4O78A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with gw612286x
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o78A01
5HFQA 5FE6A 4O77A 5DFBA 5HEMA 4QSVA 5LVQA 4O7AA 4QSPA 2DVQA 5D7XA 5FE4A 4J3IA 4CURA 4LR6A 5ENFA 2L85A 3GG3A 4QR5A 5ACYA 4HXNA 5KHMA 4Z1QA 5E9MA 4RVRA 4QY4A 4BW2A 4QSQA 4OGJA 4NYWA 5A5QA 4QC1A 5CQ7A 3UVYA 3MULA 5EQ1A 4UIWA 4ZW1A 4TYLA 3QZVA 3UV4A 4Z6IA 4YH4A 4LZ2A 5KTWA 3O37A 4YY4A 2DWWA 5BT4A 1X0JA 5K29A 3UVXA 5DKDA 4OUFA 4IR6A 4QEUA 5CQ6A 5EICA 5HQ7A 3S91A 5FB0A 4WHWA 4CLBA 4YATA 3LQHA 5D25A 4PS5A 5FG5A 5A5OA 5D3LA 2YEKA 4HBYA 4UIYA 4TT4A 5C87A 4J0SA 5F5ZA 4YYKA 5IGMA 1JM4B 3QZTA 5KTXA 5ENBA 4YBTA 3P1DA 5LJ0A 5F63A 5CQAA 3HMFA 5EU1A 4HXRA 5DYAA 2R0VA 5F61A 3O33A 4Z93A 4ZQLA 4A9MA 3HMEA 3LXJA 4LZRA 2R10A 5E9KA 5JI8A 4QR4A 4A9HA 5I83A 5LKZA 4NRAA 5IIDA 2YDWA 5A85A 5KTUA 5G4SA 5I86A 3JVJA 4XY9A 5AD3A 5C89A 3G0LA 3U5MA 4NR6A 4NUCA 4UIUA 5F2PA 4WIVA 3P5OA 5CZGA 4BW3A 4YYJA 4PKLA 4IR4A 5TB6A 5J0DA 4WHUA 2F6NA 5ENJA 5FE8A 4LYIA 5L8UA 4CFKA 4YADA 5L8TA 5CRMA 4UYDA 4MEPA 5F3AA 4QUUA 4UYFB 5D3JA 5E9VA 2OUOA 5A5PA 5EPRA 5HFRA 5CGPA 3MUKA 5E0RA 3SVHA 5E9IA 5EGUA 5II1A 4QSSA 4YYIA 4MR4A 4YYGA 5L97A 4BW1A 3P1FA 3O34A 4KV4A 4CUQA 4HXPA 4CFLA 4C67A 4TZ2A 5F60A 5H1TA 5CUDA 5LKXA 4NUEA 4NYVA 4YYDA 5CQ8A 5H1UA 5IBNA 3DAIA 3NXBA 4FLPA 4IR5A 3UVWA 4N4GA 5KU3A 5D3HA 3IU6A 4QSUA 4O71A 5ETDA 4HBWA 5E73A 5HENA 4PCIA 5DYXA 4TQNA 4N4HA 2MJVB 2FSAA 4MR6A 5D24A 5E9YA 4QYLA 2RI7A 4QC3A 2I7KA 5FH6A 5CUGA 5A83A 4LYWA 4NR7A 4N4FA 5LUUA 3U5PA 4IOQA 3S92A 5FFVA 3JVLA 5EISA 5FG6A 5CQ3A 5I7YA 5DKCA 5JWMA 4QSXA 4C66A 5ENEA 5FE1A 4Z1SA 4QSRA 4HXLA 4O76A 5DX4A 4XY8A 4CUTA 5DLZA 5HQ5A 2H60A 3HMHA 4J1PA 5CUEA 4YBSA 5CUBA 4Y03A 5FE3A 2YEMA 4NUDA 1E6IA 4IOOA 4YABA 5FE0A 4E96A 4ALGA 5HM0A 2WP1A 5FE7A 2YQDA 3G0JA 4NR8A 5EP7A 3SVGA 3MB4A 5FB1A 5E7DA 5L96A 4NQMA 2RNWA 3U5JA 2F6JA 3AADA 5F25A 5BT5A 3Q2FA 4BW4A 5CUAA 4QB3A 1N72A 5DYUA 4NS5A 5EWCA 4QZSA 3UV2A 5L98A 2YELA 5TCMA 5EVAA 5E74A 4AKNA 2DVSA 2R0YA 4Q0NA 5DFCA 5HCLA 5I88A 4LZSA 5IG6A 3LQIA 4ALHA 4TU6A 5EV9A 4UITA 5HELA 4O7CA 5CRZA 5ENIA 3D7CA 4KV1A 4HBVA 4CUPA 5EPSA 5EWDA 4A9LA 5FDZA 4A9IA 2RO1A 5LKUA 5G4RA 3AQAA 5D0CA 4O78A 5EM3A 5D26A 4YYMA 5CQTA 5ETBA 3P1EA 4O7EA 4A9KA 3ZYUA 3UVDA 5DBMA 5EK9A 3MXFA 5C4QA 5HQ6A 2DKWA 3O35A 5CP5A 5L99A 5CQ5A 5HRWA 5A7CA 5IGNA 2L5EA 5I29A 4NRCA 3I3JA 5AD2A 5EWVA 4A9OA 1F68A 2RNYA 2OO1A 5I89A 5A5SA 2RNXA 4QEWA 4CL9A 4O70A 3LJWA 2NXBA 4IORA 5BT3A 5I1QA 5D3SA 2N9GA 4LDFA 4XYAA 3U5LA 1WUGA 5D3RA 4N4IA 5EWWA 5ENHA 5A5NA 5LVRA 2RFJA 5C7NA 1WUMA 3SVFA 4TZ8A 5CFWA 4QSTA 5CS8A 4A9NA 2I8NA 4MR5A 4TS8A 5A5RA 5CPEA 2KTBB 4QEVA 5D3NA 4OGIA 5IGLA 5DYCA 5FFYA 4PTBA 4UYEA 5II2A 2D9EA 4QR3A 2GRCA 5FE2A 5F62A 3RCWA 2E3KA 2OSSA 5D3TA 4MENA 4QBMA 4A9EA 4A9FA 3TLPA 4UIVA 4UYHA 4IR3A 4XUAA 4QNSA 5I80A 3FKMX 5ENGA 5E9LA 5EA1A 4N3WA 3U5KA 5E3GA 4YBMA 4DONA 2YW5A 3U5OA 2WP2A 5HLSA 5CTLA 2DVVA 2YYNA 2E7NA 5LKTA 4O7BA 3P1CA 3U5NA 5EWHA 5FH7A 5COIA 5E3DA 4UIZA 5AMFA 5A81A 4O74A 5HJCA 4Z6HA 4GPJA 4A9JA 2D82A 4BJXA 2DATA 4HXSA 4YH3A 3JVKA 4HXKA 4HXMA 4YK0A 4PY6A 4NR5A 1ZS5A 4J0RA 2G4AA 3Q2EA 4O75A 4UYGA 5CU8A 3IU5A 5CY9A 1EQFA 4NR4A 5H85A 4NYXA 2DVRA 4TT6A 4Q0OA 4CUUA 3O36A 5FE5A 5C85A 4UIXA 4X2IA 5LJ1A 5FE9A 5I40A 5FH8A 2LSPB 4YYHA 5F36A 1JSPB 4MEOA 4MEQA 4YAXA 4LC2A 3UV5A 5DLXA 4QSWA 5ENCA 5FG4A 3UW9A 3DWYA 4QYDA 4BHWA 3K2JA 3MB3A 4QUTA 4YY6A 3JVMA 5HRXA 5LJ2A 4NXJA 5DY7A 5A82A 4CUSA 5HRVA 5F1HA 4NRBA 4UYFA 5D3PA 4YYNA 5DFDA 5DW1A 5H1VA 2R0SA 4HXOA 2L84A 4LYSA 2RS9B 5DW2A 5FFWA 4LRGA 4NQNA 4XUBA 5F1LA 4MR3A 2E7OA 4ZC9A 4TU4A 4YC9A 4O72A 5CQ4A 4HBXA 4TT2A 3ONIA 3LQJA 5CUCA 5C8GA 4O7FA 5EI4A 5FBXA 5IGKA 3QZSA 4TTEA 5AMEA 4PCEA 4NR9A 5KO4A 5DKHA 5I7XA 3MQMA 4KCXA 4F3IA 5EPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HFQA 5FE6A 4O77A 5DFBA 5HEMA 4QSVA 5LVQA 4O7AA 4QSPA 2DVQA 5D7XA 5FE4A 4J3IA 4CURA 4LR6A 5ENFA 2L85A 3GG3A 4QR5A 5ACYA 4HXNA 5KHMA 4Z1QA 5E9MA 4RVRA 4QY4A 4BW2A 4QSQA 3D1BA 4OGJA 4NYWA 5A5QA 4QC1A 5CQ7A 3UVYA 3MULA 5EQ1A 4UIWA 4ZW1A 4TYLA 3QZVA 3UV4A 4Z6IA 4YH4A 4LZ2A 1PUOA 1ZKRA 5KTWA 3O37A 4YY4A 2DWWA 5BT4A 1X0JA 5K29A 3UVXA 5DKDA 4OUFA 4IR6A 4QEUA 5CQ6A 5EICA 5HQ7A 3S91A 5FB0A 4WHWA 4CLBA 4YATA 3LQHA 5D25A 4PS5A 5FG5A 5A5OA 5D3LA 2YEKA 4HBYA 4UIYA 4TT4A 5C87A 4J0SA 5F5ZA 4YYKA 5IGMA 1JM4B 3QZTA 5KTXA 5ENBA 4YBTA 3P1DA 5LJ0A 5F63A 5CQAA 3HMFA 5EU1A 4HXRA 5DYAA 2R0VA 5F61A 3O33A 4Z93A 4ZQLA 4A9MA 3HMEA 4AI6A 3LXJA 4LZRA 2R10A 5E9KA 5JI8A 4QR4A 4A9HA 5I83A 5LKZA 4NRAA 5IIDA 2YDWA 3ERRA 5A85A 5KTUA 5G4SA 5I86A 3JVJA 4XY9A 5AD3A 5C89A 3G0LA 3U5MA 4NR6A 4NUCA 4UIUA 5F2PA 4WIVA 3P5OA 5CZGA 4BW3A 4YYJA 4AKIA 4PKLA 4IR4A 5TB6A 5J0DA 4WHUA 2F6NA 5ENJA 5FE8A 4LYIA 5L8UA 4CFKA 4YADA 5L8TA 5CRMA 4UYDA 4MEPA 5F3AA 4QUUA 4UYFB 5D3JA 5E9VA 2OUOA 5A5PA 5EPRA 5HFRA 5CGPA 3MUKA 5E0RA 3SVHA 5E9IA 5EGUA 5II1A 4QSSA 4YYIA 4MR4A 4YYGA 5L97A 4BW1A 3P1FA 3O34A 4KV4A 4CUQA 4HXPA 4CFLA 4C67A 4TZ2A 5F60A 5H1TA 5CUDA 5LKXA 4NUEA 4NYVA 4YYDA 5CQ8A 5H1UA 5IBNA 3DAIA 3NXBA 4FLPA 4IR5A 3UVWA 4N4GA 5KU3A 5D3HA 3IU6A 4QSUA 4O71A 5ETDA 4HBWA 5E73A 5HENA 4PCIA 5DYXA 4TQNA 4N4HA 2MJVB 2FSAA 4MR6A 5D24A 5E9YA 4QYLA 2RI7A 4QC3A 2I7KA 5FH6A 5CUGA 3VKHA 5A83A 4LYWA 4NR7A 4N4FA 5LUUA 3U5PA 4IOQA 3S92A 5FFVA 3JVLA 5EISA 5FG6A 5CQ3A 5I7YA 5DKCA 5JWMA 4AKGA 4QSXA 4C66A 5ENEA 5FE1A 4Z1SA 4QSRA 4HXLA 4O76A 5DX4A 4XY8A 4CUTA 5DLZA 5HQ5A 2H60A 3HMHA 4J1PA 5CUEA 4YBSA 5CUBA 4Y03A 5FE3A 2YEMA 4NUDA 1E6IA 4IOOA 4YABA 5FE0A 4E96A 4ALGA 5HM0A 2WP1A 5FE7A 2YQDA 3G0JA 4NR8A 2EJNA 5EP7A 3SVGA 3MB4A 5FB1A 5E7DA 5L96A 4NQMA 2RNWA 3U5JA 2F6JA 3AADA 5F25A 5BT5A 3Q2FA 4BW4A 5CUAA 4QB3A 1N72A 5DYUA 4NS5A 5EWCA 4QZSA 3UV2A 5L98A 2YELA 5TCMA 5EVAA 5E74A 4AKNA 2DVSA 2R0YA 4Q0NA 5DFCA 5HCLA 5I88A 4LZSA 5IG6A 3LQIA 4ALHA 4TU6A 5EV9A 4UITA 5HELA 4O7CA 5CRZA 5ENIA 3D7CA 4KV1A 4HBVA 4CUPA 5EPSA 5EWDA 4A9LA 5FDZA 4A9IA 2RO1A 5LKUA 5G4RA 3AQAA 5D0CA 4O78A 5EM3A 5D26A 4YYMA 5CQTA 5ETBA 3P1EA 4O7EA 4A9KA 3ZYUA 3UVDA 5DBMA 5EK9A 3MXFA 5C4QA 5HQ6A 2DKWA 3O35A 5CP5A 5L99A 5CQ5A 5HRWA 5A7CA 5IGNA 2L5EA 5I29A 4NRCA 3I3JA 5AD2A 5EWVA 4A9OA 1F68A 2RNYA 2OO1A 5I89A 5A5SA 2RNXA 4QEWA 4CL9A 4O70A 3LJWA 2NXBA 4IORA 5BT3A 5I1QA 5D3SA 2N9GA 4LDFA 4XYAA 3U5LA 1WUGA 5D3RA 4N4IA 5EWWA 5ENHA 5A5NA 5LVRA 2RFJA 5C7NA 1WUMA 3SVFA 4TZ8A 5CFWA 4QSTA 5CS8A 4A9NA 2I8NA 4MR5A 4TS8A 5A5RA 5CPEA 2KTBB 4QEVA 5D3NA 4OGIA 5IGLA 5DYCA 5FFYA 4PTBA 4AKHA 4UYEA 5II2A 3D1DA 2D9EA 4QR3A 2GRCA 5FE2A 5F62A 3RCWA 2E3KA 2OSSA 5D3TA 4MENA 4QBMA 4A9EA 4A9FA 3TLPA 4UIVA 4UYHA 4IR3A 4XUAA 4QNSA 5I80A 3FKMX 5ENGA 5E9LA 5EA1A 4N3WA 3U5KA 5E3GA 4YBMA 4DONA 2YW5A 3U5OA 2WP2A 5HLSA 5CTLA 2DVVA 2YYNA 2E7NA 5LKTA 4O7BA 3P1CA 3U5NA 5EWHA 5FH7A 5COIA 5E3DA 4UIZA 5AMFA 5A81A 4O74A 5HJCA 4Z6HA 4GPJA 4A9JA 2D82A 4BJXA 2DATA 4HXSA 4YH3A 3JVKA 4HXKA 4HXMA 4YK0A 4PY6A 4NR5A 1ZS5A 4J0RA 2G4AA 3Q2EA 4O75A 4UYGA 5CU8A 3IU5A 5CY9A 1EQFA 4NR4A 5H85A 4NYXA 2DVRA 4TT6A 4Q0OA 4CUUA 3O36A 5FE5A 5C85A 4UIXA 4X2IA 5LJ1A 5FE9A 5I40A 5FH8A 2LSPB 4YYHA 5F36A 1JSPB 4MEOA 4MEQA 4YAXA 4LC2A 3UV5A 5DLXA 4QSWA 5ENCA 5FG4A 3UW9A 3DWYA 4QYDA 4BHWA 3K2JA 3MB3A 4QUTA 4YY6A 3JVMA 5HRXA 5LJ2A 4NXJA 5DY7A 5A82A 4CUSA 5HRVA 5F1HA 4NRBA 4UYFA 5D3PA 4YYNA 5DFDA 5DW1A 5H1VA 2R0SA 4HXOA 2L84A 4LYSA 2RS9B 5DW2A 5FFWA 4LRGA 4NQNA 4XUBA 5F1LA 3VKGA 4MR3A 2E7OA 4ZC9A 4TU4A 4YC9A 4O72A 5CQ4A 4HBXA 4TT2A 3ONIA 3LQJA 5CUCA 5C8GA 4O7FA 5EI4A 5FBXA 5IGKA 3QZSA 4TTEA 5AMEA 4PCEA 4NR9A 5KO4A 5DKHA 5I7XA 3MQMA 4KCXA 4F3IA 5EPBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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