4TU4A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(phenylsulfonyl)amino]benzoicacid
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tu4A00
3O37A 4NUEA 5JWMA 5HCLA 5ENEA 5FB1A 5LVQA 4QEUA 3LQJA 2GRCA 4HXPA 5H1TA 5F63A 4UYFB 4Z6IA 3MUKA 3IU5A 4TZ8A 4A9JA 4YABA 5ENHA 4XUAA 5HEMA 5AMEA 4UIZA 4XYAA 3AQAA 5CQ3A 2E7NA 3AADA 5HQ5A 5CQAA 5COIA 4NRBA 5EP7A 4E96A 3U5MA 2D82A 5DFCA 5A5QA 3LQHA 4O75A 3MB4A 5D3RA 2E3KA 4J1PA 5I89A 5F3AA 3LXJA 4XY9A 5H1VA 5FFVA 4NYWA 2N9GA 5A81A 4O76A 5C87A 3U5PA 5HFQA 3QZSA 4UYGA 3FKMX 5DYAA 3MB3A 5FBXA 5I7XA 5EVAA 5KU3A 5DYUA 5CUAA 4AKNA 3P1DA 4QYLA 5DYXA 2DWWA 5D3NA 4UIYA 5D3TA 4KV4A 4J3IA 4NR9A 4F3IA 3P1EA 4MEPA 5AD2A 5I29A 2R0YA 3Q2EA 5A5NA 4O78A 4ZW1A 5ENBA 5F5ZA 4UIVA 2OSSA 3JVKA 5ACYA 5II1A 4YAXA 4A9IA 4UITA 4YATA 5EPBA 4QSTA 2R0SA 4QY4A 5FH8A 5CRMA 4UYDA 3SVGA 4Z1SA 4NUCA 4YBSA 5CRZA 3UVYA 5H1UA 5II2A 4MR6A 4QR4A 4ZC9A 4QYDA 4WHWA 3UW9A 5EM3A 5DKDA 3U5JA 2DKWA 2RNWA 5DY7A 4YK0A 1ZS5A 4FLPA 2YW5A 5BT4A 5FH6A 2RS9B 5CUBA 5CQ4A 4NR5A 4NS5A 1F68A 2L85A 5D24A 3U5OA 3HMFA 4KV1A 5KTWA 5FE3A 4MEQA 5ETBA 3S91A 5IIDA 3LQIA 2YQDA 5EWCA 4MR4A 4QSXA 4QEWA 4O7FA 4CFKA 5FE7A 5CQ7A 5I1QA 3LJWA 1JSPB 3HMEA 4QSPA 4NRAA 5H85A 4QR5A 4CFLA 4YBMA 5LKZA 3UV4A 3JVJA 2RI7A 5EWHA 4O77A 4CUPA 5FE6A 5LUUA 4QC3A 4O7BA 5EISA 5CUEA 2WP2A 5D3HA 5LKXA 5C4QA 4N3WA 5D3PA 4PY6A 3O34A 5FE4A 5I88A 4MEOA 4HXSA 5HM0A 5A83A 4IORA 4HBVA 4NR4A 5TB6A 2L84A 2RNXA 4QUUA 3O33A 5CQ8A 4Y03A 2F6JA 2KTBB 3QZVA 3UVXA 4A9NA 5I40A 1EQFA 5E0RA 4J0RA 3U5KA 5EK9A 4TQNA 4CUQA 4QBMA 5CQTA 4LZ2A 5CQ5A 5TCMA 5E3GA 5C89A 3P1CA 4UIUA 5F25A 5CP5A 3MQMA 5L98A 2YEMA 3QZTA 5DW1A 4YYDA 5FE1A 5F36A 5D3JA 4NQNA 4BW4A 4NYVA 5FFWA 4YBTA 3P5OA 2RNYA 5ENFA 4A9LA 5ENGA 5DKHA 4IOQA 5L8TA 4BJXA 5ENIA 4A9KA 2DVSA 4TT6A 5E9IA 4PS5A 5L96A 4UYEA 5DLZA 4HXLA 2RFJA 5E9MA 4YYNA 5KTXA 4IR4A 5CGPA 4NRCA 4LYWA 4PTBA 4A9OA 5DX4A 5EWDA 4YY6A 4N4HA 4Q0OA 5FB0A 4IR3A 4O72A 4O70A 4QSQA 2DATA 2D9EA 5EPSA 5CPEA 5FG4A 4O7AA 5F1HA 3D7CA 5E74A 5FFYA 5G4RA 4YYGA 2F6NA 4YYJA 2YELA 4UIWA 3DAIA 3JVMA 4IOOA 4HXRA 5EGUA 5E9YA 3I3JA 5DFBA 4QSSA 5I83A 4O71A 4YH3A 5EWVA 5AD3A 5CTLA 2YYNA 4MR3A 5A5SA 4CL9A 5F61A 5IBNA 5I7YA 4LZSA 4KCXA 3O36A 5C85A 2DVRA 5A5PA 4LC2A 5E9LA 4C66A 5J0DA 3U5LA 3UV2A 4HBWA 3DWYA 5CQ6A 5E7DA 4NYXA 4LYIA 4LRGA 4XUBA 2MJVB 3JVLA 5G4SA 4QB3A 5CY9A 4O74A 5DYCA 4RVRA 4BW3A 4ZQLA 4A9MA 4ALGA 4NXJA 5AMFA 5HELA 3UVDA 2L5EA 4YC9A 5A5OA 5BT3A 5FE9A 4UIXA 5HQ7A 5ENCA 5IGLA 4CURA 4HBXA 4A9FA 5HRXA 4NR8A 4WHUA 5DLXA 4LZRA 4LYSA 5I80A 2I8NA 5EPRA 5FE8A 2YEKA 2DVQA 4QSVA 3SVFA 4CUTA 3TLPA 2E7OA 4QSWA 4NR6A 5KO4A 5A85A 5DW2A 5IGMA 4TTEA 4Z93A 3S92A 4CUSA 4Q0NA 5D3LA 5IG6A 5L99A 4N4FA 4YYKA 5LJ2A 3HMHA 5LKUA 3NXBA 3RCWA 3G0JA 4HBYA 5F2PA 5CUDA 5IGKA 4QR3A 5DKCA 5I86A 3UV5A 2R10A 4TT4A 4YYHA 2G4AA 2DVVA 3UVWA 4PKLA 5FE5A 4YYMA 4IR5A 5CU8A 5HLSA 5EA1A 5D25A 4MENA 4QSUA 5CUCA 3ONIA 5KTUA 5CUGA 5EV9A 5D3SA 1WUGA 4NQMA 5ETDA 3MXFA 4PCEA 4XY8A 4YADA 5EWWA 4Z1QA 4J0SA 4TU6A 2H60A 4WIVA 4TU4A 3MULA 5E9KA 5HRVA 4A9EA 4HXMA 4N4GA 4YY4A 2OO1A 2R0VA 2WP1A 3Q2FA 4CUUA 4BW1A 5E73A 5FG6A 4UYFA 5FG5A 4A9HA 5FE2A 4N4IA 4OUFA 5D0CA 5L8UA 5DBMA 5F60A 5A7CA 5EQ1A 3GG3A 5CZGA 2NXBA 4QC1A 5E3DA 5HQ6A 4OGJA 4TT2A 2RO1A 2OUOA 4QZSA 5F62A 5K29A 5FDZA 5D7XA 5D26A 5FH7A 3G0LA 1WUMA 4LR6A 4HXKA 4GPJA 5CFWA 5JI8A 5LJ1A 1X0JA 4PCIA 5HJCA 4CLBA 5CS8A 5KHMA 5IGNA 5C8GA 3U5NA 4QNSA 4HXNA 4YH4A 4Z6HA 3O35A 4OGIA 4QSRA 5HFRA 5EICA 4X2IA 4DONA 5EI4A 4O7CA 3K2JA 3IU6A 4NR7A 4BHWA 2LSPB 5DFDA 4C67A 3SVHA 5A82A 5HENA 3ZYUA 5EU1A 4NUDA 4TZ2A 5FE0A 2I7KA 4LDFA 5LKTA 4IR6A 5ENJA 4BW2A 4QUTA 4ALHA 2YDWA 1JM4B 5A5RA 2FSAA 4HXOA 4TS8A 5L97A 4TYLA 5C7NA 5E9VA 4MR5A 1E6IA 5LJ0A 3P1FA 4UYHA 4YYIA 4O7EA 5F1LA 5HRWA 5BT5A 4QEVA 1N72A 5LVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O37A 4NUEA 5JWMA 5HCLA 5ENEA 5FB1A 5LVQA 4QEUA 3LQJA 2GRCA 4HXPA 5H1TA 5F63A 4UYFB 4Z6IA 3D1BA 3MUKA 3IU5A 4TZ8A 4A9JA 4YABA 5ENHA 4XUAA 5HEMA 5AMEA 4UIZA 4XYAA 3AQAA 5CQ3A 2E7NA 3AADA 5HQ5A 5CQAA 5COIA 4NRBA 5EP7A 4E96A 3U5MA 2D82A 5DFCA 5A5QA 3LQHA 4O75A 3MB4A 5D3RA 2E3KA 4J1PA 5I89A 5F3AA 3LXJA 4XY9A 5H1VA 5FFVA 4NYWA 2N9GA 5A81A 4O76A 5C87A 3U5PA 5HFQA 3QZSA 4UYGA 3FKMX 5DYAA 3MB3A 5FBXA 5I7XA 5EVAA 5KU3A 5DYUA 5CUAA 4AKNA 3P1DA 4QYLA 5DYXA 2DWWA 5D3NA 4AI6A 4UIYA 5D3TA 3D1DA 4KV4A 4J3IA 4NR9A 4F3IA 3P1EA 4MEPA 5AD2A 5I29A 2R0YA 3Q2EA 1PUOA 5A5NA 4O78A 4ZW1A 5ENBA 5F5ZA 4UIVA 2OSSA 3JVKA 5ACYA 5II1A 4YAXA 4A9IA 4UITA 4YATA 5EPBA 4QSTA 2R0SA 4QY4A 5FH8A 5CRMA 4UYDA 3SVGA 4Z1SA 4NUCA 4YBSA 5CRZA 3UVYA 5H1UA 5II2A 4MR6A 4QR4A 4ZC9A 4QYDA 4WHWA 3UW9A 5EM3A 5DKDA 3U5JA 2DKWA 2RNWA 5DY7A 4YK0A 1ZS5A 4FLPA 2YW5A 5BT4A 5FH6A 2RS9B 5CUBA 5CQ4A 4NR5A 4NS5A 1F68A 2L85A 5D24A 3U5OA 3HMFA 4KV1A 5KTWA 5FE3A 4MEQA 5ETBA 3S91A 5IIDA 3LQIA 2YQDA 5EWCA 4MR4A 4QSXA 4QEWA 4O7FA 4CFKA 5FE7A 5CQ7A 5I1QA 3LJWA 1JSPB 3HMEA 4QSPA 4NRAA 5H85A 4QR5A 4CFLA 4YBMA 5LKZA 3UV4A 3JVJA 2RI7A 5EWHA 4O77A 4CUPA 5FE6A 5LUUA 4QC3A 4O7BA 5EISA 5CUEA 2WP2A 5D3HA 5LKXA 5C4QA 4N3WA 5D3PA 4PY6A 3O34A 5FE4A 5I88A 4MEOA 4HXSA 5HM0A 5A83A 4IORA 4HBVA 4NR4A 5TB6A 2L84A 2RNXA 4QUUA 3O33A 5CQ8A 4Y03A 4AKIA 2F6JA 2KTBB 3QZVA 3UVXA 4A9NA 5I40A 1EQFA 5E0RA 4J0RA 3U5KA 5EK9A 4TQNA 4CUQA 4QBMA 5CQTA 4LZ2A 5CQ5A 5TCMA 5E3GA 5C89A 3P1CA 4UIUA 5F25A 5CP5A 3MQMA 5L98A 2YEMA 3QZTA 5DW1A 4YYDA 5FE1A 5F36A 5D3JA 4NQNA 4AKHA 4BW4A 4NYVA 5FFWA 4YBTA 3P5OA 3VKHA 2RNYA 5ENFA 4A9LA 5ENGA 5DKHA 4IOQA 5L8TA 4BJXA 5ENIA 4A9KA 2DVSA 4TT6A 5E9IA 2EJNA 4PS5A 5L96A 4UYEA 5DLZA 4HXLA 2RFJA 5E9MA 4YYNA 5KTXA 4IR4A 5CGPA 4NRCA 4LYWA 4AKGA 4PTBA 4A9OA 5DX4A 5EWDA 4YY6A 4N4HA 4Q0OA 5FB0A 4IR3A 4O72A 4O70A 4QSQA 2DATA 2D9EA 5EPSA 5CPEA 5FG4A 4O7AA 5F1HA 3D7CA 5E74A 5FFYA 5G4RA 4YYGA 2F6NA 4YYJA 2YELA 4UIWA 3DAIA 3JVMA 4IOOA 4HXRA 5EGUA 5E9YA 3I3JA 5DFBA 4QSSA 5I83A 4O71A 4YH3A 5EWVA 5AD3A 5CTLA 2YYNA 4MR3A 5A5SA 4CL9A 5F61A 5IBNA 5I7YA 4LZSA 4KCXA 3O36A 5C85A 2DVRA 5A5PA 4LC2A 5E9LA 4C66A 5J0DA 3U5LA 3UV2A 4HBWA 3DWYA 5CQ6A 5E7DA 4NYXA 4LYIA 4LRGA 4XUBA 2MJVB 3JVLA 5G4SA 4QB3A 5CY9A 4O74A 5DYCA 4RVRA 4BW3A 4ZQLA 4A9MA 4ALGA 4NXJA 5AMFA 5HELA 3UVDA 2L5EA 4YC9A 5A5OA 5BT3A 5FE9A 4UIXA 5HQ7A 5ENCA 5IGLA 4CURA 4HBXA 4A9FA 5HRXA 4NR8A 4WHUA 5DLXA 4LZRA 4LYSA 5I80A 2I8NA 5EPRA 5FE8A 2YEKA 2DVQA 4QSVA 3SVFA 4CUTA 3TLPA 2E7OA 4QSWA 4NR6A 5KO4A 5A85A 5DW2A 5IGMA 4TTEA 4Z93A 3S92A 4CUSA 4Q0NA 5D3LA 5IG6A 5L99A 4N4FA 4YYKA 5LJ2A 3HMHA 5LKUA 3NXBA 3RCWA 3G0JA 4HBYA 5F2PA 5CUDA 5IGKA 4QR3A 5DKCA 5I86A 3UV5A 2R10A 4TT4A 4YYHA 2G4AA 2DVVA 3UVWA 4PKLA 5FE5A 4YYMA 4IR5A 5CU8A 5HLSA 5EA1A 5D25A 4MENA 4QSUA 1ZKRA 5CUCA 3ONIA 5KTUA 5CUGA 5EV9A 5D3SA 1WUGA 3ERRA 4NQMA 5ETDA 3MXFA 4PCEA 4XY8A 4YADA 5EWWA 4Z1QA 4J0SA 4TU6A 2H60A 4WIVA 4TU4A 3MULA 5E9KA 5HRVA 4A9EA 4HXMA 4N4GA 4YY4A 2OO1A 2R0VA 2WP1A 3Q2FA 4CUUA 4BW1A 5E73A 5FG6A 4UYFA 5FG5A 4A9HA 5FE2A 4N4IA 4OUFA 5D0CA 5L8UA 5DBMA 3VKGA 5F60A 5A7CA 5EQ1A 3GG3A 5CZGA 2NXBA 4QC1A 5E3DA 5HQ6A 4OGJA 4TT2A 2RO1A 2OUOA 4QZSA 5F62A 5K29A 5FDZA 5D7XA 5D26A 5FH7A 3G0LA 1WUMA 4LR6A 4HXKA 4GPJA 5CFWA 5JI8A 5LJ1A 1X0JA 4PCIA 5HJCA 4CLBA 5CS8A 5KHMA 5IGNA 5C8GA 3U5NA 4QNSA 4HXNA 4YH4A 4Z6HA 3O35A 4OGIA 4QSRA 5HFRA 5EICA 4X2IA 4DONA 5EI4A 4O7CA 3K2JA 3IU6A 4NR7A 4BHWA 2LSPB 5DFDA 4C67A 3SVHA 5A82A 5HENA 3ZYUA 5EU1A 4NUDA 4TZ2A 5FE0A 2I7KA 4LDFA 5LKTA 4IR6A 5ENJA 4BW2A 4QUTA 4ALHA 2YDWA 1JM4B 5A5RA 2FSAA 4HXOA 4TS8A 5L97A 4TYLA 5C7NA 5E9VA 4MR5A 1E6IA 5LJ0A 3P1FA 4UYHA 4YYIA 4O7EA 5F1LA 5HRWA 5BT5A 4QEVA 1N72A 5LVRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3O37 A;  4NUE A;  5JWM A;  5HCL A;  5ENE A;  5FB1 A;  5LVQ A;  4QEU A;  3LQJ A;  2GRC A;  4HXP A;  5H1T A;  5F63 A;  4UYF B;  4Z6I A;  3MUK A;  3IU5 A;  4TZ8 A;  4A9J A;  4YAB A;  5ENH A;  4XUA A;  5HEM A;  5AME A;  4UIZ A;  4XYA A;  3AQA A;  5CQ3 A;  2E7N A;  3AAD A;  5HQ5 A;  5CQA A;  5COI A;  4NRB A;  5EP7 A;  4E96 A;  3U5M A;  2D82 A;  5DFC A;  5A5Q A;  3LQH A;  4O75 A;  3MB4 A;  5D3R A;  2E3K A;  4J1P A;  5I89 A;  5F3A A;  3LXJ A;  4XY9 A;  5H1V A;  5FFV A;  4NYW A;  2N9G A;  5A81 A;  4O76 A;  5C87 A;  3U5P A;  5HFQ A;  3QZS A;  4UYG A;  3FKM X;  5DYA A;  3MB3 A;  5FBX A;  5I7X A;  5EVA A;  5KU3 A;  5DYU A;  5CUA A;  4AKN A;  3P1D A;  4QYL A;  5DYX A;  2DWW A;  5D3N A;  4UIY A;  5D3T A;  4KV4 A;  4J3I A;  4NR9 A;  4F3I A;  3P1E A;  4MEP A;  5AD2 A;  5I29 A;  2R0Y A;  3Q2E A;  5A5N A;  4O78 A;  4ZW1 A;  5ENB A;  5F5Z A;  4UIV A;  2OSS A;  3JVK A;  5ACY A;  5II1 A;  4YAX A;  4A9I A;  4UIT A;  4YAT A;  5EPB A;  4QST A;  2R0S A;  4QY4 A;  5FH8 A;  5CRM A;  4UYD A;  3SVG A;  4Z1S A;  4NUC A; 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