4ALHA

N-terminal bromodomain of human brd2 with 3,5 dimethyl-4-phenyl-1,2- oxazole
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
VTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 2: Optimization of Phenylisoxazole Sulfonamides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN CONTAINING 2
total genus 35
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4alhA00
2RNXA 5AD2A 4OGJA 5LKUA 4QEUA 4TT4A 3MB4A 4QYDA 5ENGA 4HXSA 5I7YA 4A9JA 2DVQA 4TQNA 4YYGA 3G0LA 5I89A 4YH4A 4Z6HA 4Q0NA 3U5NA 4RVRA 4UYEA 4NXJA 4A9NA 4PS5A 4J0SA 2DATA 4PCEA 5L8TA 4HBWA 4HXRA 5I88A 4HXKA 4YYMA 2RS9B 4ZQLA 4O7CA 4A9FA 4QEWA 4O74A 5FE1A 5DFDA 2YQDA 4O76A 4CURA 5I40A 5I1QA 3FKMX 5EWWA 5FH7A 4TT2A 2DVSA 3LQHA 5FE6A 5TCMA 3P1CA 4HXMA 5HFQA 4TYLA 5L97A 5IIDA 4XUBA 4IORA 4QSTA 4MR6A 4NYWA 5I80A 5D3HA 3DWYA 4NR6A 4YBMA 5EICA 5FG5A 4CL9A 5DKHA 4GPJA 3D7CA 4TS8A 4A9OA 5L8UA 2YELA 4IR3A 5ETBA 4N4HA 5E73A 3Q2EA 3LQJA 5LJ0A 5CPEA 5AMEA 4J0RA 5D3SA 5ENIA 4YADA 4LZRA 2WP1A 4NR8A 5TB6A 3QZSA 4PY6A 1N72A 4HBVA 5HQ7A 5CQ3A 4Q0OA 5DFCA 5HRXA 5F3AA 4Z1SA 3JVMA 3UVWA 5CGPA 5CUAA 4BW2A 5JI8A 4BW3A 5EPSA 5FFYA 5LKTA 4YYHA 5EGUA 4YK0A 4E96A 5E9IA 5HLSA 4YYKA 5KHMA 5KTUA 5H1UA 3P1DA 4MR3A 5AD3A 5F5ZA 2RNYA 5E3GA 4CFLA 4UIXA 5A5SA 4UIUA 5ENEA 3AADA 4YH3A 4NR5A 3QZVA 4N4FA 4TTEA 4LC2A 5IGLA 5F1LA 5HFRA 5LJ1A 5A83A 5EI4A 5D7XA 1JM4B 5FFWA 2YDWA 4QSUA 4YYIA 5E9MA 4MENA 3U5LA 1X0JA 2L5EA 3UV2A 4HXPA 4BW4A 2RI7A 5CFWA 1WUMA 4KCXA 3RCWA 5C8GA 3UV5A 5HM0A 5DFBA 4IR5A 5HENA 5FE4A 4QNSA 4O7FA 5EU1A 4IOOA 4C66A 5I29A 5FE3A 2DKWA 5HJCA 2N9GA 5EISA 2E3KA 4YC9A 4A9KA 4LZ2A 2R0SA 5DYUA 4LYIA 5EWHA 5L99A 1WUGA 4UIWA 4YYDA 2F6JA 5IGNA 4X2IA 5E9VA 4A9MA 4QSSA 3HMEA 5DX4A 5ENHA 5CQTA 5FH6A 5LJ2A 5CZGA 5I86A 5ENFA 4NQNA 5A5OA 5C85A 2DWWA 3MXFA 5II2A 5I7XA 5DKDA 4WIVA 3K2JA 3MUKA 3O36A 2OUOA 2F6NA 4QSVA 5EPBA 3UVYA 3HMHA 4QB3A 2YEMA 4NRCA 4A9IA 5E9KA 2KTBB 1EQFA 4BJXA 4ALHA 4CUUA 5EK9A 4NUEA 5A5PA 5HQ5A 4BHWA 5DYCA 5IBNA 5ACYA 4O70A 5EWVA 4NYVA 5CQAA 5CUCA 5I83A 5CQ5A 2DVVA 3HMFA 4O72A 2RNWA 4QR4A 1E6IA 3IU6A 5CY9A 3MULA 4UIYA 5A5NA 4UYGA 3P1EA 5CS8A 5D25A 5IGMA 3O34A 4UYHA 4O78A 3TLPA 5LUUA 4ALGA 5F36A 5FG6A 5D0CA 4XY8A 5AMFA 3U5PA 4IR6A 5HELA 4TU6A 5K29A 4Z93A 3SVHA 5A85A 2YEKA 2E7NA 5BT3A 5FDZA 4TU4A 4O7AA 4QSRA 5FE5A 5CU8A 5DLXA 5A5QA 5D3NA 4LYWA 5LVQA 4XYAA 5A82A 4YYNA 4OUFA 4Z6IA 5A7CA 1ZS5A 5LVRA 2WP2A 2MJVB 5EPRA 5CUDA 2OSSA 2G4AA 5C7NA 5FE2A 4IR4A 5FFVA 4Y03A 5II1A 4IOQA 4NR4A 5LKXA 4MR5A 3UVXA 3AQAA 5D3RA 5FBXA 5C89A 5HRWA 3GG3A 5FE7A 2H60A 5DYXA 5G4RA 4NRAA 3DAIA 4LYSA 4QSPA 4NS5A 5J0DA 5ENJA 4LDFA 3O33A 5DKCA 5F61A 3O37A 2I7KA 4QR3A 4NR7A 4QBMA 4QSXA 4ZC9A 4O7EA 3P5OA 4J3IA 4O7BA 5EQ1A 2D9EA 5KTWA 4QYLA 4NUCA 2E7OA 4NYXA 5EM3A 4YAXA 3U5JA 5IGKA 3U5KA 2I8NA 5D3LA 5D3PA 5DW2A 4QEVA 5H1VA 4PTBA 5DLZA 2OO1A 5EWCA 5F2PA 5IG6A 5EVAA 5L98A 4XY9A 4LR6A 5CUBA 5EWDA 5FB1A 5CRZA 5F62A 5CQ6A 4A9HA 3ZYUA 4CLBA 4CUSA 4A9LA 3QZTA 4QUTA 3O35A 3G0JA 4N4IA 3U5MA 4PCIA 4YBTA 3LJWA 4O75A 5E0RA 5F1HA 5HQ6A 2L84A 4NUDA 3IU5A 4AKNA 4UYFA 5E9YA 3SVGA 4UITA 4YABA 5D26A 5C87A 4CUTA 3LQIA 2RFJA 4PKLA 3UVDA 1F68A 2YYNA 4MR4A 4C67A 5KTXA 4Z1QA 4OGIA 5DBMA 4TT6A 4TZ8A 5FE8A 4CUQA 3Q2FA 5G4SA 4UYDA 4O71A 5A81A 4QZSA 5FG4A 4N3WA 2NXBA 4QC1A 5D24A 3JVKA 4NRBA 4ZW1A 4HBYA 4KV1A 5E7DA 5JWMA 5CTLA 4UYFB 5ENCA 5FH8A 3S91A 4A9EA 3JVJA 5BT4A 2DVRA 2R0YA 3I3JA 4HXNA 4QY4A 4XUAA 2YW5A 5DW1A 4QUUA 4WHWA 5CRMA 5CQ8A 4BW1A 5CQ7A 4TZ2A 2L85A 4MEPA 5EV9A 3P1FA 4UIVA 4HXLA 5FE9A 4CFKA 3ONIA 3NXBA 4F3IA 4MEQA 5HCLA 5CP5A 5E9LA 4J1PA 4QSWA 4QR5A 5FE0A 5ENBA 4FLPA 5KU3A 2R0VA 2R10A 5CUGA 4WHUA 5EP7A 3LXJA 5KO4A 3UV4A 5BT5A 5CQ4A 4YYJA 4YATA 5D3JA 3MQMA 5HRVA 4YY6A 2GRCA 5DYAA 5L96A 5LKZA 3S92A 5D3TA 4QSQA 4KV4A 4QC3A 5H85A 4CUPA 4MEOA 2RO1A 4O77A 5C4QA 4UIZA 2FSAA 5F60A 3JVLA 3UW9A 5HEMA 5E3DA 2LSPB 2D82A 1JSPB 3U5OA 4YBSA 5F25A 3SVFA 4YY4A 5F63A 5EA1A 5ETDA 4LRGA 4HBXA 4LZSA 5CUEA 4DONA 4NR9A 5E74A 4HXOA 5FB0A 3MB3A 5COIA 4N4GA 5DY7A 5A5RA 4NQMA 5H1TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RNXA 5AD2A 4OGJA 5LKUA 4QEUA 4TT4A 3MB4A 4QYDA 5ENGA 4HXSA 5I7YA 4A9JA 2DVQA 4TQNA 4YYGA 3G0LA 5I89A 4YH4A 4Z6HA 4Q0NA 3U5NA 4RVRA 4UYEA 4NXJA 4A9NA 4PS5A 3ERRA 2DATA 4J0SA 4PCEA 5L8TA 4HBWA 4HXRA 5I88A 4HXKA 4YYMA 2RS9B 4ZQLA 4O7CA 4A9FA 4QEWA 4O74A 5FE1A 5DFDA 2YQDA 4O76A 4CURA 5I40A 5I1QA 3FKMX 5EWWA 5FH7A 4TT2A 2DVSA 3LQHA 5FE6A 5TCMA 3P1CA 4HXMA 5HFQA 3D1DA 4TYLA 5L97A 5IIDA 4XUBA 4IORA 4QSTA 4MR6A 4NYWA 5I80A 5D3HA 3DWYA 4NR6A 4YBMA 5EICA 5FG5A 4CL9A 5DKHA 4GPJA 3D7CA 4TS8A 4A9OA 5L8UA 2YELA 4IR3A 5ETBA 4N4HA 5E73A 3Q2EA 3LQJA 5LJ0A 5CPEA 5AMEA 4J0RA 5D3SA 5ENIA 4YADA 4LZRA 2WP1A 4NR8A 5TB6A 3QZSA 4PY6A 1N72A 4HBVA 5HQ7A 5CQ3A 4Q0OA 5DFCA 5HRXA 2EJNA 5F3AA 4Z1SA 3JVMA 3UVWA 5CGPA 5CUAA 4BW2A 5JI8A 4BW3A 5EPSA 5FFYA 5LKTA 4YYHA 5EGUA 4YK0A 4E96A 5E9IA 5HLSA 4YYKA 5KHMA 5KTUA 5H1UA 3P1DA 4MR3A 5AD3A 5F5ZA 2RNYA 5E3GA 4CFLA 4UIXA 5A5SA 4UIUA 5ENEA 3AADA 4YH3A 4NR5A 3QZVA 4N4FA 4TTEA 4LC2A 5IGLA 5F1LA 5HFRA 5LJ1A 5A83A 5EI4A 5D7XA 1JM4B 5FFWA 2YDWA 4QSUA 4YYIA 5E9MA 4MENA 3U5LA 1X0JA 2L5EA 3UV2A 4HXPA 4BW4A 2RI7A 5CFWA 1WUMA 4KCXA 3RCWA 5C8GA 3UV5A 5HM0A 5DFBA 4IR5A 5HENA 5FE4A 4QNSA 4O7FA 5EU1A 4IOOA 4C66A 5I29A 5FE3A 2DKWA 5HJCA 2N9GA 5EISA 2E3KA 4YC9A 4A9KA 4LZ2A 2R0SA 5DYUA 4LYIA 5EWHA 5L99A 1WUGA 4UIWA 4YYDA 2F6JA 5IGNA 4AKHA 4X2IA 5E9VA 4A9MA 4QSSA 3HMEA 5DX4A 5ENHA 5CQTA 5FH6A 5LJ2A 5CZGA 5I86A 5ENFA 4NQNA 5A5OA 5C85A 2DWWA 3MXFA 5II2A 5I7XA 5DKDA 4WIVA 3K2JA 3MUKA 3O36A 3VKGA 2OUOA 2F6NA 4QSVA 5EPBA 3UVYA 3HMHA 4QB3A 2YEMA 4NRCA 4A9IA 5E9KA 2KTBB 1EQFA 4BJXA 4ALHA 4CUUA 5EK9A 3VKHA 4NUEA 5A5PA 5HQ5A 4BHWA 5DYCA 5IBNA 5ACYA 4O70A 5EWVA 4NYVA 5CQAA 5CUCA 5I83A 5CQ5A 2DVVA 3HMFA 4O72A 2RNWA 4QR4A 1E6IA 3IU6A 5CY9A 3MULA 4UIYA 5A5NA 4UYGA 3P1EA 5CS8A 5D25A 5IGMA 3O34A 4UYHA 4O78A 3TLPA 5LUUA 4ALGA 5F36A 5FG6A 5D0CA 4XY8A 5AMFA 3U5PA 4IR6A 5HELA 4TU6A 5K29A 4Z93A 3SVHA 5A85A 2YEKA 2E7NA 5BT3A 5FDZA 4TU4A 4O7AA 4QSRA 5FE5A 5CU8A 5DLXA 5A5QA 5D3NA 4LYWA 5LVQA 4XYAA 5A82A 4YYNA 4OUFA 4Z6IA 5A7CA 1ZS5A 5LVRA 2WP2A 2MJVB 5EPRA 5CUDA 2OSSA 2G4AA 5C7NA 5FE2A 4IR4A 5FFVA 4Y03A 5II1A 4IOQA 4NR4A 5LKXA 4MR5A 3UVXA 3AQAA 5D3RA 5FBXA 5C89A 5HRWA 3GG3A 5FE7A 4AI6A 2H60A 5DYXA 5G4RA 4NRAA 3DAIA 4LYSA 4QSPA 4NS5A 5J0DA 5ENJA 4LDFA 3O33A 5DKCA 5F61A 3O37A 2I7KA 4QR3A 4NR7A 4QBMA 4QSXA 4ZC9A 4O7EA 4AKIA 3P5OA 4J3IA 4O7BA 5EQ1A 2D9EA 5KTWA 4QYLA 4NUCA 2E7OA 4NYXA 5EM3A 4YAXA 3U5JA 5IGKA 3U5KA 2I8NA 5D3LA 5D3PA 5DW2A 4QEVA 5H1VA 4PTBA 5DLZA 2OO1A 5EWCA 5F2PA 5IG6A 5EVAA 5L98A 4XY9A 4LR6A 5CUBA 5EWDA 5FB1A 5CRZA 5F62A 5CQ6A 4A9HA 3ZYUA 4CLBA 4CUSA 4A9LA 3QZTA 4QUTA 3O35A 3G0JA 4N4IA 3U5MA 4PCIA 4YBTA 3LJWA 4O75A 5E0RA 5F1HA 5HQ6A 2L84A 4NUDA 3IU5A 4AKNA 4UYFA 5E9YA 3SVGA 4UITA 4YABA 5D26A 5C87A 4CUTA 3LQIA 2RFJA 4PKLA 3UVDA 1F68A 2YYNA 4MR4A 4C67A 5KTXA 4Z1QA 4OGIA 5DBMA 4TT6A 4TZ8A 5FE8A 4CUQA 3Q2FA 5G4SA 4UYDA 4O71A 5A81A 4QZSA 5FG4A 4N3WA 2NXBA 4QC1A 5D24A 3JVKA 4NRBA 4ZW1A 4HBYA 4KV1A 5E7DA 5JWMA 5CTLA 4UYFB 5ENCA 5FH8A 3S91A 4A9EA 3JVJA 5BT4A 2DVRA 2R0YA 3I3JA 4HXNA 4QY4A 4XUAA 2YW5A 5DW1A 4QUUA 4WHWA 5CRMA 5CQ8A 4BW1A 5CQ7A 4TZ2A 2L85A 4MEPA 5EV9A 3P1FA 4UIVA 4HXLA 5FE9A 4CFKA 3ONIA 3NXBA 4F3IA 4MEQA 5HCLA 5CP5A 5E9LA 4J1PA 4QSWA 4QR5A 5FE0A 5ENBA 4FLPA 5KU3A 2R0VA 2R10A 5CUGA 4WHUA 5EP7A 3LXJA 5KO4A 3UV4A 5BT5A 5CQ4A 4YYJA 4YATA 5D3JA 3MQMA 5HRVA 4YY6A 2GRCA 5DYAA 5L96A 5LKZA 3S92A 5D3TA 4QSQA 4KV4A 4QC3A 5H85A 4CUPA 4MEOA 2RO1A 4O77A 5C4QA 4UIZA 2FSAA 5F60A 3JVLA 3UW9A 5HEMA 5E3DA 2LSPB 2D82A 1JSPB 3U5OA 4YBSA 5F25A 3SVFA 4YY4A 5F63A 5EA1A 5ETDA 1ZKRA 3D1BA 4LRGA 4HBXA 4LZSA 1PUOA 5CUEA 4DONA 4NR9A 5E74A 4HXOA 5FB0A 3MB3A 4AKGA 5COIA 4N4GA 5DY7A 5A5RA 4NQMA 5H1TA
chains in the Genus database with same CATH topology
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