5FBXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with pnz5 isoxazole inhibitor
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with PNZ5 isoxazole inhibitor
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fbxA01
5KTUA 3UVXA 5I1QA 5L8TA 3QZTA 3MULA 4NRCA 4QEUA 5LJ2A 4IR5A 4NRAA 4YY6A 4O7CA 4J1PA 4UIZA 4A9JA 5LKXA 4ALHA 4TU4A 4J0RA 2OSSA 5HQ6A 4PCEA 4CFLA 4UIYA 2D82A 4HXPA 4A9EA 5CQ7A 5A7CA 4HXMA 5E9KA 5EICA 4HXRA 2OUOA 5CQAA 4QNSA 2KTBB 5LKUA 3LQIA 5ENCA 5FE6A 5F5ZA 4XUAA 4GPJA 4YH4A 1E6IA 4UYDA 2R0SA 2WP2A 4YAXA 5FG6A 4LYWA 4IOOA 5ETBA 4TZ2A 4NYXA 5HLSA 4NRBA 5CRMA 5DW1A 5A5PA 5IGKA 2E7NA 4IORA 4IR3A 1F68A 5I80A 4KV1A 5EU1A 4TTEA 3QZSA 5HJCA 5EGUA 5FE7A 4YYNA 4LYIA 5EWWA 5HM0A 4YY4A 3G0JA 3MB3A 4QYDA 5EPBA 5IGNA 4TS8A 5I88A 5IG6A 4QUTA 5CUAA 5G4SA 3DWYA 5A5SA 5FDZA 5C8GA 4WIVA 4A9HA 2MJVB 2N9GA 4NR9A 4UYFA 2YQDA 3O36A 5EISA 3UVWA 5IGLA 5LJ0A 4QEVA 4UYEA 4QSWA 4YH3A 4CLBA 4Q0NA 4UITA 2R0YA 4HXNA 4N4GA 5A83A 3FKMX 5KHMA 5DYCA 5LKZA 3P1EA 3UV2A 4YYHA 5EVAA 4TU6A 5FE1A 4KCXA 3LXJA 4LZSA 5BT3A 5EPSA 5AD3A 3LQHA 4Z1QA 4QSRA 2RFJA 2OO1A 4LC2A 4Z6IA 4NR6A 4ZC9A 4Q0OA 5FE8A 4NUCA 4Z1SA 5CGPA 5FB0A 4ZW1A 4MEQA 5CP5A 5I29A 3UVYA 4YBTA 4X2IA 4AKNA 5HELA 5DLZA 5HQ7A 2F6NA 4CUTA 5EI4A 4XYAA 2DATA 2NXBA 4O7AA 5AMFA 4MR3A 4BJXA 5ENJA 4YYJA 5CY9A 1WUGA 4MR5A 4MR6A 5HRXA 4QSSA 4QSTA 3HMHA 5HFRA 4UYHA 5L98A 3JVKA 5J0DA 2DVSA 2RNYA 5L96A 5CUCA 5ENBA 5HRVA 5A5NA 5D26A 1JSPB 4A9OA 5ENEA 2RS9B 4TYLA 5E9IA 5A82A 5EP7A 3O33A 3DAIA 5FH7A 4YYKA 3JVMA 4HBVA 2RNWA 4QUUA 3U5LA 5A5QA 4HBXA 5FE9A 2I7KA 5EQ1A 4O78A 1JM4B 5AMEA 3UVDA 4XY9A 4BW4A 5KTWA 4QSUA 5DKDA 4C67A 4A9KA 2RI7A 5IIDA 4BHWA 3JVJA 4WHWA 5COIA 5FE0A 5ENFA 4YYIA 4NR4A 4PY6A 4UYFB 1WUMA 4LZ2A 5CFWA 4A9NA 5CQ4A 5HQ5A 4LRGA 4IR4A 2D9EA 2WP1A 3TLPA 4PS5A 4CUUA 5LKTA 5II2A 5DW2A 4HBWA 5F63A 5I83A 4HBYA 3SVGA 2YYNA 5DX4A 4NR5A 5FE4A 4N4FA 5F25A 5FBXA 5EWVA 4XUBA 2I8NA 4Z93A 5DLXA 5C87A 4CURA 4QYLA 4QSQA 4TT4A 3LJWA 3P1FA 5I7XA 3UW9A 4KV4A 5HFQA 5FFVA 4F3IA 4UIVA 4WHUA 5C7NA 4YATA 4A9FA 3U5PA 4PTBA 5FH6A 5D3NA 4QR3A 4NYVA 5CU8A 2E3KA 4YABA 4O7BA 4NQMA 4QEWA 2RO1A 4J0SA 2G4AA 4HXKA 3K2JA 5H85A 4LZRA 4MEPA 4LR6A 4C66A 5A5OA 5ACYA 5AD2A 4XY8A 5CZGA 5C4QA 5FFWA 2GRCA 3MQMA 2YW5A 2L85A 5E74A 4NQNA 5HRWA 5JWMA 5FG4A 3QZVA 5BT4A 5H1TA 3RCWA 3AQAA 4LYSA 3G0LA 4UIWA 5LUUA 2LSPB 5C85A 5CQ3A 3IU6A 4NYWA 5F60A 4O77A 4QR4A 4YBSA 2FSAA 3O37A 5FB1A 5CQ5A 2DWWA 4A9IA 3JVLA 4NR8A 4O76A 5KU3A 5LJ1A 5CQ8A 5E7DA 5DKHA 3U5NA 4N3WA 5D3TA 3U5OA 5CRZA 4QR5A 5EPRA 4NUDA 3MUKA 2E7OA 5FFYA 5LVRA 5L97A 4QZSA 5ENHA 4J3IA 5D3JA 2YEKA 5CUEA 2F6JA 4A9MA 3D7CA 5H1UA 3P1DA 5I89A 5FG5A 5CUGA 5CQ6A 5ENIA 3GG3A 4OGIA 3UV4A 5CTLA 4CUQA 4TT2A 5ETDA 5F1HA 4O72A 5DKCA 4YADA 5E73A 5CUDA 3ONIA 3O35A 4CUSA 5A81A 4QSPA 4ALGA 4O7FA 5I7YA 5EM3A 4QC1A 3P1CA 4OUFA 2DVRA 5KO4A 1ZS5A 5IGMA 5H1VA 5CPEA 4QSVA 4HXLA 3P5OA 5DFBA 5A85A 4YYMA 5CQTA 2DVQA 3U5JA 3HMEA 3SVFA 3ZYUA 5BT5A 5L99A 5F2PA 5EV9A 5DBMA 5D24A 5LVQA 3AADA 4PCIA 5F61A 1X0JA 4NS5A 4BW3A 5D0CA 5E3GA 5EWCA 5E0RA 5F3AA 4PKLA 3MXFA 5FE3A 5EWDA 4IR6A 4YYDA 3IU5A 4O75A 1EQFA 5D3HA 4NR7A 5CUBA 4YK0A 4YBMA 4DONA 4Y03A 4ZQLA 4UIXA 5CS8A 5E9YA 5D3RA 5C89A 3S92A 4O70A 4IOQA 5F62A 5I86A 3I3JA 4LDFA 2L84A 3S91A 5D3PA 5HCLA 4QC3A 4BW2A 5II1A 4QB3A 3UV5A 5DFCA 5D25A 4O7EA 4CFKA 5KTXA 5L8UA 4N4HA 4N4IA 4UIUA 5K29A 4FLPA 4YC9A 4QSXA 4HXSA 3NXBA 5DYXA 4RVRA 3MB4A 5IBNA 5EWHA 5A5RA 4MEOA 3SVHA 2YELA 5DY7A 2RNXA 4UYGA 2L5EA 5DYUA 5EA1A 4NXJA 5FH8A 5F36A 4O71A 5E9VA 4Z6HA 4CL9A 4MENA 5DFDA 2R10A 5I40A 4CUPA 2R0VA 4QY4A 5TB6A 5DYAA 4TZ8A 4NUEA 5E9MA 5EK9A 5HENA 4TT6A 3U5MA 3Q2EA 5D7XA 3HMFA 1N72A 5D3SA 3O34A 4MR4A 5F1LA 5JI8A 4OGJA 3LQJA 4TQNA 5D3LA 2DKWA 4O74A 5TCMA 5E9LA 2YDWA 3Q2FA 2H60A 4E96A 4YYGA 4A9LA 5E3DA 5ENGA 5HEMA 5FE2A 5G4RA 2YEMA 4HXOA 2DVVA 3U5KA 4QBMA 4BW1A 5FE5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KTUA 3UVXA 5I1QA 5L8TA 3QZTA 3MULA 4NRCA 4QEUA 5LJ2A 4IR5A 4NRAA 4YY6A 4O7CA 4J1PA 4UIZA 4A9JA 5LKXA 4ALHA 4TU4A 4J0RA 2OSSA 5HQ6A 4PCEA 4CFLA 4UIYA 2D82A 4HXPA 4A9EA 5CQ7A 5A7CA 4HXMA 5E9KA 5EICA 4HXRA 2OUOA 5CQAA 4QNSA 2KTBB 5LKUA 3LQIA 5ENCA 5FE6A 5F5ZA 4XUAA 4GPJA 4YH4A 1E6IA 4UYDA 2R0SA 2WP2A 4YAXA 5FG6A 4LYWA 4IOOA 5ETBA 4TZ2A 4NYXA 5HLSA 4NRBA 5CRMA 5DW1A 5A5PA 5IGKA 2E7NA 4IORA 4IR3A 1F68A 5I80A 4KV1A 5EU1A 4TTEA 3QZSA 5HJCA 5EGUA 5FE7A 4YYNA 4LYIA 5EWWA 5HM0A 4YY4A 3G0JA 3MB3A 4QYDA 5EPBA 5IGNA 4TS8A 5I88A 5IG6A 4QUTA 5CUAA 5G4SA 3DWYA 5A5SA 5FDZA 5C8GA 4WIVA 4A9HA 2MJVB 2N9GA 4NR9A 4UYFA 2YQDA 3O36A 5EISA 3UVWA 5IGLA 5LJ0A 4QEVA 4UYEA 4QSWA 4YH3A 4CLBA 4Q0NA 4UITA 2R0YA 4HXNA 4N4GA 5A83A 3FKMX 5KHMA 5DYCA 5LKZA 3P1EA 3UV2A 4YYHA 5EVAA 4TU6A 5FE1A 4KCXA 3LXJA 4LZSA 5BT3A 5EPSA 5AD3A 1ZKRA 3LQHA 4Z1QA 4QSRA 2RFJA 2OO1A 4LC2A 4Z6IA 4NR6A 4ZC9A 4Q0OA 5FE8A 4NUCA 4Z1SA 5CGPA 5FB0A 4ZW1A 4MEQA 5CP5A 5I29A 3UVYA 4YBTA 4X2IA 4AKNA 5HELA 5DLZA 5HQ7A 2F6NA 4CUTA 5EI4A 4XYAA 2DATA 2NXBA 4O7AA 5AMFA 4MR3A 4BJXA 5ENJA 4YYJA 5CY9A 1WUGA 4MR5A 4MR6A 5HRXA 4QSSA 4QSTA 3HMHA 5HFRA 4UYHA 5L98A 3JVKA 5J0DA 2DVSA 2RNYA 5L96A 5CUCA 5ENBA 5HRVA 5A5NA 5D26A 1JSPB 4A9OA 5ENEA 2RS9B 4TYLA 5E9IA 5A82A 5EP7A 3O33A 3DAIA 5FH7A 4YYKA 3JVMA 4HBVA 2RNWA 4QUUA 3U5LA 5A5QA 4HBXA 5FE9A 2I7KA 5EQ1A 4O78A 1JM4B 5AMEA 3UVDA 4XY9A 4BW4A 5KTWA 4QSUA 5DKDA 4C67A 4A9KA 2RI7A 5IIDA 4BHWA 3JVJA 4WHWA 5COIA 5FE0A 5ENFA 4YYIA 4NR4A 4PY6A 4UYFB 1WUMA 4LZ2A 5CFWA 4A9NA 5CQ4A 5HQ5A 4LRGA 4AI6A 4IR4A 2D9EA 2WP1A 3TLPA 4PS5A 4CUUA 5LKTA 5II2A 5DW2A 4HBWA 5F63A 5I83A 4HBYA 3SVGA 2YYNA 5DX4A 4NR5A 5FE4A 4N4FA 5F25A 5FBXA 5EWVA 4XUBA 2I8NA 4Z93A 5DLXA 5C87A 4CURA 4QYLA 4QSQA 4TT4A 3LJWA 3P1FA 5I7XA 3UW9A 4KV4A 5HFQA 5FFVA 4F3IA 4UIVA 4WHUA 5C7NA 4YATA 4A9FA 3U5PA 4PTBA 5FH6A 5D3NA 4QR3A 4NYVA 5CU8A 2E3KA 4YABA 1PUOA 4O7BA 3VKHA 4NQMA 4QEWA 2RO1A 4J0SA 2G4AA 4HXKA 3K2JA 5H85A 4LZRA 4MEPA 4LR6A 4C66A 5A5OA 5ACYA 2EJNA 5AD2A 4XY8A 5CZGA 5C4QA 5FFWA 2GRCA 3MQMA 2YW5A 2L85A 5E74A 4NQNA 5HRWA 5JWMA 5FG4A 3QZVA 5BT4A 5H1TA 3RCWA 3AQAA 4LYSA 3G0LA 4UIWA 5LUUA 2LSPB 5C85A 5CQ3A 3IU6A 4NYWA 5F60A 4O77A 4QR4A 4YBSA 2FSAA 3O37A 5FB1A 5CQ5A 2DWWA 4A9IA 4AKHA 3JVLA 4NR8A 4O76A 5KU3A 5LJ1A 5CQ8A 5E7DA 5DKHA 3U5NA 4N3WA 5D3TA 3U5OA 5CRZA 4QR5A 5EPRA 4NUDA 3MUKA 2E7OA 5FFYA 5LVRA 5L97A 4QZSA 5ENHA 4J3IA 5D3JA 2YEKA 5CUEA 2F6JA 4A9MA 3D7CA 5H1UA 3P1DA 5I89A 5FG5A 5CUGA 5CQ6A 5ENIA 3GG3A 4OGIA 3UV4A 5CTLA 4CUQA 4TT2A 5ETDA 5F1HA 4O72A 5DKCA 4YADA 5E73A 5CUDA 3ONIA 3O35A 4CUSA 5A81A 4QSPA 4ALGA 4O7FA 5I7YA 5EM3A 4QC1A 3P1CA 4OUFA 2DVRA 5KO4A 1ZS5A 5IGMA 5H1VA 5CPEA 4QSVA 4HXLA 3P5OA 5DFBA 5A85A 4YYMA 5CQTA 2DVQA 3U5JA 3HMEA 3SVFA 3ZYUA 5BT5A 5L99A 5F2PA 5EV9A 5DBMA 5D24A 3ERRA 5LVQA 3AADA 4PCIA 5F61A 1X0JA 4NS5A 4BW3A 5D0CA 5E3GA 5EWCA 5E0RA 5F3AA 4PKLA 3MXFA 5FE3A 5EWDA 3D1BA 4IR6A 4YYDA 3IU5A 4O75A 1EQFA 5D3HA 4NR7A 5CUBA 4YK0A 4YBMA 4DONA 4Y03A 4ZQLA 4AKIA 4UIXA 5CS8A 5E9YA 5D3RA 5C89A 3S92A 4O70A 4IOQA 5F62A 5I86A 3I3JA 4LDFA 2L84A 3S91A 5D3PA 5HCLA 4QC3A 4BW2A 5II1A 4QB3A 3UV5A 5DFCA 5D25A 4O7EA 4CFKA 3D1DA 5KTXA 5L8UA 4N4HA 4N4IA 4UIUA 5K29A 4FLPA 4YC9A 4QSXA 4HXSA 3NXBA 5DYXA 4RVRA 3MB4A 5IBNA 5EWHA 5A5RA 4MEOA 3SVHA 2YELA 5DY7A 2RNXA 4UYGA 2L5EA 5DYUA 5EA1A 4NXJA 5FH8A 5F36A 4AKGA 4O71A 5E9VA 4Z6HA 4CL9A 4MENA 5DFDA 2R10A 5I40A 4CUPA 2R0VA 4QY4A 5TB6A 5DYAA 4TZ8A 4NUEA 5E9MA 5EK9A 5HENA 4TT6A 3U5MA 3Q2EA 5D7XA 3HMFA 1N72A 5D3SA 3O34A 4MR4A 5F1LA 5JI8A 4OGJA 3LQJA 4TQNA 5D3LA 2DKWA 4O74A 5TCMA 5E9LA 2YDWA 3Q2FA 2H60A 4E96A 4YYGA 4A9LA 5E3DA 3VKGA 5ENGA 5HEMA 5FE2A 5G4RA 2YEMA 4HXOA 2DVVA 3U5KA 4QBMA 4BW1A 5FE5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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