4IR3A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-[7-amino-1-(pyrimidin-2-yl)indolizin-3-yl]ethanone (gsk2833282a)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir3A00
3LXJA 4NQNA 4N4FA 5D24A 5F1LA 3P1DA 4Z6HA 5FB1A 5D3NA 5FG6A 5IBNA 2H60A 5HEMA 2E3KA 4HXSA 5FE4A 4CLBA 5DYXA 5AMFA 3SVGA 2L85A 4HXPA 5D3HA 5FDZA 5HRVA 3QZSA 4IORA 5E9LA 5HFQA 4QEVA 4UIYA 5FE8A 4KCXA 1E6IA 5DX4A 5LJ1A 5COIA 5I29A 4NR8A 4XUAA 5D3SA 4A9FA 4QC1A 1WUGA 5TCMA 5FE3A 3UV4A 3QZTA 5ENFA 4Q0OA 5TB6A 5C87A 4QSXA 3IU6A 5EP7A 5FFYA 4BW1A 5F1HA 5A5NA 4O72A 4A9LA 5CUBA 5DYCA 2RI7A 4HXMA 4YH4A 4YY4A 4QSQA 2WP1A 5AD3A 4ZC9A 2RNYA 5F60A 2DWWA 3U5PA 4QB3A 2F6JA 5HQ6A 5HELA 4QEWA 2YW5A 4PCIA 3O33A 4QSWA 5I7XA 4BW3A 3O34A 4XYAA 5A5OA 4UYGA 5IGNA 4WHUA 4OUFA 4QR5A 5E9MA 3ZYUA 3FKMX 4MEOA 4BW2A 5JWMA 5G4RA 5D3PA 5H85A 3ONIA 2D9EA 5CFWA 5EQ1A 3RCWA 4O76A 5IIDA 5FH8A 3QZVA 5ENIA 5EWCA 4YADA 2DVRA 5I80A 5F63A 5IG6A 4YYKA 4MR4A 3UV2A 5ENGA 2R0SA 5EI4A 4NYWA 2GRCA 2DATA 3SVFA 4TZ8A 3HMFA 2I7KA 4YYIA 3O37A 5D3RA 3P1CA 5FE5A 4PTBA 5A5RA 5E9IA 5HCLA 2MJVB 5DLZA 4ZW1A 4UIWA 5L98A 2G4AA 5HM0A 4NYXA 1WUMA 4TU6A 5A83A 2RO1A 4QUUA 4TTEA 4N4GA 5HQ5A 4A9MA 4Z1QA 3U5OA 5F36A 4O77A 5I40A 3AADA 4LYIA 4UYEA 4CUTA 4MEPA 5DFCA 4QUTA 5F62A 5D0CA 4NRCA 3Q2FA 4UIZA 4UYDA 3SVHA 4YATA 4CFLA 5L8TA 5G4SA 4A9HA 5ACYA 4NR4A 5ETBA 4YYGA 5E3GA 5EPRA 4YBTA 5C4QA 3GG3A 5ENBA 2OSSA 5A81A 3MUKA 4PKLA 5DW1A 4QSVA 4MENA 4QSUA 2YYNA 5I1QA 4O7BA 5CUAA 4LC2A 5JI8A 5LKUA 4NRBA 5FH7A 2YDWA 5ENJA 5CQ7A 4NRAA 4IR3A 5CGPA 3LQIA 4FLPA 5HLSA 5A5SA 4A9IA 4CUUA 2YQDA 4WIVA 2DKWA 5ENHA 3TLPA 3O35A 2E7NA 5HJCA 4HXRA 4E96A 3P1FA 5L97A 4N4IA 4UIVA 2OO1A 5CY9A 5EVAA 3U5KA 4NR5A 3IU5A 5CQ6A 5AMEA 4QBMA 4NS5A 4PS5A 3UW9A 1ZS5A 5L8UA 4O78A 2WP2A 5FE9A 4N4HA 4C67A 3JVKA 3HMHA 5CRMA 5FE0A 5D26A 5IGLA 2LSPB 5KTXA 4Q0NA 3JVJA 4NQMA 4BW4A 5EWDA 1JSPB 4HXOA 4Z6IA 5D3JA 4A9NA 3LJWA 3P1EA 4AKNA 2KTBB 5EM3A 4YABA 4NUEA 5FE1A 4O7EA 3U5LA 5FE2A 4O74A 4QSTA 2DVVA 5II1A 2E7OA 3UV5A 4ZQLA 4QYDA 5IGKA 2OUOA 5KTWA 5L99A 4YBMA 4J3IA 2F6NA 5F3AA 5DBMA 5DFDA 5I7YA 4RVRA 5CUDA 4HXLA 4O70A 5A82A 5E73A 5CQTA 4QY4A 4CUQA 2YEKA 5I83A 5A7CA 4TT2A 4TS8A 4YYJA 4MR5A 5FG5A 3UVXA 4NR6A 3MXFA 5EV9A 5BT4A 4NR7A 2DVQA 5EPBA 4NXJA 4MEQA 5F61A 5J0DA 4PY6A 4HBXA 4TU4A 5DYUA 5F25A 4QR4A 2R10A 4UYFA 4NR9A 4TZ2A 4YK0A 5CP5A 4LYSA 4OGJA 5HQ7A 3HMEA 3K2JA 4LZRA 4O75A 2RNWA 5D3LA 4YYMA 5AD2A 3JVLA 3G0JA 5CU8A 5E9KA 4HBVA 5HRXA 5II2A 1EQFA 5FB0A 4HXKA 3LQHA 3DWYA 5A5QA 4TQNA 4LZ2A 5E7DA 5EWWA 5A85A 3G0LA 3Q2EA 5D25A 5KO4A 4UIXA 5FFWA 5EU1A 3UVWA 2D82A 5CQ3A 5C85A 5CQAA 5FH6A 4J0SA 2R0VA 5H1UA 4YYNA 5F2PA 5LKZA 4WHWA 4NYVA 5D7XA 5I86A 4NUDA 4QC3A 4O7CA 4YYHA 5I89A 3JVMA 4X2IA 5DFBA 5I88A 5E0RA 5BT5A 2RFJA 4LRGA 4UYFB 5ETDA 5LVRA 5FG4A 4QYLA 3NXBA 4YYDA 4TT4A 5EWHA 4ALGA 3MB3A 3MQMA 4ALHA 5EGUA 4MR6A 4UYHA 3DAIA 4CUSA 3LQJA 3U5MA 2I8NA 5C8GA 3U5NA 5HRWA 2YEMA 5CS8A 5DLXA 4Y03A 5LJ2A 4YH3A 5DY7A 5E9VA 2N9GA 5CTLA 2DVSA 3D7CA 5LKXA 2NXBA 5LVQA 4IR6A 5FBXA 5ENCA 5CQ4A 4LR6A 4GPJA 5BT3A 5C7NA 4XY9A 4YBSA 3AQAA 4QSRA 4QNSA 5EISA 5ENEA 4J1PA 4YAXA 5EA1A 5CQ8A 2R0YA 5H1VA 4YY6A 4CL9A 4QSPA 5CRZA 4OGIA 4IOQA 5D3TA 5E9YA 5H1TA 4QEUA 1X0JA 4DONA 3UVDA 4CFKA 5CQ5A 5KTUA 4NUCA 4O7FA 4A9EA 4C66A 3U5JA 3S91A 2RNXA 4HBWA 5LKTA 2RS9B 4Z93A 3O36A 3P5OA 5FE6A 4LDFA 3MB4A 4BJXA 4A9OA 5K29A 5DKDA 4CUPA 5DYAA 5L96A 4XY8A 4O7AA 4LYWA 4IR5A 5E3DA 3S92A 4HBYA 2L84A 1JM4B 1F68A 5FE7A 4F3IA 4YC9A 4BHWA 4CURA 5DKHA 4QR3A 5CUEA 4TYLA 4QZSA 4IR4A 5CPEA 2L5EA 4O71A 5EPSA 5E74A 5IGMA 5HENA 5KHMA 4KV4A 4HXNA 4UITA 5FFVA 2YELA 5LUUA 4UIUA 4LZSA 5CUGA 5EWVA 4TT6A 1N72A 4PCEA 5HFRA 4Z1SA 5F5ZA 5DKCA 4A9JA 5CUCA 5LJ0A 5KU3A 3UVYA 4N3WA 4MR3A 3MULA 4XUBA 5A5PA 4QSSA 4A9KA 4KV1A 5C89A 3I3JA 5CZGA 4IOOA 5EICA 5EK9A 2FSAA 4J0RA 5DW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LXJA 4NQNA 4N4FA 5D24A 5F1LA 3P1DA 4Z6HA 5FB1A 5D3NA 5FG6A 5IBNA 2H60A 5HEMA 2E3KA 4HXSA 5FE4A 4CLBA 5DYXA 5AMFA 3SVGA 2L85A 4HXPA 5D3HA 5FDZA 5HRVA 3QZSA 4IORA 5E9LA 5HFQA 4QEVA 4UIYA 4AKHA 5FE8A 4KCXA 1E6IA 5DX4A 5LJ1A 5COIA 5I29A 4NR8A 3D1DA 4XUAA 5D3SA 4A9FA 4QC1A 1WUGA 5TCMA 5FE3A 3UV4A 3QZTA 5ENFA 4Q0OA 5TB6A 5C87A 4QSXA 3IU6A 5EP7A 5FFYA 4BW1A 5F1HA 5A5NA 4O72A 4A9LA 5CUBA 5DYCA 2RI7A 4HXMA 4YH4A 4YY4A 4QSQA 2WP1A 5AD3A 4ZC9A 2RNYA 5F60A 2DWWA 3U5PA 4QB3A 2F6JA 5HQ6A 5HELA 4QEWA 2YW5A 4PCIA 3O33A 4QSWA 5I7XA 4BW3A 4AKGA 3O34A 4XYAA 5A5OA 4UYGA 5IGNA 4WHUA 4OUFA 4QR5A 5E9MA 3ZYUA 3FKMX 4MEOA 4BW2A 5JWMA 5G4RA 5D3PA 5H85A 3ONIA 2D9EA 5CFWA 5EQ1A 3RCWA 4O76A 5IIDA 3VKHA 5FH8A 3QZVA 5ENIA 5EWCA 4YADA 2DVRA 5I80A 5F63A 5IG6A 4YYKA 4MR4A 3UV2A 5ENGA 2R0SA 5EI4A 4NYWA 2GRCA 2DATA 3SVFA 4TZ8A 3HMFA 2I7KA 4YYIA 3O37A 5D3RA 3P1CA 5FE5A 4PTBA 5A5RA 5E9IA 5HCLA 2MJVB 5DLZA 4ZW1A 4UIWA 5L98A 2G4AA 5HM0A 4NYXA 1WUMA 4TU6A 5A83A 2RO1A 4QUUA 4TTEA 4N4GA 5HQ5A 4A9MA 4Z1QA 3U5OA 5F36A 4O77A 5I40A 3AADA 4LYIA 4UYEA 4CUTA 4MEPA 5DFCA 4QUTA 5F62A 3D1BA 4NRCA 5D0CA 3Q2FA 4UIZA 4UYDA 3SVHA 4YATA 4CFLA 5L8TA 5G4SA 4A9HA 5ACYA 4NR4A 5ETBA 4YYGA 5E3GA 5EPRA 4YBTA 5C4QA 3GG3A 5ENBA 2OSSA 5A81A 3MUKA 4PKLA 5DW1A 4QSVA 4MENA 4QSUA 2YYNA 5I1QA 4O7BA 5CUAA 4LC2A 5JI8A 5LKUA 3ERRA 4NRBA 5FH7A 2YDWA 5ENJA 5CQ7A 4NRAA 4IR3A 5CGPA 3LQIA 4FLPA 5HLSA 5A5SA 4A9IA 4CUUA 2YQDA 4WIVA 2DKWA 5ENHA 3TLPA 3O35A 2E7NA 5HJCA 4HXRA 4E96A 3P1FA 5L97A 4N4IA 4UIVA 2OO1A 5CY9A 5EVAA 3U5KA 4NR5A 3IU5A 5CQ6A 5AMEA 4QBMA 4NS5A 4PS5A 3UW9A 1ZS5A 5L8UA 4O78A 2WP2A 5FE9A 4N4HA 4C67A 3JVKA 3HMHA 5CRMA 5FE0A 5D26A 5IGLA 2LSPB 5KTXA 4Q0NA 3JVJA 4NQMA 4BW4A 5EWDA 1JSPB 4HXOA 4Z6IA 5D3JA 4A9NA 3LJWA 3P1EA 4AKNA 2KTBB 5EM3A 4YABA 4NUEA 5FE1A 4O7EA 3U5LA 5FE2A 4O74A 4QSTA 2DVVA 5II1A 2E7OA 3UV5A 4ZQLA 4QYDA 5IGKA 2OUOA 5KTWA 5L99A 1PUOA 4YBMA 4J3IA 2F6NA 5F3AA 5DBMA 5DFDA 5I7YA 4RVRA 5CUDA 4HXLA 4O70A 5A82A 5E73A 1ZKRA 5CQTA 4QY4A 4CUQA 2YEKA 5I83A 5A7CA 4TT2A 4TS8A 4YYJA 4MR5A 5FG5A 3UVXA 4NR6A 3MXFA 5EV9A 5BT4A 4NR7A 2DVQA 5EPBA 4NXJA 4MEQA 4AKIA 5F61A 5J0DA 4PY6A 4HBXA 4TU4A 4AI6A 5DYUA 5F25A 4QR4A 2R10A 4UYFA 4NR9A 4TZ2A 4YK0A 5CP5A 4LYSA 4OGJA 5HQ7A 3HMEA 3K2JA 4LZRA 4O75A 2RNWA 5D3LA 4YYMA 5AD2A 3JVLA 3G0JA 5CU8A 5E9KA 4HBVA 5HRXA 5II2A 1EQFA 5FB0A 4HXKA 3LQHA 3DWYA 5A5QA 4TQNA 4LZ2A 5E7DA 5EWWA 5A85A 3G0LA 3Q2EA 5D25A 5KO4A 4UIXA 5FFWA 5EU1A 3UVWA 2D82A 5CQ3A 5C85A 5CQAA 5FH6A 4J0SA 2R0VA 5H1UA 4YYNA 5F2PA 5LKZA 4WHWA 4NYVA 5D7XA 5I86A 4NUDA 4QC3A 4O7CA 4YYHA 5I89A 3JVMA 4X2IA 5DFBA 5I88A 2EJNA 5E0RA 5BT5A 2RFJA 4LRGA 4UYFB 5ETDA 5LVRA 5FG4A 4QYLA 3NXBA 4YYDA 4TT4A 5EWHA 4ALGA 3MB3A 3MQMA 4ALHA 5EGUA 4MR6A 4UYHA 3DAIA 4CUSA 3LQJA 3U5MA 2I8NA 5C8GA 3U5NA 5HRWA 2YEMA 5CS8A 5DLXA 4Y03A 5LJ2A 4YH3A 5DY7A 5E9VA 2N9GA 5CTLA 2DVSA 3D7CA 5LKXA 2NXBA 5LVQA 4IR6A 5FBXA 5ENCA 5CQ4A 4LR6A 4GPJA 5BT3A 5C7NA 4XY9A 4YBSA 3AQAA 4QSRA 4QNSA 5EISA 5ENEA 4J1PA 4YAXA 5EA1A 5CQ8A 2R0YA 5H1VA 4YY6A 4CL9A 4QSPA 5CRZA 4OGIA 4IOQA 5D3TA 5E9YA 5H1TA 4QEUA 1X0JA 4DONA 3UVDA 4CFKA 5CQ5A 5KTUA 4NUCA 4O7FA 4A9EA 4C66A 3U5JA 3S91A 2RNXA 4HBWA 5LKTA 2RS9B 4Z93A 3O36A 3P5OA 5FE6A 4LDFA 3MB4A 4BJXA 4A9OA 5K29A 5DKDA 4CUPA 5DYAA 5L96A 4XY8A 4O7AA 4LYWA 4IR5A 5E3DA 3S92A 4HBYA 2L84A 1JM4B 1F68A 5FE7A 4F3IA 4YC9A 4BHWA 4CURA 5DKHA 4QR3A 5CUEA 4TYLA 4QZSA 4IR4A 5CPEA 2L5EA 4O71A 5EPSA 5E74A 5IGMA 5HENA 5KHMA 4KV4A 4HXNA 4UITA 5FFVA 2YELA 5LUUA 4UIUA 4LZSA 5CUGA 5EWVA 4TT6A 1N72A 4PCEA 5HFRA 4Z1SA 5F5ZA 5DKCA 4A9JA 5CUCA 5LJ0A 5KU3A 3UVYA 4N3WA 4MR3A 3VKGA 3MULA 4XUBA 5A5PA 4QSSA 4A9KA 4KV1A 5C89A 3I3JA 5CZGA 4IOOA 5EICA 5EK9A 2FSAA 4J0RA 5DW2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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