5HELA

Crystal structure of the n-terminus y153h bromodomain mutant of human brd2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
SMKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCHIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
publication title Crystal structure of the N-terminus Y153H bromodomain mutant of human BRD2
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5helA00
5DKDA 5HRXA 2YDWA 5FG5A 3DAIA 4YY4A 2KTBB 5A5QA 4OGIA 4NQMA 2YQDA 5BT5A 5F60A 4WHWA 5FE1A 3MUKA 5CUGA 5CY9A 4Z6IA 1WUMA 5EA1A 2D82A 2RNYA 4PCIA 4PCEA 5CPEA 5ETDA 4IR6A 4NQNA 5A7CA 4A9OA 2WP2A 3FKMX 5DX4A 3AADA 3ZYUA 4QEUA 4QUUA 4NUEA 5E74A 4LYWA 5HQ5A 4N4FA 5AMFA 5D3RA 5CFWA 3Q2EA 4A9LA 5CQ8A 5IIDA 4NS5A 5I89A 3U5NA 5CQ4A 3O37A 5IGKA 4OUFA 4QSVA 5EICA 5A85A 4Z1SA 5FFWA 5A5OA 4QSUA 3O33A 4A9MA 4O71A 5D3NA 4HBYA 5I1QA 5CQ7A 4DONA 5L8UA 5EPBA 5FDZA 3UVXA 2G4AA 5EU1A 1JSPB 5H1UA 5C85A 2E7OA 5IG6A 5HRVA 5HELA 4GPJA 3O35A 4UIVA 5D7XA 4ZQLA 3MULA 4QYLA 5EISA 5A5SA 4QUTA 4MR5A 4TYLA 4QSWA 4NR9A 5BT3A 2F6NA 4QSQA 5EK9A 4QYDA 4IR3A 2RO1A 2R0VA 5CQTA 4YYGA 4J1PA 5FH7A 4N4HA 4CLBA 3HMFA 5LKTA 4MEQA 3MQMA 5JWMA 5EPRA 5FE5A 3RCWA 4RVRA 5II2A 5ENGA 5CUDA 3UVYA 5LJ1A 3P1DA 4UYHA 5HM0A 5IGMA 5FB1A 3I3JA 4HXPA 4O76A 5EWCA 4NYWA 5G4RA 3DWYA 5G4SA 5C8GA 3S92A 4QBMA 5DYUA 5C7NA 4CUTA 5E73A 4LRGA 3U5OA 4C66A 3P5OA 3P1CA 5H85A 5F1HA 5AD3A 5ENHA 4HXSA 5L97A 5A5NA 5FE2A 4YADA 4HBVA 4YBTA 4YYHA 4NRAA 4YH4A 3U5PA 5FE8A 5TB6A 2E7NA 4MR3A 5L98A 4A9NA 4HXKA 4UIXA 5DKHA 4ALHA 2RNWA 4AKNA 5DW2A 4QEWA 4UIYA 5HEMA 2R10A 3QZTA 1F68A 4Z93A 4F3IA 5EWVA 5F25A 4TT4A 2R0YA 4CURA 5KTUA 4UIZA 4A9FA 5KTWA 5ENIA 4MEOA 5DFBA 3LQHA 4O74A 4LZSA 4MR4A 4XUBA 2YELA 5FE4A 4QR3A 4TU4A 4YYMA 2FSAA 4LYIA 4YYKA 5A5PA 2YW5A 4A9KA 5L8TA 4O7EA 4HXNA 4NRCA 5ENJA 2RFJA 4NR5A 5I7YA 3U5KA 5E9KA 4N3WA 5EQ1A 5K29A 3LQIA 4YH3A 3LJWA 4NR8A 3Q2FA 4A9EA 4QSRA 2I7KA 4O72A 1N72A 5KTXA 4UYEA 5EP7A 4YYJA 5D3SA 4A9JA 2H60A 2YYNA 4MENA 4CUQA 5HJCA 4O70A 3ONIA 4LDFA 5EPSA 5FG4A 4BJXA 2YEMA 3D7CA 4IR4A 5A83A 2RNXA 3GG3A 5D3LA 3LQJA 4E96A 5I7XA 5E3GA 4LZRA 4LR6A 5CTLA 5L96A 3O34A 4CFLA 4WIVA 5E9IA 3NXBA 5EM3A 5IBNA 4PKLA 1ZS5A 4YYDA 5E0RA 4UIWA 5TCMA 5EWDA 5CQAA 2L84A 5E9MA 5LJ2A 4QR4A 4XYAA 2RS9B 4PS5A 4A9IA 4YYIA 5I40A 4NRBA 4QC3A 5D3JA 3IU6A 4YK0A 5CQ6A 5A5RA 4X2IA 5HFRA 5DW1A 3P1FA 5KU3A 5CUCA 4ZW1A 4Q0NA 5HCLA 4UIUA 5CUAA 5CS8A 4QR5A 5DLXA 3O36A 3UV4A 4YBMA 5DYXA 4IR5A 5ENCA 5DYAA 5HFQA 4NR7A 2L85A 5CZGA 3UW9A 3K2JA 4PY6A 5FE0A 5DKCA 2DVVA 4QB3A 4YABA 4J0SA 4J0RA 2DVRA 5KHMA 5EGUA 4QNSA 4QZSA 5ENEA 4TQNA 4A9HA 4KCXA 3UV2A 2DVQA 2I8NA 4MR6A 5D26A 5D24A 5CUEA 2WP1A 5HQ7A 4LZ2A 4QSSA 3U5LA 4HBXA 5F5ZA 5LVRA 5C89A 3JVMA 4FLPA 5F63A 3JVLA 1JM4B 4OGJA 5FB0A 5F3AA 4HXOA 5BT4A 5EWWA 4LC2A 4QC1A 4CUSA 5CUBA 3MXFA 4YC9A 1E6IA 5FH6A 3HMHA 4IOOA 5FFYA 4Y03A 5IGNA 4NUDA 5CRZA 5FE6A 4QEVA 4HXLA 4Z6HA 4CUUA 3AQAA 4O7CA 1X0JA 5D3TA 5A81A 5CGPA 5I29A 5HQ6A 5LVQA 4NXJA 5E9LA 3MB3A 2OO1A 5F62A 4BHWA 3JVKA 3JVJA 4O7BA 5E9VA 5J0DA 4BW4A 2YEKA 5CRMA 4UYGA 5FBXA 5ETBA 5DFDA 5H1VA 4XY8A 3QZVA 4TZ8A 5FH8A 2E3KA 5DBMA 3SVHA 4NR6A 2GRCA 4O78A 4IORA 5F36A 4QSXA 5DLZA 4TZ2A 4ALGA 4TS8A 2DWWA 2D9EA 5D0CA 4YATA 4CUPA 4UYFA 5DFCA 5CP5A 4Q0OA 4LYSA 5C87A 3G0JA 4TT6A 5AMEA 5C4QA 2F6JA 5AD2A 4HXMA 5ACYA 4BW3A 5F2PA 2MJVB 5CU8A 5HENA 2R0SA 4PTBA 5LKUA 2DVSA 5D3PA 5LKZA 5F1LA 3G0LA 4C67A 5LUUA 4MEPA 3SVGA 3QZSA 4BW1A 5FG6A 4QY4A 5E3DA 5D3HA 5I83A 4TTEA 4O7FA 3U5MA 5JI8A 3UVDA 4YAXA 2LSPB 5FE3A 4KV1A 5CQ5A 5ENFA 3HMEA 3SVFA 4HBWA 5FE9A 4O7AA 4IOQA 1WUGA 5EWHA 3UV5A 4NYXA 4N4GA 4UITA 4CL9A 5I88A 5LKXA 4J3IA 5I86A 5FFVA 4N4IA 4TU6A 4TT2A 4YBSA 3MB4A 4QSTA 5HLSA 5IGLA 4BW2A 5D25A 4XUAA 2N9GA 3UVWA 2DKWA 2OSSA 5L99A 2RI7A 3LXJA 2NXBA 5E7DA 5F61A 5II1A 5HRWA 4QSPA 4Z1QA 5A82A 3P1EA 4UYDA 5EVAA 3S91A 5H1TA 4YYNA 4CFKA 4NUCA 4O75A 5FE7A 3TLPA 4UYFB 5LJ0A 4WHUA 4ZC9A 5KO4A 4HXRA 3U5JA 4YY6A 2OUOA 5EV9A 2L5EA 5ENBA 5DYCA 4NR4A 2DATA 4O77A 4KV4A 1EQFA 4XY9A 5DY7A 5CQ3A 5EI4A 5COIA 5E9YA 5I80A 3IU5A 4NYVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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