5CUBA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 314268-40-1 (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 314268-40-1 (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cubA00
5C85A 4HBYA 3RCWA 4ALGA 4TU4A 4QEUA 4YYMA 2NXBA 4KV1A 4WHUA 4LYIA 5II2A 5FE4A 2I7KA 2RFJA 5L97A 5LJ0A 5EPBA 5A5SA 5L99A 5LKUA 4X2IA 4QSSA 4O7CA 4HBXA 5DKCA 5A85A 2DVVA 4KV4A 4QSUA 5ACYA 5KTUA 5FE1A 5EWWA 2L85A 3UVYA 5HCLA 3O35A 5L8UA 5E0RA 5I1QA 4HXRA 4TYLA 4IOQA 4TZ8A 4YABA 2I8NA 5LUUA 4QY4A 3P1CA 4YBSA 5FBXA 4YK0A 5CZGA 4YYIA 5I80A 5EVAA 4IR3A 4MEPA 2DVSA 3LQHA 5CP5A 4A9FA 5FE3A 4QSRA 4UYFB 5I88A 2LSPB 4MENA 3G0JA 4HXPA 4N4GA 5CUAA 4O77A 5CQ7A 5EV9A 5A7CA 1N72A 4UYEA 4A9JA 2F6NA 4YADA 4J3IA 5HENA 5I7XA 5LKXA 5LKTA 5HELA 4Z6IA 4A9EA 1JSPB 4NR4A 3JVLA 3MB4A 4YYKA 3U5LA 2DVQA 2GRCA 5EI4A 5H1VA 3Q2FA 4QBMA 5CU8A 4A9LA 3NXBA 4MR5A 4BW2A 4YYGA 4A9NA 4LR6A 5A81A 5AMEA 4NRCA 5CRZA 4E96A 4NYVA 5D3TA 4QR4A 5HFRA 5ETBA 5A5QA 4O7EA 5E3DA 2D82A 5E73A 5CQ6A 5F1HA 2YEKA 5ENIA 5IGNA 5KU3A 4NR5A 5H1UA 4UYFA 5FE6A 4UIVA 4LYWA 4MR4A 4J1PA 5DX4A 5L98A 3ONIA 5DYCA 4YYNA 5KTWA 3UV4A 3GG3A 5CQ3A 3AQAA 4UIYA 3G0LA 4TT4A 2E7OA 5DW1A 5CUGA 4HBVA 4NYWA 5DLZA 5D0CA 5CFWA 3TLPA 5C4QA 5D7XA 5C7NA 4ZQLA 1F68A 3SVHA 3LQIA 3S92A 5AD3A 5LKZA 4XUBA 4UIUA 2WP1A 2R0SA 5IGKA 4BW1A 5EWCA 5DBMA 4O74A 4Y03A 5FE9A 5F3AA 5L96A 4KCXA 5EWVA 5L8TA 1ZS5A 5ENFA 5F60A 4YC9A 4FLPA 5FFVA 4TZ2A 5EICA 4LZRA 1X0JA 4NRAA 5FH8A 4XUAA 5E9YA 5HLSA 4O75A 4IR4A 4QSVA 5D26A 5DW2A 4C66A 5FB1A 5EQ1A 4J0RA 4TT6A 4YBTA 4QNSA 5EM3A 5I40A 4PCIA 2MJVB 4CUUA 5FE8A 5CUCA 4HXOA 2DATA 4Q0OA 5F61A 2F6JA 5EISA 5HQ6A 5D3HA 4LRGA 3U5OA 4CFKA 4RVRA 5CUBA 4NQNA 3JVKA 4NUDA 1WUGA 2DVRA 3P1EA 4UYDA 3K2JA 2YQDA 5II1A 4NR9A 4QC3A 5KHMA 4YAXA 5COIA 5E9LA 5AD2A 4YH3A 4CUTA 2R10A 2DWWA 4O71A 4O78A 4NXJA 5DYUA 4LZ2A 5CUEA 3MULA 4IOOA 4UYGA 2OUOA 5FFYA 3FKMX 5EA1A 5ENBA 5CQTA 3MXFA 3HMFA 5EP7A 3QZTA 5ENGA 5FFWA 4CUQA 4BW4A 3MQMA 4IORA 2YDWA 5ENJA 5I29A 5JWMA 5F62A 5CQ8A 3IU5A 4LC2A 3MB3A 5IBNA 1JM4B 5FG4A 5A82A 5C89A 4NR6A 5EGUA 4TU6A 4HXNA 3UVDA 4O7FA 4CURA 5DFBA 5FB0A 4CFLA 4UIZA 4N4HA 4OUFA 4O7BA 4XY8A 5E9VA 5CRMA 5D3PA 4A9OA 4YH4A 3LXJA 4C67A 3S91A 3DAIA 4QEVA 4O7AA 5EU1A 5A83A 5ENHA 5G4RA 5HQ7A 5A5NA 4N4IA 4HXSA 3P1FA 4BJXA 5CPEA 5E9KA 4NUEA 4NR7A 5H85A 4QUTA 3JVJA 3Q2EA 4QSXA 5FG5A 4YYDA 5C8GA 5E74A 5TCMA 5FE7A 4PCEA 5EPSA 4YY6A 5A5RA 4N3WA 5D25A 4PS5A 5AMFA 5EWHA 5IGMA 5CQ4A 5LVQA 4QC1A 4QSTA 4PKLA 5CY9A 5HEMA 4TT2A 4XY9A 4A9KA 4BW3A 2FSAA 4O76A 2D9EA 5HQ5A 3O37A 5C87A 2KTBB 4YYJA 4NQMA 3I3JA 5ENCA 4UIXA 5HRXA 4O70A 5HRWA 5F25A 4IR6A 2E3KA 5BT4A 2RI7A 4QSWA 4CLBA 5FH7A 4UIWA 4DONA 5G4SA 3MUKA 5BT5A 4PY6A 5LJ2A 5I86A 2RS9B 4NRBA 3JVMA 4QYDA 4PTBA 4UITA 4BHWA 2N9GA 5LVRA 4NR8A 2L84A 5D3SA 5F1LA 4UYHA 4YATA 2RNXA 5IIDA 3UVWA 4CUPA 2YEMA 5HJCA 4HXKA 5BT3A 4WHWA 4QUUA 3UVXA 4ZC9A 3AADA 4ALHA 5I83A 1EQFA 4QSQA 4QSPA 5IGLA 4LDFA 3HMHA 2DKWA 5DFDA 4LYSA 5LJ1A 3LQJA 4GPJA 5TB6A 4OGJA 5ETDA 4HXLA 3DWYA 3UV2A 2L5EA 5FE5A 4A9MA 4F3IA 2WP2A 4HBWA 5EWDA 2YW5A 5DFCA 5F63A 5CUDA 5DY7A 4WIVA 3O34A 5D24A 3U5KA 4MEOA 5FDZA 5FH6A 1WUMA 5E7DA 5A5PA 5FE0A 3SVFA 3UV5A 5HRVA 4OGIA 2H60A 3U5JA 5IG6A 3P5OA 4Z93A 5E9IA 3IU6A 5K29A 4AKNA 3HMEA 5J0DA 2R0YA 5EPRA 2RNYA 4QB3A 4Q0NA 5A5OA 5ENEA 5KO4A 4MR6A 4TS8A 5KTXA 4XYAA 4N4FA 5D3JA 4YBMA 4YYHA 5F2PA 4NYXA 5D3NA 3O36A 2OSSA 5F36A 5E3GA 4Z1SA 1E6IA 3P1DA 4ZW1A 3U5NA 4NS5A 5F5ZA 4CUSA 5CGPA 5DYAA 4O72A 3QZSA 5CS8A 5CQAA 5DLXA 4YY4A 5I89A 4HXMA 3U5MA 3ZYUA 4QR3A 4LZSA 4IR5A 4MR3A 4NUCA 3SVGA 2RO1A 3UW9A 3LJWA 5D3RA 4QR5A 5FG6A 3O33A 5DYXA 5HM0A 2R0VA 5EK9A 4CL9A 4Z6HA 5H1TA 5DKHA 4Z1QA 5HFQA 4A9IA 2YELA 4QYLA 2G4AA 5JI8A 3D7CA 4TTEA 3QZVA 5I7YA 2RNWA 4MEQA 4QZSA 5FE2A 3U5PA 4TQNA 2OO1A 5E9MA 4J0SA 5DKDA 5D3LA 2E7NA 4A9HA 2YYNA 5CTLA 4QEWA 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C85A 4HBYA 3RCWA 4ALGA 4TU4A 4QEUA 4YYMA 2NXBA 4KV1A 4WHUA 4LYIA 5II2A 5FE4A 2I7KA 2RFJA 5L97A 5LJ0A 5EPBA 5A5SA 5L99A 5LKUA 4X2IA 4QSSA 4O7CA 4HBXA 5DKCA 5A85A 2DVVA 4KV4A 4QSUA 5ACYA 5KTUA 5FE1A 5EWWA 2L85A 3UVYA 5HCLA 3O35A 5L8UA 5E0RA 5I1QA 4HXRA 4TYLA 4IOQA 4TZ8A 4YABA 2I8NA 5LUUA 4QY4A 3P1CA 4YBSA 5FBXA 4YK0A 5CZGA 4YYIA 5I80A 5EVAA 4IR3A 4MEPA 2DVSA 3LQHA 5CP5A 4A9FA 5FE3A 4QSRA 4UYFB 5I88A 2LSPB 4MENA 3G0JA 4HXPA 4N4GA 5CUAA 4O77A 5CQ7A 5EV9A 5A7CA 1N72A 4UYEA 4A9JA 2F6NA 4YADA 4J3IA 5HENA 5I7XA 5LKXA 5LKTA 5HELA 4Z6IA 4A9EA 4AI6A 1JSPB 4NR4A 3JVLA 3MB4A 4YYKA 3U5LA 2DVQA 2GRCA 2EJNA 5EI4A 5H1VA 3Q2FA 4QBMA 5CU8A 4A9LA 3NXBA 4MR5A 4BW2A 4YYGA 4A9NA 4LR6A 5A81A 5AMEA 4NRCA 5CRZA 4E96A 4NYVA 5D3TA 4QR4A 5HFRA 5ETBA 5A5QA 4O7EA 5E3DA 2D82A 5E73A 5CQ6A 5F1HA 2YEKA 5ENIA 5IGNA 5KU3A 4NR5A 5H1UA 4UYFA 5FE6A 4UIVA 4LYWA 4MR4A 4J1PA 5DX4A 5L98A 3ONIA 5DYCA 4YYNA 5KTWA 3UV4A 3GG3A 5CQ3A 3AQAA 4UIYA 3G0LA 4TT4A 2E7OA 5DW1A 5CUGA 4HBVA 4NYWA 5DLZA 5D0CA 5CFWA 3TLPA 5C4QA 5D7XA 5C7NA 4ZQLA 1F68A 3SVHA 3LQIA 3S92A 5AD3A 5LKZA 4AKGA 4XUBA 4UIUA 2WP1A 2R0SA 5IGKA 4BW1A 5EWCA 5DBMA 4O74A 4Y03A 5FE9A 5F3AA 5L96A 4KCXA 5EWVA 5L8TA 1ZS5A 5ENFA 5F60A 4YC9A 4FLPA 5FFVA 4TZ2A 5EICA 4LZRA 1X0JA 4NRAA 5FH8A 4XUAA 5E9YA 5HLSA 4O75A 4IR4A 4QSVA 5D26A 5DW2A 4C66A 5FB1A 5EQ1A 4J0RA 4TT6A 4YBTA 4QNSA 5EM3A 5I40A 4PCIA 2MJVB 4CUUA 5FE8A 5CUCA 4HXOA 2DATA 4Q0OA 5F61A 2F6JA 5EISA 5HQ6A 5D3HA 4LRGA 3U5OA 4CFKA 4RVRA 5CUBA 4NQNA 3JVKA 4NUDA 1WUGA 1PUOA 2DVRA 3P1EA 4UYDA 3K2JA 2YQDA 5II1A 4NR9A 4QC3A 5KHMA 4YAXA 5COIA 5E9LA 5AD2A 4YH3A 4CUTA 2R10A 2DWWA 4O71A 4O78A 4NXJA 5DYUA 4LZ2A 5CUEA 3MULA 4IOOA 4UYGA 2OUOA 5FFYA 3FKMX 5EA1A 5ENBA 5CQTA 3MXFA 3HMFA 5EP7A 3QZTA 5ENGA 5FFWA 4CUQA 4BW4A 3MQMA 4IORA 2YDWA 5ENJA 5I29A 5JWMA 5F62A 5CQ8A 3IU5A 4LC2A 3MB3A 5IBNA 1JM4B 5FG4A 5A82A 5C89A 4NR6A 5EGUA 4TU6A 4HXNA 3UVDA 4O7FA 4CURA 5DFBA 5FB0A 4CFLA 4UIZA 4N4HA 4OUFA 4O7BA 4XY8A 5E9VA 5CRMA 5D3PA 4A9OA 4YH4A 3LXJA 4C67A 3S91A 3DAIA 4QEVA 4O7AA 5EU1A 5A83A 5ENHA 5G4RA 5HQ7A 5A5NA 4N4IA 4HXSA 3P1FA 4BJXA 5CPEA 5E9KA 4NUEA 4NR7A 5H85A 4QUTA 3JVJA 3Q2EA 4QSXA 5FG5A 4YYDA 5C8GA 5E74A 5TCMA 5FE7A 4PCEA 5EPSA 4YY6A 5A5RA 4N3WA 5D25A 4PS5A 1ZKRA 5EWHA 5AMFA 5IGMA 5CQ4A 5LVQA 4QC1A 4QSTA 4PKLA 5CY9A 5HEMA 4TT2A 4XY9A 4A9KA 4BW3A 2FSAA 4O76A 2D9EA 5HQ5A 3O37A 5C87A 2KTBB 3D1BA 4NQMA 4YYJA 3I3JA 5ENCA 4UIXA 5HRXA 4O70A 5HRWA 5F25A 4IR6A 2E3KA 5BT4A 2RI7A 4QSWA 4CLBA 5FH7A 4UIWA 4DONA 5G4SA 3MUKA 5BT5A 4PY6A 5LJ2A 5I86A 2RS9B 4NRBA 3JVMA 4QYDA 4PTBA 4UITA 4BHWA 2N9GA 5LVRA 4NR8A 2L84A 5D3SA 5F1LA 4UYHA 4YATA 2RNXA 5IIDA 3UVWA 4CUPA 2YEMA 5HJCA 4HXKA 5BT3A 4WHWA 4QUUA 3UVXA 4ZC9A 3AADA 3ERRA 4ALHA 5I83A 1EQFA 4QSQA 4QSPA 5IGLA 4LDFA 3HMHA 2DKWA 5DFDA 4LYSA 5LJ1A 3LQJA 4GPJA 5TB6A 4OGJA 5ETDA 4HXLA 3DWYA 3UV2A 2L5EA 5FE5A 4A9MA 4F3IA 2WP2A 4HBWA 5EWDA 3VKGA 2YW5A 5DFCA 5F63A 5CUDA 5DY7A 4WIVA 3O34A 5D24A 3U5KA 4MEOA 5FDZA 5FH6A 1WUMA 5E7DA 5A5PA 5FE0A 3SVFA 3UV5A 5HRVA 4OGIA 2H60A 3U5JA 5IG6A 3P5OA 4Z93A 5E9IA 3IU6A 5K29A 4AKNA 3HMEA 5J0DA 2R0YA 5EPRA 2RNYA 4QB3A 4Q0NA 5A5OA 5ENEA 5KO4A 4MR6A 4TS8A 5KTXA 4XYAA 4N4FA 5D3JA 4YBMA 4YYHA 5F2PA 4NYXA 5D3NA 3O36A 2OSSA 5F36A 5E3GA 4Z1SA 4AKHA 1E6IA 3P1DA 4ZW1A 3U5NA 4NS5A 5F5ZA 4CUSA 5CGPA 3VKHA 5DYAA 4O72A 3QZSA 5CS8A 5CQAA 5DLXA 3D1DA 4YY4A 5I89A 4HXMA 3U5MA 3ZYUA 4QR3A 4LZSA 4IR5A 4MR3A 4NUCA 3SVGA 2RO1A 3UW9A 3LJWA 5D3RA 4QR5A 5FG6A 3O33A 5DYXA 5HM0A 2R0VA 5EK9A 4CL9A 4Z6HA 5H1TA 5DKHA 4Z1QA 4AKIA 5HFQA 4A9IA 2YELA 4QYLA 2G4AA 5JI8A 3D7CA 4TTEA 3QZVA 5I7YA 2RNWA 4MEQA 4QZSA 5FE2A 3U5PA 4TQNA 2OO1A 5E9MA 4J0SA 5DKDA 5D3LA 2E7NA 4A9HA 2YYNA 5CTLA 4QEWA 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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