2E7OA

Solution structure of the bromodomain from human bromodomain adjacent to zinc finger domain 2b
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
GSSGSSGDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Dna binding protein
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B
publication title Solution structure of the Bromodomain from human Bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 30
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2e7oA00
5CPEA 4ZC9A 5EK9A 4FLPA 4YY6A 4NUEA 5D3RA 4YC9A 5F5ZA 4O71A 4N4IA 4YYJA 5TB6A 2E7OA 3MULA 4OUFA 5E73A 5FE8A 5CQAA 4Z93A 4WIVA 5CQ8A 3G0LA 4YYHA 5EWWA 4O7EA 4O76A 2NXBA 4A9KA 4PS5A 4WHUA 4ZW1A 5BT4A 5F61A 5EICA 4HBWA 3U5KA 2N9GA 3LJWA 4J3IA 4LR6A 4KCXA 4TQNA 2RNWA 4J0RA 5EPSA 4A9FA 4QSXA 2YELA 5EPBA 4HBXA 4UIZA 3QZVA 5L96A 5ENHA 4IORA 1EQFA 5LVQA 5E74A 5EA1A 4O7CA 4A9NA 5LJ2A 5HQ5A 4LZSA 3HMEA 4IOQA 5I7XA 2R0VA 5CU8A 4IOOA 5CS8A 5EWDA 4YK0A 4O77A 3G0JA 4A9LA 5IGKA 3U5OA 5DKHA 4YBMA 1X0JA 4YBTA 3UVDA 4YYIA 5KTXA 2D82A 5DLXA 1ZS5A 5CQ5A 3LQJA 4HXKA 1E6IA 4NRCA 5IG6A 5DYAA 3P1EA 3QZSA 4O72A 4QB3A 2I7KA 5D7XA 4A9OA 4QUUA 4BW3A 5HM0A 3S92A 4TU6A 3UV5A 4CL9A 5EGUA 5FFVA 1JM4B 2KTBB 4O7AA 5DX4A 5CUAA 4A9HA 5F3AA 4BW2A 5IGNA 5LKTA 3LXJA 4HXMA 3P5OA 5EVAA 4N4GA 3FKMX 3I3JA 5F63A 4YBSA 3MB3A 5CFWA 2RO1A 4UYFA 3S91A 4NR9A 3LQHA 4TZ8A 4LYSA 4UITA 5CRMA 5D24A 5DKDA 5CQ6A 4UIUA 2R10A 3JVJA 4XY9A 4QSRA 5ETBA 5H1VA 3O35A 4CUUA 4YABA 5ENBA 5L97A 5CUBA 5EP7A 3UVXA 4IR6A 5E9KA 3U5NA 4HXOA 1N72A 4MR3A 3QZTA 4MR5A 3UV4A 5KO4A 5EPRA 5H1UA 5DBMA 5HELA 2OUOA 4QYDA 4NR4A 5FBXA 5IGMA 3K2JA 3UVYA 4N4FA 5ACYA 3O34A 5LJ1A 3AADA 3JVKA 4NYXA 4LYWA 4CLBA 5AD3A 5I7YA 2RFJA 3U5LA 4TZ2A 4QZSA 5KTWA 5DLZA 3IU6A 5HRWA 4HXNA 3LQIA 4TYLA 5F1LA 5H1TA 5FE4A 4UYHA 4LC2A 5A5RA 1WUMA 4MEQA 4NQNA 4O74A 5D0CA 5D3SA 4NR5A 5ENFA 5KTUA 5CTLA 4XY8A 3NXBA 4QEVA 4QSWA 3ZYUA 2YEKA 3Q2EA 4QNSA 3TLPA 5JI8A 2G4AA 4E96A 2R0SA 4LZ2A 2WP1A 3JVMA 4QY4A 5CQ7A 5BT5A 5AD2A 5G4SA 5C4QA 5FG5A 4UIYA 5F60A 4O78A 5A5NA 4TT2A 4Z1QA 5I40A 5EQ1A 4NUDA 5KU3A 5D3HA 4CURA 2H60A 5I1QA 4QSTA 4YH3A 5FE5A 4IR5A 5II2A 5C8GA 5HQ7A 5ENIA 3P1FA 2DVSA 4QEUA 4BW1A 2YW5A 4Z1SA 3UW9A 5L98A 3HMFA 4KV4A 1F68A 1JSPB 3O37A 4NR8A 4YY4A 4QR4A 4GPJA 5DYXA 2GRCA 2L5EA 5D25A 2L84A 4UIWA 3IU5A 4C67A 2DVQA 4QSVA 5D26A 5FE1A 4C66A 2DWWA 5DW1A 5G4RA 5LKXA 5CRZA 5D3TA 5FFYA 5LKUA 2RNXA 4Y03A 3HMHA 4UIXA 3AQAA 5CUGA 5EM3A 5CUDA 4NXJA 4HBVA 4ZQLA 4TT6A 5FB0A 3SVHA 4LYIA 2L85A 4UYFB 4J1PA 5L99A 4Z6HA 5HLSA 4QSUA 3RCWA 4OGIA 5FDZA 5FE2A 3DWYA 5DW2A 5A5PA 4LDFA 4NUCA 5L8UA 3O36A 5DKCA 5ETDA 5E0RA 4QSPA 4AKNA 5D3JA 5DFCA 5CZGA 2F6NA 4OGJA 4O7BA 3UV2A 5I88A 5F1HA 4CUTA 3ONIA 5CUEA 4YYKA 4HXLA 4UYEA 5C89A 5LUUA 5H85A 4O70A 4BJXA 4IR4A 5EWCA 5COIA 4YYMA 4MEPA 2MJVB 4HXRA 4NYWA 3MB4A 5FE6A 5FE0A 1WUGA 5E9LA 4A9EA 5FFWA 5DYUA 5A83A 3U5MA 5FH8A 5I89A 5LKZA 5C7NA 5HENA 4TT4A 5D3LA 4NS5A 4PKLA 4YAXA 5A82A 5A85A 4PCEA 4NYVA 3P1DA 4HXPA 5CUCA 5DY7A 3Q2FA 4YATA 4QC3A 4TTEA 4CFKA 4NQMA 4NR7A 5LJ0A 4YYDA 4O7FA 5E3DA 5A81A 4X2IA 4F3IA 5IGLA 5A5SA 5E9VA 4QYLA 2RNYA 2D9EA 4Q0NA 5AMFA 5EWHA 3UVWA 5I83A 4WHWA 2YQDA 5HCLA 5ENJA 3MQMA 3MUKA 2DVVA 4YH4A 4QUTA 5A7CA 4CUSA 2E3KA 5E9MA 5CQ4A 4YYNA 5DYCA 5FE7A 5A5OA 4MEOA 4MR6A 2YDWA 5EU1A 5F36A 4UYGA 3U5JA 4DONA 5CP5A 5FH7A 3P1CA 5D3NA 2FSAA 5CY9A 5ENGA 5C85A 4UYDA 5C87A 4TS8A 5ENEA 3GG3A 4QC1A 5JWMA 4J0SA 4ALHA 4IR3A 5I86A 5EV9A 5CQTA 5D3PA 4LRGA 4HBYA 2I8NA 4RVRA 4XYAA 3JVLA 5EISA 3U5PA 5HJCA 5HEMA 2RS9B 4NRAA 5E9IA 5E7DA 4CFLA 4CUQA 2WP2A 3O33A 5FG6A 5HRVA 4YYGA 5I29A 4XUBA 5F25A 4TU4A 5BT3A 5F62A 5EWVA 5AMEA 2R0YA 4N4HA 4QR3A 5DFDA 4N3WA 5IIDA 4NRBA 2YYNA 5J0DA 4XUAA 4A9IA 5I80A 4HXSA 5DFBA 5FH6A 3MXFA 4LZRA 5HFQA 2LSPB 5HRXA 3SVFA 2OO1A 5KHMA 4PY6A 5E9YA 4QR5A 5HQ6A 5EI4A 2E7NA 2DKWA 4QEWA 5K29A 5F2PA 4Z6IA 5FB1A 5CGPA 4PCIA 5ENCA 4Q0OA 5IBNA 4KV1A 2DVRA 4NR6A 3D7CA 4ALGA 5E3GA 4PTBA 5TCMA 4BHWA 2DATA 4A9JA 3DAIA 2YEMA 4UIVA 2F6JA 5II1A 4CUPA 5L8TA 4YADA 4MR4A 4O75A 2OSSA 4QBMA 4QSSA 5CQ3A 5LVRA 5FG4A 5FE3A 5FE9A 2RI7A 4A9MA 5A5QA 5HFRA 4MENA 4BW4A 3SVGA 4QSQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5CPE A;  4ZC9 A;  5EK9 A;  4FLP A;  4YY6 A;  4NUE A;  5D3R A;  4YC9 A;  5F5Z A;  4O71 A;  4N4I A;  4YYJ A;  5TB6 A;  2E7O A;  3MUL A;  4OUF A;  5E73 A;  5FE8 A;  5CQA A;  4Z93 A;  4WIV A;  5CQ8 A;  3G0L A;  4YYH A;  5EWW A;  4O7E A;  4O76 A;  2NXB A;  4A9K A;  4PS5 A;  4WHU A;  4ZW1 A;  5BT4 A;  5F61 A;  5EIC A;  4HBW A;  3U5K A;  2N9G A;  3LJW A;  4J3I A;  4LR6 A;  4KCX A;  4TQN A;  2RNW A;  4J0R A;  5EPS A;  4A9F A;  4QSX A;  2YEL A;  5EPB A;  4HBX A;  4UIZ A;  3QZV A;  5L96 A;  5ENH A;  4IOR A;  1EQF A;  5LVQ A;  5E74 A;  5EA1 A;  4O7C A;  4A9N A;  5LJ2 A;  5HQ5 A;  4LZS A;  3HME A;  4IOQ A;  5I7X A;  2R0V A;  5CU8 A;  4IOO A;  5CS8 A;  5EWD A;  4YK0 A;  4O77 A;  3G0J A;  4A9L A;  5IGK A;  3U5O A;  5DKH A;  4YBM A;  1X0J A;  4YBT A;  3UVD A;  4YYI A;  5KTX A;  2D82 A;  5DLX A;  1ZS5 A;  5CQ5 A;  3LQJ A;  4HXK A;  1E6I A;  4NRC A;  5IG6 A;  5DYA A;  3P1E A;  3QZS A;  4O72 A;  4QB3 A;  2I7K A;  5D7X A;  4A9O A;  4QUU A;  4BW3 A;  5HM0 A;  3S92 A;  4TU6 A;  3UV5 A;  4CL9 A;  5EGU A;  5FFV A; 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