4O7CA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-614067-r
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7cA01
4QNSA 3IU5A 3K2JA 4UIUA 3U5MA 2DVVA 4MR3A 5FB1A 5A5QA 5EPSA 2RI7A 5ETBA 5HRXA 5KTWA 4QUTA 4O7EA 5HRWA 5HFQA 5KU3A 4NUDA 5HELA 4ALHA 5D3SA 4A9IA 4MEPA 4NXJA 4LZ2A 5CUEA 5FE6A 5FH7A 5A5PA 5EWCA 4IR4A 4A9JA 4QUUA 2GRCA 3Q2EA 5EICA 5EVAA 4NYVA 2R0VA 5D26A 4ZW1A 4Z1QA 4A9KA 4CUQA 3P1EA 5CQTA 5FE3A 3MUKA 4LZRA 4LR6A 4AKNA 5G4SA 5F1HA 5EI4A 2FSAA 5CQ6A 5FG4A 5F5ZA 5JI8A 4UIYA 2YEMA 2D9EA 1WUMA 5A5NA 5FG5A 5CQ5A 2G4AA 4IR6A 4UIZA 4NRCA 4HBYA 1WUGA 4O71A 4UIWA 4UYDA 5IGMA 5DFBA 2D82A 4OGIA 4UITA 4A9HA 4YBTA 5FFYA 4IORA 3ONIA 4YATA 3RCWA 5F1LA 4TU6A 4QEWA 5AD2A 4O78A 4Q0OA 3LQHA 4YYGA 4NR8A 4UYEA 5DY7A 3LXJA 2LSPB 2KTBB 4J3IA 4Z1SA 4BW1A 5HQ6A 5E3GA 5CP5A 5CUCA 5E3DA 5I7XA 3SVGA 5DBMA 2F6JA 5A83A 4N4HA 4RVRA 4A9NA 4BW4A 1E6IA 3JVMA 4A9EA 4TT4A 2OSSA 5F62A 4KV4A 4ZC9A 5D3HA 4O7CA 5H1TA 5DX4A 3P5OA 5L98A 4YH3A 4QSQA 2RO1A 4TS8A 4QBMA 5D3PA 5CRZA 4LYSA 4J0RA 4UYGA 3SVHA 5ENIA 5CZGA 2L5EA 5EWDA 4NR7A 5H1VA 5EGUA 1X0JA 2R10A 4NR4A 4Z93A 4YBMA 4DONA 2MJVB 4ZQLA 4YYJA 5LUUA 5LVRA 3GG3A 4YYNA 5A81A 4J0SA 4LRGA 3LQIA 5C89A 4XUAA 4OGJA 4BJXA 5DKHA 2YEKA 5CPEA 3UVWA 3UVXA 4BW2A 5LJ2A 4KCXA 5HJCA 4YBSA 4LZSA 4NS5A 5F36A 4MENA 4N3WA 2YYNA 4O76A 3U5LA 4C66A 3G0LA 4WHUA 5E9MA 5E73A 4O72A 5KTXA 4KV1A 4LYIA 4QY4A 5LKXA 4YYIA 4TQNA 5CTLA 3U5OA 5LVQA 5JWMA 4NQNA 5EK9A 3MXFA 4TT6A 5CS8A 4TZ2A 3U5NA 3MB3A 4LDFA 4X2IA 4PKLA 4ALGA 5L8TA 3JVJA 5HRVA 4Q0NA 5DYCA 5IBNA 3UVYA 4CUPA 5HLSA 5ENGA 3O35A 2WP2A 4A9MA 4O7FA 5FH6A 5DW1A 5I88A 1JSPB 4QR3A 2RNWA 5C87A 4OUFA 4QSWA 5F60A 5IIDA 5DYUA 4HXSA 4NYWA 4QSVA 5CUDA 4HXPA 4QC1A 3U5PA 4CFLA 4NYXA 5II1A 3QZVA 5ENHA 5EWVA 5IGLA 4Y03A 4Z6HA 2I7KA 5G4RA 5HENA 2RNYA 3P1FA 4HBWA 4HBXA 4YY4A 5EWWA 3Q2FA 3HMFA 5CRMA 5D3RA 3LQJA 5EU1A 3O33A 5A5SA 2DATA 4QSSA 5FFWA 2DVQA 5CGPA 2E3KA 3UVDA 5A5OA 4PCEA 5LKUA 2H60A 2L85A 4QSXA 4TTEA 2RFJA 4O70A 5H1UA 4FLPA 4A9LA 3O36A 5D3TA 5EA1A 3NXBA 4MEQA 5BT3A 4PTBA 4Z6IA 4IR5A 5C4QA 5D3JA 2F6NA 4QR5A 2WP1A 4MR6A 4NR9A 5E9IA 3JVLA 4HXMA 4IOOA 4TU4A 5DYXA 5HCLA 2E7OA 5COIA 4IOQA 4E96A 5ACYA 3S91A 3MB4A 4YYMA 4O74A 2DKWA 3TLPA 4HXRA 4XY8A 2NXBA 4NUCA 5EM3A 5C7NA 2YDWA 4A9FA 5DLXA 5DLZA 3O37A 3SVFA 5FE5A 5I1QA 2YW5A 4CURA 3P1DA 4TT2A 4YC9A 4HXKA 5CFWA 3HMEA 4UYHA 2DWWA 5C85A 5KHMA 3O34A 4YAXA 3LJWA 5E9VA 2DVSA 5I89A 4F3IA 5J0DA 1ZS5A 4A9OA 5L99A 4YADA 5I86A 3HMHA 5DKCA 5LJ0A 4NRAA 4NR5A 5ENJA 5CY9A 5E9YA 2OO1A 5LJ1A 4CUTA 3JVKA 3MULA 5DW2A 5I29A 5L8UA 4YH4A 4WIVA 5L96A 5A82A 3AADA 2R0SA 4QEUA 5DKDA 5A85A 4CUSA 4YY6A 5FE0A 4YK0A 3AQAA 3P1CA 4HXOA 2RS9B 5FBXA 4CFKA 5EWHA 4O75A 4BW3A 5KTUA 5H85A 3UV5A 5A5RA 5FE8A 5FB0A 4UYFB 5LKTA 5EPBA 5HQ7A 5LKZA 1F68A 2L84A 3S92A 4MR4A 5D7XA 4LYWA 4NR6A 4QC3A 4NRBA 5F2PA 5E9KA 5BT5A 5HFRA 4N4IA 5AD3A 5F63A 4PY6A 4O7BA 5IG6A 5I83A 4UIXA 5FFVA 5ENCA 4CLBA 5DFCA 5D25A 4QEVA 4PS5A 5F25A 4NUEA 1JM4B 3D7CA 4NQMA 4MR5A 5CQ8A 5DYAA 5IGNA 5F3AA 5FE9A 5CUBA 4CUUA 5FE1A 5L97A 5FDZA 2RNXA 3U5JA 5TCMA 4HXLA 3QZTA 5K29A 5EP7A 3FKMX 4QR4A 4YYHA 5FE7A 5EPRA 5AMFA 1EQFA 5D0CA 4O77A 4C67A 5E0RA 5HM0A 4GPJA 4QSTA 5FE4A 3QZSA 3UV4A 5EQ1A 1N72A 2OUOA 4WHWA 5II2A 4MEOA 2YELA 5CQ4A 4QSPA 5ENFA 5BT4A 4XUBA 4YYKA 3G0JA 5IGKA 2YQDA 4BHWA 4PCIA 3UW9A 5AMEA 2R0YA 4QB3A 5A7CA 4J1PA 4QSRA 3I3JA 5I7YA 4XYAA 5D3LA 4HBVA 5CQAA 5D24A 4QYDA 4QSUA 2DVRA 5FH8A 4TZ8A 4O7AA 5HQ5A 2I8NA 5HEMA 3ZYUA 4N4FA 2N9GA 5ETDA 5TB6A 5EV9A 4UYFA 5ENEA 3UV2A 5E7DA 5C8GA 4LC2A 4HXNA 5CUAA 5E9LA 5CQ7A 4YYDA 4YABA 4IR3A 4TYLA 5CQ3A 3DWYA 5CU8A 5EISA 5FE2A 4QZSA 5F61A 4CL9A 5I80A 4QYLA 5DFDA 2E7NA 3IU6A 5D3NA 5E74A 4XY9A 5CUGA 4N4GA 5I40A 4UIVA 5KO4A 5FG6A 3MQMA 3DAIA 5ENBA 3U5KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QNSA 3IU5A 3K2JA 4UIUA 3U5MA 2DVVA 4MR3A 5FB1A 5A5QA 5EPSA 2RI7A 5ETBA 5HRXA 5KTWA 4QUTA 4O7EA 5HRWA 5HFQA 5KU3A 4NUDA 5HELA 4ALHA 5D3SA 4A9IA 4MEPA 4NXJA 4LZ2A 5CUEA 5FE6A 5FH7A 5A5PA 5EWCA 4IR4A 4A9JA 4QUUA 2GRCA 3Q2EA 5EICA 5EVAA 4NYVA 2R0VA 5D26A 4ZW1A 4Z1QA 4A9KA 3D1BA 4CUQA 3P1EA 5CQTA 5FE3A 3MUKA 4LZRA 4LR6A 4AKNA 5G4SA 5F1HA 5EI4A 2FSAA 5CQ6A 5FG4A 5F5ZA 5JI8A 4UIYA 2YEMA 2D9EA 1WUMA 5A5NA 5FG5A 5CQ5A 2G4AA 4IR6A 4UIZA 4NRCA 4HBYA 1WUGA 4O71A 4UIWA 4UYDA 5IGMA 3D1DA 5DFBA 2D82A 4OGIA 3VKGA 4UITA 4A9HA 4YBTA 5FFYA 4IORA 3ONIA 4YATA 3RCWA 5F1LA 4TU6A 4QEWA 5AD2A 4O78A 4Q0OA 3LQHA 4YYGA 4NR8A 4UYEA 5DY7A 3LXJA 2LSPB 2KTBB 4J3IA 4Z1SA 4BW1A 5HQ6A 5E3GA 5CP5A 5CUCA 5E3DA 5I7XA 3SVGA 5DBMA 2F6JA 5A83A 4N4HA 4RVRA 4A9NA 3VKHA 4BW4A 1E6IA 3JVMA 4A9EA 4TT4A 2OSSA 5F62A 4KV4A 4ZC9A 5D3HA 4O7CA 5H1TA 5DX4A 3P5OA 5L98A 4YH3A 4QSQA 2RO1A 4TS8A 4QBMA 5D3PA 5CRZA 4LYSA 4J0RA 4UYGA 3SVHA 5ENIA 5CZGA 2L5EA 5EWDA 4NR7A 5H1VA 5EGUA 1X0JA 2R10A 4NR4A 4Z93A 4YBMA 4DONA 2MJVB 4ZQLA 4YYJA 5LUUA 5LVRA 3GG3A 4YYNA 5A81A 4J0SA 4LRGA 3LQIA 5C89A 4XUAA 4OGJA 4BJXA 5DKHA 2YEKA 5CPEA 3UVWA 3UVXA 4BW2A 5LJ2A 4KCXA 5HJCA 4YBSA 4LZSA 4NS5A 5F36A 4MENA 4N3WA 2YYNA 4O76A 3U5LA 4C66A 3G0LA 4WHUA 5E9MA 5E73A 4O72A 5KTXA 4KV1A 4LYIA 4QY4A 5LKXA 4YYIA 4TQNA 5CTLA 3U5OA 5LVQA 5JWMA 4NQNA 5EK9A 3MXFA 4TT6A 5CS8A 4TZ2A 3U5NA 3MB3A 4LDFA 4X2IA 4PKLA 4ALGA 5L8TA 3JVJA 5HRVA 4Q0NA 5DYCA 5IBNA 3UVYA 4CUPA 5HLSA 5ENGA 3O35A 2WP2A 4A9MA 4O7FA 5FH6A 5DW1A 5I88A 1JSPB 4QR3A 2RNWA 5C87A 4OUFA 4QSWA 5F60A 5IIDA 5DYUA 4HXSA 4NYWA 4QSVA 5CUDA 4HXPA 4QC1A 3U5PA 4CFLA 4NYXA 5II1A 3ERRA 3QZVA 5ENHA 5EWVA 4AKGA 5IGLA 4Y03A 4Z6HA 2I7KA 5G4RA 5HENA 2RNYA 3P1FA 4HBWA 2EJNA 4HBXA 4YY4A 5EWWA 3Q2FA 3HMFA 5CRMA 5D3RA 3LQJA 5EU1A 3O33A 5A5SA 2DATA 4QSSA 5FFWA 2DVQA 5CGPA 2E3KA 3UVDA 5A5OA 4PCEA 5LKUA 2H60A 2L85A 4QSXA 4TTEA 2RFJA 4O70A 5H1UA 4FLPA 4A9LA 3O36A 5D3TA 5EA1A 3NXBA 4MEQA 5BT3A 4PTBA 4Z6IA 4IR5A 5C4QA 5D3JA 2F6NA 4QR5A 2WP1A 4MR6A 4NR9A 5E9IA 4AKIA 3JVLA 4HXMA 4IOOA 4TU4A 5DYXA 5HCLA 2E7OA 5COIA 4IOQA 4E96A 5ACYA 3S91A 3MB4A 4YYMA 4O74A 2DKWA 3TLPA 4HXRA 4XY8A 2NXBA 4NUCA 5EM3A 5C7NA 2YDWA 4A9FA 5DLXA 5DLZA 3O37A 3SVFA 5FE5A 5I1QA 2YW5A 4CURA 3P1DA 4TT2A 4YC9A 4HXKA 5CFWA 3HMEA 4UYHA 2DWWA 5C85A 5KHMA 3O34A 4YAXA 3LJWA 5E9VA 2DVSA 5I89A 4F3IA 5J0DA 1ZS5A 4A9OA 5L99A 4YADA 5I86A 3HMHA 5DKCA 5LJ0A 4NRAA 4NR5A 5ENJA 5CY9A 5E9YA 2OO1A 5LJ1A 4CUTA 3JVKA 3MULA 5DW2A 5I29A 5L8UA 4YH4A 4WIVA 5L96A 5A82A 3AADA 2R0SA 4QEUA 5DKDA 5A85A 4CUSA 4YY6A 5FE0A 4YK0A 3AQAA 3P1CA 4HXOA 2RS9B 5FBXA 4CFKA 5EWHA 4O75A 4BW3A 5KTUA 5H85A 3UV5A 5A5RA 5FE8A 5FB0A 4UYFB 5LKTA 5EPBA 5HQ7A 5LKZA 1F68A 2L84A 3S92A 4MR4A 4LYWA 4NR6A 4QC3A 5D7XA 4NRBA 5F2PA 5E9KA 5BT5A 5HFRA 4N4IA 5AD3A 5F63A 4PY6A 4O7BA 5IG6A 5I83A 4UIXA 5FFVA 5ENCA 4CLBA 5DFCA 5D25A 4QEVA 4PS5A 5F25A 4AKHA 4NUEA 1JM4B 3D7CA 4NQMA 4MR5A 5CQ8A 5DYAA 5IGNA 5F3AA 5FE9A 5CUBA 4CUUA 5FE1A 5L97A 5FDZA 2RNXA 3U5JA 5TCMA 4HXLA 3QZTA 5K29A 5EP7A 3FKMX 4QR4A 4YYHA 5FE7A 5EPRA 5AMFA 1EQFA 5D0CA 4O77A 4C67A 5E0RA 5HM0A 4GPJA 4QSTA 5FE4A 3QZSA 3UV4A 5EQ1A 1N72A 2OUOA 4WHWA 5II2A 4MEOA 2YELA 5CQ4A 4QSPA 5ENFA 5BT4A 4XUBA 4YYKA 3G0JA 1ZKRA 5IGKA 2YQDA 4BHWA 4PCIA 3UW9A 5AMEA 2R0YA 4QB3A 5A7CA 4J1PA 4QSRA 3I3JA 5I7YA 4XYAA 5D3LA 4HBVA 5CQAA 5D24A 4QYDA 4QSUA 2DVRA 5FH8A 4TZ8A 4O7AA 1PUOA 5HQ5A 2I8NA 5HEMA 3ZYUA 4N4FA 4AI6A 2N9GA 5ETDA 5TB6A 5EV9A 4UYFA 5ENEA 3UV2A 5E7DA 5C8GA 4LC2A 4HXNA 5CUAA 5E9LA 5CQ7A 4YYDA 4YABA 4IR3A 4TYLA 5CQ3A 3DWYA 5CU8A 5EISA 5FE2A 4QZSA 5F61A 4CL9A 5I80A 4QYLA 5DFDA 2E7NA 3IU6A 5D3NA 5E74A 4XY9A 5CUGA 4N4GA 5I40A 4UIVA 5KO4A 5FG6A 3MQMA 3DAIA 5ENBA 3U5KA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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