5HELA

Crystal structure of the n-terminus y153h bromodomain mutant of human brd2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
SMKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCHIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminus Y153H bromodomain mutant of human BRD2
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
total genus 39
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5helA00
5FE2A 4UIUA 4Z6HA 4CUPA 5I29A 5AD2A 4YYKA 4YYJA 2R0SA 4HXRA 5CUGA 4UYDA 3LJWA 3MUKA 4YH3A 4NYXA 5DYXA 4HXNA 4O72A 4O7EA 4O7FA 5ENBA 5C8GA 4QB3A 2NXBA 4N4IA 5A5QA 5A5OA 4ALHA 4QEUA 5HEMA 5LUUA 3LQIA 4IR4A 1ZS5A 3UVYA 4YYDA 5KTUA 4QUTA 5AMEA 5D3JA 5HFQA 4BW3A 4PTBA 3S91A 4TTEA 4A9MA 3SVGA 4NXJA 5FE1A 5E74A 5HFRA 4NYWA 1JM4B 4QEVA 4LR6A 4PCIA 4C67A 4J0RA 4Z1SA 4NUCA 2R0YA 5COIA 5HENA 2E7NA 4N3WA 5DW1A 5FFYA 5CUBA 5HQ6A 3JVLA 5CRZA 5DW2A 5C7NA 2RFJA 2MJVB 1WUMA 3U5KA 2R10A 4NQNA 2DVRA 5C85A 4OGIA 3K2JA 5EWDA 4ALGA 5FB1A 4QZSA 4QSXA 4LYWA 4UIWA 4IR5A 5F25A 5IBNA 5L97A 5LJ1A 2E7OA 3LQHA 5DYUA 2RNXA 5DFCA 5DKHA 1E6IA 5E9MA 5FG6A 5L96A 5CQ7A 4TYLA 5LVRA 5A82A 4CURA 5CQTA 1JSPB 4Z6IA 5I1QA 5I7XA 4O77A 5CY9A 1N72A 4QR4A 3Q2EA 3U5MA 5CRMA 4UYHA 2I8NA 3DAIA 4HXKA 4QR5A 4YK0A 4TQNA 4IR6A 5DBMA 4J1PA 5EWHA 4YADA 5EPSA 3P1DA 5ENJA 5FH8A 4UYEA 5CQ5A 5C89A 3IU6A 4A9HA 5A83A 2I7KA 5IIDA 5TB6A 4XY8A 5I88A 5FB0A 4YYNA 4BW4A 5DX4A 5D3HA 5D26A 3G0JA 5D3PA 5DLXA 2DWWA 3UV5A 3P1FA 5FDZA 2DATA 4NRBA 4YC9A 5CU8A 5FE0A 4Q0NA 4YH4A 5E9VA 5ENFA 5A5SA 5LKZA 5I89A 4NR6A 5EA1A 5CPEA 4KV1A 5HJCA 4QSPA 5CUEA 2YDWA 5D3TA 4O75A 5A7CA 4YYIA 4YYHA 3QZSA 4Q0OA 3SVFA 5DFBA 5EQ1A 5F36A 5FE4A 4YBTA 4NRCA 3D7CA 4A9EA 4HBVA 4PS5A 4NR8A 4MR4A 5EM3A 2YELA 5C87A 5F1HA 5D25A 2D9EA 5A85A 4HXSA 5HRXA 5EU1A 5L98A 5BT5A 5AD3A 3JVMA 5EPRA 2H60A 4YY6A 3UVWA 4O7CA 3HMHA 2OSSA 3UVDA 3UW9A 5DY7A 5F61A 4QSRA 2YEMA 5LJ2A 5EI4A 4YYGA 5FH6A 2RNWA 5FE9A 2RS9B 4LDFA 4NYVA 5I83A 4A9NA 4PY6A 4UYGA 3U5LA 4DONA 2D82A 4UIVA 4N4FA 5FE3A 5G4SA 5HLSA 5EVAA 5BT3A 3MQMA 5E3GA 2L5EA 5E9IA 5F62A 5L99A 4YABA 4QEWA 5CS8A 5D3RA 5D7XA 4QNSA 4MENA 1WUGA 2FSAA 5JI8A 4QC3A 4UIYA 5CQ8A 4QY4A 5H85A 4NQMA 4ZQLA 5EWWA 2WP1A 5ENHA 2R0VA 4LYSA 4MR6A 5FBXA 4A9KA 4NR7A 5FE7A 5D0CA 4IOQA 2YW5A 5LKTA 4NR4A 5HQ7A 5CQ6A 5EWVA 2YYNA 5L8TA 4TZ8A 5IGLA 5J0DA 4IORA 5JWMA 4FLPA 2WP2A 3I3JA 3TLPA 5IG6A 5KTWA 3O36A 3ONIA 5LKUA 4YATA 5CQ4A 4BHWA 3S92A 5EP7A 5F2PA 5D3LA 4HXOA 4CUUA 5K29A 3O35A 3QZVA 3P1EA 5FG5A 4PCEA 2N9GA 3U5NA 4QSWA 3U5OA 3U5PA 3P1CA 5EWCA 4QUUA 4MEOA 2DVVA 4TZ2A 5ENGA 3DWYA 4YYMA 5C4QA 5HELA 5FH7A 4YBSA 5E3DA 3FKMX 4YBMA 4O70A 2KTBB 4KV4A 4MR5A 4TU4A 5G4RA 3O37A 5LJ0A 4OUFA 4XY9A 2OO1A 5H1TA 3NXBA 5I80A 1EQFA 5CTLA 3GG3A 4UYFB 5LVQA 4OGJA 5HQ5A 4QSQA 2DVSA 4E96A 5KHMA 4QSSA 4LZ2A 4XYAA 4QR3A 2F6NA 4TT6A 4A9FA 5CFWA 2E3KA 4HXMA 4N4GA 3MB4A 4O71A 5LKXA 3LQJA 3O33A 4HXLA 3JVJA 3UV4A 3AQAA 4J3IA 5CQAA 5D3SA 5L8UA 2L85A 5BT4A 2RO1A 4TT2A 5CUCA 4O7BA 4CUTA 5H1VA 3MULA 3SVHA 4LZSA 5TCMA 4X2IA 2G4AA 3O34A 4CL9A 5DFDA 4AKNA 4N4HA 4TU6A 1F68A 5E73A 4TT4A 4O78A 3UVXA 5CUDA 2RI7A 5KU3A 5I7YA 2YQDA 3HMFA 4QSTA 4NR5A 5EICA 4NUEA 4QC1A 5HRWA 5KTXA 4RVRA 2OUOA 3UV2A 4QYLA 4CUQA 4QYDA 5F5ZA 4UIZA 4MEPA 5D24A 5DLZA 5KO4A 4Z1QA 5IGMA 4NUDA 4J0SA 3RCWA 5HRVA 4YAXA 5DYCA 5DYAA 4C66A 5HCLA 4LZRA 5E7DA 5EISA 2DVQA 3G0LA 4A9OA 4UYFA 4NR9A 2LSPB 5EGUA 3MXFA 4QSVA 4A9LA 5CZGA 3HMEA 5F1LA 5E9KA 4O76A 3MB3A 4ZC9A 5CP5A 3U5JA 5AMFA 5A5PA 5ETDA 4HBXA 4XUAA 4IOOA 4O74A 4HBWA 4LYIA 5ETBA 5F3AA 3AADA 5FE8A 4KCXA 4WIVA 5ENEA 4CLBA 5F60A 5DKDA 3QZTA 4WHWA 4MR3A 5CQ3A 4MEQA 4CFKA 4NRAA 5CGPA 4O7AA 5HM0A 4BW1A 5ENCA 4Y03A 4NS5A 5IGKA 2L84A 4LRGA 5FE5A 4XUBA 4F3IA 5E9YA 3P5OA 5EK9A 5I86A 5A5RA 3ZYUA 5FE6A 4UIXA 4UITA 3LXJA 5FFVA 5E0RA 5II2A 5IGNA 5F63A 5EPBA 1X0JA 4YY4A 3IU5A 4IR3A 2YEKA 3Q2FA 5II1A 4GPJA 4HXPA 5FG4A 4CUSA 4BW2A 2F6JA 5I40A 5ACYA 4LC2A 4A9IA 4HBYA 5FFWA 4CFLA 2RNYA 4PKLA 4WHUA 4A9JA 5DKCA 5A5NA 3JVKA 4QSUA 5D3NA 4Z93A 4QBMA 5H1UA 2GRCA 4ZW1A 5ENIA 5E9LA 2DKWA 5EV9A 4TS8A 5CUAA 5A81A 4BJXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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