4IR3A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-[7-amino-1-(pyrimidin-2-yl)indolizin-3-yl]ethanone (gsk2833282a)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir3A00
4MEOA 2YEKA 5HCLA 5E0RA 3AQAA 4A9OA 5LKUA 4J1PA 3LQHA 4N4FA 3RCWA 5D3SA 5AMEA 4NYWA 4A9MA 5FE5A 4F3IA 4TT6A 4AKNA 3ZYUA 4HXNA 4QSXA 5A5OA 5EV9A 5FG6A 4PTBA 5FH8A 4LYWA 4YYMA 1EQFA 2DVRA 5LJ2A 3Q2FA 5ENJA 3QZVA 4HXMA 4UYFA 5IGLA 5CQ6A 5HQ6A 4LR6A 1WUMA 4NXJA 5FE1A 5CFWA 1WUGA 5TCMA 5L96A 5G4RA 4XY9A 4NUCA 3O35A 5D0CA 4YATA 5CS8A 5KTUA 5A82A 3G0JA 5FE3A 2R0YA 5L98A 5CUGA 3TLPA 4TT4A 3LQJA 3MB3A 5EWDA 3Q2EA 4IORA 4O71A 2KTBB 5E9YA 2E3KA 4YBMA 4CFLA 5KU3A 5C4QA 4MEQA 3P1FA 4HBYA 5EICA 5H85A 5I7YA 5C8GA 5AD3A 4O75A 4O7EA 5IIDA 5HEMA 4CLBA 4BW1A 3S92A 4RVRA 4O78A 4NR4A 4YY6A 3O34A 5FBXA 2E7NA 5LKZA 5EK9A 1ZS5A 4YYDA 4HXPA 1E6IA 4O7BA 4HBXA 4UYGA 5CUBA 5A81A 3UVDA 4QSUA 4NQNA 4KV4A 2YELA 5FE6A 5AMFA 5DFCA 2L84A 2YW5A 5DYXA 4X2IA 4IR4A 4CURA 5HLSA 4N4IA 5HM0A 4NR8A 4TZ8A 5KTWA 4ZQLA 4CUPA 3P1DA 4YADA 5FE9A 2RO1A 2RNXA 2YYNA 5ENHA 5EWWA 5CZGA 4UYHA 5FH7A 4YYIA 5CQ7A 5KO4A 4OGJA 3JVLA 4LZ2A 4N4GA 4IOQA 3QZSA 5ETBA 5D7XA 5E9IA 2FSAA 5A5QA 5IGKA 4NR5A 5LJ1A 5EQ1A 3LXJA 5D3LA 4KV1A 3U5PA 5KTXA 4MR3A 4YY4A 4HBVA 5E9LA 5HFQA 5FE7A 3AADA 4HXKA 5IG6A 5C87A 3UW9A 5CQTA 4MR6A 5LKXA 3SVHA 4QR5A 5CRMA 5I7XA 4J3IA 4QEVA 5DYUA 4MR4A 4Z93A 5L8UA 4TU6A 4TS8A 5I29A 3U5MA 5K29A 2RNYA 5H1UA 1N72A 5E3DA 4QUUA 4CUQA 4CUSA 5C85A 4O76A 5A83A 4QBMA 5CRZA 2L85A 5AD2A 3G0LA 4Q0NA 2WP2A 5CUDA 5CQAA 3MUKA 5A5NA 2R0VA 3HMFA 4QEWA 5FH6A 4YK0A 5A5RA 5CPEA 5FB1A 3K2JA 5C89A 4UIYA 5L97A 4NYVA 5FB0A 5FG5A 3P1CA 5EU1A 4NR6A 3LJWA 5CTLA 5HQ7A 4QYLA 5LJ0A 5I1QA 5EWCA 4UIXA 4XYAA 3O36A 5CGPA 4QB3A 5D3NA 5E9MA 5EPBA 5DKHA 3U5LA 3UV2A 4C66A 4HXOA 4BW2A 3IU5A 4NRCA 5DKDA 4IR3A 5CQ3A 4NYXA 4QSPA 5TB6A 4MR5A 2RNWA 5J0DA 4LZRA 5CQ8A 5ENEA 3QZTA 4ZW1A 3O37A 5A5PA 5F63A 4QSSA 4HXRA 4O7FA 4WHUA 5ENBA 4MENA 5D25A 4UITA 5HRXA 3U5KA 5HENA 2F6NA 5EPRA 3HMEA 3LQIA 3ONIA 3DAIA 4NRAA 2DVSA 3DWYA 3P5OA 4XUAA 3UV4A 5DBMA 4QNSA 5A5SA 3UVXA 3MULA 5CQ4A 5DKCA 5F2PA 4Q0OA 4UIVA 5H1VA 2RFJA 2G4AA 4WIVA 2F6JA 4QSWA 5FE0A 5BT5A 5ENIA 4IOOA 4PCIA 5ENCA 5DYAA 4Z6HA 2DVQA 2DVVA 5EISA 2D9EA 4NS5A 5CP5A 5II1A 3D7CA 4YH3A 2DWWA 5LVRA 1JM4B 4UYFB 2OSSA 5HRWA 4CFKA 4QSRA 4BW3A 4QUTA 3GG3A 3NXBA 5F36A 4TZ2A 5HELA 5F3AA 5D3JA 4QYDA 4QZSA 4NRBA 5E73A 5I40A 4ALHA 4MEPA 4A9FA 5A7CA 4CL9A 5F5ZA 4HXLA 5EWVA 5KHMA 4Z1SA 4TQNA 1F68A 4O74A 2RS9B 5E74A 4J0RA 3HMHA 3JVMA 4NUDA 3MXFA 3FKMX 3SVGA 4A9HA 4YYNA 4QC3A 5EI4A 4BHWA 4DONA 3UVYA 4TYLA 4LYSA 5JI8A 3JVKA 2YDWA 4LZSA 4PCEA 5DY7A 2R10A 5ENGA 5FFYA 5DW1A 5ACYA 4GPJA 5IGMA 2WP1A 5EVAA 4QR3A 4OGIA 5F62A 5F1HA 4BJXA 3U5JA 5HRVA 5IBNA 5D24A 5LUUA 5EM3A 5BT4A 5I80A 5FE2A 5CUCA 3U5OA 4Z6IA 4LRGA 4CUUA 4LC2A 5IGNA 5E3GA 5COIA 4LDFA 4QSQA 5E7DA 4ZC9A 4NUEA 5D3HA 4LYIA 4A9EA 5DLXA 5A85A 5I89A 4KCXA 3UVWA 4UIZA 4A9IA 5II2A 5F61A 5FFWA 5F60A 5CUEA 2NXBA 5DLZA 5CQ5A 4E96A 3SVFA 4HXSA 5D3PA 5E9KA 2R0SA 4XY8A 2MJVB 5LKTA 5DW2A 3UV5A 5I83A 2L5EA 4A9JA 4BW4A 4A9NA 3O33A 4XUBA 5I86A 4YYJA 5D3RA 2GRCA 5CY9A 5I88A 4TT2A 4YBTA 4ALGA 5DFBA 4O70A 5FDZA 5ENFA 5L8TA 4NQMA 5HJCA 3S91A 4O7AA 4YC9A 5EWHA 5FE8A 3U5NA 2I8NA 4YH4A 5FG4A 4C67A 4WHWA 4TU4A 5EP7A 5HFRA 2DKWA 5G4SA 4IR6A 5BT3A 5FE4A 5HQ5A 4O72A 4HBWA 3I3JA 4N3WA 5CU8A 5ETDA 1X0JA 4PS5A 4UIWA 4UYDA 5CUAA 4YYGA 4PY6A 4QEUA 5D3TA 4TTEA 4UYEA 2YEMA 4NR7A 2DATA 2OO1A 4PKLA 4QY4A 3MB4A 4A9LA 5L99A 4QSTA 4YABA 5DFDA 5D26A 4QSVA 3JVJA 4YAXA 5F25A 3IU6A 2OUOA 2E7OA 5FFVA 2I7KA 4Z1QA 1JSPB 4Y03A 2RI7A 5C7NA 2D82A 2LSPB 4QC1A 4QR4A 5DX4A 4YYKA 2N9GA 4YBSA 5JWMA 4IR5A 4YYHA 4NR9A 5EPSA 5DYCA 4UIUA 4CUTA 2YQDA 4N4HA 5F1LA 4FLPA 2H60A 4A9KA 3MQMA 5EGUA 3P1EA 5E9VA 4O77A 4J0SA 4O7CA 5EA1A 5LVQA 5H1TA 4OUFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MEOA 2YEKA 5HCLA 5E0RA 3AQAA 4A9OA 5LKUA 4J1PA 3LQHA 4N4FA 3RCWA 5D3SA 5AMEA 4NYWA 4A9MA 5FE5A 4F3IA 4TT6A 4AKNA 3ZYUA 4HXNA 4QSXA 5A5OA 5EV9A 5FG6A 4PTBA 5FH8A 4LYWA 4YYMA 1EQFA 2DVRA 5LJ2A 3Q2FA 5ENJA 3QZVA 4HXMA 4UYFA 5IGLA 5CQ6A 5HQ6A 4LR6A 1WUMA 4NXJA 5FE1A 5CFWA 1WUGA 5TCMA 5L96A 5G4RA 4XY9A 4NUCA 3O35A 5D0CA 4YATA 5CS8A 3VKHA 5KTUA 5A82A 3G0JA 5FE3A 2R0YA 5L98A 5CUGA 3TLPA 4TT4A 3LQJA 3MB3A 5EWDA 3Q2EA 4IORA 4O71A 2KTBB 5E9YA 2E3KA 4YBMA 4CFLA 5KU3A 5C4QA 4MEQA 3P1FA 4HBYA 5EICA 5H85A 5I7YA 5C8GA 5AD3A 4O75A 4O7EA 5IIDA 5HEMA 4CLBA 4BW1A 3S92A 4RVRA 4O78A 3D1DA 4NR4A 4YY6A 3O34A 5FBXA 1ZKRA 2E7NA 5LKZA 5EK9A 1ZS5A 4YYDA 4HXPA 1E6IA 4O7BA 4HBXA 4UYGA 5CUBA 5A81A 3UVDA 4QSUA 4NQNA 4KV4A 2YELA 5FE6A 5AMFA 5DFCA 2L84A 2YW5A 5DYXA 4X2IA 4IR4A 4CURA 5HLSA 4N4IA 5HM0A 4NR8A 4TZ8A 5KTWA 4ZQLA 4CUPA 3P1DA 4YADA 5FE9A 2RO1A 2RNXA 2YYNA 5ENHA 5EWWA 5CZGA 4UYHA 5FH7A 4YYIA 5CQ7A 5KO4A 4OGJA 3JVLA 4LZ2A 4N4GA 4IOQA 3QZSA 5ETBA 5D7XA 5E9IA 2FSAA 5A5QA 5IGKA 4NR5A 5LJ1A 5EQ1A 3LXJA 5D3LA 4KV1A 3U5PA 5KTXA 4MR3A 4YY4A 4HBVA 5E9LA 5HFQA 5FE7A 3AADA 3D1BA 4HXKA 5IG6A 5C87A 3UW9A 5CQTA 4MR6A 4AKHA 5LKXA 3SVHA 4QR5A 5CRMA 5I7XA 4J3IA 4QEVA 5DYUA 4MR4A 4Z93A 5L8UA 4TU6A 4TS8A 5I29A 3U5MA 5K29A 2RNYA 5H1UA 1N72A 5E3DA 4QUUA 4CUQA 4CUSA 4AKGA 5C85A 4O76A 5A83A 4QBMA 5CRZA 2L85A 5AD2A 3G0LA 4Q0NA 2WP2A 5CUDA 5CQAA 3MUKA 5A5NA 2R0VA 3HMFA 4QEWA 5FH6A 4YK0A 5A5RA 5CPEA 5FB1A 3K2JA 5C89A 4UIYA 5L97A 4NYVA 5FB0A 5FG5A 3P1CA 5EU1A 4NR6A 3LJWA 5CTLA 5HQ7A 4QYLA 5LJ0A 5I1QA 5EWCA 4UIXA 4XYAA 3O36A 5CGPA 4QB3A 5D3NA 5E9MA 5EPBA 5DKHA 3U5LA 3UV2A 4C66A 4HXOA 4BW2A 3IU5A 4NRCA 5DKDA 4IR3A 5CQ3A 4NYXA 4QSPA 5TB6A 4MR5A 2RNWA 5J0DA 1PUOA 4LZRA 5CQ8A 5ENEA 3QZTA 4ZW1A 3O37A 5A5PA 5F63A 4QSSA 4HXRA 4O7FA 4WHUA 5ENBA 4MENA 5D25A 4UITA 5HRXA 3U5KA 5HENA 2F6NA 5EPRA 3HMEA 3LQIA 3ONIA 3DAIA 4NRAA 2DVSA 3VKGA 3ERRA 3DWYA 3P5OA 4XUAA 3UV4A 5DBMA 4QNSA 5A5SA 3UVXA 3MULA 5CQ4A 5DKCA 5F2PA 4Q0OA 4UIVA 5H1VA 2RFJA 2G4AA 4WIVA 2F6JA 4QSWA 5FE0A 5BT5A 5ENIA 4IOOA 4PCIA 5ENCA 5DYAA 4Z6HA 2DVQA 2DVVA 5EISA 2D9EA 4NS5A 5CP5A 5II1A 3D7CA 4YH3A 2DWWA 5LVRA 1JM4B 4UYFB 2OSSA 5HRWA 4CFKA 4QSRA 4BW3A 4QUTA 3GG3A 3NXBA 5F36A 4TZ2A 5HELA 5F3AA 5D3JA 4QYDA 4QZSA 4NRBA 5E73A 5I40A 4ALHA 4MEPA 4A9FA 5A7CA 4CL9A 5F5ZA 4HXLA 5EWVA 5KHMA 4Z1SA 4TQNA 1F68A 4O74A 2RS9B 5E74A 4J0RA 3HMHA 3JVMA 4NUDA 3MXFA 3FKMX 3SVGA 4A9HA 4YYNA 4QC3A 5EI4A 4BHWA 4DONA 3UVYA 4TYLA 4LYSA 5JI8A 3JVKA 2YDWA 4LZSA 4PCEA 5DY7A 2R10A 5ENGA 5FFYA 5DW1A 5ACYA 4GPJA 5IGMA 2WP1A 5EVAA 4QR3A 4OGIA 5F62A 5F1HA 4BJXA 3U5JA 5HRVA 5IBNA 5D24A 5LUUA 5EM3A 5BT4A 5I80A 5FE2A 5CUCA 3U5OA 4Z6IA 4LRGA 4CUUA 4LC2A 5IGNA 5E3GA 4AI6A 5COIA 4LDFA 4QSQA 5E7DA 4ZC9A 4NUEA 2EJNA 5D3HA 4LYIA 4A9EA 5DLXA 5A85A 5I89A 4KCXA 3UVWA 4UIZA 4A9IA 5II2A 5F61A 5FFWA 5F60A 5CUEA 2NXBA 5DLZA 5CQ5A 4E96A 3SVFA 4HXSA 5D3PA 5E9KA 2R0SA 4XY8A 2MJVB 5LKTA 5DW2A 3UV5A 5I83A 2L5EA 4A9JA 4BW4A 4A9NA 3O33A 4XUBA 5I86A 4YYJA 5D3RA 2GRCA 5CY9A 5I88A 4TT2A 4YBTA 4ALGA 5DFBA 4O70A 5FDZA 5ENFA 4AKIA 5L8TA 4NQMA 5HJCA 3S91A 4O7AA 4YC9A 5EWHA 5FE8A 3U5NA 2I8NA 4YH4A 5FG4A 4C67A 4WHWA 4TU4A 5EP7A 5HFRA 2DKWA 5G4SA 4IR6A 5BT3A 5FE4A 5HQ5A 4O72A 4HBWA 3I3JA 4N3WA 5CU8A 5ETDA 1X0JA 4PS5A 4UIWA 4UYDA 5CUAA 4YYGA 4PY6A 4QEUA 5D3TA 4TTEA 4UYEA 2YEMA 4NR7A 2DATA 2OO1A 4PKLA 4QY4A 3MB4A 4A9LA 5L99A 4QSTA 4YABA 5DFDA 5D26A 4QSVA 3JVJA 4YAXA 5F25A 3IU6A 2OUOA 2E7OA 5FFVA 2I7KA 4Z1QA 1JSPB 4Y03A 2RI7A 5C7NA 2D82A 2LSPB 4QC1A 4QR4A 5DX4A 4YYKA 2N9GA 4YBSA 5JWMA 4IR5A 4YYHA 4NR9A 5EPSA 5DYCA 4UIUA 4CUTA 2YQDA 4N4HA 5F1LA 4FLPA 2H60A 4A9KA 3MQMA 5EGUA 3P1EA 5E9VA 4O77A 4J0SA 4O7CA 5EA1A 5LVQA 5H1TA 4OUFA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4MEO A;  2YEK A;  5HCL A;  5E0R A;  3AQA A;  4A9O A;  5LKU A;  4J1P A;  3LQH A;  4N4F A;  3RCW A;  5D3S A;  5AME A;  4NYW A;  4A9M A;  5FE5 A;  4F3I A;  4TT6 A;  4AKN A;  3ZYU A;  4HXN A;  4QSX A;  5A5O A;  5EV9 A;  5FG6 A;  4PTB A;  5FH8 A;  4LYW A;  4YYM A;  1EQF A;  2DVR A;  5LJ2 A;  3Q2F A;  5ENJ A;  3QZV A;  4HXM A;  4UYF A;  5IGL A;  5CQ6 A;  5HQ6 A;  4LR6 A;  1WUM A;  4NXJ A;  5FE1 A;  5CFW A;  1WUG A;  5TCM A;  5L96 A;  5G4R A;  4XY9 A;  4NUC A;  3O35 A;  5D0C A;  4YAT A;  5CS8 A;  5KTU A;  5A82 A;  3G0J A;  5FE3 A;  2R0Y A;  5L98 A;  5CUG A;  3TLP A;  4TT4 A;  3LQJ A;  3MB3 A;  5EWD A;  3Q2E A;  4IOR A;  4O71 A;  2KTB B;  5E9Y A;  2E3K A;  4YBM A;  4CFL A;  5KU3 A;  5C4Q A;  4MEQ A;  3P1F A;  4HBY A;  5EIC A;  5H85 A;  5I7Y A;  5C8G A;  5AD3 A;  4O75 A;  4O7E A;  5IID A;  5HEM A;  4CLB A;  4BW1 A;  3S92 A;  4RVR A;  4O78 A;  4NR4 A;  4YY6 A;  3O34 A;  5FBX A;  2E7N A;  5LKZ A;  5EK9 A;  1ZS5 A;  4YYD A;  4HXP A;  1E6I A;  4O7B A;  4HBX A;  4UYG A;  5CUB A;  5A81 A;  3UVD A;  4QSU A; 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