4O75A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with fostamatinib
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o75A01
2D9EA 4A9EA 4E96A 5CU8A 4YADA 4UIZA 4O7AA 4F3IA 3MULA 5D3NA 2OUOA 5FFWA 4KV1A 2LSPB 5E74A 4MR6A 4LZ2A 4QEVA 5H85A 5FH8A 3K2JA 5CQ4A 4TT2A 5H1VA 5II2A 5ENBA 4O7EA 5CUEA 3Q2FA 1JM4B 3S91A 4LYWA 4PTBA 4A9LA 4NRAA 4O70A 5LJ0A 2RO1A 4LZRA 5ENCA 3NXBA 5IBNA 4NS5A 5FE0A 5D25A 5HQ6A 4NQNA 5EQ1A 2R0YA 3QZTA 4TT6A 4NR5A 4UIWA 4MR4A 4YAXA 5DW1A 4UYEA 5A82A 5LJ2A 2N9GA 5ETDA 4NYXA 5I1QA 4QUUA 4XYAA 5ENGA 5I83A 4QSQA 4QR5A 4IORA 4A9NA 5DLZA 5ENJA 5BT5A 5E9KA 5F36A 5AMFA 5IGMA 3UV2A 4NR8A 5EK9A 4O7BA 5DX4A 4YBTA 5HRXA 5I7XA 3LXJA 5L8TA 3LQIA 3P5OA 4GPJA 2OSSA 4NYWA 3JVMA 5AMEA 4UYFB 4RVRA 5I88A 5CGPA 5CQ5A 3UVDA 4IR3A 5D3PA 2DKWA 4LZSA 5HFQA 4HXNA 5II1A 1WUGA 4O77A 3MB3A 5F60A 5H1TA 5CTLA 5DBMA 4MR3A 4A9KA 5I7YA 5HQ7A 3I3JA 2F6NA 4QNSA 4CUPA 3MUKA 5E3DA 3U5JA 4PCEA 2YYNA 5CPEA 4ALHA 3O36A 4QR4A 5DFCA 4IOQA 3SVHA 2GRCA 3ZYUA 5FDZA 2WP1A 5I29A 5KTWA 5KTUA 2DATA 5LVQA 4MEPA 5DFDA 4QYDA 4ZQLA 5CQ8A 5IIDA 4ZW1A 5LUUA 5HENA 4UIVA 4MEQA 4CFKA 5FG4A 5A81A 5KHMA 5ENFA 5EM3A 4J3IA 3P1EA 4CURA 5L96A 4YH3A 1E6IA 4LR6A 2L85A 3RCWA 5F1HA 2KTBB 5EISA 3S92A 4OGIA 4O74A 3MXFA 4N4IA 3SVFA 5CUGA 5EWHA 5CFWA 4C67A 5EICA 5CQ7A 5FFYA 4IOOA 5BT3A 4LDFA 4UYHA 5C8GA 5D26A 5DFBA 5DKDA 5A7CA 4QEUA 5ACYA 4LC2A 1F68A 4J0RA 4BW2A 4UIYA 5E9YA 5CRMA 5D3RA 5F62A 5E9MA 5E73A 5HM0A 4CUUA 5AD2A 2R0VA 4NXJA 3HMFA 4IR6A 2I7KA 1EQFA 5FE5A 4NR4A 2DWWA 5HQ5A 5FE4A 4YYKA 5A5PA 4YATA 5DW2A 2E7OA 5BT4A 5IGNA 5EPSA 4IR4A 4OUFA 4TS8A 5FG6A 5A5NA 4YBSA 4QSXA 5DKHA 4XY8A 3D7CA 4CFLA 1ZS5A 5F2PA 5I40A 4HXSA 3UVWA 2RNWA 2RFJA 2YELA 5D24A 5HJCA 2YW5A 4MR5A 4QSRA 4FLPA 4QZSA 5F25A 5D3JA 5DYAA 5EPRA 5EVAA 5D3HA 4Y03A 3HMHA 5ENEA 3SVGA 2DVSA 2WP2A 4TTEA 5DKCA 5G4RA 4NR7A 4O7FA 3U5MA 3P1DA 5E3GA 5H1UA 2G4AA 3HMEA 5KTXA 3LQHA 4NRBA 5F63A 1WUMA 4YYGA 5LKXA 3TLPA 2RNYA 4MENA 5FE8A 5LJ1A 3IU6A 4HXOA 5A5SA 4TQNA 4CUSA 2D82A 4Z93A 5G4SA 3DAIA 5E9IA 5F1LA 5FFVA 5CUDA 3UW9A 5HELA 4N4HA 3UV5A 3U5OA 4UYGA 4TZ8A 3U5LA 4QSPA 4N4GA 5TB6A 3U5PA 4A9IA 3QZSA 2L5EA 4YYJA 4BJXA 5CY9A 5DLXA 3FKMX 2RS9B 4NYVA 4J1PA 5FE6A 3G0JA 5CQTA 4NUDA 4ALGA 5D0CA 4QSSA 4LRGA 5CS8A 5A5QA 5A83A 3QZVA 4YY6A 4QUTA 4NRCA 4A9JA 4NR6A 4TU6A 4A9MA 5A85A 4HXMA 5C7NA 4QSUA 3MB4A 4QBMA 2RNXA 5L98A 3ONIA 4YBMA 4KV4A 3O37A 4QYLA 4A9OA 3UV4A 4YY4A 4N4FA 5CRZA 4YK0A 4PKLA 3JVLA 4O76A 3AADA 5F5ZA 4O71A 4HXPA 4UYFA 5FE9A 4ZC9A 4XUBA 4PS5A 4HXLA 5JI8A 5HRWA 4QEWA 5AD3A 5CQAA 3AQAA 4XUAA 5I80A 5F61A 5HFRA 5I86A 4YC9A 5TCMA 4BW4A 3JVJA 4QSVA 3UVYA 5FE2A 4UYDA 4NUEA 5LKTA 4CL9A 4HBYA 4BW3A 5HLSA 5EGUA 4TYLA 4NQMA 4N3WA 4YH4A 4YYIA 4YABA 4CUQA 3Q2EA 5EV9A 1X0JA 2FSAA 5DY7A 5FE3A 5L97A 4C66A 5LKZA 2YDWA 5IGLA 3O34A 4PCIA 5K29A 4NR9A 4PY6A 5E9LA 3O35A 5C4QA 5EWCA 5FE7A 5LKUA 3G0LA 5L99A 5E7DA 5ENHA 4X2IA 5FH7A 4A9FA 4IR5A 3U5NA 1JSPB 2E7NA 5IG6A 5KU3A 5EP7A 5D3TA 4HBXA 5D3LA 5F3AA 5COIA 4NUCA 5L8UA 1N72A 4WHUA 5EWDA 5FG5A 4HXRA 5FH6A 4LYSA 2OO1A 4HBWA 3JVKA 4OGJA 5ENIA 2E3KA 4WHWA 4O78A 4YYMA 5JWMA 2YEMA 5E0RA 4LYIA 4QC3A 2I8NA 4XY9A 3U5KA 5E9VA 5EI4A 4UIXA 4Q0OA 3LQJA 4KCXA 2DVVA 4O7CA 5C89A 5EA1A 5DYXA 5CP5A 2DVQA 5CUBA 3P1CA 3LJWA 4O72A 4Z1QA 4YYHA 5HCLA 4Z6HA 5I89A 2YQDA 4QY4A 4QR3A 4BW1A 2L84A 5C85A 3GG3A 5CUCA 4CLBA 5FB0A 5EWVA 2R0SA 4A9HA 2R10A 4HXKA 3P1FA 5EWWA 5CUAA 5FB1A 5FBXA 4QC1A 5CZGA 4DONA 5C87A 5A5RA 5EPBA 2H60A 4Q0NA 4Z1SA 5CQ6A 5J0DA 2RI7A 2F6JA 4QSTA 2MJVB 5D3SA 4O75A 5DYCA 5DYUA 5D7XA 5FE1A 4AKNA 4UITA 5ETBA 4YYDA 2YEKA 4QB3A 4HBVA 4Z6IA 3MQMA 5CQ3A 4TU4A 4J0SA 2DVRA 3IU5A 5EU1A 5A5OA 3DWYA 3O33A 5HRVA 4MEOA 4BHWA 5KO4A 5IGKA 4QSWA 5LVRA 4CUTA 4TZ2A 2NXBA 4YYNA 4WIVA 4UIUA 4TT4A 5HEMA 3UVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D9EA 4A9EA 4E96A 5CU8A 4YADA 4UIZA 4O7AA 4F3IA 3MULA 5D3NA 2OUOA 5FFWA 4KV1A 2LSPB 5E74A 4MR6A 4LZ2A 4QEVA 5H85A 5FH8A 3K2JA 5CQ4A 4TT2A 5H1VA 5II2A 5ENBA 4O7EA 5CUEA 3Q2FA 1JM4B 3S91A 4LYWA 4PTBA 4A9LA 4NRAA 4O70A 5LJ0A 2RO1A 4LZRA 5ENCA 3NXBA 5IBNA 4NS5A 5FE0A 5D25A 5HQ6A 4NQNA 5EQ1A 2R0YA 3QZTA 4TT6A 4NR5A 4UIWA 4MR4A 4YAXA 5DW1A 4UYEA 5A82A 5LJ2A 2N9GA 5ETDA 4NYXA 5I1QA 4QUUA 4XYAA 5ENGA 5I83A 4QSQA 4QR5A 4IORA 4A9NA 5DLZA 5ENJA 5BT5A 5E9KA 5F36A 5AMFA 5IGMA 3UV2A 4NR8A 5EK9A 4O7BA 5DX4A 4YBTA 5HRXA 5I7XA 3LXJA 5L8TA 3LQIA 3P5OA 4GPJA 2OSSA 4NYWA 3JVMA 5AMEA 4UYFB 4RVRA 5I88A 5CGPA 5CQ5A 3UVDA 4IR3A 5D3PA 2DKWA 4LZSA 5HFQA 4HXNA 5II1A 1WUGA 4O77A 3MB3A 5F60A 5H1TA 5CTLA 5DBMA 4MR3A 4A9KA 5I7YA 5HQ7A 3I3JA 2F6NA 4QNSA 4CUPA 3MUKA 5E3DA 3U5JA 4PCEA 2YYNA 5CPEA 4ALHA 3O36A 4QR4A 5DFCA 4IOQA 3SVHA 2GRCA 3ZYUA 5FDZA 2WP1A 5I29A 5KTWA 5KTUA 2DATA 5LVQA 4MEPA 5DFDA 4QYDA 4ZQLA 5CQ8A 5IIDA 4ZW1A 5LUUA 5HENA 4UIVA 4MEQA 4CFKA 5FG4A 5A81A 5KHMA 5ENFA 5EM3A 4J3IA 3P1EA 4CURA 5L96A 4YH3A 1E6IA 4LR6A 2L85A 3RCWA 5F1HA 2KTBB 5EISA 3S92A 4OGIA 4O74A 3MXFA 4N4IA 3SVFA 5CUGA 5EWHA 5CFWA 3VKGA 4C67A 5EICA 5CQ7A 5FFYA 4IOOA 5BT3A 4LDFA 4UYHA 5C8GA 5D26A 5DFBA 5DKDA 5A7CA 4QEUA 5ACYA 4LC2A 1F68A 4J0RA 4BW2A 4UIYA 5E9YA 5CRMA 5D3RA 5F62A 5E9MA 5E73A 5HM0A 4CUUA 5AD2A 2R0VA 4NXJA 3HMFA 4IR6A 2I7KA 1EQFA 5FE5A 4NR4A 2DWWA 5HQ5A 5FE4A 4YYKA 5A5PA 4YATA 5DW2A 2E7OA 5BT4A 5IGNA 5EPSA 4IR4A 4OUFA 4TS8A 5FG6A 5A5NA 4YBSA 4QSXA 5DKHA 4XY8A 3D7CA 4CFLA 1ZS5A 5F2PA 5I40A 4HXSA 3UVWA 2RNWA 2RFJA 2YELA 5D24A 5HJCA 2YW5A 1PUOA 4MR5A 4QSRA 4FLPA 4QZSA 5F25A 5D3JA 5DYAA 5EPRA 5EVAA 5D3HA 4Y03A 3HMHA 5ENEA 3SVGA 2DVSA 2WP2A 4TTEA 5DKCA 5G4RA 4NR7A 4O7FA 3U5MA 2EJNA 3P1DA 5E3GA 5H1UA 2G4AA 3HMEA 5KTXA 3LQHA 4NRBA 5F63A 1WUMA 4YYGA 5LKXA 3TLPA 2RNYA 4MENA 5FE8A 5LJ1A 3IU6A 4HXOA 5A5SA 4TQNA 4CUSA 2D82A 4Z93A 5G4SA 3DAIA 5E9IA 5F1LA 4AKIA 5FFVA 5CUDA 3UW9A 5HELA 4N4HA 3UV5A 3U5OA 4UYGA 4TZ8A 3U5LA 4QSPA 4N4GA 5TB6A 3U5PA 4A9IA 3QZSA 2L5EA 4YYJA 4BJXA 5CY9A 5DLXA 3FKMX 2RS9B 4NYVA 4J1PA 5FE6A 3G0JA 5CQTA 4NUDA 4ALGA 5D0CA 4QSSA 4LRGA 5CS8A 5A5QA 5A83A 3QZVA 4YY6A 4QUTA 4NRCA 1ZKRA 4A9JA 4NR6A 4TU6A 4A9MA 5A85A 4HXMA 5C7NA 4QSUA 3MB4A 4QBMA 2RNXA 5L98A 3ONIA 4YBMA 4KV4A 3O37A 4QYLA 4A9OA 3UV4A 4YY4A 4N4FA 5CRZA 4YK0A 4PKLA 3JVLA 4O76A 3AADA 5F5ZA 4O71A 4HXPA 4UYFA 5FE9A 4ZC9A 4XUBA 4PS5A 4HXLA 5JI8A 5HRWA 4QEWA 3D1DA 5AD3A 5CQAA 3AQAA 4XUAA 5I80A 5F61A 5HFRA 5I86A 4YC9A 5TCMA 4BW4A 3JVJA 4QSVA 3UVYA 5FE2A 4UYDA 4NUEA 5LKTA 4CL9A 4HBYA 4BW3A 5HLSA 3D1BA 5EGUA 4TYLA 4NQMA 4N3WA 4YH4A 4YYIA 4YABA 4CUQA 3Q2EA 5EV9A 1X0JA 2FSAA 5DY7A 5FE3A 5L97A 4C66A 5LKZA 2YDWA 5IGLA 3O34A 4PCIA 5K29A 4NR9A 4PY6A 5E9LA 3O35A 5C4QA 5EWCA 5FE7A 5LKUA 3G0LA 5L99A 5E7DA 5ENHA 4X2IA 5FH7A 4AI6A 4A9FA 4IR5A 3U5NA 1JSPB 2E7NA 5IG6A 5KU3A 5EP7A 5D3TA 4HBXA 5D3LA 5F3AA 5COIA 4NUCA 5L8UA 1N72A 4WHUA 5EWDA 5FG5A 4HXRA 5FH6A 4LYSA 2OO1A 4HBWA 3JVKA 4OGJA 5ENIA 2E3KA 4WHWA 4O78A 4YYMA 5JWMA 2YEMA 5E0RA 4LYIA 4AKGA 4QC3A 2I8NA 4XY9A 3U5KA 5E9VA 5EI4A 4UIXA 4Q0OA 3LQJA 4KCXA 2DVVA 4O7CA 5C89A 5EA1A 5DYXA 5CP5A 2DVQA 5CUBA 3P1CA 3LJWA 4O72A 4Z1QA 4YYHA 5HCLA 4Z6HA 5I89A 2YQDA 4QY4A 4QR3A 4BW1A 2L84A 5C85A 3GG3A 5CUCA 4CLBA 5FB0A 5EWVA 2R0SA 4A9HA 2R10A 4HXKA 3P1FA 5EWWA 5CUAA 5FB1A 5FBXA 4QC1A 5CZGA 4DONA 5C87A 5A5RA 5EPBA 2H60A 3ERRA 4Q0NA 4Z1SA 5CQ6A 5J0DA 2RI7A 2F6JA 4QSTA 2MJVB 5D3SA 4O75A 5DYCA 5DYUA 5D7XA 5FE1A 4AKNA 4UITA 5ETBA 4YYDA 2YEKA 4QB3A 4HBVA 4Z6IA 3MQMA 5CQ3A 4AKHA 4TU4A 3VKHA 4J0SA 2DVRA 3IU5A 5EU1A 5A5OA 3DWYA 3O33A 5HRVA 4MEOA 4BHWA 5KO4A 5IGKA 4QSWA 5LVRA 4CUTA 4TZ2A 2NXBA 4YYNA 4WIVA 4UIUA 4TT4A 5HEMA 3UVXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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