3Q2FA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with a triazolo ligand
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal Structure of the bromodomain of human BAZ2B in complex with a triazolo ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3q2fA00
4MENA 5ENEA 3Q2EA 4NUCA 4O71A 5KHMA 4A9JA 3P5OA 5DY7A 4O7EA 4QBMA 5I88A 5CUGA 5EK9A 3UVWA 4YYHA 1EQFA 4LZSA 5COIA 3ONIA 4RVRA 2YQDA 5LVRA 4BW4A 5FB1A 4C66A 4HXMA 4YBMA 4TQNA 3LQHA 2D82A 5FH6A 4BW1A 5IIDA 4C67A 5EWCA 4UIVA 4IR5A 2R0SA 2N9GA 4IR6A 4Z1SA 2YYNA 4LYIA 5E7DA 5EQ1A 5F2PA 3GG3A 5AD3A 3LQIA 5CZGA 3JVMA 5HRVA 4NUEA 5D25A 5HEMA 5FG6A 5DYAA 1JSPB 4LR6A 4N4IA 3ZYUA 5F5ZA 4O72A 3U5JA 4F3IA 5DYCA 4ZQLA 2F6JA 4XUAA 5EM3A 5EWWA 3MULA 5DFBA 4TT4A 5CUAA 3IU5A 5EU1A 5EP7A 3QZSA 5DLXA 5HELA 2YW5A 4NR4A 3U5LA 5ENGA 4PKLA 4QR5A 5CUCA 5A5RA 4NR8A 4NUDA 4UYGA 5A5QA 5A82A 2E7NA 4HXSA 5E9YA 4NR6A 4PCIA 4CFLA 4UIUA 3UVDA 2YDWA 4NR5A 5D24A 5AMEA 4X2IA 5FG4A 4YYJA 2E3KA 5D26A 5H1TA 5HFQA 5FE1A 5A83A 5ENIA 5C87A 3Q2FA 5DKHA 5FE5A 5FE6A 5I80A 3P1CA 4NRBA 5CP5A 5F60A 1ZS5A 5FE9A 3SVGA 5FE0A 1N72A 4HXPA 4N3WA 4NRCA 4TS8A 4ZC9A 5I7YA 3JVKA 5G4RA 3HMHA 2RI7A 5FFWA 4Y03A 5LKTA 3JVJA 4IORA 5E9IA 5FE8A 4J3IA 4LRGA 5CRMA 4BW3A 4QEUA 5L97A 3O34A 5DLZA 3MXFA 5LUUA 4J0RA 4Z6IA 5FE7A 5IG6A 4TU6A 4TZ2A 4UYHA 4A9IA 5EICA 5HM0A 4UIYA 3SVHA 3FKMX 4J1PA 5E0RA 5LKUA 4YYMA 3O33A 5CQ6A 5BT5A 4NYXA 5AMFA 5FH7A 4E96A 5DBMA 4NYVA 2L85A 4QR4A 5II1A 4Q0NA 4UIZA 3UV4A 5FH8A 5EWVA 4AKNA 5EA1A 5HENA 4OGJA 4LDFA 5D3HA 4NYWA 5D7XA 5ENBA 4IR4A 5HQ6A 2H60A 5ENCA 5F1HA 5D3SA 4MEPA 5IGLA 3P1FA 4NR7A 4QSSA 2L5EA 5CUBA 2DVSA 4CUSA 5FBXA 5A85A 3QZTA 4Q0OA 4BJXA 5CGPA 4IOQA 5D0CA 4WHWA 5HRWA 3AADA 2R0YA 5II2A 5L99A 5CUEA 5D3JA 5FFVA 2D9EA 4Z93A 3IU6A 2RNXA 2RNYA 3U5MA 4CUQA 4HBYA 4YY4A 3I3JA 5G4SA 4PY6A 5LKXA 5A7CA 5LJ1A 2OO1A 3DWYA 4LYSA 4NQMA 5E73A 4OUFA 3MB4A 5E9MA 5CFWA 4XY9A 4YBTA 5DFDA 4YYNA 3O36A 2I8NA 2YEMA 3P1EA 5D3PA 4LZ2A 4UITA 4NR9A 2RNWA 5J0DA 5F62A 5HRXA 4A9EA 5DX4A 4J0SA 3G0LA 2L84A 5D3NA 4QYLA 4CFKA 4O7BA 4TT2A 5HQ5A 5CQ4A 4UYFA 5F3AA 4TU4A 4O70A 4N4GA 4OGIA 5D3TA 5IBNA 2DVRA 2DWWA 4A9NA 2RFJA 4CURA 3S92A 5DYUA 4HXNA 5KU3A 4YC9A 4MEQA 5E9KA 1WUMA 5HJCA 4XYAA 2WP1A 5CS8A 5EGUA 4MR4A 4YYIA 5F1LA 3U5KA 5FFYA 4QY4A 2RS9B 5CQ7A 4LC2A 3UV2A 3S91A 4HXKA 5EI4A 5F36A 5JI8A 5F61A 4BW2A 3TLPA 4A9OA 3O35A 2E7OA 5TB6A 3MUKA 4O76A 3SVFA 3P1DA 4IOOA 5DW2A 3UW9A 4YBSA 3MB3A 4YYDA 3QZVA 5D3LA 5CQ5A 4DONA 4KCXA 5CUDA 5A81A 4QC1A 5IGMA 2LSPB 5E3DA 4A9HA 4CUUA 3LXJA 5DYXA 4LYWA 5EISA 4TYLA 5E9LA 5F63A 3U5OA 4QSQA 5CPEA 5C85A 5LJ2A 4MEOA 1WUGA 3HMEA 3HMFA 3G0JA 4ALGA 5I29A 5HFRA 4UIWA 2OUOA 5I83A 3DAIA 5LJ0A 3U5NA 5ETBA 2YEKA 2F6NA 3D7CA 5L98A 1X0JA 5TCMA 4QEWA 4QSUA 4TT6A 4CUPA 5EWHA 4QSXA 4MR5A 3O37A 5C89A 3UV5A 5DKCA 4QSRA 2DVQA 5ETDA 5I89A 2R0VA 5KTUA 4Z1QA 5E9VA 2YELA 4N4FA 5BT4A 3RCWA 4YYKA 5D3RA 4QB3A 5FE2A 2I7KA 5IGKA 2G4AA 5L8UA 5CY9A 5JWMA 4YAXA 5C7NA 5HCLA 5I86A 4XY8A 2MJVB 5HLSA 5ENHA 4ALHA 4QUUA 5KTWA 2R10A 5DKDA 5A5PA 4BHWA 5I7XA 5FB0A 4ZW1A 4HXLA 5EVAA 4O7CA 2WP2A 1F68A 5FDZA 4PTBA 4MR3A 5CQAA 4O77A 4A9KA 5A5OA 2OSSA 4IR3A 5A5SA 2DKWA 4N4HA 4O75A 5ENFA 4PCEA 4YABA 2RO1A 4UYFB 4QUTA 5AD2A 4UIXA 4QR3A 2FSAA 5K29A 4YY6A 4UYDA 1E6IA 5LVQA 4HBXA 4NQNA 2KTBB 4QSVA 4CL9A 4LZRA 3JVLA 4NRAA 4YATA 4QSWA 4TZ8A 4QNSA 4XUBA 5C8GA 5EWDA 5H85A 2DVVA 3UVXA 5HQ7A 5ACYA 5I40A 5FG5A 4QZSA 4Z6HA 1JM4B 5IGNA 5F25A 5EPBA 3LJWA 4KV4A 5KO4A 5DFCA 5DW1A 5E3GA 5ENJA 4QYDA 5E74A 4HXRA 2DATA 5L96A 5H1VA 3LQJA 5CU8A 5CQ3A 4O7AA 5CQ8A 5EPRA 4NXJA 5CTLA 4O7FA 4A9FA 5L8TA 4A9MA 4MR6A 4UYEA 4QSTA 4FLPA 4QEVA 5CRZA 4HXOA 4HBWA 5CQTA 3NXBA 5FE3A 4O74A 5H1UA 3U5PA 4YK0A 4YH4A 4TTEA 5EV9A 5LKZA 4CUTA 4A9LA 5C4QA 3MQMA 5KTXA 4YH3A 4O78A 2NXBA 3K2JA 5FE4A 4YADA 4GPJA 5A5NA 3UVYA 5BT3A 5I1QA 4CLBA 5EPSA 4WIVA 2GRCA 4QSPA 4KV1A 4NS5A 3AQAA 4PS5A 4HBVA 4YYGA 4QC3A 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MENA 5ENEA 3Q2EA 4NUCA 4O71A 5KHMA 4A9JA 3P5OA 5DY7A 4O7EA 4QBMA 5I88A 5CUGA 5EK9A 3UVWA 4YYHA 1EQFA 4LZSA 5COIA 3ONIA 4RVRA 2YQDA 5LVRA 4BW4A 5FB1A 4C66A 4HXMA 4YBMA 4TQNA 3LQHA 2D82A 5FH6A 4BW1A 5IIDA 4C67A 5EWCA 4UIVA 4IR5A 2R0SA 2N9GA 4IR6A 4Z1SA 2YYNA 4LYIA 5E7DA 5EQ1A 5F2PA 3GG3A 5AD3A 3LQIA 5CZGA 3JVMA 5HRVA 4NUEA 5D25A 5HEMA 5FG6A 5DYAA 1JSPB 4LR6A 4N4IA 3ZYUA 5F5ZA 4O72A 3U5JA 4F3IA 5DYCA 4ZQLA 2F6JA 4XUAA 5EM3A 5EWWA 3MULA 5DFBA 4TT4A 5CUAA 3IU5A 5EU1A 5EP7A 3QZSA 5DLXA 5HELA 2YW5A 4NR4A 3U5LA 5ENGA 4PKLA 4QR5A 5CUCA 5A5RA 4NR8A 4NUDA 4UYGA 5A5QA 5A82A 2E7NA 4HXSA 5E9YA 4NR6A 4PCIA 4CFLA 4UIUA 3UVDA 3ERRA 2YDWA 4NR5A 5D24A 5AMEA 4X2IA 5FG4A 4YYJA 2E3KA 5D26A 5H1TA 5HFQA 5FE1A 5A83A 5ENIA 5C87A 3Q2FA 5DKHA 5FE5A 5FE6A 5I80A 3P1CA 4NRBA 5CP5A 5F60A 1ZS5A 5FE9A 3SVGA 5FE0A 1N72A 4HXPA 4N3WA 4NRCA 4TS8A 4ZC9A 5I7YA 3JVKA 5G4RA 3HMHA 2RI7A 5FFWA 4Y03A 5LKTA 3JVJA 4IORA 5E9IA 5FE8A 4J3IA 4LRGA 5CRMA 4BW3A 4QEUA 5L97A 3O34A 5DLZA 3MXFA 5LUUA 4J0RA 4Z6IA 5FE7A 5IG6A 4TU6A 4TZ2A 4UYHA 4A9IA 5EICA 5HM0A 4UIYA 3SVHA 3FKMX 4J1PA 5E0RA 5LKUA 4YYMA 3O33A 5CQ6A 5BT5A 4NYXA 5AMFA 5FH7A 4E96A 5DBMA 4NYVA 2L85A 4QR4A 5II1A 4Q0NA 4UIZA 3VKHA 3UV4A 5FH8A 5EWVA 4AKNA 5EA1A 5HENA 4OGJA 4LDFA 5D3HA 4NYWA 5D7XA 5ENBA 4IR4A 5HQ6A 2H60A 5ENCA 5F1HA 5D3SA 4MEPA 5IGLA 3P1FA 4NR7A 4QSSA 2L5EA 1ZKRA 5CUBA 2DVSA 4CUSA 5FBXA 5A85A 3QZTA 4Q0OA 4BJXA 5CGPA 4IOQA 5D0CA 4WHWA 5HRWA 3AADA 2R0YA 5II2A 5L99A 5CUEA 5D3JA 5FFVA 2D9EA 4Z93A 3IU6A 2RNXA 2RNYA 3U5MA 4CUQA 4HBYA 4YY4A 3I3JA 5G4SA 4PY6A 5LKXA 5A7CA 5LJ1A 2OO1A 3DWYA 4LYSA 4NQMA 5E73A 4OUFA 3MB4A 5E9MA 5CFWA 4XY9A 4YBTA 5DFDA 4YYNA 3O36A 2I8NA 2YEMA 3P1EA 5D3PA 4LZ2A 4UITA 4NR9A 2RNWA 5J0DA 5F62A 5HRXA 4A9EA 5DX4A 4J0SA 3G0LA 2L84A 5D3NA 4QYLA 4CFKA 4O7BA 4TT2A 5HQ5A 5CQ4A 4UYFA 5F3AA 4TU4A 4O70A 4N4GA 4OGIA 5D3TA 5IBNA 2DVRA 2DWWA 4A9NA 2RFJA 4CURA 3S92A 5DYUA 4HXNA 5KU3A 4YC9A 4MEQA 5E9KA 1WUMA 4AKIA 5HJCA 4XYAA 2WP1A 5CS8A 5EGUA 4MR4A 4YYIA 5F1LA 3U5KA 5FFYA 4QY4A 2RS9B 5CQ7A 4LC2A 3UV2A 3D1BA 3S91A 4HXKA 5EI4A 5F36A 5JI8A 5F61A 4BW2A 3TLPA 4A9OA 3O35A 2E7OA 5TB6A 3MUKA 4O76A 3SVFA 3P1DA 4IOOA 5DW2A 3UW9A 4YBSA 3MB3A 4YYDA 3QZVA 5D3LA 5CQ5A 4DONA 4KCXA 5CUDA 5A81A 4QC1A 5IGMA 2LSPB 5E3DA 4A9HA 4CUUA 3LXJA 5DYXA 4LYWA 5EISA 4TYLA 5E9LA 5F63A 3U5OA 4QSQA 5CPEA 5C85A 5LJ2A 4MEOA 1WUGA 3HMEA 3HMFA 3G0JA 4ALGA 5I29A 5HFRA 4UIWA 2OUOA 5I83A 3DAIA 5LJ0A 3U5NA 5ETBA 2YEKA 2F6NA 3D7CA 5L98A 1X0JA 5TCMA 4QEWA 4QSUA 4TT6A 4CUPA 5EWHA 4QSXA 4MR5A 3O37A 5C89A 3UV5A 5DKCA 4QSRA 2DVQA 5ETDA 5I89A 2R0VA 5KTUA 4Z1QA 5E9VA 2YELA 4N4FA 5BT4A 3RCWA 4YYKA 5D3RA 4QB3A 5FE2A 2I7KA 5IGKA 2G4AA 5L8UA 5CY9A 5JWMA 4YAXA 5C7NA 5HCLA 5I86A 4XY8A 2MJVB 5HLSA 5ENHA 4ALHA 4QUUA 5KTWA 2R10A 5DKDA 5A5PA 4BHWA 5I7XA 5FB0A 4ZW1A 4HXLA 5EVAA 4O7CA 2WP2A 1F68A 5FDZA 4PTBA 1PUOA 4MR3A 5CQAA 4O77A 4A9KA 5A5OA 4AKHA 2OSSA 4IR3A 5A5SA 2DKWA 4N4HA 4O75A 5ENFA 4PCEA 4YABA 2RO1A 4UYFB 4QUTA 5AD2A 4UIXA 4QR3A 2FSAA 5K29A 4YY6A 4UYDA 1E6IA 5LVQA 4HBXA 4NQNA 2KTBB 4QSVA 4CL9A 4LZRA 3JVLA 4NRAA 4YATA 4QSWA 4TZ8A 4QNSA 4XUBA 5C8GA 5EWDA 2EJNA 2DVVA 5H85A 3UVXA 5HQ7A 5ACYA 5I40A 5FG5A 4QZSA 4Z6HA 1JM4B 5IGNA 5F25A 5EPBA 3LJWA 4KV4A 4AKGA 5KO4A 5DFCA 5DW1A 5E3GA 5ENJA 4QYDA 5E74A 4HXRA 2DATA 5L96A 5H1VA 3LQJA 5CU8A 5CQ3A 4O7AA 5CQ8A 5EPRA 4NXJA 5CTLA 4O7FA 4A9FA 4AI6A 5L8TA 4A9MA 4MR6A 4UYEA 4QSTA 3D1DA 4FLPA 4QEVA 5CRZA 4HXOA 4HBWA 5CQTA 3NXBA 5FE3A 4O74A 5H1UA 3U5PA 4YK0A 4YH4A 4TTEA 5EV9A 5LKZA 4CUTA 4A9LA 5C4QA 3MQMA 5KTXA 4YH3A 3VKGA 4O78A 2NXBA 3K2JA 5FE4A 4YADA 4GPJA 5A5NA 3UVYA 5BT3A 5I1QA 4CLBA 5EPSA 4WIVA 2GRCA 4QSPA 4KV1A 4NS5A 3AQAA 4PS5A 4HBVA 4YYGA 4QC3A 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4MEN A;  5ENE A;  3Q2E A;  4NUC A;  4O71 A;  5KHM A;  4A9J A;  3P5O A;  5DY7 A;  4O7E A;  4QBM A;  5I88 A;  5CUG A;  5EK9 A;  3UVW A;  4YYH A;  1EQF A;  4LZS A;  5COI A;  3ONI A;  4RVR A;  2YQD A;  5LVR A;  4BW4 A;  5FB1 A;  4C66 A;  4HXM A;  4YBM A;  4TQN A;  3LQH A;  2D82 A;  5FH6 A;  4BW1 A;  5IID A;  4C67 A;  5EWC A;  4UIV A;  4IR5 A;  2R0S A;  2N9G A;  4IR6 A;  4Z1S A;  2YYN A;  4LYI A;  5E7D A;  5EQ1 A;  5F2P A;  3GG3 A;  5AD3 A;  3LQI A;  5CZG A;  3JVM A;  5HRV A;  4NUE A;  5D25 A;  5HEM A;  5FG6 A;  5DYA A;  1JSP B;  4LR6 A;  4N4I A;  3ZYU A;  5F5Z A;  4O72 A;  3U5J A;  4F3I A;  5DYC A;  4ZQL A;  2F6J A;  4XUA A;  5EM3 A;  5EWW A;  3MUL A;  5DFB A;  4TT4 A;  5CUA A;  3IU5 A;  5EU1 A;  5EP7 A;  3QZS A;  5DLX A;  5HEL A;  2YW5 A;  4NR4 A;  3U5L A;  5ENG A;  4PKL A;  4QR5 A;  5CUC A;  5A5R A;  4NR8 A;  4NUD A;  4UYG A;  5A5Q A;  5A82 A;  2E7N A;  4HXS A;  5E9Y A;  4NR6 A;  4PCI A;  4CFL A;  4UIU A;  3UVD A;  2YDW A;  4NR5 A;  5D24 A;  5AME A;  4X2I A;  5FG4 A;  4YYJ A;  2E3K A;  5D26 A; 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