4TU4A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(phenylsulfonyl)amino]benzoicacid
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Gene regulation
source organism Homo sapiens
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tu4A00
2F6NA 4HXOA 3S91A 5CUDA 5HJCA 4CUTA 4HXLA 4O78A 3MQMA 5L96A 5CUCA 5LKUA 5I83A 4Y03A 5KHMA 4DONA 3ZYUA 4YATA 5AMEA 4NS5A 4TZ8A 5IGKA 5IGMA 4BW3A 4QUUA 5EP7A 5DY7A 5J0DA 4QBMA 3I3JA 2H60A 3U5OA 5CU8A 4YK0A 3MXFA 4NRBA 4BW1A 3U5NA 5HQ7A 5FE8A 5A5SA 3Q2FA 4N3WA 5CQ3A 3QZVA 4LR6A 4HBXA 5CUBA 5DW1A 5CTLA 5KO4A 5CFWA 5EM3A 5D3LA 4BW2A 3O36A 4HXMA 4QR4A 5CRZA 3LQJA 2KTBB 2L84A 5E9KA 1ZS5A 3U5PA 4NR8A 5A5RA 3QZSA 5DFCA 5L99A 3SVFA 3UV4A 4IR6A 4CUUA 2GRCA 5FH6A 5DKDA 3UVWA 4A9NA 5A82A 5DLXA 4Z1QA 5FE1A 4HBWA 4O74A 2MJVB 4QC3A 3P5OA 5D7XA 5ETDA 5BT3A 4LYSA 4CURA 4Z6HA 4QC1A 5I1QA 5DYAA 5EA1A 5F1HA 5A83A 3RCWA 4CUSA 4N4IA 5HRXA 5F62A 4A9OA 5KTXA 5LUUA 4C66A 2LSPB 4QSQA 4OUFA 4NRCA 4NYVA 4CUPA 5HLSA 4QSPA 4QEUA 1JSPB 5I89A 5EPBA 4YYHA 5H1UA 4J0SA 3Q2EA 4O7BA 5E9IA 4O72A 4A9IA 5F60A 5E0RA 4NXJA 4YBTA 2E7OA 5EQ1A 4MR6A 4ZC9A 5D0CA 5I86A 4LDFA 2WP2A 2D9EA 5HCLA 4UYFA 5LKXA 3U5LA 5G4SA 4NUEA 5F61A 5H1TA 5FE9A 5EWCA 5LJ2A 5CP5A 5BT5A 4A9KA 4A9MA 5IBNA 4YYIA 4KV4A 5AD2A 1WUMA 3IU5A 4OGJA 4LRGA 4QZSA 4TU6A 4LZ2A 4YC9A 4NR9A 4PY6A 5FE3A 5C4QA 5CZGA 4MR3A 5HM0A 5D26A 4YYMA 2RO1A 4TT2A 2RFJA 4O7FA 4QEVA 5F2PA 5E9LA 5FDZA 4ALGA 5IIDA 4UYFB 4QNSA 2R0SA 3O33A 4YYJA 3UW9A 4CFLA 2DKWA 3O35A 5E3DA 2YEMA 4UIYA 5L8UA 5JI8A 5L97A 4HBVA 5F1LA 5E7DA 5EPRA 4XUBA 5FB0A 5E74A 5BT4A 4XY9A 5CQ8A 5FBXA 4QR5A 4QSVA 5EWHA 4HXNA 1E6IA 4WHWA 4MR4A 4YAXA 4QSXA 4LZRA 5CS8A 5JWMA 5FG4A 5DX4A 5EK9A 4YYDA 4UIWA 4YADA 2E3KA 5D3PA 5H1VA 4MR5A 4XUAA 3TLPA 3MUKA 5CUGA 5DBMA 5DYCA 3U5MA 5LJ1A 1JM4B 5F5ZA 5C8GA 4O7AA 5KTUA 5A5QA 5CQTA 5ETBA 5CUAA 5FE2A 5TB6A 3P1EA 4NUCA 2YW5A 4N4GA 5EWWA 4C67A 2YYNA 4MEOA 4NQNA 5D3TA 4WHUA 4NR6A 4TZ2A 4J1PA 4LC2A 4QSSA 5FG5A 4PKLA 5I7YA 2RNYA 4O71A 5II2A 1F68A 5KU3A 4A9LA 2F6JA 4N4FA 4KCXA 4TU4A 5DFDA 3AQAA 4HXKA 3JVJA 4IOQA 4N4HA 5CQ7A 4CFKA 5CQ6A 5DW2A 5F63A 4UIVA 3LQHA 4HXPA 4A9HA 2D82A 3LXJA 5CQ4A 5E9VA 5E9MA 2I7KA 5HENA 4LYIA 5E73A 4XY8A 4Z1SA 2R0YA 4PCEA 4FLPA 5ACYA 4UYHA 4F3IA 4ZQLA 5LKZA 4TT6A 4YYKA 5H85A 2DVVA 2FSAA 2L5EA 4YH4A 4UYGA 3UVXA 5ENCA 4QSWA 3G0LA 5D25A 5L8TA 1N72A 1EQFA 3HMFA 4Z6IA 3U5JA 2OUOA 5FFVA 4CUQA 3UV5A 2RNXA 4NR5A 4YH3A 4UIXA 4TS8A 5AMFA 5ENIA 2E7NA 4Q0OA 4HXSA 3HMHA 3UVYA 4UYDA 5C87A 4IORA 3MB4A 3HMEA 4QYLA 5AD3A 5F25A 3GG3A 4NR4A 4UYEA 2YEKA 5C7NA 5FE7A 2R0VA 3P1DA 5CRMA 4HBYA 5LJ0A 3S92A 4MENA 5LKTA 5DKHA 5FH8A 4J3IA 4IR4A 5C89A 3P1FA 4MEQA 4PCIA 5G4RA 4UIZA 3QZTA 3MULA 5I29A 4Q0NA 1WUGA 5EI4A 4QSUA 4IR3A 3JVKA 3DWYA 3JVLA 4BW4A 4NQMA 5A81A 5ENBA 4LYWA 4NYXA 4E96A 5I80A 5HRWA 3LQIA 5A5OA 2WP1A 2DWWA 3FKMX 5ENFA 5FE6A 5D24A 3UV2A 2DVQA 2YELA 4IR5A 5F36A 3IU6A 5HQ6A 4QEWA 5FG6A 5I40A 4O77A 5EISA 3DAIA 5DYUA 3O34A 4QYDA 5EVAA 2DVRA 2RI7A 4TQNA 5FE4A 3K2JA 5I7XA 3UVDA 5A5PA 4TT4A 3SVGA 4LZSA 5LVQA 2NXBA 4WIVA 5EWDA 3P1CA 5D3SA 2R10A 4QY4A 3AADA 4RVRA 5L98A 4NR7A 4OGIA 2G4AA 5FFWA 4ALHA 5II1A 5CQAA 5FE0A 5E9YA 4O7CA 4O76A 2RNWA 5ENGA 4UIUA 4QUTA 5CY9A 4KV1A 4YY4A 5HFQA 4YBMA 4HXRA 5IG6A 5KTWA 4UITA 4IOOA 5DLZA 5EU1A 5HFRA 5CPEA 5HEMA 5K29A 4QR3A 4O75A 3NXBA 4GPJA 5EWVA 5C85A 5CGPA 3SVHA 4ZW1A 4A9FA 3JVMA 5HQ5A 4MEPA 5DKCA 5D3JA 5TCMA 2DATA 5CUEA 4CLBA 4NYWA 4O7EA 4QB3A 5HRVA 5A7CA 4YBSA 5D3NA 5FB1A 4A9JA 2DVSA 5I88A 3ONIA 4TTEA 4O70A 4X2IA 4BJXA 5LVRA 3D7CA 2OO1A 2N9GA 3MB3A 5ENJA 3U5KA 5IGLA 4J0RA 4QSTA 5CQ5A 5ENHA 5DYXA 2L85A 5FE5A 5FFYA 2YDWA 3G0JA 4TYLA 5EGUA 4YY6A 4AKNA 5FH7A 2RS9B 4Z93A 2I8NA 2YQDA 5ENEA 5A85A 4A9EA 4BHWA 4XYAA 4NRAA 5D3RA 4YABA 5IGNA 3LJWA 4QSRA 5E3GA 5EPSA 4YYNA 4YYGA 4NUDA 5DFBA 5F3AA 2OSSA 5EICA 5COIA 5EV9A 1X0JA 4PS5A 5HELA 5A5NA 5D3HA 4CL9A 3O37A 4PTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F6NA 4HXOA 3S91A 5CUDA 5HJCA 4CUTA 4HXLA 4O78A 3MQMA 5L96A 5CUCA 5LKUA 5I83A 4Y03A 5KHMA 4DONA 3ZYUA 4YATA 5AMEA 4NS5A 4TZ8A 5IGKA 5IGMA 4BW3A 4QUUA 5EP7A 5DY7A 5J0DA 4QBMA 3I3JA 2H60A 3U5OA 5CU8A 4YK0A 3MXFA 4NRBA 4BW1A 3U5NA 5HQ7A 5FE8A 5A5SA 3Q2FA 4N3WA 5CQ3A 3QZVA 4LR6A 4HBXA 5CUBA 5DW1A 5CTLA 5KO4A 5CFWA 5EM3A 5D3LA 4BW2A 3O36A 4AI6A 4HXMA 4QR4A 5CRZA 3LQJA 2KTBB 2L84A 5E9KA 1ZS5A 3U5PA 4NR8A 5A5RA 3QZSA 5DFCA 5L99A 3SVFA 3UV4A 4IR6A 4CUUA 2GRCA 5FH6A 5DKDA 3UVWA 4A9NA 5A82A 5DLXA 4Z1QA 5FE1A 4HBWA 4O74A 2MJVB 4QC3A 3P5OA 5D7XA 5ETDA 5BT3A 4LYSA 4CURA 4Z6HA 4QC1A 5I1QA 5DYAA 5EA1A 5F1HA 5A83A 3RCWA 4CUSA 4N4IA 5HRXA 5F62A 4A9OA 5KTXA 5LUUA 4C66A 2LSPB 4QSQA 4OUFA 4NRCA 4NYVA 4CUPA 5HLSA 4QSPA 4QEUA 2EJNA 1JSPB 5I89A 5EPBA 4YYHA 5H1UA 4J0SA 3Q2EA 4O7BA 5E9IA 4O72A 4A9IA 5F60A 5E0RA 4NXJA 4YBTA 2E7OA 5EQ1A 4MR6A 4ZC9A 5D0CA 5I86A 4LDFA 2WP2A 2D9EA 5HCLA 4UYFA 5LKXA 3U5LA 5G4SA 4NUEA 5F61A 5H1TA 5FE9A 5EWCA 5LJ2A 5CP5A 5BT5A 4A9KA 4A9MA 5IBNA 4YYIA 4KV4A 5AD2A 1WUMA 3ERRA 3IU5A 4OGJA 4LRGA 4QZSA 4TU6A 4LZ2A 4YC9A 3D1BA 4NR9A 4PY6A 5FE3A 5C4QA 5CZGA 4MR3A 5HM0A 5D26A 4YYMA 4AKHA 2RO1A 4TT2A 2RFJA 4O7FA 3VKGA 4QEVA 5F2PA 5E9LA 5FDZA 4ALGA 5IIDA 4UYFB 4QNSA 2R0SA 3O33A 4YYJA 3UW9A 4CFLA 2DKWA 3O35A 5E3DA 2YEMA 3VKHA 4UIYA 5L8UA 5JI8A 5L97A 4HBVA 5F1LA 5E7DA 5EPRA 4XUBA 5FB0A 5E74A 5BT4A 4XY9A 5CQ8A 5FBXA 4QR5A 4QSVA 5EWHA 4HXNA 1E6IA 4WHWA 4MR4A 4YAXA 4QSXA 4LZRA 5CS8A 5JWMA 5FG4A 5DX4A 3D1DA 5EK9A 4YYDA 4UIWA 4YADA 2E3KA 5D3PA 5H1VA 4MR5A 4XUAA 3TLPA 3MUKA 5CUGA 5DBMA 5DYCA 3U5MA 5LJ1A 1JM4B 5F5ZA 5C8GA 4O7AA 5KTUA 5A5QA 5CQTA 5ETBA 5CUAA 5FE2A 5TB6A 3P1EA 4NUCA 2YW5A 4N4GA 5EWWA 4C67A 2YYNA 4MEOA 4NQNA 5D3TA 4WHUA 4NR6A 4TZ2A 4J1PA 4LC2A 4QSSA 5FG5A 4PKLA 5I7YA 2RNYA 4O71A 5II2A 1F68A 5KU3A 4A9LA 2F6JA 4N4FA 4KCXA 4TU4A 5DFDA 3AQAA 4HXKA 3JVJA 4IOQA 4N4HA 5CQ7A 4CFKA 5CQ6A 5DW2A 5F63A 4UIVA 3LQHA 4HXPA 4A9HA 2D82A 3LXJA 5CQ4A 5E9VA 5E9MA 2I7KA 5HENA 4LYIA 5E73A 4XY8A 4Z1SA 2R0YA 4PCEA 4FLPA 5ACYA 4AKIA 4UYHA 4F3IA 4ZQLA 5LKZA 4TT6A 4YYKA 5H85A 2DVVA 2FSAA 2L5EA 4YH4A 4UYGA 3UVXA 5ENCA 4QSWA 3G0LA 5D25A 5L8TA 1N72A 1EQFA 3HMFA 4Z6IA 3U5JA 2OUOA 5FFVA 4CUQA 3UV5A 2RNXA 4NR5A 4YH3A 4UIXA 4TS8A 5AMFA 5ENIA 2E7NA 4Q0OA 4HXSA 3HMHA 3UVYA 4UYDA 5C87A 4IORA 3MB4A 3HMEA 4QYLA 5AD3A 5F25A 3GG3A 4NR4A 4UYEA 2YEKA 5C7NA 5FE7A 2R0VA 3P1DA 5CRMA 4HBYA 5LJ0A 3S92A 4MENA 5LKTA 5DKHA 5FH8A 4J3IA 4IR4A 5C89A 3P1FA 4MEQA 4PCIA 5G4RA 4UIZA 3QZTA 3MULA 5I29A 4Q0NA 1WUGA 5EI4A 4QSUA 4IR3A 3JVKA 3DWYA 3JVLA 4BW4A 4NQMA 5A81A 5ENBA 4LYWA 4NYXA 4E96A 5I80A 5HRWA 3LQIA 5A5OA 2WP1A 2DWWA 3FKMX 5ENFA 5FE6A 5D24A 3UV2A 2DVQA 2YELA 1ZKRA 4IR5A 5F36A 3IU6A 5HQ6A 4QEWA 5FG6A 5I40A 4O77A 5EISA 3DAIA 5DYUA 3O34A 4QYDA 5EVAA 2DVRA 2RI7A 4TQNA 5FE4A 3K2JA 5I7XA 3UVDA 5A5PA 4TT4A 3SVGA 4LZSA 5LVQA 2NXBA 4WIVA 5EWDA 3P1CA 5D3SA 2R10A 4QY4A 3AADA 4RVRA 5L98A 4NR7A 4OGIA 2G4AA 5FFWA 4ALHA 1PUOA 5II1A 5CQAA 5FE0A 5E9YA 4O7CA 4O76A 2RNWA 5ENGA 4UIUA 4QUTA 5CY9A 4KV1A 4YY4A 5HFQA 4YBMA 4HXRA 5IG6A 5KTWA 4UITA 4IOOA 5DLZA 5EU1A 5HFRA 5CPEA 5HEMA 5K29A 4QR3A 4O75A 3NXBA 4GPJA 5EWVA 5C85A 5CGPA 3SVHA 4ZW1A 4A9FA 3JVMA 5HQ5A 4MEPA 5DKCA 5D3JA 5TCMA 2DATA 5CUEA 4CLBA 4NYWA 4O7EA 4QB3A 5HRVA 5A7CA 4YBSA 5D3NA 5FB1A 4A9JA 2DVSA 5I88A 3ONIA 4TTEA 4O70A 4X2IA 4BJXA 5LVRA 3D7CA 2OO1A 2N9GA 3MB3A 5ENJA 3U5KA 5IGLA 4J0RA 4QSTA 5CQ5A 5ENHA 5DYXA 2L85A 5FE5A 5FFYA 2YDWA 3G0JA 4TYLA 5EGUA 4YY6A 4AKNA 5FH7A 2RS9B 4Z93A 2I8NA 2YQDA 5ENEA 5A85A 4A9EA 4BHWA 4XYAA 4NRAA 5D3RA 4YABA 5IGNA 3LJWA 4QSRA 5E3GA 5EPSA 4AKGA 4YYNA 4YYGA 4NUDA 5DFBA 5F3AA 2OSSA 5EICA 5COIA 5EV9A 1X0JA 4PS5A 5HELA 5A5NA 5D3HA 4CL9A 3O37A 4PTBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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