5FBXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with pnz5 isoxazole inhibitor
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with PNZ5 isoxazole inhibitor
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fbxA01
5DYUA 4TU6A 5DKHA 3GG3A 4BW4A 4NUEA 5EPSA 5ENGA 5DYAA 4NUCA 4A9OA 5FH8A 5D3RA 3O35A 1WUGA 5FE7A 3HMEA 4LR6A 5D3SA 5EICA 3P1EA 5DLZA 5ACYA 4LYSA 5ENFA 5KTUA 4A9FA 2G4AA 4NRBA 5E9KA 4HXSA 5I83A 4TT4A 3MB3A 2DVQA 4A9IA 4J0RA 4CUUA 5E9VA 5FFVA 5HEMA 4YYHA 4QSRA 4NRCA 5EK9A 5DYCA 5H1VA 4HXMA 5E9IA 4KV4A 5EWWA 5E9YA 5LUUA 3ONIA 4YK0A 4NR6A 4OGJA 5D3HA 5F63A 4O7BA 5H1UA 5CQ3A 4LZRA 4OUFA 2L85A 4YBSA 5CRMA 5HFRA 3UVXA 5L98A 4A9EA 4N4FA 3LQJA 4QSUA 4ZQLA 4Y03A 5IGNA 4LYIA 5D3PA 4QR4A 3O33A 4J3IA 5A5NA 5HM0A 2E7OA 4QUTA 4CUQA 4MEQA 5DFDA 4BJXA 5F60A 5ENIA 5CRZA 4C67A 5C7NA 5CUBA 5LJ1A 5DBMA 5DKCA 4NYXA 2DVSA 4IORA 4ZC9A 5I40A 2E3KA 5F2PA 3UV2A 5HRXA 2OUOA 2RNWA 5HRVA 4YABA 5CPEA 2F6NA 4MR3A 2WP1A 2YYNA 4UYDA 5EI4A 5EWDA 5FE6A 4QEWA 5FFYA 5HQ6A 5HLSA 5KO4A 4HXKA 2R0SA 5AMEA 3UVDA 4UYFA 4TTEA 4YATA 4NYVA 5E0RA 4HBWA 3LJWA 4QSPA 4QSXA 5F36A 5CU8A 3LXJA 3MQMA 2I7KA 4KV1A 5G4SA 5FBXA 5IGMA 4QEVA 4QSWA 5DKDA 5I80A 5CQ4A 5A85A 5E9MA 4A9HA 5LJ0A 5CUEA 3D7CA 5F3AA 4CLBA 3UW9A 3U5KA 4O70A 4IR3A 5D3LA 5LKUA 4QR3A 2D9EA 4CFLA 4UIWA 5EA1A 4UYEA 4CUTA 5BT4A 4NR4A 4ZW1A 3Q2FA 5CQ7A 2DWWA 3JVKA 5IGLA 4A9MA 5I29A 4NR7A 5A5SA 2RNXA 3G0LA 5F1LA 2R0YA 5LVQA 5EVAA 4TYLA 5A5QA 4YYKA 5A7CA 4C66A 5COIA 2F6JA 5LKXA 5EU1A 5FG4A 4E96A 4UIXA 4OGIA 4LC2A 4XY9A 4NQMA 4MR4A 3NXBA 5CFWA 4HBVA 5E74A 5A5PA 2YEMA 2R0VA 4QBMA 4Z93A 3U5PA 4QSQA 3TLPA 3P5OA 4HXRA 4XUAA 4QZSA 4QY4A 4GPJA 4TQNA 5CS8A 5ENHA 5FB1A 4YY4A 5KTXA 1JSPB 5EQ1A 3FKMX 5CQ8A 5IGKA 3S92A 4QNSA 4TT6A 5KHMA 4F3IA 4YY6A 4LRGA 3S91A 2RO1A 4LZSA 4UYHA 5DFCA 5FE2A 5HRWA 4PS5A 5KTWA 4O75A 3G0JA 3O36A 2NXBA 5IG6A 3UV5A 4CFKA 2YEKA 4UIVA 3QZTA 4NS5A 3SVFA 4Z1QA 5EM3A 5HJCA 4WIVA 4NQNA 5EPRA 5D3JA 5JWMA 4Q0OA 5IIDA 5C8GA 5D3NA 4N4GA 2YDWA 2MJVB 5A81A 5F1HA 5L96A 5II1A 3SVGA 4O7AA 4HXLA 5F62A 3DAIA 5E9LA 1JM4B 5FE4A 4HXNA 4YBMA 4O77A 1ZS5A 5E3DA 4LDFA 4YYMA 5I89A 5ENJA 5ENBA 3HMFA 4YC9A 5FH7A 4NUDA 5II2A 5LVRA 3QZVA 5AD3A 4O7EA 5D26A 5DX4A 1EQFA 5CQ5A 4YYGA 3O37A 5E7DA 5D24A 4CUSA 5EWCA 4QSTA 4O74A 4UYFB 1N72A 3RCWA 3P1FA 5L8UA 4QC3A 5HCLA 4BW1A 4J0SA 5L8TA 2E7NA 4ALGA 4QYLA 5C4QA 3U5JA 4NR8A 4Z6HA 5FE0A 4YH4A 2RNYA 3O34A 5D3TA 4WHUA 5IBNA 5HELA 4YAXA 5CQ6A 4KCXA 5HQ5A 5FG6A 5FE8A 5CY9A 5C85A 5I86A 5I7YA 4A9JA 4NRAA 3AADA 4WHWA 4IR6A 5EISA 2DATA 3DWYA 5A83A 3LQIA 4QEUA 1E6IA 5J0DA 5FE1A 5AMFA 4Z1SA 3IU5A 4QR5A 2DVVA 5BT3A 5ETDA 3I3JA 4YYIA 3U5NA 5TCMA 3UVWA 5FH6A 4LYWA 5FE3A 4QSVA 5EGUA 4MR6A 3MUKA 4UIUA 5EWHA 5FE9A 2YQDA 1WUMA 4PCIA 5FDZA 5D25A 5DW2A 5F61A 2YELA 5CGPA 5BT5A 5K29A 4UYGA 4IOQA 4O71A 3JVJA 2I8NA 4PKLA 5H1TA 5JI8A 5C87A 3MB4A 4O72A 4YYJA 2DKWA 2RS9B 4QC1A 5CZGA 4IR4A 4QUUA 4UIYA 5LJ2A 2RI7A 5I88A 4PTBA 4UITA 4CL9A 5CUGA 3JVMA 3SVHA 4YYNA 4TS8A 5CUAA 5DW1A 5H85A 4DONA 2WP2A 4YH3A 2N9GA 5CP5A 4Z6IA 5A5OA 5LKZA 4UIZA 4CURA 4QSSA 5D7XA 2R10A 4N3WA 2OSSA 3MULA 4TZ8A 4ALHA 4MENA 4TZ2A 2LSPB 4TU4A 5CUDA 4XY8A 4QYDA 3AQAA 3ZYUA 4A9NA 2H60A 5EWVA 5CQTA 2OO1A 1X0JA 5C89A 4N4IA 4NYWA 5L99A 4MEPA 3U5LA 2DVRA 4XYAA 5EV9A 5HQ7A 5E73A 4PY6A 5I7XA 2KTBB 2D82A 5F25A 4NR5A 4O78A 5KU3A 3P1DA 3LQHA 5ETBA 5HENA 4HBXA 4O7CA 2YW5A 5CTLA 5FB0A 4BHWA 3UVYA 5DYXA 4A9LA 4X2IA 3Q2EA 5DLXA 4J1PA 5HFQA 4NR9A 4YBTA 1F68A 4MR5A 5TB6A 3IU6A 5EPBA 4AKNA 4YYDA 5I1QA 3HMHA 2GRCA 4O7FA 4Q0NA 3UV4A 2L5EA 3K2JA 4CUPA 4RVRA 4NXJA 3U5OA 5A5RA 4YADA 4O76A 5A82A 5FG5A 5EP7A 4HXOA 4TT2A 2FSAA 5CQAA 4BW2A 3JVLA 4FLPA 3MXFA 4XUBA 4HBYA 5L97A 5FE5A 5E3GA 5G4RA 5AD2A 4A9KA 5ENEA 3U5MA 2RFJA 3P1CA 5FFWA 5DY7A 5ENCA 5F5ZA 4LZ2A 5LKTA 4IOOA 5CUCA 4QB3A 2L84A 4BW3A 5D0CA 4PCEA 3QZSA 4HXPA 4IR5A 4MEOA 4N4HA 5DFBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DYUA 4TU6A 5DKHA 3GG3A 4BW4A 4NUEA 5EPSA 5ENGA 5DYAA 4NUCA 4A9OA 5FH8A 5D3RA 3O35A 1WUGA 5FE7A 3HMEA 4LR6A 5D3SA 5EICA 3P1EA 5DLZA 5ACYA 4LYSA 5ENFA 5KTUA 4A9FA 2G4AA 4NRBA 5E9KA 4HXSA 5I83A 4TT4A 3MB3A 2DVQA 4A9IA 4J0RA 4CUUA 5E9VA 5FFVA 5HEMA 4YYHA 4QSRA 4NRCA 5EK9A 5DYCA 5H1VA 4HXMA 5E9IA 4KV4A 5EWWA 5E9YA 5LUUA 3ONIA 4YK0A 4NR6A 4OGJA 5D3HA 5F63A 4O7BA 5H1UA 5CQ3A 4LZRA 4OUFA 2L85A 4YBSA 5CRMA 5HFRA 3UVXA 5L98A 4A9EA 4N4FA 3LQJA 4QSUA 4ZQLA 4Y03A 5IGNA 4LYIA 5D3PA 4QR4A 3O33A 4J3IA 5A5NA 5HM0A 2E7OA 4QUTA 4CUQA 3VKHA 4MEQA 5DFDA 4BJXA 5F60A 5ENIA 5CRZA 4C67A 5C7NA 5CUBA 5LJ1A 5DBMA 5DKCA 4NYXA 2DVSA 4IORA 4ZC9A 5I40A 2E3KA 5F2PA 3UV2A 5HRXA 2OUOA 2RNWA 5HRVA 4YABA 5CPEA 2F6NA 4MR3A 2WP1A 2YYNA 4UYDA 5EI4A 5EWDA 5FE6A 4QEWA 5FFYA 5HQ6A 5HLSA 4AKGA 5KO4A 4HXKA 2R0SA 5AMEA 3UVDA 4UYFA 3D1DA 4TTEA 4YATA 1PUOA 4NYVA 5E0RA 4HBWA 3LJWA 4QSPA 4QSXA 5F36A 5CU8A 3LXJA 3MQMA 2I7KA 4KV1A 5G4SA 5FBXA 5IGMA 4QEVA 4QSWA 5DKDA 5I80A 5CQ4A 5A85A 5E9MA 4A9HA 5LJ0A 5CUEA 3D7CA 5F3AA 4CLBA 3UW9A 3U5KA 4AKIA 4O70A 4IR3A 5D3LA 5LKUA 4QR3A 2D9EA 4CFLA 4UIWA 5EA1A 4UYEA 4CUTA 5BT4A 4NR4A 4ZW1A 3Q2FA 5CQ7A 2DWWA 3JVKA 5IGLA 4A9MA 5I29A 4NR7A 5A5SA 2RNXA 3G0LA 5F1LA 2R0YA 5LVQA 5EVAA 4TYLA 5A5QA 4YYKA 5A7CA 4C66A 5COIA 2F6JA 5LKXA 5EU1A 5FG4A 1ZKRA 4E96A 4UIXA 4OGIA 4LC2A 4XY9A 4NQMA 4MR4A 3NXBA 5CFWA 4HBVA 5E74A 5A5PA 2YEMA 2R0VA 4QBMA 3D1BA 4Z93A 3U5PA 4QSQA 3TLPA 3P5OA 4HXRA 4XUAA 4QZSA 4QY4A 4GPJA 4TQNA 5CS8A 5ENHA 5FB1A 4YY4A 5KTXA 1JSPB 5EQ1A 3FKMX 5CQ8A 5IGKA 3S92A 4QNSA 4TT6A 5KHMA 4F3IA 4YY6A 4LRGA 3S91A 2RO1A 4LZSA 4UYHA 5DFCA 5FE2A 5HRWA 4PS5A 5KTWA 4O75A 3G0JA 3O36A 2NXBA 5IG6A 3UV5A 4CFKA 2YEKA 4UIVA 3QZTA 4NS5A 3SVFA 4Z1QA 5EM3A 5HJCA 4WIVA 4NQNA 5EPRA 5D3JA 5JWMA 4Q0OA 5IIDA 5C8GA 5D3NA 4N4GA 2YDWA 2MJVB 5A81A 5F1HA 5L96A 5II1A 3SVGA 4O7AA 4HXLA 5F62A 3DAIA 5E9LA 1JM4B 5FE4A 4HXNA 4YBMA 4O77A 1ZS5A 5E3DA 4LDFA 4YYMA 5I89A 5ENJA 5ENBA 3HMFA 4YC9A 5FH7A 4NUDA 5II2A 5LVRA 3QZVA 5AD3A 4O7EA 5D26A 5DX4A 1EQFA 5CQ5A 4YYGA 3O37A 5E7DA 5D24A 4CUSA 5EWCA 4QSTA 4O74A 4UYFB 1N72A 3RCWA 3P1FA 5L8UA 4QC3A 5HCLA 4BW1A 4J0SA 5L8TA 2E7NA 4ALGA 4QYLA 5C4QA 3U5JA 4NR8A 4Z6HA 5FE0A 4YH4A 2RNYA 3O34A 5D3TA 4WHUA 5IBNA 5HELA 4YAXA 5CQ6A 4KCXA 5HQ5A 5FG6A 5FE8A 5CY9A 5C85A 5I86A 5I7YA 4A9JA 4NRAA 3AADA 4WHWA 4IR6A 5EISA 2DATA 3DWYA 3ERRA 3LQIA 5A83A 4QEUA 1E6IA 5J0DA 5FE1A 5AMFA 4Z1SA 3IU5A 2EJNA 4QR5A 2DVVA 5BT3A 5ETDA 3I3JA 4YYIA 3U5NA 4AI6A 5TCMA 3UVWA 5FH6A 4LYWA 5FE3A 4QSVA 5EGUA 4MR6A 3MUKA 4UIUA 5EWHA 5FE9A 2YQDA 1WUMA 4PCIA 5FDZA 5D25A 5DW2A 5F61A 2YELA 5CGPA 5BT5A 5K29A 4UYGA 4IOQA 4O71A 3JVJA 2I8NA 4PKLA 5H1TA 5JI8A 5C87A 3MB4A 4O72A 4YYJA 2DKWA 2RS9B 4QC1A 5CZGA 4IR4A 4QUUA 4UIYA 5LJ2A 2RI7A 5I88A 4PTBA 4UITA 4CL9A 5CUGA 3JVMA 3SVHA 4YYNA 4TS8A 5CUAA 5DW1A 4AKHA 5H85A 4DONA 2WP2A 4YH3A 2N9GA 5CP5A 4Z6IA 5A5OA 5LKZA 4UIZA 4CURA 4QSSA 5D7XA 2R10A 4N3WA 2OSSA 3MULA 4TZ8A 4ALHA 4MENA 4TZ2A 2LSPB 4TU4A 5CUDA 4XY8A 4QYDA 3AQAA 3ZYUA 4A9NA 2H60A 5EWVA 5CQTA 2OO1A 1X0JA 5C89A 4N4IA 4NYWA 5L99A 4MEPA 3U5LA 2DVRA 4XYAA 5EV9A 5HQ7A 5E73A 4PY6A 5I7XA 2KTBB 2D82A 5F25A 4NR5A 4O78A 5KU3A 3P1DA 3LQHA 5ETBA 5HENA 4HBXA 4O7CA 2YW5A 5CTLA 5FB0A 4BHWA 3UVYA 5DYXA 4A9LA 4X2IA 3Q2EA 5DLXA 4J1PA 5HFQA 4NR9A 4YBTA 1F68A 4MR5A 5TB6A 3IU6A 5EPBA 4AKNA 4YYDA 5I1QA 3HMHA 2GRCA 4O7FA 4Q0NA 3UV4A 2L5EA 3K2JA 4CUPA 4RVRA 4NXJA 3U5OA 5A5RA 4YADA 4O76A 5A82A 5FG5A 5EP7A 4HXOA 4TT2A 2FSAA 5CQAA 4BW2A 3JVLA 4FLPA 3MXFA 3VKGA 4XUBA 4HBYA 5L97A 5FE5A 5E3GA 5G4RA 5AD2A 4A9KA 5ENEA 3U5MA 2RFJA 3P1CA 5FFWA 5DY7A 5ENCA 5F5ZA 4LZ2A 5LKTA 4IOOA 5CUCA 4QB3A 2L84A 4BW3A 5D0CA 4PCEA 3QZSA 4HXPA 4IR5A 4MEOA 4N4HA 5DFBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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