3UVYA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k16ack20ac)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
QTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvyA01
3TLPA 5D7XA 3S91A 5CUGA 4NUEA 4A9NA 5DYXA 5DLZA 5C85A 5CQ6A 5D3NA 5CGPA 3AQAA 4UIZA 4E96A 4O7EA 5CZGA 2DVSA 4TU6A 5HRVA 5CRMA 4O72A 4HXLA 3LQJA 3U5JA 3IU6A 5FG4A 2RNYA 3U5NA 5I7XA 3DAIA 5DYUA 4MEPA 4O7FA 4QEVA 2D82A 3D7CA 5DFBA 5FFWA 5A82A 2E7NA 2RNXA 4HXRA 5A5OA 5ENEA 4YBSA 4QSRA 4KV1A 4QC1A 5EWDA 4TTEA 4O71A 5LKZA 5CQ7A 3UV5A 5F63A 5HRWA 4C67A 4Q0NA 2FSAA 4DONA 5DYCA 5FBXA 5BT3A 3P1DA 4OGIA 5ENFA 4QSQA 3Q2FA 3UVYA 4LYSA 5KO4A 3JVKA 4A9IA 3K2JA 2DVVA 4UYFA 5EWWA 5FH8A 4YYDA 5EPBA 2YW5A 4O76A 4A9OA 5A83A 5F62A 5A5QA 3Q2EA 5HM0A 3IU5A 3O37A 5EWCA 5FB1A 4YBTA 5F1HA 4MR3A 4TS8A 4N4HA 4WHWA 5CQ3A 5F3AA 1N72A 4Z1QA 1E6IA 4NS5A 4CUTA 5HQ6A 5EICA 3RCWA 5E7DA 2RO1A 4YYHA 4YYKA 4ALGA 4NYVA 4N3WA 3U5KA 5CTLA 5E0RA 5HQ7A 5FB0A 4QNSA 4TT2A 5FE3A 5EU1A 5CUEA 4CUSA 5EVAA 5H1VA 2RS9B 5HENA 4CURA 3QZSA 5ENBA 4QEWA 4LYIA 5H1UA 5EM3A 5I7YA 4J1PA 5DYAA 2OO1A 5G4SA 3FKMX 3O34A 5FE5A 4Y03A 4CUPA 4NR5A 3I3JA 3LXJA 4PS5A 4A9FA 1ZS5A 5L99A 4IR6A 2YEKA 5BT4A 3GG3A 5DKDA 4IR5A 2F6NA 5II1A 5CUDA 2I7KA 5E9VA 5I29A 3HMHA 1EQFA 3ONIA 4QUUA 5EWHA 4N4GA 3MXFA 4O7AA 5E74A 3U5MA 5HJCA 5HFQA 5CFWA 4HBXA 5A5PA 2NXBA 5E9KA 2KTBB 3MB3A 5FE4A 5JI8A 4UYEA 2LSPB 4QR5A 2DATA 4QB3A 2R0YA 3P1EA 5IGNA 2DKWA 5HELA 5KTXA 4O7BA 4ZQLA 4IR3A 5F2PA 4WIVA 5A5RA 5E9MA 5CUCA 5DKHA 5EQ1A 3U5OA 4CUQA 5COIA 3MB4A 5CY9A 5CU8A 4O78A 4NUCA 2R10A 5D3JA 2YYNA 5JWMA 2R0SA 2L85A 5C4QA 5C89A 5ENIA 1WUMA 4MEQA 4NRAA 4QSVA 4YK0A 4YBMA 5HFRA 5D3HA 5AD3A 2YEMA 4X2IA 5D25A 4CFKA 4PKLA 4YYNA 4YH4A 5F61A 4UIVA 5EP7A 5F25A 5EK9A 5IGKA 5A85A 3JVJA 4MEOA 5L97A 4CUUA 4O70A 5FFVA 4J3IA 4HXKA 4QZSA 4XY8A 5E3DA 4HXOA 3MULA 4A9JA 5AD2A 5HRXA 5D24A 4TT4A 5A7CA 4LDFA 5C87A 4A9EA 2L84A 4ZW1A 4N4FA 4MR6A 5A5NA 2WP2A 5E3GA 5L98A 5LVQA 4YAXA 5F5ZA 4YY6A 3SVGA 5G4RA 5CUBA 4NQMA 5ENHA 4O77A 3DWYA 4QSXA 5FDZA 5A5SA 5FE8A 3UV4A 1WUGA 4WHUA 4CFLA 2WP1A 4CLBA 4NR9A 5E9LA 5KU3A 2RFJA 5HLSA 5LJ2A 4IOOA 4QR4A 5FE0A 2GRCA 4QSTA 5IGLA 3G0JA 5I86A 2L5EA 4QYLA 4PCIA 5LJ0A 5D3TA 5J0DA 4UYHA 5DW2A 4IORA 3QZVA 2DVRA 5FH6A 4A9LA 3LQIA 3MUKA 3LJWA 4OGJA 5IIDA 4HXNA 3ZYUA 3P5OA 4XYAA 4HXPA 5L8UA 4QR3A 2OUOA 5I80A 4MR4A 2H60A 3G0LA 4UIWA 5EPSA 5C7NA 4QSUA 4O75A 5FE7A 5FE1A 4HBWA 5D3PA 5L8TA 5FH7A 2R0VA 5E73A 4UIYA 4ALHA 4FLPA 4BW2A 3O33A 5F36A 4NR4A 5FFYA 5I88A 2OSSA 5TB6A 4LR6A 3O36A 2YELA 3JVMA 4J0RA 4BJXA 3SVHA 4LZ2A 4A9HA 4YC9A 3QZTA 5C8GA 4QYDA 2RNWA 5CQAA 4IR4A 4O7CA 4TYLA 3UW9A 2F6JA 4LYWA 4A9MA 4YABA 5IGMA 3S92A 5LKTA 4YYMA 2E3KA 4PTBA 5CQ4A 3U5LA 4QBMA 5CP5A 4NXJA 2YQDA 5I83A 5A81A 5D26A 4LZRA 5EGUA 5FE2A 4TQNA 4GPJA 4YH3A 4LC2A 3UV2A 4BW1A 5HCLA 4BW3A 5HEMA 5CPEA 5I89A 3P1FA 4UITA 5DY7A 3LQHA 4Z6HA 5LUUA 5L96A 4Z93A 4NR8A 4LRGA 5EPRA 5F60A 5DW1A 3U5PA 3O35A 2DVQA 5D3SA 4AKNA 4NR6A 5K29A 2DWWA 5FG5A 5CQTA 4NUDA 3HMFA 4XUBA 5ACYA 1X0JA 5I40A 1JSPB 5DFDA 4LZSA 3NXBA 4TU4A 4XY9A 3JVLA 5AMFA 5IBNA 5CQ8A 5HQ5A 1F68A 3HMEA 4QSPA 4MR5A 3MQMA 4MENA 5D3RA 5IG6A 4UYFB 5ENJA 4IOQA 4F3IA 4YYGA 5EISA 4NRCA 4YYIA 5ETDA 3UVWA 4BW4A 4A9KA 5D3LA 4QSSA 2D9EA 5ENGA 2MJVB 5CRZA 5LJ1A 5FE6A 4TT6A 4PY6A 4QY4A 4Z1SA 1JM4B 5EV9A 5F1LA 5FG6A 4QC3A 3SVFA 4NQNA 4HBYA 3P1CA 4Q0OA 4UYDA 5BT5A 5TCMA 4UIXA 4UIUA 4NRBA 5LVRA 4OUFA 4RVRA 4CL9A 5I1QA 5H85A 4KCXA 4NYWA 5EI4A 4UYGA 4QSWA 5DBMA 5DLXA 5CS8A 4YADA 5ETBA 4TZ2A 5DKCA 3AADA 4BHWA 2G4AA 4HXMA 5CUAA 5EA1A 4C66A 5D0CA 5DX4A 3UVDA 4HXSA 4NR7A 5KTUA 4KV4A 5LKUA 5FE9A 5E9YA 4YYJA 4YATA 5AMEA 5ENCA 4XUAA 5KTWA 4HBVA 5DFCA 2E7OA 4N4IA 3UVXA 4O74A 4TZ8A 2YDWA 4NYXA 5EWVA 5LKXA 4ZC9A 5II2A 4YY4A 5H1TA 2I8NA 5KHMA 4QUTA 2N9GA 4PCEA 4Z6IA 2RI7A 5E9IA 4QEUA 5CQ5A 4J0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TLPA 5D7XA 3S91A 5CUGA 4NUEA 4A9NA 5DYXA 5DLZA 5C85A 5CQ6A 5D3NA 5CGPA 3AQAA 4UIZA 4E96A 4O7EA 5CZGA 2DVSA 4TU6A 5HRVA 5CRMA 4O72A 4HXLA 3LQJA 3U5JA 3IU6A 5FG4A 4AKIA 2RNYA 3U5NA 5I7XA 3DAIA 5DYUA 4MEPA 4O7FA 4QEVA 2D82A 3D7CA 5DFBA 5FFWA 5A82A 2E7NA 2RNXA 4HXRA 5A5OA 5ENEA 4YBSA 4QSRA 4KV1A 4QC1A 5EWDA 4TTEA 4O71A 5LKZA 5CQ7A 3UV5A 5F63A 5HRWA 4C67A 4Q0NA 2FSAA 4DONA 5DYCA 5FBXA 5BT3A 3P1DA 4OGIA 5ENFA 4QSQA 3Q2FA 3UVYA 4LYSA 5KO4A 3JVKA 4A9IA 3K2JA 2DVVA 4UYFA 5EWWA 5FH8A 4YYDA 5EPBA 2YW5A 4O76A 4A9OA 5A83A 4AKGA 5F62A 5A5QA 3Q2EA 5HM0A 3IU5A 3O37A 5EWCA 5FB1A 4YBTA 5F1HA 4MR3A 4TS8A 4N4HA 4WHWA 5CQ3A 5F3AA 1N72A 4Z1QA 1E6IA 4NS5A 4CUTA 5HQ6A 5EICA 3RCWA 5E7DA 2RO1A 4YYHA 4YYKA 4ALGA 4NYVA 4N3WA 3U5KA 5CTLA 5E0RA 5HQ7A 5FB0A 4QNSA 4TT2A 5FE3A 5EU1A 5CUEA 4CUSA 5EVAA 5H1VA 2RS9B 5HENA 4CURA 3VKHA 3QZSA 5ENBA 4QEWA 4LYIA 5H1UA 5EM3A 5I7YA 4J1PA 5DYAA 2OO1A 5G4SA 3FKMX 3O34A 5FE5A 4Y03A 4CUPA 4NR5A 3I3JA 3LXJA 4PS5A 4A9FA 1ZS5A 5L99A 3D1BA 4IR6A 2YEKA 5BT4A 3GG3A 5DKDA 4IR5A 2F6NA 5II1A 5CUDA 2I7KA 5E9VA 5I29A 3HMHA 1EQFA 3ONIA 4QUUA 5EWHA 4N4GA 3MXFA 4O7AA 5E74A 3U5MA 5HJCA 5HFQA 5CFWA 4HBXA 5A5PA 2NXBA 5E9KA 2KTBB 3MB3A 5FE4A 5JI8A 4UYEA 2LSPB 4QR5A 2DATA 4QB3A 2R0YA 3P1EA 5IGNA 2DKWA 5HELA 5KTXA 4O7BA 4ZQLA 4IR3A 5F2PA 4WIVA 5A5RA 5E9MA 5CUCA 5DKHA 5EQ1A 3U5OA 4CUQA 5COIA 3MB4A 5CY9A 5CU8A 3VKGA 4O78A 4NUCA 2R10A 5D3JA 2YYNA 5JWMA 2R0SA 2L85A 5C4QA 5C89A 5ENIA 1WUMA 4MEQA 4NRAA 4QSVA 4YK0A 4YBMA 5HFRA 5D3HA 5AD3A 2YEMA 4X2IA 5D25A 4CFKA 4PKLA 4YYNA 4YH4A 5F61A 3D1DA 4UIVA 5EP7A 5F25A 5EK9A 5IGKA 5A85A 3JVJA 4MEOA 5L97A 4CUUA 4O70A 5FFVA 4J3IA 4HXKA 4QZSA 4XY8A 5E3DA 4HXOA 3MULA 4A9JA 5AD2A 5HRXA 5D24A 4TT4A 5A7CA 4LDFA 5C87A 4A9EA 2L84A 4ZW1A 4N4FA 4MR6A 5A5NA 2WP2A 5E3GA 5L98A 5LVQA 4YAXA 5F5ZA 4YY6A 3SVGA 5G4RA 5CUBA 4NQMA 5ENHA 4O77A 3DWYA 4QSXA 5FDZA 5A5SA 5FE8A 3UV4A 1WUGA 4WHUA 4CFLA 2WP1A 4CLBA 4NR9A 5E9LA 5KU3A 2RFJA 5HLSA 5LJ2A 4IOOA 4QR4A 5FE0A 2GRCA 4QSTA 5IGLA 3G0JA 5I86A 2L5EA 4QYLA 4PCIA 5LJ0A 5D3TA 5J0DA 4UYHA 5DW2A 4IORA 3QZVA 2DVRA 5FH6A 4A9LA 3LQIA 4AI6A 3MUKA 3LJWA 4OGJA 5IIDA 4HXNA 3ZYUA 3P5OA 4XYAA 4HXPA 5L8UA 4QR3A 2OUOA 5I80A 4MR4A 3G0LA 2H60A 4UIWA 5EPSA 5C7NA 4QSUA 4O75A 5FE7A 5FE1A 4HBWA 5D3PA 5L8TA 1PUOA 5FH7A 2R0VA 5E73A 4UIYA 4ALHA 4FLPA 4BW2A 1ZKRA 3O33A 5F36A 4NR4A 5FFYA 5I88A 2OSSA 5TB6A 4LR6A 3O36A 2YELA 3JVMA 4J0RA 4BJXA 3SVHA 4LZ2A 4A9HA 4YC9A 3QZTA 5C8GA 4QYDA 2RNWA 5CQAA 4IR4A 4O7CA 4TYLA 3UW9A 2F6JA 4LYWA 4A9MA 4YABA 5IGMA 3S92A 5LKTA 4AKHA 4YYMA 2E3KA 4PTBA 5CQ4A 3U5LA 4QBMA 5CP5A 4NXJA 2YQDA 5I83A 5A81A 5D26A 4LZRA 5EGUA 5FE2A 4TQNA 4GPJA 4YH3A 4LC2A 3UV2A 4BW1A 5HCLA 4BW3A 5HEMA 5CPEA 5I89A 3P1FA 4UITA 5DY7A 3LQHA 4Z6HA 5LUUA 5L96A 4Z93A 4NR8A 4LRGA 5EPRA 5F60A 5DW1A 3U5PA 3O35A 2DVQA 5D3SA 4AKNA 3ERRA 4NR6A 5K29A 2DWWA 5FG5A 5CQTA 4NUDA 3HMFA 4XUBA 5ACYA 1X0JA 5I40A 1JSPB 5DFDA 4LZSA 3NXBA 4TU4A 4XY9A 3JVLA 5AMFA 5IBNA 5CQ8A 5HQ5A 1F68A 3HMEA 4QSPA 4MR5A 3MQMA 4MENA 5D3RA 5IG6A 4UYFB 5ENJA 4IOQA 4F3IA 4YYGA 5EISA 4NRCA 4YYIA 5ETDA 3UVWA 4BW4A 4A9KA 5D3LA 4QSSA 2D9EA 5ENGA 2MJVB 5CRZA 5LJ1A 5FE6A 4TT6A 4PY6A 4QY4A 4Z1SA 1JM4B 5EV9A 5F1LA 5FG6A 4QC3A 3SVFA 4NQNA 4HBYA 3P1CA 4Q0OA 4UYDA 5BT5A 5TCMA 4UIXA 4UIUA 4NRBA 5LVRA 4OUFA 4RVRA 4CL9A 5I1QA 5H85A 4KCXA 2EJNA 4NYWA 5EI4A 4UYGA 4QSWA 5DBMA 5DLXA 5CS8A 4YADA 5ETBA 4TZ2A 5DKCA 3AADA 4BHWA 2G4AA 4HXMA 5CUAA 5EA1A 4C66A 5D0CA 5DX4A 3UVDA 4HXSA 4NR7A 5KTUA 4KV4A 5LKUA 5FE9A 5E9YA 4YYJA 4YATA 5AMEA 5ENCA 4XUAA 5KTWA 4HBVA 5DFCA 2E7OA 4N4IA 3UVXA 4O74A 4TZ8A 2YDWA 4NYXA 5EWVA 5LKXA 4ZC9A 5II2A 4YY4A 5H1TA 2I8NA 5KHMA 4QUTA 2N9GA 4PCEA 4Z6IA 2RI7A 5E9IA 4QEUA 5CQ5A 4J0SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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