3MQMA

Crystal structure of the bromodomain of human ash1l
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMEVARAARLAQIFKEICDGIISYKDSSRQALAAPLLNLPPKKKNADYYEKISDPLDLITIEKQILTGYYKTVEAFDADMLKVFRNAEKYYGRKSPVGRDVCRLRKAYYNARHEASAQIDEIVGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Probable histone-lysine N-methyltransferase ASH1L
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 126
sequence length 126
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3mqmA00
4KV1A 5DFDA 5A85A 5LJ1A 3MUKA 5CQ4A 4J3IA 4BW3A 4O74A 3NXBA 2DVRA 5IGNA 3TLPA 5HJCA 5L8TA 5L96A 5DBMA 4N4HA 4CUPA 4QR4A 4YH3A 4QEWA 4YBSA 5I89A 1F68A 4MEOA 3HMFA 5A82A 5CRMA 4HXKA 4O7AA 5HCLA 4YC9A 2YEKA 4CUTA 5E3GA 4QSSA 2RNWA 3LJWA 4MEPA 5D3JA 5LVQA 5C4QA 5G4RA 4NUCA 3UVYA 5C87A 5EK9A 5FBXA 5ETDA 5E74A 5A5OA 5CQ3A 4BJXA 4YH4A 4J0SA 4YK0A 2E7NA 5DW2A 5EWCA 5FFWA 5FE1A 5KO4A 5AD2A 4LZSA 4HBWA 3UVXA 5I88A 2D82A 1WUGA 3U5JA 3K2JA 5A81A 3MULA 5HM0A 2RFJA 5EICA 5JWMA 5LKXA 2OUOA 5D3RA 4HXNA 5KU3A 2R0SA 4DONA 4XYAA 5EPBA 4YYDA 5CQTA 5A7CA 4ZC9A 4HXLA 3U5KA 4XUAA 5E73A 3SVFA 5C85A 5AMEA 3O36A 5F1LA 3LQJA 4QSQA 4NYWA 4HBXA 4UIXA 4A9OA 3DWYA 5BT5A 5DKHA 5CQ5A 5FE5A 5I40A 5EWHA 4NRAA 4HXSA 5KTXA 4BW2A 2RNYA 4YYMA 4AKNA 5CRZA 4IR3A 2RS9B 5DFBA 5CY9A 4QY4A 4QB3A 4LZ2A 4QNSA 3QZVA 4C67A 4QZSA 4A9MA 4MR5A 4Y03A 5ENBA 4O7CA 2F6NA 4HXOA 4LYWA 3U5PA 2DATA 4ALGA 2DWWA 3JVMA 3P5OA 5A5PA 5FB1A 2L5EA 3I3JA 5A5NA 4TTEA 2L84A 4O7FA 4QR3A 4QSXA 5IGLA 3MB4A 5DW1A 3MXFA 1JSPB 2YEMA 4NR5A 5D3LA 3G0JA 5FE9A 4UYGA 5ENGA 5CTLA 5BT3A 4LR6A 1WUMA 4QUTA 5TCMA 4QC3A 5LVRA 4PCIA 5EWDA 2I7KA 5D3NA 4NR7A 3P1DA 3G0LA 4PY6A 4QEUA 3UV4A 5F2PA 5E9LA 3AADA 4YY6A 5LKTA 3LQIA 5HFQA 5DYXA 4YBTA 5F3AA 5F5ZA 4CLBA 4YYJA 5E0RA 5HRVA 4A9FA 5EP7A 5IBNA 4E96A 5I86A 4J1PA 4QYDA 5FE8A 5JI8A 4NS5A 2KTBB 5E7DA 3U5MA 5KTWA 5D25A 5FH7A 4NUEA 3HMHA 4PCEA 4TQNA 5D3TA 4CUUA 4PKLA 5HEMA 4O78A 5DKCA 5DYCA 3S92A 4C66A 4N4GA 4XY9A 4TT2A 5CP5A 4HXMA 5EU1A 4LYSA 3GG3A 5I80A 1ZS5A 4A9IA 5CQ6A 4O75A 4YABA 4YBMA 2G4AA 5DX4A 5HENA 1EQFA 2MJVB 3Q2FA 4GPJA 4Z6HA 4UYFA 3SVHA 4N3WA 3UVDA 4TT4A 4NR9A 5DYUA 4CUQA 2WP1A 3JVKA 4ZQLA 4RVRA 4NR8A 4QBMA 5CQAA 4YYNA 2I8NA 5F25A 2R0YA 5E9MA 4A9KA 5ACYA 4O7BA 2N9GA 4Q0OA 5ENHA 5FB0A 5I83A 3MB3A 5LUUA 4FLPA 5EM3A 4NRBA 5EV9A 4YYIA 5DY7A 5HQ5A 3SVGA 5IIDA 3ONIA 4F3IA 5I7YA 2F6JA 3LQHA 4QUUA 4NQMA 4Q0NA 5FFYA 5C7NA 5CPEA 3P1CA 5ENIA 1E6IA 3UVWA 5ENEA 5F60A 4UIUA 4QSPA 4UIWA 5L97A 2H60A 5C8GA 5FE4A 5CQ8A 4NXJA 5A5SA 4QR5A 5I7XA 2RI7A 4O71A 4YYGA 4LC2A 5F61A 3HMEA 3AQAA 5IG6A 4KV4A 5IGKA 4NYXA 5KHMA 4A9HA 4MR4A 4NQNA 5LKUA 4CL9A 4TT6A 5E9YA 5EA1A 2R0VA 4KCXA 4IR4A 3P1FA 4LYIA 5DLZA 3JVLA 5CQ7A 4OGIA 5ENJA 5HRXA 3UV5A 4NR6A 2RNXA 5FG6A 5FE7A 5LJ0A 4IR5A 1X0JA 5HQ6A 4CUSA 2OSSA 4HBYA 5D3PA 4Z1QA 2WP2A 3DAIA 4UYEA 4QC1A 4Z93A 2YELA 5C89A 5F63A 4TZ2A 4WHWA 3Q2EA 4ZW1A 5FE2A 5ETBA 4MR3A 5J0DA 5D0CA 4CFKA 5FG4A 3IU6A 5HELA 3JVJA 5KTUA 5FH8A 5E3DA 4ALHA 3MQMA 5FG5A 4LZRA 5K29A 5CUDA 5FFVA 3U5LA 5TB6A 4Z1SA 5BT4A 5HFRA 5COIA 4UIYA 4NYVA 5HRWA 5EGUA 4TU4A 4YATA 5CGPA 5D24A 4BW4A 5CU8A 2E7OA 4N4IA 4MEQA 5G4SA 4YADA 5LKZA 4UITA 5H1UA 4UIVA 4J0RA 5EISA 5IGMA 5HQ7A 5I29A 4XUBA 2OO1A 4MR6A 4XY8A 3QZSA 3U5NA 5H1VA 3U5OA 5I1QA 4TZ8A 4YY4A 4O70A 4TU6A 4O72A 5EQ1A 5FE0A 5CFWA 5CZGA 2LSPB 4IORA 4LDFA 3UW9A 4A9EA 4NUDA 4BHWA 5F1HA 4PS5A 5A83A 4LRGA 2DKWA 3D7CA 4NRCA 5A5QA 4YAXA 4O77A 4BW1A 4HXPA 4IOOA 3ZYUA 5E9KA 5E9IA 4A9JA 5DKDA 5EI4A 2R10A 2NXBA 5FE3A 4CFLA 3O35A 5CUEA 4UYFB 5EPSA 2DVSA 2FSAA 4UYDA 5D3HA 4NR4A 3O37A 4UIZA 4QSTA 2GRCA 4WIVA 4TYLA 5HLSA 5CUAA 4QEVA 5II2A 5FDZA 4YYKA 2YW5A 4QSUA 4IR6A 4IOQA 4O7EA 3RCWA 4Z6IA 5CUGA 3FKMX 4QYLA 4WHUA 5D26A 4HXRA 2DVVA 5H1TA 4YYHA 5DLXA 4MENA 2E3KA 3O34A 5AD3A 3S91A 5CS8A 5L8UA 5E9VA 4QSVA 4O76A 1JM4B 5EWWA 2DVQA 3P1EA 4HBVA 5AMFA 5FE6A 2YYNA 5DYAA 1N72A 5EWVA 2L85A 5FH6A 4A9LA 4OGJA 2YDWA 5EPRA 3LXJA 5L99A 2RO1A 5L98A 4UYHA 3IU5A 5CUBA 5D3SA 4QSWA 5H85A 4X2IA 4PTBA 5LJ2A 4CURA 2YQDA 4TS8A 5A5RA 4N4FA 5DFCA 2D9EA 3QZTA 3UV2A 5EVAA 5F36A 3O33A 5CUCA 5ENCA 4OUFA 4QSRA 5II1A 5ENFA 5F62A 4A9NA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KV1A 5DFDA 5A85A 5LJ1A 3MUKA 5CQ4A 4J3IA 4BW3A 4O74A 3NXBA 2DVRA 5IGNA 3TLPA 5HJCA 5L8TA 5L96A 5DBMA 4N4HA 4CUPA 4QR4A 4YH3A 4QEWA 4YBSA 5I89A 1F68A 4MEOA 3HMFA 5A82A 5CRMA 4HXKA 4O7AA 5HCLA 4YC9A 2YEKA 4CUTA 5E3GA 4QSSA 2RNWA 3LJWA 4MEPA 5D3JA 5LVQA 5C4QA 5G4RA 4NUCA 3UVYA 5C87A 5EK9A 5FBXA 5ETDA 5E74A 5A5OA 5CQ3A 4BJXA 4YH4A 4J0SA 4YK0A 2E7NA 5DW2A 5EWCA 5FFWA 5FE1A 5KO4A 5AD2A 4LZSA 4HBWA 3UVXA 5I88A 2D82A 1WUGA 3U5JA 3K2JA 5A81A 3MULA 5HM0A 2RFJA 5EICA 5JWMA 5LKXA 2OUOA 5D3RA 4HXNA 5KU3A 2R0SA 4DONA 4XYAA 5EPBA 4YYDA 5CQTA 5A7CA 4ZC9A 4HXLA 3U5KA 4XUAA 5E73A 3SVFA 5C85A 5AMEA 3O36A 5F1LA 3LQJA 4QSQA 4NYWA 4HBXA 4UIXA 4A9OA 3DWYA 5BT5A 5DKHA 5CQ5A 5FE5A 5I40A 5EWHA 4NRAA 4HXSA 5KTXA 4BW2A 2RNYA 4YYMA 4AKNA 5CRZA 4IR3A 2RS9B 5DFBA 5CY9A 4QY4A 4QB3A 4LZ2A 4QNSA 3QZVA 4C67A 4QZSA 4A9MA 4MR5A 4Y03A 5ENBA 4O7CA 2F6NA 4HXOA 4LYWA 3U5PA 2DATA 4ALGA 2DWWA 3JVMA 3P5OA 5A5PA 5FB1A 2L5EA 3I3JA 5A5NA 4TTEA 2L84A 4O7FA 4QR3A 4QSXA 5IGLA 3MB4A 5DW1A 3MXFA 1JSPB 2YEMA 4NR5A 5D3LA 3G0JA 5FE9A 4UYGA 5ENGA 5CTLA 5BT3A 4LR6A 1WUMA 4QUTA 5TCMA 4QC3A 5LVRA 4PCIA 5EWDA 2I7KA 5D3NA 4NR7A 3P1DA 3G0LA 4PY6A 4QEUA 3UV4A 5F2PA 5E9LA 3AADA 4YY6A 5LKTA 3LQIA 5HFQA 5DYXA 4YBTA 5F3AA 5F5ZA 4CLBA 4YYJA 5E0RA 5HRVA 4A9FA 5EP7A 5IBNA 4E96A 5I86A 4J1PA 4QYDA 5FE8A 5JI8A 4NS5A 2KTBB 5E7DA 3U5MA 5KTWA 5D25A 5FH7A 4NUEA 3HMHA 4PCEA 4TQNA 5D3TA 1PUOA 4CUUA 4PKLA 5HEMA 4O78A 5DKCA 5DYCA 3S92A 4C66A 4N4GA 4XY9A 4TT2A 5CP5A 3D1BA 4HXMA 4AKGA 5EU1A 4LYSA 3GG3A 5I80A 1ZS5A 4A9IA 5CQ6A 4O75A 4YABA 4YBMA 2G4AA 5DX4A 5HENA 1EQFA 2MJVB 3Q2FA 4GPJA 4Z6HA 4UYFA 3SVHA 4N3WA 3UVDA 4TT4A 4NR9A 5DYUA 4CUQA 2WP1A 3JVKA 4ZQLA 4RVRA 4NR8A 4QBMA 5CQAA 4YYNA 2I8NA 5F25A 2R0YA 5E9MA 4A9KA 5ACYA 4O7BA 4AKHA 2N9GA 4Q0OA 5ENHA 5FB0A 5I83A 3MB3A 5LUUA 4FLPA 5EM3A 4NRBA 5EV9A 4YYIA 5DY7A 5HQ5A 3SVGA 5IIDA 3ONIA 4F3IA 5I7YA 2F6JA 3LQHA 4QUUA 4NQMA 4Q0NA 5FFYA 5C7NA 5CPEA 3P1CA 5ENIA 1E6IA 3UVWA 5ENEA 5F60A 4UIUA 4QSPA 4UIWA 5L97A 2H60A 5C8GA 5FE4A 5CQ8A 4NXJA 5A5SA 4QR5A 5I7XA 2RI7A 4O71A 4YYGA 4LC2A 5F61A 3HMEA 3AQAA 5IG6A 4KV4A 5IGKA 4NYXA 5KHMA 2EJNA 4A9HA 4MR4A 4NQNA 5LKUA 4CL9A 4TT6A 5E9YA 5EA1A 2R0VA 4KCXA 4IR4A 3P1FA 4LYIA 5DLZA 3JVLA 5CQ7A 4OGIA 5ENJA 5HRXA 3UV5A 4NR6A 2RNXA 5FG6A 5FE7A 5LJ0A 4IR5A 1X0JA 5HQ6A 4AI6A 4CUSA 3VKHA 2OSSA 4HBYA 5D3PA 4Z1QA 2WP2A 3DAIA 4UYEA 4QC1A 4Z93A 2YELA 5C89A 5F63A 4TZ2A 4WHWA 3Q2EA 4ZW1A 5FE2A 3D1DA 5ETBA 4MR3A 5J0DA 5D0CA 4CFKA 5FG4A 3IU6A 5HELA 3JVJA 5KTUA 5FH8A 5E3DA 4ALHA 3MQMA 5FG5A 4LZRA 5K29A 5CUDA 5FFVA 3U5LA 5TB6A 4Z1SA 5BT4A 5HFRA 5COIA 4UIYA 4NYVA 5HRWA 5EGUA 4TU4A 4YATA 5CGPA 5D24A 4BW4A 5CU8A 2E7OA 4N4IA 4MEQA 5G4SA 4YADA 5LKZA 4UITA 5H1UA 4UIVA 4J0RA 5EISA 5IGMA 5HQ7A 5I29A 4XUBA 2OO1A 4MR6A 4XY8A 3QZSA 3U5NA 5H1VA 3U5OA 5I1QA 4TZ8A 4YY4A 4O70A 3VKGA 4TU6A 4O72A 5EQ1A 5FE0A 5CFWA 5CZGA 2LSPB 4IORA 4LDFA 3UW9A 4A9EA 4NUDA 4BHWA 5F1HA 4PS5A 5A83A 4LRGA 2DKWA 3D7CA 4NRCA 5A5QA 4YAXA 4O77A 4BW1A 4HXPA 4IOOA 3ZYUA 5E9KA 5E9IA 4A9JA 5DKDA 1ZKRA 5EI4A 2R10A 2NXBA 5FE3A 4CFLA 3O35A 5CUEA 4UYFB 5EPSA 2DVSA 2FSAA 4UYDA 5D3HA 4NR4A 3O37A 4UIZA 4QSTA 2GRCA 4WIVA 4TYLA 5HLSA 5CUAA 4QEVA 5II2A 5FDZA 4YYKA 2YW5A 4QSUA 4IR6A 4IOQA 4O7EA 3RCWA 4Z6IA 5CUGA 3FKMX 4QYLA 4WHUA 5D26A 4HXRA 2DVVA 5H1TA 4YYHA 5DLXA 4MENA 2E3KA 3O34A 5AD3A 3S91A 5CS8A 5L8UA 5E9VA 4QSVA 4O76A 1JM4B 5EWWA 2DVQA 3P1EA 4HBVA 5AMFA 5FE6A 4AKIA 2YYNA 5DYAA 1N72A 5EWVA 2L85A 5FH6A 4A9LA 4OGJA 2YDWA 5EPRA 3LXJA 5L99A 2RO1A 5L98A 4UYHA 3IU5A 5CUBA 5D3SA 4QSWA 5H85A 4X2IA 4PTBA 5LJ2A 4CURA 2YQDA 4TS8A 5A5RA 4N4FA 5DFCA 2D9EA 3QZTA 3UV2A 5EVAA 5F36A 3O33A 5CUCA 5ENCA 4OUFA 4QSRA 5II1A 5ENFA 5F62A 3ERRA 4A9NA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH topology
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