3UVYA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k16ack20ac)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
QTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/protein binding
total genus 36
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvyA01
3LQIA 4NYXA 3UVDA 4QSQA 4HXMA 2L5EA 3O34A 5EA1A 5LVQA 2RO1A 5IGKA 4YYNA 5AD3A 4A9LA 5IGNA 2YW5A 4HXRA 5F1HA 4LYWA 5IGMA 5FE7A 5D3RA 4MR4A 4MEQA 3IU6A 4BJXA 4NRCA 4CFKA 4IR3A 4TS8A 3U5MA 3SVHA 4N4IA 2OO1A 4Q0NA 3LJWA 3D7CA 3TLPA 4QNSA 5L8UA 2RS9B 4N4HA 5EICA 4O76A 4BHWA 4MR3A 5A5QA 5EWDA 4Z1SA 5EU1A 5DLXA 5EWCA 3SVGA 4J0RA 2L85A 4TZ8A 4KCXA 3UVWA 5FE4A 5COIA 4UIWA 4A9EA 5LJ2A 4QSTA 5CUCA 5E74A 5FE6A 5KU3A 4QB3A 5CUBA 2R0VA 3NXBA 4BW1A 5C7NA 5DFCA 4CUTA 5LJ0A 3LXJA 3QZSA 3I3JA 5CTLA 5FH7A 4X2IA 2NXBA 5DKCA 4C67A 2LSPB 5HQ5A 3G0JA 5DYAA 4UYGA 5CGPA 5FBXA 4MEOA 4Y03A 5L97A 3S92A 4BW4A 5BT5A 4NR4A 4HXLA 4HXOA 4YC9A 4QSUA 5EM3A 4XY8A 5FB0A 4UYDA 2KTBB 4A9OA 3P1FA 3LQJA 5A7CA 2R10A 3FKMX 4NUDA 5D3JA 5EK9A 5KO4A 5CQ6A 5EVAA 5CQ7A 4CUUA 5ETBA 3HMHA 4XYAA 4QYLA 5D3TA 3O35A 4QYDA 4HXSA 5CPEA 5LKZA 4YYMA 4QEWA 4QSSA 5BT3A 2DVQA 5C87A 5FE8A 5A82A 5I7XA 3DAIA 2OSSA 5CS8A 5I89A 5FE9A 4UYFA 3SVFA 4A9MA 4XUBA 5L8TA 4YYHA 5ACYA 4O72A 4QR4A 3MB3A 5EWVA 2H60A 5DW1A 2DWWA 3LQHA 5F3AA 2RI7A 4O75A 4TZ2A 3HMEA 4YH4A 5HLSA 5H1TA 4NYWA 5FDZA 5H1VA 2F6JA 5E9LA 4LZRA 3U5JA 5HELA 2D9EA 5A85A 4N4FA 5CFWA 3G0LA 5HFRA 4WHWA 3JVMA 4IOQA 2E7OA 2YELA 3ONIA 4QBMA 5HCLA 5DYCA 4QEUA 2DKWA 5F61A 3UV4A 5TB6A 5CY9A 5LVRA 2DVSA 4UITA 4NR5A 4GPJA 4O77A 5C85A 4NYVA 4YBSA 5C4QA 4N4GA 4YYJA 4TU6A 5E9VA 5LKXA 4Z1QA 2DVRA 4WHUA 4PKLA 4J0SA 5KHMA 3MXFA 4A9IA 4FLPA 5FG4A 4MEPA 5I40A 5G4SA 5E9IA 4UIZA 3QZVA 3RCWA 5TCMA 1X0JA 5CU8A 4CUPA 2R0SA 5A5SA 5HJCA 5IIDA 5LKTA 5HEMA 5AD2A 4MENA 5A5RA 4TU4A 5HFQA 5K29A 3JVLA 4O7FA 5HRVA 5FG6A 4J3IA 4O78A 5HRWA 5ENIA 5A5OA 4HBYA 4IR5A 4TT6A 4C66A 4YYIA 5ENJA 4LZ2A 4QR5A 5F63A 3AADA 4QY4A 4F3IA 5II2A 4RVRA 5IBNA 5HM0A 4UYFB 4PCIA 4QZSA 3U5NA 4O74A 4QSXA 3MB4A 4Z93A 5EPSA 4NXJA 4YY6A 4YK0A 2FSAA 5FE5A 3UV5A 5I86A 5CRMA 2E7NA 5EPBA 4A9NA 4YABA 5KTXA 4O7BA 4CL9A 5H1UA 2YEMA 4CFLA 4DONA 3U5PA 4CUSA 2E3KA 5DFBA 4HXPA 3JVKA 5D3SA 5C89A 4ALHA 4PS5A 5HRXA 5CP5A 4IOOA 1WUMA 4HXKA 3U5LA 2RNWA 5L98A 4QEVA 3O36A 4NR6A 4YATA 4YYKA 2DVVA 4NR7A 4Z6IA 4A9JA 4A9KA 1JM4B 1F68A 5CQ8A 5JI8A 2YYNA 3O37A 5EI4A 5A5NA 5FE0A 5E3GA 4O7CA 4NR8A 2G4AA 5D26A 4QSWA 4NUCA 4LYSA 4MR6A 4YY4A 5EGUA 4YBTA 2GRCA 4UIUA 2MJVB 5L99A 4YYDA 2WP1A 5DKDA 5IG6A 5EISA 3O33A 5FH8A 3UV2A 2WP2A 5I29A 4PCEA 4OGJA 5HQ6A 5H85A 5AMFA 5HENA 2N9GA 4LDFA 4MR5A 4QSVA 5D3PA 5F2PA 5D24A 3IU5A 4O70A 4IR4A 4TT4A 3P1CA 3U5KA 5D7XA 3JVJA 3U5OA 5F1LA 2YDWA 4YAXA 4KV4A 4PTBA 5DLZA 2RNXA 3UVXA 5EP7A 3Q2FA 5E0RA 5CQTA 4QC3A 3MQMA 5I80A 2YEKA 4YBMA 4NS5A 5E73A 4LR6A 5CQ3A 5DYXA 5CRZA 5FFYA 5LKUA 4QUTA 4UIXA 5CQ5A 5CUAA 3Q2EA 4TTEA 4ZC9A 2D82A 4LC2A 4IR6A 2OUOA 5L96A 5F62A 4XUAA 5DYUA 5KTWA 5D0CA 5II1A 4YH3A 5BT4A 5E3DA 4HBWA 1JSPB 4UYHA 5EV9A 4J1PA 1WUGA 4Z6HA 5J0DA 3ZYUA 5DKHA 4QSPA 5EPRA 5C8GA 4BW2A 3GG3A 4LRGA 5IGLA 2I7KA 4NRAA 4TT2A 4Q0OA 4O7AA 5DBMA 3MUKA 4QSRA 5KTUA 4OGIA 4O7EA 5D3LA 4E96A 5DY7A 5E9MA 5FFVA 4QUUA 3UVYA 5F60A 5E9YA 3P5OA 5G4RA 2F6NA 2L84A 4OUFA 5FG5A 3MULA 5F5ZA 5ETDA 4UIYA 2I8NA 4CURA 5FE1A 1N72A 5I83A 5A83A 1ZS5A 5CQAA 5I7YA 4TYLA 4BW3A 4HBVA 5EQ1A 4AKNA 4CLBA 5EWHA 4ALGA 5AMEA 5ENEA 3K2JA 4A9HA 4IORA 5FH6A 5E9KA 3QZTA 5EWWA 5A81A 4HXNA 3DWYA 4LYIA 4YYGA 1E6IA 5ENCA 4ZQLA 4QC1A 2YQDA 5FB1A 5CUDA 3S91A 5DX4A 4NQNA 5LJ1A 2DATA 5ENHA 5FFWA 2R0YA 5D25A 4NRBA 4HBXA 3P1DA 5JWMA 2RNYA 5CUEA 4PY6A 4WIVA 5CQ4A 4A9FA 1EQFA 4YADA 5DFDA 5HQ7A 5FE3A 3UW9A 4UIVA 4NUEA 5A5PA 5ENBA 5I1QA 5E7DA 3AQAA 3P1EA 3HMFA 5ENGA 5I88A 4CUQA 5F25A 2RFJA 5LUUA 4N3WA 5CUGA 4LZSA 5CZGA 4TQNA 5D3NA 4NQMA 4QR3A 4UYEA 4NR9A 5D3HA 5ENFA 5FE2A 4O71A 4KV1A 4ZW1A 5F36A 4XY9A 5DW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LQIA 4NYXA 3UVDA 4QSQA 4HXMA 2L5EA 3O34A 5EA1A 5LVQA 2RO1A 5IGKA 4YYNA 5AD3A 4A9LA 5IGNA 2YW5A 4HXRA 5F1HA 4LYWA 5IGMA 5FE7A 5D3RA 4MR4A 4MEQA 3IU6A 4BJXA 4NRCA 4CFKA 4IR3A 4TS8A 3U5MA 3SVHA 4N4IA 2OO1A 4Q0NA 3LJWA 3D7CA 3TLPA 4QNSA 5L8UA 2RS9B 4N4HA 5EICA 4O76A 4BHWA 4MR3A 5A5QA 5EWDA 4Z1SA 5EU1A 5DLXA 5EWCA 3SVGA 4J0RA 2L85A 4TZ8A 4KCXA 4AI6A 3UVWA 5FE4A 5COIA 4UIWA 4A9EA 5LJ2A 4QSTA 2EJNA 5CUCA 5E74A 5FE6A 5KU3A 4QB3A 5CUBA 2R0VA 3NXBA 4BW1A 5C7NA 5DFCA 4CUTA 5LJ0A 3LXJA 3QZSA 3I3JA 5CTLA 5FH7A 4X2IA 2NXBA 5DKCA 4C67A 2LSPB 5HQ5A 3G0JA 5DYAA 4UYGA 5CGPA 5FBXA 4MEOA 4Y03A 5L97A 3S92A 4BW4A 5BT5A 4NR4A 4HXLA 4HXOA 4YC9A 4QSUA 5EM3A 4XY8A 5FB0A 4UYDA 2KTBB 4A9OA 3P1FA 3LQJA 5A7CA 2R10A 3FKMX 4NUDA 5D3JA 5EK9A 5KO4A 5CQ6A 5EVAA 5CQ7A 4CUUA 5ETBA 3HMHA 4XYAA 4QYLA 5D3TA 3O35A 4QYDA 4HXSA 5CPEA 5LKZA 4YYMA 4QEWA 4QSSA 5BT3A 2DVQA 5C87A 5FE8A 5A82A 5I7XA 3DAIA 2OSSA 5CS8A 5I89A 5FE9A 4UYFA 3SVFA 4A9MA 4XUBA 5L8TA 4YYHA 5ACYA 4O72A 4QR4A 3MB3A 5EWVA 2H60A 5DW1A 2DWWA 3LQHA 5F3AA 2RI7A 4O75A 4TZ2A 3HMEA 4YH4A 5HLSA 5H1TA 4NYWA 4AKIA 5FDZA 5H1VA 2F6JA 5E9LA 4LZRA 3U5JA 5HELA 3D1BA 2D9EA 5A85A 4N4FA 5CFWA 3G0LA 5HFRA 4WHWA 3JVMA 4IOQA 2E7OA 2YELA 3ONIA 4QBMA 5HCLA 5DYCA 4QEUA 2DKWA 5F61A 3UV4A 5TB6A 5CY9A 5LVRA 2DVSA 4UITA 4NR5A 4GPJA 4O77A 5C85A 4NYVA 4YBSA 5C4QA 4N4GA 4YYJA 4TU6A 5E9VA 5LKXA 4Z1QA 2DVRA 4WHUA 4PKLA 4J0SA 5KHMA 3MXFA 4A9IA 4FLPA 5FG4A 4MEPA 5I40A 5G4SA 5E9IA 4UIZA 3QZVA 3RCWA 5TCMA 1X0JA 5CU8A 4CUPA 2R0SA 5A5SA 5HJCA 5IIDA 5LKTA 5HEMA 5AD2A 4MENA 5A5RA 4TU4A 5HFQA 5K29A 3JVLA 4O7FA 5HRVA 5FG6A 4J3IA 4O78A 5HRWA 5ENIA 5A5OA 4HBYA 4IR5A 4TT6A 4C66A 4YYIA 5ENJA 4LZ2A 4QR5A 5F63A 3AADA 4QY4A 4F3IA 5II2A 4RVRA 5IBNA 5HM0A 4UYFB 4PCIA 4QZSA 3U5NA 4O74A 4QSXA 3MB4A 4Z93A 5EPSA 4NXJA 4YY6A 4YK0A 2FSAA 5FE5A 3UV5A 5I86A 5CRMA 2E7NA 5EPBA 4A9NA 4YABA 5KTXA 4O7BA 4CL9A 5H1UA 2YEMA 4CFLA 4DONA 3U5PA 4CUSA 2E3KA 5DFBA 4HXPA 3JVKA 5D3SA 5C89A 4ALHA 4PS5A 5HRXA 5CP5A 4IOOA 1WUMA 4HXKA 3U5LA 2RNWA 5L98A 4QEVA 3O36A 4NR6A 4YATA 4YYKA 2DVVA 4NR7A 4Z6IA 4A9JA 4A9KA 1JM4B 1F68A 5CQ8A 5JI8A 2YYNA 3O37A 5EI4A 5A5NA 5FE0A 1ZKRA 5E3GA 4O7CA 4NR8A 2G4AA 5D26A 4QSWA 4NUCA 4LYSA 4MR6A 4YY4A 5EGUA 4YBTA 2GRCA 4UIUA 2MJVB 5L99A 4YYDA 2WP1A 5DKDA 5IG6A 5EISA 3O33A 5FH8A 3UV2A 4AKGA 2WP2A 5I29A 4PCEA 4OGJA 5HQ6A 5H85A 5AMFA 5HENA 2N9GA 4LDFA 4MR5A 3VKGA 4QSVA 5D3PA 5F2PA 1PUOA 3IU5A 5D24A 4O70A 4IR4A 4TT4A 3P1CA 3U5KA 5D7XA 3JVJA 3U5OA 5F1LA 2YDWA 4YAXA 4KV4A 4PTBA 5DLZA 2RNXA 3UVXA 5EP7A 3Q2FA 5E0RA 5CQTA 4QC3A 3MQMA 5I80A 2YEKA 4YBMA 4NS5A 5E73A 4LR6A 5CQ3A 5DYXA 5CRZA 5FFYA 5LKUA 4QUTA 4UIXA 5CQ5A 5CUAA 3Q2EA 3VKHA 4TTEA 4ZC9A 2D82A 4LC2A 4IR6A 2OUOA 5L96A 5F62A 4XUAA 5DYUA 5KTWA 5D0CA 5II1A 4YH3A 5BT4A 5E3DA 4HBWA 1JSPB 4UYHA 5EV9A 4J1PA 1WUGA 4Z6HA 5J0DA 3ZYUA 5DKHA 4QSPA 5EPRA 5C8GA 3ERRA 3GG3A 4LRGA 4BW2A 5IGLA 2I7KA 4NRAA 4TT2A 4Q0OA 4O7AA 5DBMA 3MUKA 4QSRA 5KTUA 4OGIA 3D1DA 4O7EA 5D3LA 4E96A 5DY7A 5E9MA 5FFVA 4QUUA 3UVYA 5F60A 5E9YA 3P5OA 5G4RA 2F6NA 2L84A 4OUFA 5FG5A 3MULA 5F5ZA 5ETDA 4UIYA 2I8NA 4CURA 5FE1A 1N72A 5I83A 5A83A 1ZS5A 5CQAA 5I7YA 4TYLA 4BW3A 4HBVA 5EQ1A 4AKNA 4CLBA 5EWHA 4ALGA 5AMEA 5ENEA 3K2JA 4A9HA 4IORA 5FH6A 5E9KA 3QZTA 5EWWA 5A81A 4HXNA 3DWYA 4LYIA 4YYGA 1E6IA 5ENCA 4ZQLA 4QC1A 2YQDA 5FB1A 5CUDA 3S91A 5DX4A 4NQNA 5LJ1A 2DATA 5ENHA 5FFWA 2R0YA 5D25A 4NRBA 4HBXA 3P1DA 5JWMA 2RNYA 5CUEA 4PY6A 4WIVA 5CQ4A 4A9FA 1EQFA 4YADA 5DFDA 5HQ7A 5FE3A 3UW9A 4UIVA 4NUEA 5A5PA 5ENBA 5I1QA 5E7DA 3AQAA 4AKHA 3P1EA 3HMFA 5ENGA 5I88A 4CUQA 5F25A 2RFJA 5LUUA 4N3WA 5CUGA 4LZSA 5CZGA 4TQNA 5D3NA 4NQMA 4QR3A 4UYEA 4NR9A 5D3HA 5ENFA 5FE2A 4O71A 4KV1A 4ZW1A 5F36A 4XY9A 5DW2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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