3Q2FA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with a triazolo ligand
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of the bromodomain of human BAZ2B in complex with a triazolo ligand
rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3q2fA00
4GPJA 5CQ4A 4QSXA 4O7CA 5DFBA 2D82A 5EQ1A 4UYHA 4YYHA 1ZS5A 5CPEA 5C89A 5D3PA 3QZVA 4QSWA 4NR6A 4PTBA 5CQTA 4UITA 4ALGA 5ENHA 5A83A 5HQ5A 5CQ8A 3S92A 4O74A 5BT5A 5CQ7A 3P5OA 5D25A 5L96A 2DKWA 4NS5A 4UIWA 5J0DA 5FE1A 5C4QA 5DYXA 5F25A 5D3NA 5DBMA 5A5NA 5F1HA 5A5OA 5EA1A 3O36A 4IR4A 4QUTA 3U5JA 5FDZA 5FE9A 4HBVA 5DW1A 5I7XA 4HXMA 4YH3A 3U5PA 4ZQLA 5FB1A 4HXRA 4QBMA 3HMHA 4QC1A 4Z1SA 2E7NA 3UW9A 4A9MA 3K2JA 5F36A 3U5KA 4OGJA 5C7NA 5L98A 3LQIA 5D3SA 5HFQA 2F6JA 4J0SA 5AD3A 5D3JA 3MUKA 4A9NA 5EPBA 5IG6A 5HRWA 5CS8A 3LQHA 4KV1A 4IOQA 4NUEA 4NRAA 4NUCA 4MR3A 2G4AA 1JSPB 4OGIA 3HMEA 5DFCA 4QB3A 5DFDA 4WHUA 5HJCA 4HXLA 5TB6A 4YYJA 2RNYA 4BW2A 4XY8A 5DX4A 2NXBA 5DKCA 2RS9B 5CU8A 5DYCA 5FH6A 2YDWA 4UIXA 5L8TA 4YABA 5D3HA 4A9IA 4QZSA 5FFVA 5FH8A 4YC9A 4CUQA 3P1FA 3G0LA 4CUUA 5HQ6A 4TTEA 4HBXA 4XUBA 4A9HA 4CUPA 4HXKA 3MXFA 5EWWA 4Z6HA 5F3AA 5L8UA 5ENFA 4BHWA 4NYWA 4YY6A 2RNXA 5E73A 5IGMA 5CUCA 4QNSA 5BT4A 4O76A 4QEVA 4YYMA 5BT3A 5HEMA 4TZ8A 4IORA 2DVSA 2D9EA 4O7EA 2I8NA 3AADA 5I83A 2LSPB 3MB3A 4NUDA 5LJ2A 5A85A 4A9FA 2KTBB 4YATA 3GG3A 2L84A 5FE2A 5JWMA 3ONIA 4CUSA 4XY9A 5COIA 4QEWA 2OO1A 2L5EA 4Q0NA 4HXOA 4TS8A 5L97A 4BJXA 4UIVA 4BW1A 4Y03A 4QYLA 2DVQA 3P1DA 1N72A 4MR5A 3QZSA 5A5RA 4KCXA 4WIVA 4XUAA 4YH4A 4N4FA 4A9KA 5CP5A 3DAIA 3HMFA 5IBNA 4O7BA 4E96A 5A7CA 4RVRA 3UV2A 5CRMA 4ALHA 5I40A 5KTXA 4QY4A 4CFLA 5DW2A 3Q2FA 3UV4A 4HXPA 4Q0OA 5E3GA 5TCMA 5CQ6A 3U5NA 5C87A 4NYXA 5EI4A 5ENBA 4J0RA 5ETBA 4J3IA 4O7AA 2YQDA 4TZ2A 5H85A 4LZRA 5LKTA 5ETDA 5E9LA 4QR4A 4UYFB 4CL9A 4OUFA 4TT2A 5HFRA 4QC3A 4QR5A 2YW5A 5D26A 2E7OA 4YYNA 4IR6A 5H1TA 3I3JA 5FB0A 5KTWA 1WUMA 4MEPA 5DKDA 3IU6A 5LVRA 5D3TA 5CUGA 5FG4A 5D0CA 3U5LA 2RO1A 3O34A 5FE0A 1JM4B 1E6IA 5II2A 4J1PA 4YYKA 5EWCA 5EU1A 5E74A 3MULA 5EVAA 5CQ3A 4QUUA 4NYVA 5AMFA 2WP1A 5DYAA 3QZTA 5K29A 3IU5A 3JVKA 2YEMA 3UV5A 3G0JA 3AQAA 4QSTA 5LJ0A 4MEQA 3DWYA 5E9KA 5FG5A 5A82A 3JVLA 5EP7A 5EK9A 5I88A 4UYGA 3D7CA 5G4SA 2FSAA 5AD2A 5EM3A 5E9MA 5IIDA 5I80A 5CQ5A 4A9OA 4F3IA 5ENGA 4CUTA 4UYEA 5ENCA 5HRVA 4YAXA 3SVGA 5DYUA 4CFKA 3O37A 3P1EA 4NQMA 4PY6A 3O35A 5C8GA 4LDFA 2RNWA 4IR5A 5FH7A 5F63A 5CTLA 4UIYA 4YYDA 5D7XA 4QSUA 4A9LA 3UVDA 3NXBA 5EWHA 5EPSA 5E7DA 5HELA 4YYIA 5CUBA 4Z6IA 2R0VA 4NR4A 3SVHA 5F5ZA 5LKXA 4BW4A 2H60A 5DLZA 4ZC9A 4TT4A 4UYDA 4UIZA 4PCEA 5FE7A 5EISA 4O7FA 5FFYA 3UVXA 3UVYA 4TU6A 5CY9A 5FE5A 5CFWA 3LQJA 2RI7A 4MR4A 4NRCA 4YY4A 5LKZA 2R10A 5EWDA 5F62A 5EGUA 3O33A 5E9IA 5KU3A 4QSVA 4IR3A 4O71A 5FFWA 3LXJA 5KO4A 2GRCA 5IGKA 5IGLA 4MENA 4UIUA 5ENJA 3SVFA 4A9EA 2DVRA 5F61A 2N9GA 4PKLA 5DLXA 4TQNA 5A81A 5FE4A 3TLPA 5II1A 4N4GA 5EPRA 4WHWA 5H1VA 4LYSA 5CQAA 3JVJA 2OUOA 4ZW1A 5DKHA 5CUAA 2DVVA 5A5QA 4NR9A 4HXNA 4HXSA 4QSSA 5JI8A 2YYNA 2I7KA 2MJVB 4YADA 5HM0A 4NR5A 5CUDA 4CLBA 5I86A 4LR6A 3MB4A 4NQNA 4PS5A 4Z93A 5F1LA 3LJWA 4O72A 4HBWA 4O77A 5FE3A 2E3KA 4LZ2A 4AKNA 5CGPA 3FKMX 5I1QA 4O75A 2YEKA 4TT6A 4YBSA 3P1CA 5LKUA 4LZSA 5LUUA 4QSRA 4TU4A 1X0JA 4DONA 3U5MA 4LC2A 4QSPA 5FE8A 4KV4A 5HENA 4Z1QA 5HRXA 2DATA 2RFJA 5FBXA 4C67A 5I29A 3U5OA 4A9JA 4X2IA 5ENIA 5KHMA 4MEOA 3Q2EA 2DWWA 4NRBA 5CUEA 5E3DA 5KTUA 4YBMA 4QSQA 5HCLA 4LRGA 5EWVA 5FE6A 5D3LA 4NXJA 4QR3A 5I89A 1WUGA 4NR7A 2R0SA 5DY7A 5I7YA 5F2PA 5E9YA 5ENEA 4LYWA 5AMEA 2F6NA 4BW3A 4QYDA 4N4IA 3JVMA 4YYGA 2YELA 4N3WA 5ACYA 4UYFA 5LVQA 4TYLA 3RCWA 3S91A 5E0RA 5A5SA 3UVWA 5F60A 5G4RA 4O78A 5L99A 5EV9A 4CURA 5IGNA 4YBTA 2OSSA 4PCIA 3ZYUA 5H1UA 5D24A 2L85A 4O70A 5LJ1A 4NR8A 4HBYA 2WP2A 2R0YA 3MQMA 1EQFA 5CZGA 4C66A 4IOOA 4XYAA 5EICA 4YK0A 5D3RA 1F68A 4LYIA 5C85A 5HQ7A 5A5PA 5E9VA 4N4HA 5CRZA 5FG6A 5HLSA 4MR6A 4QEUA 4FLPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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