5ENIA

Crystal structure of the second bromodomain of pleckstrin homology domain interacting protein (phip) in complex with compound-13 n11537 (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
SMSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title A poised fragment library enables rapid synthetic expansion yielding the first reported inhibitors of PHIP(2), an atypical bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PH-interacting protein
total genus 46
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eniA00
5DYCA 4Q0NA 5TB6A 2DVVA 5CTLA 5EA1A 4IORA 3S91A 4TT6A 5JI8A 5CUCA 2KTBB 3U5NA 4UYEA 5H1VA 4BW4A 3UVWA 5A5PA 5D0CA 5D3JA 5A7CA 3O35A 4HXRA 5CS8A 2RFJA 5CQ8A 4WHWA 4NRAA 2RI7A 5L98A 4IR6A 2I8NA 3MXFA 4O78A 1EQFA 5L8TA 5ENHA 5FH6A 5II2A 4NR9A 2NXBA 4BW1A 3U5OA 5EWCA 5L99A 5EP7A 4AKNA 4NYXA 3QZVA 2R10A 1F68A 5HQ7A 2MJVB 5EWHA 5F36A 5A85A 3SVGA 5CQTA 5CQAA 4NR6A 3LXJA 5IBNA 5FE9A 4UIWA 4A9OA 3LQJA 5CQ4A 4KCXA 5BT3A 3U5JA 5HCLA 4PS5A 5C87A 4QUUA 4PCEA 5H1TA 4OUFA 4J0RA 2YEMA 4TTEA 4O77A 3FKMX 2L85A 3P5OA 2DVSA 4PKLA 5FH7A 5FB1A 2OUOA 3QZSA 4J1PA 4YC9A 4Z6HA 3JVLA 3JVMA 4WIVA 3U5KA 5FFYA 4NR4A 3AQAA 5HM0A 2GRCA 5E9YA 2DVQA 5DKHA 5D25A 2FSAA 4A9FA 2YELA 3I3JA 5F25A 5E9MA 4LYIA 2RNYA 3MUKA 4A9EA 3UV5A 5HQ5A 3Q2EA 2E7NA 4PY6A 4NS5A 4NR7A 5I7XA 3TLPA 4NR5A 4Y03A 5E73A 5C8GA 4NUDA 4O7CA 4UIUA 4QBMA 5CQ3A 5LKTA 4NRCA 4HXKA 5D26A 3G0JA 5F2PA 5LJ2A 5E0RA 3ONIA 5G4SA 4LZ2A 4IR5A 3U5MA 5AMFA 4F3IA 4O7FA 5I83A 4KV4A 4O74A 5DYUA 4N3WA 4CUSA 3HMEA 4QR4A 4WHUA 3ZYUA 2E7OA 5D24A 2YEKA 5CRMA 4A9JA 4QSWA 5ENFA 4LYSA 4MENA 5EWVA 5KTXA 4O76A 5IIDA 3RCWA 4N4GA 4YBMA 4QYDA 4PTBA 5AMEA 4YATA 4QSVA 3MB4A 5EVAA 3D7CA 5ENCA 1E6IA 2DVRA 4E96A 1ZS5A 4UIZA 2OO1A 3NXBA 4LR6A 5CU8A 4HBYA 4BHWA 5J0DA 4HXLA 5H1UA 5K29A 5IGNA 2YDWA 5TCMA 5EISA 4CUTA 5DFDA 5D3LA 3U5LA 5KTUA 4FLPA 4QYLA 3O37A 2DATA 4ZQLA 4XUBA 5FE4A 5DFCA 4HXOA 5HLSA 4YY4A 4NR8A 4YK0A 4TZ2A 5CUDA 5DW1A 5EK9A 3UV2A 4RVRA 3O34A 5F3AA 5E9IA 4UYFA 5HEMA 1N72A 5HFQA 5G4RA 4LC2A 5ENBA 4PCIA 3P1CA 4J3IA 4QEVA 4QSQA 1JSPB 5EWWA 5F1HA 1JM4B 5CGPA 5I89A 5DKCA 4CURA 4YABA 3IU5A 4LYWA 5FE8A 3P1DA 4QUTA 4GPJA 5LKXA 4NUEA 3Q2FA 5F5ZA 5A81A 5A5QA 5COIA 4CUQA 5D3HA 4Z93A 5D3RA 4ZC9A 3UVDA 3LJWA 5EGUA 3UW9A 4NQNA 5EQ1A 5HELA 5FE2A 5HRXA 5KTWA 4O72A 5HRWA 4YADA 4A9IA 5F62A 5CQ5A 4YH3A 5A5NA 1X0JA 3O33A 4N4IA 5HFRA 5A82A 4QEUA 5E74A 5D7XA 2L5EA 5FE6A 5IGKA 4LZSA 2R0SA 4UYDA 5ETDA 5FFWA 4YYGA 4HXNA 4O7BA 4ZW1A 5II1A 4NUCA 4QEWA 3K2JA 5FE0A 5DY7A 3HMHA 3IU6A 5DKDA 3UVYA 4N4HA 5DLXA 4CFLA 4TT4A 5C7NA 5HQ6A 5L8UA 5FB0A 4YYHA 4BJXA 4ALGA 4YBSA 4HXMA 5BT4A 5I86A 5FE7A 4O75A 4MR3A 4IR3A 2F6NA 2RNXA 4Z1SA 5LUUA 3AADA 4QZSA 4YAXA 3S92A 5LVQA 4LRGA 4QR5A 5FBXA 4Q0OA 4QC1A 4QNSA 5DBMA 2E3KA 3DAIA 3P1FA 5EICA 5ACYA 4QSPA 2RO1A 4UYHA 4CL9A 5IGMA 5F63A 5FE5A 4NYVA 5E9KA 4YYKA 4UYGA 4QR3A 4CFKA 4Z1QA 4YYIA 4O71A 5FH8A 5I40A 2R0YA 2RNWA 4TU4A 5EU1A 4J0SA 4ALHA 5L97A 3G0LA 3LQIA 5EPBA 5I88A 4QSTA 4UIYA 4A9NA 2YW5A 4MR6A 4N4FA 5LVRA 2RS9B 5CUBA 5ENEA 4DONA 5EM3A 5LJ1A 5D3NA 4MEOA 4MR4A 4IR4A 4LZRA 5HRVA 4HBVA 4A9HA 4UIVA 5LKZA 5LKUA 5CUAA 5DW2A 4TU6A 4TZ8A 5CQ7A 4OGJA 5A83A 4CLBA 5E3GA 2H60A 5FFVA 5KO4A 5KHMA 4A9LA 5L96A 5C89A 1WUGA 4YH4A 4YYDA 4LDFA 4XUAA 4X2IA 3U5PA 4UIXA 5LJ0A 1WUMA 3MB3A 4Z6IA 4IOQA 3UVXA 4C67A 4KV1A 5EPSA 5I29A 5CPEA 5D3PA 3O36A 3P1EA 5DX4A 5ENJA 5F61A 2L84A 5A5OA 4YY6A 2I7KA 5FE3A 2YYNA 4O7AA 4MEPA 4XY8A 4UYFB 5A5RA 4NRBA 3SVFA 5DLZA 3UV4A 2LSPB 4QC3A 5AD2A 4QSUA 5FE1A 5IGLA 5EWDA 2N9GA 5EI4A 5H85A 5FDZA 4YYNA 3GG3A 5C4QA 5CUGA 3JVKA 2YQDA 5CZGA 3LQHA 4C66A 4NQMA 4A9KA 3MQMA 4CUUA 4NXJA 2DWWA 4O7EA 4XYAA 5CFWA 5D3TA 5E9LA 5JWMA 4YYMA 5ETBA 5HENA 2OSSA 3QZTA 4NYWA 5DYAA 4QSRA 5F60A 4QSXA 5CUEA 4MEQA 4CUPA 4YBTA 5C85A 4XY9A 3HMFA 3JVJA 5FG6A 2WP2A 5IG6A 5DYXA 5CQ6A 5ENGA 4HXSA 4YYJA 4TT2A 4QY4A 5E3DA 4IOOA 4QB3A 4UITA 2DKWA 5F1LA 4HBWA 2D82A 5DFBA 5AD3A 4HXPA 5BT5A 4HBXA 2F6JA 5HJCA 4BW2A 5I1QA 5I80A 4BW3A 2D9EA 4TS8A 4MR5A 5FG4A 4QSSA 5CP5A 3MULA 5D3SA 5ENIA 5EV9A 5I7YA 5CY9A 4O70A 5E7DA 4TQNA 5CRZA 5A5SA 4A9MA 4TYLA 3DWYA 5FG5A 2G4AA 5E9VA 3SVHA 5EPRA 2R0VA 2WP1A 5KU3A 4OGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DYCA 4Q0NA 5TB6A 2DVVA 5CTLA 5EA1A 4IORA 3S91A 4TT6A 5JI8A 5CUCA 2KTBB 3U5NA 4UYEA 5H1VA 4BW4A 3UVWA 5A5PA 5D0CA 5D3JA 5A7CA 3O35A 4HXRA 5CS8A 2RFJA 5CQ8A 4WHWA 4NRAA 2RI7A 4AKHA 5L98A 4IR6A 2I8NA 3MXFA 4O78A 1EQFA 5L8TA 5ENHA 5FH6A 5II2A 1ZKRA 4NR9A 2NXBA 4BW1A 3U5OA 5EWCA 5L99A 5EP7A 4AKNA 4NYXA 3QZVA 2R10A 1F68A 5HQ7A 2MJVB 5EWHA 5F36A 5A85A 3SVGA 5CQTA 5CQAA 4NR6A 3LXJA 5IBNA 5FE9A 3VKHA 4UIWA 4A9OA 3LQJA 5CQ4A 4KCXA 5BT3A 3U5JA 3VKGA 5HCLA 4PS5A 5C87A 4QUUA 4PCEA 5H1TA 4OUFA 4J0RA 2YEMA 4TTEA 4O77A 3FKMX 2L85A 3P5OA 2DVSA 4PKLA 5FH7A 5FB1A 2OUOA 3QZSA 4J1PA 4YC9A 4Z6HA 3JVLA 3JVMA 4WIVA 4AKIA 3U5KA 5FFYA 4NR4A 3AQAA 5HM0A 2GRCA 5E9YA 2DVQA 5DKHA 5D25A 2FSAA 4A9FA 2YELA 3I3JA 5F25A 5E9MA 4LYIA 2RNYA 3MUKA 4A9EA 3UV5A 5HQ5A 3Q2EA 2E7NA 4PY6A 4NS5A 4NR7A 5I7XA 3TLPA 4NR5A 4Y03A 5E73A 5C8GA 4NUDA 4O7CA 4UIUA 4QBMA 5CQ3A 5LKTA 4NRCA 3D1DA 4HXKA 5D26A 3G0JA 5F2PA 4AI6A 5LJ2A 5E0RA 3ONIA 5G4SA 4LZ2A 4IR5A 3U5MA 5AMFA 4F3IA 4O7FA 5I83A 4KV4A 4O74A 5DYUA 4N3WA 4CUSA 3HMEA 4QR4A 4WHUA 3ZYUA 2E7OA 5D24A 2YEKA 5CRMA 4A9JA 4QSWA 5ENFA 4LYSA 4MENA 5EWVA 5KTXA 4O76A 5IIDA 3RCWA 4N4GA 4YBMA 4QYDA 4PTBA 5AMEA 4YATA 4QSVA 3MB4A 5EVAA 3D7CA 5ENCA 1E6IA 2DVRA 4E96A 1ZS5A 4UIZA 2OO1A 3NXBA 4LR6A 5CU8A 4HBYA 4BHWA 5J0DA 4HXLA 5H1UA 5K29A 5IGNA 2YDWA 5TCMA 5EISA 4CUTA 5DFDA 5D3LA 3U5LA 5KTUA 4FLPA 4QYLA 3O37A 2DATA 4ZQLA 4XUBA 5FE4A 5DFCA 4HXOA 5HLSA 4YY4A 4NR8A 4YK0A 4TZ2A 5CUDA 5DW1A 5EK9A 3UV2A 4RVRA 3O34A 5F3AA 5E9IA 4UYFA 5HEMA 1N72A 5HFQA 5G4RA 4LC2A 5ENBA 4PCIA 3P1CA 4J3IA 4QEVA 4QSQA 1JSPB 5EWWA 5F1HA 1JM4B 5CGPA 5I89A 5DKCA 4CURA 4YABA 3IU5A 4LYWA 5FE8A 3P1DA 4QUTA 4GPJA 5LKXA 4NUEA 3Q2FA 5F5ZA 5A81A 5A5QA 5COIA 4CUQA 5D3HA 4Z93A 5D3RA 4ZC9A 3UVDA 3LJWA 5EGUA 3UW9A 4NQNA 5EQ1A 5HELA 5FE2A 5HRXA 5KTWA 4O72A 5HRWA 4YADA 4A9IA 5F62A 5CQ5A 4YH3A 5A5NA 1X0JA 3O33A 4N4IA 5HFRA 5A82A 4QEUA 5E74A 5D7XA 2L5EA 5FE6A 5IGKA 4LZSA 2R0SA 4UYDA 5ETDA 5FFWA 4YYGA 4HXNA 4O7BA 4ZW1A 5II1A 4NUCA 4QEWA 3K2JA 5FE0A 5DY7A 3HMHA 3IU6A 5DKDA 3UVYA 4N4HA 5DLXA 4CFLA 4TT4A 5C7NA 5HQ6A 5L8UA 5FB0A 4YYHA 4BJXA 4ALGA 4YBSA 4HXMA 5BT4A 5I86A 5FE7A 4O75A 4MR3A 4IR3A 2F6NA 2RNXA 4Z1SA 5LUUA 3AADA 4QZSA 4YAXA 3S92A 5LVQA 4LRGA 4QR5A 5FBXA 4Q0OA 4QC1A 4QNSA 5DBMA 2E3KA 3DAIA 3P1FA 5EICA 5ACYA 4QSPA 2RO1A 4UYHA 4CL9A 5IGMA 5F63A 5FE5A 4NYVA 5E9KA 4YYKA 4AKGA 4UYGA 4QR3A 4CFKA 4Z1QA 4YYIA 4O71A 5FH8A 3ERRA 5I40A 2R0YA 2RNWA 2EJNA 4TU4A 5EU1A 4J0SA 4ALHA 5L97A 3G0LA 3LQIA 5EPBA 5I88A 4QSTA 4UIYA 4A9NA 2YW5A 4MR6A 4N4FA 5LVRA 2RS9B 5CUBA 5ENEA 4DONA 5EM3A 5LJ1A 5D3NA 4MEOA 4MR4A 4IR4A 4LZRA 5HRVA 4HBVA 4A9HA 4UIVA 5LKZA 5LKUA 5CUAA 5DW2A 4TU6A 4TZ8A 5CQ7A 4OGJA 5A83A 4CLBA 5E3GA 2H60A 5FFVA 5KO4A 5KHMA 4A9LA 5L96A 5C89A 1WUGA 4YH4A 4YYDA 4LDFA 4XUAA 1PUOA 4X2IA 3U5PA 4UIXA 5LJ0A 1WUMA 3MB3A 4Z6IA 4IOQA 3UVXA 4C67A 4KV1A 5EPSA 5I29A 5CPEA 5D3PA 3O36A 3P1EA 5DX4A 5ENJA 5F61A 2L84A 5A5OA 4YY6A 2I7KA 5FE3A 2YYNA 4O7AA 4MEPA 4XY8A 4UYFB 5A5RA 4NRBA 3SVFA 5DLZA 3UV4A 2LSPB 4QC3A 5AD2A 4QSUA 5FE1A 5IGLA 5EWDA 2N9GA 5EI4A 5H85A 5FDZA 4YYNA 3GG3A 5C4QA 5CUGA 3JVKA 2YQDA 5CZGA 3LQHA 4C66A 4NQMA 4A9KA 3MQMA 4CUUA 4NXJA 2DWWA 4O7EA 4XYAA 5CFWA 3D1BA 5D3TA 5E9LA 5JWMA 4YYMA 5ETBA 5HENA 2OSSA 3QZTA 4NYWA 5DYAA 4QSRA 5F60A 4QSXA 5CUEA 4MEQA 4CUPA 4YBTA 5C85A 4XY9A 3HMFA 3JVJA 5FG6A 2WP2A 5IG6A 5DYXA 5CQ6A 5ENGA 4HXSA 4YYJA 4TT2A 4QY4A 5E3DA 4IOOA 4QB3A 4UITA 2DKWA 5F1LA 4HBWA 2D82A 5DFBA 5AD3A 4HXPA 5BT5A 4HBXA 2F6JA 5HJCA 4BW2A 5I1QA 5I80A 4BW3A 2D9EA 4TS8A 4MR5A 5FG4A 4QSSA 5CP5A 3MULA 5D3SA 5ENIA 5EV9A 5I7YA 5CY9A 4O70A 5E7DA 4TQNA 5CRZA 5A5SA 4A9MA 4TYLA 3DWYA 5FG5A 2G4AA 5E9VA 3SVHA 5EPRA 2R0VA 2WP1A 5KU3A 4OGIA
chains in the Genus database with same CATH topology
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