5AD2A

Bivalent binding to bet bromodomains
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Potent and Selective Bivalent Inhibitors of Bet Bromodomains
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ad2A01
4ZQLA 5DY7A 3O34A 4HBVA 4IOQA 5FH8A 5DX4A 5EU1A 5HQ7A 3ONIA 4HXOA 4YATA 5F2PA 1X0JA 2I7KA 4OGJA 4ALGA 5G4RA 4YY4A 5F1HA 5FG5A 5I80A 5A82A 3SVGA 4RVRA 4QSPA 2RNYA 4O7FA 5C85A 5D24A 2YELA 3U5JA 5BT3A 5EPSA 3S92A 4BW2A 4BW1A 5C8GA 4LYSA 5IGMA 5FB1A 2NXBA 5DKCA 4QR3A 4XUBA 4YBSA 4IR4A 5D3SA 4MR6A 4UYFB 5FE4A 3MXFA 4J0SA 4MEQA 1ZS5A 4N4FA 3UVXA 2OO1A 2E7NA 4J0RA 5F5ZA 5FBXA 5DFCA 3UV2A 5EI4A 4NRBA 4N4GA 5FFVA 5LKTA 4A9IA 2KTBB 3SVHA 4YYDA 5HFRA 4IR3A 4KV1A 5ENJA 4CL9A 5CQ6A 4Z6IA 5EWVA 5I7YA 4TZ8A 5CU8A 5DLXA 3Q2EA 3AQAA 4PKLA 4Z93A 5CY9A 2D9EA 5I1QA 5CRZA 5EPBA 3UVDA 5EISA 4UYGA 5DKDA 5L96A 5I88A 5F61A 5I83A 5AD2A 3LXJA 2YQDA 4YH4A 5TCMA 3P5OA 4XYAA 3G0JA 5HFQA 5CQ5A 5CP5A 4O78A 5A5RA 5H1UA 4NR7A 4PS5A 4BW4A 4O7AA 5FE0A 3LQIA 3GG3A 1JM4B 4QYLA 5L99A 4YYNA 5FE6A 4TT6A 4CUUA 5FE9A 4F3IA 4QEUA 4QEVA 5A81A 5H1TA 3JVLA 5EQ1A 5A7CA 4PCEA 4O72A 4LRGA 4UIZA 5C89A 4QR4A 5FE1A 3I3JA 4UIVA 5ENCA 2DVRA 4TT4A 4NR9A 3O37A 4LR6A 5ENIA 3S91A 4QZSA 5CUGA 4NRAA 3O36A 4CLBA 5CQ4A 4TS8A 5KO4A 4WIVA 4O75A 3UW9A 5CQAA 4DONA 4YK0A 4YYIA 5CS8A 5TB6A 4QR5A 2RNWA 4HXRA 5G4SA 4YBMA 4PCIA 4UYHA 2DKWA 4TU4A 4YBTA 5EP7A 5IGLA 5F63A 2L85A 5HRXA 4NUCA 5D3NA 3MQMA 4A9OA 5ENHA 4QUUA 3MB3A 3ZYUA 4YYMA 4PY6A 4NR4A 4N4HA 5IBNA 5FH7A 4MEOA 5D26A 4LZRA 4NR8A 4QSSA 3O35A 4QSVA 4YABA 4TYLA 4TZ2A 2YW5A 5JWMA 2YYNA 2RO1A 4LYIA 4QC1A 4TTEA 5II1A 4AKNA 4YC9A 1WUGA 5HELA 4YYJA 4GPJA 3P1CA 5HQ5A 5E9VA 2E7OA 5FE3A 5LKXA 2R0VA 3LJWA 5C7NA 4NRCA 2FSAA 5AMEA 4Z6HA 4O7EA 4HXLA 2RFJA 4LZSA 5CUDA 5ETDA 3RCWA 4QB3A 3JVJA 2YEMA 1WUMA 5F3AA 4HBYA 3MB4A 5C4QA 4Z1QA 5DW1A 4UIUA 2D82A 5EV9A 4BHWA 5EWCA 4YH3A 5HRVA 5HQ6A 3JVMA 1N72A 4QYDA 5CGPA 3Q2FA 5ENGA 2OSSA 4LYWA 4YYHA 5D25A 2L5EA 4WHWA 5FG6A 5CZGA 5CRMA 2I8NA 5D3LA 4A9MA 2RNXA 5LVRA 4IR5A 5CQTA 4UIYA 5D3HA 4BW3A 4HBXA 4HXPA 5ENBA 4CFLA 3D7CA 4O77A 5HM0A 4N3WA 5LUUA 5A5QA 5CQ3A 4NUDA 5AMFA 3DAIA 5CFWA 5E0RA 3MULA 3O33A 5FB0A 4NQNA 5A5NA 5EPRA 4TT2A 5EK9A 3G0LA 4XY9A 3QZTA 5LKUA 3SVFA 3LQJA 1JSPB 4QC3A 5KTWA 4YY6A 4UYFA 4UIXA 5A5SA 4LC2A 5CQ7A 4Z1SA 5H1VA 4YAXA 5H85A 5KTUA 5KTXA 3UV5A 5DBMA 4LZ2A 5DKHA 4HXKA 5FE2A 4O70A 4IOOA 3U5LA 3UVYA 1EQFA 4Q0NA 5J0DA 5IIDA 5COIA 5EWHA 5E9IA 4XUAA 5ENEA 4QNSA 2WP1A 3HMEA 4TU6A 5I29A 1E6IA 5EA1A 5L97A 2F6JA 5LJ1A 2R0YA 3JVKA 5F1LA 2F6NA 4NR5A 4C67A 2RS9B 3FKMX 4OGIA 4UYEA 5CUEA 4A9JA 3K2JA 5DW2A 5FE5A 5HENA 4YADA 3U5KA 4NS5A 5ENFA 4HXNA 4J3IA 4KCXA 4XY8A 5EWDA 5ACYA 5E74A 2YDWA 4UITA 2DVVA 3U5OA 4YYGA 4FLPA 4QSTA 4QUTA 4OUFA 5EVAA 5CQ8A 4QSQA 5I7XA 5F25A 5FG4A 4CFKA 5EGUA 3U5NA 5DYCA 2N9GA 5D7XA 4NUEA 5LVQA 5C87A 2YEKA 4CURA 5FH6A 5A5OA 5E9KA 4CUQA 4HXSA 4UIWA 2DATA 5EWWA 4YYKA 5DFBA 5II2A 5AD3A 5IG6A 3HMFA 5L8UA 4X2IA 4Y03A 5CUCA 5DFDA 2E3KA 3P1DA 3U5PA 5FDZA 5HJCA 3NXBA 5E9MA 5HEMA 5E9YA 5DYAA 3UVWA 3P1FA 5FE7A 4O74A 4HBWA 2OUOA 4NYVA 5IGNA 5KHMA 5BT4A 5E73A 2RI7A 5EICA 3DWYA 4QSRA 5I86A 3IU5A 2DWWA 3P1EA 4O71A 4ZW1A 5BT5A 4ZC9A 4J1PA 4CUTA 5A85A 5L8TA 5DYUA 5I40A 5KU3A 4N4IA 2GRCA 4A9NA 2WP2A 5E3GA 4MENA 5HCLA 5LJ0A 5E9LA 4NXJA 3IU6A 5D3PA 5HRWA 4MEPA 3QZSA 4MR3A 5F62A 5D3RA 5D3JA 5DLZA 3HMHA 5D3TA 4ALHA 5JI8A 5F60A 5HLSA 2R10A 3AADA 2L84A 4NYXA 3QZVA 4A9HA 2LSPB 4CUSA 4QEWA 5E7DA 4QBMA 2H60A 4O7CA 5E3DA 4TQNA 4QSUA 4MR5A 2DVSA 4PTBA 5CUAA 5A83A 5CTLA 5LKZA 1F68A 4Q0OA 4QSXA 5DYXA 4LDFA 4A9KA 5CUBA 4A9EA 4A9FA 4HXMA 2MJVB 4BJXA 3U5MA 2G4AA 5LJ2A 5FE8A 5F36A 2R0SA 4NQMA 5D0CA 5IGKA 4A9LA 4IR6A 4O7BA 4CUPA 5FFWA 5ETBA 5EM3A 4NYWA 3TLPA 4UYDA 4C66A 5I89A 4O76A 4WHUA 5FFYA 4NR6A 5K29A 4E96A 4QSWA 5CPEA 4IORA 5L98A 3LQHA 4MR4A 4QY4A 3MUKA 2DVQA 4KV4A 5A5PA 3UV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZQLA 5DY7A 3O34A 4HBVA 4IOQA 5FH8A 5DX4A 5EU1A 5HQ7A 3ONIA 4HXOA 4YATA 5F2PA 1X0JA 2I7KA 4OGJA 4ALGA 5G4RA 4YY4A 5F1HA 5FG5A 5I80A 5A82A 3SVGA 4RVRA 4QSPA 2RNYA 4O7FA 5C85A 5D24A 2YELA 3U5JA 5BT3A 5EPSA 3S92A 4BW2A 4BW1A 5C8GA 1ZKRA 4LYSA 5IGMA 5FB1A 2NXBA 5DKCA 4QR3A 4XUBA 4YBSA 4IR4A 5D3SA 4MR6A 4UYFB 5FE4A 3MXFA 4J0SA 4MEQA 1ZS5A 4N4FA 3UVXA 2OO1A 2E7NA 4J0RA 5F5ZA 5FBXA 5DFCA 3UV2A 5EI4A 4NRBA 4N4GA 5FFVA 5LKTA 4A9IA 2KTBB 3SVHA 4YYDA 5HFRA 4IR3A 4KV1A 5ENJA 4CL9A 5CQ6A 4Z6IA 5EWVA 5I7YA 4TZ8A 5CU8A 5DLXA 3Q2EA 3AQAA 4PKLA 4Z93A 5CY9A 2D9EA 5I1QA 5CRZA 5EPBA 3UVDA 5EISA 4UYGA 5DKDA 5L96A 5I88A 5F61A 5I83A 5AD2A 3LXJA 2YQDA 4YH4A 5TCMA 3P5OA 4XYAA 3G0JA 5HFQA 5CQ5A 5CP5A 4O78A 5A5RA 2EJNA 5H1UA 4NR7A 4PS5A 4BW4A 4O7AA 5FE0A 3LQIA 3GG3A 1JM4B 4QYLA 5L99A 4YYNA 5FE6A 4TT6A 4CUUA 5FE9A 4F3IA 4QEUA 4QEVA 5A81A 5H1TA 3JVLA 5EQ1A 5A7CA 4PCEA 4O72A 4LRGA 4UIZA 5C89A 4QR4A 5FE1A 3I3JA 4UIVA 5ENCA 2DVRA 4TT4A 4NR9A 3O37A 4LR6A 5ENIA 3S91A 4QZSA 5CUGA 4NRAA 3O36A 4CLBA 5CQ4A 4TS8A 5KO4A 4WIVA 4O75A 3UW9A 5CQAA 4DONA 4YK0A 4YYIA 5CS8A 5TB6A 4QR5A 2RNWA 4HXRA 5G4SA 4YBMA 4PCIA 4UYHA 2DKWA 4TU4A 4YBTA 5EP7A 5IGLA 5F63A 2L85A 3D1BA 5HRXA 4NUCA 5D3NA 3MQMA 4A9OA 5ENHA 4QUUA 3MB3A 3ZYUA 4YYMA 4PY6A 4NR4A 4N4HA 5IBNA 5FH7A 4MEOA 5D26A 4LZRA 4NR8A 4QSSA 3O35A 4QSVA 4YABA 4TYLA 4TZ2A 2YW5A 5JWMA 2YYNA 2RO1A 4LYIA 4QC1A 4TTEA 5II1A 4AKNA 4YC9A 1WUGA 5HELA 4YYJA 4GPJA 3P1CA 5HQ5A 5E9VA 2E7OA 5FE3A 5LKXA 2R0VA 3LJWA 5C7NA 4NRCA 2FSAA 5AMEA 4Z6HA 4O7EA 4HXLA 2RFJA 4LZSA 5CUDA 5ETDA 3RCWA 4QB3A 3JVJA 2YEMA 1WUMA 5F3AA 4HBYA 3MB4A 5C4QA 4Z1QA 5DW1A 4UIUA 2D82A 5EV9A 4BHWA 5EWCA 4YH3A 5HRVA 5HQ6A 3JVMA 1N72A 4QYDA 5CGPA 3Q2FA 5ENGA 2OSSA 4LYWA 4YYHA 5D25A 2L5EA 4WHWA 5FG6A 5CZGA 5CRMA 4AKHA 2I8NA 5D3LA 4A9MA 2RNXA 5LVRA 4IR5A 5CQTA 4UIYA 5D3HA 4BW3A 4HBXA 4HXPA 5ENBA 4CFLA 3D7CA 4O77A 5HM0A 4N3WA 5LUUA 5A5QA 5CQ3A 4NUDA 5AMFA 3DAIA 5CFWA 5E0RA 3MULA 3O33A 5FB0A 4NQNA 5A5NA 5EPRA 4TT2A 5EK9A 3G0LA 4XY9A 3QZTA 5LKUA 3SVFA 3LQJA 1JSPB 4QC3A 5KTWA 4YY6A 4UYFA 4AKGA 4UIXA 5A5SA 4LC2A 5CQ7A 4Z1SA 5H1VA 4YAXA 5H85A 5KTUA 5KTXA 3UV5A 5DBMA 4LZ2A 5DKHA 4HXKA 5FE2A 4O70A 4IOOA 3U5LA 3UVYA 1EQFA 4Q0NA 5J0DA 5IIDA 4AI6A 5COIA 5EWHA 5E9IA 4XUAA 5ENEA 4AKIA 4QNSA 2WP1A 3HMEA 4TU6A 5I29A 1E6IA 5EA1A 5L97A 2F6JA 5LJ1A 2R0YA 3JVKA 5F1LA 2F6NA 4NR5A 4C67A 2RS9B 3FKMX 4OGIA 4UYEA 5CUEA 4A9JA 3K2JA 5DW2A 5FE5A 5HENA 4YADA 3U5KA 4NS5A 5ENFA 4HXNA 4J3IA 4KCXA 4XY8A 5EWDA 5ACYA 5E74A 2YDWA 4UITA 2DVVA 3U5OA 4YYGA 4FLPA 4QSTA 4QUTA 4OUFA 5EVAA 5CQ8A 4QSQA 5I7XA 5F25A 5FG4A 4CFKA 5EGUA 3U5NA 5DYCA 2N9GA 5D7XA 4NUEA 5LVQA 5C87A 2YEKA 4CURA 1PUOA 5FH6A 5A5OA 5E9KA 4CUQA 4HXSA 4UIWA 2DATA 5EWWA 4YYKA 5DFBA 5II2A 5AD3A 5IG6A 3HMFA 5L8UA 4X2IA 4Y03A 5CUCA 5DFDA 2E3KA 3P1DA 3U5PA 5FDZA 5HJCA 3NXBA 5E9MA 5HEMA 5E9YA 5DYAA 3UVWA 3P1FA 5FE7A 3ERRA 4O74A 4HBWA 2OUOA 4NYVA 5IGNA 5KHMA 5BT4A 5E73A 2RI7A 5EICA 3DWYA 4QSRA 5I86A 3D1DA 3VKGA 2DWWA 3IU5A 3P1EA 4O71A 4ZW1A 5BT5A 4ZC9A 4J1PA 4CUTA 5A85A 5L8TA 5DYUA 5I40A 5KU3A 4N4IA 2GRCA 4A9NA 2WP2A 5E3GA 4MENA 5HCLA 5LJ0A 5E9LA 4NXJA 3IU6A 5D3PA 5HRWA 4MEPA 3QZSA 4MR3A 5F62A 5D3RA 5D3JA 5DLZA 3HMHA 5D3TA 4ALHA 5JI8A 5F60A 5HLSA 2R10A 3AADA 2L84A 4NYXA 3QZVA 4A9HA 2LSPB 4CUSA 4QEWA 5E7DA 4QBMA 2H60A 4O7CA 5E3DA 4TQNA 4QSUA 4MR5A 2DVSA 4PTBA 5CUAA 5A83A 5CTLA 5LKZA 1F68A 4Q0OA 4QSXA 5DYXA 4LDFA 4A9KA 5CUBA 4A9EA 4A9FA 4HXMA 2MJVB 4BJXA 3U5MA 2G4AA 5LJ2A 5FE8A 5F36A 2R0SA 4NQMA 5D0CA 5IGKA 4A9LA 4IR6A 4O7BA 4CUPA 5FFWA 5ETBA 5EM3A 4NYWA 3TLPA 4UYDA 4C66A 5I89A 4O76A 4WHUA 5FFYA 4NR6A 5K29A 4E96A 4QSWA 5CPEA 4IORA 5L98A 3LQHA 4MR4A 4QY4A 3MUKA 2DVQA 3VKHA 4KV4A 5A5PA 3UV4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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