3GG3A

Crystal structure of the bromodomain of human pcaf
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
PDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Histone acetyltransferase PCAF
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3gg3A00
5I40A 5HELA 4NR8A 5A5NA 5E9LA 5H1VA 4RVRA 2DVSA 5D24A 5IIDA 2L85A 3DAIA 5FFYA 4ZW1A 3UW9A 5FG6A 4NYVA 2E3KA 3S92A 4A9EA 3IU5A 5CUBA 4NS5A 4O75A 5D3HA 5KTUA 1JM4B 4IOQA 4YH3A 3TLPA 4O7EA 5L8UA 5FE5A 1X0JA 4N4HA 4CFLA 4FLPA 5FE6A 5DYUA 2DWWA 3UV2A 2I7KA 5LKUA 5EICA 4BW1A 4LZSA 3MQMA 5ENGA 5FE9A 5DYXA 4HBYA 3LQHA 4A9OA 5KU3A 4QSSA 4QR5A 4UYEA 1E6IA 2YEMA 4NYXA 3P1DA 4QSVA 5D25A 4O78A 5CGPA 4YYJA 5HCLA 2OO1A 3HMFA 4UYFB 5AMEA 3K2JA 5H1TA 2YYNA 4NUEA 5E73A 5HEMA 5A85A 4WHWA 4QEVA 3QZSA 5CS8A 4QEWA 5F62A 3O36A 4Q0OA 4QSTA 4TT6A 5CUGA 4ALGA 4PCEA 4TT2A 5E74A 4LZRA 4YBMA 5IGMA 5FE1A 5EWHA 4NYWA 5HRVA 4YK0A 4YYHA 2WP2A 3O37A 2R0VA 2YELA 5ACYA 5CQ5A 4AKNA 5FE8A 5E9YA 4WHUA 4O7CA 4A9NA 5FBXA 5HJCA 3LXJA 2RS9B 3ONIA 2F6JA 4HXRA 5CQAA 5LVQA 4LYSA 5LJ1A 5CY9A 5CPEA 4MEOA 4N4GA 4QC3A 5CP5A 5E9KA 5F1HA 4Z1SA 1EQFA 4N3WA 4YAXA 5F36A 5EISA 5AD2A 4Q0NA 2YQDA 3HMEA 2DKWA 4NQNA 4MR6A 4NRBA 4PCIA 4MR5A 1F68A 5FH6A 5ENBA 5LJ2A 4LR6A 5FB0A 5E9VA 5TB6A 5HFQA 5FE3A 4BJXA 5A5OA 4TQNA 5KO4A 4A9FA 3QZVA 3U5NA 4QYDA 4UIWA 5J0DA 3FKMX 4YBTA 5I83A 4A9LA 2G4AA 5I1QA 4NXJA 2RFJA 5CFWA 4YYKA 4XYAA 4HXMA 2RNWA 4CFKA 3UV5A 5EU1A 3I3JA 4MR3A 4O74A 5EV9A 3MUKA 4QSUA 4ALHA 2D9EA 4PY6A 4XUBA 2GRCA 5H1UA 2YW5A 4C67A 4QR4A 5II1A 2NXBA 3P1FA 4QUTA 5C8GA 3AQAA 4O72A 5G4SA 5DFCA 4YYGA 5A82A 4O7BA 4J0RA 4UYFA 4UIVA 1N72A 5CTLA 4Z6IA 5DX4A 3JVJA 4DONA 5CQ3A 3MXFA 5A5PA 2FSAA 4O77A 4UIYA 4UIUA 4HBWA 5E3DA 5I7YA 5II2A 4J0SA 5DW2A 5C4QA 4PS5A 5D0CA 5F63A 3IU6A 3LQJA 5I89A 4UYDA 5G4RA 3G0LA 3U5KA 5CRMA 5CUCA 4QR3A 5ETBA 5FH7A 4BW2A 4CLBA 4CUQA 5FE7A 4HXSA 5FFWA 4TZ2A 5EK9A 5HENA 4QC1A 2KTBB 5E3GA 4TT4A 4QSPA 4QUUA 3SVFA 4IR5A 4A9JA 5D3NA 5I88A 5LJ0A 5F25A 5COIA 4QSQA 5D3PA 5F61A 3GG3A 4IORA 5CUEA 4UIZA 5CZGA 4QSRA 5CRZA 4CURA 4A9KA 5FE0A 4KV1A 2RNXA 5HQ6A 5EPBA 5HQ5A 4YYMA 5D3TA 5ENCA 3QZTA 4XY9A 5CQ7A 2WP1A 5IGKA 3JVLA 5EWVA 5F60A 5CQ4A 5CQ8A 5I80A 5I86A 5L99A 5EVAA 5FH8A 4NR7A 3AADA 3LQIA 4OGIA 2H60A 5DLZA 5A5QA 5EA1A 4HXLA 5HFRA 5ENIA 4WIVA 4MEPA 3SVHA 4CL9A 4CUUA 4J1PA 2RI7A 5I7XA 4IR3A 4HXOA 4UITA 3O35A 5FDZA 4NQMA 5C85A 2I8NA 5DKHA 3JVKA 4C66A 5DYCA 4IR6A 4KV4A 4MENA 5DY7A 5H85A 5JI8A 2LSPB 3MULA 5DYAA 3MB4A 5I29A 5F3AA 3LJWA 5EM3A 4QB3A 5EWCA 2DVVA 4TU6A 5DFDA 4Z6HA 5CUDA 4QEUA 5KHMA 4YABA 4HBXA 4IOOA 5CUAA 5BT3A 5HRXA 2RNYA 3U5OA 5AD3A 5L8TA 4HBVA 5D3SA 4HXKA 4A9IA 4LC2A 5HM0A 3NXBA 5FFVA 5FB1A 5E0RA 4NRAA 5CQTA 5E7DA 5EPRA 5EQ1A 5EI4A 5L98A 5EP7A 4LRGA 2D82A 2F6NA 5EWDA 5LKTA 3UVWA 5FE4A 5D3LA 4HXPA 1WUMA 4O70A 2L5EA 5E9IA 3U5MA 5TCMA 5FG4A 4MEQA 4E96A 4NUDA 5A7CA 4IR4A 4OGJA 5C87A 5E9MA 2YEKA 4UIXA 2R0SA 2DVQA 5A5RA 4PTBA 5A83A 4BW3A 5F2PA 5KTXA 5D3JA 3D7CA 4YC9A 5ENFA 5CQ6A 3O34A 2OSSA 4X2IA 5EPSA 4A9HA 5F1LA 5A81A 3HMHA 4Z1QA 5ENHA 3U5PA 2R10A 5AMFA 5DKDA 4PKLA 4YADA 5BT4A 4XY8A 4YBSA 5L97A 5FE2A 4TZ8A 4CUSA 3P1EA 5D7XA 3P5OA 5FG5A 4QBMA 5ENJA 2E7NA 5IGNA 2N9GA 4Z93A 4QZSA 4OUFA 4UYHA 5DKCA 4A9MA 4NR6A 5IBNA 3MB3A 5IGLA 4NUCA 2OUOA 4QSWA 4LYWA 4XUAA 4YH4A 4GPJA 4N4FA 5EGUA 3SVGA 1ZS5A 4YYIA 4J3IA 3U5JA 5F5ZA 4N4IA 5HLSA 4QY4A 5DFBA 3Q2EA 4LZ2A 4QSXA 4F3IA 3S91A 5C89A 1WUGA 5DW1A 5DBMA 5LVRA 5ETDA 4TTEA 4ZQLA 5LUUA 3Q2FA 4BW4A 4QYLA 5L96A 3UVXA 4CUTA 4O7FA 4YY4A 3O33A 5IG6A 5LKZA 4LYIA 4YY6A 2R0YA 5ENEA 2E7OA 3UVDA 4TS8A 4ZC9A 4LDFA 4HXNA 2RO1A 3RCWA 5KTWA 3G0JA 4CUPA 5EWWA 3P1CA 4NR5A 4QNSA 4O7AA 5D26A 5DLXA 5JWMA 4MR4A 3UVYA 2DATA 3UV4A 5C7NA 4Y03A 5K29A 4YYDA 2DVRA 3ZYUA 5LKXA 5D3RA 5HRWA 4NR4A 3DWYA 4TU4A 4O76A 4O71A 4TYLA 5BT5A 5CU8A 4NRCA 4BHWA 5A5SA 4YYNA 4NR9A 2YDWA 4YATA 5HQ7A 4UYGA 1JSPB 2L84A 4KCXA 3JVMA 2MJVB 3U5LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I40A 5HELA 4NR8A 5A5NA 5E9LA 5H1VA 4RVRA 2DVSA 5D24A 5IIDA 2L85A 3DAIA 5FFYA 4ZW1A 3UW9A 5FG6A 4NYVA 2E3KA 3S92A 4A9EA 3IU5A 5CUBA 4NS5A 4O75A 5D3HA 5KTUA 1JM4B 4IOQA 4YH3A 3TLPA 4O7EA 5L8UA 5FE5A 1X0JA 4N4HA 4CFLA 4FLPA 5FE6A 5DYUA 2DWWA 3UV2A 2I7KA 5LKUA 5EICA 4BW1A 4LZSA 3MQMA 5ENGA 5FE9A 5DYXA 4HBYA 3LQHA 4A9OA 5KU3A 4QSSA 4QR5A 4UYEA 1E6IA 2YEMA 4NYXA 3P1DA 4QSVA 5D25A 4O78A 5CGPA 4YYJA 5HCLA 2OO1A 3HMFA 4UYFB 5AMEA 3K2JA 5H1TA 2YYNA 4NUEA 5E73A 5HEMA 5A85A 4WHWA 4QEVA 3QZSA 5CS8A 4QEWA 5F62A 3O36A 4Q0OA 4QSTA 4TT6A 5CUGA 4ALGA 4PCEA 4TT2A 5E74A 4LZRA 4YBMA 5IGMA 5FE1A 5EWHA 4NYWA 5HRVA 4YK0A 4YYHA 2WP2A 3O37A 2R0VA 2YELA 5ACYA 5CQ5A 4AKNA 5FE8A 5E9YA 4WHUA 4O7CA 4A9NA 5FBXA 5HJCA 3D1BA 3LXJA 2RS9B 3ONIA 4AI6A 2F6JA 4HXRA 5CQAA 5LVQA 4LYSA 5LJ1A 5CY9A 5CPEA 4MEOA 4N4GA 4QC3A 5CP5A 5E9KA 5F1HA 4Z1SA 1EQFA 4N3WA 3ERRA 4YAXA 3VKHA 5F36A 5EISA 5AD2A 4Q0NA 2YQDA 3HMEA 2DKWA 4NQNA 4MR6A 4NRBA 4PCIA 4MR5A 1F68A 5FH6A 5ENBA 5LJ2A 4LR6A 5FB0A 5E9VA 5TB6A 5HFQA 5FE3A 4BJXA 5A5OA 4TQNA 5KO4A 4A9FA 3QZVA 3U5NA 4QYDA 4UIWA 5J0DA 3FKMX 4YBTA 5I83A 4A9LA 2G4AA 5I1QA 4NXJA 2RFJA 5CFWA 4YYKA 4XYAA 4HXMA 2RNWA 4CFKA 3UV5A 5EU1A 3I3JA 4MR3A 4O74A 5EV9A 3MUKA 4QSUA 4ALHA 2D9EA 4PY6A 4XUBA 2GRCA 5H1UA 2YW5A 4C67A 4QR4A 5II1A 2NXBA 3P1FA 4QUTA 5C8GA 3AQAA 4O72A 5G4SA 5DFCA 4YYGA 5A82A 4O7BA 4J0RA 4UYFA 4UIVA 1N72A 5CTLA 4Z6IA 5DX4A 3JVJA 4DONA 5CQ3A 3MXFA 5A5PA 2FSAA 4O77A 4UIYA 4UIUA 4HBWA 5E3DA 5I7YA 5II2A 4J0SA 5DW2A 5C4QA 4PS5A 5D0CA 5F63A 3IU6A 3LQJA 5I89A 4UYDA 5G4RA 3G0LA 3U5KA 5CRMA 5CUCA 4QR3A 5ETBA 5FH7A 4BW2A 4CLBA 4CUQA 5FE7A 4HXSA 5FFWA 4TZ2A 5EK9A 5HENA 4QC1A 4AKGA 2KTBB 5E3GA 4TT4A 4QSPA 4QUUA 3SVFA 4IR5A 4A9JA 5D3NA 5I88A 3D1DA 5LJ0A 5F25A 5COIA 4QSQA 5D3PA 5F61A 3GG3A 4IORA 5CUEA 4UIZA 5CZGA 4QSRA 5CRZA 4CURA 4A9KA 5FE0A 4KV1A 2RNXA 5HQ6A 5EPBA 5HQ5A 4YYMA 5D3TA 5ENCA 3QZTA 4XY9A 5CQ7A 2WP1A 5IGKA 3JVLA 5EWVA 5F60A 5CQ4A 1ZKRA 5CQ8A 5I80A 5I86A 5L99A 5EVAA 5FH8A 4NR7A 3AADA 3LQIA 4OGIA 2H60A 5DLZA 5A5QA 5EA1A 4HXLA 5HFRA 5ENIA 4WIVA 4MEPA 3SVHA 4CL9A 4CUUA 4J1PA 2RI7A 5I7XA 4IR3A 4HXOA 4UITA 3O35A 5FDZA 4NQMA 5C85A 2I8NA 5DKHA 3JVKA 4C66A 5DYCA 4IR6A 4KV4A 4MENA 5DY7A 5H85A 5JI8A 2LSPB 3MULA 4AKIA 5DYAA 3MB4A 5I29A 5F3AA 3LJWA 5EM3A 4QB3A 5EWCA 2DVVA 4TU6A 5DFDA 4Z6HA 5CUDA 4QEUA 5KHMA 4YABA 4HBXA 4IOOA 5CUAA 5BT3A 5HRXA 2RNYA 3U5OA 5AD3A 5L8TA 4HBVA 5D3SA 4HXKA 4A9IA 4LC2A 5HM0A 3NXBA 5FFVA 5FB1A 5E0RA 4NRAA 5CQTA 5E7DA 5EPRA 5EQ1A 5EI4A 5L98A 5EP7A 4LRGA 2D82A 2F6NA 3VKGA 5EWDA 5LKTA 3UVWA 5FE4A 5D3LA 4HXPA 1WUMA 4O70A 2L5EA 5E9IA 3U5MA 5TCMA 5FG4A 4MEQA 1PUOA 4E96A 4NUDA 5A7CA 4IR4A 4OGJA 5C87A 5E9MA 2YEKA 4UIXA 2R0SA 2DVQA 5A5RA 4PTBA 5A83A 4BW3A 5F2PA 5KTXA 5D3JA 3D7CA 4YC9A 5ENFA 5CQ6A 3O34A 2OSSA 4X2IA 5EPSA 4A9HA 5F1LA 5A81A 3HMHA 4Z1QA 5ENHA 3U5PA 2R10A 5AMFA 5DKDA 4PKLA 4YADA 5BT4A 4XY8A 4YBSA 5L97A 5FE2A 4TZ8A 4CUSA 3P1EA 5D7XA 3P5OA 5FG5A 4QBMA 5ENJA 2E7NA 5IGNA 2N9GA 4Z93A 4QZSA 4OUFA 4UYHA 5DKCA 4A9MA 4NR6A 5IBNA 3MB3A 5IGLA 4NUCA 2OUOA 4QSWA 4LYWA 4XUAA 4YH4A 4GPJA 4N4FA 5EGUA 3SVGA 1ZS5A 4YYIA 4J3IA 3U5JA 5F5ZA 4N4IA 5HLSA 4QY4A 5DFBA 3Q2EA 4LZ2A 4QSXA 4F3IA 3S91A 5C89A 1WUGA 5DW1A 5DBMA 5LVRA 5ETDA 4TTEA 4ZQLA 5LUUA 3Q2FA 4BW4A 4QYLA 5L96A 3UVXA 4CUTA 4O7FA 4YY4A 3O33A 5IG6A 5LKZA 4LYIA 4YY6A 2R0YA 5ENEA 2E7OA 3UVDA 4TS8A 4ZC9A 4LDFA 4HXNA 2RO1A 3RCWA 5KTWA 3G0JA 4CUPA 5EWWA 3P1CA 4NR5A 4QNSA 5D26A 4O7AA 2EJNA 5DLXA 5JWMA 4MR4A 3UVYA 2DATA 3UV4A 5C7NA 4Y03A 5K29A 4YYDA 2DVRA 3ZYUA 5LKXA 4AKHA 5D3RA 5HRWA 4NR4A 3DWYA 4TU4A 4O76A 4O71A 4TYLA 5BT5A 5CU8A 4NRCA 4BHWA 5A5SA 4YYNA 4NR9A 2YDWA 4YATA 5HQ7A 4UYGA 1JSPB 2L84A 4KCXA 3JVMA 2MJVB 3U5LA
chains in the Genus database with same CATH topology
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