2DKWA

Solution structure of the bromodomain of human protein kiaa1240
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
131
structure length
131
Chain Sequence
GSSGSSGNTLRELRLFLRDVTKRLATDKRFNIFSKPVSDYLEVIKEPMDLSTVITKIDKHNYLTAKDFLKDIDLICSNALEYNPDKDPGDKIIRHRACTLKDTAHAIIAAELDPEFNKLCEEIKESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution structure of the bromodomain of human protein KIAA1240
rcsb
molecule keywords hypothetical protein KIAA1240
molecule tags Gene regulation
source organism Homo sapiens
total genus 32
structure length 131
sequence length 131
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2dkwA00
5LVQA 5HJCA 4HXPA 5FE9A 5HFQA 4N4HA 5ENIA 5I7XA 5ENCA 5DKCA 4CFKA 5EICA 5EPSA 4J0SA 3U5NA 5F1LA 3LJWA 3SVGA 3UVDA 4O7EA 4Q0OA 4QSQA 5D3RA 4E96A 2F6JA 5A83A 5HENA 4RVRA 5EK9A 4YBMA 4LDFA 4TT6A 3NXBA 4N4FA 4WIVA 5D3HA 4XUAA 4BW4A 5CRZA 5DW1A 4CUUA 4NRBA 3S92A 4C66A 5EA1A 5AD2A 4KV1A 2E3KA 4QSVA 4YYDA 4HXKA 2E7OA 3SVFA 5E3DA 5AMFA 4QR5A 2OO1A 4TT2A 5ACYA 3UV2A 3DAIA 2D82A 4PCEA 5FFYA 3UW9A 5LKUA 3LQHA 2I7KA 5BT3A 4YYNA 5I29A 5D3PA 5JWMA 4J1PA 5E9KA 3UVYA 4UIWA 4HXSA 5E74A 5G4RA 5H85A 5L98A 5A5RA 4NQMA 4LZRA 4IR3A 4Y03A 5A5SA 5F1HA 4A9LA 5C85A 5IGMA 5CUGA 4A9HA 4TT4A 4CLBA 4NXJA 5D3TA 3MB4A 2YEMA 3FKMX 4HXLA 4NS5A 5DLZA 5EM3A 4YYMA 4YATA 2H60A 3MQMA 2YYNA 2GRCA 4O71A 2RS9B 3AQAA 3MB3A 3IU5A 4WHWA 3UV5A 5CTLA 5CQ5A 3I3JA 5ENFA 2E7NA 5G4SA 5TB6A 3QZTA 5FB0A 5CQ8A 5FE1A 4A9JA 4NQNA 4BW2A 4LC2A 5FE4A 4UITA 4HXNA 5A85A 4CURA 3QZVA 2G4AA 4AKNA 4MR5A 4TQNA 3ONIA 5DFBA 3U5KA 5DYCA 4UYFA 5CQAA 5FH8A 5I86A 5HQ7A 2D9EA 4Q0NA 3DWYA 5KTXA 5ENEA 4YY4A 4A9NA 5D26A 2OUOA 4HXOA 5DX4A 2RFJA 4QSPA 2LSPB 5BT5A 3LQJA 5HEMA 4LZSA 5A5PA 2DVVA 1ZS5A 4QSWA 3Q2EA 5DYXA 3TLPA 5K29A 2R0SA 2YEKA 4NR5A 2L85A 4QEVA 4IORA 5FE3A 5DYAA 4CUQA 5F5ZA 5IG6A 1EQFA 4Z1SA 4XUBA 4BJXA 4HXMA 5IIDA 5A7CA 3JVKA 5F36A 5D3SA 5I88A 4O78A 5HCLA 1X0JA 4O7CA 4LYIA 5EVAA 5CQ7A 4TU6A 4KV4A 5LKZA 3MULA 4MEOA 5I40A 2L84A 3GG3A 4QEUA 3O35A 5KTUA 5ENGA 5H1VA 4OGIA 5FE6A 5A81A 5F61A 4YYKA 4UIYA 5F63A 3UV4A 4YYIA 5H1UA 5FG4A 4TZ8A 4QSXA 5D0CA 2WP1A 4QY4A 2R10A 4QR3A 4Z93A 4MR3A 3HMHA 5CQ6A 5D3LA 4NYVA 3Q2FA 5DFDA 5F2PA 3K2JA 4OUFA 5A5OA 5EV9A 4NR6A 4UIUA 3AADA 2RNYA 5E9YA 4CFLA 4PY6A 5HLSA 2DATA 3JVJA 4NRAA 5L97A 5HQ6A 4O7BA 5LVRA 2RI7A 4QBMA 1N72A 3G0LA 4ZC9A 4ALHA 3P1FA 4NR9A 4QSUA 5DKDA 5FB1A 5HQ5A 4NUCA 5IGKA 5A5NA 5JI8A 4YYGA 4N4IA 4CUTA 3G0JA 2RNXA 3MUKA 2DVQA 5CS8A 5D25A 5EWHA 5IGNA 4WHUA 4Z6HA 1F68A 4XY9A 4HBVA 5A82A 2RO1A 4A9KA 4TU4A 5ENJA 4IR5A 4MEQA 5HRWA 5I7YA 4TZ2A 2L5EA 4NYXA 4LR6A 3O34A 4KCXA 5CRMA 5DBMA 5KHMA 5CUBA 2R0VA 4OGJA 5F3AA 4NR8A 5D24A 5E0RA 5FH7A 3HMEA 2KTBB 4IOOA 4DONA 5D3JA 4PS5A 3ZYUA 4YYJA 5DFCA 5COIA 3IU6A 5KU3A 2OSSA 5L8UA 4O76A 2I8NA 5F25A 5FE0A 5FE2A 4O72A 4YBTA 4UYEA 4QUUA 5CFWA 5H1TA 4IR6A 4XY8A 4C67A 4QYDA 4LZ2A 4X2IA 4YBSA 5E3GA 5LUUA 5FG6A 3S91A 4TS8A 4QYLA 3QZSA 5E9MA 5EWWA 4A9OA 5FDZA 4F3IA 4QSSA 5CQTA 3D7CA 5D3NA 4NRCA 5FBXA 5ETDA 2YDWA 4QZSA 5FFWA 5TCMA 4NR7A 4TTEA 4HXRA 5EWDA 5ENBA 5HRXA 5LKTA 2WP2A 2DVSA 5C87A 5E73A 3LXJA 5ETBA 4YABA 2YW5A 3LQIA 2N9GA 4UIXA 4BW1A 2RNWA 5CZGA 2MJVB 4UIZA 5CGPA 4FLPA 5L8TA 4MENA 5FG5A 3P1DA 5CUAA 3MXFA 5CUEA 4YAXA 5C4QA 5DYUA 2DVRA 3U5LA 5C89A 4XYAA 5I89A 5C8GA 5I1QA 4YY6A 5L99A 3P5OA 5BT4A 5HFRA 5FE8A 5I83A 4J0RA 4ALGA 5EGUA 4ZW1A 5F62A 4YH3A 4N3WA 4QSRA 4A9MA 4QB3A 4LRGA 3SVHA 5E7DA 4QUTA 4CL9A 4O77A 3P1EA 4QEWA 3O37A 4J3IA 4IR4A 3P1CA 4PCIA 4YADA 5II2A 5LJ2A 1JM4B 3HMFA 2YELA 5ENHA 5DLXA 2YQDA 5IGLA 4CUSA 4NUEA 4YC9A 5HRVA 4O70A 4UIVA 4CUPA 1E6IA 5E9IA 5EWCA 5EU1A 4HBWA 5I80A 4NR4A 5AMEA 5FE5A 4HBXA 5LKXA 1JSPB 3JVMA 4MEPA 4NUDA 5EWVA 4LYWA 3JVLA 4O7AA 5KTWA 5J0DA 4YH4A 4UYGA 4Z1QA 3RCWA 5HM0A 4O74A 4MR6A 4IOQA 4BHWA 4BW3A 4PKLA 4UYDA 4QC1A 5CP5A 4MR4A 5DY7A 5LJ0A 2DKWA 1WUGA 5EPBA 5A5QA 4QR4A 4O7FA 5EP7A 4HBYA 5EQ1A 5E9LA 2FSAA 1WUMA 4TYLA 2F6NA 3U5JA 5CUDA 4UYHA 5CPEA 5EI4A 5CY9A 3O33A 5FE7A 4GPJA 5D7XA 5CU8A 4QNSA 5HELA 5KO4A 4UYFB 3O36A 4NYWA 5IBNA 4A9EA 5F60A 4YYHA 4A9IA 5L96A 3UVXA 4O75A 2R0YA 4QSTA 5FH6A 5II1A 4LYSA 5AD3A 5CQ4A 5LJ1A 5E9VA 3U5PA 5CUCA 5EPRA 2NXBA 4PTBA 4A9FA 4ZQLA 5EISA 3U5MA 2DWWA 5FFVA 3U5OA 4YK0A 4N4GA 4QC3A 5DW2A 4Z6IA 3UVWA 5CQ3A 5C7NA 5DKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LVQA 5HJCA 4HXPA 5FE9A 5HFQA 4N4HA 5ENIA 5I7XA 2EJNA 5ENCA 5DKCA 4CFKA 5EICA 5EPSA 4J0SA 3U5NA 5F1LA 3LJWA 3SVGA 3UVDA 4O7EA 4Q0OA 4QSQA 5D3RA 4E96A 2F6JA 5A83A 5HENA 4RVRA 5EK9A 4YBMA 4LDFA 4TT6A 3NXBA 4N4FA 4WIVA 5D3HA 4XUAA 4BW4A 5CRZA 5DW1A 3VKGA 4CUUA 4NRBA 3S92A 4C66A 5EA1A 5AD2A 4KV1A 2E3KA 4QSVA 4YYDA 4HXKA 2E7OA 3SVFA 5E3DA 5AMFA 4QR5A 2OO1A 4TT2A 5ACYA 3UV2A 3DAIA 2D82A 4PCEA 5FFYA 3UW9A 5LKUA 3LQHA 2I7KA 5BT3A 4YYNA 5I29A 5D3PA 5JWMA 4J1PA 5E9KA 3UVYA 4UIWA 4HXSA 5E74A 5G4RA 5H85A 5L98A 5A5RA 4NQMA 4LZRA 4IR3A 4Y03A 5A5SA 5F1HA 4A9LA 5C85A 5IGMA 5CUGA 4A9HA 4TT4A 4CLBA 4NXJA 5D3TA 3MB4A 2YEMA 3FKMX 4HXLA 4NS5A 5DLZA 5EM3A 4YYMA 4YATA 2H60A 3MQMA 2YYNA 2GRCA 4O71A 2RS9B 3AQAA 3MB3A 3VKHA 3IU5A 1ZKRA 4WHWA 3UV5A 5CTLA 5CQ5A 3I3JA 5ENFA 2E7NA 5G4SA 5TB6A 3QZTA 5FB0A 5CQ8A 5FE1A 4A9JA 4NQNA 4BW2A 4LC2A 5FE4A 4UITA 4HXNA 5A85A 4CURA 3QZVA 2G4AA 4AKNA 4MR5A 4TQNA 3ONIA 5DFBA 3U5KA 5DYCA 4UYFA 5CQAA 5FH8A 5I86A 5HQ7A 2D9EA 4Q0NA 3DWYA 5KTXA 5ENEA 4YY4A 4A9NA 5D26A 2OUOA 4HXOA 5DX4A 2RFJA 4QSPA 2LSPB 5BT5A 3LQJA 5HEMA 4LZSA 5A5PA 2DVVA 1ZS5A 4QSWA 3Q2EA 5DYXA 3TLPA 5K29A 2R0SA 2YEKA 4NR5A 2L85A 4QEVA 4IORA 5FE3A 5DYAA 4CUQA 5F5ZA 5IG6A 1EQFA 4Z1SA 4XUBA 4BJXA 4HXMA 5IIDA 5A7CA 3JVKA 5F36A 5D3SA 5I88A 4O78A 5HCLA 1X0JA 4O7CA 4LYIA 5EVAA 4AKHA 5CQ7A 4TU6A 4KV4A 5LKZA 3MULA 4MEOA 5I40A 1PUOA 2L84A 3GG3A 4QEUA 3O35A 5KTUA 5ENGA 5H1VA 4OGIA 5FE6A 5A81A 5F61A 4YYKA 4UIYA 5F63A 3UV4A 4YYIA 5H1UA 5FG4A 4TZ8A 4QSXA 5D0CA 2WP1A 4QY4A 2R10A 4QR3A 4Z93A 4MR3A 3HMHA 5CQ6A 5D3LA 4NYVA 3Q2FA 5DFDA 5F2PA 3K2JA 4OUFA 5A5OA 5EV9A 4NR6A 4UIUA 3AADA 2RNYA 5E9YA 4CFLA 4PY6A 5HLSA 2DATA 3JVJA 4NRAA 5L97A 5HQ6A 4O7BA 5LVRA 2RI7A 4QBMA 1N72A 3G0LA 4ZC9A 4ALHA 3P1FA 4NR9A 4QSUA 5DKDA 5FB1A 5HQ5A 4NUCA 5IGKA 5A5NA 5JI8A 4YYGA 4N4IA 4CUTA 3G0JA 2RNXA 3MUKA 2DVQA 5CS8A 5D25A 5EWHA 5IGNA 4WHUA 4Z6HA 1F68A 4XY9A 4HBVA 5A82A 2RO1A 4A9KA 4TU4A 5ENJA 4IR5A 4MEQA 5HRWA 5I7YA 4TZ2A 2L5EA 4NYXA 4LR6A 3O34A 4KCXA 5CRMA 5DBMA 5KHMA 5CUBA 2R0VA 4OGJA 5F3AA 4NR8A 5D24A 5E0RA 5FH7A 3HMEA 2KTBB 4IOOA 4DONA 5D3JA 4PS5A 3ZYUA 4YYJA 5DFCA 5COIA 3IU6A 5KU3A 2OSSA 5L8UA 4O76A 2I8NA 5F25A 5FE0A 5FE2A 4O72A 4YBTA 4UYEA 4QUUA 5CFWA 5H1TA 4IR6A 4XY8A 4C67A 4QYDA 4LZ2A 4X2IA 4YBSA 5E3GA 5LUUA 5FG6A 3S91A 4TS8A 4QYLA 3QZSA 5E9MA 4AKIA 5EWWA 4A9OA 5FDZA 4F3IA 4QSSA 5CQTA 3D7CA 5D3NA 4NRCA 5FBXA 5ETDA 2YDWA 4QZSA 5FFWA 5TCMA 4NR7A 4TTEA 4HXRA 5EWDA 4AI6A 5ENBA 5HRXA 5LKTA 2WP2A 2DVSA 5C87A 5E73A 3LXJA 5ETBA 4YABA 2YW5A 3LQIA 2N9GA 4UIXA 4BW1A 2RNWA 5CZGA 2MJVB 4UIZA 5CGPA 4FLPA 5L8TA 4MENA 5FG5A 3P1DA 5CUAA 3MXFA 5CUEA 4YAXA 5C4QA 5DYUA 2DVRA 3U5LA 5C89A 4XYAA 5I89A 5C8GA 5I1QA 4YY6A 5L99A 3P5OA 5BT4A 5HFRA 5FE8A 5I83A 4J0RA 4ALGA 5EGUA 4ZW1A 5F62A 4YH3A 4N3WA 4QSRA 4A9MA 4QB3A 4LRGA 3SVHA 5E7DA 4QUTA 4CL9A 4O77A 3P1EA 4QEWA 3O37A 3D1DA 4J3IA 4IR4A 3P1CA 4PCIA 4YADA 5II2A 5LJ2A 1JM4B 3HMFA 2YELA 5ENHA 5DLXA 2YQDA 5IGLA 4CUSA 4NUEA 4YC9A 5HRVA 4O70A 4UIVA 4CUPA 1E6IA 5E9IA 5EWCA 5EU1A 4HBWA 5I80A 4NR4A 5AMEA 5FE5A 4HBXA 5LKXA 1JSPB 3JVMA 4MEPA 4NUDA 5EWVA 4LYWA 3JVLA 4O7AA 5KTWA 5J0DA 4AKGA 4YH4A 4UYGA 4Z1QA 3RCWA 5HM0A 4O74A 4MR6A 4IOQA 4BHWA 4BW3A 4PKLA 4UYDA 4QC1A 5CP5A 4MR4A 5DY7A 5LJ0A 2DKWA 1WUGA 5EPBA 5A5QA 4QR4A 4O7FA 5EP7A 4HBYA 5EQ1A 5E9LA 2FSAA 1WUMA 4TYLA 2F6NA 3U5JA 5CUDA 4UYHA 5CPEA 5EI4A 5CY9A 3O33A 5FE7A 4GPJA 5D7XA 5CU8A 4QNSA 5HELA 5KO4A 4UYFB 3O36A 4NYWA 5IBNA 4A9EA 5F60A 4YYHA 4A9IA 5L96A 3UVXA 4O75A 2R0YA 4QSTA 5FH6A 5II1A 4LYSA 5AD3A 5CQ4A 5LJ1A 5E9VA 3D1BA 3U5PA 5CUCA 5EPRA 2NXBA 4PTBA 4A9FA 4ZQLA 5EISA 3U5MA 2DWWA 5FFVA 3U5OA 3ERRA 4YK0A 4N4GA 4QC3A 5DW2A 4Z6IA 3UVWA 5CQ3A 5C7NA 5DKHA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LVQ A;  5HJC A;  4HXP A;  5FE9 A;  5HFQ A;  4N4H A;  5ENI A;  5I7X A;  5ENC A;  5DKC A;  4CFK A;  5EIC A;  5EPS A;  4J0S A;  3U5N A;  5F1L A;  3LJW A;  3SVG A;  3UVD A;  4O7E A;  4Q0O A;  4QSQ A;  5D3R A;  4E96 A;  2F6J A;  5A83 A;  5HEN A;  4RVR A;  5EK9 A;  4YBM A;  4LDF A;  4TT6 A;  3NXB A;  4N4F A;  4WIV A;  5D3H A;  4XUA A;  4BW4 A;  5CRZ A;  5DW1 A;  4CUU A;  4NRB A;  3S92 A;  4C66 A;  5EA1 A;  5AD2 A;  4KV1 A;  2E3K A;  4QSV A;  4YYD A;  4HXK A;  2E7O A;  3SVF A;  5E3D A;  5AMF A;  4QR5 A;  2OO1 A;  4TT2 A;  5ACY A;  3UV2 A;  3DAI A;  2D82 A;  4PCE A;  5FFY A;  3UW9 A;  5LKU A;  3LQH A;  2I7K A;  5BT3 A;  4YYN A;  5I29 A;  5D3P A;  5JWM A;  4J1P A;  5E9K A;  3UVY A;  4UIW A;  4HXS A;  5E74 A;  5G4R A;  5H85 A;  5L98 A;  5A5R A;  4NQM A;  4LZR A;  4IR3 A;  4Y03 A;  5A5S A;  5F1H A;  4A9L A;  5C85 A;  5IGM A;  5CUG A;  4A9H A;  4TT4 A;  4CLB A;  4NXJ A;  5D3T A;  3MB4 A;  2YEM A;  3FKM X;  4HXL A;  4NS5 A;  5DLZ A;  5EM3 A;  4YYM A;  4YAT A;  2H60 A;  3MQM A;  2YYN A;  2GRC A;  4O71 A; 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