4TU4A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(phenylsulfonyl)amino]benzoicacid
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Gene regulation
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tu4A00
5F60A 3P1FA 3ONIA 5HRVA 1WUMA 4NYXA 5FH6A 5FE7A 5ETBA 4LRGA 2OO1A 4MEQA 5AMEA 4A9NA 3LQHA 4QC1A 5C85A 3IU6A 4QR5A 5CTLA 2RI7A 4Z6IA 3MB4A 2GRCA 4QSWA 5IG6A 5D3JA 5L8TA 4LYWA 5LVQA 5TCMA 4NR6A 5I1QA 2DATA 2RNYA 4PY6A 5FE2A 4PKLA 3O37A 2RS9B 1JSPB 5EICA 1ZS5A 3JVMA 3FKMX 5D25A 5LKXA 4NUEA 2DVSA 5D0CA 5A5SA 4A9KA 4N4FA 4A9EA 5DW2A 4C66A 5EWCA 5IGKA 4YATA 3O34A 4MEPA 5E9KA 4QSSA 2RNXA 5DYAA 5EWDA 4NR7A 5I89A 3MXFA 4QSTA 3UW9A 5F1HA 4O72A 5L96A 5ENCA 5A85A 5D3RA 4HBWA 4YH4A 3RCWA 3UV5A 4PS5A 5E0RA 4TT6A 4MR6A 4YYDA 4YYIA 4O75A 4KV1A 4QEUA 1WUGA 4KCXA 4O74A 2YEMA 4PTBA 5CQ4A 5EWWA 3HMFA 4LZRA 3D7CA 4QB3A 2KTBB 4TZ8A 4N4GA 3LQIA 2E3KA 4UYFB 5HFRA 5F62A 4CUQA 4QC3A 1X0JA 5L98A 5FH7A 3Q2FA 5H1TA 5A83A 1F68A 4Z6HA 5DLXA 5CQTA 4TYLA 5F1LA 2F6NA 5IIDA 2YQDA 5ENEA 2YELA 3I3JA 2NXBA 4HXRA 3QZVA 4DONA 3SVGA 4IR4A 5L99A 3U5MA 5D3TA 3JVKA 5CQ8A 3S92A 4HXMA 5EVAA 3U5PA 5F5ZA 5C4QA 4Z1QA 4WHUA 5HM0A 4Z1SA 2R0VA 5H1UA 5DKCA 5EWVA 3AQAA 4BW4A 5FDZA 5D3PA 4MR3A 2RO1A 2YEKA 5DYUA 5EI4A 3SVFA 3IU5A 4FLPA 5FE3A 5HLSA 4MENA 5DLZA 3JVJA 5JI8A 3UVWA 5FFYA 3UVXA 4HXPA 4NYVA 5FE1A 5CP5A 4QZSA 5I83A 4NRAA 4A9LA 5A7CA 5KTWA 5HFQA 2E7NA 4O70A 3UV2A 4CUTA 4YC9A 2LSPB 4F3IA 3MULA 5TB6A 5DX4A 2R0YA 5DFDA 2N9GA 2D82A 2L5EA 5FE4A 4NR9A 5CQ7A 3O35A 4TU4A 5FFVA 4ZQLA 3U5KA 5D24A 2DVQA 5ENGA 4HXOA 4YY6A 3JVLA 4CUSA 5FG5A 5LJ1A 4O7FA 4YYJA 5CQ6A 5CFWA 4LC2A 5ACYA 5EK9A 5LKZA 1N72A 4YBTA 4QEVA 2DVRA 5LKUA 5DFBA 5E7DA 4QSPA 5ENJA 4YH3A 4BW1A 5FE9A 5J0DA 2WP1A 5CQ5A 4Y03A 5D26A 4KV4A 4N4IA 4QUUA 3P5OA 4CUUA 5JWMA 5C89A 4BHWA 4O7AA 3GG3A 2RNWA 1E6IA 2OUOA 4UYFA 2R0SA 5HENA 4UYDA 5I7XA 4UIUA 4NR8A 5FG4A 5EM3A 5ETDA 2I7KA 5HQ7A 4UYGA 3S91A 5II1A 4IOOA 4YYKA 4YYGA 4GPJA 4QBMA 5CUBA 5FG6A 5L8UA 2YW5A 5CPEA 5DKHA 2L85A 3DAIA 5CU8A 4UIYA 5E74A 5EPBA 4E96A 4UYEA 5I86A 4YAXA 5A5RA 5L97A 4MR5A 4NS5A 3HMHA 3MB3A 5LJ0A 4YABA 4HBXA 2DVVA 5EISA 4BJXA 4HBVA 3SVHA 3LJWA 5CY9A 5ENHA 2OSSA 4UIVA 4Z93A 2FSAA 5CQ3A 4QY4A 4CURA 5KO4A 2E7OA 5DFCA 4UIXA 5HRWA 4LZSA 4QSXA 4TT4A 4HXLA 4XUAA 4QNSA 5HQ6A 3UVDA 5LKTA 4A9MA 4NRBA 4NYWA 4QSVA 5FB0A 4J3IA 5E3GA 4BW2A 4C67A 5D3SA 5HQ5A 2RFJA 5DBMA 5EQ1A 4O77A 3P1DA 5ENBA 5HCLA 3UV4A 1EQFA 5FFWA 5I29A 4CFKA 4YADA 2F6JA 2WP2A 5FE6A 4CUPA 4YBSA 4IR3A 5BT3A 4J0RA 3MQMA 5EGUA 5DW1A 5KTUA 2I8NA 3K2JA 4IR6A 4OGJA 5E9MA 4NRCA 3Q2EA 4YY4A 4ZW1A 3O36A 5CUCA 4TQNA 5DY7A 4NR4A 4CFLA 4J0SA 4OGIA 4LYSA 4HXKA 5EWHA 3TLPA 5AD3A 3U5JA 5FE8A 5EV9A 4MEOA 4BW3A 4HBYA 5E9YA 5C7NA 5ENIA 5C8GA 3LQJA 5F36A 5LVRA 4Q0NA 5HRXA 4TZ2A 5CQAA 4TU6A 4YYMA 5COIA 4NXJA 1JM4B 4QUTA 5F25A 4CLBA 5A5OA 5DKDA 5ENFA 4A9FA 5IGLA 4UYHA 5CUEA 5A5PA 4XUBA 3G0LA 5FH8A 4QSUA 5C87A 4PCEA 3P1CA 4XYAA 2YDWA 5FE0A 3U5NA 2DKWA 5EU1A 5CS8A 4LR6A 4HXNA 5G4SA 5H1VA 4ALGA 4YYNA 5A5QA 4Q0OA 5D3NA 4UITA 5DYCA 4ALHA 5FE5A 4QSRA 5DYXA 4QYDA 4A9JA 4A9HA 4TT2A 5F3AA 5HJCA 5AMFA 4HXSA 4PCIA 5E9IA 4N4HA 5K29A 4XY8A 4OUFA 4UIZA 5EP7A 4NUDA 5G4RA 3U5OA 5E9VA 4ZC9A 2YYNA 5CRMA 5FB1A 3DWYA 5A81A 5CRZA 3QZTA 2D9EA 4X2IA 4O71A 5KU3A 5CZGA 3LXJA 4RVRA 5F63A 3ZYUA 4O7BA 5E9LA 4QR4A 2DWWA 5EA1A 2R10A 4CL9A 4IR5A 5CUDA 4MR4A 5E73A 5BT4A 5KHMA 4YK0A 4WHWA 5EPSA 5IBNA 5D3LA 5I88A 5E3DA 4O76A 4TTEA 3QZSA 5I7YA 4A9OA 5I40A 3MUKA 4IOQA 5CGPA 5D7XA 4YBMA 3U5LA 5H85A 4J1PA 4O7CA 5IGNA 4YYHA 4QEWA 5HEMA 5LJ2A 4NQMA 2L84A 5CUGA 4A9IA 3AADA 5CUAA 3P1EA 3NXBA 5I80A 4LZ2A 5F61A 4IORA 5HELA 5A5NA 5A82A 4NUCA 4LYIA 4NR5A 5F2PA 3HMEA 5LUUA 5EPRA 5FBXA 2H60A 4UIWA 4XY9A 5D3HA 4QYLA 4N3WA 5II2A 2G4AA 5BT5A 4NQNA 5IGMA 4O78A 5KTXA 3O33A 4WIVA 3UVYA 3G0JA 4LDFA 4O7EA 5AD2A 2MJVB 4QR3A 4AKNA 4QSQA 4TS8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F60A 3P1FA 3ONIA 5HRVA 1WUMA 4NYXA 5FH6A 5FE7A 5ETBA 4LRGA 2OO1A 4MEQA 5AMEA 4A9NA 3LQHA 4QC1A 5C85A 3IU6A 4QR5A 5CTLA 2RI7A 4Z6IA 3MB4A 2GRCA 4QSWA 5IG6A 5D3JA 5L8TA 4LYWA 5LVQA 5TCMA 4NR6A 5I1QA 2DATA 2RNYA 4PY6A 5FE2A 4PKLA 3VKHA 3O37A 2RS9B 1JSPB 5EICA 4AKGA 1ZS5A 3JVMA 3FKMX 5D25A 5LKXA 4NUEA 2DVSA 5D0CA 5A5SA 4A9KA 4N4FA 4A9EA 5DW2A 4C66A 5EWCA 5IGKA 4YATA 3O34A 4MEPA 5E9KA 4QSSA 2RNXA 5DYAA 5EWDA 4NR7A 5I89A 3MXFA 4QSTA 3UW9A 5F1HA 4O72A 5L96A 5ENCA 5A85A 5D3RA 4HBWA 4YH4A 3RCWA 3UV5A 4PS5A 5E0RA 4TT6A 4MR6A 4YYDA 4YYIA 4O75A 4KV1A 4QEUA 1WUGA 4KCXA 4O74A 2YEMA 4PTBA 5CQ4A 5EWWA 3HMFA 4LZRA 3D7CA 4QB3A 2KTBB 4TZ8A 4N4GA 3LQIA 2E3KA 4UYFB 5HFRA 5F62A 1ZKRA 4CUQA 4QC3A 1X0JA 5L98A 5FH7A 3Q2FA 5H1TA 5A83A 1F68A 4Z6HA 5DLXA 3ERRA 5CQTA 4TYLA 5F1LA 2F6NA 5IIDA 2YQDA 5ENEA 2YELA 3I3JA 2NXBA 4HXRA 3QZVA 4DONA 3SVGA 4IR4A 5L99A 3U5MA 5D3TA 3JVKA 5CQ8A 3S92A 4HXMA 5EVAA 3U5PA 5F5ZA 5C4QA 4Z1QA 4WHUA 5HM0A 4Z1SA 2R0VA 5H1UA 5DKCA 5EWVA 3AQAA 4BW4A 5FDZA 5D3PA 4MR3A 2RO1A 2YEKA 5DYUA 5EI4A 3SVFA 3IU5A 4FLPA 5FE3A 5HLSA 4MENA 5DLZA 3JVJA 5JI8A 3UVWA 5FFYA 3UVXA 4HXPA 4NYVA 5FE1A 3VKGA 5CP5A 4QZSA 5I83A 4NRAA 4A9LA 5A7CA 5KTWA 5HFQA 2E7NA 4O70A 3UV2A 4CUTA 4YC9A 2LSPB 4F3IA 3MULA 5TB6A 5DX4A 2R0YA 5DFDA 2N9GA 2D82A 2L5EA 5FE4A 4NR9A 5CQ7A 3O35A 4TU4A 5FFVA 4ZQLA 3U5KA 5D24A 2DVQA 5ENGA 4HXOA 4YY6A 3JVLA 4CUSA 5FG5A 5LJ1A 4O7FA 4YYJA 5CQ6A 5CFWA 4LC2A 5ACYA 5EK9A 5LKZA 1N72A 4YBTA 4QEVA 2DVRA 5LKUA 5DFBA 5E7DA 4QSPA 5ENJA 4YH3A 4BW1A 5FE9A 5J0DA 2WP1A 5CQ5A 4Y03A 5D26A 4KV4A 4N4IA 4QUUA 3P5OA 4CUUA 5JWMA 5C89A 4BHWA 4O7AA 3GG3A 2RNWA 1E6IA 2OUOA 4UYFA 3D1BA 2R0SA 5HENA 4UYDA 5I7XA 4UIUA 4NR8A 5FG4A 5EM3A 5ETDA 2I7KA 5HQ7A 4UYGA 3S91A 5II1A 4IOOA 4YYKA 4YYGA 4GPJA 4QBMA 5CUBA 5FG6A 5L8UA 2YW5A 5CPEA 5DKHA 2L85A 3DAIA 5CU8A 4UIYA 5E74A 5EPBA 4E96A 4UYEA 5I86A 4YAXA 5A5RA 5L97A 4MR5A 4NS5A 3HMHA 3MB3A 5LJ0A 4YABA 4HBXA 2DVVA 5EISA 4BJXA 4HBVA 3SVHA 3LJWA 5CY9A 5ENHA 2OSSA 4UIVA 4Z93A 2FSAA 5CQ3A 4QY4A 4CURA 5KO4A 2E7OA 5DFCA 4UIXA 5HRWA 4LZSA 4QSXA 4TT4A 4HXLA 4XUAA 4QNSA 5HQ6A 3UVDA 5LKTA 4A9MA 4NRBA 4NYWA 4QSVA 5FB0A 4J3IA 5E3GA 4BW2A 4C67A 5D3SA 5HQ5A 2RFJA 5DBMA 5EQ1A 4O77A 3P1DA 5ENBA 5HCLA 3D1DA 3UV4A 1EQFA 5FFWA 5I29A 4CFKA 4YADA 2F6JA 2WP2A 5FE6A 4CUPA 4YBSA 4IR3A 5BT3A 4J0RA 3MQMA 4AKIA 5EGUA 5DW1A 5KTUA 2I8NA 3K2JA 4IR6A 4OGJA 5E9MA 4NRCA 3Q2EA 4YY4A 4ZW1A 3O36A 2EJNA 5CUCA 4TQNA 5DY7A 4NR4A 4CFLA 4J0SA 4OGIA 4LYSA 4HXKA 5EWHA 3TLPA 5AD3A 3U5JA 5FE8A 5EV9A 4MEOA 4BW3A 4HBYA 5E9YA 5C7NA 5ENIA 5C8GA 3LQJA 5F36A 5LVRA 4Q0NA 5HRXA 4TZ2A 5CQAA 4TU6A 4YYMA 5COIA 4NXJA 1JM4B 4QUTA 5F25A 4CLBA 5A5OA 5DKDA 5ENFA 4A9FA 5IGLA 4UYHA 5CUEA 5A5PA 4XUBA 3G0LA 5FH8A 4QSUA 5C87A 4PCEA 3P1CA 4XYAA 2YDWA 5FE0A 4AKHA 3U5NA 2DKWA 5EU1A 5CS8A 4LR6A 4HXNA 5G4SA 5H1VA 4ALGA 4YYNA 5A5QA 4Q0OA 5D3NA 4UITA 5DYCA 4ALHA 5FE5A 4QSRA 5DYXA 4QYDA 4A9JA 4A9HA 4TT2A 5F3AA 5HJCA 5AMFA 4HXSA 4PCIA 5E9IA 4N4HA 5K29A 4XY8A 4OUFA 4UIZA 5EP7A 4NUDA 5G4RA 3U5OA 5E9VA 4ZC9A 2YYNA 5CRMA 5FB1A 3DWYA 5A81A 5CRZA 3QZTA 2D9EA 4X2IA 4O71A 5KU3A 5CZGA 3LXJA 4RVRA 5F63A 3ZYUA 4O7BA 5E9LA 4QR4A 4AI6A 2DWWA 5EA1A 2R10A 4CL9A 4IR5A 5CUDA 4MR4A 5E73A 5BT4A 5KHMA 4YK0A 4WHWA 5EPSA 5IBNA 5D3LA 5I88A 5E3DA 4O76A 4TTEA 3QZSA 5I7YA 4A9OA 5I40A 3MUKA 4IOQA 5CGPA 5D7XA 4YBMA 3U5LA 5H85A 4J1PA 4O7CA 5IGNA 4YYHA 4QEWA 5HEMA 5LJ2A 4NQMA 2L84A 5CUGA 1PUOA 4A9IA 3AADA 5CUAA 3P1EA 3NXBA 5I80A 4LZ2A 5F61A 4IORA 5HELA 5A5NA 5A82A 4NUCA 4LYIA 4NR5A 5F2PA 3HMEA 5LUUA 5EPRA 5FBXA 2H60A 4UIWA 4XY9A 5D3HA 4QYLA 4N3WA 5II2A 2G4AA 5BT5A 4NQNA 5IGMA 4O78A 5KTXA 3O33A 4WIVA 3UVYA 3G0JA 4LDFA 4O7EA 5AD2A 2MJVB 4QR3A 4AKNA 4QSQA 4TS8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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