5AD2A

Bivalent binding to bet bromodomains
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Potent and Selective Bivalent Inhibitors of Bet Bromodomains
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ad2A01
4CLBA 3O33A 4IR6A 5A83A 2FSAA 5FE7A 4LZSA 3P1EA 5H1UA 4YYNA 5G4RA 1JSPB 5ENFA 5H1VA 4XY9A 2GRCA 5DFDA 5CFWA 4N3WA 3U5OA 3LJWA 4TTEA 4TU6A 5CUEA 5FBXA 5L8UA 4HXOA 3JVKA 3I3JA 4PY6A 4QBMA 3Q2FA 5C8GA 5LKUA 4UIXA 2D9EA 4O76A 4QB3A 4NYWA 5EWDA 5AMFA 2R0YA 4A9HA 4NYXA 4NQNA 5C87A 4QC3A 5D0CA 5ENCA 5DLXA 4NXJA 2DKWA 4IOQA 4XYAA 4HBVA 2G4AA 5IBNA 4IOOA 5H1TA 4QNSA 5LKZA 3O37A 5BT5A 4UIZA 5TCMA 1E6IA 3AQAA 3U5JA 5A5RA 4QUTA 3AADA 5G4SA 5HENA 2D82A 5C89A 4C67A 4UIVA 2OSSA 2YEMA 5HRWA 1WUGA 5CUDA 5E9YA 4LYSA 3UW9A 4YYDA 5COIA 5ENHA 5EWWA 4YY6A 5L96A 5DW2A 3MXFA 5LVRA 4CUSA 5BT3A 3UVYA 5ETDA 4KV1A 4N4IA 4YYGA 4PKLA 5I7XA 4HXMA 4YYMA 2F6NA 5KTXA 4GPJA 4UYFA 5L98A 4QY4A 3K2JA 5I7YA 4BJXA 5KTWA 5F25A 5KHMA 2E3KA 4WIVA 5A5OA 4UYGA 3MQMA 5FE2A 5E7DA 5II2A 2N9GA 4N4HA 3U5PA 4NRBA 4YH3A 2I7KA 4PCEA 5LUUA 4LYIA 4O7CA 5L97A 5L99A 5FE5A 4LR6A 4PTBA 4Q0OA 5H85A 4BW2A 5DY7A 4YYJA 4CFKA 4UYHA 4QSUA 5DKDA 4QSSA 2DVVA 2YDWA 4YC9A 5HM0A 5TB6A 4MR5A 4NYVA 4BW4A 3O36A 2RNYA 3NXBA 5HQ5A 4IR5A 3LQJA 3HMFA 4IR4A 5CP5A 5F2PA 5FFWA 5D26A 5EWHA 3TLPA 5ENIA 5CY9A 4UYEA 4BW3A 3QZTA 5FB1A 5E9VA 4O7FA 4HXNA 5FE9A 4HBWA 3SVGA 5HFQA 4DONA 2OUOA 4A9LA 4LDFA 5D3NA 5ACYA 5LVQA 5HCLA 4QZSA 5E74A 2WP1A 4TZ2A 4O72A 4XUBA 4UITA 5F3AA 5D3JA 5DKHA 5HJCA 4LC2A 4NS5A 5A7CA 5HLSA 3O34A 4Q0NA 3S92A 4UIUA 2YYNA 4YH4A 4KV4A 4CUPA 5FFYA 5A85A 5K29A 5CRMA 4A9NA 4A9FA 2H60A 3D7CA 5F63A 4YBSA 3JVJA 4Z1SA 5CUBA 5I80A 5IGNA 3RCWA 4O77A 3FKMX 4O75A 5EK9A 5II1A 5E9IA 4KCXA 2F6JA 5DYUA 5HFRA 5BT4A 4Y03A 5EVAA 4QC1A 4TYLA 5CTLA 5A5PA 5EPBA 5KTUA 4YABA 5IGLA 5F36A 1X0JA 5J0DA 4NR4A 3U5MA 5DLZA 4C66A 5CPEA 2L5EA 5CUCA 2WP2A 5CQ8A 5DX4A 3UV2A 5F62A 3LQIA 5F1HA 3JVLA 2RNWA 5DBMA 5EWCA 3LQHA 5I1QA 5EV9A 4N4GA 4FLPA 4YAXA 4Z1QA 3QZSA 5CUAA 5D3RA 5FE8A 2YEKA 4N4FA 4A9KA 5D3SA 5FE3A 3SVFA 4Z6HA 4TS8A 5ETBA 5A5NA 5ENGA 4A9OA 4QR4A 2RFJA 5EP7A 5FE6A 4NR5A 5JI8A 4ZQLA 4TT2A 5A5QA 3MB3A 1EQFA 3O35A 5CQAA 1ZS5A 3SVHA 3P5OA 5KO4A 5LKXA 5E3GA 4ZW1A 5HELA 4OUFA 4RVRA 5CQ7A 4YBMA 5FH6A 4UIWA 2R10A 3IU5A 5CZGA 4MR3A 5AMEA 5F1LA 4LZRA 5EGUA 4HXSA 4HXPA 4MENA 4BHWA 4IR3A 5D3PA 4YYHA 2R0SA 2OO1A 3DAIA 5HEMA 4QSTA 3UV4A 4IORA 5D3HA 4A9EA 5EPRA 4Z6IA 4NUDA 4YBTA 5DYCA 4CUTA 5CRZA 4Z93A 2YQDA 2DVSA 5IG6A 5A5SA 4WHUA 3GG3A 5F5ZA 2RS9B 4X2IA 5FFVA 3Q2EA 5CQ3A 4OGJA 2DVQA 5KU3A 5CQ5A 5FH7A 4TU4A 2YELA 3HMEA 5IIDA 2DATA 4ZC9A 3U5LA 3U5NA 5L8TA 5IGMA 4MR6A 4F3IA 5FE4A 5E73A 5HQ7A 2E7NA 3DWYA 3ONIA 4J3IA 4NRCA 5LJ0A 4NR6A 1N72A 5EWVA 2NXBA 5CU8A 3ZYUA 5AD2A 5E9LA 4CL9A 4QEUA 4A9JA 5I89A 4OGIA 5EM3A 5EA1A 4NR9A 4HXLA 4NR7A 5DKCA 4TQNA 3JVMA 5D3LA 4O70A 4CUQA 5F61A 4J0SA 5D25A 4HBXA 5HRXA 2LSPB 4MR4A 5FG6A 4ALGA 4ALHA 4MEOA 4UIYA 4XY8A 5E9MA 5E3DA 5ENEA 5D7XA 4QSXA 5I88A 4QR3A 5E9KA 5FE0A 4TT4A 5DW1A 2RO1A 4WHWA 3P1CA 5FG4A 3UVXA 5LJ1A 2L85A 5LJ2A 2KTBB 5DFBA 4J0RA 3UVWA 4CFLA 3UV5A 3QZVA 3HMHA 1JM4B 3LXJA 1WUMA 3U5KA 3MUKA 4QSVA 5DYAA 4O78A 3MULA 5ENJA 4QYLA 5HRVA 5CQ6A 4A9MA 5A82A 5FDZA 4QSPA 4UYFB 5DFCA 4QEVA 4E96A 5FB0A 5CUGA 4BW1A 4QSWA 3MB4A 4O7AA 3P1DA 2MJVB 4NR8A 5D3TA 4CURA 5HQ6A 5I29A 4LZ2A 4PS5A 5CGPA 5DYXA 5C85A 5I40A 5EISA 3G0JA 2I8NA 5F60A 5FE1A 5C4QA 4MEQA 4QR5A 4QYDA 4YYKA 3S91A 5CQTA 4HBYA 4UYDA 4YYIA 4PCIA 5I86A 4A9IA 5EICA 4XUAA 5IGKA 4J1PA 4O7BA 4O7EA 2R0VA 4QEWA 4HXKA 5FH8A 3G0LA 4O74A 4TZ8A 5A81A 4O71A 5ENBA 4LRGA 4NUEA 4QSRA 2RI7A 4MEPA 4NUCA 3P1FA 5I83A 5E0RA 4QUUA 2DVRA 4HXRA 4LYWA 2YW5A 5LKTA 5EU1A 5C7NA 4CUUA 5EQ1A 2DWWA 4YATA 4AKNA 4TT6A 3UVDA 2RNXA 5CQ4A 5D24A 1F68A 5CS8A 3IU6A 4YK0A 4NQMA 5FG5A 4YADA 4YY4A 5EI4A 2L84A 5EPSA 4QSQA 5AD3A 4NRAA 2E7OA 5JWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CLBA 3O33A 4IR6A 5A83A 2FSAA 5FE7A 3VKGA 4LZSA 3P1EA 5H1UA 4YYNA 5G4RA 1JSPB 5ENFA 5H1VA 4XY9A 2GRCA 5DFDA 5CFWA 4N3WA 3U5OA 3LJWA 4TTEA 4TU6A 5CUEA 5FBXA 5L8UA 4HXOA 3JVKA 3I3JA 4PY6A 4QBMA 3Q2FA 5C8GA 5LKUA 4UIXA 2D9EA 4O76A 4QB3A 4NYWA 5EWDA 5AMFA 2R0YA 4A9HA 4NYXA 4NQNA 5C87A 4QC3A 5D0CA 5ENCA 5DLXA 4NXJA 2DKWA 4IOQA 4XYAA 4HBVA 2G4AA 5IBNA 4IOOA 5H1TA 4QNSA 5LKZA 3O37A 5BT5A 4UIZA 5TCMA 1E6IA 3AQAA 3U5JA 5A5RA 4QUTA 3AADA 5G4SA 5HENA 2D82A 5C89A 4C67A 4UIVA 2OSSA 2YEMA 5HRWA 1WUGA 5CUDA 5E9YA 4LYSA 3UW9A 4YYDA 5COIA 5ENHA 5EWWA 4YY6A 5L96A 5DW2A 3MXFA 5LVRA 4CUSA 5BT3A 3UVYA 5ETDA 4KV1A 4N4IA 4YYGA 4PKLA 5I7XA 4HXMA 4YYMA 2F6NA 5KTXA 4GPJA 4UYFA 5L98A 4QY4A 3K2JA 5I7YA 4BJXA 5KTWA 5F25A 5KHMA 2E3KA 4WIVA 5A5OA 4UYGA 3MQMA 4AKIA 5FE2A 5E7DA 5II2A 2N9GA 4N4HA 3U5PA 4NRBA 4YH3A 2I7KA 4PCEA 5LUUA 4LYIA 4O7CA 5L97A 5L99A 5FE5A 4LR6A 4PTBA 4Q0OA 5H85A 4BW2A 5DY7A 4YYJA 4CFKA 4UYHA 4QSUA 5DKDA 4QSSA 2DVVA 2YDWA 4YC9A 5HM0A 5TB6A 4MR5A 4NYVA 4BW4A 3O36A 2RNYA 3NXBA 5HQ5A 3VKHA 4IR5A 3LQJA 3HMFA 4IR4A 5CP5A 5F2PA 5FFWA 5D26A 5EWHA 3TLPA 5ENIA 5CY9A 4UYEA 4BW3A 3QZTA 5FB1A 5E9VA 4O7FA 4HXNA 5FE9A 4HBWA 3SVGA 5HFQA 4DONA 2OUOA 4A9LA 4LDFA 5D3NA 5ACYA 5LVQA 5HCLA 4QZSA 5E74A 2WP1A 4TZ2A 4O72A 4XUBA 4UITA 5F3AA 5D3JA 5DKHA 5HJCA 4LC2A 4NS5A 5A7CA 5HLSA 3O34A 4Q0NA 3S92A 4UIUA 2YYNA 4YH4A 4KV4A 4CUPA 5FFYA 5A85A 5K29A 5CRMA 4A9NA 4A9FA 2H60A 3D7CA 5F63A 4YBSA 3JVJA 4Z1SA 5CUBA 5I80A 5IGNA 3RCWA 4O77A 3FKMX 4O75A 5EK9A 5II1A 5E9IA 4KCXA 2F6JA 5DYUA 5HFRA 5BT4A 4Y03A 5EVAA 4QC1A 4TYLA 5CTLA 5A5PA 5EPBA 5KTUA 4YABA 5IGLA 5F36A 1X0JA 5J0DA 4NR4A 3U5MA 5DLZA 3D1DA 5CPEA 2L5EA 4C66A 5CUCA 2WP2A 5CQ8A 5DX4A 3UV2A 5F62A 3LQIA 5F1HA 2RNWA 3JVLA 5DBMA 5EWCA 3LQHA 5I1QA 5EV9A 4N4GA 4FLPA 4YAXA 4Z1QA 3QZSA 5CUAA 5D3RA 5FE8A 2YEKA 4N4FA 4A9KA 5D3SA 5FE3A 3SVFA 4Z6HA 4TS8A 5ETBA 5A5NA 5ENGA 4A9OA 4QR4A 2RFJA 5EP7A 5FE6A 4NR5A 5JI8A 4ZQLA 4TT2A 5A5QA 3MB3A 1EQFA 3O35A 5CQAA 1ZS5A 3SVHA 3P5OA 5KO4A 5LKXA 5E3GA 4ZW1A 5HELA 4OUFA 4RVRA 5CQ7A 4YBMA 5FH6A 4UIWA 2R10A 3IU5A 5CZGA 4MR3A 5AMEA 5F1LA 4LZRA 5EGUA 4HXSA 4HXPA 4MENA 4BHWA 4IR3A 5D3PA 4YYHA 2R0SA 2OO1A 3DAIA 5HEMA 4QSTA 3UV4A 4IORA 5D3HA 4A9EA 3D1BA 5EPRA 4Z6IA 4NUDA 4YBTA 5DYCA 4CUTA 5CRZA 4Z93A 2YQDA 2DVSA 5IG6A 5A5SA 4WHUA 3GG3A 5F5ZA 2RS9B 4X2IA 5FFVA 3Q2EA 5CQ3A 4OGJA 2DVQA 5KU3A 5CQ5A 5FH7A 1ZKRA 4TU4A 2YELA 3HMEA 5IIDA 2DATA 4ZC9A 3U5LA 2EJNA 3U5NA 5L8TA 5IGMA 4MR6A 4F3IA 5FE4A 5E73A 5HQ7A 2E7NA 3DWYA 3ONIA 4J3IA 4NRCA 5LJ0A 4NR6A 1N72A 5EWVA 2NXBA 5CU8A 3ZYUA 5AD2A 5E9LA 4CL9A 4QEUA 4A9JA 5I89A 4OGIA 5EM3A 5EA1A 4NR9A 4HXLA 4NR7A 5DKCA 4TQNA 3JVMA 5D3LA 4O70A 4CUQA 5F61A 4J0SA 1PUOA 5D25A 4HBXA 5HRXA 2LSPB 4MR4A 5FG6A 4ALGA 4ALHA 4MEOA 4UIYA 4XY8A 5E9MA 5E3DA 5ENEA 5D7XA 4QSXA 5I88A 4QR3A 5E9KA 5FE0A 4TT4A 5DW1A 2RO1A 4WHWA 3P1CA 5FG4A 3UVXA 5LJ1A 2L85A 5LJ2A 2KTBB 5DFBA 4J0RA 3UVWA 4CFLA 3UV5A 3QZVA 3HMHA 1JM4B 3LXJA 1WUMA 3U5KA 3MUKA 4QSVA 5DYAA 3ERRA 4O78A 3MULA 5ENJA 4QYLA 5HRVA 5CQ6A 4A9MA 5A82A 5FDZA 4QSPA 4UYFB 5DFCA 4QEVA 4E96A 5FB0A 5CUGA 4BW1A 4QSWA 3MB4A 4O7AA 3P1DA 2MJVB 4AKHA 4NR8A 5D3TA 4CURA 5HQ6A 5I29A 4LZ2A 4PS5A 5CGPA 5DYXA 5C85A 5I40A 5EISA 3G0JA 2I8NA 5F60A 5FE1A 5C4QA 4MEQA 4QR5A 4QYDA 4YYKA 3S91A 5CQTA 4HBYA 4UYDA 4YYIA 4PCIA 5I86A 4A9IA 5EICA 4XUAA 5IGKA 4J1PA 4O7BA 4O7EA 4AI6A 2R0VA 4QEWA 4HXKA 5FH8A 3G0LA 4O74A 4TZ8A 5A81A 4O71A 5ENBA 4LRGA 4AKGA 4NUEA 4QSRA 2RI7A 4MEPA 4NUCA 3P1FA 5I83A 5E0RA 4QUUA 2DVRA 4HXRA 4LYWA 2YW5A 5LKTA 5EU1A 5C7NA 4CUUA 5EQ1A 2DWWA 4YATA 4AKNA 4TT6A 3UVDA 2RNXA 5CQ4A 5D24A 1F68A 5CS8A 3IU6A 4YK0A 4NQMA 5FG5A 4YADA 4YY4A 5EI4A 2L84A 5EPSA 4QSQA 5AD3A 4NRAA 2E7OA 5JWMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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