5CUBA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 314268-40-1 (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 314268-40-1 (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cubA00
4XY9A 5I80A 5A82A 5E9YA 5EWDA 5HCLA 4QSXA 5CQ4A 4BW3A 5CZGA 5EK9A 4HXMA 4Z6HA 5H1VA 4IORA 4YYHA 5DFCA 5HFQA 5EQ1A 2FSAA 4BJXA 5F5ZA 4O7EA 5IGMA 3S91A 2RNWA 3G0LA 4NRAA 1WUMA 4TTEA 4NYXA 5CS8A 5LJ0A 3UV4A 5C4QA 4MEOA 4ALHA 4NUEA 5FH7A 4XY8A 5JWMA 1E6IA 5F1HA 5F25A 3IU5A 5CRZA 2I8NA 4YYDA 4NR9A 5KO4A 4CLBA 5F36A 5H85A 3HMEA 4A9KA 5L97A 4LZSA 3U5JA 3U5LA 4YY4A 5G4SA 1JM4B 4O70A 2E7OA 5E0RA 4LR6A 5EPSA 4CUUA 4YBSA 4XUAA 4CUTA 4AKNA 2DVQA 5CQ3A 5FB1A 4YYNA 3LJWA 5EWHA 5ENHA 4J0SA 5CUEA 4C67A 2KTBB 5FE9A 4Q0NA 3Q2FA 4QSVA 5E74A 5F2PA 2RI7A 5FFVA 3ZYUA 5IIDA 3U5OA 4YBTA 5CTLA 4TZ2A 5EWVA 4CURA 2G4AA 5ETBA 4UITA 4CFLA 4QSQA 5FE0A 4KV4A 4TU6A 5DKCA 4PCIA 4ZC9A 2DVVA 5D7XA 4QSPA 4NYWA 4NXJA 5EV9A 5LVRA 5ETDA 5EGUA 3UW9A 4BW4A 5LJ1A 4HXOA 2LSPB 5I1QA 5HJCA 4LRGA 5KU3A 4NQMA 4UYFA 4MR5A 4NR6A 4CFKA 4CUQA 2N9GA 4IR4A 4MEQA 5EP7A 5DX4A 5KTXA 4QEVA 4A9MA 5I7XA 4Z1QA 5D3JA 3MXFA 4LZRA 4LC2A 5EI4A 4QYLA 5FE2A 2RO1A 4MENA 2DVSA 2YEMA 4J1PA 5FH8A 5H1TA 5D3TA 5DW1A 4TU4A 3SVGA 5DYCA 4QEWA 5CQ6A 5FG5A 5CUGA 4IR5A 5FDZA 5FE8A 4QR4A 5LKUA 4A9FA 5L96A 4O77A 4OGJA 4UYFB 5FE6A 4QEUA 2YQDA 5LKZA 5G4RA 4BW2A 5DFBA 4PKLA 5L8TA 3UVDA 4QB3A 2R0YA 2YELA 4UIUA 5F62A 5KHMA 4UIVA 5EM3A 5CQTA 5E73A 4MR6A 4UIZA 5IG6A 3MQMA 4LYSA 4TT2A 5AMFA 4O7AA 5E7DA 5CGPA 4ZQLA 4HXSA 5HEMA 4N4HA 4C66A 5DYAA 3MB3A 4O7CA 5K29A 2D82A 3GG3A 4PCEA 5AD2A 5CFWA 3O33A 3Q2EA 5I86A 5ENGA 4NUDA 2GRCA 4YH4A 4YYJA 5II1A 4HXPA 5EPBA 5II2A 3LQJA 4QSTA 5JI8A 5HFRA 3NXBA 5D25A 4J3IA 4QZSA 3P1FA 3QZVA 5FH6A 3UV5A 5J0DA 2F6JA 5LUUA 4QBMA 5A5NA 3MULA 4XUBA 4YABA 3P5OA 4CL9A 3U5KA 2R0SA 2MJVB 4O78A 4QSWA 4A9JA 3U5NA 5CQ8A 4NYVA 4HXRA 4NR5A 4O71A 4QY4A 5FE4A 5FBXA 5TCMA 5D24A 4A9HA 1N72A 3O34A 4TZ8A 4F3IA 5DKHA 4QC1A 4QR5A 4A9IA 5EVAA 4NR4A 4QSRA 3RCWA 4QC3A 5I29A 4PY6A 5A5PA 4Z6IA 4UYDA 5E3GA 4J0RA 5BT5A 4N4GA 5FG4A 2L84A 5CQ5A 4YATA 5D3NA 4IOQA 3LQHA 2DVRA 5BT3A 4RVRA 5DLXA 3SVHA 1WUGA 3AADA 3QZSA 2H60A 4QSSA 5CUAA 4UIWA 5FE3A 4TT4A 5HRVA 5E9KA 2RNXA 5F63A 2D9EA 4N3WA 3I3JA 4HXNA 5ENCA 3JVJA 3JVKA 3P1CA 4BW1A 5ENEA 4TYLA 5D0CA 5I88A 4YADA 3O36A 5FE7A 2YDWA 4PTBA 4E96A 5HLSA 2DWWA 3LQIA 5CRMA 5DFDA 3UV2A 5A5RA 5HM0A 5FFYA 5D3RA 4HBVA 2OUOA 5D3PA 4KCXA 4YK0A 5E9VA 5A5SA 3JVLA 3FKMX 4QSUA 3O35A 5E3DA 5I7YA 5FG6A 4YY6A 5I40A 2OO1A 4Y03A 3TLPA 5ACYA 4YYGA 5H1UA 5FB0A 4QUTA 4O7FA 3QZTA 5D3LA 5F61A 4Z93A 5KTUA 4UIYA 5I83A 4NRBA 4BHWA 4O72A 3S92A 4O75A 5DW2A 2RNYA 2E3KA 4OGIA 5L98A 5A5QA 5C7NA 2RS9B 3DWYA 4A9OA 2OSSA 3LXJA 3U5PA 5TB6A 4MEPA 4NR7A 2L85A 2E7NA 5CUBA 5CUDA 2DKWA 4UYEA 1X0JA 5IGKA 2YYNA 5ENJA 4HBWA 4YBMA 4WHWA 1EQFA 4TQNA 4N4IA 5HRXA 5CY9A 4CUSA 5L8UA 5D3SA 5DKDA 4YYKA 4HXLA 4IOOA 2I7KA 4NS5A 5A7CA 5F1LA 4YH3A 5EA1A 5E9IA 5EU1A 3K2JA 5DYUA 1JSPB 5A81A 4NRCA 5C87A 5LJ2A 5IGLA 4A9LA 5C85A 4IR6A 4TT6A 5E9MA 4O76A 5ENBA 4HXKA 5C8GA 5CU8A 2WP2A 5A5OA 5CQAA 4QUUA 5FFWA 4X2IA 3P1EA 4FLPA 4A9EA 5CPEA 4MR3A 3U5MA 3DAIA 3JVMA 5EPRA 4XYAA 4NR8A 5LKTA 4LYIA 4N4FA 4WIVA 5E9LA 4PS5A 4QYDA 3UVXA 5EICA 4YYIA 3G0JA 4UYGA 5BT4A 5EISA 5DBMA 5HQ5A 5DY7A 2F6NA 4TS8A 5IBNA 2DATA 4YYMA 5FE1A 2WP1A 2YEKA 2R0VA 4QR3A 5KTWA 5D26A 5EWCA 3MB4A 4ZW1A 5CP5A 5AD3A 5AMEA 5LVQA 5FE5A 4HBYA 5F60A 2R10A 4LDFA 4QNSA 2YW5A 4O7BA 4YC9A 4A9NA 3UVWA 3HMHA 5HQ6A 5A83A 4ALGA 1F68A 3HMFA 3UVYA 5HQ7A 5EWWA 4Z1SA 5L99A 4NUCA 5DYXA 3AQAA 4DONA 4GPJA 4MR4A 4WHUA 5IGNA 4HBXA 5C89A 4NQNA 5HENA 1ZS5A 4CUPA 4LYWA 3IU6A 5F3AA 4UIXA 2RFJA 3MUKA 3O37A 4Q0OA 5LKXA 5HRWA 4YAXA 4UYHA 4LZ2A 3ONIA 5A85A 3SVFA 3P1DA 5DLZA 4OUFA 5I89A 4IR3A 5CQ7A 5CUCA 5D3HA 3D7CA 5COIA 2L5EA 2NXBA 5ENFA 5HELA 4O74A 4KV1A 5ENIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XY9A 5I80A 5A82A 5E9YA 5EWDA 5HCLA 4QSXA 5CQ4A 4BW3A 5CZGA 5EK9A 3ERRA 4HXMA 4Z6HA 5H1VA 4IORA 4YYHA 5DFCA 5HFQA 5EQ1A 2FSAA 4BJXA 5F5ZA 4O7EA 5IGMA 3S91A 2RNWA 3G0LA 4NRAA 1WUMA 4TTEA 4NYXA 5CS8A 5LJ0A 3UV4A 5C4QA 4AKGA 4MEOA 4ALHA 4NUEA 5FH7A 4XY8A 5JWMA 1E6IA 5F1HA 5F25A 3IU5A 5CRZA 2I8NA 4YYDA 4NR9A 5KO4A 4CLBA 5F36A 5H85A 3HMEA 4A9KA 5L97A 4LZSA 3U5JA 3U5LA 4YY4A 5G4SA 1JM4B 4O70A 2E7OA 5E0RA 4LR6A 5EPSA 4CUUA 4YBSA 4XUAA 4CUTA 4AKNA 2DVQA 5CQ3A 5FB1A 4YYNA 3LJWA 5EWHA 5ENHA 4J0SA 5CUEA 4C67A 2KTBB 5FE9A 4Q0NA 3Q2FA 4QSVA 5E74A 5F2PA 3D1DA 2RI7A 5FFVA 3ZYUA 5IIDA 3U5OA 4YBTA 5CTLA 4TZ2A 5EWVA 4CURA 2G4AA 5ETBA 4UITA 4CFLA 4QSQA 5FE0A 4KV4A 4TU6A 5DKCA 4PCIA 4ZC9A 2DVVA 5D7XA 4QSPA 4NYWA 4NXJA 5EV9A 5LVRA 5ETDA 5EGUA 3UW9A 4BW4A 5LJ1A 4HXOA 2LSPB 5I1QA 5HJCA 4LRGA 5KU3A 4NQMA 4UYFA 4MR5A 4NR6A 4CFKA 4CUQA 2N9GA 4IR4A 4MEQA 5EP7A 5DX4A 5KTXA 4QEVA 4A9MA 1ZKRA 5I7XA 4Z1QA 5D3JA 3MXFA 4LZRA 4LC2A 5EI4A 4QYLA 5FE2A 2RO1A 4MENA 2DVSA 2YEMA 4J1PA 5FH8A 5H1TA 5D3TA 5DW1A 4TU4A 3SVGA 5DYCA 4QEWA 5CQ6A 5FG5A 5CUGA 4IR5A 5FDZA 5FE8A 4QR4A 5LKUA 4A9FA 5L96A 4O77A 4OGJA 4UYFB 5FE6A 4QEUA 2YQDA 5LKZA 5G4RA 4BW2A 5DFBA 4PKLA 5L8TA 3UVDA 4QB3A 2R0YA 2YELA 4UIUA 5F62A 5KHMA 4UIVA 5EM3A 5CQTA 5E73A 4MR6A 4UIZA 5IG6A 3MQMA 4LYSA 4TT2A 5AMFA 4O7AA 5E7DA 5CGPA 4ZQLA 4HXSA 5HEMA 4N4HA 4C66A 5DYAA 3MB3A 4O7CA 5K29A 2D82A 3GG3A 4PCEA 5AD2A 5CFWA 3O33A 3Q2EA 5I86A 5ENGA 4NUDA 2GRCA 4YH4A 4YYJA 5II1A 4HXPA 5EPBA 5II2A 3LQJA 4QSTA 5JI8A 5HFRA 3NXBA 5D25A 4J3IA 4QZSA 3P1FA 3QZVA 5FH6A 3UV5A 5J0DA 2F6JA 5LUUA 4QBMA 5A5NA 3MULA 4XUBA 4YABA 3P5OA 4CL9A 3U5KA 2R0SA 2MJVB 4O78A 4QSWA 4A9JA 3U5NA 5CQ8A 4NYVA 4HXRA 4NR5A 4O71A 4QY4A 5FE4A 5FBXA 5TCMA 5D24A 4A9HA 1N72A 3O34A 4TZ8A 4F3IA 5DKHA 4QC1A 4QR5A 4A9IA 5EVAA 3VKHA 4NR4A 4QSRA 3RCWA 4QC3A 5I29A 4PY6A 5A5PA 4Z6IA 4UYDA 5E3GA 4J0RA 5BT5A 4N4GA 5FG4A 2L84A 5CQ5A 2EJNA 4YATA 5D3NA 4IOQA 3LQHA 2DVRA 5BT3A 4RVRA 5DLXA 3SVHA 1WUGA 3AADA 3QZSA 2H60A 4QSSA 5CUAA 4UIWA 5FE3A 4TT4A 5HRVA 5E9KA 2RNXA 5F63A 2D9EA 3D1BA 4N3WA 3I3JA 4HXNA 5ENCA 3JVJA 3JVKA 3P1CA 4BW1A 5ENEA 4TYLA 5D0CA 5I88A 4YADA 3O36A 5FE7A 2YDWA 4PTBA 4E96A 5HLSA 2DWWA 3LQIA 5CRMA 5DFDA 3UV2A 5A5RA 5HM0A 5FFYA 5D3RA 4HBVA 2OUOA 5D3PA 4KCXA 4YK0A 5E9VA 5A5SA 3JVLA 3FKMX 4QSUA 3O35A 5E3DA 5I7YA 5FG6A 4YY6A 5I40A 2OO1A 4Y03A 3TLPA 5ACYA 4YYGA 5H1UA 5FB0A 4QUTA 4O7FA 3QZTA 5D3LA 5F61A 4AI6A 4Z93A 5KTUA 4UIYA 5I83A 4NRBA 4BHWA 4O72A 3S92A 4O75A 5DW2A 2RNYA 2E3KA 4OGIA 5L98A 5A5QA 5C7NA 4AKHA 2RS9B 3DWYA 4A9OA 2OSSA 3LXJA 3U5PA 5TB6A 4MEPA 4NR7A 2L85A 2E7NA 5CUBA 5CUDA 2DKWA 4UYEA 1X0JA 5IGKA 2YYNA 5ENJA 4HBWA 4YBMA 4WHWA 1EQFA 4TQNA 4N4IA 5HRXA 5CY9A 4CUSA 5L8UA 5D3SA 5DKDA 4YYKA 4HXLA 4IOOA 2I7KA 4NS5A 5A7CA 5F1LA 4YH3A 5EA1A 5E9IA 5EU1A 3K2JA 5DYUA 1JSPB 5A81A 4NRCA 5C87A 5LJ2A 5IGLA 4A9LA 5C85A 4IR6A 4TT6A 5E9MA 4O76A 5ENBA 4HXKA 5C8GA 5CU8A 2WP2A 5A5OA 5CQAA 4QUUA 5FFWA 4X2IA 3P1EA 4FLPA 4A9EA 5CPEA 4MR3A 3U5MA 3DAIA 3JVMA 5EPRA 4AKIA 4XYAA 4NR8A 5LKTA 4LYIA 4N4FA 4WIVA 5E9LA 4PS5A 4QYDA 3UVXA 5EICA 4YYIA 3G0JA 4UYGA 5BT4A 5EISA 5DBMA 5HQ5A 5DY7A 2F6NA 4TS8A 5IBNA 2DATA 4YYMA 5FE1A 2WP1A 2YEKA 2R0VA 4QR3A 5KTWA 5D26A 5EWCA 3MB4A 4ZW1A 5CP5A 5AD3A 5AMEA 5LVQA 5FE5A 4HBYA 5F60A 2R10A 4LDFA 4QNSA 2YW5A 4O7BA 4YC9A 4A9NA 3UVWA 3HMHA 5HQ6A 5A83A 4ALGA 1F68A 3HMFA 3UVYA 5HQ7A 5EWWA 4Z1SA 1PUOA 5L99A 4NUCA 5DYXA 3AQAA 4DONA 4GPJA 4MR4A 4WHUA 5IGNA 4HBXA 5C89A 4NQNA 5HENA 1ZS5A 4CUPA 4LYWA 3IU6A 5F3AA 3VKGA 4UIXA 2RFJA 3MUKA 3O37A 4Q0OA 5LKXA 5HRWA 4YAXA 4UYHA 4LZ2A 3ONIA 5A85A 3SVFA 3P1DA 5DLZA 4OUFA 5I89A 4IR3A 5CQ7A 5CUCA 5D3HA 3D7CA 5COIA 2L5EA 2NXBA 5ENFA 5HELA 4O74A 4KV1A 5ENIA
chains in the Genus database with same CATH topology
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