3UVYA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k16ack20ac)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
QTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/protein binding
total genus 36
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvyA01
4AKNA 5EICA 5IGLA 4MENA 3IU6A 4YBSA 4O74A 4NR5A 5D3TA 5ENJA 5J0DA 4O7FA 3Q2EA 4HXPA 4PCIA 5DFDA 5H1UA 5FG4A 5A85A 3MQMA 5F3AA 5CY9A 2OO1A 2MJVB 4QSSA 3U5OA 4LZ2A 5D3NA 5DYUA 4A9MA 5DFCA 5E9LA 4OGJA 5FDZA 4YBTA 4YYJA 5F62A 2RS9B 4YY4A 5A5NA 3G0JA 3DAIA 5AMFA 4C66A 5COIA 3QZTA 5C7NA 1WUGA 4UYFB 5CTLA 5CQ4A 4O76A 3LQIA 4TT6A 4YYGA 4CFKA 5ENFA 4MR5A 4XYAA 4PKLA 3O37A 4C67A 2G4AA 5ENEA 5FH7A 5CPEA 4YH4A 5LJ2A 5DBMA 5FFYA 5LKZA 5I88A 4ZC9A 4NUEA 5FE4A 2L5EA 4ALHA 5HM0A 4KV1A 5A7CA 4Z1SA 2I7KA 4YY6A 5HJCA 2YYNA 3UV5A 3UV2A 5CS8A 4OGIA 4QSTA 5CGPA 5EWCA 2YQDA 4NQMA 5DKHA 4BW4A 4XY9A 4MR3A 1WUMA 5DYAA 4LDFA 5FE3A 2FSAA 3U5MA 5AD3A 4NYVA 3UW9A 5F25A 4GPJA 2WP2A 5ETBA 3LQHA 5EP7A 2R10A 5CUAA 4KV4A 2WP1A 4YATA 5A5RA 3DWYA 2F6NA 4TT2A 5I89A 5L96A 3O36A 3UVDA 1EQFA 4N4IA 5LKXA 4N4GA 4O78A 2RNXA 4CFLA 5EVAA 5F61A 4A9KA 2I8NA 5HENA 5H1TA 5KTXA 1E6IA 5HCLA 4UYGA 4YBMA 5L8UA 3U5KA 4IR3A 5H85A 4YYKA 5ENGA 5AMEA 5HQ6A 4O7EA 2F6JA 4A9LA 4QB3A 5FG5A 3UV4A 5E3GA 4IOQA 5F5ZA 4RVRA 5G4SA 4DONA 5D24A 5CUDA 5CQ7A 4YYDA 4Q0NA 4ALGA 4BW1A 5EV9A 4YYNA 2D82A 5TB6A 5BT3A 4O71A 2DKWA 5D3RA 5H1VA 5FB1A 4NR6A 4OUFA 2H60A 3I3JA 4NUDA 4YC9A 4O72A 5HQ7A 4IR6A 3P5OA 4HXKA 4UYHA 5EK9A 1JSPB 3SVGA 3Q2FA 5E0RA 4NR7A 5C85A 3U5JA 5LVQA 4Z1QA 5A5OA 5DLXA 5IGKA 5FE9A 2DVVA 5FE7A 5LKTA 5I80A 3P1EA 5I83A 5EWVA 5F60A 4UIWA 3MXFA 5HELA 4O7BA 4NYXA 4XY8A 4HBVA 5A82A 3K2JA 4YYIA 4N4HA 5A83A 4CUSA 5EISA 4TYLA 5C4QA 5CUBA 3RCWA 5DFBA 5E9YA 3AQAA 4HXSA 5EM3A 4TT4A 4UYFA 4QBMA 2YELA 2E7OA 4QC1A 5I7YA 4UIVA 4HBXA 3O33A 4HXMA 4HBWA 2R0SA 3HMEA 4A9HA 5KO4A 4QSPA 3QZSA 4Y03A 4Z93A 4NRBA 5CQ3A 4QSUA 4NRCA 5EPBA 2R0YA 2N9GA 4NR8A 4QC3A 5FH8A 5FE6A 4O7AA 5D7XA 5FE2A 2YEKA 3U5NA 4ZQLA 4A9IA 5EI4A 5CUGA 2E3KA 4TZ8A 5D3SA 5FBXA 5C89A 4QUTA 5IBNA 3AADA 4MR6A 2OSSA 5CQTA 4O70A 5FE1A 4A9EA 4E96A 2RNYA 4TU6A 5G4RA 2E7NA 4A9NA 5A81A 5KHMA 5FE0A 5DYXA 5DW2A 2GRCA 5ENBA 3P1FA 4NR4A 3FKMX 5I7XA 5LKUA 4PY6A 4NXJA 4QNSA 5KU3A 4O77A 3JVJA 4NQNA 3ONIA 5E74A 5HFQA 5E73A 3LJWA 5HLSA 5ENHA 4WHWA 1JM4B 4PTBA 3S91A 5A5SA 4NRAA 2YW5A 5ENCA 4XUBA 5I1QA 4TQNA 4O75A 4HXNA 5KTUA 4CUQA 4YAXA 2DVRA 4MEPA 5EA1A 1N72A 3IU5A 5CFWA 5CUCA 4HXRA 5I29A 1F68A 4BW3A 4MEOA 4MEQA 5DY7A 4MR4A 4QYLA 5L8TA 5DKDA 3S92A 5D3LA 3U5PA 2DATA 4CURA 3NXBA 3MUKA 3G0LA 4YABA 4IR4A 4UITA 5FFWA 5KTWA 5CZGA 5C87A 3UVXA 4N4FA 4LYWA 3GG3A 4YADA 2RNWA 4CUUA 4HXOA 2DVSA 3MULA 5II2A 5L97A 5HRWA 5LVRA 5BT4A 4YYHA 4NS5A 4UIUA 4KCXA 5DKCA 2D9EA 5D25A 5II1A 4TU4A 4N3WA 5F63A 5ENIA 4A9JA 3MB4A 5EQ1A 5JI8A 5JWMA 5IGNA 5EWHA 4J0RA 5EWWA 4QEUA 2DVQA 2OUOA 4LR6A 4UIZA 5K29A 5LJ1A 4QSWA 3SVFA 5ACYA 5CP5A 4QEWA 5C8GA 5FB0A 4QYDA 5L98A 4QSVA 5HQ5A 5CU8A 4IOOA 5D3HA 4UIXA 4O7CA 5CQ8A 4PCEA 4Z6IA 3SVHA 5D0CA 5CQAA 4NR9A 5D26A 5DW1A 4F3IA 3P1CA 4HBYA 5E9KA 4X2IA 4XUAA 5E9IA 5HFRA 4TZ2A 4J0SA 5EPSA 4CL9A 5D3JA 4LYIA 4QSRA 4Q0OA 3HMHA 4YYMA 5FG6A 5HRVA 2NXBA 5EGUA 4BJXA 2LSPB 3HMFA 5FH6A 5F1HA 4ZW1A 4CUPA 5AD2A 5EU1A 5I40A 3P1DA 5TCMA 4CLBA 3O34A 5DX4A 4BHWA 4NYWA 1ZS5A 4LZRA 3UVYA 2DWWA 5FE8A 5IG6A 2L84A 2L85A 3QZVA 3LQJA 5ETDA 4BW2A 4UYDA 5BT5A 3O35A 4WIVA 5F36A 3D7CA 3JVMA 4CUTA 5A5QA 5CUEA 5F2PA 2RFJA 3JVLA 4QEVA 5E3DA 5FFVA 2YEMA 5DYCA 5FE5A 5E7DA 5CQ5A 4FLPA 3UVWA 4QUUA 5IIDA 4TS8A 4Z6HA 3TLPA 5EPRA 5D3PA 4QR4A 3MB3A 4UIYA 5E9VA 5LUUA 3JVKA 5IGMA 4LYSA 2RI7A 5CRZA 5LJ0A 5I86A 5F1LA 1X0JA 2KTBB 4WHUA 4QSXA 5E9MA 4A9OA 4A9FA 5DLZA 5EWDA 4LRGA 4IORA 5CQ6A 4LZSA 4QZSA 2RO1A 4QR3A 4J3IA 4J1PA 3U5LA 4YK0A 4QR5A 4QSQA 4NUCA 4YH3A 3LXJA 4IR5A 5A5PA 5HRXA 4QY4A 4HXLA 4PS5A 4LC2A 5L99A 4TTEA 2YDWA 2R0VA 4UYEA 5HEMA 5CRMA 3ZYUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AKNA 3ERRA 5EICA 5IGLA 4MENA 3IU6A 4YBSA 4O74A 4NR5A 5D3TA 5ENJA 5J0DA 4O7FA 3Q2EA 4HXPA 4PCIA 5DFDA 5H1UA 5FG4A 5A85A 3MQMA 5F3AA 5CY9A 2OO1A 2MJVB 4QSSA 3U5OA 4LZ2A 5D3NA 5DYUA 4A9MA 5DFCA 5E9LA 4OGJA 5FDZA 4YBTA 4YYJA 5F62A 2RS9B 4YY4A 5A5NA 3G0JA 3DAIA 5AMFA 4C66A 5COIA 3QZTA 5C7NA 1WUGA 4UYFB 5CTLA 5CQ4A 4O76A 3LQIA 4TT6A 4YYGA 4CFKA 5ENFA 4MR5A 4XYAA 4PKLA 3O37A 4C67A 2G4AA 5ENEA 5FH7A 5CPEA 4YH4A 5LJ2A 5DBMA 5FFYA 5LKZA 5I88A 4ZC9A 4NUEA 5FE4A 2L5EA 4ALHA 5HM0A 4KV1A 5A7CA 4Z1SA 2I7KA 4YY6A 5HJCA 2YYNA 3UV5A 3UV2A 5CS8A 4OGIA 4QSTA 5CGPA 5EWCA 2YQDA 4NQMA 5DKHA 4BW4A 4XY9A 4MR3A 1WUMA 5DYAA 4LDFA 5FE3A 2FSAA 3U5MA 5AD3A 4NYVA 3UW9A 5F25A 4GPJA 2WP2A 5ETBA 3LQHA 5EP7A 2R10A 5CUAA 4KV4A 2WP1A 4YATA 5A5RA 3DWYA 2F6NA 4TT2A 5I89A 5L96A 3O36A 3UVDA 1EQFA 4N4IA 5LKXA 4N4GA 4O78A 2RNXA 4CFLA 5EVAA 5F61A 4A9KA 2I8NA 5HENA 5H1TA 5KTXA 1E6IA 5HCLA 4UYGA 4YBMA 5L8UA 3U5KA 4IR3A 5H85A 4YYKA 5ENGA 5AMEA 5HQ6A 4O7EA 2F6JA 4A9LA 4QB3A 5FG5A 3UV4A 5E3GA 4IOQA 5F5ZA 4RVRA 5G4SA 4DONA 5D24A 5CUDA 5CQ7A 4YYDA 4Q0NA 4ALGA 4BW1A 5EV9A 4YYNA 2D82A 5TB6A 5BT3A 4O71A 2DKWA 5D3RA 5H1VA 5FB1A 4NR6A 4OUFA 2H60A 3I3JA 4NUDA 4YC9A 4O72A 5HQ7A 4IR6A 3P5OA 4HXKA 4UYHA 5EK9A 1JSPB 3SVGA 3Q2FA 5E0RA 4NR7A 5C85A 3U5JA 5LVQA 4Z1QA 5A5OA 5DLXA 5IGKA 5FE9A 2DVVA 5FE7A 5LKTA 5I80A 3P1EA 5I83A 5EWVA 5F60A 4UIWA 3MXFA 5HELA 4O7BA 4NYXA 4XY8A 4HBVA 5A82A 3K2JA 4YYIA 4N4HA 5A83A 4CUSA 5EISA 4TYLA 5C4QA 5CUBA 3RCWA 5DFBA 5E9YA 3AQAA 4HXSA 5EM3A 4TT4A 4UYFA 4QBMA 2YELA 2E7OA 4QC1A 5I7YA 4UIVA 4HBXA 3O33A 4HXMA 4HBWA 2R0SA 3HMEA 4A9HA 5KO4A 4QSPA 3QZSA 4Y03A 4Z93A 4NRBA 5CQ3A 4QSUA 4NRCA 5EPBA 2R0YA 2N9GA 4NR8A 4QC3A 5FH8A 5FE6A 4O7AA 5D7XA 5FE2A 2YEKA 3U5NA 4ZQLA 4A9IA 5EI4A 5CUGA 2E3KA 4TZ8A 5D3SA 5FBXA 5C89A 4QUTA 5IBNA 3AADA 4MR6A 2OSSA 5CQTA 4O70A 5FE1A 4A9EA 4E96A 2RNYA 4TU6A 5G4RA 2E7NA 4A9NA 5A81A 5KHMA 5FE0A 5DYXA 5DW2A 2GRCA 5ENBA 3P1FA 4NR4A 3FKMX 5I7XA 5LKUA 4PY6A 4NXJA 4QNSA 5KU3A 4O77A 3JVJA 4NQNA 3ONIA 5E74A 1PUOA 2EJNA 5HFQA 5E73A 3LJWA 5HLSA 5ENHA 4WHWA 1JM4B 4PTBA 3S91A 5A5SA 4NRAA 2YW5A 5ENCA 4XUBA 5I1QA 4TQNA 4O75A 4HXNA 5KTUA 4CUQA 4YAXA 2DVRA 4MEPA 5EA1A 1N72A 3IU5A 5CFWA 5CUCA 4HXRA 5I29A 1F68A 4BW3A 4MEOA 4MEQA 5DY7A 4MR4A 4QYLA 5L8TA 5DKDA 3S92A 5D3LA 3U5PA 2DATA 4CURA 3NXBA 3MUKA 3G0LA 4YABA 4IR4A 4UITA 5FFWA 5KTWA 5CZGA 5C87A 3UVXA 4N4FA 4LYWA 3GG3A 4YADA 2RNWA 4CUUA 4HXOA 2DVSA 3MULA 5II2A 5L97A 5HRWA 5LVRA 5BT4A 4YYHA 4NS5A 4UIUA 4KCXA 5DKCA 2D9EA 5D25A 5II1A 4TU4A 4N3WA 5F63A 5ENIA 4A9JA 3MB4A 5EQ1A 5JI8A 5JWMA 5IGNA 5EWHA 4J0RA 5EWWA 4QEUA 2DVQA 2OUOA 4LR6A 4AI6A 3VKHA 4UIZA 5K29A 5LJ1A 4QSWA 3SVFA 5ACYA 5CP5A 4QEWA 5C8GA 5FB0A 4QYDA 5L98A 4QSVA 5HQ5A 5CU8A 4IOOA 5D3HA 4UIXA 4O7CA 5CQ8A 4PCEA 4Z6IA 3SVHA 5D0CA 5CQAA 4NR9A 5D26A 5DW1A 4F3IA 3P1CA 4HBYA 5E9KA 4X2IA 4XUAA 5E9IA 5HFRA 4TZ2A 4J0SA 5EPSA 4CL9A 5D3JA 4LYIA 4QSRA 4Q0OA 3HMHA 4YYMA 5FG6A 5HRVA 2NXBA 5EGUA 4BJXA 2LSPB 3HMFA 5FH6A 5F1HA 4ZW1A 4CUPA 5AD2A 5EU1A 5I40A 3P1DA 5TCMA 4CLBA 3O34A 5DX4A 4BHWA 4NYWA 1ZS5A 4LZRA 3UVYA 2DWWA 5FE8A 5IG6A 2L84A 2L85A 3QZVA 3LQJA 5ETDA 3D1DA 4BW2A 4UYDA 5BT5A 3O35A 1ZKRA 4WIVA 5F36A 4AKIA 3D7CA 3JVMA 4CUTA 5A5QA 5CUEA 4AKGA 5F2PA 3D1BA 2RFJA 3JVLA 4QEVA 5E3DA 5FFVA 2YEMA 5DYCA 5FE5A 3VKGA 5E7DA 5CQ5A 4FLPA 3UVWA 4QUUA 5IIDA 4TS8A 4Z6HA 3TLPA 5EPRA 5D3PA 4QR4A 3MB3A 4UIYA 5E9VA 5LUUA 3JVKA 5IGMA 4LYSA 2RI7A 5CRZA 5LJ0A 5I86A 5F1LA 1X0JA 2KTBB 4WHUA 4QSXA 5E9MA 4A9OA 4A9FA 5DLZA 4AKHA 5EWDA 4LRGA 4IORA 5CQ6A 4LZSA 4QZSA 2RO1A 4QR3A 4J3IA 4J1PA 3U5LA 4YK0A 4QR5A 4QSQA 4NUCA 4YH3A 3LXJA 4IR5A 5A5PA 5HRXA 4QY4A 4HXLA 4PS5A 4LC2A 5L99A 4TTEA 2YDWA 2R0VA 4UYEA 5HEMA 5CRMA 3ZYUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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