2G4AA

Solution structure of a bromodomain from ring3 protein
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
EQLKHCNVILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
publication title Solution structure of a Bromodomain from RING3
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Gene regulation
total genus 28
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2g4aA00
5FE1A 5DFDA 5A81A 3U5OA 3U5KA 5A7CA 4A9NA 4X2IA 5BT4A 5E9LA 4YBSA 4QC3A 5EWCA 4LC2A 3MB3A 4BW4A 4YYDA 3P1DA 4HXPA 4QUUA 5I40A 5G4RA 5TB6A 4N3WA 2YEMA 4IR3A 5IG6A 3Q2FA 5D3HA 3JVMA 4QUTA 5E0RA 5IGMA 5CQ4A 4Z6HA 4IORA 5EU1A 4J0RA 4NUEA 5II1A 3O37A 4CUUA 5CRMA 5CP5A 5L96A 2RI7A 2F6NA 3MXFA 5A85A 5K29A 5D26A 3HMHA 4HBVA 4PCIA 5FG5A 5H1UA 3GG3A 5EM3A 4WHUA 4WHWA 5D3NA 5ENGA 2MJVB 3U5LA 4N4FA 4QB3A 2OSSA 4TU6A 4O76A 5F2PA 4YH4A 2YDWA 5HRWA 5CQ8A 5EQ1A 5IBNA 2H60A 4O7FA 5HEMA 2D9EA 4NR8A 4QSQA 4MR4A 5DBMA 3LQHA 4CFLA 4YYMA 5F5ZA 5FBXA 4A9JA 4YABA 5FE0A 4XUAA 5A82A 5HQ5A 2R0SA 4HXRA 2RS9B 5FE8A 4Q0NA 4OGJA 4YY4A 3P1CA 4J3IA 5L98A 4UITA 3O33A 5EWVA 5FB0A 5ENBA 5D3LA 4A9KA 4Q0OA 4YYGA 5FE4A 4HXOA 5CUDA 5DYXA 4PCEA 5DW2A 4MR5A 5DYUA 4CURA 5LKTA 3Q2EA 5L8UA 4NYWA 1E6IA 4UYFA 4NR5A 4UYGA 3DWYA 3S92A 3MB4A 4IR6A 5D7XA 3AADA 4UYEA 4E96A 5F1HA 5EV9A 3TLPA 2DVVA 4BW3A 5F62A 4N4IA 4O75A 4O70A 2DVRA 3U5MA 4O7CA 2OUOA 4MEQA 1ZS5A 2GRCA 4QSUA 5LJ2A 5CUCA 5EICA 1EQFA 5KTWA 5E9YA 5CZGA 4TT2A 5CQ6A 4NR6A 4XYAA 4YC9A 3U5PA 4GPJA 5CU8A 5KTXA 4TYLA 4TTEA 4A9MA 4AKNA 3P5OA 4TS8A 4MEPA 5DFCA 5D0CA 5A5OA 4A9IA 4CLBA 4QEVA 5EWDA 5FE2A 4Z1QA 3O34A 4O71A 3U5NA 4NRBA 5ENCA 5EPRA 4ZC9A 2DATA 3FKMX 3MULA 4UYFB 3I3JA 4KV1A 5EVAA 5DFBA 5E7DA 4YYKA 4IR5A 4BJXA 4CUQA 5C89A 3UV5A 5JI8A 4CUPA 5HRXA 4NR4A 4MR6A 5HQ7A 3IU6A 4J0SA 5AD3A 3AQAA 3P1EA 3UVXA 5D24A 5FDZA 5I89A 4QEUA 4YATA 4J1PA 2LSPB 4O72A 5AMEA 4A9FA 5IIDA 4YADA 4HBXA 5HELA 3UV2A 4QSXA 3LQJA 4NQNA 5D3RA 4MEOA 4LRGA 3UW9A 5FB1A 3G0JA 2E3KA 4DONA 5A5NA 4IOOA 4Z1SA 3P1FA 3MUKA 2DVQA 3UVYA 4HBYA 5DX4A 4Y03A 4NYVA 5F61A 2R0YA 4TT4A 4QY4A 4QSTA 5C8GA 3JVKA 2L5EA 4O7EA 4PS5A 2YQDA 4A9EA 5I86A 5LVRA 5COIA 3MQMA 4QEWA 5EPSA 5CUBA 5CTLA 5I7YA 4YH3A 5CY9A 2R0VA 4UIUA 4UYHA 5D3JA 3D7CA 1JM4B 3UVDA 5EK9A 2E7OA 5F63A 4NR7A 4YAXA 2DVSA 5CQ3A 5H85A 2YW5A 4CUSA 4CL9A 3S91A 5CUEA 4C66A 4QNSA 5KU3A 4LYSA 5CUAA 4YYHA 5I29A 5E9IA 4TU4A 2WP1A 3SVFA 3LXJA 3QZSA 4QR5A 4A9LA 3DAIA 5DKHA 2RO1A 4QSPA 5HLSA 5EISA 3G0LA 4HXKA 5FE3A 5DYAA 5FH8A 5TCMA 5LVQA 5CQ5A 4Z6IA 5F60A 5C7NA 5F25A 5IGKA 4ALGA 4UIWA 3UVWA 4QYLA 4TZ2A 2RFJA 4QSVA 4YYIA 4A9OA 5KTUA 4LZRA 5HJCA 5E9MA 5HQ6A 4O77A 5E74A 5BT5A 4NUCA 3U5JA 5HFQA 5F3AA 5AMFA 4TZ8A 2YELA 4YBMA 4HXSA 4NRAA 5ENHA 5DLXA 5IGNA 4N4HA 5EA1A 5EP7A 5H1VA 4ALHA 4ZW1A 5C85A 5FFVA 2I8NA 5HCLA 3HMFA 1F68A 5EWWA 3QZTA 5CGPA 5E3GA 4CFKA 4YYJA 4A9HA 4NYXA 4LR6A 4PKLA 5KHMA 5ACYA 4BW1A 5FFYA 5A5QA 5LJ1A 5I7XA 4LZSA 4OUFA 4UIXA 2YYNA 1X0JA 5HM0A 4UYDA 1JSPB 5E73A 4YK0A 5JWMA 4ZQLA 3NXBA 4KCXA 3LQIA 2L85A 4QYDA 2YEKA 5DLZA 4O7BA 4TQNA 4Z93A 5J0DA 4NS5A 5LKXA 5D3TA 2RNXA 3O35A 5DYCA 5EWHA 3UV4A 5L97A 2E7NA 2D82A 4XY8A 2OO1A 4MR3A 2F6JA 4HXMA 3ZYUA 4QSWA 3K2JA 5DKCA 5FE6A 5ENIA 2FSAA 2I7KA 5ENEA 5A5SA 5C4QA 4HXLA 4IOQA 3SVHA 4YBTA 4CUTA 5CQTA 5F36A 4C67A 4PTBA 5DW1A 5DKDA 3JVJA 4O7AA 4WIVA 5FG6A 5I83A 3HMEA 2NXBA 4NUDA 4QZSA 1WUMA 4NRCA 4LYIA 4QR3A 4QR4A 2DWWA 4HBWA 3RCWA 3O36A 4FLPA 3JVLA 5C87A 2L84A 3SVGA 5E9KA 2RNWA 3QZVA 5IGLA 4QC1A 2R10A 5HRVA 4QBMA 5FFWA 5CS8A 5HENA 5CQ7A 5I88A 2G4AA 5ENJA 5BT3A 4KV4A 4LZ2A 5CRZA 5D3PA 5G4SA 5E3DA 4XY9A 5CPEA 4BW2A 5LUUA 4MENA 4HXNA 1WUGA 5HFRA 4NXJA 3ONIA 5LKZA 2RNYA 5FG4A 4OGIA 3LJWA 3IU5A 5II2A 5L99A 4YY6A 4UIZA 4IR4A 5A5PA 5H1TA 5F1LA 2N9GA 5CFWA 2WP2A 4XUBA 5I80A 5LJ0A 4UIVA 5ENFA 4QSSA 5L8TA 5AD2A 4LDFA 5A83A 5D25A 5CUGA 2KTBB 4N4GA 2DKWA 4O74A 4QSRA 5EPBA 4UIYA 5ETDA 5FH7A 5EGUA 4TT6A 4LYWA 5D3SA 4PY6A 1N72A 4RVRA 5CQAA 5EI4A 4YYNA 5FH6A 5ETBA 5KO4A 4NQMA 5FE7A 5FE5A 5FE9A 5A5RA 5DY7A 4NR9A 4F3IA 5LKUA 4O78A 4BHWA 5E9VA 5I1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE1A 5DFDA 5A81A 3U5OA 3U5KA 5A7CA 4A9NA 4X2IA 5BT4A 5E9LA 4AKIA 4YBSA 4QC3A 5EWCA 4LC2A 3MB3A 4BW4A 4YYDA 3P1DA 4HXPA 4QUUA 5I40A 5G4RA 5TB6A 4N3WA 2YEMA 4IR3A 5IG6A 3Q2FA 5D3HA 3JVMA 4QUTA 5E0RA 5IGMA 5CQ4A 4AKHA 4Z6HA 4IORA 5EU1A 4J0RA 4NUEA 5II1A 3O37A 4CUUA 5CRMA 5CP5A 5L96A 2RI7A 2F6NA 3MXFA 5A85A 5K29A 5D26A 3HMHA 4HBVA 4PCIA 5FG5A 5H1UA 3GG3A 5EM3A 4WHUA 4WHWA 5D3NA 5ENGA 2MJVB 3U5LA 4N4FA 4QB3A 2OSSA 4TU6A 4O76A 5F2PA 4YH4A 2YDWA 5HRWA 5CQ8A 5EQ1A 5IBNA 2H60A 4O7FA 5HEMA 2D9EA 4NR8A 4QSQA 4MR4A 5DBMA 4AI6A 3LQHA 4CFLA 4YYMA 5F5ZA 5FBXA 4A9JA 4YABA 5FE0A 4XUAA 5A82A 5HQ5A 2R0SA 4HXRA 2RS9B 5FE8A 4Q0NA 4OGJA 4YY4A 3P1CA 4J3IA 5L98A 4UITA 3O33A 5EWVA 5FB0A 5ENBA 5D3LA 4A9KA 4Q0OA 4YYGA 5FE4A 4HXOA 5CUDA 5DYXA 4PCEA 5DW2A 4MR5A 5DYUA 4CURA 5LKTA 3Q2EA 5L8UA 4NYWA 1E6IA 4UYFA 4NR5A 4UYGA 3DWYA 3S92A 3MB4A 3VKGA 4IR6A 5D7XA 3AADA 4UYEA 1ZKRA 4E96A 5F1HA 5EV9A 3TLPA 2DVVA 4BW3A 5F62A 4N4IA 4O75A 4O70A 2DVRA 3U5MA 4O7CA 2OUOA 4MEQA 1ZS5A 2GRCA 4QSUA 5LJ2A 5CUCA 5EICA 1EQFA 5KTWA 5E9YA 5CZGA 4TT2A 5CQ6A 4NR6A 4XYAA 4YC9A 3U5PA 4GPJA 5CU8A 5KTXA 4TYLA 4TTEA 4A9MA 4AKNA 3P5OA 4TS8A 4MEPA 5DFCA 3D1DA 5D0CA 5A5OA 4A9IA 4CLBA 4QEVA 5EWDA 5FE2A 4Z1QA 3O34A 4O71A 3U5NA 4NRBA 5ENCA 5EPRA 4ZC9A 2DATA 3FKMX 3MULA 4UYFB 3I3JA 4KV1A 5EVAA 4AKGA 5DFBA 5E7DA 4YYKA 4IR5A 4BJXA 4CUQA 5C89A 3UV5A 5JI8A 4CUPA 5HRXA 3D1BA 4NR4A 4MR6A 5HQ7A 3IU6A 4J0SA 5AD3A 3AQAA 3P1EA 3UVXA 5D24A 5FDZA 5I89A 4QEUA 4YATA 4J1PA 2LSPB 4O72A 5AMEA 4A9FA 5IIDA 4YADA 4HBXA 5HELA 3UV2A 4QSXA 3LQJA 4NQNA 5D3RA 4MEOA 4LRGA 3UW9A 5FB1A 3G0JA 2E3KA 4DONA 5A5NA 4IOOA 4Z1SA 3P1FA 3MUKA 2DVQA 3UVYA 4HBYA 5DX4A 4Y03A 4NYVA 5F61A 2R0YA 4TT4A 4QY4A 4QSTA 5C8GA 3JVKA 2L5EA 4O7EA 4PS5A 2YQDA 4A9EA 5I86A 5LVRA 5COIA 3MQMA 4QEWA 5EPSA 5CUBA 5CTLA 5I7YA 4YH3A 5CY9A 2R0VA 4UIUA 4UYHA 5D3JA 3D7CA 1JM4B 3UVDA 5EK9A 2E7OA 5F63A 4NR7A 4YAXA 2DVSA 5CQ3A 5H85A 2YW5A 4CUSA 4CL9A 3S91A 5CUEA 4C66A 4QNSA 5KU3A 4LYSA 5CUAA 4YYHA 1PUOA 5I29A 5E9IA 4TU4A 2WP1A 3SVFA 3LXJA 3QZSA 4QR5A 4A9LA 3DAIA 5DKHA 2RO1A 4QSPA 5HLSA 5EISA 3G0LA 4HXKA 5FE3A 5DYAA 5FH8A 5TCMA 5LVQA 5CQ5A 4Z6IA 5F60A 5C7NA 3ERRA 5F25A 5IGKA 4ALGA 4UIWA 3UVWA 4QYLA 4TZ2A 2RFJA 4QSVA 4YYIA 4A9OA 5KTUA 4LZRA 5HJCA 5E9MA 5HQ6A 4O77A 5E74A 5BT5A 4NUCA 3U5JA 5HFQA 5F3AA 5AMFA 4TZ8A 2YELA 4YBMA 4HXSA 4NRAA 5ENHA 5DLXA 5IGNA 4N4HA 5EA1A 5EP7A 5H1VA 4ALHA 4ZW1A 5C85A 5FFVA 2I8NA 5HCLA 3HMFA 1F68A 5EWWA 3QZTA 5CGPA 5E3GA 4CFKA 4YYJA 4A9HA 4NYXA 4LR6A 4PKLA 5KHMA 5ACYA 4BW1A 5FFYA 5A5QA 5LJ1A 5I7XA 4LZSA 4OUFA 4UIXA 2YYNA 1X0JA 5HM0A 4UYDA 1JSPB 5E73A 4YK0A 5JWMA 4ZQLA 3NXBA 4KCXA 3LQIA 2L85A 4QYDA 2YEKA 5DLZA 4O7BA 4TQNA 4Z93A 5J0DA 4NS5A 5LKXA 5D3TA 2RNXA 3O35A 5DYCA 5EWHA 3UV4A 5L97A 2E7NA 2D82A 4XY8A 2OO1A 4MR3A 2F6JA 4HXMA 3ZYUA 4QSWA 3K2JA 5DKCA 5FE6A 5ENIA 2FSAA 2I7KA 5ENEA 5A5SA 5C4QA 4HXLA 4IOQA 3SVHA 4YBTA 4CUTA 5CQTA 5F36A 4C67A 4PTBA 5DW1A 5DKDA 3JVJA 4O7AA 4WIVA 5FG6A 5I83A 3HMEA 2NXBA 4NUDA 4QZSA 1WUMA 4NRCA 4LYIA 4QR3A 4QR4A 2DWWA 4HBWA 3RCWA 3O36A 4FLPA 3JVLA 5C87A 2L84A 3SVGA 5E9KA 2RNWA 3QZVA 5IGLA 4QC1A 2EJNA 2R10A 5HRVA 4QBMA 5FFWA 5CS8A 5HENA 5CQ7A 5I88A 2G4AA 5ENJA 5BT3A 4KV4A 4LZ2A 5CRZA 5D3PA 5G4SA 5E3DA 4XY9A 5CPEA 4BW2A 5LUUA 3VKHA 4MENA 4HXNA 1WUGA 5HFRA 4NXJA 3ONIA 5LKZA 2RNYA 5FG4A 4OGIA 3LJWA 3IU5A 5II2A 5L99A 4YY6A 4UIZA 4IR4A 5A5PA 5H1TA 5F1LA 2N9GA 5CFWA 2WP2A 4XUBA 5I80A 5LJ0A 4UIVA 5ENFA 4QSSA 5L8TA 5AD2A 4LDFA 5A83A 5D25A 5CUGA 2KTBB 4N4GA 2DKWA 4O74A 4QSRA 5EPBA 4UIYA 5ETDA 5FH7A 5EGUA 4TT6A 4LYWA 5D3SA 4PY6A 1N72A 4RVRA 5CQAA 5EI4A 4YYNA 5FH6A 5ETBA 5KO4A 4NQMA 5FE7A 5FE5A 5FE9A 5A5RA 5DY7A 4NR9A 4F3IA 5LKUA 4O78A 4BHWA 5E9VA 5I1QA
chains in the Genus database with same CATH topology
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