4QUTA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) complexed with histone h4-k(ac)12
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Atad2 is a generalist facilitator of chromatin dynamics in embryonic stem cells.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qutA00
3JVMA 4Z93A 4NUEA 4PY6A 5L8TA 5DY7A 4TZ2A 4YY6A 4HXRA 4NR7A 4YYJA 5CTLA 5I83A 4O77A 5DBMA 4UITA 3G0LA 5F3AA 5IGLA 1ZS5A 4HXLA 5E73A 5D0CA 4NR4A 4A9HA 3FKMX 4CUTA 4LZRA 5AD2A 4IORA 2KTBB 4TT6A 2LSPB 4O71A 4WHWA 2R0YA 3IU5A 4HBWA 5HRXA 4WIVA 4YC9A 4BHWA 5HLSA 5E7DA 5HQ5A 3LJWA 4LYWA 5ENEA 2H60A 5CY9A 5CPEA 4A9JA 4A9EA 4O75A 4O7AA 2DVSA 3U5NA 2DVVA 3SVGA 4TYLA 4LYSA 5CP5A 2I8NA 3U5PA 3UV5A 4BW1A 4BW4A 3U5LA 4YBMA 5E3GA 4LDFA 3P1FA 3NXBA 4GPJA 2MJVB 4LZSA 5CRZA 5LUUA 5FE3A 4UIWA 3O34A 5FE7A 2E7NA 2RNYA 3O37A 5FH7A 4A9LA 3JVJA 2DVQA 4J3IA 5FDZA 5F25A 3ONIA 5D3RA 3SVFA 2DVRA 4IOQA 4NYVA 4YADA 4UYEA 5EP7A 4NR5A 5E0RA 5IGMA 5LVQA 3LQJA 5HFQA 4QR3A 5H1VA 3S92A 5AD3A 2YDWA 5ENIA 5CRMA 3LQIA 5G4RA 5I7XA 4CUPA 2YQDA 3LXJA 2RS9B 2YEKA 4WHUA 5LKUA 4IR6A 5DYCA 3GG3A 4HXKA 4A9NA 5A82A 5LKTA 4LYIA 5EWHA 4C66A 5LKZA 4XUAA 5DLZA 4LRGA 4YY4A 5J0DA 4QR5A 5KTXA 4PCEA 3QZSA 4CFKA 5A5RA 4OGIA 4BW3A 5LVRA 5ACYA 2R10A 5FBXA 4QSUA 5EK9A 4QY4A 5F5ZA 5AMFA 4YYMA 4CUSA 3SVHA 5KU3A 4YYGA 5E9IA 1JSPB 5L96A 4YK0A 5II2A 2WP2A 4N4FA 5A5PA 5D25A 2G4AA 3UVXA 5II1A 5E9LA 5ENFA 4N4IA 4F3IA 4IR4A 4QSXA 3UV2A 5FG6A 5CQ7A 1E6IA 5EPSA 5DFCA 5L98A 5FB0A 4HXOA 5D3LA 5F2PA 4NRAA 5DX4A 2F6JA 2D9EA 3MB4A 5CZGA 5L97A 4UYHA 5E9YA 5BT3A 5HFRA 3O36A 5IGNA 3P1CA 5A81A 1EQFA 4QSSA 4UYGA 5EISA 4MR3A 2RNWA 4NR6A 5EA1A 4UIUA 5EI4A 5H1UA 5LJ1A 4YYKA 2WP1A 5FE9A 4NUDA 4A9IA 5DFBA 4YATA 5HELA 5KTUA 4QSTA 5I40A 5IG6A 5JI8A 5CQTA 5FE0A 4NR9A 5IIDA 5I80A 4O72A 4MR6A 5EWVA 4AKNA 4O76A 5HEMA 4QEWA 4HXSA 4IR3A 5F1LA 4QR4A 4CURA 5HQ6A 4TQNA 5I29A 4LZ2A 4HXNA 3ZYUA 5EGUA 5AMEA 5DYXA 5BT4A 4ALGA 5FE8A 4XY9A 3TLPA 5CS8A 5A7CA 4Z1QA 5CGPA 4E96A 2DATA 2GRCA 4TS8A 5FB1A 5EWWA 3U5OA 2FSAA 2OSSA 5LJ0A 5FH8A 5C7NA 5HRWA 4YAXA 4YYHA 5H85A 4O74A 5HENA 4NR8A 1X0JA 5EWCA 4MEPA 4HXPA 5FFVA 4C67A 5E3DA 4QSQA 3Q2FA 4KV4A 1JM4B 4A9KA 4TU4A 4XY8A 5KHMA 4YBSA 4UYFA 4PKLA 4NXJA 5A5SA 5EU1A 2RO1A 5G4SA 3MQMA 4N4HA 3HMEA 5C4QA 2R0SA 5DKCA 4Z6IA 4OUFA 5CQAA 4J0RA 4QSVA 3UW9A 5ETBA 5FG4A 4DONA 5C8GA 3AQAA 4NYWA 4TT4A 5D7XA 5HQ7A 5CQ8A 4UYFB 5F62A 4HBVA 5A85A 5HM0A 5ENJA 4UIVA 5F60A 5C89A 2YELA 3P1DA 4PTBA 4LR6A 5ENCA 4Y03A 3UVYA 5CQ5A 4QC1A 4TZ8A 5CFWA 5DW1A 2D82A 3MXFA 5EVAA 4ZC9A 5EM3A 5D3TA 4MENA 5L99A 5F1HA 4O70A 3U5KA 3DWYA 4PS5A 5KTWA 5TCMA 5DKDA 5E9MA 4Q0NA 5A5NA 5D26A 5FE4A 5ENHA 4HXMA 4CUQA 5CUBA 4A9OA 3JVLA 4QEUA 5I1QA 5E9KA 4QYDA 4N4GA 2L84A 4NUCA 3K2JA 5DW2A 4NQMA 5FE5A 4NS5A 3RCWA 4BW2A 5CQ6A 4TU6A 4J0SA 1WUGA 4QYLA 5KO4A 4QUUA 3O35A 4IOOA 4O7FA 5TB6A 4NQNA 4TT2A 5H1TA 5EPRA 4YYDA 4KV1A 4YABA 4NYXA 4YYIA 4ZW1A 5FG5A 3QZVA 5DFDA 2E7OA 3JVKA 2E3KA 5F63A 5L8UA 5F36A 5DKHA 5K29A 5FE1A 4IR5A 4CFLA 2RI7A 2L85A 2YYNA 5D3SA 5EICA 5A5QA 3MUKA 5BT5A 2OUOA 3U5JA 4A9MA 4QB3A 4YH3A 5EWDA 3UVDA 3AADA 1N72A 5CUEA 5C87A 4UYDA 3P5OA 4PCIA 4ZQLA 2OO1A 3IU6A 4OGJA 3O33A 4UIYA 2RFJA 1WUMA 4O7BA 5EQ1A 3UVWA 4QC3A 5D3PA 5I88A 4MR4A 5D3HA 5IBNA 4YBTA 4XUBA 4X2IA 2YW5A 4MR5A 4YYNA 2R0VA 4CLBA 5JWMA 4MEQA 3U5MA 4QBMA 5D3JA 4QUTA 3P1EA 5EV9A 5C85A 2NXBA 4ALHA 4O7EA 4LC2A 4XYAA 4QZSA 3I3JA 3MB3A 4Z1SA 5E9VA 3QZTA 2N9GA 4BJXA 4YH4A 4A9FA 5IGKA 5A5OA 5FH6A 5FE6A 3S91A 5DLXA 5COIA 2L5EA 4NRCA 2F6NA 5I7YA 4HBXA 3Q2EA 4J1PA 3HMHA 2YEMA 3DAIA 5CQ4A 5DYUA 4Q0OA 3HMFA 3LQHA 4FLPA 2DKWA 5FFYA 3G0JA 4UIZA 5CUAA 4HBYA 4NRBA 5HRVA 5I86A 4N3WA 4RVRA 5F61A 5I89A 4UIXA 4Z6HA 5ENGA 4O78A 4TTEA 5CUGA 5A83A 5LJ2A 4QNSA 5ETDA 5FFWA 5CU8A 5D24A 4MEOA 2DWWA 5CUDA 4KCXA 5E74A 5ENBA 5CQ3A 2RNXA 1F68A 4QEVA 5D3NA 5FE2A 5DYAA 4O7CA 2I7KA 4QSPA 4QSRA 5HCLA 5LKXA 3UV4A 4QSWA 5CUCA 3MULA 5HJCA 5EPBA 3D7CA 4CL9A 4CUUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JVMA 4Z93A 4NUEA 4PY6A 5L8TA 5DY7A 4TZ2A 4YY6A 4HXRA 4NR7A 4YYJA 5CTLA 5I83A 4O77A 5DBMA 4UITA 3G0LA 5F3AA 5IGLA 1ZS5A 4HXLA 5E73A 5D0CA 4NR4A 4A9HA 3FKMX 4CUTA 4LZRA 5AD2A 4IORA 2KTBB 4TT6A 2LSPB 4O71A 4WHWA 2R0YA 3IU5A 4HBWA 5HRXA 4WIVA 4YC9A 4BHWA 5HLSA 5E7DA 5HQ5A 3LJWA 4LYWA 5ENEA 2H60A 5CY9A 5CPEA 4A9JA 4A9EA 4O75A 4O7AA 2DVSA 3U5NA 2DVVA 3SVGA 4TYLA 4LYSA 5CP5A 2I8NA 3U5PA 3UV5A 4BW1A 4BW4A 3U5LA 4YBMA 5E3GA 4LDFA 3P1FA 3NXBA 4GPJA 2MJVB 4LZSA 5CRZA 5LUUA 5FE3A 4UIWA 3O34A 5FE7A 2E7NA 2RNYA 3O37A 5FH7A 4A9LA 3JVJA 2DVQA 4J3IA 5FDZA 5F25A 3ONIA 5D3RA 3SVFA 2DVRA 4IOQA 4NYVA 4YADA 4UYEA 5EP7A 4NR5A 5E0RA 5IGMA 5LVQA 3LQJA 5HFQA 4QR3A 5H1VA 3S92A 5AD3A 2YDWA 5ENIA 5CRMA 3LQIA 5G4RA 5I7XA 4CUPA 2YQDA 3LXJA 2RS9B 2YEKA 3ERRA 4WHUA 5LKUA 4IR6A 5DYCA 3GG3A 4HXKA 4A9NA 5A82A 1ZKRA 3D1BA 5LKTA 4LYIA 5EWHA 4C66A 5LKZA 4XUAA 5DLZA 4LRGA 4YY4A 5J0DA 4QR5A 5KTXA 4PCEA 3QZSA 4CFKA 5A5RA 4OGIA 4BW3A 5LVRA 5ACYA 2R10A 5FBXA 4QSUA 5EK9A 4QY4A 5F5ZA 5AMFA 4YYMA 4CUSA 3SVHA 5KU3A 4YYGA 5E9IA 1JSPB 5L96A 4YK0A 5II2A 2WP2A 4N4FA 5A5PA 5D25A 2G4AA 3UVXA 5II1A 5E9LA 5ENFA 4N4IA 4F3IA 4IR4A 4QSXA 3UV2A 5FG6A 5CQ7A 1E6IA 5EPSA 5DFCA 5L98A 5FB0A 4HXOA 5D3LA 5F2PA 4NRAA 5DX4A 2F6JA 2D9EA 3MB4A 5CZGA 5L97A 4UYHA 5E9YA 5BT3A 5HFRA 3O36A 5IGNA 3P1CA 5A81A 1EQFA 4QSSA 4UYGA 5EISA 4MR3A 3D1DA 2RNWA 4NR6A 5EA1A 4UIUA 5EI4A 5H1UA 5LJ1A 4YYKA 2WP1A 5FE9A 4NUDA 4A9IA 5DFBA 4YATA 5HELA 5KTUA 4QSTA 5I40A 5IG6A 5JI8A 5CQTA 5FE0A 4NR9A 5IIDA 5I80A 4O72A 4MR6A 5EWVA 4AKNA 4O76A 5HEMA 4QEWA 4HXSA 4IR3A 5F1LA 4QR4A 4CURA 5HQ6A 4TQNA 5I29A 4LZ2A 4HXNA 3ZYUA 5EGUA 5AMEA 5DYXA 5BT4A 4ALGA 5FE8A 4XY9A 3TLPA 5CS8A 5A7CA 4Z1QA 5CGPA 4E96A 2DATA 2GRCA 4AKHA 4TS8A 5FB1A 5EWWA 3U5OA 2FSAA 2OSSA 5LJ0A 5FH8A 5C7NA 5HRWA 4YAXA 4AKGA 4YYHA 5H85A 4O74A 5HENA 4NR8A 1X0JA 5EWCA 4MEPA 4AI6A 4HXPA 5FFVA 4C67A 5E3DA 4QSQA 3Q2FA 4KV4A 1JM4B 3VKHA 4A9KA 4TU4A 4XY8A 5KHMA 4YBSA 4UYFA 4PKLA 4NXJA 5A5SA 5EU1A 2RO1A 5G4SA 3MQMA 4N4HA 3HMEA 5C4QA 2R0SA 5DKCA 4Z6IA 4OUFA 5CQAA 4J0RA 4QSVA 3UW9A 5ETBA 5FG4A 4DONA 5C8GA 3AQAA 4NYWA 4TT4A 5D7XA 5HQ7A 5CQ8A 4UYFB 5F62A 4HBVA 5A85A 5HM0A 5ENJA 4UIVA 5F60A 5C89A 2YELA 3P1DA 4PTBA 4LR6A 5ENCA 4Y03A 3UVYA 5CQ5A 4QC1A 4TZ8A 5CFWA 5DW1A 2D82A 3MXFA 5EVAA 4ZC9A 5EM3A 5D3TA 4MENA 5L99A 5F1HA 4O70A 3U5KA 3DWYA 4PS5A 5KTWA 5TCMA 5DKDA 5E9MA 4Q0NA 5A5NA 5D26A 5FE4A 5ENHA 4HXMA 4CUQA 5CUBA 4A9OA 3JVLA 4QEUA 5I1QA 5E9KA 4QYDA 4N4GA 2L84A 4NUCA 3K2JA 5DW2A 4NQMA 5FE5A 4NS5A 3RCWA 4BW2A 5CQ6A 4TU6A 4J0SA 1WUGA 4QYLA 5KO4A 4QUUA 3O35A 4IOOA 4O7FA 5TB6A 4NQNA 4TT2A 5H1TA 5EPRA 4YYDA 4KV1A 4YABA 4NYXA 4YYIA 4ZW1A 5FG5A 3QZVA 5DFDA 2E7OA 3JVKA 2E3KA 5F63A 5L8UA 5F36A 5DKHA 5K29A 5FE1A 4IR5A 4CFLA 2RI7A 1PUOA 2L85A 2YYNA 5D3SA 5EICA 5A5QA 3MUKA 5BT5A 2OUOA 3U5JA 4A9MA 4QB3A 4YH3A 5EWDA 3UVDA 3AADA 1N72A 5CUEA 5C87A 4UYDA 3P5OA 4PCIA 4ZQLA 2OO1A 3IU6A 4OGJA 3O33A 4UIYA 2RFJA 1WUMA 4O7BA 5EQ1A 3UVWA 4QC3A 5D3PA 5I88A 4MR4A 5D3HA 5IBNA 4YBTA 4XUBA 4X2IA 2YW5A 4MR5A 4YYNA 2R0VA 4CLBA 5JWMA 4MEQA 3U5MA 4QBMA 5D3JA 4QUTA 3P1EA 5EV9A 5C85A 2NXBA 4ALHA 4O7EA 4LC2A 4XYAA 4QZSA 3I3JA 3MB3A 4Z1SA 5E9VA 3QZTA 2N9GA 4BJXA 4YH4A 4A9FA 5IGKA 5A5OA 5FH6A 5FE6A 3S91A 5DLXA 5COIA 2L5EA 4NRCA 2F6NA 5I7YA 4HBXA 3Q2EA 4J1PA 3HMHA 2YEMA 3DAIA 5CQ4A 5DYUA 4AKIA 4Q0OA 3HMFA 3LQHA 4FLPA 2DKWA 5FFYA 3G0JA 4UIZA 5CUAA 4HBYA 4NRBA 5HRVA 5I86A 4N3WA 4RVRA 5F61A 5I89A 4UIXA 4Z6HA 2EJNA 5ENGA 4O78A 4TTEA 5CUGA 5A83A 5LJ2A 3VKGA 4QNSA 5ETDA 5FFWA 5CU8A 5D24A 4MEOA 2DWWA 5CUDA 4KCXA 5E74A 5ENBA 5CQ3A 2RNXA 1F68A 4QEVA 5D3NA 5FE2A 5DYAA 4O7CA 2I7KA 4QSPA 4QSRA 5HCLA 5LKXA 3UV4A 4QSWA 5CUCA 3MULA 5HJCA 5EPBA 3D7CA 4CL9A 4CUUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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