5D26A

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd28
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d26A01
4CLBA 4YAXA 4HXSA 5EI4A 2F6JA 3G0LA 4Z6HA 5EWHA 4O74A 5I7YA 4N4FA 5AD3A 5I7XA 5CRZA 5CPEA 4YC9A 4YBSA 4HXNA 4NS5A 5H1VA 3UVDA 4MR3A 5L97A 3O33A 5A5SA 5TB6A 5LKXA 4OGJA 5A5NA 4BHWA 2G4AA 5A5QA 4WHUA 2WP1A 5DY7A 3ZYUA 3O34A 5HQ7A 4UYDA 4CUTA 5EWCA 5DFBA 5F63A 5EGUA 1JM4B 5HFRA 5E9MA 5FE4A 4OUFA 2RNYA 4QC3A 4TU6A 4NR5A 5HM0A 5EPSA 5FB1A 5DYXA 4A9NA 5FE1A 3P1DA 4PTBA 4QR3A 4O7CA 5F1LA 5HRXA 4MEOA 5CP5A 4BW2A 5LJ1A 5C87A 5DKHA 5L8TA 5EWDA 4QNSA 4O7FA 5CZGA 3K2JA 4HBVA 4TT6A 4MENA 3ONIA 5CY9A 3S92A 5LJ2A 5E74A 1F68A 5F3AA 5HQ6A 4ALGA 5I80A 5KTUA 4X2IA 3JVKA 4CL9A 4O75A 3NXBA 3Q2EA 4XYAA 5EU1A 4LRGA 5EQ1A 4BJXA 3O36A 4BW4A 4HXLA 2D82A 3QZTA 4O71A 5ENHA 5CFWA 5EISA 4YYJA 4A9OA 4OGIA 5A82A 5LJ0A 5FG6A 5A5RA 5I88A 3LJWA 4YYKA 5CQ7A 4ZW1A 3U5PA 4O76A 4ZQLA 4IR5A 4NYVA 5C7NA 5K29A 3MB4A 2NXBA 4YY6A 4YYHA 5A7CA 4KV1A 5D3NA 4QSQA 4O7BA 5FE8A 3DWYA 4LC2A 4CFKA 4NR6A 1EQFA 5HENA 5C8GA 5HFQA 4O72A 1N72A 4F3IA 3QZVA 4TZ2A 5CUAA 5CUEA 4YYGA 4CUUA 5A81A 5I89A 2RFJA 4DONA 2DVQA 5E7DA 4A9LA 5IGMA 5D3HA 5DW1A 4YYMA 4UYGA 4TYLA 4O78A 4N3WA 5DX4A 5D3TA 5CS8A 5II2A 5FE5A 4QR4A 3MXFA 4IR6A 5C4QA 5DYAA 3MUKA 5II1A 5HJCA 4BW1A 5DYUA 4Z6IA 3TLPA 5EICA 4QSPA 4YBTA 2N9GA 5LKTA 4O77A 5KTWA 5LKZA 5FBXA 4O7AA 5FE7A 3UVXA 5ENJA 3LXJA 5CQ5A 4UIVA 5E3DA 4LZ2A 3LQHA 4YYIA 3HMFA 5FG5A 4TU4A 5ETBA 4XY8A 4HXRA 5FH7A 5EPBA 5F36A 5F2PA 2R10A 5G4SA 4QSWA 5HEMA 2YEKA 4QBMA 4YH3A 4PY6A 5I29A 4MEPA 3IU6A 4NYWA 5FFVA 5HRVA 4TTEA 3RCWA 5EVAA 3IU5A 5EM3A 1JSPB 5A85A 1WUGA 5ENBA 4LYSA 4IOOA 5ENIA 4J0SA 3UV2A 2R0VA 4QR5A 4NR8A 2OO1A 5F62A 2E7OA 5CUCA 5CRMA 5AMEA 3MQMA 5HLSA 5D3RA 3DAIA 3GG3A 4BW3A 5DFCA 5F1HA 4A9MA 3U5MA 4N4IA 5ETDA 3UV4A 3Q2FA 4LR6A 5ENGA 2KTBB 5KO4A 5E9KA 3D7CA 5D24A 4MR4A 2RI7A 2E3KA 4C67A 3U5OA 4YATA 5EWVA 5HRWA 4YADA 5E3GA 3U5JA 4NRAA 3O35A 1E6IA 5A83A 5H1TA 3JVLA 5TCMA 2L85A 5EA1A 5LVRA 5E9IA 5F60A 5E9YA 5CGPA 4FLPA 5ENCA 2D9EA 5E0RA 4UYFB 3SVHA 2FSAA 5FE0A 5LVQA 5DLXA 4NQMA 5FE6A 2DWWA 4YYNA 2OUOA 4YY4A 4YK0A 2OSSA 4TT4A 4IOQA 4NR7A 4HBXA 5DW2A 4NYXA 4NR9A 5EV9A 3AQAA 5CQTA 3LQIA 4XUAA 3JVJA 5IGKA 3P1CA 5CUGA 4QC1A 5I1QA 3O37A 5FFWA 4RVRA 4HXKA 5E9VA 5D0CA 5D3JA 4TQNA 3LQJA 4CUQA 3UVWA 3I3JA 5IGLA 5CU8A 2DVSA 4NXJA 4E96A 5DFDA 4Z1QA 4LYWA 5HCLA 4UITA 4UIXA 4UYHA 2I8NA 5AD2A 4UIZA 4HXMA 4PCIA 4TZ8A 5FDZA 3UW9A 4KCXA 5FH8A 4A9HA 3G0JA 5CQ8A 5FH6A 5DYCA 5H85A 5D3SA 5L98A 4C66A 5CTLA 5C89A 2DVRA 4QEWA 4N4HA 4QY4A 4XUBA 5FE2A 5I83A 4QSVA 4NRBA 4ALHA 5JWMA 3AADA 3P1EA 4PCEA 4CFLA 4Z1SA 3SVFA 3MB3A 4NQNA 4O70A 4WIVA 4HBWA 4QB3A 4QSTA 4PKLA 5BT4A 5HELA 5I40A 4NUDA 4CUPA 4AKNA 4Q0OA 5L96A 5FFYA 5A5OA 4YYDA 4LDFA 4XY9A 5D7XA 3P5OA 5KTXA 2MJVB 5IG6A 1ZS5A 5LKUA 4UYFA 5D26A 5BT5A 5E73A 4MR6A 3QZSA 5F25A 4QEUA 5CUDA 4QYDA 3SVGA 4LZSA 5FE3A 4UIYA 5HQ5A 5ACYA 2LSPB 4A9KA 4MEQA 5C85A 5D25A 4Q0NA 4TT2A 2RS9B 2YYNA 5JI8A 5ENFA 2DATA 3UV5A 5DLZA 2RO1A 4YABA 4QSSA 4YH4A 2YELA 4WHWA 4O7EA 4PS5A 4QSUA 4IORA 5DBMA 4Y03A 4ZC9A 4MR5A 1X0JA 5EP7A 4J3IA 4A9EA 5F5ZA 4QEVA 5BT3A 5CQ3A 5KHMA 4Z93A 2YDWA 4NRCA 4QUUA 4UIUA 5I86A 5L8UA 4LYIA 5E9LA 3JVMA 5LUUA 5F61A 5COIA 5D3PA 4A9IA 2YQDA 4IR4A 4CURA 5CUBA 2L5EA 4TS8A 5AMFA 2I7KA 3HMEA 3FKMX 3U5KA 4CUSA 2YW5A 5FE9A 2R0YA 5EWWA 4QSXA 4LZRA 4UIWA 3S91A 3MULA 2R0SA 2YEMA 5DKDA 3P1FA 5H1UA 4KV4A 4QYLA 3HMHA 5L99A 2RNXA 4GPJA 5IIDA 4UYEA 2WP2A 2E7NA 2RNWA 5J0DA 5IGNA 5FB0A 4HXPA 5KU3A 4A9JA 4HBYA 3U5LA 5G4RA 5IBNA 2GRCA 5CQ6A 4J1PA 2DKWA 4N4GA 4J0RA 5CQAA 4YBMA 2F6NA 4NUCA 4QSRA 3U5NA 2L84A 5DKCA 2H60A 1WUMA 4NR4A 4QZSA 4IR3A 5D3LA 5EPRA 5CQ4A 4QUTA 5ENEA 5FG4A 5EK9A 5A5PA 3UVYA 4HXOA 4NUEA 2DVVA 4A9FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CLBA 4YAXA 4HXSA 5EI4A 2F6JA 3G0LA 4Z6HA 5EWHA 4O74A 5I7YA 4N4FA 5AD3A 5I7XA 5CRZA 5CPEA 4YC9A 4YBSA 4HXNA 4NS5A 5H1VA 3UVDA 4MR3A 5L97A 3O33A 5A5SA 5TB6A 5LKXA 4OGJA 5A5NA 4BHWA 2G4AA 5A5QA 4WHUA 2WP1A 5DY7A 3ZYUA 3O34A 5HQ7A 4UYDA 4CUTA 5EWCA 5DFBA 5F63A 5EGUA 1JM4B 5HFRA 5E9MA 5FE4A 4OUFA 2RNYA 4QC3A 4TU6A 4NR5A 3D1DA 5HM0A 5EPSA 5FB1A 5DYXA 4A9NA 5FE1A 4AI6A 3P1DA 4PTBA 4QR3A 1PUOA 4O7CA 5F1LA 5HRXA 4MEOA 5CP5A 4BW2A 5LJ1A 5C87A 5DKHA 5L8TA 5EWDA 4QNSA 4O7FA 5CZGA 3K2JA 4HBVA 4TT6A 4MENA 3ONIA 5CY9A 3S92A 5LJ2A 5E74A 1F68A 5F3AA 5HQ6A 4ALGA 5I80A 5KTUA 4X2IA 3JVKA 4CL9A 4O75A 3NXBA 3Q2EA 4XYAA 5EU1A 4LRGA 5EQ1A 4BJXA 3O36A 4BW4A 4HXLA 2D82A 3QZTA 4O71A 5ENHA 5CFWA 5EISA 4YYJA 4A9OA 4OGIA 5A82A 5LJ0A 5FG6A 5A5RA 5I88A 3LJWA 4YYKA 5CQ7A 4ZW1A 3U5PA 4O76A 4ZQLA 4IR5A 4NYVA 5C7NA 5K29A 3MB4A 2NXBA 3D1BA 4YY6A 4YYHA 5A7CA 4KV1A 5D3NA 4QSQA 4O7BA 5FE8A 3DWYA 4LC2A 4CFKA 4NR6A 1EQFA 5HENA 5C8GA 5HFQA 4O72A 1N72A 4F3IA 3QZVA 4TZ2A 5CUAA 5CUEA 4YYGA 4CUUA 5A81A 5I89A 2RFJA 4DONA 2DVQA 5E7DA 4A9LA 5IGMA 5D3HA 5DW1A 4YYMA 4UYGA 4TYLA 4O78A 2EJNA 4N3WA 5D3TA 5CS8A 5DX4A 5II2A 4AKIA 5FE5A 4QR4A 3MXFA 4IR6A 5C4QA 5DYAA 3MUKA 5II1A 5HJCA 4BW1A 5DYUA 4Z6IA 3TLPA 5EICA 4QSPA 4YBTA 2N9GA 5LKTA 4O77A 5KTWA 5LKZA 5FBXA 4O7AA 5FE7A 3UVXA 5ENJA 3LXJA 5CQ5A 4UIVA 5E3DA 4LZ2A 3LQHA 4YYIA 3HMFA 5FG5A 4TU4A 5ETBA 4XY8A 4HXRA 5FH7A 5EPBA 5F36A 5F2PA 2R10A 5G4SA 4QSWA 5HEMA 2YEKA 4QBMA 4YH3A 4PY6A 5I29A 3VKGA 4MEPA 3IU6A 4NYWA 5FFVA 5HRVA 4TTEA 3RCWA 5EVAA 3IU5A 5EM3A 1JSPB 5A85A 1WUGA 5ENBA 4LYSA 4IOOA 5ENIA 4J0SA 3UV2A 2R0VA 4QR5A 4NR8A 2OO1A 5F62A 2E7OA 5CUCA 5CRMA 5AMEA 4AKHA 3MQMA 5HLSA 5D3RA 3DAIA 3GG3A 4BW3A 5DFCA 5F1HA 4A9MA 3U5MA 4N4IA 5ETDA 3UV4A 3Q2FA 4LR6A 5ENGA 2KTBB 5KO4A 5E9KA 3D7CA 5D24A 4MR4A 2RI7A 2E3KA 4C67A 3U5OA 4YATA 5EWVA 5HRWA 4YADA 5E3GA 3U5JA 4NRAA 3O35A 1E6IA 5A83A 5H1TA 3JVLA 5TCMA 2L85A 5EA1A 5LVRA 5E9IA 5F60A 5E9YA 5CGPA 4FLPA 5ENCA 2D9EA 5E0RA 4UYFB 3SVHA 2FSAA 5FE0A 5LVQA 5DLXA 4NQMA 5FE6A 2DWWA 4YYNA 2OUOA 4YY4A 4YK0A 2OSSA 4TT4A 4IOQA 4NR7A 4HBXA 5DW2A 4NYXA 4NR9A 5EV9A 3AQAA 5CQTA 3LQIA 4XUAA 3JVJA 5IGKA 3P1CA 5CUGA 4QC1A 5I1QA 3O37A 5FFWA 4RVRA 4HXKA 5E9VA 5D0CA 5D3JA 4TQNA 3LQJA 4CUQA 3UVWA 3I3JA 5IGLA 5CU8A 2DVSA 4NXJA 4E96A 5DFDA 4Z1QA 4LYWA 5HCLA 4UITA 4UIXA 4UYHA 2I8NA 5AD2A 4UIZA 4HXMA 4PCIA 4TZ8A 5FDZA 3UW9A 4KCXA 5FH8A 4A9HA 3G0JA 5CQ8A 5FH6A 5DYCA 5H85A 5D3SA 5L98A 4C66A 5CTLA 5C89A 2DVRA 4QEWA 4N4HA 4QY4A 4XUBA 5FE2A 5I83A 4QSVA 4NRBA 4ALHA 5JWMA 3AADA 3P1EA 4PCEA 4CFLA 4Z1SA 3SVFA 3MB3A 1ZKRA 4NQNA 4O70A 4WIVA 4HBWA 4QB3A 4QSTA 4PKLA 5BT4A 5HELA 5I40A 4NUDA 4CUPA 4AKNA 4Q0OA 5L96A 5FFYA 5A5OA 4YYDA 4LDFA 4XY9A 5D7XA 3P5OA 5KTXA 2MJVB 5IG6A 1ZS5A 5LKUA 4UYFA 5D26A 5BT5A 5E73A 4MR6A 3QZSA 5F25A 4QEUA 5CUDA 4QYDA 3SVGA 4LZSA 5FE3A 4UIYA 5HQ5A 5ACYA 2LSPB 4AKGA 4A9KA 4MEQA 5C85A 5D25A 4Q0NA 4TT2A 2RS9B 2YYNA 5JI8A 5ENFA 2DATA 3UV5A 5DLZA 2RO1A 4YABA 4QSSA 4YH4A 2YELA 4WHWA 4O7EA 4PS5A 4QSUA 4IORA 5DBMA 4Y03A 4ZC9A 4MR5A 1X0JA 5EP7A 4J3IA 4A9EA 5F5ZA 4QEVA 5BT3A 5CQ3A 5KHMA 4Z93A 2YDWA 4NRCA 4QUUA 4UIUA 5I86A 5L8UA 4LYIA 5E9LA 3JVMA 5LUUA 5F61A 5COIA 5D3PA 4A9IA 2YQDA 4IR4A 4CURA 5CUBA 2L5EA 4TS8A 5AMFA 2I7KA 3HMEA 3FKMX 3U5KA 4CUSA 2YW5A 5FE9A 2R0YA 5EWWA 4QSXA 4LZRA 4UIWA 3S91A 3MULA 2R0SA 2YEMA 5DKDA 3P1FA 5H1UA 4KV4A 4QYLA 3HMHA 5L99A 2RNXA 4GPJA 5IIDA 4UYEA 2WP2A 2E7NA 2RNWA 5J0DA 5IGNA 5FB0A 4HXPA 5KU3A 4A9JA 4HBYA 3U5LA 5G4RA 5IBNA 2GRCA 5CQ6A 4J1PA 2DKWA 4N4GA 4J0RA 5CQAA 4YBMA 2F6NA 4NUCA 4QSRA 3U5NA 2L84A 5DKCA 2H60A 1WUMA 4NR4A 4QZSA 3ERRA 4IR3A 5D3LA 5EPRA 5CQ4A 4QUTA 5ENEA 5FG4A 5EK9A 5A5PA 3UVYA 4HXOA 4NUEA 2DVVA 4A9FA 3VKHA
chains in the Genus database with same CATH topology
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