4CUTA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-5 n09428
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-5 N09428
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cutA00
5E3GA 3U5JA 2DVRA 5A5QA 4PTBA 3U5MA 4CUUA 5IG6A 4QEWA 4MEQA 3QZTA 3U5NA 5FE3A 4NUCA 4E96A 2FSAA 3O37A 4QB3A 3MUKA 5F3AA 4QSUA 5HENA 4O7EA 4NRBA 5FE4A 5D3RA 4PKLA 5EISA 5EICA 4O78A 5FE6A 4YH4A 5KTWA 4N4GA 3MQMA 3I3JA 5HRWA 4YK0A 5I7YA 5FE2A 4UYEA 5D3JA 4MR3A 3MB3A 4WIVA 5DLZA 5D3NA 5CPEA 2I8NA 4PCEA 4Z93A 3JVKA 5JI8A 3QZVA 5CGPA 5DFBA 5DFDA 2NXBA 5F1LA 3Q2EA 4NR7A 4IR5A 4TQNA 4NR6A 2GRCA 4Z1SA 2E3KA 4IORA 3MULA 4Z6HA 1E6IA 5IGNA 1F68A 4O76A 5I83A 3LQJA 3UVYA 4QSQA 2DATA 3P1DA 5ENHA 2DKWA 4UITA 4UYGA 5DFCA 5A5NA 4HXMA 2OUOA 4IR6A 5H1VA 4KV1A 5FE8A 4UYHA 4Y03A 4PY6A 5LKZA 3AQAA 3LXJA 2WP1A 5FFYA 4Z6IA 5DX4A 5L96A 3K2JA 4O7AA 2YW5A 5E9LA 3P1CA 4IR3A 4UIXA 4J0SA 4A9EA 5D0CA 5EWWA 4HBVA 4TT4A 5EP7A 5II2A 4QSSA 4F3IA 3JVMA 4YYGA 5EK9A 4A9KA 5FG6A 5CU8A 3P5OA 5DY7A 1X0JA 4XY8A 4TT2A 5KO4A 4UIUA 3IU5A 5DYCA 5DBMA 5A81A 3DAIA 5E9YA 2OSSA 2YEKA 2KTBB 4NR4A 4O71A 1EQFA 4N4HA 4LZSA 5LKUA 4YYMA 4Q0NA 5EWHA 5CUGA 4PS5A 4NR8A 2RNXA 5G4RA 3DWYA 4C67A 3UW9A 5EA1A 4CFKA 4LRGA 5F60A 2YDWA 3IU6A 5ENFA 4XYAA 5AMFA 5H1TA 4O7CA 3P1FA 5CQ4A 2I7KA 4YYNA 4BW4A 4RVRA 4YH3A 5L99A 5LJ0A 5DYXA 5LKXA 4A9MA 4NR9A 5EV9A 3P1EA 5ENCA 4YY4A 5I7XA 2RFJA 4QR5A 4A9OA 5HRXA 3G0JA 3U5LA 5C4QA 4NR5A 4HXKA 5D26A 5F1HA 3O36A 4LYWA 4YC9A 1WUMA 5II1A 4UYFB 5D3PA 5CRMA 5DYUA 4QUTA 4MR4A 3LQIA 4XUBA 5I29A 4MR5A 1ZS5A 5L8UA 4QR3A 4NUDA 4QZSA 5L97A 4XY9A 4YYKA 3LQHA 4QY4A 4QEUA 5CTLA 5FFVA 5DW1A 5CQ3A 4HBWA 2E7OA 3JVJA 4YY6A 3HMHA 4NYVA 2R0SA 3S91A 4MENA 2R0VA 4QNSA 5IGMA 5A5SA 5D3SA 4UIYA 5ENGA 4J1PA 5DKDA 4Q0OA 5DKHA 5CQ7A 3O35A 4MR6A 3UV5A 5CUAA 3U5KA 5H1UA 4QSPA 4UYDA 5D7XA 5EPRA 2F6NA 4J0RA 5HLSA 5FE5A 5HQ5A 2MJVB 5FE7A 3SVHA 4WHUA 5LUUA 5EWVA 5F36A 5HCLA 5FDZA 5A5RA 5HQ7A 3ONIA 4OGJA 4QSVA 5EWDA 4O7BA 5F61A 4ALHA 4CLBA 5C87A 5I1QA 4WHWA 5CUEA 3UV4A 4XUAA 2YQDA 2RNWA 5BT4A 5CFWA 5ACYA 3TLPA 3O33A 4HXPA 4LYIA 4BHWA 2LSPB 5EVAA 3SVFA 3NXBA 2RI7A 4QSXA 4C66A 5D24A 5F2PA 5G4SA 4DONA 4KCXA 4QUUA 5E9MA 5FG5A 3UVDA 4FLPA 5I86A 2D9EA 3D7CA 2R0YA 5D3LA 4QYLA 5CQAA 5H85A 4TT6A 5CRZA 5CZGA 3JVLA 5I89A 3S92A 4AKNA 5D25A 3SVGA 4HXLA 5A7CA 5BT3A 2F6JA 4A9NA 5HRVA 5A5OA 5DKCA 5F63A 4QC3A 5J0DA 5BT5A 5HQ6A 5FH6A 3AADA 5KHMA 3LJWA 5AD3A 4CUQA 4NRCA 4NYXA 4NYWA 4CL9A 4Z1QA 5FB1A 2H60A 4HBYA 4NUEA 5EPBA 5E9IA 5CY9A 4YYIA 5LVRA 4IR4A 5K29A 5F25A 3FKMX 4O77A 5CUBA 4NRAA 5A82A 4LDFA 5EQ1A 4UIZA 3U5OA 5FE9A 2R10A 5A85A 4MEPA 5EGUA 4HXSA 5FH7A 4CUPA 5C89A 4BW3A 5CUDA 5HFQA 5A5PA 5F62A 5FG4A 4PCIA 5CQ8A 4YBTA 4A9HA 4BW2A 5HEMA 4KV4A 3RCWA 3UVXA 5E74A 5TB6A 2D82A 5LVQA 4GPJA 4OGIA 4TTEA 4TS8A 4MEOA 5IIDA 1WUGA 5EU1A 4BW1A 4O70A 5L98A 5TCMA 5E7DA 1JSPB 4QC1A 2YEMA 4QBMA 4O75A 5LJ2A 5CQ6A 5ENBA 5CQ5A 3GG3A 5FFWA 5E73A 5KTXA 4UIWA 4QSTA 2N9GA 4LC2A 5KU3A 3QZSA 5DYAA 2L5EA 4O72A 2E7NA 4YADA 4UIVA 3ZYUA 4YYDA 5I88A 2YYNA 4NQMA 4QYDA 2DVVA 3Q2FA 5HFRA 5D3HA 5A83A 5FH8A 5IBNA 4TZ2A 5CP5A 4O74A 4CUSA 4YABA 5ENEA 5JWMA 5FE1A 5FB0A 4TU6A 5CS8A 5EI4A 4A9JA 4YBSA 5I40A 4HBXA 1JM4B 1N72A 3O34A 4IOQA 4HXNA 5IGLA 4A9LA 4YAXA 5ENJA 4TYLA 4A9IA 4X2IA 5AMEA 2L85A 5E9KA 4QR4A 5LKTA 5EWCA 2L84A 2RS9B 4ZQLA 4LYSA 3UV2A 4N3WA 2G4AA 5L8TA 5EPSA 2DVSA 3G0LA 4CUTA 4TZ8A 2DVQA 2YELA 4YBMA 3U5PA 5IGKA 5F5ZA 4UYFA 5CQTA 3HMFA 5HM0A 4J3IA 4IOOA 5CUCA 5FBXA 5DW2A 4ZW1A 3HMEA 4NS5A 5DLXA 3MB4A 5E3DA 4LR6A 4N4FA 4LZRA 5ENIA 2RNYA 4ZC9A 4NQNA 2OO1A 4A9FA 4OUFA 5ETBA 3UVWA 4HXOA 4QSWA 5AD2A 5C7NA 5HJCA 5HELA 5KTUA 5C85A 5E9VA 4ALGA 2RO1A 4HXRA 4CURA 4YYHA 5I80A 5COIA 4O7FA 4QEVA 4YATA 5LJ1A 3MXFA 4N4IA 4QSRA 4LZ2A 5C8GA 2WP2A 4BJXA 5D3TA 5FE0A 2DWWA 4NXJA 5EM3A 5E0RA 4TU4A 5ETDA 4CFLA 4YYJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E3GA 3U5JA 2DVRA 5A5QA 4PTBA 3U5MA 4CUUA 5IG6A 4QEWA 4MEQA 3QZTA 3U5NA 5FE3A 4NUCA 4E96A 2FSAA 3O37A 4QB3A 3MUKA 5F3AA 4QSUA 5HENA 4O7EA 4NRBA 5FE4A 5D3RA 4PKLA 5EISA 5EICA 4O78A 5FE6A 4YH4A 5KTWA 4N4GA 3MQMA 3I3JA 5HRWA 4YK0A 5I7YA 5FE2A 4UYEA 5D3JA 4MR3A 3MB3A 3D1DA 4WIVA 5DLZA 5D3NA 5CPEA 2I8NA 4PCEA 4Z93A 3JVKA 5JI8A 3QZVA 5CGPA 5DFBA 5DFDA 2NXBA 5F1LA 3Q2EA 4NR7A 4IR5A 4TQNA 3VKHA 4NR6A 2GRCA 4Z1SA 2E3KA 4IORA 3MULA 4Z6HA 1E6IA 5IGNA 1F68A 4O76A 5I83A 3LQJA 3UVYA 4QSQA 2DATA 3P1DA 5ENHA 2DKWA 4UITA 4UYGA 5DFCA 5A5NA 4HXMA 2OUOA 4IR6A 5H1VA 4AKGA 4KV1A 5FE8A 4UYHA 4Y03A 4PY6A 5LKZA 3AQAA 3LXJA 2WP1A 5FFYA 4Z6IA 5DX4A 5L96A 3K2JA 4O7AA 2YW5A 5E9LA 3P1CA 4IR3A 4UIXA 4J0SA 4A9EA 5D0CA 5EWWA 4HBVA 4TT4A 5EP7A 5II2A 4QSSA 4F3IA 3JVMA 4YYGA 5EK9A 4A9KA 5FG6A 5CU8A 3P5OA 5DY7A 1X0JA 4XY8A 4TT2A 5KO4A 4UIUA 3IU5A 5DYCA 5DBMA 5A81A 3DAIA 5E9YA 2OSSA 2YEKA 2KTBB 4NR4A 4O71A 1EQFA 4N4HA 4LZSA 5LKUA 4YYMA 4Q0NA 5EWHA 5CUGA 4PS5A 4NR8A 2RNXA 5G4RA 3DWYA 4C67A 3UW9A 5EA1A 4CFKA 4LRGA 5F60A 2YDWA 3IU6A 5ENFA 4XYAA 5AMFA 5H1TA 4O7CA 3P1FA 5CQ4A 2I7KA 4YYNA 4BW4A 4RVRA 4YH3A 5L99A 5LJ0A 5DYXA 5LKXA 4A9MA 4NR9A 3ERRA 5EV9A 3P1EA 5ENCA 4YY4A 5I7XA 2RFJA 4QR5A 4A9OA 5HRXA 3G0JA 3U5LA 5C4QA 4NR5A 4HXKA 5D26A 5F1HA 3O36A 4LYWA 4YC9A 1WUMA 5II1A 4UYFB 5D3PA 5CRMA 5DYUA 4QUTA 4MR4A 3LQIA 4XUBA 5I29A 4MR5A 1ZS5A 5L8UA 4QR3A 4NUDA 4QZSA 5L97A 4XY9A 4YYKA 3LQHA 4QY4A 4QEUA 5CTLA 5FFVA 5DW1A 5CQ3A 4HBWA 2E7OA 3JVJA 4YY6A 3HMHA 4NYVA 2R0SA 3S91A 4MENA 2R0VA 4QNSA 5IGMA 5A5SA 5D3SA 4UIYA 5ENGA 4J1PA 5DKDA 4Q0OA 5DKHA 5CQ7A 3O35A 4MR6A 3UV5A 5CUAA 3U5KA 5H1UA 4QSPA 4UYDA 5D7XA 5EPRA 2F6NA 4J0RA 5HLSA 5FE5A 5HQ5A 2MJVB 5FE7A 3SVHA 4WHUA 5LUUA 5EWVA 5F36A 5HCLA 5FDZA 5A5RA 5HQ7A 3ONIA 4OGJA 4QSVA 5EWDA 4O7BA 5F61A 4ALHA 4CLBA 5C87A 5I1QA 4WHWA 5CUEA 3UV4A 4XUAA 2YQDA 2RNWA 5BT4A 5CFWA 5ACYA 3TLPA 3O33A 4HXPA 4LYIA 4BHWA 2LSPB 5EVAA 3SVFA 3NXBA 2RI7A 4QSXA 4C66A 5D24A 5F2PA 5G4SA 4DONA 1PUOA 4KCXA 4QUUA 5E9MA 5FG5A 3UVDA 4FLPA 5I86A 2D9EA 3D7CA 2R0YA 5D3LA 4QYLA 5CQAA 5H85A 4TT6A 5CRZA 5CZGA 3JVLA 5I89A 3S92A 4AKNA 5D25A 3SVGA 4HXLA 5A7CA 5BT3A 2F6JA 4A9NA 5HRVA 5A5OA 5DKCA 5F63A 4QC3A 5J0DA 5BT5A 5HQ6A 5FH6A 3AADA 5KHMA 3LJWA 5AD3A 4CUQA 4NRCA 4NYXA 4NYWA 4CL9A 3VKGA 4Z1QA 5FB1A 2H60A 4HBYA 4NUEA 5EPBA 5E9IA 5CY9A 4YYIA 5LVRA 4IR4A 5K29A 5F25A 3FKMX 2EJNA 4O77A 5CUBA 4NRAA 5A82A 4LDFA 5EQ1A 4UIZA 3U5OA 5FE9A 2R10A 5A85A 4MEPA 5EGUA 4HXSA 5FH7A 4CUPA 5C89A 4BW3A 5CUDA 5HFQA 5A5PA 5F62A 5FG4A 4PCIA 5CQ8A 4YBTA 4A9HA 4BW2A 5HEMA 4KV4A 3RCWA 3UVXA 5E74A 5TB6A 2D82A 5LVQA 4GPJA 4OGIA 4TTEA 4TS8A 4MEOA 5IIDA 1WUGA 5EU1A 4BW1A 4O70A 5L98A 5TCMA 5E7DA 1JSPB 4QC1A 2YEMA 4QBMA 4O75A 5LJ2A 5CQ6A 5ENBA 5CQ5A 3GG3A 5FFWA 5E73A 5KTXA 4UIWA 4QSTA 4AKHA 2N9GA 4LC2A 5KU3A 3QZSA 5DYAA 2L5EA 4O72A 2E7NA 4YADA 4UIVA 3ZYUA 4YYDA 5I88A 2YYNA 4NQMA 4QYDA 2DVVA 3Q2FA 3D1BA 5HFRA 5D3HA 5A83A 5FH8A 5IBNA 4TZ2A 5CP5A 4O74A 4CUSA 4YABA 5ENEA 5JWMA 5FE1A 5FB0A 4TU6A 5CS8A 5EI4A 4A9JA 4YBSA 5I40A 4HBXA 1JM4B 1N72A 4AKIA 3O34A 4IOQA 4HXNA 5IGLA 4A9LA 4YAXA 5ENJA 4TYLA 4A9IA 4X2IA 5AMEA 2L85A 5E9KA 4QR4A 5LKTA 5EWCA 2L84A 2RS9B 4ZQLA 4LYSA 3UV2A 4N3WA 2G4AA 5L8TA 5EPSA 2DVSA 3G0LA 4CUTA 4TZ8A 2DVQA 2YELA 4YBMA 3U5PA 5IGKA 5F5ZA 4UYFA 5CQTA 3HMFA 5HM0A 4J3IA 4IOOA 5CUCA 5FBXA 1ZKRA 5DW2A 4ZW1A 3HMEA 4NS5A 5DLXA 3MB4A 5E3DA 4LR6A 4N4FA 4LZRA 5ENIA 2RNYA 4AI6A 4ZC9A 4NQNA 2OO1A 4A9FA 4OUFA 5ETBA 3UVWA 4HXOA 4QSWA 5AD2A 5C7NA 5HJCA 5HELA 5KTUA 5C85A 5E9VA 4ALGA 2RO1A 4HXRA 4CURA 4YYHA 5I80A 5COIA 4O7FA 4QEVA 4YATA 5LJ1A 3MXFA 4N4IA 4QSRA 4LZ2A 5C8GA 2WP2A 4BJXA 5D3TA 5FE0A 2DWWA 4NXJA 5EM3A 5E0RA 4TU4A 5ETDA 4CFLA 4YYJA
chains in the Genus database with same CATH topology
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