5D26A

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd28
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d26A01
3G0JA 5E9YA 4YYKA 5C87A 5I7XA 4LYIA 4CUQA 5FE5A 3O35A 5E74A 3QZSA 4N4GA 5DFCA 5DYUA 4LZ2A 5F60A 5CGPA 1X0JA 3U5PA 5HCLA 3P1CA 5EK9A 4NQNA 5A82A 3O37A 4HXPA 5E0RA 5HQ6A 2G4AA 4QEVA 2I7KA 5ENGA 5L96A 4HXKA 4ZC9A 2R10A 5KTUA 4LYWA 4CUUA 3ONIA 3Q2EA 4MR6A 2NXBA 4TS8A 4NQMA 4E96A 5FE7A 3U5NA 4NUCA 4KV4A 4O75A 5I83A 4QSWA 4HBXA 5EI4A 5CQAA 4BHWA 4NR5A 5KTWA 5LVRA 4NXJA 5DKHA 1F68A 5DYCA 5CU8A 4MEPA 5EICA 4IORA 5HENA 4IR5A 2WP2A 5C7NA 5FG6A 4YBMA 5CUEA 3SVFA 5FE9A 2DWWA 5E3DA 5D3PA 5EPRA 5F2PA 3UVYA 5A81A 4QC3A 4A9OA 4J0SA 5EVAA 5BT5A 3UVWA 5E7DA 3U5OA 4BW3A 3G0LA 4RVRA 5C4QA 4TQNA 5F3AA 5CTLA 4O7FA 4PCIA 4YYNA 4CLBA 4IR6A 5KHMA 5C85A 1JM4B 4Z6HA 5CQ4A 3U5KA 5IGLA 2F6JA 4CFKA 5DY7A 5DYAA 5HM0A 3JVLA 5ENFA 5F25A 4TT4A 5DLZA 5LUUA 5EISA 5I7YA 4NYVA 5I1QA 3AQAA 4MEQA 4CURA 2YW5A 4HXRA 5CUGA 4A9EA 5EWCA 3S92A 2OO1A 1JSPB 4UIXA 3MXFA 4XUAA 5I29A 4O74A 4QSVA 1E6IA 5D3RA 5HFQA 4O76A 4PY6A 3P1FA 4QY4A 5HELA 3S91A 5HQ7A 4UYDA 5D7XA 5HFRA 4N4FA 5A85A 2DVSA 5A5RA 5CUDA 5FFWA 4BJXA 3DAIA 5IGNA 4HBYA 3UV2A 4PTBA 4A9NA 4QR5A 5FE3A 5IG6A 4QYLA 2L85A 2RFJA 5FDZA 2L84A 5FG4A 4YC9A 4NR9A 4TU4A 4ZQLA 4YADA 5DBMA 4NRAA 5ETBA 3JVKA 5FG5A 2R0VA 5ENCA 5EU1A 5DW2A 4LDFA 5LKTA 4GPJA 2YEMA 4HBVA 4YYHA 4NR8A 5EGUA 3QZTA 5FH8A 4UYFA 4UYGA 4QR3A 4Z93A 4IR4A 3DWYA 4MR3A 5CUBA 2R0SA 4YYJA 4O7EA 5CQ6A 4O7AA 5D25A 3HMHA 1EQFA 5L8TA 2YELA 5J0DA 4YABA 5F36A 5D3LA 2RNWA 4DONA 4O78A 5LKUA 5HLSA 4UIUA 4NUEA 4IR3A 3ZYUA 5FFYA 4C67A 4QBMA 2R0YA 4MENA 5CY9A 5HRVA 2YEKA 4WHWA 4YBSA 3UW9A 5LKZA 5CFWA 5D26A 5ENEA 2RNXA 5ACYA 5A5SA 5A83A 5A5OA 4QSUA 4LRGA 4XY9A 5A5QA 5IIDA 4PS5A 5G4RA 2DVQA 4TT2A 5I80A 5H85A 4O7BA 2D9EA 5FE0A 4QSPA 3IU6A 5I89A 4HXNA 5CUAA 4UYFB 4NYWA 3UV5A 4UIYA 5H1VA 4IOOA 2WP1A 4O77A 3U5LA 5LJ1A 4A9JA 4UIVA 4UIZA 5COIA 5ENJA 5CPEA 4A9HA 5F61A 2E7NA 5K29A 5E3GA 5II1A 4XY8A 2F6NA 3P1DA 4Z1SA 5H1TA 4QYDA 5C8GA 4O70A 2DATA 2E3KA 2H60A 5FE8A 4YH3A 5D3NA 4LC2A 2RI7A 5DKDA 4QSQA 2DVVA 5D3SA 5DKCA 4J1PA 3FKMX 4XUBA 3UVXA 5L97A 5JI8A 4UYHA 4N4IA 3IU5A 5D3HA 4HXLA 5DFBA 5HQ5A 4Y03A 3UVDA 4CUSA 5IGKA 3MB3A 5HRXA 4YY6A 5DFDA 5L8UA 4X2IA 4A9KA 5DW1A 4YY4A 4IOQA 4MR4A 4HXMA 4LR6A 3O36A 4YH4A 5LVQA 5FB0A 4TZ2A 5ENBA 3O34A 4LZSA 3I3JA 5EWHA 5D3TA 4QR4A 4QZSA 4OGJA 5CQ8A 5EPBA 5FH6A 5G4SA 4OGIA 4Q0NA 5ETDA 3UV4A 3TLPA 5FE4A 5A5PA 4NYXA 3RCWA 4BW2A 4QUTA 2I8NA 4HXSA 4BW1A 4A9MA 4XYAA 3LJWA 5F62A 2MJVB 4NS5A 5A5NA 5C89A 4TZ8A 3LQJA 5II2A 5EP7A 2YYNA 4MR5A 4A9LA 3LXJA 3SVGA 5F1LA 4UITA 3GG3A 5D3JA 4QSRA 5IGMA 5I88A 3HMFA 1WUGA 5IBNA 4O71A 5F1HA 5CQTA 4YYIA 5FE1A 5L98A 3SVHA 4N4HA 5E9IA 5EWWA 2YDWA 5L99A 4WHUA 2DKWA 3U5JA 4QB3A 3LQIA 4YK0A 5E9MA 5CQ7A 5EWVA 4YYDA 5KTXA 5FFVA 4NR7A 3AADA 4ALGA 4CUPA 5HEMA 3MB4A 5TCMA 3MUKA 4F3IA 5F63A 5H1UA 4AKNA 4O7CA 5CRZA 2LSPB 5ENHA 5EV9A 4OUFA 4TTEA 5FH7A 4YAXA 4LZRA 3LQHA 5DYXA 5CQ5A 5AMFA 5FE6A 4YYGA 5A7CA 2OUOA 4YBTA 5FBXA 4QEUA 2RS9B 4QC1A 4WIVA 4NRCA 4QSSA 2OSSA 5FB1A 2DVRA 4ZW1A 4A9IA 4PCEA 4J0RA 5F5ZA 2RNYA 5HJCA 5I40A 5EPSA 4TU6A 4C66A 2FSAA 4UIWA 5ENIA 4QSTA 4CFLA 5E9KA 5E73A 2GRCA 5EQ1A 4NR6A 3Q2FA 4CUTA 5KU3A 3P1EA 2KTBB 4BW4A 2RO1A 4YATA 4Z1QA 5BT3A 3D7CA 4QSXA 5I86A 2L5EA 5HRWA 4N3WA 5JWMA 4NUDA 3NXBA 5CRMA 5AD3A 4O72A 4NRBA 1WUMA 4J3IA 5D24A 5CUCA 5EWDA 5CQ3A 2D82A 4FLPA 4MEOA 3O33A 3P5OA 4ALHA 4QNSA 4KCXA 3MQMA 2YQDA 3JVMA 5CS8A 4LYSA 4A9FA 4Z6IA 5TB6A 3MULA 5E9LA 4Q0OA 3JVJA 4KV1A 3HMEA 4QUUA 3U5MA 5LJ0A 4TT6A 4HXOA 4UYEA 4TYLA 3K2JA 2E7OA 4HBWA 4QEWA 4NR4A 5CP5A 4CL9A 4YYMA 5DX4A 5D0CA 1N72A 1ZS5A 5CZGA 5FE2A 4PKLA 5LKXA 5E9VA 5BT4A 2N9GA 5LJ2A 5EM3A 5KO4A 5DLXA 5AD2A 5AMEA 5EA1A 3QZVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G0JA 5E9YA 4YYKA 5C87A 5I7XA 4LYIA 4CUQA 5FE5A 3O35A 5E74A 3QZSA 4N4GA 5DFCA 5DYUA 4LZ2A 5F60A 5CGPA 1X0JA 3U5PA 5HCLA 3P1CA 5EK9A 4NQNA 5A82A 3O37A 4HXPA 5E0RA 5HQ6A 2G4AA 4QEVA 2I7KA 5ENGA 5L96A 4HXKA 4ZC9A 2R10A 5KTUA 4LYWA 4CUUA 3ONIA 3Q2EA 4MR6A 2NXBA 4TS8A 4NQMA 4E96A 5FE7A 3U5NA 4NUCA 4KV4A 4O75A 3VKHA 5I83A 4QSWA 4HBXA 5EI4A 5CQAA 4BHWA 4NR5A 5KTWA 5LVRA 4NXJA 5DKHA 1F68A 5DYCA 5CU8A 4MEPA 5EICA 4IORA 5HENA 4IR5A 2WP2A 5C7NA 5FG6A 4YBMA 5CUEA 3SVFA 5FE9A 2DWWA 5E3DA 5D3PA 5EPRA 5F2PA 3UVYA 5A81A 4QC3A 4A9OA 4J0SA 5EVAA 5BT5A 3UVWA 5E7DA 3U5OA 4BW3A 3G0LA 4RVRA 5C4QA 4TQNA 5F3AA 5CTLA 4O7FA 4PCIA 4YYNA 4CLBA 4IR6A 5KHMA 5C85A 1JM4B 4Z6HA 5CQ4A 3U5KA 5IGLA 2F6JA 4CFKA 5DY7A 5DYAA 5HM0A 3JVLA 5ENFA 5F25A 4TT4A 5DLZA 5LUUA 5EISA 5I7YA 4NYVA 5I1QA 3AQAA 4MEQA 4CURA 4AI6A 2YW5A 4HXRA 5CUGA 4A9EA 5EWCA 3S92A 2OO1A 1JSPB 2EJNA 4UIXA 3MXFA 4XUAA 5I29A 4O74A 4QSVA 1E6IA 5D3RA 5HFQA 4O76A 4PY6A 3P1FA 4QY4A 5HELA 3S91A 5HQ7A 4UYDA 5D7XA 5HFRA 4N4FA 3VKGA 5A85A 2DVSA 5A5RA 5CUDA 5FFWA 4BJXA 3DAIA 3ERRA 5IGNA 4HBYA 3UV2A 4PTBA 4A9NA 4QR5A 5FE3A 5IG6A 4QYLA 2L85A 2RFJA 5FDZA 2L84A 5FG4A 4YC9A 4NR9A 4TU4A 4ZQLA 4YADA 5DBMA 4NRAA 5ETBA 3JVKA 5FG5A 2R0VA 5ENCA 5EU1A 5DW2A 4LDFA 5LKTA 4GPJA 2YEMA 4HBVA 4YYHA 4NR8A 5EGUA 3QZTA 3D1BA 5FH8A 4UYFA 4UYGA 4QR3A 4Z93A 4IR4A 3DWYA 4MR3A 5CUBA 2R0SA 4YYJA 4O7EA 5CQ6A 4O7AA 5D25A 3HMHA 1EQFA 5L8TA 2YELA 5J0DA 4YABA 5F36A 5D3LA 2RNWA 4DONA 4O78A 5LKUA 5HLSA 4UIUA 4NUEA 4IR3A 3ZYUA 5FFYA 4C67A 4QBMA 2R0YA 4MENA 5CY9A 5HRVA 2YEKA 4WHWA 4YBSA 3UW9A 5LKZA 5CFWA 5D26A 5ENEA 2RNXA 5ACYA 5A5SA 5A83A 5A5OA 4QSUA 4LRGA 4XY9A 5A5QA 5IIDA 4PS5A 5G4RA 2DVQA 4TT2A 5I80A 5H85A 4O7BA 2D9EA 5FE0A 4QSPA 3IU6A 5I89A 4HXNA 5CUAA 4UYFB 4NYWA 3UV5A 4UIYA 5H1VA 4IOOA 2WP1A 4O77A 3U5LA 5LJ1A 4A9JA 4UIVA 4UIZA 5COIA 5ENJA 5CPEA 4A9HA 5F61A 2E7NA 5K29A 5E3GA 5II1A 4XY8A 2F6NA 3P1DA 4Z1SA 5H1TA 4QYDA 5C8GA 4O70A 2DATA 2E3KA 2H60A 5FE8A 4YH3A 5D3NA 4LC2A 2RI7A 5DKDA 4QSQA 2DVVA 5D3SA 5DKCA 4J1PA 3FKMX 4XUBA 3UVXA 5L97A 4AKHA 5JI8A 4UYHA 4N4IA 3IU5A 5D3HA 4HXLA 5DFBA 5HQ5A 4Y03A 3UVDA 4CUSA 5IGKA 3MB3A 5HRXA 4YY6A 5DFDA 5L8UA 4X2IA 4A9KA 5DW1A 4YY4A 4IOQA 4MR4A 4HXMA 4LR6A 3O36A 4YH4A 5LVQA 5FB0A 4TZ2A 5ENBA 3O34A 4LZSA 3I3JA 1ZKRA 5EWHA 5D3TA 4QR4A 4QZSA 4OGJA 5CQ8A 5EPBA 5FH6A 5G4SA 4OGIA 4Q0NA 5ETDA 3UV4A 3TLPA 5FE4A 5A5PA 4NYXA 3RCWA 4BW2A 4QUTA 2I8NA 4HXSA 4BW1A 4A9MA 4XYAA 3LJWA 5F62A 2MJVB 4NS5A 5A5NA 5C89A 4TZ8A 3LQJA 5II2A 5EP7A 2YYNA 4MR5A 4A9LA 3LXJA 3SVGA 5F1LA 4UITA 3GG3A 5D3JA 4QSRA 5IGMA 5I88A 3HMFA 1WUGA 5IBNA 4O71A 5F1HA 5CQTA 4YYIA 5FE1A 5L98A 3SVHA 4N4HA 5E9IA 5EWWA 2YDWA 5L99A 4WHUA 2DKWA 3U5JA 4QB3A 3LQIA 4YK0A 5E9MA 5CQ7A 5EWVA 4YYDA 5KTXA 5FFVA 4NR7A 3AADA 4ALGA 4CUPA 4AKGA 4AKIA 5HEMA 3MB4A 5TCMA 3MUKA 4F3IA 5F63A 5H1UA 4AKNA 4O7CA 5CRZA 2LSPB 5ENHA 5EV9A 4OUFA 4TTEA 5FH7A 4YAXA 4LZRA 3LQHA 5DYXA 5CQ5A 5AMFA 5FE6A 4YYGA 5A7CA 2OUOA 4YBTA 5FBXA 4QEUA 2RS9B 4QC1A 4WIVA 4NRCA 4QSSA 2OSSA 5FB1A 2DVRA 4ZW1A 4A9IA 4PCEA 4J0RA 5F5ZA 2RNYA 5HJCA 5I40A 5EPSA 4TU6A 4C66A 2FSAA 4UIWA 5ENIA 4QSTA 4CFLA 5E9KA 5E73A 2GRCA 5EQ1A 4NR6A 3Q2FA 4CUTA 5KU3A 3P1EA 2KTBB 4BW4A 2RO1A 4YATA 4Z1QA 5BT3A 3D7CA 4QSXA 5I86A 2L5EA 5HRWA 4N3WA 5JWMA 4NUDA 3NXBA 5CRMA 5AD3A 4O72A 4NRBA 1WUMA 4J3IA 5D24A 5CUCA 5EWDA 5CQ3A 2D82A 4FLPA 4MEOA 3O33A 3P5OA 4ALHA 4QNSA 4KCXA 3MQMA 2YQDA 3JVMA 5CS8A 4LYSA 4A9FA 4Z6IA 5TB6A 3MULA 5E9LA 4Q0OA 3JVJA 4KV1A 3HMEA 4QUUA 3U5MA 5LJ0A 4TT6A 4HXOA 4UYEA 4TYLA 3K2JA 2E7OA 4HBWA 4QEWA 4NR4A 5CP5A 4CL9A 4YYMA 3D1DA 5DX4A 5D0CA 1N72A 1ZS5A 5CZGA 5FE2A 4PKLA 5LKXA 5E9VA 5BT4A 1PUOA 2N9GA 5LJ2A 5EM3A 5KO4A 5DLXA 5AD2A 5AMEA 5EA1A 3QZVA
chains in the Genus database with same CATH topology
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