4HXLA

Brd4 bromodomain 1 complex with 3-cyclohexyl-n-{3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)-5-[(thiophen-2-ylsulfonyl)amino]phenyl}propanamide inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 44
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxlA01
3LJWA 5AD2A 4LDFA 5DKCA 5D3JA 4YAXA 5AMEA 5D3RA 3K2JA 4NR7A 3LQIA 4O78A 2D9EA 5DX4A 5E9MA 5IGLA 5EQ1A 2RS9B 2YELA 1ZS5A 5DFDA 3MXFA 5G4SA 4F3IA 5HLSA 5I83A 2OSSA 5I7YA 4IOOA 3U5OA 4HXNA 4YH4A 4DONA 5E3GA 5D3PA 5F36A 4QZSA 3MB3A 5K29A 5IGKA 4QSRA 4TS8A 3G0LA 5FFVA 4QSSA 5EWDA 4IORA 3JVLA 4TTEA 4OGIA 5L96A 4LR6A 5CS8A 2R0SA 4A9OA 2F6NA 5A83A 5KU3A 2DVSA 5E9YA 5DFCA 4LZ2A 5EA1A 2YEKA 3GG3A 4A9KA 3QZSA 5CY9A 5FB0A 4QSVA 4HXRA 5CQTA 4YY4A 4YK0A 3P5OA 5EWHA 5KHMA 4QBMA 5FE4A 5E9LA 4A9EA 2E7NA 3QZVA 4MR3A 5CUEA 5EISA 2N9GA 4QSUA 5ENJA 5ENHA 5CRMA 4IR6A 2GRCA 5KO4A 5C85A 4CFLA 4NXJA 5FBXA 4J1PA 3HMEA 4UIVA 5EWCA 5ENEA 3UV4A 2OUOA 4XUBA 2YEMA 4BW1A 5L97A 4HXPA 4QEUA 3P1EA 5DLXA 4UIWA 3U5PA 5C4QA 4Q0OA 4BW3A 4YABA 4KV1A 5EP7A 5I80A 3UV2A 5L98A 4LYIA 4HXMA 4N3WA 4O71A 4TZ8A 5E73A 5EICA 4BHWA 4FLPA 4A9LA 3Q2FA 3UW9A 4QR5A 3JVMA 4GPJA 5HFRA 4NRCA 5ENBA 5FE8A 4QYDA 5COIA 5ENFA 5A5OA 4UIXA 5CUGA 4QNSA 4YADA 4UYGA 5E0RA 5DY7A 5LUUA 3UVDA 4QR4A 5HFQA 4OUFA 5EM3A 5HM0A 4YYIA 4TT4A 4NYWA 5D3LA 3IU6A 2MJVB 4Z1SA 5LJ0A 4MEOA 5ETBA 1JSPB 5CFWA 4NR9A 5CQ8A 4YYDA 4O72A 3U5LA 4ZQLA 5A5QA 3FKMX 3HMFA 5EVAA 5A5NA 3S91A 5FE1A 4WHUA 2E7OA 3JVJA 5HENA 4TYLA 5D3NA 5HEMA 4NR4A 4CLBA 4TT2A 5FE7A 3DAIA 5FH6A 4HXOA 1WUMA 5CQ5A 5FDZA 4LRGA 5CP5A 5FB1A 3U5MA 2RNWA 5CQ7A 5EPRA 3Q2EA 5DYUA 2RNYA 2L84A 4PCIA 2DVQA 5E3DA 5I89A 2L5EA 4NR8A 5E74A 4Q0NA 4CUTA 5IG6A 3MUKA 5FH7A 4XY9A 5BT5A 5HRWA 4HBXA 4XUAA 4N4HA 5F1HA 4CUQA 4A9IA 5FE9A 2DVRA 5D26A 5ENIA 3AADA 4J0SA 5I1QA 5EWWA 5D7XA 2KTBB 3G0JA 4IOQA 5CTLA 4HBVA 4QUTA 4UYDA 5CUAA 4XY8A 5E9IA 2R0VA 4NRAA 4QSPA 5F5ZA 3P1FA 4YYNA 5IIDA 5TB6A 2YDWA 3O35A 4A9MA 4QYLA 2DWWA 2RFJA 4BJXA 5AMFA 4O7AA 5ACYA 4QR3A 3ONIA 5KTXA 3P1CA 4NYVA 5HELA 2E3KA 4UIUA 5EU1A 4Z1QA 3D7CA 4A9FA 2RI7A 4YYKA 4HXKA 4MENA 4YH3A 5FE0A 4Y03A 3UVYA 4YYGA 3HMHA 4HBYA 3O34A 5CRZA 4KCXA 4PTBA 5F60A 4O75A 5FG6A 3I3JA 4Z6HA 5JWMA 2I7KA 5FFYA 5FG5A 5A7CA 4TZ2A 4YC9A 1JM4B 5LKXA 5F61A 2D82A 3UV5A 5J0DA 3JVKA 5CGPA 4QY4A 4ZC9A 4NQNA 4YY6A 4NUCA 4LC2A 1EQFA 2OO1A 3MQMA 5FFWA 5IGNA 2RO1A 5LJ1A 5A85A 5CUBA 5F62A 5A5SA 5LVQA 4NRBA 4RVRA 4X2IA 2G4AA 5BT4A 5DBMA 4CUSA 4C66A 3MB4A 2LSPB 5DKHA 2F6JA 5A82A 4QUUA 2I8NA 1E6IA 1F68A 4KV4A 5II2A 2RNXA 4CFKA 5C7NA 5CZGA 5DW2A 4Z6IA 4LZRA 3LXJA 2YQDA 5I88A 5LVRA 4NUEA 3SVFA 2R10A 5G4RA 3SVGA 5CUCA 3O37A 2NXBA 4QB3A 5FE6A 3U5KA 4A9NA 5L99A 5H85A 4HXLA 4PS5A 5TCMA 5FE3A 2WP2A 2H60A 5CQ3A 4CURA 4LZSA 4OGJA 4QEWA 5FE5A 5F2PA 4TU6A 4WIVA 5E9VA 5EV9A 4ALGA 4BW4A 5EK9A 5L8UA 4TQNA 5HRXA 3U5JA 5HQ7A 4QC3A 5D3HA 5HQ5A 2DATA 4UIYA 4O70A 5KTWA 5HRVA 5EGUA 4YYMA 4O7EA 4UYFA 2FSAA 4HBWA 4C67A 5JI8A 4QEVA 5EPSA 2R0YA 5C89A 2DKWA 4O76A 5A5PA 4LYSA 1WUGA 5F25A 4MR6A 2WP1A 5A81A 4NR5A 5FG4A 4YBMA 4BW2A 5F1LA 5ENGA 2YYNA 5D3TA 5HQ6A 3TLPA 5C87A 3NXBA 5DW1A 3SVHA 5CQAA 3O36A 3QZTA 5HJCA 4LYWA 4O7BA 4QSWA 4UYFB 3UVXA 3MULA 5D0CA 5I29A 5AD3A 5F3AA 5FE2A 4IR4A 4O7FA 1N72A 4PKLA 4MEPA 5F63A 4A9HA 5DKDA 3ZYUA 4J3IA 4NYXA 3DWYA 5CQ6A 4NS5A 4NQMA 3LQJA 4TU4A 4J0RA 4MEQA 5H1VA 3U5NA 5CQ4A 2DVVA 5HCLA 4XYAA 5LJ2A 1X0JA 5IGMA 5L8TA 4AKNA 4NUDA 5II1A 4YBTA 4N4GA 4QSTA 5LKUA 5D24A 5H1UA 4N4FA 4O77A 4UYHA 5LKZA 5DFBA 3S92A 4CL9A 4Z93A 5I86A 3UVWA 4ALHA 2YW5A 5FH8A 4O7CA 5DLZA 4QSXA 4YYJA 5E7DA 5KTUA 5LKTA 4PCEA 4CUUA 5ENCA 4WHWA 5BT3A 5EWVA 4NR6A 4UIZA 3P1DA 4UITA 5CU8A 5C8GA 5ETDA 5I7XA 2L85A 4YBSA 3O33A 3IU5A 4CUPA 4QC1A 5EPBA 4MR5A 3AQAA 4IR5A 5CPEA 5H1TA 4O74A 4MR4A 4QSQA 4TT6A 5D25A 5I40A 4N4IA 5EI4A 5A5RA 5CUDA 4YATA 5IBNA 5DYXA 4IR3A 5DYAA 4E96A 4PY6A 4UYEA 5D3SA 5DYCA 5E9KA 4A9JA 3LQHA 4HXSA 3RCWA 4YYHA 4ZW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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