5I83A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02773986
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 40
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i83A00
3U5OA 2YELA 5DYXA 5D0CA 4HXSA 5COIA 2RNXA 4O7BA 5JWMA 2OUOA 4IR4A 4QUTA 5E9KA 5IGLA 4PKLA 5ENGA 4IR5A 5I7XA 5HQ6A 4HBXA 4HXRA 4QEWA 5FE5A 5EM3A 4QYLA 3LQHA 5CS8A 3U5PA 5I7YA 3DWYA 3LQJA 4QSSA 4MENA 5CUAA 4PCIA 5FH7A 5FE2A 3ZYUA 2DVVA 4LZSA 4WIVA 5D24A 4CUPA 3U5NA 5E9IA 4MR5A 5H1VA 5I40A 2DVQA 5A83A 3MUKA 4HXKA 5C87A 4PS5A 1X0JA 3UW9A 3O34A 3HMEA 4LYWA 2D9EA 5L96A 5LKXA 4OGIA 3AQAA 2RFJA 4UYHA 5EICA 4YAXA 4UITA 4NRBA 2F6NA 3K2JA 5A5QA 4A9FA 5K29A 5EWDA 5I86A 4UIWA 5EPSA 4A9JA 5LUUA 5EWCA 4J0RA 4UYGA 5CQ3A 4WHUA 4BW3A 4NR5A 3QZVA 4MR4A 4QEUA 5I80A 5LKTA 4N4GA 4PCEA 4J1PA 5FG6A 4A9KA 4HXNA 2D82A 5HRVA 5D3RA 5A5SA 2WP2A 4QSQA 2H60A 3HMFA 4BW1A 5E7DA 5ACYA 1WUGA 3JVJA 5CTLA 3LXJA 5DW2A 4UYEA 5E9YA 5CP5A 4O7AA 4QNSA 5EGUA 3MXFA 4MEPA 3G0JA 5EP7A 5HRWA 3IU5A 3UVDA 4UIYA 4CUTA 5II1A 5F5ZA 5EISA 5AMFA 5IG6A 3UVWA 4C67A 5I83A 4HBWA 3G0LA 5CU8A 5FE6A 4QZSA 4QYDA 4IOQA 4YYGA 4RVRA 4NR4A 5E73A 1JM4B 4YATA 3U5LA 3SVFA 5IGNA 3O33A 3UV4A 5A7CA 5F1LA 4HXPA 4NS5A 5ENJA 3UVYA 4QSUA 4A9OA 4WHWA 4IORA 4YH3A 5F3AA 5EA1A 5E9LA 2L85A 1E6IA 4UYDA 5LKZA 5DX4A 2I7KA 4NQNA 4O70A 5II2A 4F3IA 5FE9A 5D26A 3D7CA 5L8TA 2KTBB 5A5RA 5HFQA 4OGJA 4DONA 3DAIA 4UIXA 5KTUA 4HXOA 3I3JA 5LVRA 5F25A 5FE1A 5AMEA 4O7FA 5EQ1A 4YADA 4YYJA 3NXBA 5DLXA 5FE3A 5L97A 3O37A 5FFYA 3RCWA 4J0SA 4CURA 1JSPB 3IU6A 5HFRA 5A5OA 4O77A 4A9MA 4QSPA 5J0DA 4Z93A 5LJ0A 5I1QA 4MEOA 4BHWA 5HELA 3SVGA 4O74A 4TT2A 5C85A 4A9NA 5E9VA 5L98A 3UV5A 5BT4A 1EQFA 5C8GA 5A5PA 4CUQA 2OO1A 2YDWA 4PTBA 2R10A 5HJCA 5CPEA 5FDZA 4NR9A 5F63A 2E7OA 4LRGA 3MB3A 5EPBA 4Z6HA 3QZSA 5KO4A 3O36A 4A9EA 4TS8A 4QR4A 4LZ2A 4LZRA 5CUCA 5CQ7A 4KCXA 2YW5A 5L99A 5EI4A 4CL9A 2R0YA 4XYAA 5CUBA 5H1TA 4Y03A 4QSXA 4QUUA 5ETBA 5AD2A 5EU1A 4QC1A 4ZW1A 4TT6A 3UVXA 4QB3A 5IGKA 5ENEA 3Q2FA 4TZ2A 4MEQA 2RNYA 5CQ6A 5E74A 2LSPB 4A9LA 5TB6A 5F36A 4NYVA 2YEKA 2N9GA 4XY9A 5DFDA 4UIVA 4PY6A 4N4FA 3LJWA 4NR8A 4NR7A 5D7XA 4NRAA 5ENBA 5FG4A 5FH6A 5EK9A 2L84A 4O78A 5ENCA 3P5OA 4MR3A 4XUAA 3AADA 5CFWA 2L5EA 5D3PA 5KHMA 4QY4A 5DBMA 5DW1A 2YQDA 2RNWA 3JVLA 4YY4A 4LC2A 5IIDA 3FKMX 4IR3A 4NUEA 5E9MA 4CUUA 5A82A 4Q0OA 3MULA 4QR5A 4KV1A 4YY6A 2OSSA 5CRMA 4YYNA 4LDFA 4NUCA 5D3TA 4BJXA 4N3WA 5DKCA 5CUGA 5FFVA 5CQAA 4BW4A 5FE8A 5EV9A 2R0VA 5FFWA 3S92A 4QEVA 4YBMA 2FSAA 3UV2A 4BW2A 5BT3A 2DWWA 4HBYA 5C7NA 3P1EA 3ONIA 4TZ8A 4NQMA 5AD3A 3O35A 5CGPA 5F2PA 4NRCA 5HEMA 5CUEA 5DYUA 4A9IA 5DYCA 2G4AA 4TU4A 4ALHA 4LYSA 5ENFA 5F62A 5LJ1A 5LJ2A 2DVRA 4NYXA 5I88A 5D25A 5H85A 2RS9B 4YBSA 2GRCA 3MQMA 4CLBA 4YABA 2YEMA 4O7EA 4HXMA 4OUFA 4TT4A 5DKHA 5DLZA 2DKWA 4QSRA 4X2IA 3P1CA 4Q0NA 1ZS5A 3MB4A 4XUBA 2YYNA 4N4HA 2E7NA 5EVAA 5I29A 5TCMA 4QR3A 5HQ5A 5DFBA 5LVQA 5A85A 4QSVA 5F60A 3GG3A 2R0SA 5ENIA 5H1UA 5EWWA 4IR6A 5ENHA 4UIUA 4IOOA 5LKUA 3JVKA 3Q2EA 4LYIA 4KV4A 4O72A 3QZTA 4TTEA 5KTXA 2WP1A 4E96A 2RI7A 5I89A 5L8UA 4YYDA 1WUMA 4ZQLA 5FBXA 5CQ4A 4O7CA 2RO1A 4MR6A 3U5JA 5CQ8A 5E3GA 5IBNA 5C4QA 5CY9A 5HQ7A 4YYMA 4LR6A 2NXBA 4A9HA 4CFLA 4YYHA 4YYIA 5EWHA 5BT5A 5ETDA 4ZC9A 3U5KA 5CQTA 5HM0A 2I8NA 3JVMA 4QBMA 5FE0A 5A81A 3HMHA 3S91A 2F6JA 4CUSA 3P1DA 5FB1A 5A5NA 2MJVB 3P1FA 5DY7A 5FE4A 3TLPA 5HCLA 4QSTA 5KU3A 5HRXA 2DATA 4ALGA 5E0RA 5CQ5A 4C66A 4Z1SA 4Z6IA 4O75A 4TYLA 5CRZA 5CUDA 5KTWA 4NXJA 4YH4A 4NUDA 5IGMA 5G4SA 4TQNA 4HXLA 4YYKA 4UYFA 5G4RA 3SVHA 4QSWA 4HBVA 3U5MA 4QC3A 4O71A 5D3HA 4O76A 5EWVA 4CFKA 5F1HA 4UYFB 4GPJA 4XY8A 3LQIA 5JI8A 4TU6A 5HENA 4Z1QA 5C89A 5D3NA 4NYWA 4AKNA 4FLPA 2DVSA 4N4IA 4NR6A 5DFCA 5D3SA 5E3DA 5FG5A 5HLSA 4J3IA 5FH8A 4YC9A 5F61A 4YBTA 5EPRA 4YK0A 5FB0A 1F68A 5D3JA 5FE7A 5DKDA 1N72A 2E3KA 5DYAA 5CZGA 4UIZA 5D3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U5OA 2YELA 5DYXA 5D0CA 3ERRA 4HXSA 5COIA 2RNXA 4O7BA 5JWMA 2OUOA 4IR4A 4QUTA 5E9KA 5IGLA 4PKLA 5ENGA 4IR5A 5I7XA 5HQ6A 4HBXA 4HXRA 4QEWA 5FE5A 5EM3A 4QYLA 3LQHA 5CS8A 3U5PA 5I7YA 3DWYA 3LQJA 2EJNA 4QSSA 4MENA 5CUAA 4PCIA 5FH7A 5FE2A 3ZYUA 2DVVA 4LZSA 4WIVA 5D24A 4CUPA 3U5NA 5E9IA 4MR5A 5H1VA 5I40A 2DVQA 5A83A 3MUKA 4HXKA 5C87A 4PS5A 1X0JA 3UW9A 3O34A 3HMEA 4LYWA 2D9EA 5L96A 5LKXA 4OGIA 3AQAA 4AI6A 2RFJA 4UYHA 5EICA 3D1BA 4YAXA 4UITA 4NRBA 2F6NA 3K2JA 5A5QA 4A9FA 5K29A 5EWDA 5I86A 4UIWA 5EPSA 4A9JA 5LUUA 5EWCA 4J0RA 4UYGA 5CQ3A 4WHUA 4BW3A 4NR5A 3QZVA 4MR4A 4QEUA 5I80A 5LKTA 4N4GA 4PCEA 4J1PA 5FG6A 4A9KA 4HXNA 2D82A 5HRVA 5D3RA 5A5SA 2WP2A 4QSQA 2H60A 3HMFA 4BW1A 5E7DA 5ACYA 1WUGA 3JVJA 5CTLA 3LXJA 5DW2A 4UYEA 5E9YA 5CP5A 4O7AA 4QNSA 5EGUA 3MXFA 4MEPA 3G0JA 5EP7A 5HRWA 3IU5A 3UVDA 4UIYA 4CUTA 5II1A 5F5ZA 5EISA 5AMFA 5IG6A 3UVWA 4C67A 5I83A 4HBWA 3G0LA 5CU8A 5FE6A 4QZSA 4QYDA 4IOQA 4YYGA 4RVRA 4NR4A 5E73A 1JM4B 4YATA 3U5LA 3VKHA 3SVFA 5IGNA 3O33A 3UV4A 5A7CA 5F1LA 4HXPA 4NS5A 5ENJA 3UVYA 4QSUA 4A9OA 4WHWA 4IORA 4YH3A 5F3AA 5EA1A 1ZKRA 5E9LA 2L85A 1E6IA 4UYDA 5LKZA 5DX4A 2I7KA 4NQNA 4O70A 5II2A 3D1DA 4F3IA 5FE9A 5D26A 3D7CA 5L8TA 2KTBB 1PUOA 5A5RA 5HFQA 4OGJA 4DONA 3DAIA 4UIXA 5KTUA 4HXOA 3I3JA 5LVRA 5F25A 5FE1A 4AKGA 5AMEA 4O7FA 5EQ1A 4YADA 4YYJA 3NXBA 5DLXA 5FE3A 5L97A 3O37A 5FFYA 4AKHA 3RCWA 4J0SA 4CURA 1JSPB 3IU6A 5HFRA 5A5OA 4O77A 4A9MA 4QSPA 5J0DA 4Z93A 5LJ0A 5I1QA 4MEOA 4BHWA 5HELA 3SVGA 4O74A 4TT2A 5C85A 4A9NA 5E9VA 5L98A 3UV5A 5BT4A 1EQFA 5C8GA 5A5PA 4CUQA 2OO1A 2YDWA 4PTBA 2R10A 5HJCA 5CPEA 5FDZA 4NR9A 5F63A 2E7OA 4LRGA 3MB3A 5EPBA 4Z6HA 3QZSA 5KO4A 3O36A 4A9EA 4TS8A 4QR4A 4LZ2A 4LZRA 5CUCA 5CQ7A 4KCXA 2YW5A 5L99A 5EI4A 4CL9A 2R0YA 4XYAA 5CUBA 5H1TA 4Y03A 4QSXA 4QUUA 5ETBA 5AD2A 5EU1A 4QC1A 4ZW1A 4TT6A 3UVXA 4QB3A 5IGKA 5ENEA 3Q2FA 4TZ2A 4MEQA 2RNYA 5CQ6A 5E74A 2LSPB 4A9LA 5TB6A 5F36A 4NYVA 2YEKA 2N9GA 4XY9A 5DFDA 4UIVA 4PY6A 4N4FA 3LJWA 4NR8A 4NR7A 5D7XA 4NRAA 5ENBA 5FG4A 5FH6A 5EK9A 2L84A 4O78A 5ENCA 3P5OA 4MR3A 4XUAA 3AADA 5CFWA 2L5EA 5D3PA 5KHMA 4QY4A 5DBMA 5DW1A 2YQDA 2RNWA 3JVLA 4YY4A 4LC2A 5IIDA 3FKMX 4IR3A 4NUEA 5E9MA 4CUUA 4AKIA 5A82A 4Q0OA 3MULA 4QR5A 4KV1A 4YY6A 2OSSA 5CRMA 4YYNA 4LDFA 4NUCA 5D3TA 4BJXA 4N3WA 5DKCA 5CUGA 5FFVA 5CQAA 4BW4A 5FE8A 5EV9A 2R0VA 5FFWA 3S92A 4QEVA 4YBMA 2FSAA 3UV2A 4BW2A 5BT3A 2DWWA 4HBYA 5C7NA 3P1EA 3ONIA 4TZ8A 4NQMA 5AD3A 3O35A 5CGPA 5F2PA 4NRCA 5HEMA 5CUEA 5DYUA 4A9IA 5DYCA 2G4AA 4TU4A 4ALHA 4LYSA 5ENFA 5F62A 5LJ1A 5LJ2A 2DVRA 4NYXA 5I88A 5D25A 5H85A 2RS9B 4YBSA 2GRCA 3MQMA 4CLBA 4YABA 2YEMA 4O7EA 4HXMA 4OUFA 4TT4A 5DKHA 5DLZA 2DKWA 4QSRA 4X2IA 3P1CA 4Q0NA 1ZS5A 3MB4A 4XUBA 2YYNA 4N4HA 2E7NA 5EVAA 5I29A 5TCMA 4QR3A 5HQ5A 5DFBA 5LVQA 5A85A 4QSVA 5F60A 3GG3A 2R0SA 5ENIA 5H1UA 5EWWA 4IR6A 5ENHA 4UIUA 4IOOA 5LKUA 3JVKA 3Q2EA 4LYIA 4KV4A 4O72A 3QZTA 4TTEA 5KTXA 2WP1A 4E96A 2RI7A 5I89A 5L8UA 4YYDA 1WUMA 4ZQLA 5FBXA 5CQ4A 4O7CA 2RO1A 4MR6A 3U5JA 5CQ8A 5E3GA 5IBNA 5C4QA 5CY9A 5HQ7A 4YYMA 4LR6A 2NXBA 4A9HA 4CFLA 4YYHA 4YYIA 5EWHA 5BT5A 5ETDA 4ZC9A 3U5KA 5CQTA 5HM0A 2I8NA 3JVMA 4QBMA 5FE0A 5A81A 3HMHA 3S91A 2F6JA 3VKGA 4CUSA 3P1DA 5FB1A 5A5NA 2MJVB 3P1FA 5DY7A 5FE4A 3TLPA 5HCLA 4QSTA 5KU3A 5HRXA 2DATA 4ALGA 5E0RA 5CQ5A 4C66A 4Z1SA 4Z6IA 4O75A 4TYLA 5CRZA 5CUDA 5KTWA 4NXJA 4YH4A 4NUDA 5IGMA 5G4SA 4TQNA 4HXLA 4YYKA 4UYFA 5G4RA 3SVHA 4QSWA 4HBVA 3U5MA 4QC3A 4O71A 5D3HA 4O76A 5EWVA 4CFKA 5F1HA 4UYFB 4GPJA 4XY8A 3LQIA 5JI8A 4TU6A 5HENA 4Z1QA 5C89A 5D3NA 4NYWA 4AKNA 4FLPA 2DVSA 4N4IA 4NR6A 5DFCA 5D3SA 5E3DA 5FG5A 5HLSA 4J3IA 5FH8A 4YC9A 5F61A 4YBTA 5EPRA 4YK0A 5FB0A 1F68A 5D3JA 5FE7A 5DKDA 1N72A 2E3KA 5DYAA 5CZGA 4UIZA 5D3LA
chains in the Genus database with same CATH topology
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