4YK0A

Crystal structure of the cbp bromodomain in complex with cpi098
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords CREB-binding protein
publication title Regulatory T Cell Modulation by CBP/EP300 Bromodomain Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 38
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yk0A00
5L8UA 4A9IA 4QZSA 3FKMX 3UVYA 5D3PA 5A5SA 5I29A 2D9EA 4QSUA 4QEVA 3P1EA 5DFBA 3SVGA 5JI8A 5IGKA 5E7DA 4UYEA 3O36A 5CQ3A 3JVJA 5F1LA 4IOQA 4YYDA 5I40A 5BT5A 5L99A 2OO1A 4LZRA 3DWYA 4O75A 4QUTA 2YEKA 4HBVA 4C66A 2RFJA 4XUBA 5HRVA 5H1VA 4YADA 4QSXA 4QB3A 5D3SA 5A5OA 5LJ1A 4TS8A 4QEUA 4NYWA 5L96A 3P1FA 4NQMA 5G4SA 1N72A 4TYLA 3JVMA 5H85A 5II2A 5HRWA 5IIDA 2E7OA 2YEMA 4YYJA 5I80A 5FE3A 5FE8A 5A81A 4PTBA 2FSAA 2F6NA 4A9OA 5E9VA 5C8GA 5F5ZA 4TT2A 5DYCA 5E0RA 5IGLA 4QC1A 4Z6IA 5CUAA 4LZSA 3O37A 2RNXA 5FH6A 4NRBA 4YYGA 4BW2A 5JWMA 4UYFB 1E6IA 5CQ7A 4NYXA 5DKCA 5ENEA 5FE0A 4TU6A 2YYNA 4O77A 5DYAA 3MB4A 5CUDA 5CUGA 4HXPA 5L98A 4MR5A 5FBXA 5EPBA 4O70A 4QUUA 5E9IA 1X0JA 2YW5A 4ZC9A 3O33A 5F3AA 5A7CA 3AQAA 5D25A 5A5NA 2I8NA 5HJCA 4CUQA 5EICA 5A5RA 5A82A 5KU3A 3TLPA 2OUOA 3MB3A 2DKWA 5HFRA 5ENCA 4A9JA 5KTXA 5AMEA 5DW1A 4QSSA 4NXJA 4UITA 5EV9A 4UIVA 2L85A 5EWVA 4CLBA 5F36A 4NUDA 5CTLA 5FDZA 3UW9A 3NXBA 5AD2A 4HXKA 4TU4A 4OGJA 5CP5A 5I86A 2DATA 5KTWA 4Y03A 4Z6HA 4J0SA 3P5OA 4KCXA 5E74A 5I83A 4LYIA 5HFQA 2E3KA 5LKXA 4NR8A 5EPSA 4BHWA 1F68A 4NUEA 5ENGA 5ENBA 4NR7A 5E3GA 5H1UA 3UVXA 3U5OA 5EISA 4CUPA 4PY6A 2NXBA 3P1CA 4ZQLA 5TB6A 3QZTA 5DY7A 5G4RA 5C4QA 4UYDA 4TTEA 5DX4A 4A9HA 4O74A 4YH4A 5DFCA 4NRCA 4UIXA 5FH8A 4MEPA 4MR6A 4N3WA 2R0SA 4MR3A 3LQJA 5D3NA 5COIA 5KTUA 5BT3A 4FLPA 3MUKA 3U5LA 2YQDA 4QBMA 3LJWA 5E9MA 4NS5A 5EWDA 4PS5A 4O76A 5J0DA 5EA1A 2RNYA 3G0LA 3O34A 4YAXA 5C89A 4HXOA 5D0CA 4KV1A 4UIYA 2OSSA 4YATA 5F2PA 5DYUA 5ENIA 5CQTA 5HLSA 4YYNA 4BW1A 5CZGA 4UIWA 4Q0OA 2R10A 5FFWA 5A5QA 2YDWA 5K29A 4WIVA 5HRXA 2D82A 5HCLA 5FB0A 4OGIA 3S91A 4HXMA 4NR4A 5EWHA 5BT4A 4Q0NA 5HELA 5CRMA 4UIZA 5EM3A 3K2JA 3SVFA 5I1QA 4XY8A 4XY9A 4UYFA 4TZ2A 5CQ8A 4O71A 5C85A 2H60A 4MEQA 3UVDA 4HBXA 5CQ4A 5HENA 3RCWA 4A9EA 3JVKA 5D3TA 3S92A 4QR5A 5DLZA 4YYKA 3LQIA 5LVRA 3GG3A 5LKTA 2DVQA 4YC9A 4BW4A 4YYIA 2F6JA 5F62A 4Z1SA 2RI7A 5I89A 5KHMA 5D3HA 5D3LA 5KO4A 2DVVA 4HBYA 5E73A 5DKHA 3QZSA 4AKNA 5CS8A 5CFWA 4IORA 3MXFA 4LDFA 5EWWA 4IR6A 5FE5A 5DYXA 2R0VA 4HXSA 3HMFA 5FG4A 5EWCA 4QSPA 2RO1A 4TQNA 5E9KA 5LKZA 5E9LA 4WHWA 4YK0A 4TZ8A 4QR3A 5FB1A 5FE4A 3SVHA 4KV4A 5CY9A 4MR4A 4RVRA 4Z1QA 3IU6A 5F1HA 5EPRA 4HXLA 3U5JA 3Q2EA 4QYLA 2DVSA 4YBMA 5L8TA 3O35A 5DKDA 5EVAA 3HMEA 4N4FA 4YBSA 4CUUA 5ACYA 2L84A 5CUEA 5FG5A 4J1PA 4F3IA 5CPEA 5CU8A 4YY6A 4WHUA 3I3JA 2LSPB 4QC3A 3UV5A 4GPJA 4N4HA 2DVRA 4Z93A 5CQ5A 4O7FA 5FE2A 4LRGA 4QSTA 4DONA 5ETBA 3LQHA 1ZS5A 4QSVA 4UYGA 4LZ2A 4IR4A 5DBMA 5D24A 3G0JA 4OUFA 4O7BA 5D3RA 4O7CA 4IR5A 5HQ5A 4O78A 4A9FA 4TT6A 4HXNA 4NQNA 5LUUA 4CL9A 4LR6A 4YBTA 4CUSA 2WP2A 5A85A 5C7NA 5FE7A 1WUGA 4MEOA 4QSRA 3LXJA 5FE1A 5I7YA 5IG6A 5A83A 1JM4B 5ETDA 4C67A 4NR6A 5CGPA 1EQFA 2RNWA 4YH3A 4QY4A 4A9LA 5IGNA 3P1DA 4QR4A 4NYVA 2I7KA 5A5PA 4QYDA 5FFYA 2N9GA 4QSQA 5DLXA 4LYSA 2L5EA 5DFDA 3U5NA 5F61A 4ZW1A 3ONIA 3IU5A 3QZVA 1JSPB 4QSWA 3UVWA 4YY4A 5FFVA 5I7XA 2KTBB 5I88A 4QNSA 4LC2A 3MULA 3JVLA 4UYHA 2DWWA 5E3DA 4J0RA 5FG6A 4YYHA 5ENHA 5IBNA 4TT4A 5LVQA 4CFKA 5CUBA 4A9NA 5AMFA 4PKLA 2GRCA 5L97A 1WUMA 5FE9A 4NUCA 4NR5A 3MQMA 5II1A 5F25A 5H1TA 4NRAA 5EGUA 4YABA 3AADA 5F63A 4E96A 4N4GA 5CQ6A 4PCIA 3D7CA 3Q2FA 5LJ0A 4CUTA 2R0YA 5F60A 4PCEA 5CQAA 5E9YA 5CRZA 3U5PA 3UV4A 4XYAA 5CUCA 5AD3A 5EI4A 3UV2A 4O7EA 5D26A 4UIUA 5D3JA 5LKUA 5LJ2A 5C87A 4IOOA 3U5MA 5HM0A 5IGMA 5FE6A 4HXRA 5FH7A 4X2IA 5HEMA 4N4IA 4NR9A 2YELA 4CURA 4LYWA 4HBWA 4IR3A 4QEWA 4A9MA 4J3IA 5TCMA 4YYMA 5ENJA 5HQ6A 4O7AA 5ENFA 4ALHA 4ALGA 2RS9B 5EP7A 5EK9A 4A9KA 4BJXA 2MJVB 5DW2A 2G4AA 5D7XA 4MENA 5EQ1A 3HMHA 3U5KA 4BW3A 3DAIA 4CFLA 5HQ7A 4XUAA 4O72A 3ZYUA 2E7NA 2WP1A 5EU1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L8UA 4A9IA 4QZSA 3FKMX 3UVYA 5D3PA 5A5SA 5I29A 2D9EA 4QSUA 4QEVA 3P1EA 5DFBA 3SVGA 5JI8A 5IGKA 5E7DA 4AKIA 4UYEA 3O36A 5CQ3A 3JVJA 5F1LA 4IOQA 4YYDA 5I40A 5BT5A 1ZKRA 5L99A 2OO1A 4LZRA 3DWYA 4O75A 4QUTA 2YEKA 4HBVA 4C66A 2RFJA 4XUBA 5HRVA 5H1VA 4YADA 4QSXA 4QB3A 5D3SA 5A5OA 5LJ1A 4TS8A 4QEUA 4NYWA 5L96A 3P1FA 4NQMA 5G4SA 1N72A 4TYLA 3JVMA 5H85A 5II2A 5HRWA 5IIDA 2E7OA 2YEMA 4YYJA 5I80A 5FE3A 5FE8A 5A81A 4PTBA 2FSAA 2F6NA 4A9OA 5E9VA 5C8GA 5F5ZA 4TT2A 5DYCA 5E0RA 5IGLA 4QC1A 4Z6IA 5CUAA 4LZSA 3O37A 2RNXA 5FH6A 4NRBA 4YYGA 4BW2A 5JWMA 4UYFB 1E6IA 5CQ7A 4NYXA 5DKCA 5ENEA 5FE0A 4TU6A 2YYNA 4O77A 5DYAA 3MB4A 5CUDA 5CUGA 4HXPA 5L98A 4MR5A 5FBXA 5EPBA 4O70A 4QUUA 5E9IA 1X0JA 2YW5A 4ZC9A 3O33A 5F3AA 5A7CA 3AQAA 5D25A 5A5NA 2I8NA 5HJCA 4CUQA 5EICA 5A5RA 5A82A 5KU3A 3TLPA 2OUOA 3MB3A 2DKWA 5HFRA 5ENCA 4A9JA 5KTXA 5AMEA 5DW1A 4UITA 4NXJA 4QSSA 3D1DA 5EV9A 4UIVA 2L85A 5EWVA 4CLBA 5F36A 4NUDA 5CTLA 5FDZA 3UW9A 3NXBA 5AD2A 4HXKA 4TU4A 4OGJA 5CP5A 5I86A 2DATA 5KTWA 4Y03A 4Z6HA 3D1BA 4J0SA 3P5OA 4KCXA 5E74A 5I83A 4LYIA 5HFQA 2E3KA 5LKXA 4NR8A 5EPSA 4BHWA 1F68A 4NUEA 5ENGA 5ENBA 4NR7A 5E3GA 5H1UA 3UVXA 3U5OA 5EISA 4CUPA 4PY6A 2NXBA 3P1CA 4ZQLA 5TB6A 3QZTA 5DY7A 5G4RA 5C4QA 4UYDA 4TTEA 5DX4A 4A9HA 4O74A 4YH4A 5DFCA 4NRCA 4UIXA 5FH8A 4MEPA 4MR6A 4N3WA 2R0SA 4MR3A 3LQJA 5D3NA 5COIA 5KTUA 5BT3A 4FLPA 3MUKA 3U5LA 2YQDA 4QBMA 3LJWA 5E9MA 4NS5A 5EWDA 4PS5A 4O76A 5J0DA 5EA1A 2RNYA 3G0LA 3O34A 4YAXA 5C89A 4HXOA 5D0CA 4KV1A 4UIYA 2OSSA 4YATA 5F2PA 5DYUA 5ENIA 5CQTA 5HLSA 4YYNA 4BW1A 5CZGA 4UIWA 4Q0OA 2R10A 5FFWA 5A5QA 2YDWA 5K29A 4WIVA 5HRXA 2D82A 5HCLA 5FB0A 4OGIA 3S91A 4HXMA 4NR4A 5EWHA 5BT4A 4Q0NA 5HELA 5CRMA 4UIZA 5EM3A 3K2JA 3SVFA 5I1QA 4XY8A 4XY9A 4UYFA 4TZ2A 5CQ8A 4O71A 5C85A 2H60A 4MEQA 3UVDA 4HBXA 5CQ4A 5HENA 3RCWA 4A9EA 3JVKA 5D3TA 3S92A 4QR5A 5DLZA 4YYKA 3LQIA 5LVRA 3GG3A 5LKTA 2DVQA 4YC9A 4BW4A 4YYIA 2F6JA 5F62A 4Z1SA 2RI7A 5I89A 5KHMA 5D3HA 4AKHA 5D3LA 5KO4A 2DVVA 4HBYA 5E73A 5DKHA 3QZSA 4AKNA 5CS8A 5CFWA 4IORA 3MXFA 4LDFA 5EWWA 4IR6A 5FE5A 5DYXA 2R0VA 4HXSA 3HMFA 5FG4A 5EWCA 4QSPA 2RO1A 4TQNA 5E9KA 5LKZA 5E9LA 4WHWA 4YK0A 4TZ8A 4QR3A 5FB1A 5FE4A 3VKHA 3SVHA 4KV4A 5CY9A 4MR4A 4RVRA 4Z1QA 3IU6A 5F1HA 5EPRA 4HXLA 3U5JA 3Q2EA 4QYLA 2DVSA 4YBMA 5L8TA 4AKGA 3O35A 5DKDA 5EVAA 3HMEA 4N4FA 4YBSA 4CUUA 5ACYA 2L84A 5CUEA 5FG5A 4J1PA 4F3IA 5CPEA 5CU8A 4YY6A 4WHUA 3I3JA 2LSPB 4QC3A 3UV5A 4GPJA 4N4HA 2DVRA 4Z93A 5CQ5A 4O7FA 5FE2A 4LRGA 4QSTA 4DONA 5ETBA 3LQHA 1ZS5A 4QSVA 4UYGA 4LZ2A 4IR4A 5DBMA 5D24A 3G0JA 4OUFA 4O7BA 5D3RA 4O7CA 4IR5A 5HQ5A 4O78A 4A9FA 4TT6A 4HXNA 4NQNA 5LUUA 4CL9A 4LR6A 4YBTA 4CUSA 2WP2A 5A85A 5C7NA 5FE7A 1WUGA 4MEOA 4QSRA 3LXJA 5FE1A 5I7YA 5IG6A 5A83A 1JM4B 5ETDA 4C67A 4NR6A 5CGPA 1EQFA 2RNWA 4YH3A 4QY4A 4AI6A 4A9LA 5IGNA 3P1DA 4QR4A 4NYVA 2I7KA 5A5PA 4QYDA 5FFYA 2N9GA 4QSQA 5DLXA 4LYSA 2L5EA 5DFDA 3U5NA 5F61A 4ZW1A 3ONIA 3IU5A 3QZVA 1JSPB 4QSWA 3UVWA 4YY4A 5FFVA 5I7XA 2KTBB 5I88A 4QNSA 4LC2A 3MULA 3JVLA 4UYHA 2DWWA 5E3DA 4J0RA 5FG6A 4YYHA 5ENHA 5IBNA 4TT4A 5LVQA 2EJNA 4CFKA 5CUBA 4A9NA 5AMFA 4PKLA 2GRCA 5L97A 1WUMA 5FE9A 4NUCA 4NR5A 1PUOA 3MQMA 5II1A 5F25A 5H1TA 3VKGA 4NRAA 5EGUA 4YABA 3AADA 5F63A 4E96A 4N4GA 5CQ6A 4PCIA 3D7CA 3Q2FA 5LJ0A 4CUTA 2R0YA 5F60A 4PCEA 5CQAA 5E9YA 5CRZA 3U5PA 3UV4A 4XYAA 5CUCA 5AD3A 5EI4A 3UV2A 4O7EA 5D26A 4UIUA 5D3JA 5LKUA 5LJ2A 5C87A 4IOOA 3U5MA 5HM0A 5IGMA 5FE6A 4HXRA 5FH7A 4X2IA 5HEMA 4N4IA 4NR9A 2YELA 4CURA 4LYWA 4HBWA 4IR3A 4QEWA 4A9MA 4J3IA 5TCMA 4YYMA 5ENJA 5HQ6A 4O7AA 5ENFA 4ALHA 4ALGA 2RS9B 5EP7A 5EK9A 4A9KA 4BJXA 2MJVB 5DW2A 2G4AA 5D7XA 4MENA 5EQ1A 3HMHA 3U5KA 3ERRA 4BW3A 3DAIA 4CFLA 5HQ7A 4XUAA 4O72A 3ZYUA 2E7NA 2WP1A 5EU1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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