4HXRA

Brd4 bromodomain 1 complex with n-[3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)phenyl]thiophene-2-sulfonamide inhibitor
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxrA01
5EWVA 4CL9A 4UIYA 5I83A 4HXPA 5D7XA 5EVAA 4CUSA 5AMEA 3MULA 5ENJA 4LYWA 4YABA 3U5LA 5FB0A 4LC2A 4HXNA 3GG3A 5A85A 4YYDA 5COIA 5A5PA 4Z1SA 4UIZA 5HQ6A 4HXMA 4HXSA 5HQ5A 5ENBA 5DKDA 5E3DA 2L5EA 4LR6A 4HBVA 4QZSA 3O37A 3S91A 4A9LA 5CQ6A 4BW3A 5FE0A 4HBYA 5E74A 4TT4A 5AMFA 2RFJA 3UV5A 5FB1A 4CURA 4MEQA 5CQ7A 4FLPA 4QBMA 5CQ5A 5E9IA 5ETDA 4UIWA 5FE4A 4MR6A 2FSAA 5A5RA 4QUUA 5A83A 2YEMA 4TYLA 4HBXA 4KV1A 5L8TA 5LJ0A 5A5NA 2DVVA 2R10A 2WP2A 4A9NA 4XY8A 5CRZA 3UVYA 5LKXA 5F25A 4A9JA 3P1EA 3Q2FA 2D82A 4BW1A 5FH6A 4O74A 3HMHA 4OGIA 5FFWA 2OO1A 3U5KA 2E7NA 4NR5A 5IGLA 2OSSA 3G0LA 5C89A 5AD2A 3U5NA 5E9KA 5L97A 4A9OA 4C66A 5CQ4A 5EV9A 4Z1QA 5A82A 5EP7A 4O70A 4ZQLA 4HXLA 5G4RA 4MEPA 5CPEA 4NR9A 4RVRA 2DKWA 4CUTA 3DAIA 3LJWA 4TU4A 4O76A 1N72A 4QNSA 4Y03A 5EICA 4N3WA 5BT5A 3LXJA 3U5MA 5DYUA 4NRBA 4LYIA 4NRCA 5FE3A 5F63A 4YYGA 4TTEA 5CUGA 4LDFA 5FG5A 4QR3A 3SVHA 5D3JA 4A9IA 4TZ2A 4F3IA 5G4SA 4YY4A 4QC1A 5ETBA 4UIXA 5HJCA 4NXJA 1JM4B 5FFYA 2RNXA 5D3NA 5HELA 1F68A 5D25A 5C4QA 5F1HA 4HBWA 2KTBB 5ENIA 5DY7A 5BT3A 3O36A 4Z6HA 5EWDA 5HEMA 3UV4A 5BT4A 4TS8A 2MJVB 5CUDA 4Z93A 4TU6A 4IR6A 4XUBA 5CGPA 4N4HA 5HFRA 5L96A 5H1UA 2YELA 4NYVA 5I7YA 5IGKA 2G4AA 5KTWA 3P1DA 4UYGA 5CUBA 4KV4A 4UYDA 5E9VA 5CQ3A 4QR4A 4NUEA 5DKCA 5C8GA 4QYLA 5HQ7A 3AQAA 4NS5A 5DKHA 4O75A 4C67A 5F60A 3HMEA 2F6NA 4ZC9A 3O33A 5HFQA 3D7CA 4QYDA 4YBSA 5FDZA 5DLZA 5HRWA 5CTLA 5L98A 5C87A 3UVDA 5CUEA 3MXFA 5F5ZA 5IBNA 5KTUA 5D3HA 2DVRA 4BJXA 5E9MA 4LZRA 5J0DA 5ENEA 5FBXA 4QSUA 3TLPA 2H60A 4O7BA 5IGNA 5FE1A 3MB3A 4PKLA 4QC3A 1EQFA 4LRGA 3MB4A 3FKMX 5CUAA 5DFCA 3NXBA 4TZ8A 5EWHA 5FE6A 3IU6A 5EISA 5I88A 5FFVA 5F2PA 4PTBA 5EM3A 4QSVA 5I1QA 4A9KA 5ENGA 5I86A 2I8NA 3JVMA 3ZYUA 5TB6A 5ENFA 4UYEA 3HMFA 4YY6A 4O7EA 2R0VA 4WIVA 4YYKA 3IU5A 4TT6A 5FE2A 4QSRA 5D3LA 5D24A 4J0RA 3P5OA 2RNYA 4YC9A 5A7CA 2OUOA 3P1CA 4N4FA 5A81A 5EI4A 5EGUA 5A5QA 5E73A 4Q0NA 5JI8A 4NUDA 5EPRA 4YYMA 4O72A 2RO1A 5EK9A 4YYNA 5I7XA 5DYAA 3I3JA 3LQHA 5H1TA 4BHWA 4UIUA 3MUKA 4QSPA 5E3GA 4IOOA 5FH7A 5F1LA 5LVRA 3QZTA 4MR5A 5LKZA 2R0SA 2WP1A 4NR6A 4UITA 5DBMA 5CQAA 4PCEA 2YEKA 5DW1A 4Q0OA 3AADA 4BW2A 4A9MA 4NRAA 5DFBA 1E6IA 4ALHA 4NQMA 5EPSA 5TCMA 4IORA 5H1VA 5KHMA 5C7NA 4YBMA 5ENCA 3UVXA 2DWWA 5I80A 4MEOA 4OGJA 5LJ2A 2L84A 5FE9A 4XUAA 2R0YA 4O7AA 5HLSA 2DATA 1JSPB 5HENA 4CFKA 3UW9A 5A5SA 5IGMA 5EQ1A 4QUTA 5F61A 5L8UA 4ZW1A 5ENHA 4KCXA 3Q2EA 5FG4A 4OUFA 4N4GA 3DWYA 4QSTA 4YADA 5CQTA 3P1FA 4O7FA 5E9YA 5HCLA 5LKTA 4QSWA 4TT2A 2D9EA 5D3TA 5CZGA 5HRXA 2RS9B 3JVKA 4QEUA 3LQIA 5DW2A 5I89A 4IOQA 5KO4A 5D3PA 4QB3A 5CU8A 5F3AA 2L85A 5FE7A 5D3SA 3S92A 4E96A 3O34A 3QZVA 5FG6A 3JVLA 3UVWA 4YAXA 4PCIA 4LYSA 5JWMA 5DFDA 5HRVA 5ACYA 4NR7A 2GRCA 5CY9A 2LSPB 5L99A 5LVQA 4YH3A 5I40A 4QSQA 5E0RA 3U5OA 5IIDA 5A5OA 3QZSA 5LUUA 4DONA 3SVGA 2NXBA 3MQMA 5HM0A 5F62A 4NR8A 4HXRA 5CRMA 4NQNA 5I29A 5D3RA 2F6JA 4UYFB 5D26A 4HXOA 4J0SA 4MENA 1ZS5A 3U5JA 5II1A 2N9GA 4HXKA 4X2IA 4LZ2A 4BW4A 4A9FA 4YYJA 5H85A 2DVSA 5F36A 4A9EA 2YW5A 5K29A 4GPJA 4YBTA 4O71A 5DYCA 5DYXA 3O35A 3G0JA 4QR5A 5CS8A 4O7CA 5II2A 5IG6A 2YQDA 2E3KA 3LQJA 4MR4A 4UYFA 4QSXA 2E7OA 5FE8A 2DVQA 4WHWA 5C85A 1WUGA 2I7KA 2YYNA 3ONIA 4J3IA 4YATA 4CUQA 5CP5A 5EA1A 4O78A 2RI7A 5CFWA 5KU3A 4TQNA 5DLXA 5EWWA 3JVJA 4A9HA 4N4IA 5E7DA 5FE5A 5KTXA 3U5PA 4IR5A 1WUMA 4NYXA 4YK0A 5EU1A 5EWCA 4QEVA 4XY9A 5D0CA 4MR3A 4CLBA 3SVFA 4PY6A 2RNWA 5EPBA 4ALGA 5AD3A 4NR4A 4YYIA 4CUUA 4NUCA 5FH8A 4XYAA 4PS5A 4CUPA 4YH4A 4IR3A 5LKUA 3K2JA 4UIVA 4AKNA 5CUCA 4YYHA 4Z6IA 5DX4A 4J1PA 4O77A 5E9LA 4IR4A 2YDWA 5LJ1A 5CQ8A 3RCWA 4LZSA 4QSSA 3UV2A 4UYHA 4QY4A 1X0JA 4QEWA 4CFLA 4NYWA 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EWVA 4CL9A 4UIYA 5I83A 4HXPA 5D7XA 5EVAA 4CUSA 5AMEA 3MULA 5ENJA 4LYWA 4YABA 3U5LA 5FB0A 4LC2A 4HXNA 3GG3A 5A85A 4YYDA 5COIA 5A5PA 4Z1SA 4UIZA 5HQ6A 4HXMA 4HXSA 5HQ5A 5ENBA 5DKDA 5E3DA 2L5EA 4LR6A 4HBVA 4QZSA 3O37A 3S91A 4A9LA 5CQ6A 4BW3A 5FE0A 4HBYA 5E74A 4TT4A 5AMFA 2RFJA 3UV5A 5FB1A 4CURA 4AI6A 4MEQA 5CQ7A 4FLPA 4QBMA 5CQ5A 5E9IA 5ETDA 4UIWA 5FE4A 4MR6A 2FSAA 5A5RA 4QUUA 4AKHA 5A83A 2YEMA 4TYLA 4HBXA 4KV1A 5L8TA 5LJ0A 5A5NA 2DVVA 2R10A 2WP2A 4A9NA 4XY8A 5CRZA 3UVYA 5LKXA 5F25A 4A9JA 3P1EA 3Q2FA 2D82A 4BW1A 5FH6A 4O74A 3HMHA 4OGIA 5FFWA 2OO1A 3U5KA 2E7NA 4NR5A 5IGLA 2OSSA 3G0LA 5C89A 5AD2A 3U5NA 5E9KA 5L97A 4A9OA 4C66A 5CQ4A 5EV9A 4AKIA 4Z1QA 3D1DA 5A82A 5EP7A 4O70A 4ZQLA 4HXLA 5G4RA 4MEPA 5CPEA 4NR9A 4RVRA 3D1BA 2DKWA 4CUTA 3DAIA 3LJWA 4TU4A 4O76A 1N72A 4QNSA 4Y03A 5EICA 4N3WA 5BT5A 3LXJA 3U5MA 5DYUA 4NRBA 4LYIA 4NRCA 5FE3A 5F63A 4YYGA 4TTEA 5CUGA 4LDFA 5FG5A 4QR3A 3SVHA 5D3JA 4AKGA 4A9IA 4TZ2A 4F3IA 5G4SA 4YY4A 4QC1A 5ETBA 4UIXA 5HJCA 4NXJA 1JM4B 5FFYA 2RNXA 5D3NA 5HELA 1F68A 5D25A 5C4QA 5F1HA 4HBWA 2KTBB 5ENIA 5DY7A 5BT3A 3O36A 4Z6HA 5EWDA 5HEMA 3UV4A 5BT4A 4TS8A 2MJVB 5CUDA 4Z93A 4TU6A 4IR6A 4XUBA 5CGPA 4N4HA 5HFRA 5L96A 5H1UA 2YELA 4NYVA 5I7YA 5IGKA 2G4AA 5KTWA 3P1DA 4UYGA 5CUBA 4KV4A 4UYDA 5E9VA 5CQ3A 4QR4A 4NUEA 5DKCA 5C8GA 4QYLA 5HQ7A 3AQAA 4NS5A 5DKHA 4O75A 4C67A 5F60A 3HMEA 2F6NA 4ZC9A 3O33A 5HFQA 3D7CA 4QYDA 4YBSA 5FDZA 5DLZA 5HRWA 5CTLA 5L98A 5C87A 3UVDA 5CUEA 3MXFA 5F5ZA 5IBNA 5KTUA 5D3HA 2DVRA 4BJXA 5E9MA 4LZRA 5J0DA 5ENEA 5FBXA 4QSUA 3TLPA 2H60A 4O7BA 5IGNA 5FE1A 3MB3A 4PKLA 4QC3A 1EQFA 4LRGA 3MB4A 3FKMX 5CUAA 5DFCA 3NXBA 4TZ8A 5EWHA 5FE6A 3IU6A 5EISA 5I88A 1PUOA 5FFVA 5F2PA 4PTBA 5EM3A 4QSVA 5I1QA 4A9KA 5ENGA 5I86A 2I8NA 3JVMA 3ZYUA 5TB6A 5ENFA 4UYEA 3HMFA 4YY6A 4O7EA 2R0VA 4WIVA 4YYKA 3IU5A 4TT6A 5FE2A 4QSRA 5D3LA 5D24A 4J0RA 3P5OA 2RNYA 4YC9A 5A7CA 2OUOA 3P1CA 4N4FA 5A81A 5EI4A 5EGUA 5A5QA 5E73A 4Q0NA 5JI8A 4NUDA 5EPRA 4YYMA 4O72A 2RO1A 5EK9A 4YYNA 5I7XA 5DYAA 3I3JA 3LQHA 5H1TA 4BHWA 4UIUA 3MUKA 4QSPA 5E3GA 4IOOA 5FH7A 5F1LA 5LVRA 3QZTA 4MR5A 5LKZA 2R0SA 3ERRA 2WP1A 4NR6A 4UITA 5DBMA 5CQAA 4PCEA 2YEKA 5DW1A 4Q0OA 3AADA 4BW2A 4A9MA 4NRAA 5DFBA 1E6IA 4ALHA 4NQMA 5EPSA 5TCMA 4IORA 5H1VA 5KHMA 5C7NA 4YBMA 5ENCA 3UVXA 2DWWA 5I80A 4MEOA 4OGJA 5LJ2A 2L84A 5FE9A 4XUAA 2R0YA 4O7AA 5HLSA 2DATA 1JSPB 5HENA 4CFKA 3UW9A 5A5SA 5IGMA 5EQ1A 4QUTA 5F61A 5L8UA 4ZW1A 5ENHA 4KCXA 3Q2EA 5FG4A 4OUFA 4N4GA 3DWYA 4QSTA 4YADA 5CQTA 3P1FA 1ZKRA 4O7FA 5E9YA 5HCLA 5LKTA 4QSWA 4TT2A 2D9EA 5D3TA 5CZGA 5HRXA 2RS9B 3JVKA 4QEUA 3LQIA 5DW2A 5I89A 4IOQA 5KO4A 5D3PA 4QB3A 5CU8A 5F3AA 2L85A 5FE7A 5D3SA 3S92A 4E96A 3O34A 3QZVA 5FG6A 3VKGA 3JVLA 3UVWA 4YAXA 4PCIA 4LYSA 5JWMA 5DFDA 5HRVA 5ACYA 4NR7A 2GRCA 5CY9A 2LSPB 5L99A 5LVQA 4YH3A 5I40A 4QSQA 5E0RA 3U5OA 5IIDA 5A5OA 3QZSA 5LUUA 4DONA 3SVGA 2NXBA 3MQMA 5HM0A 5F62A 4NR8A 4HXRA 5CRMA 4NQNA 5I29A 5D3RA 2F6JA 4UYFB 5D26A 4HXOA 4J0SA 4MENA 1ZS5A 3U5JA 5II1A 2N9GA 4HXKA 4X2IA 4LZ2A 4BW4A 4A9FA 4YYJA 5H85A 2DVSA 5F36A 4A9EA 2YW5A 5K29A 4GPJA 3VKHA 4YBTA 4O71A 5DYCA 5DYXA 3O35A 3G0JA 4QR5A 5CS8A 4O7CA 5II2A 5IG6A 2YQDA 2E3KA 3LQJA 4MR4A 4UYFA 4QSXA 2E7OA 5FE8A 2DVQA 4WHWA 5C85A 1WUGA 2I7KA 2YYNA 3ONIA 4J3IA 2EJNA 4YATA 4CUQA 5CP5A 5EA1A 4O78A 2RI7A 5CFWA 5KU3A 4TQNA 5DLXA 5EWWA 3JVJA 4A9HA 4N4IA 5E7DA 5FE5A 5KTXA 3U5PA 4IR5A 1WUMA 4NYXA 4YK0A 5EU1A 5EWCA 4QEVA 4XY9A 5D0CA 4MR3A 4CLBA 3SVFA 4PY6A 2RNWA 5EPBA 4ALGA 5AD3A 4NR4A 4YYIA 4CUUA 4NUCA 5FH8A 4XYAA 4PS5A 4CUPA 4YH4A 4IR3A 5LKUA 3K2JA 4UIVA 4AKNA 5CUCA 4YYHA 4Z6IA 5DX4A 4J1PA 4O77A 5E9LA 4IR4A 2YDWA 5LJ1A 5CQ8A 3RCWA 4LZSA 4QSSA 3UV2A 4UYHA 4QY4A 1X0JA 4QEWA 4CFLA 4NYWA 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EWV A;  4CL9 A;  4UIY A;  5I83 A;  4HXP A;  5D7X A;  5EVA A;  4CUS A;  5AME A;  3MUL A;  5ENJ A;  4LYW A;  4YAB A;  3U5L A;  5FB0 A;  4LC2 A;  4HXN A;  3GG3 A;  5A85 A;  4YYD A;  5COI A;  5A5P A;  4Z1S A;  4UIZ A;  5HQ6 A;  4HXM A;  4HXS A;  5HQ5 A;  5ENB A;  5DKD A;  5E3D A;  2L5E A;  4LR6 A;  4HBV A;  4QZS A;  3O37 A;  3S91 A;  4A9L A;  5CQ6 A;  4BW3 A;  5FE0 A;  4HBY A;  5E74 A;  4TT4 A;  5AMF A;  2RFJ A;  3UV5 A;  5FB1 A;  4CUR A;  4MEQ A;  5CQ7 A;  4FLP A;  4QBM A;  5CQ5 A;  5E9I A;  5ETD A;  4UIW A;  5FE4 A;  4MR6 A;  2FSA A;  5A5R A;  4QUU A;  5A83 A;  2YEM A;  4TYL A;  4HBX A;  4KV1 A;  5L8T A;  5LJ0 A;  5A5N A;  2DVV A;  2R10 A;  2WP2 A;  4A9N A;  4XY8 A;  5CRZ A;  3UVY A;  5LKX A;  5F25 A;  4A9J A;  3P1E A;  3Q2F A;  2D82 A;  4BW1 A;  5FH6 A;  4O74 A;  3HMH A;  4OGI A;  5FFW A;  2OO1 A;  3U5K A;  2E7N A;  4NR5 A;  5IGL A;  2OSS A;  3G0L A;  5C89 A;  5AD2 A;  3U5N A;  5E9K A;  5L97 A;  4A9O A;  4C66 A;  5CQ4 A;  5EV9 A;  4Z1Q A;  5A82 A;  5EP7 A;  4O70 A;  4ZQL A;  4HXL A;  5G4R A; 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