4CFKA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ly294002
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BRD4 PROTEIN
publication title The Commonly Used Pi3-Kinase Probe Ly294002 is an Inhibitor of Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Cell cycle
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cfkA01
5CUEA 5D3LA 3IU5A 5FH7A 4O7EA 4QR3A 4AKNA 4UYFB 1EQFA 1WUMA 4O7CA 4MR3A 4QSVA 2KTBB 2RNXA 4MEQA 5L98A 2YQDA 4QSUA 4XY8A 4O7BA 3QZSA 4ALHA 5DYAA 4NXJA 5FB1A 5EWDA 4A9EA 1X0JA 2E3KA 5KHMA 4TU6A 4TU4A 4TT4A 4FLPA 2YEMA 3IU6A 5I1QA 4WHUA 4YYHA 4TZ2A 5A7CA 3UV4A 4YYJA 4UYHA 4IR3A 4BW3A 4QBMA 5LKTA 5FE9A 5FE5A 5ETBA 5HQ7A 5CUBA 5EGUA 5CFWA 4QSPA 4YYIA 4OUFA 4A9HA 4QC3A 4PCIA 4QSWA 5CQ4A 5CQ5A 4LRGA 5CUCA 5HRWA 4QUUA 5FE1A 3U5LA 2DWWA 5CU8A 2OUOA 4HBXA 3P1DA 5A81A 4YC9A 4QY4A 5ENCA 2D9EA 4CUQA 4NR8A 3ONIA 5E9LA 4NRCA 5II1A 5LJ2A 4PTBA 5FFWA 4A9KA 4LZRA 2E7OA 4XUAA 5DFBA 4CFKA 5C8GA 5ENJA 3UVWA 4QC1A 3S91A 3G0LA 5A82A 4C67A 5E3GA 5KO4A 5DW1A 3FKMX 5EWHA 5FE4A 5CRZA 5CQ6A 4QEVA 5CTLA 5EWWA 4J3IA 4OGIA 3P1FA 4LYIA 4TT6A 5E9KA 2DVRA 4Q0OA 5EM3A 5CQ8A 5E9MA 5FE8A 4Y03A 5F3AA 3MB3A 3SVHA 1ZS5A 5E74A 4PCEA 5I7YA 3LQIA 4TS8A 5EISA 4J0RA 3MB4A 4KV4A 4TZ8A 5EP7A 5DYCA 4YYGA 5EPSA 5FE0A 3O36A 5TB6A 2RS9B 3HMEA 2RNWA 4QUTA 5FB0A 3UVYA 4QSQA 2R0VA 5AD3A 4MR6A 5CPEA 4A9JA 5C4QA 4MR5A 5KU3A 4LYWA 3Q2EA 5L8TA 3G0JA 4LR6A 5LJ1A 5I86A 3QZVA 5DFCA 4C66A 4NQMA 4CLBA 5CQ3A 5FG4A 4UYEA 2I7KA 2YDWA 5J0DA 4IR6A 5EICA 2GRCA 5I40A 4IORA 3UV2A 4A9OA 3MULA 4IOQA 3LJWA 5TCMA 3O35A 4MR4A 2LSPB 5CUDA 5FH8A 4LZSA 4Z6IA 5E9YA 2YELA 3P5OA 4YYMA 4YATA 3HMFA 2L85A 5A5RA 4BW4A 2E7NA 4O74A 5E3DA 4KCXA 5FG5A 4BW2A 2WP1A 5HENA 5AD2A 4XUBA 4ALGA 5DFDA 5D3PA 4IOOA 5CP5A 5DY7A 5EI4A 4J1PA 2F6JA 4N4IA 4IR5A 5C7NA 4Z6HA 5II2A 5COIA 5FFYA 2L84A 4YAXA 5DYXA 4A9MA 5H1TA 5DKCA 5HRVA 3UW9A 3UV5A 4UIUA 5DYUA 5F1LA 5IGKA 5A5SA 4QSSA 5A83A 4QR4A 1F68A 4NUDA 5D3NA 5D3JA 5HQ6A 5H1VA 5CS8A 2WP2A 5ENBA 4O71A 1N72A 4YYKA 4ZQLA 3MQMA 3UVDA 4YH3A 5A85A 3MXFA 5ENGA 3TLPA 2RFJA 4NQNA 5CQ7A 5BT5A 3Q2FA 5HJCA 4KV1A 4YBTA 5F1HA 4Z1QA 4NR9A 4UIXA 5EA1A 4CUPA 4UIVA 5IGNA 4NUEA 4O78A 5DW2A 4ZW1A 5F25A 4HBVA 5D3RA 4UITA 3GG3A 5ACYA 4MENA 3D7CA 3LQHA 1JSPB 5I88A 5E73A 2FSAA 3NXBA 4XYAA 5LJ0A 3AQAA 5F60A 4NR5A 5CQTA 4O7FA 4YADA 4TT2A 5IG6A 4QSXA 4LYSA 5LKXA 5LUUA 4O75A 3U5JA 3I3JA 5JI8A 3JVMA 4HXMA 5E9IA 4NRAA 5CZGA 5LVRA 4CL9A 5CRMA 4CURA 5EK9A 4Z93A 2R0SA 4UYFA 4BJXA 2DKWA 4TQNA 4DONA 4NUCA 5I80A 5D24A 3QZTA 2YW5A 4NRBA 4PKLA 4QYLA 5EPRA 3U5KA 4TTEA 4YY6A 4YBSA 5DX4A 5FE3A 4QEUA 4BHWA 5EV9A 2H60A 5KTWA 2L5EA 4WHWA 2YYNA 2I8NA 4CUTA 4NYWA 4CUUA 4QSRA 4QEWA 4A9NA 4YBMA 5LVQA 4YABA 4WIVA 5ENHA 5DKHA 4MEOA 3S92A 2NXBA 5L99A 5CQAA 3DAIA 5HELA 5FFVA 5L8UA 5IGMA 5HLSA 2DVVA 4NYVA 4CFLA 5BT4A 5AMEA 3UVXA 4UIZA 4MEPA 3LQJA 5C85A 5D3HA 2N9GA 5BT3A 5CUGA 5HEMA 4HXSA 2MJVB 4LDFA 3P1EA 5FE7A 3JVJA 3O34A 4ZC9A 5I89A 3JVLA 4Z1SA 4N4GA 5C87A 4QB3A 4UIYA 5FE6A 5HRXA 4QYDA 5D3SA 1JM4B 5IIDA 4PS5A 5C89A 5D0CA 5FH6A 3P1CA 4A9FA 4OGJA 4XY9A 4QR5A 4A9LA 5EWVA 5E0RA 5HM0A 3U5OA 5H1UA 3AADA 4QZSA 5FDZA 4HXKA 5D7XA 5F61A 4NR6A 5L96A 5HQ5A 5DKDA 4N4FA 5L97A 2OO1A 5K29A 2RNYA 5KTUA 5F63A 4PY6A 3RCWA 1E6IA 5ENIA 4LZ2A 4HBYA 5EU1A 4HXPA 5A5OA 4X2IA 3O33A 4TYLA 5IBNA 5CGPA 4N4HA 4RVRA 2RO1A 5I7XA 4IR4A 5LKUA 3SVGA 2DVSA 5CY9A 2D82A 4NYXA 4O76A 2RI7A 4O72A 4Q0NA 5FG6A 4YYNA 4CUSA 4NR4A 4QSTA 4E96A 4NS5A 5G4RA 5FE2A 4HBWA 5F5ZA 4HXLA 3HMHA 5FBXA 2G4AA 4BW1A 5EPBA 5HCLA 2OSSA 4LC2A 3SVFA 4YYDA 4YY4A 4F3IA 2YEKA 2DATA 5EWCA 5F62A 5E7DA 2R10A 5A5QA 5HFRA 5JWMA 5HFQA 3LXJA 5D25A 5EQ1A 5LKZA 3U5PA 4YH4A 5DBMA 5F36A 4HXOA 3MUKA 4J0SA 5ETDA 3U5NA 3DWYA 4N3WA 4A9IA 5IGLA 4HXNA 5H85A 3O37A 1WUGA 3JVKA 5AMFA 3U5MA 4UYGA 4HXRA 5A5NA 5I83A 5D3TA 5ENFA 4O7AA 4O77A 5CUAA 4UIWA 2F6NA 4QNSA 5A5PA 5E9VA 5G4SA 5KTXA 4YK0A 4NR7A 3K2JA 5I29A 2R0YA 4GPJA 5EVAA 5DLXA 5ENEA 3ZYUA 5F2PA 4O70A 4UYDA 5D26A 5DLZA 2DVQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CUEA 5D3LA 3IU5A 5FH7A 4O7EA 4QR3A 4AKNA 4UYFB 1EQFA 1WUMA 4O7CA 4MR3A 4QSVA 2KTBB 2RNXA 4MEQA 5L98A 2YQDA 4QSUA 4XY8A 4O7BA 3QZSA 4ALHA 5DYAA 4NXJA 5FB1A 5EWDA 4A9EA 1X0JA 2E3KA 5KHMA 4TU6A 4TU4A 4TT4A 4FLPA 2YEMA 3IU6A 5I1QA 4WHUA 4YYHA 4TZ2A 5A7CA 3UV4A 4YYJA 4UYHA 4IR3A 4BW3A 4QBMA 5LKTA 5FE9A 5FE5A 5ETBA 5HQ7A 5CUBA 5EGUA 5CFWA 4QSPA 4YYIA 4OUFA 4A9HA 4QC3A 4PCIA 4QSWA 5CQ4A 5CQ5A 4LRGA 5CUCA 5HRWA 4QUUA 1PUOA 5FE1A 3U5LA 2DWWA 5CU8A 2OUOA 4HBXA 3P1DA 5A81A 4YC9A 4QY4A 5ENCA 2D9EA 4CUQA 4NR8A 3ONIA 5E9LA 4NRCA 5II1A 5LJ2A 4PTBA 5FFWA 4A9KA 4LZRA 2E7OA 4XUAA 5DFBA 4CFKA 5C8GA 5ENJA 3UVWA 4QC1A 3S91A 3G0LA 5A82A 4C67A 5E3GA 5KO4A 5DW1A 3FKMX 5EWHA 5FE4A 5CRZA 5CQ6A 4QEVA 5CTLA 5EWWA 4J3IA 4OGIA 3P1FA 4LYIA 4TT6A 5E9KA 2DVRA 4Q0OA 5EM3A 5CQ8A 5E9MA 5FE8A 4Y03A 5F3AA 3MB3A 3SVHA 1ZS5A 5E74A 4PCEA 5I7YA 3LQIA 4TS8A 5EISA 4J0RA 3MB4A 4KV4A 4TZ8A 5EP7A 5DYCA 4YYGA 5EPSA 5FE0A 3O36A 5TB6A 2RS9B 3HMEA 2RNWA 4QUTA 5FB0A 3UVYA 4QSQA 2R0VA 5AD3A 4MR6A 5CPEA 4A9JA 5C4QA 4MR5A 5KU3A 4LYWA 3Q2EA 5L8TA 3G0JA 4LR6A 5LJ1A 5I86A 3QZVA 5DFCA 4C66A 4NQMA 4CLBA 5CQ3A 3D1BA 5FG4A 4UYEA 2I7KA 2YDWA 5J0DA 4IR6A 5EICA 2GRCA 5I40A 4IORA 3UV2A 4A9OA 3MULA 4IOQA 3LJWA 5TCMA 3O35A 4MR4A 2LSPB 5CUDA 5FH8A 4LZSA 4Z6IA 5E9YA 2YELA 3P5OA 4YYMA 4YATA 3HMFA 2L85A 5A5RA 4BW4A 2E7NA 4O74A 5E3DA 4KCXA 5FG5A 4BW2A 4AKIA 2WP1A 5HENA 5AD2A 4XUBA 4ALGA 5DFDA 5D3PA 4IOOA 5CP5A 5DY7A 5EI4A 4J1PA 2F6JA 4N4IA 4IR5A 5C7NA 4Z6HA 5II2A 5COIA 5FFYA 2L84A 4YAXA 5DYXA 4A9MA 5H1TA 5DKCA 5HRVA 3UW9A 3UV5A 4UIUA 5DYUA 5F1LA 5IGKA 5A5SA 4QSSA 5A83A 4QR4A 1F68A 4NUDA 5D3NA 5D3JA 5HQ6A 5H1VA 5CS8A 2WP2A 5ENBA 4O71A 4AKHA 1N72A 4YYKA 4ZQLA 3MQMA 3UVDA 4YH3A 3VKGA 5A85A 3MXFA 5ENGA 3TLPA 2RFJA 4NQNA 5CQ7A 5BT5A 3Q2FA 5HJCA 4KV1A 4YBTA 5F1HA 4Z1QA 4NR9A 4UIXA 5EA1A 4CUPA 4UIVA 5IGNA 4NUEA 4O78A 5DW2A 4ZW1A 5F25A 4HBVA 5D3RA 4UITA 3GG3A 5ACYA 4MENA 3D7CA 3LQHA 1JSPB 5I88A 5E73A 3VKHA 2FSAA 3NXBA 4XYAA 5LJ0A 3ERRA 3AQAA 5F60A 4NR5A 5CQTA 4O7FA 4YADA 4TT2A 5IG6A 4QSXA 4LYSA 5LKXA 5LUUA 4O75A 3U5JA 3I3JA 5JI8A 3JVMA 4HXMA 5E9IA 4NRAA 5CZGA 5LVRA 4CL9A 5CRMA 4CURA 5EK9A 2R0SA 4UYFA 4Z93A 4BJXA 2DKWA 4TQNA 4DONA 4NUCA 5I80A 5D24A 3QZTA 2YW5A 3D1DA 4NRBA 4PKLA 4QYLA 4AKGA 5EPRA 3U5KA 4TTEA 4YY6A 4YBSA 5DX4A 4AI6A 5FE3A 4QEUA 4BHWA 5EV9A 2H60A 5KTWA 2L5EA 4WHWA 2YYNA 2I8NA 4CUTA 4NYWA 4CUUA 4QSRA 4QEWA 4A9NA 4YBMA 5LVQA 4YABA 4WIVA 5ENHA 5DKHA 4MEOA 3S92A 2NXBA 5L99A 5CQAA 3DAIA 5HELA 5FFVA 5L8UA 5IGMA 5HLSA 2DVVA 4NYVA 4CFLA 5BT4A 5AMEA 3UVXA 4UIZA 4MEPA 3LQJA 5C85A 5D3HA 2N9GA 5BT3A 5CUGA 5HEMA 4HXSA 2MJVB 4LDFA 3P1EA 5FE7A 3JVJA 3O34A 4ZC9A 5I89A 3JVLA 4Z1SA 4N4GA 5C87A 4QB3A 4UIYA 5FE6A 5HRXA 4QYDA 5D3SA 1JM4B 5IIDA 4PS5A 5C89A 5D0CA 5FH6A 3P1CA 4A9FA 4OGJA 4XY9A 4QR5A 4A9LA 5EWVA 5E0RA 5HM0A 3U5OA 5H1UA 3AADA 4QZSA 5FDZA 4HXKA 5D7XA 5F61A 4NR6A 5L96A 5HQ5A 5DKDA 4N4FA 5L97A 2OO1A 5K29A 2RNYA 5KTUA 5F63A 4PY6A 3RCWA 1E6IA 5ENIA 4LZ2A 4HBYA 5EU1A 4HXPA 5A5OA 4X2IA 3O33A 4TYLA 5IBNA 5CGPA 4N4HA 4RVRA 2RO1A 5I7XA 4IR4A 5LKUA 3SVGA 2DVSA 5CY9A 2D82A 4NYXA 4O76A 2RI7A 4O72A 4Q0NA 5FG6A 4YYNA 4CUSA 4NR4A 4QSTA 4E96A 4NS5A 5G4RA 5FE2A 4HBWA 5F5ZA 4HXLA 3HMHA 5FBXA 2G4AA 4BW1A 5EPBA 5HCLA 2OSSA 4LC2A 3SVFA 1ZKRA 4YYDA 4YY4A 4F3IA 2YEKA 2DATA 5EWCA 5F62A 5E7DA 2R10A 5A5QA 5HFRA 5JWMA 5HFQA 3LXJA 5D25A 5EQ1A 5LKZA 3U5PA 4YH4A 5DBMA 5F36A 4HXOA 3MUKA 4J0SA 5ETDA 3U5NA 3DWYA 4N3WA 4A9IA 5IGLA 4HXNA 5H85A 3O37A 1WUGA 3JVKA 5AMFA 3U5MA 4UYGA 4HXRA 5A5NA 5I83A 5D3TA 5ENFA 4O7AA 4O77A 5CUAA 4UIWA 2F6NA 4QNSA 5A5PA 5E9VA 5G4SA 5KTXA 4YK0A 4NR7A 3K2JA 5I29A 2R0YA 4GPJA 5EVAA 2EJNA 5DLXA 5ENEA 3ZYUA 5F2PA 4O70A 4UYDA 5D26A 5DLZA 2DVQA
chains in the Genus database with same CATH topology
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