4HBXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazolin ligand
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbxA01
5FB0A 4NUDA 5BT5A 4LR6A 3O36A 5HFRA 5AMEA 5IGLA 5DW2A 3QZTA 5HLSA 5L99A 4QZSA 5ENGA 5EPSA 5HJCA 1JSPB 3K2JA 4QSUA 3HMFA 5IBNA 2YW5A 3D7CA 4O72A 5DLXA 5EQ1A 4YY4A 4YBMA 5H1UA 5KTWA 5CQ5A 5EA1A 2R0VA 4UITA 4X2IA 5FE1A 4PCEA 4BW2A 3JVLA 5A5RA 5KTXA 4QEWA 3DWYA 5E9YA 3MB3A 4NRCA 4BW1A 4YYJA 4UIWA 5D7XA 5EU1A 4BJXA 4MENA 4HXOA 5D3SA 4J0SA 4NQNA 4YATA 4O7AA 5FE0A 5I29A 5II2A 5CTLA 3QZVA 2YEKA 5ETBA 5ENJA 4OUFA 4TT2A 5CZGA 4ZQLA 5F25A 5I40A 3P1EA 4CUQA 4YADA 5C85A 4MR6A 4YYGA 4MR4A 4XY8A 5CFWA 4A9FA 2WP1A 3LJWA 5E9LA 5F61A 2L84A 5I7XA 4IOQA 5CQ4A 4NR5A 4N4GA 4DONA 4QR3A 4YC9A 3U5OA 2I7KA 3U5KA 5A83A 4FLPA 3O33A 5EICA 5FE6A 4CL9A 5IGKA 2G4AA 4NR7A 5A81A 4CFLA 5A5PA 1N72A 4QSRA 5COIA 4YYKA 2D82A 5J0DA 5E0RA 5F60A 5AMFA 4QSWA 5CQ3A 2L5EA 4PTBA 2E3KA 5E9MA 4ALGA 4ZW1A 3RCWA 5LUUA 5I83A 3JVJA 4IR5A 4MEQA 4HBYA 5H1TA 2RNXA 5CUDA 3MUKA 4IORA 3I3JA 5EISA 5E9IA 5FG4A 1JM4B 5FH7A 3S91A 5FB1A 4HBVA 5CQ6A 5DY7A 5CP5A 4O7BA 4A9JA 5EGUA 4O7CA 4YAXA 4KV1A 4YYDA 2RS9B 5FBXA 4A9EA 4TQNA 4C67A 2E7OA 4NYVA 4YH4A 2RI7A 5F62A 5KO4A 5FE7A 4YABA 3AQAA 3O37A 4LRGA 3AADA 5KU3A 4HXNA 5DFDA 4QSVA 4TT6A 5D26A 4XYAA 4UIYA 5ENFA 5H1VA 5BT3A 5DKCA 2H60A 5HRWA 2F6NA 5FDZA 5HRXA 4NYWA 4PKLA 3P1CA 4CLBA 4PY6A 4UYHA 5D3JA 4CUUA 4N4IA 3JVMA 5D3LA 4BW4A 3ZYUA 4QR5A 2DKWA 4O71A 5D3RA 2LSPB 5DLZA 4WHUA 4LYWA 2RNWA 4BHWA 5HFQA 1E6IA 4QUTA 5EWWA 4LC2A 5G4RA 4O77A 3P1FA 5DFBA 3MB4A 4QC1A 4Q0OA 5CPEA 3LQHA 1ZS5A 5HCLA 5I7YA 4QB3A 5I89A 3UVXA 4CURA 4IR6A 4NRBA 2YEMA 4A9IA 4O7FA 5AD3A 4XY9A 3HMEA 5FE8A 3LQIA 5CRZA 2F6JA 4A9LA 4N4FA 5CQ7A 5EK9A 3SVFA 5IG6A 5CUGA 5EWCA 3SVHA 5F3AA 4ALHA 5ENBA 2YDWA 5H85A 5DYUA 5E73A 4NYXA 4YK0A 2FSAA 5DYXA 2I8NA 4O75A 5CQAA 5DKDA 4QYDA 5HELA 1WUGA 4O78A 4OGIA 2DVSA 5E3GA 4Y03A 3DAIA 4HXKA 4A9NA 5HM0A 5DKHA 4YYNA 5C7NA 5LKXA 5D3TA 5F1LA 5HEMA 1F68A 4QSPA 4HXRA 4MR5A 4HXPA 5ENCA 5D0CA 3JVKA 2DWWA 5I1QA 5LKUA 3Q2EA 5E3DA 5LJ1A 5HQ7A 4N3WA 4KV4A 5DYAA 5EWVA 3U5LA 3HMHA 5ETDA 5EWHA 4O76A 5DW1A 5A5SA 4J0RA 4YY6A 2R0YA 4LYIA 2RFJA 3MXFA 2E7NA 5FE9A 5FFWA 4Z6IA 4LZ2A 3UW9A 5L8UA 4PS5A 3SVGA 5IGMA 4QSXA 5ENIA 3G0JA 2WP2A 4LZSA 3UV2A 5HQ6A 4TZ8A 5A5OA 4Z1QA 4YYMA 1EQFA 4PCIA 4A9HA 4XUAA 5DBMA 5HQ5A 5D3PA 5LKTA 5CU8A 4YBTA 4IR4A 5I88A 5DFCA 5DX4A 2DATA 5AD2A 4NR8A 4CUTA 3P1DA 4F3IA 4UIZA 3P5OA 4MR3A 3LQJA 5ACYA 4O7EA 4QEVA 5EVAA 4LZRA 5FH6A 5F63A 4N4HA 4UIVA 5FE4A 4Z6HA 4QY4A 4NR9A 5EI4A 5JWMA 4J3IA 4NQMA 2NXBA 4MEOA 5HRVA 4NRAA 5F36A 4J1PA 2OSSA 3Q2FA 3U5JA 5CUEA 5KHMA 4OGJA 4CUSA 2DVRA 2D9EA 4TU6A 4NXJA 4UIXA 4BW3A 4CFKA 5EWDA 5JI8A 4O70A 1X0JA 2RNYA 5E9KA 4YYIA 5C4QA 5CUCA 4O74A 5CUAA 5K29A 4QYLA 5D3HA 4TYLA 5LKZA 5FFYA 5LJ2A 4NUEA 4HXMA 4QUUA 4GPJA 4YYHA 5C87A 2YYNA 5KTUA 5F1HA 5CGPA 5FG5A 5G4SA 4A9MA 3LXJA 2DVVA 5E74A 5FH8A 4UYGA 5E9VA 5A85A 3U5PA 5D3NA 3ONIA 4Z93A 4XUBA 3QZSA 5CS8A 2DVQA 4IOOA 4QR4A 4UYDA 5D24A 5A7CA 5A82A 4NUCA 4Q0NA 2YQDA 4QNSA 4RVRA 5ENHA 4UYFA 5I80A 4LYSA 5L97A 4WHWA 3MQMA 4UIUA 4HBXA 3UV4A 5L98A 5CY9A 5D25A 2RO1A 4IR3A 4UYFB 2YELA 5IIDA 2KTBB 3UVWA 5CRMA 2L85A 4E96A 3FKMX 4A9KA 5F2PA 2R0SA 4QSSA 5II1A 3U5NA 3UVDA 4WIVA 5FG6A 3UV5A 5FE2A 2N9GA 1WUMA 5EP7A 5F5ZA 5A5NA 4CUPA 4HBWA 4TS8A 4QC3A 4YBSA 4LDFA 5E7DA 4AKNA 5L8TA 3G0LA 4ZC9A 5CQ8A 4UYEA 4HXLA 5FE5A 3IU5A 3S92A 3IU6A 5HENA 3TLPA 3UVYA 5I86A 2OUOA 2GRCA 4TU4A 5EM3A 4YH3A 3O35A 5BT4A 4QBMA 4QSTA 5ENEA 2OO1A 5IGNA 4KCXA 4HXSA 4Z1SA 5CQTA 5C8GA 5TB6A 5EPBA 2MJVB 4NR4A 5EPRA 4A9OA 3GG3A 5EV9A 3U5MA 4C66A 5LVRA 2R10A 3O34A 5DYCA 5FE3A 3MULA 5TCMA 5A5QA 4MEPA 4QEUA 4TT4A 3NXBA 5C89A 4TTEA 5LJ0A 5FFVA 5LVQA 4TZ2A 5CUBA 4NS5A 4NR6A 4QSQA 5L96A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EJNA 5FB0A 4NUDA 5BT5A 4LR6A 3O36A 5HFRA 5AMEA 5IGLA 5DW2A 3QZTA 5HLSA 5L99A 4QZSA 5ENGA 5EPSA 5HJCA 1JSPB 3K2JA 4QSUA 3HMFA 5IBNA 2YW5A 3D7CA 4O72A 5DLXA 5EQ1A 4YY4A 4YBMA 5H1UA 5KTWA 5CQ5A 5EA1A 2R0VA 4AI6A 4UITA 4X2IA 5FE1A 4PCEA 4BW2A 3JVLA 5A5RA 5KTXA 4QEWA 3DWYA 5E9YA 3MB3A 4NRCA 4BW1A 4YYJA 4UIWA 5D7XA 5EU1A 4BJXA 4MENA 4HXOA 5D3SA 4J0SA 4NQNA 4YATA 4O7AA 5FE0A 5I29A 5II2A 4AKHA 5CTLA 3QZVA 2YEKA 5ETBA 5ENJA 4OUFA 4TT2A 5CZGA 4ZQLA 5F25A 5I40A 3P1EA 4CUQA 4YADA 5C85A 4MR6A 4YYGA 4MR4A 4XY8A 5CFWA 4A9FA 2WP1A 3LJWA 5E9LA 5F61A 2L84A 5I7XA 4IOQA 5CQ4A 4NR5A 4N4GA 4DONA 4QR3A 4YC9A 3U5OA 2I7KA 3U5KA 5A83A 4FLPA 3O33A 5EICA 5FE6A 4CL9A 5IGKA 2G4AA 4NR7A 5A81A 4CFLA 5A5PA 1N72A 4QSRA 5COIA 4YYKA 2D82A 5J0DA 5E0RA 5F60A 5AMFA 4QSWA 5CQ3A 2L5EA 4PTBA 2E3KA 5E9MA 4ALGA 4ZW1A 3RCWA 5LUUA 5I83A 3JVJA 4IR5A 4MEQA 4HBYA 5H1TA 2RNXA 5CUDA 3MUKA 4IORA 3I3JA 5EISA 5E9IA 5FG4A 1JM4B 5FH7A 3S91A 5FB1A 4HBVA 5CQ6A 5DY7A 5CP5A 4O7BA 4A9JA 4AKIA 5EGUA 4O7CA 4YAXA 4KV1A 4YYDA 2RS9B 5FBXA 4A9EA 4TQNA 4C67A 2E7OA 4NYVA 4YH4A 2RI7A 5F62A 5KO4A 5FE7A 4YABA 3AQAA 3O37A 4LRGA 3AADA 5KU3A 4HXNA 5DFDA 4QSVA 4TT6A 5D26A 4XYAA 4UIYA 5ENFA 5H1VA 5BT3A 5DKCA 2H60A 5HRWA 2F6NA 5FDZA 5HRXA 4NYWA 4PKLA 3P1CA 4CLBA 4PY6A 4UYHA 5D3JA 4CUUA 4N4IA 3JVMA 5D3LA 4BW4A 3ZYUA 4QR5A 2DKWA 4O71A 5D3RA 2LSPB 5DLZA 4WHUA 4LYWA 2RNWA 4BHWA 5HFQA 1E6IA 4QUTA 5EWWA 4LC2A 5G4RA 4O77A 3P1FA 5DFBA 3MB4A 4QC1A 4Q0OA 5CPEA 3LQHA 1ZS5A 5HCLA 5I7YA 4QB3A 5I89A 3UVXA 4CURA 4IR6A 4NRBA 2YEMA 4A9IA 4O7FA 5AD3A 4XY9A 3HMEA 5FE8A 3ERRA 3LQIA 5CRZA 2F6JA 4A9LA 4N4FA 5CQ7A 5EK9A 3SVFA 5IG6A 5CUGA 5EWCA 3SVHA 5F3AA 4ALHA 5ENBA 2YDWA 5H85A 5DYUA 5E73A 4NYXA 4YK0A 2FSAA 5DYXA 2I8NA 4O75A 5CQAA 5DKDA 4QYDA 5HELA 1WUGA 4O78A 4OGIA 2DVSA 5E3GA 4Y03A 3DAIA 4HXKA 4A9NA 5HM0A 5DKHA 4YYNA 5C7NA 5LKXA 5D3TA 5F1LA 5HEMA 1F68A 4QSPA 4HXRA 4MR5A 4HXPA 5ENCA 5D0CA 3JVKA 2DWWA 5I1QA 5LKUA 3Q2EA 5E3DA 5LJ1A 5HQ7A 4N3WA 4KV4A 5DYAA 5EWVA 3U5LA 3HMHA 5ETDA 5EWHA 4O76A 5DW1A 5A5SA 4J0RA 4YY6A 2R0YA 4LYIA 2RFJA 3MXFA 2E7NA 5FE9A 5FFWA 4Z6IA 4LZ2A 3UW9A 5L8UA 4PS5A 3SVGA 5IGMA 3VKGA 4QSXA 5ENIA 3G0JA 2WP2A 4LZSA 3UV2A 5HQ6A 4TZ8A 5A5OA 4Z1QA 4YYMA 1EQFA 3D1DA 4PCIA 4A9HA 4XUAA 5DBMA 5HQ5A 5D3PA 5LKTA 5CU8A 4YBTA 4IR4A 5I88A 5DFCA 5DX4A 3VKHA 2DATA 5AD2A 4NR8A 4CUTA 1ZKRA 3P1DA 4F3IA 4UIZA 3P5OA 4MR3A 3LQJA 5ACYA 4O7EA 4QEVA 5EVAA 4LZRA 5FH6A 5F63A 4N4HA 4UIVA 5FE4A 4Z6HA 4QY4A 4NR9A 5EI4A 5JWMA 4J3IA 4NQMA 2NXBA 4MEOA 5HRVA 4NRAA 5F36A 4J1PA 2OSSA 3Q2FA 3U5JA 5CUEA 5KHMA 4AKGA 4OGJA 4CUSA 2DVRA 2D9EA 4TU6A 4NXJA 4UIXA 4BW3A 4CFKA 5EWDA 5JI8A 4O70A 1X0JA 2RNYA 5E9KA 4YYIA 5C4QA 5CUCA 4O74A 5CUAA 1PUOA 5K29A 4QYLA 5D3HA 4TYLA 5LKZA 5FFYA 5LJ2A 4NUEA 4HXMA 4QUUA 4GPJA 4YYHA 5C87A 2YYNA 5KTUA 5F1HA 5CGPA 5FG5A 5G4SA 4A9MA 3LXJA 2DVVA 5E74A 5FH8A 4UYGA 5E9VA 5A85A 3U5PA 5D3NA 3ONIA 4Z93A 4XUBA 3QZSA 5CS8A 2DVQA 4IOOA 4QR4A 4UYDA 5D24A 5A7CA 5A82A 4NUCA 4Q0NA 2YQDA 4QNSA 4RVRA 5ENHA 4UYFA 5I80A 4LYSA 5L97A 4WHWA 3MQMA 4UIUA 4HBXA 3UV4A 5L98A 5CY9A 5D25A 2RO1A 4IR3A 4UYFB 2YELA 5IIDA 2KTBB 3UVWA 5CRMA 2L85A 4E96A 3FKMX 4A9KA 5F2PA 2R0SA 4QSSA 5II1A 3U5NA 3UVDA 4WIVA 5FG6A 3UV5A 5FE2A 2N9GA 1WUMA 5EP7A 5F5ZA 5A5NA 4CUPA 4HBWA 4TS8A 4QC3A 4YBSA 4LDFA 5E7DA 4AKNA 5L8TA 3G0LA 4ZC9A 5CQ8A 4UYEA 4HXLA 5FE5A 3IU5A 3S92A 3IU6A 5HENA 3TLPA 3UVYA 3D1BA 5I86A 2OUOA 2GRCA 4TU4A 5EM3A 4YH3A 3O35A 5BT4A 4QBMA 4QSTA 5ENEA 2OO1A 5IGNA 4KCXA 4HXSA 4Z1SA 5CQTA 5C8GA 5TB6A 5EPBA 2MJVB 4NR4A 5EPRA 4A9OA 3GG3A 5EV9A 3U5MA 4C66A 5LVRA 2R10A 3O34A 5DYCA 5FE3A 3MULA 5TCMA 5A5QA 4MEPA 4QEUA 4TT4A 3NXBA 5C89A 4TTEA 5LJ0A 5FFVA 5LVQA 4TZ2A 5CUBA 4NS5A 4NR6A 4QSQA 5L96A
chains in the Genus database with same CATH topology
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