA 5H1VA 5EV9A 2DVSA 5IGLA 3IU5A 3SVHA 5IGKA 5F1LA 2DATA 3D7CA 4NR8A 4DONA 5C89A 5I88A 5EA1A 4ZW1A 3P1FA 2YW5A 4Q0NA 2RNXA 5LKZA 5EGUA 4CL9A 2D82A 5FE0A 2GRCA 5FH8A 3DWYA 4QEUA 4YYHA 4TZ2A 2RI7A 2MJVB 4IR6A 4O75A 2I8NA 5HM0A 4RVRA 5E9MA 4E96A 5CQTA 5II2A 5FE3A 1ZS5A 5FE7A 4O7CA 3HMHA 4O74A 4PS5A 5FG4A 4TZ8A 3UVWA 5CGPA 5COIA 4NR6A 5F62A 5KHMA 3LQIA 5HQ5A 3P5OA 4TYLA 5FG5A 3ZYUA 5FE6A 2DVVA 4Z93A 3QZSA 3UV5A 5L96A 4MR4A 5ENFA 4CLBA 5L98A 3K2JA 5DKCA 4J3IA 4Z1QA 4GPJA 4UYDA 3U5NA 5E7DA 2R0YA 5DFDA 2YDWA 5FH6A 4YYMA 2YQDA 4MR6A 5EPSA 5HFRA 4NUEA 4NRAA 5CQ5A 5KTWA 4O7FA 5IG6A 5LKUA 3AQAA 5D3SA 5ENBA 5FE2A 5D7XA 4A9IA 4QC3A 3P1DA 5KTXA 4BHWA 5F1HA 3SVFA 5HJCA 4NQNA 4HXKA 2L5EA 4XY9A 5D3NA 4IOOA 5HQ7A 4YYDA 4WHUA 4TU6A 5C87A 4NXJA 5D3LA 4Z1SA 5FE9A 1JSPB 4HXPA 3LQHA 4CUUA 4A9MA 4J0SA 5A5PA 4YH3A 5I1QA 4O7BA 2DWWA 4Q0OA 5HRXA 5CQ3A 4WHWA 5ENEA 5F63A 3UV4A 4J0RA 3O37A 5HEMA 3O33A 5F25A 2DVRA 5CQ7A 2OUOA 4LZ2A 4QSVA 3UW9A 3LJWA 4OGJA 4QSXA 4PCIA 5ENIA 3UVDA 5DLZA 5JI8A 5C4QA 5DLXA 3O36A 4YK0A 4QR5A 3U5KA 5F60A 5F36A 5ETBA 5D0CA 2WP1A 5EPBA 4TT6A 5KTUA 4MR3A 4NR9A 5DFCA 5E9LA 4QEWA 2L84A 1EQFA 5LVQA 4O71A 4QC1A 4CURA 4YABA 5E73A 2E7NA 4NR7A 2I7KA 5EQ1A 4HXNA 4LDFA 5CUEA 3MB3A 4A9OA 5F2PA 3ONIA 4QSWA 2R0SA 5HENA 4QSSA 4YBSA 5AD2A 4BW1A 3O34A 5BT3A 4QEVA 4TT4A 4YATA 3NXBA 5CQAA 3MQMA 2D9EA 2R0VA 4O7AA 4WIVA 4UIUA 4HXLA 4HXRA 4YC9A 5A81A 4UIZA 4QBMA 5FBXA 4HXMA 4MEQA 2H60A 5HRVA 4QB3A 4TS8A 4PTBA 1JM4B 4CUQA 4HXSA 4YYNA 5KU3A 5HRWA 3I3JA 4LYWA 3SVGA 4QY4A 4YYKA 3RCWA 2NXBA 5F3AA 4O7EA 4N4FA 5EWDA 5DW2A 4Z6IA 4A9HA 5CTLA 4KV1A 4LRGA 5H85A 2RNYA 4UIVA 5LVRA 4BW3A 4A9EA 4FLPA 4O76A 5FDZA 5I83A 4LYSA 5E3GA 5D3JA 5EWVA 4UYFB 5LUUA 5A83A 4QR4A 5A5RA 4QSUA 4NR5A 3LQJA 4QUUA 5EI4A 4YBTA 4IR4A 5D25A 5EM3A 5LJ0A 5FFVA 5C7NA 4UIYA 4HBVA 5I7XA 5E9VA 5DYAA 5EWCA 4J1PA 3MB4A 2KTBB 5FB0A 1WUMA 5CP5A 4QR3A 1F68A 4BW4A 4LC2A 4TU4A 2WP2A 5A85A 4MEPA 5I86A 3U5JA 5I7YA 2YEKA 3GG3A 5HQ6A 5IIDA 3MXFA 5DYCA 5LKXA 4IORA 5D3RA 5EK9A 4ZQLA 5H1UA 5ETDA 5DX4A 3S91A 5G4SA 5LJ1A 4IOQA 5A7CA 4TQNA 5F61A 5EU1A 4PKLA 5A5NA 3P1EA 3TLPA 2YELA 2L85A 4Z6HA 4N3WA 5CUBA 5G4RA 3UVXA 5L8TA 2FSAA 5HFQA 2YYNA 1X0JA 5I29A 5K29A 3Q2EA 5DKHA 4KCXA 4O78A 4OGIA 4HBWA 3JVKA 4YYGA 5BT4A 4UYGA 5CRMA 4UITA 5CY9A 3IU6A 4NYXA 4QYDA 2E3KA 5L8UA 4ALGA 4BJXA 4QNSA 3FKMX 4AKNA 3HMFA 4UIWA 4ZC9A 4NS5A 2G4AA 5EPRA 4CFKA 3U5LA 5L99A 4XUBA 4KV4A 4O72A 5D3PA 5DKDA 5LKTA 5CFWA 4PCEA 3U5PA 4HXOA 4CUSA 2DKWA 2F6NA 5CS8A 3P1CA 4HBYA 2OO1A 5KO4A 2LSPB 2RNWA 5TB6A 1WUGA 4UYEA 4X2IA 3MULA 5FE4A 5TCMA 5C85A 3O35A 5E3DA 5BT5A 3S92A 4QSRA 4C66A 5CU8A 3G0JA 1N72A 2DVQA 4QSTA 5FB1A 4XY8A 5E0RA 4NRBA 4YY6A 3LXJA 4NYWA 4O77A 4YAXA 5CUCA 2R10A 4IR5A 4CFLA 5A82A 4A9FA 4QSPA 5EISA 5ENHA 5EVAA 2N9GA 5C8GA 5FE8A 4HBXA 5ENGA 3UV2A 2YEMA 5DYUA 4Y03A 5D26A 5EWHA 4A9LA 5F5ZA 1E6IA 5EICA 3AADA 5CUGA 5CPEA 4NYVA 5DYXA 5CQ8A 5FE5A 5HCLA 4MEOA 4QSQA 5E9KA 5I80A 5CUAA 5DW1A 2RFJA 5CQ6A 4NUCA 3UVYA 5JWMA 4NR4A 3U5MA 5H1TA 4N4IA 4YYJA 4QZSA 3U5OA 5D3TA 5II1A 5A5OA 5EP7A 4LYIA 4LZSA 5L97A 4YADA 3QZVA 2RS9B 5FFYA 4UYHA 4LR6A 5CZGA 5AMFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F6JA 4IR3A 4UYFA 4NRCA 5IGMA 4A9KA 3D1DA 3JVJA 3MUKA 4N4HA 4QUTA 4A9NA 4YH4A 4YBMA 4F3IA 3QZTA 3Q2FA 4XYAA 5ENJA 2RO1A 4A9JA 4YY4A 4YYIA 4OUFA 5E74A 5FG6A 5D3HA 5A5QA 5I40A 3HMEA 5HELA 5IGNA 4QYLA 4NQMA 4XUAA 4BW2A 5FFWA 5EWWA 3DAIA 4ALHA 5J0DA 5FE1A 4MR5A 4N4GA 5DFBA 5I89A 5AD3A 4TT2A 4CUPA 5DBMA 5D24A 5IBNA 3G0LA 5CQ4A 4CUTA 5AMEA 5FH7A 4C67A 4NUDA 4LZRA 5DY7A 5CUDA 5ENCA 5HLSA 5A5SA 4MENA 4O70A 4UIXA 3JVLA 5ACYA 5LJ2A 4PY6A 3JVMA 5E9YA 2E7OA 4TTEA 5CRZA 2OSSA 5E9IA 5H1VA 5EV9A 1ZKRA 2DVSA 5IGLA 3IU5A 3SVHA 5IGKA 5F1LA 2DATA 3D7CA 4NR8A 4DONA 5C89A 5I88A 5EA1A 4ZW1A 3P1FA 2YW5A 4Q0NA 2RNXA 5LKZA 5EGUA 4CL9A 2D82A 5FE0A 2GRCA 5FH8A 3DWYA 4QEUA 4YYHA 4TZ2A 2RI7A 2MJVB 4IR6A 4O75A 2I8NA 5HM0A 4RVRA 5E9MA 4E96A 5CQTA 5II2A 5FE3A 1ZS5A 5FE7A 4O7CA 3HMHA 4O74A 4PS5A 5FG4A 4TZ8A 3UVWA 5CGPA 5COIA 4NR6A 5F62A 5KHMA 3LQIA 5HQ5A 3P5OA 4TYLA 5FG5A 3ZYUA 5FE6A 2DVVA 4Z93A 3QZSA 3UV5A 5L96A 4MR4A 5ENFA 4CLBA 5L98A 3K2JA 5DKCA 4J3IA 4Z1QA 4GPJA 4UYDA 3U5NA 5E7DA 2R0YA 5DFDA 2YDWA 5FH6A 4YYMA 2YQDA 4MR6A 5EPSA 5HFRA 4NUEA 4NRAA 5CQ5A 5KTWA 4O7FA 5IG6A 5LKUA 3AQAA 5D3SA 5ENBA 5FE2A 5D7XA 4A9IA 4QC3A 3P1DA 5KTXA 4BHWA 5F1HA 3SVFA 5HJCA 4NQNA 4HXKA 2L5EA 4AI6A 4XY9A 5D3NA 4IOOA 5HQ7A 4YYDA 4WHUA 4TU6A 5C87A 4NXJA 5D3LA 4Z1SA 5FE9A 1JSPB 4HXPA 3LQHA 4CUUA 3ERRA 4A9MA 4J0SA 5A5PA 4YH3A 5I1QA 4O7BA 2DWWA 4Q0OA 5HRXA 5CQ3A 4WHWA 5ENEA 5F63A 3UV4A 4J0RA 3O37A 5HEMA 3O33A 5F25A 2DVRA 5CQ7A 2OUOA 4LZ2A 4QSVA 3UW9A 3LJWA 4OGJA 4QSXA 4PCIA 5ENIA 3UVDA 5DLZA 5JI8A 5C4QA 5DLXA 3O36A 4YK0A 4QR5A 3U5KA 5F60A 5F36A 5ETBA 5D0CA 2WP1A 5EPBA 4TT6A 5KTUA 4MR3A 4NR9A 5DFCA 5E9LA 4QEWA 4AKIA 2L84A 1EQFA 5LVQA 4O71A 4QC1A 4CURA 4YABA 5E73A 2E7NA 4NR7A 2I7KA 5EQ1A 4HXNA 4LDFA 5CUEA 3MB3A 4A9OA 5F2PA 3ONIA 4QSWA 2R0SA 5HENA 4QSSA 4YBSA 5AD2A 4BW1A 3O34A 5BT3A 4QEVA 4TT4A 4YATA 3NXBA 5CQAA 3MQMA 4AKHA 2D9EA 2R0VA 4O7AA 4WIVA 4UIUA 4HXLA 4HXRA 4YC9A 5A81A 4UIZA 4QBMA 5FBXA 4HXMA 4MEQA 2H60A 5HRVA 4QB3A 4TS8A 4PTBA 1JM4B 4CUQA 4HXSA 4YYNA 5KU3A 5HRWA 3I3JA 4LYWA 3SVGA 4QY4A 4YYKA 3RCWA 2NXBA 5F3AA 4O7EA 4N4FA 5EWDA 5DW2A 4Z6IA 3D1BA 4A9HA 5CTLA 4KV1A 4LRGA 5H85A 2RNYA 4UIVA 5LVRA 4BW3A 4A9EA 4FLPA 4O76A 5FDZA 5I83A 4LYSA 5E3GA 5D3JA 5EWVA 1PUOA 3VKGA 4UYFB 5LUUA 5A83A 4QR4A 5A5RA 4QSUA 4NR5A 3LQJA 4QUUA 5EI4A 4YBTA 4IR4A 5D25A 5EM3A 5LJ0A 5FFVA 5C7NA 4UIYA 4HBVA 5I7XA 5E9VA 5DYAA 5EWCA 4J1PA 3MB4A 2KTBB 5FB0A 1WUMA 5CP5A 4QR3A 1F68A 4BW4A 4LC2A 4TU4A 2WP2A 5A85A 4MEPA 5I86A 3U5JA 5I7YA 2YEKA 3GG3A 5HQ6A 5IIDA 3MXFA 5DYCA 5LKXA 4IORA 5D3RA 5EK9A 3VKHA 4ZQLA 5H1UA 5ETDA 5DX4A 3S91A 5G4SA 5LJ1A 4IOQA 5A7CA 4TQNA 5F61A 5EU1A 4PKLA 5A5NA 3P1EA 3TLPA 2YELA 2L85A 4Z6HA 4N3WA 5CUBA 5G4RA 3UVXA 5L8TA 2FSAA 5HFQA 2YYNA 1X0JA 5I29A 5K29A 3Q2EA 5DKHA 4KCXA 4O78A 4OGIA 4HBWA 3JVKA 4YYGA 5BT4A 4UYGA 5CRMA 4UITA 5CY9A 3IU6A 4NYXA 4QYDA 2E3KA 5L8UA 4ALGA 4BJXA 4QNSA 3FKMX 4AKNA 3HMFA 4UIWA 4ZC9A 4NS5A 2G4AA 5EPRA 4CFKA 3U5LA 5L99A 4XUBA 4KV4A 4O72A 5D3PA 5DKDA 5LKTA 5CFWA 4PCEA 3U5PA 4HXOA 4CUSA 2DKWA 2F6NA 5CS8A 2EJNA 3P1CA 4HBYA 2OO1A 5KO4A 2LSPB 2RNWA 5TB6A 1WUGA 4UYEA 4X2IA 3MULA 5FE4A 5TCMA 5C85A 3O35A 5E3DA 5BT5A 3S92A 4QSRA 4C66A 5CU8A 3G0JA 1N72A 2DVQA 4QSTA 5FB1A 4XY8A 5E0RA 4NRBA 4YY6A 3LXJA 4NYWA 4O77A 4YAXA 5CUCA 2R10A 4IR5A 4CFLA 5A82A 4A9FA 4QSPA 5EISA 5ENHA 5EVAA 2N9GA 5C8GA 5FE8A 4HBXA 5ENGA 3UV2A 2YEMA 5DYUA 4Y03A 5D26A 5EWHA 4A9LA 5F5ZA 1E6IA 5EICA 3AADA 5CUGA 5CPEA 4NYVA 5DYXA 5CQ8A 5FE5A 5HCLA 4MEOA 4QSQA 5E9KA 5I80A 5CUAA 5DW1A 2RFJA 5CQ6A 4NUCA 3UVYA 5JWMA 4NR4A 3U5MA 5H1TA 4N4IA 4YYJA 4QZSA 3U5OA 5D3TA 4AKGA 5II1A 5A5OA 5EP7A 4LYIA 4LZSA 5L97A 4YADA 3QZVA 2RS9B 5FFYA 4UYHA 4LR6A 5CZGA 5AMFA
chains in the Genus database with same CATH topology
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