3GG3A

Crystal structure of the bromodomain of human pcaf
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
PDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histone acetyltransferase PCAF
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3gg3A00
5D3RA 5D7XA 4HXOA 3SVFA 4PCEA 3ZYUA 5F61A 5TB6A 5IGLA 3JVJA 5CZGA 3SVGA 3QZSA 3D7CA 4N3WA 4QBMA 4Z6HA 4CUUA 4LC2A 2OUOA 5BT4A 5EK9A 3S91A 4PCIA 5FH6A 5ETDA 1WUGA 5EI4A 5FE7A 4XUBA 3LXJA 1E6IA 4GPJA 4NXJA 2DVSA 5ENCA 4LDFA 3FKMX 5I80A 5DFDA 5E9MA 4YADA 4BW2A 4MEOA 4YABA 5DKHA 5F60A 4CUPA 2WP2A 3MUKA 4A9IA 4QNSA 4YBSA 4CFKA 5HQ6A 4QB3A 4J3IA 4QC3A 5A81A 5E74A 4TQNA 5EPSA 5CQTA 4LYWA 5F5ZA 4ZQLA 4IR3A 5I86A 5HCLA 2E7NA 5FE0A 5F25A 5LKZA 4QUTA 3HMHA 3ONIA 4HXNA 3K2JA 4O7CA 5FH8A 5DFBA 4F3IA 4LZSA 5CP5A 4Z93A 5I40A 5G4RA 4A9LA 5ETBA 5FE1A 5LKUA 5A82A 4C66A 3RCWA 2NXBA 4NR9A 4UYDA 4TU6A 5D3PA 5KU3A 4NR7A 5D3JA 5EGUA 2F6JA 4QR4A 5HQ5A 4O7AA 4IOQA 5D3SA 5EISA 4MEQA 5E9YA 4NRBA 4QEWA 4YATA 4N4GA 4TT6A 2L85A 4NYVA 4NR5A 4QSXA 4AKNA 5E3GA 4LZRA 5DKCA 4LYSA 4YY4A 5CS8A 3S92A 1EQFA 2G4AA 5I7YA 4UIWA 1X0JA 5LJ1A 3GG3A 4MEPA 4UIUA 5IIDA 3O37A 5CTLA 5A83A 5A5OA 2DKWA 5BT3A 5DW1A 4CURA 5IGKA 4QEUA 5EWCA 5E73A 4O70A 4HXSA 4LYIA 5ACYA 5LVRA 4Z1SA 3O35A 5EM3A 3Q2FA 2RO1A 4MR3A 5LKTA 4IR6A 4TU4A 5E9KA 5FFYA 4N4HA 4NUDA 4KV4A 4QZSA 5H85A 4HBWA 2R0VA 4YC9A 5AD3A 5FE2A 5II1A 5LJ0A 5FDZA 4J0SA 4LRGA 5KO4A 4FLPA 2MJVB 3QZVA 5G4SA 2R0YA 5AMEA 5ENIA 2R10A 2GRCA 4LZ2A 5ENHA 5HJCA 2DATA 5KHMA 4YYKA 4X2IA 5F63A 5A5PA 2OSSA 4DONA 4XY8A 4C67A 4IR5A 5D24A 4KV1A 4RVRA 4KCXA 4TYLA 5I88A 2I8NA 5KTXA 4MR5A 5FG4A 5FG5A 5BT5A 5LKXA 5IGNA 4XYAA 5CQ7A 3U5JA 5L96A 4YY6A 5HM0A 3I3JA 3IU6A 2RI7A 2L84A 5D25A 4PS5A 3LQIA 2E7OA 4BW4A 2YDWA 4UYGA 5CU8A 4O7BA 5C85A 4TT2A 2RS9B 2YYNA 5CPEA 4QR5A 2DVQA 2WP1A 3LQHA 5ENEA 4CLBA 5H1TA 2RNYA 4J0RA 5DYXA 4YYJA 5CUDA 3NXBA 5A5RA 2I7KA 5CQ8A 2E3KA 4O71A 4N4IA 5F3AA 5CQ6A 3UVDA 3DWYA 4UYEA 3MB4A 4UYHA 4LR6A 2RFJA 5IG6A 4BW3A 5FBXA 5A7CA 5C7NA 5CUBA 4QY4A 3TLPA 3Q2EA 4QUUA 5A85A 3O33A 3U5NA 3JVLA 5CUCA 5HELA 4YBMA 4QYDA 4O74A 5CQ4A 4QSPA 5L98A 4NRCA 3O36A 4CUSA 5HENA 5C87A 4HBVA 4YYGA 3P1DA 4A9FA 3HMEA 3U5KA 4Q0NA 3G0JA 5EU1A 4PY6A 4O76A 5C8GA 5FB0A 2D9EA 5IBNA 3DAIA 4A9MA 4UIVA 4IORA 4UIXA 5FE9A 5JWMA 5COIA 5EPBA 2FSAA 4NYXA 5I1QA 5FE8A 4YH4A 5KTWA 5C89A 4QSQA 4Z6IA 3UV4A 3JVKA 3UV2A 4A9HA 4YYDA 4NUCA 5FFVA 5L97A 4TTEA 4A9KA 3MQMA 4IOOA 4QR3A 4E96A 4MR4A 5CQAA 1ZS5A 5I89A 5DYCA 4PTBA 5EA1A 3HMFA 3AQAA 5A5NA 5E9VA 5II2A 3UV5A 2DVRA 3U5OA 4UITA 4HXLA 4XY9A 5DLZA 5CRMA 5HEMA 5HLSA 5L8TA 5CUGA 5F36A 4OGIA 5E0RA 5IGMA 5FB1A 5FE3A 4ZC9A 4TZ2A 5DY7A 4UIZA 5DFCA 5HFQA 4Q0OA 4HXKA 5LVQA 4J1PA 5I83A 2LSPB 4QEVA 4O7FA 1JM4B 2N9GA 3MULA 3AADA 4CUTA 4HBYA 4Y03A 2YEKA 4TZ8A 4NS5A 4QSVA 5H1VA 4YYMA 5FE6A 4UYFB 5E3DA 4CFLA 4YAXA 4QSSA 3P1EA 2R0SA 5F2PA 4QSRA 5HQ7A 5AD2A 4O77A 5D3NA 2RNWA 5EV9A 5H1UA 5D26A 3P1CA 4NRAA 5F1HA 4CUQA 5EWWA 5I7XA 5KTUA 2D82A 2OO1A 5FFWA 2YW5A 5DYUA 5FH7A 4CL9A 5K29A 4OGJA 3QZTA 4HXPA 3U5PA 2YQDA 5LJ2A 4WIVA 5L8UA 5E9IA 5CRZA 3UVWA 3LQJA 2F6NA 1JSPB 4ALHA 5DX4A 4QSTA 5HRWA 4O78A 4QC1A 4NUEA 4UIYA 5DW2A 4NQNA 4NR6A 4A9JA 5FG6A 5CQ5A 4YYIA 5ENFA 4ZW1A 5CQ3A 5D3HA 5JI8A 4QYLA 1F68A 5A5QA 2H60A 5CUEA 4PKLA 5DLXA 5EWVA 4HXMA 1N72A 4TT4A 5FE5A 2RNXA 4O75A 3G0LA 3LJWA 5CFWA 4NQMA 4YYNA 5LUUA 5F62A 5E7DA 1WUMA 4WHWA 5EVAA 5E9LA 5CY9A 4HBXA 4TS8A 2YELA 5DBMA 5J0DA 2YEMA 5L99A 3JVMA 5D0CA 3MB3A 4O72A 4UYFA 4NR8A 3IU5A 4A9EA 5DYAA 5ENBA 3P5OA 5D3TA 5CUAA 5D3LA 2DVVA 2DWWA 4A9NA 5EQ1A 5HRVA 4QSWA 3U5LA 5ENJA 4YYHA 4O7EA 5EWDA 5C4QA 5EP7A 4XUAA 4BW1A 3MXFA 5EPRA 3U5MA 4OUFA 2L5EA 4BHWA 5I29A 4N4FA 4QSUA 3UW9A 4BJXA 4IR4A 5EWHA 5ENGA 5DKDA 4ALGA 5AMFA 4YH3A 5F1LA 5FE4A 4MENA 4YBTA 4WHUA 2KTBB 5A5SA 5EICA 3O34A 4YK0A 5HFRA 5HRXA 5TCMA 3P1FA 4Z1QA 4NYWA 3UVXA 4HXRA 4MR6A 3UVYA 4A9OA 3SVHA 4NR4A 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D3RA 5D7XA 4HXOA 3SVFA 4PCEA 3ZYUA 5F61A 5TB6A 5IGLA 3JVJA 5CZGA 3SVGA 3QZSA 3D7CA 4N3WA 4QBMA 4Z6HA 4CUUA 4LC2A 2OUOA 5BT4A 5EK9A 3S91A 4PCIA 5FH6A 5ETDA 1WUGA 5EI4A 5FE7A 4XUBA 3LXJA 1E6IA 4GPJA 4NXJA 2DVSA 5ENCA 4LDFA 3FKMX 5I80A 5DFDA 5E9MA 4YADA 4AKHA 4BW2A 4MEOA 4YABA 5DKHA 5F60A 4CUPA 2WP2A 3MUKA 4A9IA 4QNSA 4YBSA 4CFKA 5HQ6A 4QB3A 4J3IA 4QC3A 5A81A 5E74A 4TQNA 5EPSA 5CQTA 4LYWA 5F5ZA 4ZQLA 4IR3A 5I86A 5HCLA 4AKGA 2E7NA 5FE0A 5F25A 5LKZA 4QUTA 3HMHA 3ONIA 4HXNA 3K2JA 4O7CA 5FH8A 5DFBA 4F3IA 4LZSA 5CP5A 4Z93A 5I40A 5G4RA 4A9LA 3ERRA 5ETBA 5FE1A 5LKUA 5A82A 4C66A 3RCWA 2NXBA 4NR9A 4UYDA 4TU6A 5D3PA 5KU3A 4NR7A 5D3JA 5EGUA 2F6JA 4QR4A 5HQ5A 4O7AA 4IOQA 5D3SA 5EISA 4MEQA 5E9YA 4NRBA 4QEWA 4YATA 4N4GA 4TT6A 2L85A 4NYVA 4NR5A 4QSXA 4AKNA 5E3GA 4LZRA 5DKCA 4LYSA 4YY4A 5CS8A 3S92A 1EQFA 2G4AA 5I7YA 4UIWA 1X0JA 5LJ1A 3GG3A 4MEPA 4UIUA 5IIDA 3O37A 5CTLA 5A83A 5A5OA 2DKWA 5BT3A 5DW1A 4CURA 5IGKA 4QEUA 5EWCA 5E73A 4O70A 4HXSA 4LYIA 5ACYA 5LVRA 4Z1SA 3O35A 5EM3A 3Q2FA 2RO1A 4MR3A 5LKTA 4IR6A 4TU4A 5E9KA 5FFYA 4N4HA 4NUDA 4KV4A 4QZSA 5H85A 4HBWA 2R0VA 4YC9A 5AD3A 5FE2A 1PUOA 5II1A 5LJ0A 5FDZA 4J0SA 4LRGA 5KO4A 4FLPA 2MJVB 3QZVA 5G4SA 2R0YA 5AMEA 5ENIA 2R10A 2GRCA 4LZ2A 5ENHA 5HJCA 2DATA 5KHMA 4YYKA 4X2IA 5F63A 5A5PA 2OSSA 4DONA 4XY8A 4C67A 4IR5A 5D24A 4KV1A 4RVRA 4KCXA 4TYLA 5I88A 2I8NA 5KTXA 4MR5A 5FG4A 5FG5A 5BT5A 5LKXA 5IGNA 4XYAA 5CQ7A 3U5JA 5L96A 4YY6A 5HM0A 3I3JA 3IU6A 2RI7A 2L84A 5D25A 4PS5A 3LQIA 2E7OA 4BW4A 2YDWA 4UYGA 5CU8A 4O7BA 5C85A 4TT2A 2RS9B 2YYNA 5CPEA 4QR5A 2DVQA 2WP1A 3LQHA 5ENEA 4CLBA 5H1TA 2RNYA 4J0RA 5DYXA 4YYJA 5CUDA 3NXBA 5A5RA 2I7KA 5CQ8A 3VKHA 2E3KA 4O71A 4N4IA 5F3AA 5CQ6A 3UVDA 3DWYA 4UYEA 3MB4A 4UYHA 4LR6A 2RFJA 5IG6A 4BW3A 5FBXA 5A7CA 5C7NA 5CUBA 4QY4A 3TLPA 3Q2EA 4QUUA 5A85A 3O33A 3U5NA 3JVLA 5CUCA 5HELA 4YBMA 4QYDA 4O74A 5CQ4A 4QSPA 5L98A 4NRCA 3O36A 4CUSA 5HENA 5C87A 4HBVA 4YYGA 3P1DA 4A9FA 3HMEA 3U5KA 4Q0NA 3G0JA 5EU1A 4PY6A 4O76A 5C8GA 5FB0A 4AKIA 2D9EA 5IBNA 3DAIA 4A9MA 4UIVA 4IORA 4UIXA 5FE9A 5JWMA 5COIA 5EPBA 2FSAA 4NYXA 5I1QA 1ZKRA 5FE8A 4YH4A 5KTWA 5C89A 4QSQA 4Z6IA 3UV4A 3JVKA 3UV2A 4A9HA 4YYDA 4NUCA 5FFVA 5L97A 3D1DA 4TTEA 4A9KA 3MQMA 3VKGA 4IOOA 4QR3A 4E96A 4MR4A 5CQAA 1ZS5A 5I89A 5DYCA 4PTBA 5EA1A 3HMFA 3AQAA 5A5NA 5E9VA 5II2A 3UV5A 2DVRA 3U5OA 4UITA 4HXLA 4XY9A 5DLZA 5CRMA 5HEMA 5HLSA 5L8TA 5CUGA 5F36A 4OGIA 5E0RA 5IGMA 5FB1A 5FE3A 4ZC9A 4TZ2A 5DY7A 4UIZA 5DFCA 5HFQA 4Q0OA 4HXKA 5LVQA 4J1PA 5I83A 2LSPB 4QEVA 4O7FA 1JM4B 2N9GA 3MULA 3AADA 4CUTA 4HBYA 4Y03A 2YEKA 4TZ8A 4NS5A 4QSVA 5H1VA 4YYMA 5FE6A 4UYFB 5E3DA 4CFLA 4YAXA 4QSSA 3P1EA 2R0SA 5F2PA 4QSRA 5HQ7A 5AD2A 4O77A 5D3NA 2RNWA 5EV9A 4AI6A 5H1UA 5D26A 3P1CA 4NRAA 5F1HA 4CUQA 5EWWA 5I7XA 5KTUA 3D1BA 2D82A 2OO1A 5FFWA 2YW5A 2EJNA 5DYUA 5FH7A 4CL9A 5K29A 4OGJA 3QZTA 4HXPA 3U5PA 2YQDA 5LJ2A 4WIVA 5L8UA 5E9IA 5CRZA 3UVWA 3LQJA 2F6NA 1JSPB 4ALHA 5DX4A 4QSTA 5HRWA 4O78A 4QC1A 4NUEA 4UIYA 5DW2A 4NQNA 4NR6A 4A9JA 5FG6A 5CQ5A 4YYIA 5ENFA 4ZW1A 5CQ3A 5D3HA 5JI8A 4QYLA 1F68A 5A5QA 2H60A 5CUEA 4PKLA 5DLXA 5EWVA 4HXMA 1N72A 4TT4A 5FE5A 2RNXA 4O75A 3G0LA 3LJWA 5CFWA 4NQMA 4YYNA 5LUUA 5F62A 5E7DA 1WUMA 4WHWA 5EVAA 5E9LA 5CY9A 4HBXA 4TS8A 2YELA 5DBMA 5J0DA 2YEMA 5L99A 3JVMA 5D0CA 3MB3A 4O72A 4UYFA 4NR8A 3IU5A 4A9EA 5DYAA 5ENBA 3P5OA 5D3TA 5CUAA 5D3LA 2DVVA 2DWWA 4A9NA 5EQ1A 5HRVA 4QSWA 3U5LA 5ENJA 4YYHA 4O7EA 5EWDA 5C4QA 5EP7A 4XUAA 4BW1A 3MXFA 5EPRA 3U5MA 4OUFA 2L5EA 4BHWA 5I29A 4N4FA 4QSUA 3UW9A 4BJXA 4IR4A 5EWHA 5ENGA 5DKDA 4ALGA 5AMFA 4YH3A 5F1LA 5FE4A 4MENA 4YBTA 4WHUA 2KTBB 5A5SA 5EICA 3O34A 4YK0A 5HFRA 5HRXA 5TCMA 3P1FA 4Z1QA 4NYWA 3UVXA 4HXRA 4MR6A 3UVYA 4A9OA 3SVHA 4NR4A 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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