3S92A

Crystal structure of the second bromodomain of human brd3 in complex with the inhibitor jq1
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
KLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Unknown function
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
publication title Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD3 in complex with the inhibitor JQ1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3s92A00
5CS8A 5D3SA 5EICA 4LYIA 4DONA 4HXPA 3LXJA 5LKXA 4IOOA 5EV9A 4UYEA 4KCXA 5AD2A 4A9MA 5LKTA 3S91A 5DW2A 5HM0A 2YEKA 5J0DA 4QUUA 3QZSA 3O35A 5CQ6A 3Q2FA 4O7CA 4YYIA 4TTEA 5E7DA 4QUTA 4UIYA 2L85A 4A9FA 4XYAA 3LQJA 5ENEA 5AMEA 3DAIA 2YW5A 3QZVA 3MB3A 5BT5A 5HRWA 4CFKA 5FE9A 2L84A 5FE3A 5HELA 5C87A 5L99A 4TU4A 3QZTA 4QR5A 5ENHA 4O77A 1WUMA 5F36A 5EQ1A 4QSWA 5A81A 3UVDA 4NQMA 2OSSA 4NYXA 4QZSA 5G4SA 5FE2A 4ALGA 4HXMA 3S92A 4PTBA 1EQFA 5BT4A 5CUGA 5FB1A 2N9GA 5EM3A 4HXNA 5KTXA 1F68A 4NRCA 5F1LA 5E9LA 3GG3A 5I88A 4HBVA 4TZ2A 5H1VA 5HEMA 2YDWA 5L8UA 2LSPB 2OO1A 4A9OA 5HLSA 4Q0OA 1JM4B 4YYJA 4YATA 2D82A 5F5ZA 5H1UA 2YYNA 4WHWA 4Z1QA 4N3WA 2YEMA 5A5NA 4YYMA 5CU8A 5AD3A 4UYHA 3JVMA 4TT4A 5CP5A 5C7NA 5D3TA 2RNYA 4QB3A 4QR3A 4XY9A 5D3LA 4UIXA 3SVGA 4HXOA 4Z6IA 4O7EA 5CUCA 5F60A 4BW4A 4ALHA 4NXJA 4LYSA 5LJ1A 5EI4A 3IU5A 5IBNA 3MB4A 5DYUA 4MEQA 3JVJA 5F63A 5E0RA 4TYLA 5KTUA 3G0JA 5EK9A 5H85A 5A5OA 5IGMA 2E3KA 3JVLA 5D0CA 5E9IA 4LZSA 2DWWA 4YY4A 4YAXA 5C85A 3U5OA 1JSPB 4YYGA 4NQNA 2E7OA 3U5KA 5LJ2A 4BW1A 5D3NA 5DLZA 2MJVB 3D7CA 5CUAA 4WHUA 4J0SA 4YBSA 3ONIA 5CUEA 2R0SA 3UV5A 4YYKA 2DVQA 5FE0A 4LRGA 4QSVA 4YH4A 5CTLA 4CUTA 3UV2A 3LQIA 4IR4A 4YYDA 2I8NA 4YBTA 2F6JA 4NS5A 4O71A 3K2JA 5I40A 3UW9A 4MR6A 4HBWA 1ZS5A 2RI7A 4TU6A 1N72A 4PS5A 5I80A 4HXSA 3FKMX 4UITA 1E6IA 5DX4A 4YC9A 5D7XA 5D3PA 2FSAA 4BHWA 2I7KA 5L98A 5DYXA 5EPSA 2RNWA 5DKDA 2WP2A 4CUQA 5E9VA 4J3IA 5DYAA 5DLXA 5CZGA 2DVRA 4QEVA 4TQNA 5E9MA 4QEUA 4QNSA 5EP7A 4LR6A 5CQTA 4IOQA 5IGKA 4UYFB 5A85A 4IR3A 4C67A 4BW2A 4QYLA 4J1PA 5LKUA 4TT6A 5E74A 4QBMA 4CLBA 5DBMA 5E73A 3P5OA 2RFJA 4NYVA 4AKNA 3U5PA 4YABA 4CURA 5DFCA 4NR4A 3U5JA 4QR4A 5E3GA 4F3IA 4QC1A 5CRMA 5HENA 5K29A 5FE6A 3P1CA 4O7BA 1WUGA 5FG5A 4NUDA 3MULA 4HXLA 3JVKA 4MEOA 3O34A 5HQ5A 5HQ7A 5KTWA 3O33A 4MR4A 4NRBA 5HFQA 5LVRA 4IR6A 4UYDA 4Z93A 5FB0A 3UV4A 2GRCA 5HQ6A 2NXBA 5ENBA 5D3JA 4CL9A 2H60A 5I83A 2DKWA 4O70A 5CUBA 4TZ8A 5FG6A 5IG6A 4ZW1A 3AQAA 4IR5A 5I29A 4IORA 4MR3A 4CUSA 5EGUA 4NUCA 5LUUA 2R0YA 5EWHA 4A9EA 5ETBA 4UIVA 3U5LA 5DKCA 4QSXA 5D3RA 5CQ5A 5CY9A 2R0VA 5CUDA 5C89A 2DATA 4N4GA 4ZQLA 4MEPA 5CQAA 4NR5A 3SVFA 3U5MA 4O7FA 5EU1A 5FFWA 5FE7A 4HBYA 5EVAA 5FG4A 3IU6A 4WIVA 5F61A 2WP1A 5CQ7A 5A5PA 4NR8A 5FFVA 4YBMA 4QSTA 5FH8A 5CFWA 5ENGA 4NR7A 5D24A 4UIUA 5FE8A 5I89A 4OGIA 5D26A 4Q0NA 4BJXA 5CQ4A 4YH3A 5C4QA 5F2PA 5II1A 5ENFA 3AADA 4YYNA 5KO4A 4QC3A 5BT3A 5ENIA 2RO1A 5FE5A 5A5QA 3P1EA 5F3AA 4OUFA 5LKZA 5I7YA 5L8TA 5CGPA 5D25A 5D3HA 5E9KA 5L97A 3LJWA 3MXFA 4A9NA 4MENA 4Y03A 3LQHA 5DFDA 4XUBA 5E9YA 4O7AA 5ETDA 2R10A 2YELA 4NUEA 4LYWA 3O37A 4UIZA 5EPRA 4A9JA 5CQ8A 4RVRA 3MUKA 4O74A 2OUOA 4KV4A 5TCMA 4N4HA 4HBXA 5HFRA 5HRXA 3ZYUA 4UYGA 4PCIA 4NYWA 5IGLA 3I3JA 4XY8A 4QSUA 5I7XA 2E7NA 3SVHA 3Q2EA 4C66A 2RS9B 5HRVA 2D9EA 4O78A 4OGJA 5FH7A 5CRZA 4Z1SA 3P1FA 4LZ2A 3NXBA 5F62A 5L96A 5CQ3A 5DY7A 5DFBA 5A5RA 3HMHA 4J0RA 4MR5A 5A5SA 4PCEA 4CUUA 5HCLA 4GPJA 5II2A 5EWVA 5ENCA 3UVXA 4YK0A 5AMFA 5C8GA 5DKHA 4Z6HA 4NR6A 5A7CA 5LJ0A 4QY4A 4FLPA 4LC2A 4QSQA 3O36A 4UIWA 5KU3A 5TB6A 4YY6A 4QSSA 5EWDA 5F1HA 4PY6A 5I86A 4HXKA 5FH6A 4CFLA 5LVQA 5EISA 2KTBB 1X0JA 4HXRA 3U5NA 4O76A 4O72A 5DW1A 5EWWA 3MQMA 4LDFA 5ACYA 5FE4A 3UVYA 5EPBA 5G4RA 5KHMA 4A9IA 3HMFA 3G0LA 5FE1A 2RNXA 4N4IA 5H1TA 5DYCA 5I1QA 3RCWA 4KV1A 2G4AA 4N4FA 4E96A 5COIA 2L5EA 2DVSA 5EA1A 5ENJA 4A9LA 3TLPA 4YADA 4QYDA 4ZC9A 4QEWA 5JI8A 3UVWA 5F25A 4YYHA 4LZRA 5JWMA 5EWCA 5FFYA 2F6NA 4TS8A 5E3DA 5A82A 3P1DA 4QSPA 4NRAA 2DVVA 4TT2A 5HJCA 5CPEA 4PKLA 5FBXA 4X2IA 5IIDA 3DWYA 3HMEA 5FDZA 4UYFA 5A83A 4A9KA 4O75A 4BW3A 5IGNA 4QSRA 4NR9A 4XUAA 4A9HA 2YQDA 4CUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CS8A 5D3SA 5EICA 4LYIA 4DONA 4HXPA 3LXJA 5LKXA 4IOOA 5EV9A 4UYEA 4KCXA 5AD2A 4A9MA 5LKTA 3S91A 5DW2A 5HM0A 2YEKA 5J0DA 4QUUA 3QZSA 3O35A 5CQ6A 3Q2FA 4O7CA 4YYIA 4TTEA 5E7DA 4QUTA 4UIYA 2L85A 4A9FA 4XYAA 3LQJA 5ENEA 5AMEA 3DAIA 2YW5A 3QZVA 3MB3A 5BT5A 5HRWA 4CFKA 5FE9A 2L84A 5FE3A 5HELA 5C87A 5L99A 4TU4A 3QZTA 4QR5A 5ENHA 4O77A 1WUMA 5F36A 1ZKRA 5EQ1A 4QSWA 5A81A 3UVDA 4NQMA 2OSSA 4NYXA 4QZSA 5G4SA 5FE2A 4ALGA 4HXMA 3S92A 4PTBA 1EQFA 5BT4A 5CUGA 3D1DA 5FB1A 2N9GA 5EM3A 4HXNA 5KTXA 1F68A 4NRCA 5F1LA 5E9LA 3GG3A 5I88A 4HBVA 4TZ2A 5H1VA 5HEMA 2YDWA 5L8UA 2LSPB 2OO1A 4A9OA 5HLSA 4Q0OA 1JM4B 4YYJA 4YATA 2D82A 5F5ZA 5H1UA 2YYNA 4WHWA 4Z1QA 4N3WA 4AI6A 2YEMA 5A5NA 4YYMA 5CU8A 5AD3A 4UYHA 3JVMA 4TT4A 5CP5A 5C7NA 5D3TA 2RNYA 4QB3A 4QR3A 4XY9A 5D3LA 4UIXA 3SVGA 4HXOA 4Z6IA 4O7EA 5CUCA 5F60A 4BW4A 4ALHA 4NXJA 4LYSA 5LJ1A 5EI4A 3IU5A 5IBNA 3MB4A 5DYUA 4MEQA 3JVJA 5F63A 5E0RA 4TYLA 5KTUA 3G0JA 5EK9A 5H85A 5A5OA 5IGMA 2E3KA 3JVLA 5D0CA 5E9IA 4LZSA 2DWWA 4YY4A 4YAXA 5C85A 3U5OA 1JSPB 4YYGA 4NQNA 2E7OA 3U5KA 5LJ2A 4BW1A 5D3NA 5DLZA 2MJVB 3D7CA 5CUAA 4WHUA 4J0SA 4YBSA 3ONIA 5CUEA 2R0SA 3UV5A 4AKGA 4YYKA 2DVQA 5FE0A 4LRGA 4QSVA 4YH4A 5CTLA 4CUTA 3UV2A 3LQIA 4IR4A 4YYDA 2I8NA 4YBTA 2EJNA 2F6JA 4NS5A 4O71A 3K2JA 5I40A 3UW9A 4MR6A 4HBWA 1ZS5A 2RI7A 4TU6A 1N72A 4PS5A 4AKIA 5I80A 4HXSA 3FKMX 4UITA 1E6IA 5DX4A 4YC9A 5D7XA 5D3PA 2FSAA 4BHWA 2I7KA 5L98A 5DYXA 5EPSA 2RNWA 5DKDA 2WP2A 4CUQA 5E9VA 4J3IA 5DYAA 5DLXA 5CZGA 2DVRA 4QEVA 4TQNA 5E9MA 4QEUA 4QNSA 5EP7A 4LR6A 5CQTA 4IOQA 5IGKA 4UYFB 5A85A 4IR3A 4C67A 4BW2A 4QYLA 4J1PA 5LKUA 4TT6A 5E74A 4QBMA 4CLBA 5DBMA 5E73A 3P5OA 2RFJA 4NYVA 4AKNA 3U5PA 4YABA 4CURA 5DFCA 4NR4A 3U5JA 3VKHA 4QR4A 5E3GA 4F3IA 4QC1A 5CRMA 5HENA 5K29A 5FE6A 3P1CA 4O7BA 1WUGA 5FG5A 4NUDA 3MULA 4HXLA 3JVKA 4MEOA 3O34A 5HQ5A 5HQ7A 5KTWA 3O33A 4MR4A 4NRBA 5HFQA 5LVRA 4IR6A 4UYDA 4Z93A 5FB0A 3UV4A 2GRCA 5HQ6A 2NXBA 5ENBA 5D3JA 4CL9A 2H60A 5I83A 2DKWA 3VKGA 4O70A 5CUBA 4TZ8A 5FG6A 5IG6A 4ZW1A 3AQAA 4IR5A 5I29A 4IORA 4MR3A 4CUSA 5EGUA 4NUCA 5LUUA 2R0YA 5EWHA 4A9EA 5ETBA 4UIVA 3U5LA 5DKCA 4QSXA 5D3RA 5CQ5A 5CY9A 2R0VA 5CUDA 5C89A 2DATA 4N4GA 4ZQLA 4MEPA 5CQAA 4NR5A 3SVFA 3U5MA 4O7FA 5EU1A 5FFWA 5FE7A 4HBYA 5EVAA 5FG4A 3IU6A 4WIVA 5F61A 2WP1A 5CQ7A 5A5PA 4NR8A 5FFVA 4YBMA 4QSTA 5FH8A 5CFWA 5ENGA 4NR7A 5D24A 4UIUA 5FE8A 5I89A 4OGIA 5D26A 4Q0NA 4BJXA 5CQ4A 4YH3A 5C4QA 5F2PA 5II1A 5ENFA 3AADA 4YYNA 5KO4A 4QC3A 5BT3A 5ENIA 2RO1A 5FE5A 5A5QA 3P1EA 5F3AA 4OUFA 5LKZA 5I7YA 5L8TA 5CGPA 5D25A 5D3HA 5E9KA 5L97A 3LJWA 3MXFA 4A9NA 4MENA 4Y03A 3LQHA 5DFDA 4XUBA 5E9YA 4O7AA 5ETDA 2R10A 2YELA 4NUEA 4LYWA 3O37A 4UIZA 3ERRA 5EPRA 3D1BA 4A9JA 5CQ8A 4RVRA 3MUKA 4O74A 2OUOA 4KV4A 5TCMA 4N4HA 4HBXA 5HFRA 5HRXA 3ZYUA 4UYGA 4PCIA 4NYWA 5IGLA 3I3JA 4XY8A 4QSUA 5I7XA 2E7NA 3SVHA 3Q2EA 4C66A 2RS9B 5HRVA 2D9EA 4O78A 4OGJA 5FH7A 5CRZA 4Z1SA 3P1FA 4LZ2A 3NXBA 5F62A 5L96A 5CQ3A 5DY7A 5DFBA 5A5RA 3HMHA 4J0RA 4MR5A 5A5SA 4PCEA 4CUUA 5HCLA 4GPJA 5II2A 5EWVA 5ENCA 3UVXA 4YK0A 5AMFA 5C8GA 5DKHA 4Z6HA 4NR6A 5A7CA 5LJ0A 1PUOA 4QY4A 4FLPA 4LC2A 4QSQA 3O36A 4UIWA 5KU3A 5TB6A 4YY6A 4QSSA 5EWDA 5F1HA 4PY6A 5I86A 4HXKA 5FH6A 4CFLA 5LVQA 5EISA 2KTBB 1X0JA 4HXRA 3U5NA 4O76A 4O72A 5DW1A 5EWWA 3MQMA 4LDFA 5ACYA 5FE4A 3UVYA 5EPBA 5G4RA 5KHMA 4A9IA 3HMFA 3G0LA 5FE1A 2RNXA 4N4IA 5H1TA 5DYCA 5I1QA 3RCWA 4KV1A 2G4AA 4N4FA 4E96A 5COIA 2L5EA 2DVSA 5EA1A 5ENJA 4A9LA 3TLPA 4YADA 4QYDA 4ZC9A 4AKHA 4QEWA 5JI8A 3UVWA 5F25A 4YYHA 4LZRA 5JWMA 5EWCA 5FFYA 2F6NA 4TS8A 5E3DA 5A82A 3P1DA 4QSPA 4NRAA 2DVVA 4TT2A 5HJCA 5CPEA 4PKLA 5FBXA 4X2IA 5IIDA 3DWYA 3HMEA 5FDZA 4UYFA 5A83A 4A9KA 4O75A 4BW3A 5IGNA 4QSRA 4NR9A 4XUAA 4A9HA 2YQDA 4CUPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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