4IR3A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-[7-amino-1-(pyrimidin-2-yl)indolizin-3-yl]ethanone (gsk2833282a)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir3A00
2E3KA 5E74A 3QZVA 4KCXA 5ENGA 3MULA 5HQ6A 4PY6A 4UYEA 4TYLA 5FFWA 3GG3A 5FH7A 5II1A 5C7NA 4QYLA 5G4SA 5DYCA 5I89A 5LKUA 3P1CA 5L99A 4LYSA 5FE6A 5ENCA 5CQ7A 1E6IA 2RNXA 4NR5A 5E9LA 5EWVA 5I7XA 5L8UA 5E9VA 4TS8A 3UVWA 4LR6A 5II2A 3QZSA 5EU1A 4YC9A 4O72A 2YW5A 4O7FA 5IGKA 4XYAA 4HBWA 2DWWA 3P5OA 4A9KA 4IORA 4LYWA 4NR9A 4MR6A 5L98A 5KU3A 4CURA 5LVQA 4TT2A 4A9JA 5DW2A 2YEKA 4NUDA 5IG6A 2OO1A 4NYXA 5CQTA 4CUPA 5I7YA 4LC2A 2DVQA 5EICA 3LQIA 3Q2FA 4YATA 4O7AA 3JVLA 5EWDA 5E3GA 4ZQLA 4RVRA 4QR5A 4O76A 5CQ5A 4MENA 5EISA 4Z6IA 4MEPA 2DVSA 3U5LA 3DWYA 5LKZA 3I3JA 4ALHA 5DFCA 4QB3A 5FFYA 2D82A 3ONIA 4NQNA 4QZSA 4O70A 4ALGA 4N4FA 2L84A 2F6JA 4QSTA 3MQMA 4UYHA 4HXOA 5F25A 2YELA 5F63A 4XUAA 2H60A 5FG5A 4UYFA 4QY4A 4UIZA 4FLPA 4YAXA 4BHWA 3P1DA 4PKLA 3S91A 5HELA 5FG4A 3P1EA 4QSQA 5K29A 5I1QA 5JI8A 4Z1QA 5H85A 4YYDA 5CY9A 4BW1A 4YBTA 5KHMA 5KTWA 3O33A 5F1HA 4LZ2A 5LJ0A 2R10A 4A9IA 4HXNA 4Z6HA 2R0SA 4CUUA 5EWWA 4HXLA 4CLBA 2E7OA 4UITA 5F60A 4O74A 5CUBA 5EGUA 5FH8A 5A5OA 5H1VA 5CGPA 3DAIA 3U5KA 5HFRA 5DFDA 4PCEA 4WIVA 4N4GA 5KTUA 5F1LA 3QZTA 1JM4B 5I40A 4LZRA 5HQ5A 4IR6A 5FB1A 5COIA 4QEVA 4A9HA 4TT4A 1WUGA 4GPJA 4ZC9A 4A9OA 4N4HA 4O7CA 2FSAA 5FG6A 5FE2A 5LKXA 5EVAA 4CL9A 4O7BA 5FE7A 4QNSA 5C4QA 3UV5A 5EI4A 2WP2A 3MUKA 4UYFB 4HBYA 3IU5A 5ENJA 5J0DA 3O37A 3LQJA 5HRXA 5CQ3A 2RO1A 3P1FA 4NR4A 2DVVA 5EWCA 4Q0NA 5A82A 4YBMA 4NQMA 5HCLA 3LQHA 5I88A 5C89A 4BJXA 4QSXA 4NRBA 3RCWA 5CUEA 3SVHA 3UVXA 2YQDA 4CUSA 5LKTA 5CTLA 5A5QA 5C85A 4YY6A 5FE5A 5HM0A 5CP5A 4E96A 2L85A 4OGIA 5TB6A 4YBSA 4PCIA 5CRMA 1X0JA 4CFKA 4YH3A 5FE1A 5D24A 5DYUA 5I83A 4NRAA 5DX4A 4PS5A 4UYGA 4YYGA 5FE0A 5AMEA 4YYHA 3O35A 4UIWA 1N72A 5CQ4A 5F2PA 5FB0A 5A5PA 4CUTA 4QBMA 4XUBA 4QSSA 4QEWA 4YY4A 2RNWA 4YYMA 5E9YA 3UVDA 4TU4A 1ZS5A 4YK0A 4YADA 4QSRA 2RI7A 3AADA 5I29A 5CS8A 5EPBA 3MB4A 4BW4A 3D7CA 5D3SA 5FFVA 2D9EA 4BW2A 5FE8A 5ACYA 5A83A 4O71A 5F62A 4UIXA 5E0RA 4QR4A 5ETDA 4UIUA 5HEMA 4TTEA 2YYNA 5CUAA 4YH4A 4KV4A 5ENEA 4HXKA 5EK9A 4LYIA 5D26A 5CU8A 4TU6A 2RFJA 5IBNA 2I8NA 5EPSA 2MJVB 5HFQA 5D0CA 3SVGA 3Q2EA 2L5EA 4MR3A 5L97A 4IR5A 2R0VA 2YDWA 4QC3A 5CQ8A 4MR5A 5F36A 2G4AA 5I86A 1WUMA 4QSUA 1EQFA 4NXJA 5FE9A 3TLPA 5I80A 5EWHA 3U5NA 5ENIA 4WHWA 2OUOA 5D3NA 4QR3A 3FKMX 5DYAA 4LDFA 5A5SA 5EQ1A 5HRVA 3SVFA 5BT3A 4OGJA 4NYVA 4HXPA 4F3IA 4YYIA 3ZYUA 5FE4A 3HMFA 5D3HA 5E9IA 5FBXA 5G4RA 3G0LA 4QSVA 4ZW1A 5IGLA 4AKNA 3JVKA 4J1PA 5D3TA 5HRWA 4Q0OA 4YABA 3U5JA 4OUFA 5CZGA 4PTBA 2R0YA 5HENA 4XY9A 3MXFA 5A7CA 3S92A 3U5PA 4YYJA 2LSPB 4TZ8A 4LZSA 2DVRA 4XY8A 5A81A 3U5MA 5DYXA 4O78A 4IOQA 2YEMA 2GRCA 5ETBA 4NS5A 5DW1A 5IIDA 3HMHA 4NUCA 4IOOA 5LVRA 4IR4A 4O7EA 5A85A 3JVMA 3G0JA 2KTBB 4MEOA 5DFBA 5E73A 4CUQA 4TT6A 2F6NA 5DLXA 5IGNA 5EP7A 5F3AA 5CQ6A 4Y03A 2OSSA 4A9LA 5ENBA 2RNYA 4UIYA 5IGMA 3UW9A 4NYWA 3K2JA 5BT4A 5EA1A 1JSPB 4TZ2A 5D3RA 5KO4A 4HXMA 4MR4A 5KTXA 2E7NA 4NR6A 1F68A 5HQ7A 4QUUA 5CUDA 5EM3A 4UIVA 5BT5A 4O75A 5FH6A 4NRCA 4Z1SA 4HXRA 4A9MA 5LUUA 4N4IA 5FDZA 2RS9B 4QSWA 4KV1A 3IU6A 5ENHA 4LRGA 5DKDA 4QUTA 3UVYA 3O34A 4NUEA 5C87A 4QEUA 4NR8A 5CRZA 5D3JA 4J0RA 5JWMA 4C66A 5D7XA 5LJ2A 5EPRA 5L8TA 4QYDA 4YYKA 5AD2A 3LJWA 5DY7A 3AQAA 5AMFA 4J0SA 4TQNA 5TCMA 4WHUA 5L96A 4A9NA 4MEQA 5DKCA 2DATA 3JVJA 4DONA 5FE3A 2I7KA 2N9GA 2DKWA 4IR3A 5DLZA 5EV9A 3MB3A 3NXBA 5H1TA 5A5RA 5A5NA 5D3LA 4UYDA 5DKHA 5F61A 5E9MA 4CFLA 4NR7A 3LXJA 4HBVA 4N3WA 5HLSA 4Z93A 5E9KA 4YYNA 2NXBA 5LJ1A 5C8GA 5CUGA 2WP1A 3UV2A 4J3IA 4QSPA 3U5OA 4C67A 5ENFA 3HMEA 4X2IA 5DBMA 4QC1A 5D25A 5CPEA 5HJCA 3O36A 3UV4A 5E7DA 4HXSA 5CQAA 4O77A 4HBXA 4BW3A 4A9FA 5CUCA 5D3PA 4A9EA 5AD3A 5F5ZA 5CFWA 5H1UA 5E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E3KA 5E74A 3QZVA 4KCXA 5ENGA 3MULA 5HQ6A 4PY6A 4UYEA 4TYLA 5FFWA 3GG3A 5FH7A 5II1A 5C7NA 4QYLA 5G4SA 5DYCA 5I89A 5LKUA 3P1CA 5L99A 4LYSA 5FE6A 5ENCA 5CQ7A 1E6IA 2RNXA 4NR5A 5E9LA 5EWVA 5I7XA 5L8UA 5E9VA 4TS8A 3UVWA 4LR6A 5II2A 3QZSA 5EU1A 4YC9A 4O72A 2YW5A 4O7FA 5IGKA 4XYAA 4HBWA 2DWWA 3P5OA 4A9KA 3ERRA 4IORA 4LYWA 4NR9A 4MR6A 5L98A 5KU3A 4CURA 5LVQA 4TT2A 4A9JA 5DW2A 2YEKA 4NUDA 5IG6A 2OO1A 4NYXA 5CQTA 4CUPA 5I7YA 4LC2A 2DVQA 5EICA 3LQIA 3Q2FA 4YATA 4AKIA 4O7AA 3JVLA 5EWDA 5E3GA 4ZQLA 4RVRA 4QR5A 4O76A 5CQ5A 4MENA 5EISA 4Z6IA 4MEPA 2DVSA 3U5LA 3DWYA 5LKZA 3I3JA 4ALHA 5DFCA 4QB3A 5FFYA 1PUOA 2D82A 3ONIA 4NQNA 4QZSA 4O70A 4ALGA 4N4FA 2L84A 2F6JA 4QSTA 3MQMA 4UYHA 4HXOA 5F25A 2YELA 5F63A 4XUAA 2H60A 5FG5A 4UYFA 4QY4A 4UIZA 4FLPA 4YAXA 4BHWA 3P1DA 4PKLA 3S91A 5HELA 5FG4A 3P1EA 4QSQA 5K29A 5I1QA 5JI8A 4Z1QA 5H85A 4YYDA 5CY9A 4BW1A 4YBTA 5KHMA 5KTWA 3O33A 5F1HA 4LZ2A 5LJ0A 2R10A 4A9IA 4HXNA 4Z6HA 2R0SA 4CUUA 5EWWA 4HXLA 4CLBA 2E7OA 4UITA 5F60A 4O74A 5CUBA 5EGUA 5FH8A 5A5OA 5H1VA 5CGPA 3DAIA 3U5KA 5HFRA 5DFDA 4PCEA 4WIVA 4N4GA 5KTUA 5F1LA 3QZTA 1JM4B 5I40A 4LZRA 5HQ5A 4IR6A 5FB1A 5COIA 4QEVA 4A9HA 4TT4A 1WUGA 4GPJA 4ZC9A 4A9OA 4N4HA 4O7CA 2FSAA 5FG6A 5FE2A 5LKXA 5EVAA 4CL9A 4O7BA 5FE7A 4QNSA 5C4QA 3UV5A 5EI4A 2WP2A 3D1BA 3MUKA 4HBYA 3IU5A 4UYFB 5ENJA 5J0DA 3O37A 3LQJA 5HRXA 5CQ3A 2RO1A 3P1FA 4NR4A 2DVVA 5EWCA 4Q0NA 5A82A 4YBMA 4NQMA 5HCLA 3LQHA 5I88A 5C89A 4BJXA 4QSXA 4NRBA 3RCWA 5CUEA 3SVHA 3UVXA 2YQDA 4CUSA 5LKTA 5CTLA 5A5QA 5C85A 4YY6A 5FE5A 5HM0A 5CP5A 4E96A 2L85A 4OGIA 5TB6A 4YBSA 4PCIA 5CRMA 1X0JA 4CFKA 4YH3A 5FE1A 5D24A 5DYUA 5I83A 4NRAA 5DX4A 4PS5A 4UYGA 4YYGA 5FE0A 5AMEA 4YYHA 3O35A 4UIWA 1N72A 5CQ4A 5F2PA 5FB0A 5A5PA 4CUTA 4QBMA 4XUBA 4QSSA 4QEWA 4YY4A 2RNWA 4YYMA 5E9YA 3UVDA 4TU4A 1ZS5A 4YK0A 4YADA 4QSRA 2RI7A 3AADA 5I29A 5CS8A 5EPBA 3MB4A 4BW4A 3D7CA 5D3SA 5FFVA 2D9EA 4BW2A 5FE8A 5ACYA 5A83A 4O71A 5F62A 4UIXA 5E0RA 4QR4A 5ETDA 4UIUA 5HEMA 4TTEA 2YYNA 5CUAA 4YH4A 4KV4A 5ENEA 4HXKA 5EK9A 4LYIA 5D26A 5CU8A 4TU6A 2RFJA 5IBNA 2I8NA 5EPSA 2MJVB 5HFQA 5D0CA 3SVGA 3Q2EA 2L5EA 4MR3A 5L97A 4IR5A 2R0VA 2YDWA 4QC3A 5CQ8A 4MR5A 5F36A 2G4AA 5I86A 1WUMA 4QSUA 1EQFA 4NXJA 5FE9A 3TLPA 5I80A 5EWHA 3U5NA 3D1DA 5ENIA 4WHWA 2OUOA 5D3NA 4QR3A 3FKMX 5DYAA 4LDFA 5A5SA 5EQ1A 5HRVA 3SVFA 5BT3A 4OGJA 4NYVA 4HXPA 4F3IA 4YYIA 3ZYUA 5FE4A 3HMFA 5D3HA 5E9IA 5FBXA 5G4RA 4AKGA 3G0LA 4QSVA 4AKHA 4ZW1A 5IGLA 4AKNA 3JVKA 4J1PA 5D3TA 5HRWA 4Q0OA 4YABA 2EJNA 3U5JA 4OUFA 5CZGA 4PTBA 2R0YA 5HENA 4XY9A 3MXFA 5A7CA 3S92A 3U5PA 4AI6A 4YYJA 2LSPB 4TZ8A 4LZSA 2DVRA 4XY8A 5A81A 3U5MA 5DYXA 4O78A 4IOQA 2YEMA 2GRCA 5ETBA 4NS5A 5DW1A 5IIDA 3HMHA 4NUCA 4IOOA 5LVRA 4IR4A 4O7EA 5A85A 3JVMA 3G0JA 2KTBB 4MEOA 5DFBA 5E73A 4CUQA 4TT6A 2F6NA 5DLXA 5IGNA 5EP7A 5F3AA 5CQ6A 4Y03A 2OSSA 4A9LA 5ENBA 2RNYA 4UIYA 5IGMA 3UW9A 4NYWA 3K2JA 5BT4A 5EA1A 1JSPB 4TZ2A 5D3RA 5KO4A 4HXMA 4MR4A 5KTXA 2E7NA 4NR6A 1F68A 5HQ7A 4QUUA 5CUDA 5EM3A 4UIVA 5BT5A 4O75A 5FH6A 4NRCA 4Z1SA 4HXRA 4A9MA 5LUUA 4N4IA 5FDZA 2RS9B 4QSWA 4KV1A 3IU6A 5ENHA 4LRGA 5DKDA 4QUTA 3UVYA 3VKGA 1ZKRA 3O34A 4NUEA 5C87A 4QEUA 4NR8A 5CRZA 5D3JA 4J0RA 5JWMA 4C66A 5D7XA 5LJ2A 5EPRA 5L8TA 4QYDA 4YYKA 5AD2A 3LJWA 5DY7A 3AQAA 5AMFA 4J0SA 4TQNA 5TCMA 4WHUA 5L96A 4A9NA 4MEQA 5DKCA 2DATA 3JVJA 4DONA 5FE3A 2I7KA 2N9GA 2DKWA 4IR3A 5DLZA 5EV9A 3MB3A 3NXBA 5H1TA 5A5RA 5A5NA 5D3LA 4UYDA 5DKHA 5F61A 5E9MA 4CFLA 4NR7A 3LXJA 4HBVA 4N3WA 5HLSA 4Z93A 5E9KA 4YYNA 2NXBA 5LJ1A 5C8GA 5CUGA 3VKHA 2WP1A 3UV2A 4J3IA 4QSPA 3U5OA 4C67A 5ENFA 3HMEA 4X2IA 5DBMA 4QC1A 5D25A 5CPEA 5HJCA 3O36A 3UV4A 5E7DA 4HXSA 5CQAA 4O77A 4HBXA 4BW3A 4A9FA 5CUCA 5D3PA 4A9EA 5AD3A 5F5ZA 5CFWA 5H1UA 5E3DA
chains in the Genus database with same CATH topology
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