4ZC9A

Crystal structure of the brd4a/db-2-190 complex
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title DRUG DEVELOPMENT. Phthalimide conjugation as a strategy for in vivo target protein degradation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein/inhibitor
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4zc9A01
4QSSA 4F3IA 5HRWA 5EPRA 5L98A 2L85A 5C89A 5DLXA 5F61A 5DKCA 5FG4A 5LVRA 3UVXA 5IGLA 2RS9B 4QSUA 1WUMA 5E9YA 5EV9A 5BT3A 5HLSA 3DAIA 2E7OA 4MR4A 2RFJA 5EISA 5LKUA 4QR3A 5L99A 2OUOA 5CUAA 2D9EA 5E74A 5E3DA 4AKNA 4IR4A 3D7CA 4QSQA 4MEQA 4X2IA 4YYMA 5ENGA 5CQ4A 3LXJA 4Z93A 4TT6A 5I89A 3MQMA 2E3KA 5F63A 4WHWA 4LZSA 3K2JA 4LRGA 5CZGA 5BT4A 4HXRA 5G4SA 4WHUA 5EU1A 3QZTA 3HMHA 4CUSA 2RNYA 4O78A 2H60A 5I7YA 2MJVB 4IR5A 2L5EA 4C66A 5H1VA 4NRBA 5ENHA 5FH8A 3QZVA 4UIZA 5ENJA 4N4HA 4LDFA 5DYCA 4Z6HA 4QZSA 4O7CA 5CRMA 5IBNA 5LUUA 4MEOA 5CUEA 4IR6A 5DYAA 2LSPB 4N4GA 5H1TA 3FKMX 3AQAA 4O7BA 4OGJA 5II1A 3RCWA 4MR3A 5C4QA 2DATA 2F6NA 4N4FA 5II2A 1N72A 5FE6A 5L8TA 2OSSA 3O37A 4NUEA 4O75A 5D3PA 5F36A 3SVHA 4YYGA 5CUGA 4YABA 4A9HA 5AMFA 4HBXA 4HBYA 5CU8A 5EWCA 5G4RA 5EM3A 5IGKA 5CQTA 2YYNA 5KU3A 2F6JA 3MB4A 5JWMA 4CUPA 4UIYA 5D24A 4QSWA 5F25A 4QYLA 2D82A 5KHMA 4Q0OA 1WUGA 3ZYUA 5IIDA 3LJWA 4YYKA 5LVQA 4YH3A 4UITA 4NR9A 5AD2A 5HEMA 5K29A 3UVDA 5CUDA 5FE3A 4YY6A 5D7XA 4ZQLA 5L96A 4C67A 2RNWA 3G0JA 4BHWA 4UYDA 3LQJA 5F2PA 3Q2FA 4QUTA 4TYLA 5HFQA 2N9GA 3ONIA 4TU6A 4NXJA 5H1UA 4KCXA 4UIVA 4XUBA 5CQ8A 4N4IA 5EWWA 5IGMA 2DVRA 5E9KA 4NUDA 5C8GA 5COIA 5DKHA 2YDWA 5CUCA 5F3AA 5I7XA 2L84A 5EA1A 1F68A 4FLPA 4O71A 5CQ6A 4QYDA 5EP7A 5CUBA 4QUUA 5TB6A 4QEVA 3P1DA 5EWVA 4IOQA 3JVMA 5EK9A 4LYWA 4YYDA 5E9VA 4XYAA 5EWHA 5A83A 2YW5A 5DX4A 5LKZA 5I40A 4NRCA 5L97A 4UYFA 4ZC9A 5IGNA 2RO1A 4NR5A 4N3WA 4O76A 4YBMA 5D25A 4J3IA 4WIVA 3UV2A 3TLPA 4NR7A 4MR6A 5DYUA 5FE9A 5HJCA 5KO4A 4UYFB 5FB1A 4QSTA 4TT4A 4HXPA 2I7KA 4A9IA 3O34A 5EICA 4QBMA 5ENBA 5HQ5A 4PCIA 4A9FA 5JI8A 4YC9A 5ENEA 4NQMA 2DVQA 2YQDA 4UYEA 3P1CA 4TU4A 4MEPA 3HMFA 4QR5A 4HBVA 4XUAA 5ENIA 2RNXA 3UW9A 5CP5A 5C85A 5E3GA 4CFKA 3SVGA 4QEWA 5C87A 4XY9A 3DWYA 4HXLA 5FE5A 5KTXA 4CUUA 3U5PA 5FFVA 4RVRA 5CRZA 5CPEA 3UVWA 4YBTA 5HM0A 3P5OA 4HXSA 4YAXA 5A5PA 4QSRA 5DW1A 4CL9A 5LKXA 5D3SA 1E6IA 4PKLA 5A85A 4A9KA 5I83A 5EPSA 4QSPA 4NS5A 5I88A 2GRCA 5E7DA 5CQAA 4YBSA 2DKWA 5CQ5A 4TTEA 5CFWA 4UIUA 3NXBA 3G0LA 4UYHA 5FH6A 5DY7A 4NR4A 5EI4A 4O7AA 4CLBA 5E73A 3MXFA 4DONA 5CQ3A 5LJ0A 5DFDA 5HENA 4CUQA 5E9MA 5FB0A 5F1HA 5F1LA 2R0SA 4QB3A 5CTLA 4NR6A 5A5OA 4QNSA 3MB3A 1JSPB 4CUTA 5F62A 5TCMA 2YELA 2I8NA 5HQ6A 3S91A 1EQFA 4PS5A 4NR8A 4BJXA 4YYIA 5I1QA 5ACYA 5LJ1A 3MUKA 5F60A 3UV4A 4QEUA 4NYVA 5C7NA 3UVYA 4NQNA 5A7CA 5FE8A 4XY8A 5FG5A 4PTBA 3I3JA 3MULA 5FG6A 5CS8A 4LZRA 4Z6IA 3U5JA 3SVFA 5DBMA 3P1FA 4UYGA 4BW1A 4OGIA 4QR4A 5HCLA 4UIWA 5DYXA 5DKDA 5H85A 3O33A 4ZW1A 5I80A 3IU6A 5I29A 3JVKA 4IR3A 5HRXA 2R10A 4QSVA 4BW2A 4QC1A 3U5LA 5E9IA 1JM4B 4J0SA 5A5RA 5A81A 5ETBA 5HELA 4PCEA 5E9LA 2WP1A 5FDZA 2RI7A 4YYHA 2R0YA 4LYIA 4QSXA 4Y03A 4NRAA 4PY6A 4UIXA 5KTUA 5J0DA 5FBXA 3LQIA 5A5SA 4NUCA 2OO1A 4QC3A 4CURA 3O36A 5D3TA 5KTWA 3JVJA 4HXMA 4BW3A 4A9OA 5LKTA 4YY4A 4IOOA 3HMEA 5D3JA 5E0RA 4O74A 5ETDA 4YH4A 3IU5A 5CY9A 4HXKA 4YK0A 4YADA 3U5NA 5L8UA 3QZSA 5DW2A 4J0RA 5D3HA 2R0VA 4HXOA 5A82A 5FE4A 5EWDA 5FE2A 4MR5A 3JVLA 5D3NA 5DFCA 2WP2A 5D0CA 4O77A 3Q2EA 3P1EA 5EPBA 3AADA 5AMEA 5HFRA 4BW4A 4MENA 4A9JA 2YEMA 4TT2A 5A5QA 5FE0A 5A5NA 3UV5A 4Z1SA 5I86A 1X0JA 4QY4A 5FE7A 2DVVA 4J1PA 2DVSA 5EQ1A 5D3RA 5FH7A 4O72A 4Q0NA 4IORA 4TZ8A 5HQ7A 2E7NA 5ENCA 5FFWA 4Z1QA 5D26A 4E96A 4NYXA 4ALHA 2KTBB 5FFYA 5HRVA 3U5MA 5FE1A 5EGUA 4CFLA 4O70A 5DLZA 4KV4A 5D3LA 4O7FA 4TQNA 4TS8A 4LR6A 4LZ2A 4A9NA 5AD3A 3O35A 4O7EA 4YATA 5ENFA 4A9EA 5DFBA 4A9MA 1ZS5A 5BT5A 4ALGA 3S92A 4LYSA 4KV1A 2G4AA 4A9LA 5LJ2A 5EVAA 2FSAA 2YEKA 3GG3A 3LQHA 4YYJA 3U5KA 4TZ2A 2NXBA 4NYWA 4HBWA 5F5ZA 2DWWA 3U5OA 5IG6A 4YYNA 5CGPA 4HXNA 4OUFA 4GPJA 4LC2A 5CQ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSSA 4F3IA 5HRWA 5EPRA 5L98A 2L85A 5C89A 5DLXA 5F61A 5DKCA 3VKHA 5FG4A 5LVRA 3UVXA 5IGLA 2RS9B 4QSUA 1WUMA 5E9YA 5EV9A 5BT3A 5HLSA 3DAIA 2E7OA 4MR4A 2RFJA 5EISA 5LKUA 4QR3A 5L99A 2OUOA 5CUAA 2D9EA 5E74A 5E3DA 4AKNA 4IR4A 2EJNA 3D7CA 4QSQA 4MEQA 4X2IA 4YYMA 5ENGA 5CQ4A 3LXJA 4Z93A 4TT6A 5I89A 3MQMA 2E3KA 5F63A 4WHWA 4LZSA 3K2JA 4LRGA 5CZGA 5BT4A 4HXRA 5G4SA 4WHUA 5EU1A 3QZTA 3HMHA 4CUSA 2RNYA 4O78A 2H60A 5I7YA 2MJVB 4IR5A 2L5EA 4C66A 5H1VA 4NRBA 5ENHA 5FH8A 3QZVA 4UIZA 5ENJA 4N4HA 4LDFA 5DYCA 4Z6HA 4QZSA 4O7CA 5CRMA 5IBNA 5LUUA 4MEOA 5CUEA 4IR6A 5DYAA 2LSPB 4N4GA 5H1TA 3FKMX 3AQAA 4O7BA 4OGJA 5II1A 3RCWA 4MR3A 5C4QA 2DATA 2F6NA 4N4FA 5II2A 1N72A 5FE6A 5L8TA 2OSSA 3O37A 4NUEA 4O75A 5D3PA 5F36A 3SVHA 4YYGA 5CUGA 4YABA 4A9HA 5AMFA 4HBXA 4HBYA 5CU8A 5EWCA 5G4RA 5EM3A 5IGKA 5CQTA 2YYNA 5KU3A 2F6JA 3MB4A 5JWMA 4CUPA 4UIYA 5D24A 4QSWA 5F25A 3D1BA 4QYLA 2D82A 5KHMA 4Q0OA 1WUGA 3ZYUA 5IIDA 3LJWA 4YYKA 5LVQA 4YH3A 4UITA 4AKGA 4NR9A 5AD2A 5HEMA 5K29A 3UVDA 5CUDA 5FE3A 4YY6A 5D7XA 4ZQLA 5L96A 4C67A 2RNWA 3G0JA 4BHWA 4UYDA 3LQJA 5F2PA 3Q2FA 4QUTA 4TYLA 5HFQA 2N9GA 3ONIA 3ERRA 4NXJA 4TU6A 5H1UA 4KCXA 4UIVA 4XUBA 5CQ8A 4N4IA 5EWWA 5IGMA 2DVRA 5E9KA 4NUDA 5C8GA 5COIA 5DKHA 2YDWA 5CUCA 5F3AA 5I7XA 2L84A 5EA1A 1F68A 4FLPA 4O71A 5CQ6A 4QYDA 5EP7A 5CUBA 4QUUA 5TB6A 4QEVA 3P1DA 5EWVA 3VKGA 4IOQA 3JVMA 5EK9A 4LYWA 4YYDA 5E9VA 4XYAA 5EWHA 5A83A 2YW5A 5DX4A 5LKZA 5I40A 4NRCA 5L97A 4UYFA 4ZC9A 5IGNA 2RO1A 4NR5A 4N3WA 4O76A 4YBMA 5D25A 4J3IA 4WIVA 3UV2A 3TLPA 4NR7A 4MR6A 5DYUA 5FE9A 5HJCA 1PUOA 5KO4A 4UYFB 5FB1A 4QSTA 4TT4A 4HXPA 2I7KA 4A9IA 3O34A 5EICA 4QBMA 5ENBA 5HQ5A 4PCIA 4A9FA 5JI8A 4YC9A 5ENEA 4NQMA 2DVQA 2YQDA 4UYEA 3P1CA 4TU4A 4MEPA 3HMFA 4QR5A 4HBVA 4XUAA 5ENIA 2RNXA 3UW9A 5CP5A 5C85A 5E3GA 4CFKA 3D1DA 3SVGA 4QEWA 5C87A 4XY9A 3DWYA 4HXLA 5FE5A 5KTXA 4CUUA 3U5PA 5FFVA 4RVRA 5CRZA 5CPEA 3UVWA 4YBTA 5HM0A 3P5OA 4HXSA 4YAXA 5A5PA 4QSRA 5DW1A 4CL9A 5LKXA 5D3SA 1E6IA 4PKLA 5A85A 4A9KA 5I83A 5EPSA 4QSPA 4NS5A 5I88A 2GRCA 5E7DA 5CQAA 4YBSA 2DKWA 5CQ5A 4TTEA 5CFWA 4UIUA 3NXBA 3G0LA 4UYHA 5FH6A 5DY7A 4NR4A 5EI4A 4O7AA 4CLBA 5E73A 3MXFA 4DONA 5CQ3A 5LJ0A 5DFDA 5HENA 4CUQA 5E9MA 5FB0A 5F1HA 5F1LA 2R0SA 4QB3A 5CTLA 4NR6A 5A5OA 4QNSA 3MB3A 1JSPB 4CUTA 5F62A 5TCMA 2YELA 2I8NA 5HQ6A 3S91A 1EQFA 4PS5A 4NR8A 4BJXA 4YYIA 5I1QA 5ACYA 5LJ1A 3MUKA 5F60A 3UV4A 4QEUA 4NYVA 5C7NA 3UVYA 4NQNA 5A7CA 5FE8A 4XY8A 5FG5A 4PTBA 3I3JA 3MULA 5FG6A 5CS8A 4LZRA 4Z6IA 3U5JA 3SVFA 5DBMA 3P1FA 4UYGA 4BW1A 4OGIA 4QR4A 5HCLA 4UIWA 5DYXA 5DKDA 5H85A 3O33A 4ZW1A 5I80A 3IU6A 5I29A 3JVKA 4IR3A 5HRXA 2R10A 4QSVA 4BW2A 4QC1A 3U5LA 5E9IA 1JM4B 4J0SA 5A5RA 5A81A 5ETBA 5HELA 4PCEA 5E9LA 2WP1A 5FDZA 2RI7A 4YYHA 2R0YA 4LYIA 4QSXA 4Y03A 4NRAA 4PY6A 4UIXA 5KTUA 5J0DA 5FBXA 4AKIA 3LQIA 5A5SA 4AKHA 4NUCA 2OO1A 4QC3A 4CURA 3O36A 5D3TA 5KTWA 3JVJA 4HXMA 4BW3A 4A9OA 5LKTA 4YY4A 4IOOA 3HMEA 5D3JA 5E0RA 4O74A 5ETDA 4YH4A 3IU5A 5CY9A 4HXKA 4YK0A 4YADA 3U5NA 5L8UA 3QZSA 5DW2A 4AI6A 4J0RA 5D3HA 2R0VA 4HXOA 5A82A 5FE4A 5EWDA 5FE2A 4MR5A 3JVLA 5D3NA 5DFCA 2WP2A 5D0CA 4O77A 3Q2EA 3P1EA 5EPBA 3AADA 5AMEA 5HFRA 4BW4A 4MENA 4A9JA 2YEMA 4TT2A 5A5QA 5FE0A 5A5NA 3UV5A 4Z1SA 5I86A 1X0JA 4QY4A 5FE7A 2DVVA 4J1PA 2DVSA 5EQ1A 5D3RA 5FH7A 4O72A 4Q0NA 1ZKRA 4IORA 4TZ8A 5HQ7A 2E7NA 5ENCA 5FFWA 4Z1QA 5D26A 4E96A 4NYXA 4ALHA 2KTBB 5FFYA 5HRVA 3U5MA 5FE1A 5EGUA 4CFLA 4O70A 5DLZA 4KV4A 5D3LA 4O7FA 4TQNA 4TS8A 4LR6A 4LZ2A 4A9NA 5AD3A 3O35A 4O7EA 4YATA 5ENFA 4A9EA 5DFBA 4A9MA 1ZS5A 5BT5A 4ALGA 3S92A 4LYSA 4KV1A 2G4AA 4A9LA 5LJ2A 5EVAA 2FSAA 2YEKA 3GG3A 3LQHA 4YYJA 3U5KA 4TZ2A 2NXBA 4NYWA 4HBWA 5F5ZA 2DWWA 3U5OA 5IG6A 4YYNA 5CGPA 4HXNA 4OUFA 4GPJA 4LC2A 5CQ7A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QSS A;  4F3I A;  5HRW A;  5EPR A;  5L98 A;  2L85 A;  5C89 A;  5DLX A;  5F61 A;  5DKC A;  5FG4 A;  5LVR A;  3UVX A;  5IGL A;  2RS9 B;  4QSU A;  1WUM A;  5E9Y A;  5EV9 A;  5BT3 A;  5HLS A;  3DAI A;  2E7O A;  4MR4 A;  2RFJ A;  5EIS A;  5LKU A;  4QR3 A;  5L99 A;  2OUO A;  5CUA A;  2D9E A;  5E74 A;  5E3D A;  4AKN A;  4IR4 A;  3D7C A;  4QSQ A;  4MEQ A;  4X2I A;  4YYM A;  5ENG A;  5CQ4 A;  3LXJ A;  4Z93 A;  4TT6 A;  5I89 A;  3MQM A;  2E3K A;  5F63 A;  4WHW A;  4LZS A;  3K2J A;  4LRG A;  5CZG A;  5BT4 A;  4HXR A;  5G4S A;  4WHU A;  5EU1 A;  3QZT A;  3HMH A;  4CUS A;  2RNY A;  4O78 A;  2H60 A;  5I7Y A;  2MJV B;  4IR5 A;  2L5E A;  4C66 A;  5H1V A;  4NRB A;  5ENH A;  5FH8 A;  3QZV A;  4UIZ A;  5ENJ A;  4N4H A;  4LDF A;  5DYC A;  4Z6H A;  4QZS A;  4O7C A;  5CRM A;  5IBN A;  5LUU A;  4MEO A;  5CUE A;  4IR6 A;  5DYA A;  2LSP B;  4N4G A;  5H1T A;  3FKM X;  3AQA A;  4O7B A;  4OGJ A;  5II1 A;  3RCW A;  4MR3 A;  5C4Q A;  2DAT A;  2F6N A;  4N4F A;  5II2 A;  1N72 A;  5FE6 A;  5L8T A;  2OSS A;  3O37 A;  4NUE A; 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