3MQMA

Crystal structure of the bromodomain of human ash1l
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMEVARAARLAQIFKEICDGIISYKDSSRQALAAPLLNLPPKKKNADYYEKISDPLDLITIEKQILTGYYKTVEAFDADMLKVFRNAEKYYGRKSPVGRDVCRLRKAYYNARHEASAQIDEIVGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Probable histone-lysine N-methyltransferase ASH1L
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 126
sequence length 126
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3mqmA00
4QY4A 5IG6A 5KTWA 4ZC9A 5C8GA 5H1TA 5JWMA 5D25A 4QEUA 4IR6A 4NR6A 4Z93A 5D3HA 5A5OA 4HXPA 5CQ5A 4LRGA 3UVDA 5BT5A 4YBSA 5C4QA 5FFWA 4A9FA 5F63A 5E9YA 5DLZA 4MEPA 4QUUA 5L97A 3U5LA 4A9IA 4NR9A 4CUSA 3G0LA 4HXLA 4TYLA 4XUAA 4O7AA 4IR3A 4ALHA 5F36A 3ONIA 5ENJA 5E7DA 5AMFA 4QSVA 4O7EA 4QB3A 5A5PA 5CUAA 4N4GA 3LQHA 5CS8A 2NXBA 2F6NA 4CUUA 3MB3A 1N72A 3U5MA 3S91A 3RCWA 4NR5A 5LJ1A 5CUCA 3I3JA 2D9EA 3U5NA 5C85A 4A9KA 2KTBB 5DBMA 5EV9A 5HRXA 4QR4A 4BW3A 1WUGA 3MUKA 4BJXA 5HFRA 4C67A 5EICA 5ENGA 5FG5A 4YYKA 5II1A 3JVLA 2I8NA 4YY4A 5L8TA 5IGLA 5CUBA 4MENA 4PCEA 5BT4A 5H85A 4UIVA 5D3LA 5HRWA 4YYGA 2WP2A 5FBXA 4YC9A 5KTUA 5DYCA 4UIWA 5I1QA 5ENHA 4OUFA 5DFDA 5EWDA 4QSPA 5A7CA 2H60A 5EWHA 3LQIA 5TB6A 3GG3A 2YQDA 5EPRA 5D0CA 4NXJA 4CURA 3LXJA 1E6IA 2GRCA 4O72A 5E9LA 5ETDA 4CUQA 5IGKA 4O75A 5DLXA 3P1DA 4HBVA 5HENA 4A9EA 5CU8A 4YATA 4NRCA 4NUCA 4BW1A 5ACYA 5IGNA 4HXRA 5FH7A 4LYIA 5F2PA 5EM3A 4BW4A 3JVKA 5FE2A 4QEVA 2D82A 2LSPB 3K2JA 2DWWA 4YAXA 4YY6A 5JI8A 4J0RA 3P5OA 5LJ2A 5LVRA 4IOOA 5LKUA 4QNSA 5A5QA 4UIZA 5A5RA 5EWVA 2RNYA 4LZSA 3U5KA 2YEMA 4UYEA 4Z6IA 4NYVA 4WHUA 5D3JA 4YBTA 4QZSA 4TU4A 5K29A 4PCIA 5DFCA 5DW2A 4CUPA 2F6JA 2OO1A 5E0RA 3UVYA 5FFYA 4LC2A 5EPSA 3D7CA 4QYDA 4KV4A 3U5JA 4QC3A 4BW2A 5CUGA 5FE1A 4NRBA 5J0DA 2RNWA 4Z1QA 4J0SA 4GPJA 4NR4A 5DYAA 4QEWA 5CQ4A 5FG4A 2YYNA 4MEOA 2RS9B 5H1VA 3UV4A 4YYIA 5FE0A 5LKTA 4Q0OA 5CQ8A 3SVHA 4UYFB 5DY7A 5HFQA 5EU1A 4UITA 4MR6A 5D3TA 5HELA 4HBWA 5E3GA 5DFBA 4QC1A 5CTLA 3LQJA 4UYDA 5KO4A 4HBXA 4N4HA 4N4FA 4QSTA 4BHWA 4E96A 5ENBA 4YYNA 5I83A 5HEMA 5EPBA 2YELA 5D3RA 4OGJA 4PTBA 5E9MA 2FSAA 5LUUA 5L8UA 4QR3A 4TZ8A 4CL9A 5HCLA 5I7XA 2G4AA 4WHWA 4QYLA 4TT6A 4N3WA 4CFKA 5FE7A 4J1PA 2E3KA 4DONA 2I7KA 5EWCA 3DWYA 3P1CA 5TCMA 5HJCA 4LYWA 3MQMA 3UVWA 5A82A 3SVFA 3QZVA 3UV2A 5C89A 2L5EA 3IU6A 5HRVA 3HMFA 5D7XA 5CPEA 3SVGA 4NRAA 4QSQA 4QUTA 5DYUA 2L84A 4ZW1A 5A81A 4A9MA 4KCXA 3LJWA 5CFWA 4PY6A 5F3AA 5D3PA 5I80A 3JVJA 4YADA 2R10A 4NQNA 1X0JA 5CZGA 4Y03A 2L85A 4O76A 4PKLA 4XUBA 4YH4A 5F60A 2R0SA 4YYDA 5FE5A 2YW5A 5EQ1A 5CQTA 5CQ7A 4HXOA 4TQNA 3HMHA 5ENIA 1JSPB 5KU3A 4O78A 4CFLA 4A9NA 3Q2EA 5E9KA 5ENEA 3MULA 5CUEA 2R0YA 5FH6A 5I86A 5F1HA 4HXSA 4CLBA 4LZ2A 5C7NA 4QSSA 2DVSA 5ENFA 5E3DA 5CP5A 5FFVA 3NXBA 4NUEA 3O36A 5I7YA 5EA1A 4A9LA 5EK9A 4TZ2A 4IR4A 5DW1A 5LJ0A 5FE3A 3AQAA 3U5OA 4UIYA 4XY8A 2MJVB 4HBYA 4O74A 1ZS5A 4IOQA 3HMEA 5EWWA 5FE8A 4QR5A 5HQ6A 1F68A 4NYXA 5A83A 4A9HA 2RFJA 4IORA 5CQ6A 2R0VA 3P1FA 5CQ3A 5E73A 2E7OA 4QSRA 5EP7A 4UYGA 5KHMA 5IIDA 4UYHA 4UYFA 5BT3A 4TT2A 1EQFA 4NUDA 4O71A 4IR5A 3O34A 5FG6A 1WUMA 4HXMA 4NR7A 4Q0NA 5ENCA 4UIXA 5E9VA 4TU6A 4O7CA 4ZQLA 3UV5A 2DKWA 5LKZA 3P1EA 3UVXA 4J3IA 5FE6A 4X2IA 5F25A 5EVAA 5COIA 5D3SA 3ZYUA 5HM0A 4YK0A 5AD3A 3O35A 5KTXA 5FB0A 3TLPA 3IU5A 2YEKA 4YYMA 5FE4A 4YYJA 4MR4A 5I29A 5A5SA 5C87A 5HQ5A 4LR6A 4CUTA 4YH3A 4O7BA 5A5NA 4Z1SA 3U5PA 5D3NA 4TS8A 5DKDA 4YYHA 5DYXA 3MB4A 4F3IA 5I40A 5IBNA 5G4RA 4C66A 4MEQA 4QBMA 5LVQA 5DKHA 5E9IA 2RNXA 4A9JA 5EISA 4XY9A 3QZTA 3G0JA 2OSSA 4MR5A 5F61A 4A9OA 5CRZA 2WP1A 5D24A 4NYWA 5F5ZA 4O70A 4RVRA 5CRMA 5AMEA 5L96A 5CY9A 2RO1A 5FE9A 2DVRA 4PS5A 2OUOA 4NR8A 4TT4A 5DX4A 5CGPA 4HXNA 5HLSA 4XYAA 5D26A 5I88A 2DATA 3JVMA 4QSWA 5CUDA 5LKXA 4LZRA 4NS5A 5G4SA 3QZSA 4YBMA 2DVQA 4N4IA 4AKNA 5A85A 3S92A 5L98A 5I89A 5EGUA 4QSUA 4NQMA 5HQ7A 4LDFA 2N9GA 2RI7A 3UW9A 4UIUA 2E7NA 5FDZA 5DKCA 4MR3A 5E74A 3DAIA 4KV1A 3FKMX 4Z6HA 4TTEA 2YDWA 5F1LA 5L99A 3O37A 4OGIA 5EI4A 5IGMA 4HXKA 4LYSA 4O77A 5II2A 5F62A 5FH8A 5H1UA 4WIVA 5CQAA 5AD2A 3MXFA 4ALGA 4YABA 4QSXA 1JM4B 3Q2FA 4FLPA 3O33A 3AADA 4O7FA 5FB1A 2DVVA 5ETBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QY4A 5IG6A 5KTWA 4ZC9A 5C8GA 5H1TA 5JWMA 5D25A 4QEUA 4IR6A 4NR6A 4Z93A 5D3HA 5A5OA 4HXPA 5CQ5A 4LRGA 3UVDA 5BT5A 4YBSA 5C4QA 5FFWA 4A9FA 5F63A 5E9YA 5DLZA 4MEPA 4QUUA 5L97A 3U5LA 4A9IA 4NR9A 4CUSA 3G0LA 4HXLA 4TYLA 4XUAA 4O7AA 4IR3A 4ALHA 5F36A 3ONIA 5ENJA 5E7DA 5AMFA 4QSVA 4O7EA 4QB3A 5A5PA 5CUAA 4N4GA 3LQHA 5CS8A 2NXBA 2F6NA 4CUUA 3MB3A 1N72A 3U5MA 3S91A 3RCWA 4NR5A 5LJ1A 5CUCA 3I3JA 2D9EA 3U5NA 5C85A 4A9KA 2KTBB 5DBMA 5EV9A 5HRXA 4QR4A 4BW3A 1WUGA 3MUKA 4AKHA 4BJXA 5HFRA 4C67A 5EICA 5ENGA 5FG5A 4YYKA 5II1A 3JVLA 2I8NA 4YY4A 5L8TA 5IGLA 5CUBA 4MENA 4PCEA 5BT4A 5H85A 4UIVA 5D3LA 5HRWA 4YYGA 2WP2A 5FBXA 4YC9A 5KTUA 5DYCA 4UIWA 5I1QA 5ENHA 4OUFA 5DFDA 5EWDA 4QSPA 5A7CA 2H60A 5EWHA 3LQIA 5TB6A 3GG3A 2YQDA 5EPRA 5D0CA 4NXJA 4CURA 3LXJA 1E6IA 1PUOA 2GRCA 4O72A 5E9LA 5ETDA 4CUQA 5IGKA 4O75A 5DLXA 3P1DA 4HBVA 5HENA 4A9EA 5CU8A 4YATA 4NRCA 4NUCA 4BW1A 5ACYA 5IGNA 4HXRA 5FH7A 4LYIA 5F2PA 5EM3A 4BW4A 3JVKA 5FE2A 4QEVA 2D82A 2LSPB 3K2JA 2DWWA 4YAXA 4YY6A 5JI8A 4J0RA 3P5OA 5LJ2A 5LVRA 4IOOA 5LKUA 4QNSA 5A5QA 4UIZA 5A5RA 5EWVA 2RNYA 4LZSA 3U5KA 2YEMA 4UYEA 4Z6IA 4NYVA 4WHUA 5D3JA 4YBTA 4QZSA 4AKGA 4TU4A 5K29A 4PCIA 5DFCA 5DW2A 4CUPA 2F6JA 2OO1A 5E0RA 3UVYA 5FFYA 4LC2A 5EPSA 3D7CA 4QYDA 4KV4A 3U5JA 4QC3A 4BW2A 5CUGA 5FE1A 4NRBA 5J0DA 2RNWA 4Z1QA 4J0SA 4GPJA 4NR4A 5DYAA 4QEWA 5CQ4A 5FG4A 2YYNA 4MEOA 2RS9B 5H1VA 3UV4A 4YYIA 5FE0A 5LKTA 4Q0OA 5CQ8A 3SVHA 4UYFB 3VKGA 5DY7A 5HFQA 5EU1A 4UITA 4MR6A 5D3TA 5HELA 4HBWA 5E3GA 5DFBA 4QC1A 5CTLA 3LQJA 4UYDA 5KO4A 4HBXA 4N4HA 4N4FA 4QSTA 4BHWA 4E96A 5ENBA 4YYNA 5I83A 5HEMA 5EPBA 2YELA 5D3RA 4OGJA 4PTBA 5E9MA 2FSAA 5LUUA 5L8UA 4QR3A 4TZ8A 4CL9A 5HCLA 5I7XA 2G4AA 4WHWA 4QYLA 4TT6A 4N3WA 4CFKA 5FE7A 4J1PA 2E3KA 4DONA 2I7KA 5EWCA 3DWYA 3P1CA 5TCMA 5HJCA 4LYWA 3MQMA 3UVWA 3D1BA 5A82A 3SVFA 3QZVA 3UV2A 5C89A 2L5EA 3IU6A 5HRVA 3HMFA 5D7XA 5CPEA 3SVGA 4NRAA 4QSQA 4QUTA 5DYUA 2L84A 4ZW1A 5A81A 4A9MA 4KCXA 1ZKRA 3LJWA 5CFWA 4PY6A 5F3AA 5D3PA 5I80A 3JVJA 4YADA 2R10A 4NQNA 1X0JA 5CZGA 4Y03A 3VKHA 2L85A 4O76A 4PKLA 4XUBA 4YH4A 5F60A 2R0SA 4YYDA 5FE5A 2YW5A 5EQ1A 5CQTA 5CQ7A 4HXOA 4TQNA 3HMHA 5ENIA 1JSPB 5KU3A 4O78A 4CFLA 4A9NA 3Q2EA 5E9KA 5ENEA 3MULA 5CUEA 2R0YA 5FH6A 5I86A 5F1HA 4HXSA 4CLBA 4LZ2A 5C7NA 4QSSA 2DVSA 5ENFA 5E3DA 5CP5A 5FFVA 3NXBA 4NUEA 4AKIA 3O36A 5I7YA 5EA1A 4A9LA 5EK9A 4TZ2A 4IR4A 5DW1A 5LJ0A 5FE3A 3AQAA 3U5OA 4UIYA 4XY8A 2MJVB 4HBYA 4O74A 1ZS5A 4IOQA 3HMEA 5EWWA 5FE8A 4QR5A 5HQ6A 1F68A 4NYXA 5A83A 4A9HA 2RFJA 4IORA 5CQ6A 2R0VA 3P1FA 5CQ3A 5E73A 2E7OA 4QSRA 5EP7A 4UYGA 5KHMA 5IIDA 4UYHA 4UYFA 5BT3A 4TT2A 1EQFA 4NUDA 4O71A 4IR5A 3O34A 5FG6A 1WUMA 4HXMA 4NR7A 4Q0NA 5ENCA 3D1DA 4UIXA 5E9VA 4TU6A 2EJNA 4O7CA 4ZQLA 3UV5A 2DKWA 5LKZA 3P1EA 3UVXA 4J3IA 5FE6A 4X2IA 5F25A 5EVAA 5COIA 5D3SA 3ZYUA 5HM0A 4YK0A 5AD3A 3O35A 5KTXA 5FB0A 3TLPA 3IU5A 2YEKA 4YYMA 5FE4A 4YYJA 4MR4A 5I29A 5A5SA 5C87A 5HQ5A 4LR6A 4CUTA 4YH3A 4O7BA 5A5NA 4Z1SA 3U5PA 5D3NA 4TS8A 5DKDA 4YYHA 5DYXA 3MB4A 4F3IA 5I40A 5IBNA 5G4RA 4C66A 4MEQA 4QBMA 5LVQA 5DKHA 5E9IA 2RNXA 4A9JA 5EISA 4XY9A 3QZTA 3G0JA 2OSSA 4MR5A 5F61A 4A9OA 5CRZA 2WP1A 5D24A 4NYWA 5F5ZA 4O70A 4RVRA 5CRMA 3ERRA 5AMEA 5L96A 5CY9A 2RO1A 5FE9A 2DVRA 4PS5A 2OUOA 4NR8A 4TT4A 5DX4A 5CGPA 4HXNA 5HLSA 4XYAA 5D26A 5I88A 2DATA 3JVMA 4QSWA 5CUDA 5LKXA 4LZRA 4NS5A 5G4SA 3QZSA 4YBMA 2DVQA 4N4IA 4AKNA 5A85A 3S92A 5L98A 5I89A 5EGUA 4QSUA 4NQMA 5HQ7A 4LDFA 2N9GA 2RI7A 3UW9A 4UIUA 2E7NA 5FDZA 5DKCA 4MR3A 5E74A 3DAIA 4KV1A 3FKMX 4Z6HA 4TTEA 2YDWA 5F1LA 5L99A 3O37A 4OGIA 5EI4A 5IGMA 4HXKA 4LYSA 4O77A 5II2A 5F62A 5FH8A 5H1UA 4WIVA 5CQAA 5AD2A 3MXFA 4ALGA 4YABA 4QSXA 1JM4B 3Q2FA 4AI6A 4FLPA 3O33A 3AADA 4O7FA 5FB1A 2DVVA 5ETBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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