5E9MA

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with n-methyltrimethylacetamide
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title High-Throughput Fragment Docking into the BAZ2B Bromodomain: Efficient in Silico Screening for X-Ray Crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e9mA00
3UVXA 5BT5A 5I80A 2R0YA 4QUTA 5LJ1A 5AD3A 5A85A 3U5MA 4QY4A 4A9JA 4XY9A 5CTLA 4QUUA 4A9HA 5FE7A 4UYFB 4ZC9A 5DKDA 3GG3A 5CS8A 5EU1A 2DVVA 4HXLA 3HMEA 4O7CA 5G4RA 4HXPA 4QZSA 4QEWA 1JSPB 4O70A 5JI8A 3MB3A 4ALHA 2YEKA 2R0SA 5CQ6A 2E7NA 5F5ZA 4ALGA 4MEQA 4PKLA 3DWYA 4BW3A 5ENIA 4Z1SA 5CU8A 5TB6A 4A9FA 5AMEA 3SVGA 4NS5A 3Q2EA 4Y03A 5D3SA 5COIA 5I89A 4XUAA 4N4HA 3HMHA 5IGNA 4MENA 3LQIA 5I40A 5I86A 4UIXA 4NQNA 5A82A 4CL9A 5II2A 4TT2A 5C4QA 5ENHA 5K29A 5ETBA 1ZS5A 4LC2A 2YQDA 2RNWA 3Q2FA 4J1PA 5HQ6A 3SVHA 5L99A 3G0LA 5E3GA 4XY8A 5L96A 3P1DA 5EQ1A 2L85A 4YBSA 5EPBA 4WHUA 5BT4A 3AADA 4HXSA 2DKWA 5FE3A 4XUBA 4UIUA 5D3HA 2E7OA 5I1QA 5E9VA 3O35A 5A81A 2YELA 4YK0A 4LR6A 2RFJA 5LUUA 4QB3A 1F68A 5CUCA 5DW2A 5CP5A 5KU3A 5D3JA 5KTXA 5E73A 5E9MA 5KTWA 5E0RA 2E3KA 4A9NA 4MR6A 5BT3A 2GRCA 4Z93A 4YBTA 5DFBA 5CFWA 5F63A 4AKNA 3MB4A 4NRBA 3U5PA 4QR4A 5KTUA 4NR6A 4QC1A 4NR4A 3JVLA 5C8GA 5D25A 4IR4A 4LDFA 4PCIA 5F36A 5E9IA 5CUEA 5C87A 3RCWA 5I88A 3UV2A 4YYGA 5EGUA 5A5QA 3UVDA 5CUGA 5F1HA 4C67A 5DYCA 4QSXA 5EK9A 4YYHA 4DONA 5CUBA 5HQ5A 3QZVA 4IOQA 2WP1A 4KCXA 3P1EA 3O36A 5EP7A 4QYLA 5EM3A 5L8TA 2D9EA 4NXJA 4O76A 4UYDA 3LXJA 5L8UA 5HEMA 5FB1A 5FFVA 5A5RA 5HLSA 5J0DA 4N4IA 5HELA 5EWWA 4A9LA 5IGKA 5DKCA 2FSAA 2DWWA 4UIZA 3U5LA 5CRMA 4NYWA 5CY9A 4HXRA 4NR7A 4PY6A 3UVYA 4Z1QA 5A5OA 5A5SA 5E74A 2RO1A 2NXBA 2KTBB 3O34A 4TZ8A 5FFYA 5CZGA 3UV4A 5CQ4A 5EISA 3S91A 5E3DA 4IR3A 4O72A 2YYNA 4NRAA 5ENEA 5HM0A 5F2PA 4CLBA 4ZQLA 4YC9A 5FFWA 5FE9A 3LQJA 4HBWA 4O74A 4YBMA 5FE5A 5EWCA 4IR6A 5TCMA 3MXFA 5D3RA 2DVQA 2I7KA 3D7CA 5DFDA 4YYKA 5DBMA 5CPEA 5EWDA 5L97A 4CUPA 5LKUA 1JM4B 4QSPA 5DYXA 4MR5A 4Z6IA 5CUDA 4CUQA 5KO4A 5I7YA 5D3TA 4XYAA 2H60A 5ENGA 5D3NA 5LKTA 5CQTA 5JWMA 5HCLA 5AD2A 2RS9B 5FG5A 5IGMA 4YATA 4QYDA 5F1LA 4TZ2A 4YYIA 5ENFA 5LJ0A 4YABA 5CQAA 2YEMA 2F6JA 4YH4A 3ZYUA 4O7EA 3P5OA 4NR9A 4YAXA 5FB0A 4MEOA 4FLPA 3P1FA 3LQHA 5DYAA 4WHWA 4CFLA 5HRWA 5D0CA 4NUEA 4O75A 3K2JA 4LYIA 4LZ2A 4YYMA 4QC3A 4PTBA 5E9LA 4CUTA 2DVRA 4N4GA 5FDZA 5FG6A 5EA1A 5CGPA 5D3LA 5D7XA 5IG6A 4GPJA 5C89A 4J0RA 4YYJA 1N72A 3AQAA 5F25A 5ETDA 4HXMA 4QR5A 4NYXA 1EQFA 4UIWA 5I83A 4LZSA 4Q0NA 5A5NA 3QZSA 4J0SA 4NUCA 4TT6A 3MULA 4HBVA 4WIVA 2I8NA 4KV1A 5H1UA 4QSSA 5CQ3A 2G4AA 2WP2A 4NR5A 2R10A 5KHMA 4QEVA 4IOOA 4O7AA 2N9GA 4NRCA 3HMFA 5CRZA 5F61A 5EPSA 5EVAA 4OUFA 2L5EA 4HBXA 4LRGA 4QSRA 4Z6HA 4O71A 2RNYA 2R0VA 5F3AA 3IU6A 3JVJA 4QSQA 3JVMA 5A83A 4A9OA 4TU6A 4UYGA 5LVRA 4IORA 4QBMA 3NXBA 4HXKA 5LKZA 5HRXA 4YY4A 3IU5A 3U5OA 1E6IA 4QR3A 4O77A 5FBXA 4NUDA 5EWHA 4UYHA 5FH7A 5ENCA 5FG4A 2OSSA 5AMFA 4BW2A 5CQ8A 4OGIA 4E96A 4MR3A 4MR4A 2RNXA 4NYVA 4TT4A 4UIVA 4YH3A 4CUSA 4UYEA 5CQ7A 2LSPB 5A7CA 4QEUA 4QSVA 2YDWA 4NQMA 5A5PA 4CURA 3S92A 3TLPA 3DAIA 3U5KA 4MEPA 3FKMX 5EWVA 4J3IA 5E7DA 4YYNA 4C66A 3MUKA 4HXOA 2F6NA 4CFKA 3O33A 5IGLA 2DATA 4YADA 3U5JA 4UITA 5HQ7A 5LJ2A 2L84A 5H1TA 5LVQA 4BHWA 4A9MA 5LKXA 5L98A 4OGJA 4CUUA 1WUMA 3I3JA 5D24A 4ZW1A 5ACYA 3JVKA 5I29A 5HENA 5II1A 4O7BA 4PCEA 4O7FA 2MJVB 5E9YA 3UW9A 4N3WA 5DY7A 5C7NA 4LYSA 3ONIA 5HFQA 4BJXA 1X0JA 3QZTA 5CUAA 2RI7A 5EV9A 4O78A 5FE8A 5FE4A 2OUOA 5IBNA 4A9IA 3UV5A 4TU4A 3G0JA 4YYDA 5DKHA 5F60A 4RVRA 3UVWA 4KV4A 2OO1A 4TS8A 5F62A 4HBYA 5D26A 5FE1A 4BW1A 4TQNA 5FE2A 5FH8A 5DW1A 4X2IA 5DYUA 5C85A 5DLZA 3LJWA 4A9KA 3MQMA 4F3IA 5EI4A 4QSWA 5DLXA 5FE0A 4IR5A 4N4FA 4QSTA 5DX4A 5H1VA 5DFCA 5HFRA 4NR8A 4PS5A 5IIDA 4BW4A 4TTEA 4TYLA 5H85A 4UYFA 4LYWA 5G4SA 5HJCA 1WUGA 4HXNA 4YY6A 5I7XA 4UIYA 3SVFA 4A9EA 4Q0OA 2DVSA 4QSUA 5ENJA 5D3PA 5HRVA 3O37A 2YW5A 5EPRA 5EICA 3U5NA 2D82A 3P1CA 5FH6A 4QNSA 5FE6A 5CQ5A 5E9KA 4LZRA 5ENBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UVXA 5BT5A 5I80A 2R0YA 4QUTA 5LJ1A 5AD3A 5A85A 3U5MA 4QY4A 4A9JA 4XY9A 5CTLA 4QUUA 4A9HA 5FE7A 4UYFB 4ZC9A 5DKDA 3GG3A 5CS8A 5EU1A 2DVVA 4HXLA 3D1BA 3HMEA 4O7CA 5G4RA 4HXPA 4QZSA 4QEWA 1JSPB 4O70A 5JI8A 3MB3A 4ALHA 2YEKA 2R0SA 5CQ6A 2E7NA 5F5ZA 4ALGA 4AI6A 4MEQA 4PKLA 3DWYA 4BW3A 5ENIA 4Z1SA 5CU8A 5TB6A 4A9FA 5AMEA 3SVGA 4NS5A 3Q2EA 4Y03A 5D3SA 5COIA 5I89A 4XUAA 4N4HA 3HMHA 5IGNA 4MENA 3LQIA 5I40A 5I86A 4UIXA 4NQNA 5A82A 4CL9A 5II2A 4TT2A 5C4QA 5ENHA 5K29A 5ETBA 4AKIA 1ZS5A 4LC2A 2YQDA 2RNWA 3Q2FA 4J1PA 5HQ6A 3SVHA 5L99A 2EJNA 3G0LA 3ERRA 5E3GA 4XY8A 5L96A 3P1DA 5EQ1A 2L85A 4YBSA 5EPBA 4WHUA 5BT4A 3AADA 4HXSA 2DKWA 5FE3A 4XUBA 4UIUA 5D3HA 2E7OA 5I1QA 5E9VA 3O35A 5A81A 2YELA 4YK0A 4LR6A 2RFJA 5LUUA 4QB3A 1F68A 5CUCA 5DW2A 5CP5A 5KU3A 5D3JA 5KTXA 5E73A 5E9MA 5KTWA 5E0RA 2E3KA 4A9NA 4MR6A 5BT3A 2GRCA 4Z93A 4YBTA 5DFBA 5CFWA 5F63A 4AKNA 3MB4A 4NRBA 3U5PA 4QR4A 5KTUA 4NR6A 4QC1A 4NR4A 3JVLA 5C8GA 5D25A 4IR4A 4LDFA 4PCIA 5F36A 5E9IA 5CUEA 5C87A 3RCWA 5I88A 3UV2A 4YYGA 5EGUA 5A5QA 3UVDA 5CUGA 5F1HA 4C67A 5DYCA 4QSXA 5EK9A 4YYHA 4DONA 5CUBA 5HQ5A 3QZVA 4IOQA 2WP1A 4KCXA 3P1EA 3O36A 5EP7A 4QYLA 5EM3A 5L8TA 2D9EA 4NXJA 4O76A 4UYDA 3LXJA 5L8UA 5HEMA 5FB1A 5FFVA 5A5RA 5HLSA 5J0DA 4N4IA 5HELA 5EWWA 4A9LA 5IGKA 5DKCA 2FSAA 2DWWA 4UIZA 3U5LA 5CRMA 4NYWA 5CY9A 4HXRA 4NR7A 4PY6A 3UVYA 4Z1QA 5A5OA 5A5SA 5E74A 2RO1A 2NXBA 2KTBB 3O34A 4TZ8A 5FFYA 5CZGA 3UV4A 5CQ4A 5EISA 3S91A 5E3DA 4IR3A 4O72A 2YYNA 4NRAA 5ENEA 5HM0A 5F2PA 4CLBA 4ZQLA 4YC9A 5FFWA 5FE9A 3LQJA 4HBWA 4O74A 4YBMA 5FE5A 5EWCA 4IR6A 5TCMA 3MXFA 5D3RA 2DVQA 2I7KA 3D7CA 5DFDA 4YYKA 5DBMA 5CPEA 5EWDA 5L97A 4CUPA 5LKUA 1JM4B 4QSPA 5DYXA 4MR5A 4Z6IA 5CUDA 4CUQA 5KO4A 5I7YA 5D3TA 4XYAA 2H60A 5ENGA 5D3NA 5LKTA 5CQTA 5JWMA 5HCLA 5AD2A 2RS9B 4AKHA 5FG5A 5IGMA 4YATA 4QYDA 5F1LA 4TZ2A 4YYIA 5ENFA 5LJ0A 4YABA 5CQAA 2YEMA 2F6JA 4YH4A 3ZYUA 4O7EA 3P5OA 4NR9A 4YAXA 5FB0A 4MEOA 4FLPA 3P1FA 3LQHA 5DYAA 4WHWA 4CFLA 5HRWA 5D0CA 4NUEA 4O75A 3K2JA 4LYIA 4LZ2A 4YYMA 4QC3A 4PTBA 5E9LA 4CUTA 2DVRA 4N4GA 5FDZA 5FG6A 5EA1A 5CGPA 5D3LA 5D7XA 5IG6A 4GPJA 5C89A 4J0RA 4YYJA 1N72A 3AQAA 5F25A 5ETDA 4HXMA 4QR5A 4NYXA 1EQFA 1ZKRA 4UIWA 5I83A 4LZSA 4Q0NA 5A5NA 3QZSA 4J0SA 4NUCA 4TT6A 3MULA 4HBVA 4WIVA 2I8NA 4KV1A 5H1UA 4QSSA 5CQ3A 2G4AA 2WP2A 4NR5A 2R10A 5KHMA 4QEVA 4IOOA 4O7AA 2N9GA 4NRCA 3HMFA 5CRZA 5F61A 5EPSA 5EVAA 4OUFA 2L5EA 4HBXA 4LRGA 4QSRA 4Z6HA 4O71A 2RNYA 2R0VA 5F3AA 3IU6A 3JVJA 4QSQA 3JVMA 5A83A 4A9OA 4TU6A 4UYGA 5LVRA 4IORA 4QBMA 3NXBA 4HXKA 5LKZA 5HRXA 4YY4A 3IU5A 3U5OA 1E6IA 4QR3A 4O77A 5FBXA 4NUDA 5EWHA 4UYHA 5FH7A 5ENCA 5FG4A 2OSSA 5AMFA 4BW2A 5CQ8A 4OGIA 4E96A 4MR3A 4MR4A 2RNXA 4NYVA 4TT4A 4UIVA 4YH3A 4CUSA 4UYEA 5CQ7A 2LSPB 5A7CA 4QEUA 4QSVA 2YDWA 4NQMA 5A5PA 4CURA 3S92A 3TLPA 3DAIA 3U5KA 4MEPA 3FKMX 5EWVA 4J3IA 5E7DA 4YYNA 4C66A 3MUKA 4HXOA 2F6NA 4CFKA 3O33A 5IGLA 2DATA 4YADA 3U5JA 4UITA 5HQ7A 5LJ2A 2L84A 5H1TA 5LVQA 4BHWA 4A9MA 5LKXA 5L98A 4OGJA 4CUUA 1WUMA 3I3JA 5D24A 4ZW1A 4AKGA 5ACYA 3JVKA 5I29A 5HENA 5II1A 4O7BA 4PCEA 4O7FA 2MJVB 5E9YA 3UW9A 4N3WA 5DY7A 5C7NA 4LYSA 3ONIA 5HFQA 4BJXA 1X0JA 3QZTA 5CUAA 2RI7A 5EV9A 4O78A 5FE8A 5FE4A 2OUOA 5IBNA 4A9IA 3UV5A 4TU4A 3G0JA 4YYDA 5DKHA 5F60A 4RVRA 3UVWA 4KV4A 2OO1A 4TS8A 5F62A 4HBYA 5D26A 5FE1A 4BW1A 4TQNA 5FE2A 1PUOA 5DW1A 4X2IA 5DYUA 5FH8A 5DLZA 5C85A 3LJWA 4A9KA 3MQMA 4F3IA 5EI4A 4QSWA 5DLXA 5FE0A 4IR5A 4N4FA 4QSTA 5DX4A 5H1VA 5DFCA 5HFRA 4NR8A 4PS5A 3VKGA 5IIDA 4BW4A 4TTEA 4TYLA 5H85A 4UYFA 3VKHA 4LYWA 5G4SA 5HJCA 1WUGA 4HXNA 4YY6A 5I7XA 4UIYA 3D1DA 3SVFA 4A9EA 4Q0OA 2DVSA 4QSUA 5ENJA 5D3PA 5HRVA 3O37A 2YW5A 5EPRA 5EICA 3U5NA 2D82A 3P1CA 5FH6A 4QNSA 5FE6A 5CQ5A 5E9KA 4LZRA 5ENBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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