4O75A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with fostamatinib
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o75A01
5E3DA 5E9LA 3U5LA 5I29A 4NQNA 5DW2A 4YH3A 3JVMA 5EWCA 5ENBA 4YYGA 5IIDA 1WUMA 4LZSA 5IGMA 5KTXA 4IOOA 3RCWA 4N3WA 5CP5A 4WIVA 4HXSA 3UV2A 4A9KA 3U5OA 5LJ2A 4NR6A 4N4FA 4MR4A 5AD3A 3MXFA 5CQTA 4TZ8A 5CUEA 2L85A 5DLZA 4NQMA 3QZTA 2RNWA 5LVQA 4A9EA 5II1A 5FE8A 3JVKA 4LYSA 4HXMA 4A9HA 4NRCA 5D24A 4QSVA 2GRCA 3HMFA 4YYHA 5F63A 5CPEA 5CY9A 4IR5A 4TS8A 5CQ5A 5FFYA 4IOQA 3Q2EA 4IR4A 2DWWA 5A5SA 5AMEA 5C87A 5LUUA 4OGJA 4NRAA 5G4SA 4NUDA 4KCXA 4YYNA 4TT6A 5F1HA 5FG5A 5H1VA 4Z93A 4ALHA 5CQ8A 5CTLA 4QYDA 3U5KA 4RVRA 5F61A 3U5PA 5A5RA 4IR3A 3TLPA 4O78A 5L98A 4YBMA 4QSXA 4BW1A 4YY4A 4QSWA 4E96A 5F5ZA 4YYJA 4NR4A 5DYUA 4O75A 5EPBA 4QSQA 4BW2A 3LQIA 3MULA 5ACYA 5EV9A 2KTBB 4CUTA 3LQJA 5H1TA 4Z6HA 5LKUA 3O33A 2I8NA 4QC1A 5E9VA 4QNSA 5A82A 3P1EA 2YELA 4J0RA 5EQ1A 4YYMA 2WP2A 4TZ2A 4CFLA 5I88A 5CUGA 5HFRA 5FE3A 5I40A 4QB3A 4PTBA 4Q0OA 4MR3A 5ENEA 5CQ6A 3P5OA 5E9MA 4YBTA 4A9MA 5AD2A 4BW4A 4NR5A 4O7BA 4J0SA 5EPSA 5D3TA 2F6JA 5J0DA 5E9KA 5F25A 2R10A 4CUQA 2E7OA 2DVQA 1N72A 2OSSA 5D25A 4CUPA 3P1CA 4HBYA 3I3JA 4UIZA 4FLPA 4YC9A 2L5EA 4HBWA 4TU6A 5CS8A 4ZW1A 3U5JA 4QSTA 2RNYA 3LQHA 4A9JA 3O37A 3IU5A 5DKCA 2I7KA 4UYGA 3O35A 5DY7A 3U5NA 2FSAA 4NUEA 5CU8A 5FBXA 5EPRA 4TTEA 4UYDA 5L96A 5CQAA 5EU1A 4QSSA 4YYKA 4YBSA 5D3RA 4MR5A 5CQ4A 4QEUA 5A5OA 4QEWA 5F36A 3SVGA 4PKLA 4O7EA 4N4IA 5ENHA 4HBVA 5DYXA 5CQ3A 5I89A 5I1QA 4O71A 5A5NA 5D0CA 5II2A 2D9EA 5DYAA 5H1UA 4NYVA 4NR8A 5EM3A 4QUUA 5EI4A 4KV1A 5CUBA 4QSPA 4O77A 5D3NA 4LYIA 4NUCA 5D3JA 5ENCA 2RFJA 5DLXA 4Y03A 4UIUA 4XY9A 4LDFA 4MEPA 5BT5A 4ZC9A 5A7CA 5EICA 3P1DA 5I83A 5L97A 1EQFA 4IORA 4UIYA 2RO1A 4Z1SA 3D7CA 5C89A 5FE2A 4NRBA 4OGIA 4MENA 4PS5A 4O74A 4WHUA 5CZGA 4CLBA 3HMHA 5HCLA 5D3HA 4TYLA 3LXJA 5DYCA 4HBXA 5D26A 5DW1A 5A81A 4TU4A 3K2JA 5ENGA 5A5QA 2LSPB 3UV5A 1JSPB 2D82A 5KTUA 3S92A 3MUKA 5CUDA 5HEMA 5KTWA 4O7CA 5L8UA 5BT3A 4NYXA 5A85A 5BT4A 3ONIA 3Q2FA 5FE0A 4ALGA 4QR3A 4OUFA 4QEVA 5LKTA 2F6NA 5D3PA 2YW5A 5L99A 3AADA 3QZSA 5KHMA 4NYWA 5CRMA 4PCIA 4GPJA 4N4GA 5F2PA 5EP7A 5FH7A 4DONA 2RNXA 4NS5A 4YADA 2OUOA 4YAXA 4QR5A 5LKZA 4QUTA 2OO1A 5HELA 3SVFA 5E3GA 5DFBA 2DKWA 5DX4A 4A9OA 4Q0NA 3U5MA 5FH8A 5FDZA 2YYNA 4QSUA 5DKHA 1X0JA 5HQ7A 3G0JA 5I7XA 5DFCA 5IGLA 5CRZA 5CFWA 5E74A 2WP1A 5FG4A 4KV4A 5ENJA 4F3IA 4PCEA 4XYAA 4AKNA 5EGUA 3GG3A 5AMFA 5EK9A 5EVAA 2NXBA 3UVXA 5ENFA 5JWMA 4J3IA 5LJ0A 5EA1A 5FG6A 5IBNA 5TB6A 5FFVA 5A5PA 4XUAA 3FKMX 5FFWA 4MEOA 4NXJA 4O76A 4MR6A 4YH4A 5FE7A 5D7XA 4NR9A 4O70A 3UV4A 2RI7A 4A9FA 2R0SA 4O7AA 5E9IA 4QYLA 4LC2A 5EISA 5EWHA 3AQAA 5EWDA 2YQDA 4LR6A 5TCMA 4TT4A 5E0RA 2R0VA 5ETDA 2YEMA 5HRVA 3SVHA 4HXOA 5D3LA 3O34A 4O7FA 3MB3A 4QY4A 5CUAA 3G0LA 4UYEA 4A9NA 2DVRA 4TQNA 5DBMA 4CUUA 5HM0A 2H60A 2DVSA 4QZSA 5FH6A 4HXLA 4A9LA 4IR6A 4UITA 5FE5A 5HRWA 5IGNA 3HMEA 4J1PA 4UIVA 5HQ5A 5E7DA 5KU3A 4HXRA 4NR7A 5FB0A 2L84A 4UYFA 4WHWA 2N9GA 4YYDA 5IGKA 5E73A 4QBMA 4XY8A 5F3AA 4YABA 4YK0A 5C8GA 1F68A 5I86A 4QC3A 5FE6A 5C85A 3DWYA 5CGPA 4BW3A 4HXNA 3DAIA 5D3SA 3NXBA 5HQ6A 2RS9B 4UYHA 5COIA 3UW9A 2MJVB 4ZQLA 4TT2A 4QSRA 1E6IA 4C66A 5HLSA 2DVVA 5LKXA 5G4RA 4YATA 2R0YA 4CUSA 5FE4A 2DATA 5C4QA 5I80A 4UIXA 3QZVA 4N4HA 5LJ1A 4HXPA 2G4AA 3JVLA 5F1LA 5E9YA 4CFKA 4YYIA 4BJXA 4O72A 3MQMA 5HFQA 4MEQA 5HRXA 4Z6IA 4LYWA 2YEKA 3UVWA 2E3KA 3JVJA 4C67A 3P1FA 4HXKA 4YY6A 4A9IA 5JI8A 3IU6A 5L8TA 4X2IA 5A83A 2E7NA 3S91A 5F60A 4CL9A 4UYFB 2YDWA 5KO4A 5DFDA 5F62A 5K29A 5IG6A 5ETBA 5EWWA 5LVRA 4CURA 5C7NA 4XUBA 5H85A 5HJCA 4LZ2A 4QR4A 5FE9A 5ENIA 4PY6A 5EWVA 3UVDA 1ZS5A 3ZYUA 3MB4A 5HENA 5FB1A 3O36A 4LZRA 5CQ7A 1WUGA 4UIWA 3UVYA 4BHWA 5I7YA 1JM4B 5FE1A 4LRGA 3LJWA 4Z1QA 5CUCA 5DKDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E3DA 5E9LA 3U5LA 5I29A 4NQNA 5DW2A 4YH3A 3JVMA 5EWCA 5ENBA 4YYGA 5IIDA 1WUMA 4LZSA 5IGMA 5KTXA 4IOOA 3RCWA 4N3WA 5CP5A 4WIVA 4HXSA 3UV2A 4A9KA 3U5OA 5LJ2A 4NR6A 4N4FA 4MR4A 5AD3A 3MXFA 5CQTA 4TZ8A 5CUEA 2L85A 5DLZA 4NQMA 3QZTA 2RNWA 5LVQA 4A9EA 5II1A 3VKGA 5FE8A 3JVKA 4LYSA 4HXMA 4A9HA 4NRCA 5D24A 4AKHA 4QSVA 2GRCA 3D1DA 3HMFA 4YYHA 5F63A 5CPEA 5CY9A 4IR5A 4TS8A 5CQ5A 5FFYA 4IOQA 3Q2EA 4IR4A 2DWWA 5A5SA 1PUOA 5AMEA 5C87A 5LUUA 4OGJA 4NRAA 5G4SA 4NUDA 4KCXA 4YYNA 4TT6A 5F1HA 5FG5A 5H1VA 4Z93A 4ALHA 5CQ8A 5CTLA 4QYDA 3U5KA 4RVRA 5F61A 3U5PA 5A5RA 4IR3A 3TLPA 4O78A 5L98A 4YBMA 4QSXA 4BW1A 4YY4A 4QSWA 4E96A 5F5ZA 4YYJA 4NR4A 5DYUA 4O75A 5EPBA 4QSQA 4BW2A 3LQIA 3MULA 5ACYA 5EV9A 2KTBB 4CUTA 3LQJA 4AI6A 5H1TA 4Z6HA 5LKUA 3O33A 2I8NA 4QC1A 5E9VA 4QNSA 5A82A 3P1EA 2YELA 4J0RA 5EQ1A 4YYMA 2WP2A 4TZ2A 4CFLA 5I88A 5CUGA 5HFRA 5FE3A 5I40A 4QB3A 4PTBA 4Q0OA 4MR3A 5ENEA 5CQ6A 3P5OA 5E9MA 4YBTA 4A9MA 5AD2A 4BW4A 4NR5A 4O7BA 4J0SA 5EPSA 5D3TA 2F6JA 5J0DA 5E9KA 5F25A 2R10A 4CUQA 2E7OA 2DVQA 1N72A 2OSSA 5D25A 4CUPA 3P1CA 4HBYA 3I3JA 4UIZA 4FLPA 4YC9A 2L5EA 4HBWA 4TU6A 5CS8A 4ZW1A 3U5JA 4QSTA 2RNYA 3LQHA 4A9JA 3O37A 3IU5A 5DKCA 2I7KA 4UYGA 3O35A 5DY7A 3U5NA 2FSAA 4NUEA 5CU8A 5FBXA 5EPRA 4TTEA 4UYDA 5L96A 5CQAA 5EU1A 4QSSA 4YYKA 4YBSA 5D3RA 4MR5A 5CQ4A 4QEUA 5A5OA 4QEWA 5F36A 3SVGA 4PKLA 4O7EA 4N4IA 5ENHA 4HBVA 5DYXA 5CQ3A 5I89A 5I1QA 4O71A 5A5NA 5D0CA 5II2A 2D9EA 5DYAA 5H1UA 4NYVA 4NR8A 5EM3A 4QUUA 5EI4A 4KV1A 5CUBA 4QSPA 4O77A 5D3NA 4LYIA 3D1BA 4NUCA 5D3JA 5ENCA 2RFJA 5DLXA 4Y03A 4UIUA 4XY9A 4LDFA 4MEPA 5BT5A 4ZC9A 5A7CA 5EICA 3P1DA 5I83A 5L97A 1EQFA 4IORA 4UIYA 2RO1A 4Z1SA 3D7CA 5C89A 5FE2A 4NRBA 4OGIA 4MENA 4PS5A 4O74A 4WHUA 5CZGA 4CLBA 3HMHA 5HCLA 5D3HA 4TYLA 3LXJA 5DYCA 4HBXA 5D26A 5DW1A 5A81A 4TU4A 3K2JA 5ENGA 5A5QA 2LSPB 3UV5A 1JSPB 2D82A 5KTUA 3S92A 3MUKA 5CUDA 5HEMA 5KTWA 4O7CA 5L8UA 5BT3A 4NYXA 5A85A 5BT4A 3ONIA 3Q2FA 5FE0A 4ALGA 4QR3A 4OUFA 4QEVA 5LKTA 2F6NA 5D3PA 2YW5A 5L99A 3AADA 3QZSA 5KHMA 4NYWA 5CRMA 4PCIA 4GPJA 4AKGA 4N4GA 5F2PA 5EP7A 5FH7A 4DONA 2RNXA 4NS5A 4YADA 2OUOA 4YAXA 4QR5A 5LKZA 4QUTA 2OO1A 5HELA 3SVFA 5E3GA 5DFBA 2DKWA 5DX4A 4A9OA 2EJNA 4Q0NA 3U5MA 5FH8A 5FDZA 2YYNA 4QSUA 5DKHA 1X0JA 5HQ7A 3G0JA 5I7XA 5DFCA 5IGLA 5CRZA 5CFWA 5E74A 2WP1A 5FG4A 4KV4A 5ENJA 4F3IA 4PCEA 4XYAA 4AKNA 5EGUA 3GG3A 5AMFA 5EK9A 5EVAA 2NXBA 3UVXA 5ENFA 5JWMA 4J3IA 5LJ0A 5EA1A 5FG6A 5IBNA 5TB6A 5FFVA 5A5PA 4XUAA 3FKMX 5FFWA 4MEOA 4NXJA 4O76A 4MR6A 4YH4A 5FE7A 5D7XA 4NR9A 4O70A 3UV4A 2RI7A 4A9FA 2R0SA 4O7AA 5E9IA 4QYLA 4LC2A 5EISA 5EWHA 3AQAA 5EWDA 2YQDA 4LR6A 5TCMA 4TT4A 5E0RA 1ZKRA 2R0VA 5ETDA 2YEMA 5HRVA 3SVHA 4HXOA 5D3LA 3O34A 4O7FA 3MB3A 4QY4A 5CUAA 3G0LA 4UYEA 4A9NA 2DVRA 4TQNA 5DBMA 4CUUA 5HM0A 2H60A 2DVSA 4QZSA 5FH6A 4HXLA 4A9LA 4IR6A 4UITA 5FE5A 5HRWA 5IGNA 3HMEA 4J1PA 4UIVA 5HQ5A 5E7DA 5KU3A 4HXRA 4NR7A 5FB0A 2L84A 4UYFA 4WHWA 2N9GA 4YYDA 5IGKA 5E73A 4QBMA 4XY8A 5F3AA 4YABA 4YK0A 5C8GA 1F68A 5I86A 4QC3A 5FE6A 5C85A 3DWYA 5CGPA 4BW3A 4HXNA 3DAIA 5D3SA 3NXBA 5HQ6A 2RS9B 4UYHA 5COIA 3UW9A 2MJVB 4ZQLA 4TT2A 4QSRA 1E6IA 4C66A 5HLSA 2DVVA 5LKXA 5G4RA 4YATA 2R0YA 4CUSA 5FE4A 2DATA 5C4QA 5I80A 4UIXA 3QZVA 4N4HA 5LJ1A 4HXPA 2G4AA 3JVLA 5F1LA 5E9YA 4CFKA 4YYIA 4BJXA 4O72A 3MQMA 5HFQA 4MEQA 5HRXA 4AKIA 4Z6IA 4LYWA 2YEKA 3UVWA 2E3KA 3JVJA 4C67A 3P1FA 4HXKA 4YY6A 4A9IA 5JI8A 3IU6A 5L8TA 4X2IA 5A83A 2E7NA 3VKHA 3S91A 5F60A 4CL9A 4UYFB 2YDWA 5KO4A 5DFDA 5F62A 5K29A 5IG6A 5ETBA 5EWWA 5LVRA 4CURA 5C7NA 4XUBA 5H85A 5HJCA 4LZ2A 4QR4A 5FE9A 5ENIA 4PY6A 5EWVA 3UVDA 1ZS5A 3ZYUA 3MB4A 5HENA 5FB1A 3O36A 4LZRA 5CQ7A 1WUGA 4UIWA 3UVYA 4BHWA 5I7YA 1JM4B 5FE1A 4LRGA 3LJWA 4Z1QA 5CUCA 5DKDA 3ERRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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