4HBXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazolin ligand
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding/inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbxA01
3UVYA 4A9IA 4QC1A 2H60A 5CUEA 2D9EA 5EPSA 4HXLA 5CUGA 3JVJA 4HXPA 3UV5A 4CUUA 5CQTA 4MEQA 5EGUA 5CQ3A 5ENGA 4LYSA 4PS5A 4O7CA 5FBXA 5CUCA 4YATA 4QR5A 5II1A 5ENCA 4NUEA 5DYCA 2NXBA 2YW5A 5I40A 3G0JA 5DW1A 4QYDA 5EPBA 1WUMA 5DLZA 5BT5A 4QSVA 4MEPA 4PCEA 5L98A 4RVRA 5I89A 5FE5A 2L85A 5D26A 2I7KA 3Q2FA 1F68A 5L96A 5EISA 5DYXA 5DBMA 5CRMA 4NRAA 4NR4A 5A83A 4LZRA 5DX4A 5CQ5A 4UIVA 4UYHA 5KU3A 4NR9A 3O35A 5CQ7A 5AD3A 4HXMA 5KTUA 2OSSA 5DKDA 4QBMA 4YYGA 4QSWA 4NQNA 3U5PA 4YBTA 4O72A 2RI7A 4QB3A 5EWWA 5HEMA 5HFQA 2RO1A 5D25A 4E96A 4MR6A 4IORA 5F5ZA 5FB0A 4NRBA 5D3LA 2L5EA 3SVFA 4O76A 5DLXA 3LQJA 5HFRA 4J0RA 4TU4A 5C87A 4HXKA 5EP7A 5FG4A 5EA1A 5LJ1A 5CQ6A 3MXFA 4PKLA 4NUCA 5A7CA 5I1QA 5LKUA 5A81A 2YELA 5HRWA 4HXNA 5J0DA 4O7BA 4YYHA 5I29A 3TLPA 3AQAA 3UV2A 4CFKA 3U5JA 3K2JA 4TTEA 5FFVA 5H1TA 3QZSA 4NS5A 4XYAA 4WIVA 5EI4A 5FDZA 4WHUA 4Z6HA 5EICA 4UYFB 5F61A 4C67A 5JI8A 3P1EA 5CP5A 3GG3A 2RFJA 5DYUA 5D3SA 2MJVB 5E9IA 4YABA 5C8GA 3DWYA 5L8TA 5JWMA 3MULA 4NUDA 2DVRA 4UYFA 4QSTA 4A9EA 4C66A 4CUTA 2RNWA 4HBVA 5D24A 5KHMA 3O34A 3MUKA 4LC2A 4O7EA 4TT4A 3S91A 2GRCA 5A5OA 4O74A 4QYLA 5HENA 5IBNA 5IGLA 5CGPA 4UIYA 4LR6A 5LVQA 5D3JA 5AD2A 2D82A 4DONA 4TS8A 4PY6A 5HELA 5LJ2A 5EQ1A 2YEKA 5A85A 4NR6A 5FE0A 5E3DA 4LZ2A 5FFWA 5E3GA 5CQAA 4O75A 5E9VA 2E3KA 4TU6A 5HCLA 4QUTA 5A5QA 5I86A 4MR4A 5F1HA 5D3PA 5F3AA 4Z93A 3LQHA 5FFYA 4A9MA 4O78A 3LJWA 4N4HA 4LDFA 4QR3A 5FH7A 5HRVA 3P5OA 4CUQA 4ZW1A 5HJCA 4TT2A 3HMFA 5COIA 4NYVA 2LSPB 1JM4B 5FE7A 4IOOA 1N72A 5A5RA 5ENFA 5FE2A 4A9NA 3LQIA 3ONIA 2YDWA 5CQ4A 5H85A 5A5SA 3O37A 5FE6A 3DAIA 3MB4A 4A9FA 4OGJA 3UVDA 1E6IA 4A9HA 4YYKA 5D3TA 4FLPA 5LKXA 5FE4A 5EV9A 5BT3A 3P1CA 5CU8A 5DYAA 2R0VA 5DW2A 4KV4A 4N4GA 5G4SA 4YYIA 4ZQLA 5HQ5A 3SVHA 4N4IA 4IR4A 5FH6A 3QZTA 4NQMA 2N9GA 2E7NA 3S92A 2WP1A 5F1LA 5L99A 5LKTA 2RS9B 2L84A 4KV1A 4O7FA 3JVLA 4O77A 4YYJA 3JVMA 5E0RA 5FG5A 4XUBA 4UYDA 5I88A 4UITA 5ETDA 4Q0OA 5FE1A 5ACYA 5AMEA 4N4FA 4HBXA 5F36A 3U5KA 5A5PA 4O71A 4XUAA 5F2PA 4NR7A 4QSPA 1EQFA 5HQ6A 5ETBA 3FKMX 4LYWA 5C7NA 5TB6A 4NXJA 5EM3A 5FE8A 2YEMA 4OGIA 5DFCA 5AMFA 4J0SA 4YC9A 4CUSA 4MEOA 3P1DA 3O36A 4PTBA 5EU1A 3JVKA 5IGNA 3ZYUA 3U5OA 5IGMA 4Z1QA 4QSSA 4HBWA 5FE9A 5D7XA 4A9KA 5E9KA 4BW1A 5A82A 4HXRA 4J3IA 4CUPA 2KTBB 4BW4A 5DY7A 4BHWA 4YBMA 2FSAA 3HMEA 3P1FA 5E9LA 2I8NA 5ENHA 3UVWA 5CQ8A 4YY4A 5EVAA 5A5NA 4YK0A 4ALGA 5CFWA 5I7XA 2DWWA 4IR6A 5L97A 4QSQA 2RNXA 4QR4A 5D3NA 3MB3A 4TQNA 5IG6A 4MENA 5LJ0A 2DKWA 4ZC9A 5HLSA 5C85A 5LUUA 4PCIA 2RNYA 4TZ8A 5CY9A 4NR8A 5CRZA 5EWHA 5FG6A 4F3IA 4HBYA 4HXOA 2E7OA 4QEVA 5FB1A 5ENIA 4NRCA 5IIDA 5F60A 2DVVA 4Q0NA 4LYIA 5D3HA 4QUUA 4YY6A 3UV4A 5E73A 4YBSA 1X0JA 4CL9A 4TZ2A 1WUGA 4IOQA 4LRGA 4XY8A 4WHWA 5HM0A 4OUFA 4O70A 5F25A 5E9MA 3O33A 4QY4A 4QSXA 2YYNA 2F6NA 2YQDA 5C89A 5D0CA 3Q2EA 5CTLA 5FE3A 5LKZA 3AADA 4NYWA 4UIXA 4TYLA 5G4RA 3NXBA 4UYEA 3U5LA 5EWDA 4XY9A 3U5NA 4O7AA 4YYDA 3SVGA 4MR5A 2R0YA 5L8UA 5FH8A 4QEUA 4QC3A 3IU6A 5II2A 4IR5A 5KTXA 4AKNA 2DVSA 3I3JA 5EK9A 3D7CA 4BW2A 5ENEA 2F6JA 4QNSA 5DKHA 3G0LA 5ENBA 4QSUA 1JSPB 4KCXA 4CLBA 5BT4A 2DVQA 4NYXA 5K29A 3UVXA 4TT6A 5D3RA 5IGKA 2R0SA 2WP2A 4GPJA 4UYGA 4A9JA 4BJXA 4N3WA 5CUDA 4QSRA 5E74A 4ALHA 4A9LA 4CFLA 5EWVA 5KTWA 4Z6IA 5KO4A 5I83A 4YAXA 3HMHA 5EWCA 5E7DA 4IR3A 3MQMA 5DFBA 4Z1SA 4YADA 5I80A 5LVRA 5F62A 4QEWA 1ZS5A 5CUBA 5DFDA 5EPRA 5H1UA 3RCWA 3U5MA 4UIZA 5C4QA 4MR3A 2DATA 4NR5A 4UIUA 5CS8A 5H1VA 4UIWA 5I7YA 4LZSA 4J1PA 4YYMA 5E9YA 3IU5A 4Y03A 4X2IA 4BW3A 5TCMA 4YH3A 2R10A 2OO1A 3LXJA 5HQ7A 4HXSA 3UW9A 5CZGA 5DKCA 5F63A 2OUOA 4QZSA 3QZVA 2G4AA 5ENJA 4YYNA 4A9OA 5CUAA 4CURA 5CPEA 5HRXA 4YH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UVYA 4A9IA 4QC1A 2H60A 5CUEA 2D9EA 5EPSA 4HXLA 5CUGA 3JVJA 4HXPA 3UV5A 1PUOA 4CUUA 5CQTA 4MEQA 5EGUA 5CQ3A 5ENGA 4LYSA 4PS5A 4O7CA 5FBXA 5CUCA 4YATA 4QR5A 5II1A 5ENCA 4NUEA 4AI6A 5DYCA 2NXBA 2YW5A 5I40A 3G0JA 5DW1A 4QYDA 5EPBA 1WUMA 5DLZA 5BT5A 4QSVA 4MEPA 4PCEA 5L98A 4RVRA 5I89A 5FE5A 2L85A 5D26A 2I7KA 3Q2FA 1F68A 5L96A 5EISA 5DYXA 5DBMA 5CRMA 3VKGA 4NRAA 4NR4A 5A83A 4LZRA 5DX4A 5CQ5A 4UIVA 4UYHA 5KU3A 4NR9A 3O35A 5CQ7A 5AD3A 4HXMA 5KTUA 2OSSA 5DKDA 4QBMA 4YYGA 4QSWA 4NQNA 3U5PA 4YBTA 4O72A 2RI7A 3ERRA 4QB3A 5EWWA 5HEMA 5HFQA 2RO1A 5D25A 4E96A 4MR6A 4IORA 5F5ZA 5FB0A 4NRBA 5D3LA 2L5EA 3SVFA 4O76A 5DLXA 3LQJA 5HFRA 4J0RA 4TU4A 5C87A 4HXKA 5EP7A 5FG4A 5EA1A 5LJ1A 5CQ6A 3MXFA 4PKLA 4NUCA 5A7CA 5I1QA 5LKUA 5A81A 2YELA 5HRWA 4HXNA 5J0DA 4O7BA 4YYHA 5I29A 3TLPA 3AQAA 3UV2A 4CFKA 3U5JA 3K2JA 4TTEA 5FFVA 5H1TA 3QZSA 4NS5A 4XYAA 4WIVA 5EI4A 5FDZA 4WHUA 4Z6HA 5EICA 4UYFB 5F61A 4C67A 5JI8A 3P1EA 5CP5A 3GG3A 2RFJA 5DYUA 5D3SA 2MJVB 5E9IA 4YABA 5C8GA 3DWYA 5L8TA 5JWMA 3MULA 4NUDA 3D1BA 2DVRA 4UYFA 4QSTA 4A9EA 4C66A 4CUTA 2RNWA 4HBVA 5D24A 5KHMA 3O34A 3MUKA 4LC2A 4O7EA 4TT4A 3S91A 2GRCA 5A5OA 4O74A 4QYLA 5HENA 5IBNA 5IGLA 5CGPA 4UIYA 4LR6A 5LVQA 5D3JA 5AD2A 2D82A 4DONA 4TS8A 4PY6A 5HELA 5LJ2A 5EQ1A 2YEKA 3D1DA 5A85A 4NR6A 5FE0A 5E3DA 4LZ2A 5FFWA 5E3GA 5CQAA 4O75A 5E9VA 2E3KA 4TU6A 5HCLA 4QUTA 5A5QA 5I86A 4MR4A 5F1HA 5D3PA 5F3AA 4Z93A 3LQHA 5FFYA 4A9MA 4O78A 3LJWA 4N4HA 4LDFA 4QR3A 5FH7A 5HRVA 3P5OA 4CUQA 4ZW1A 5HJCA 4TT2A 3HMFA 5COIA 4NYVA 2LSPB 1JM4B 5FE7A 4IOOA 1N72A 5A5RA 5ENFA 5FE2A 4A9NA 3LQIA 3ONIA 2YDWA 5CQ4A 5H85A 5A5SA 3O37A 5FE6A 3DAIA 3MB4A 4A9FA 4OGJA 3UVDA 1E6IA 4A9HA 4YYKA 5D3TA 4AKHA 4FLPA 5LKXA 5FE4A 5EV9A 5BT3A 3P1CA 5CU8A 5DYAA 2R0VA 5DW2A 4KV4A 4N4GA 5G4SA 4YYIA 4ZQLA 5HQ5A 3SVHA 4N4IA 4IR4A 5FH6A 3QZTA 4NQMA 2N9GA 2E7NA 3S92A 2WP1A 5F1LA 5L99A 5LKTA 2RS9B 2L84A 4KV1A 4O7FA 3JVLA 4O77A 4YYJA 3JVMA 5E0RA 5FG5A 4XUBA 4UYDA 5I88A 4UITA 5ETDA 4Q0OA 5FE1A 5ACYA 5AMEA 4N4FA 4HBXA 5F36A 3U5KA 5A5PA 4O71A 4XUAA 5F2PA 4NR7A 4QSPA 1EQFA 5HQ6A 5ETBA 3FKMX 4LYWA 5C7NA 5TB6A 4NXJA 5EM3A 5FE8A 2YEMA 4OGIA 5DFCA 5AMFA 4J0SA 4YC9A 4CUSA 4MEOA 3P1DA 3O36A 4PTBA 5EU1A 3JVKA 5IGNA 3ZYUA 3U5OA 5IGMA 4Z1QA 4QSSA 4HBWA 5FE9A 5D7XA 4A9KA 5E9KA 4BW1A 5A82A 4HXRA 4J3IA 4CUPA 2KTBB 4BW4A 5DY7A 4BHWA 4YBMA 2FSAA 3HMEA 3P1FA 5E9LA 2I8NA 5ENHA 3UVWA 5CQ8A 4YY4A 5EVAA 5A5NA 4YK0A 4ALGA 5CFWA 5I7XA 2DWWA 4IR6A 5L97A 4QSQA 2RNXA 4QR4A 5D3NA 3MB3A 4TQNA 5IG6A 4MENA 5LJ0A 2DKWA 4ZC9A 5HLSA 5C85A 5LUUA 4PCIA 2RNYA 4TZ8A 5CY9A 4NR8A 5CRZA 5EWHA 5FG6A 4F3IA 2EJNA 4HBYA 4HXOA 2E7OA 4QEVA 5FB1A 5ENIA 4NRCA 5IIDA 5F60A 2DVVA 4Q0NA 4LYIA 5D3HA 4QUUA 4YY6A 3UV4A 5E73A 4YBSA 1X0JA 4CL9A 4TZ2A 1WUGA 4IOQA 4LRGA 4XY8A 4WHWA 5HM0A 4OUFA 4O70A 5F25A 5E9MA 3O33A 4QY4A 4QSXA 2YYNA 2F6NA 2YQDA 5C89A 5D0CA 3Q2EA 5CTLA 5FE3A 5LKZA 3AADA 4NYWA 4UIXA 4TYLA 5G4RA 3NXBA 4UYEA 3U5LA 5EWDA 4XY9A 3U5NA 4O7AA 4YYDA 3SVGA 4MR5A 2R0YA 5L8UA 5FH8A 4QEUA 4QC3A 3IU6A 5II2A 4IR5A 5KTXA 4AKNA 2DVSA 3I3JA 5EK9A 3D7CA 4BW2A 5ENEA 4AKIA 2F6JA 4QNSA 3VKHA 5DKHA 3G0LA 5ENBA 4QSUA 1JSPB 4KCXA 4CLBA 5BT4A 2DVQA 4NYXA 5K29A 3UVXA 4TT6A 5D3RA 5IGKA 2R0SA 2WP2A 4GPJA 4UYGA 4A9JA 4BJXA 4N3WA 5CUDA 4QSRA 5E74A 4ALHA 4A9LA 4CFLA 5EWVA 5KTWA 4Z6IA 5KO4A 5I83A 4YAXA 3HMHA 5EWCA 5E7DA 4IR3A 3MQMA 5DFBA 4Z1SA 4YADA 5I80A 5LVRA 5F62A 4QEWA 1ZS5A 5CUBA 5DFDA 5EPRA 5H1UA 3RCWA 3U5MA 4UIZA 5C4QA 4MR3A 2DATA 4NR5A 4UIUA 5CS8A 4AKGA 5H1VA 4UIWA 5I7YA 4LZSA 4J1PA 4YYMA 5E9YA 3IU5A 4Y03A 1ZKRA 4X2IA 4BW3A 5TCMA 4YH3A 2R10A 2OO1A 3LXJA 5HQ7A 4HXSA 3UW9A 5CZGA 5DKCA 5F63A 2OUOA 4QZSA 3QZVA 2G4AA 5ENJA 4YYNA 4A9OA 5CUAA 4CURA 5CPEA 5HRXA 4YH4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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