4O7BA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-284847-bt
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7bA01
2RNXA 5ENCA 5E9VA 5DFDA 4HBWA 5CRZA 4N4IA 5C8GA 3O37A 4CL9A 3P1FA 4F3IA 5FE0A 5EWDA 5FE5A 4MENA 5CQ7A 5A5PA 5I7XA 4NRBA 5JI8A 5CFWA 5D25A 4IR5A 5FE7A 2WP2A 5EPRA 5D3NA 4TTEA 4CUTA 4IOQA 5TB6A 4Z6HA 3SVGA 4QYDA 4YYGA 4NR5A 5LKZA 4A9KA 2YDWA 4UIXA 2RS9B 3U5OA 5IGMA 5E9YA 4QNSA 4YYNA 4TQNA 2L84A 4WHWA 3S91A 4YH4A 5E9LA 5L99A 2RO1A 5D3TA 5AMFA 5CZGA 4YBSA 3HMEA 5D3LA 5FB0A 5LUUA 5HLSA 4BW1A 3U5KA 5ENIA 5LKUA 3IU5A 4CFKA 4HXOA 5CUDA 3JVLA 4QUTA 5DYCA 5DKCA 3GG3A 5EP7A 3K2JA 5DYXA 4Q0NA 5FH6A 5BT3A 5LJ0A 5A83A 4UYFA 4ZW1A 4C67A 5FG4A 4LC2A 4MEOA 5FE2A 2RNWA 5EPSA 3U5LA 4XUAA 4HXKA 4UIUA 4NYVA 4Z6IA 4YBMA 5CUGA 4TU6A 3UVYA 5KTWA 5CY9A 4YYJA 4YC9A 5I7YA 3LXJA 4HXSA 4O71A 5AMEA 5CUBA 4YY4A 2DATA 5FE1A 5DX4A 4UYHA 4UYFB 5TCMA 5DLZA 3ONIA 3AADA 4NUCA 4LZ2A 4YH3A 5EK9A 5HFQA 4O7BA 5F3AA 5LJ2A 5I1QA 4TYLA 4XYAA 4NRCA 5C7NA 5F1LA 5I86A 2OUOA 5FFVA 5KO4A 2KTBB 4YBTA 4YYMA 5IGLA 4QB3A 4PCIA 5FE8A 5E7DA 5ENGA 3G0LA 4IOOA 4HBVA 2H60A 4PS5A 5EWVA 4A9JA 5ENHA 5C85A 5A5RA 3U5MA 5EQ1A 5DY7A 2R0VA 4QC3A 5CQTA 5CUCA 5EI4A 5JWMA 4WHUA 5DLXA 2DKWA 3P5OA 4CUPA 4N4GA 3JVMA 4CUUA 5H1TA 5KTXA 5CQ3A 3FKMX 5L8UA 4UIZA 1ZS5A 5FE6A 1JSPB 5FE3A 5E3GA 3Q2EA 5CQ4A 5IGKA 4N3WA 3O33A 5FG5A 2RI7A 4QSQA 5ENFA 2YQDA 5I29A 5E73A 4LR6A 5HQ7A 5DBMA 5I88A 5F61A 3O35A 2F6NA 3UV2A 4YY6A 5L8TA 4HXMA 4MR4A 4O78A 2YW5A 4A9MA 4QSTA 1EQFA 5EWHA 5C87A 5C89A 3DWYA 4J1PA 2E3KA 4YATA 4YAXA 4LYIA 5FFYA 4NR8A 5AD3A 4QR4A 4GPJA 2R10A 5I80A 5IIDA 4ZQLA 3QZTA 4O75A 5ENEA 4J0SA 5CTLA 4UIYA 4KV1A 5A7CA 5J0DA 5KHMA 5CU8A 2RNYA 2GRCA 3MB4A 4HXNA 5HCLA 4O7AA 4LDFA 3JVJA 5EV9A 5HRVA 4HXRA 4YYKA 2YEMA 4TS8A 2YELA 1F68A 5E0RA 3JVKA 4QR3A 4MEPA 4CLBA 4O74A 5D3PA 3U5PA 4NUDA 4QR5A 3LQHA 3G0JA 3MQMA 4TU4A 5EU1A 5D0CA 5A5SA 3SVHA 2OSSA 4IR6A 5K29A 5CGPA 3UVXA 3I3JA 3LJWA 2E7OA 4PTBA 4BW3A 2NXBA 4FLPA 3TLPA 3HMHA 5E3DA 5DYAA 4LYWA 4NS5A 4QSXA 5HRWA 5F60A 5DW2A 5ENBA 4WIVA 5KTUA 5FG6A 2LSPB 2F6JA 3P1EA 4OUFA 4Q0OA 5C4QA 4UIVA 4OGIA 4TT4A 3MULA 4TZ2A 4QEVA 3QZSA 3UV5A 4CFLA 4QUUA 5CRMA 5IBNA 4NYWA 5G4RA 5A5NA 4BW2A 5I89A 4QC1A 4CUSA 5I40A 5EWWA 4TT6A 4ALGA 3UV4A 4QSSA 3UVWA 5D3HA 5F62A 4N4HA 5II2A 3SVFA 5HELA 5H1VA 5CQ8A 4CUQA 4AKNA 4X2IA 3NXBA 4QEWA 4KCXA 4QBMA 3HMFA 5F63A 3MXFA 2R0SA 4IR3A 5FFWA 4A9LA 4HBYA 4HXPA 4XUBA 3DAIA 5IGNA 5EICA 3QZVA 5F25A 4N4FA 5HRXA 4MR3A 4TZ8A 5DYUA 5F1HA 4BW4A 4LYSA 5F36A 4HXLA 4NR9A 4O72A 5FE9A 2YYNA 4QSWA 5EA1A 5I83A 5FBXA 3U5NA 2RFJA 5E74A 4ALHA 4DONA 5FH8A 5L97A 4Z1SA 4NUEA 5CPEA 5BT5A 4UYGA 5H85A 3MB3A 4XY9A 2FSAA 4QY4A 5H1UA 2N9GA 4NR4A 2E7NA 4C66A 4UYDA 4LZSA 5DFCA 4O7CA 4YABA 5ETBA 4YADA 2D82A 5CQ5A 4UYEA 5F5ZA 4NYXA 4PY6A 4UITA 2R0YA 4PKLA 2L85A 4QSUA 2G4AA 2I8NA 5A82A 5LVRA 5A5QA 1WUMA 4YK0A 5D26A 4PCEA 5L98A 5HQ5A 4Z1QA 2DVRA 5CUEA 3UVDA 5D24A 4NR6A 4A9EA 4NR7A 5HEMA 4YYHA 5FB1A 4A9NA 5A85A 1X0JA 2L5EA 5ENJA 4NXJA 5CP5A 4O7EA 5KU3A 4BJXA 5D7XA 5HFRA 3RCWA 2DVSA 4A9HA 4QSRA 5DFBA 5E9KA 4IORA 4O7FA 4QSPA 4LRGA 3MUKA 4O70A 3ZYUA 4YYIA 4QSVA 5CS8A 5ACYA 5A81A 5FH7A 4A9IA 5DKDA 4YYDA 5IG6A 3IU6A 5COIA 5BT4A 5E9MA 4LZRA 3Q2FA 5FE4A 5HJCA 5II1A 2DVVA 4MEQA 5EISA 4A9OA 5D3SA 4O76A 5HM0A 3P1DA 4XY8A 4MR6A 1E6IA 3AQAA 5EWCA 4OGJA 1WUGA 5LKXA 5FDZA 4NQNA 2WP1A 5DW1A 4BHWA 4ZC9A 2MJVB 4O77A 5D3JA 5G4SA 3O34A 4Y03A 5A5OA 5LKTA 3LQIA 4J0RA 5EM3A 5LJ1A 5HENA 3D7CA 4QZSA 1JM4B 3P1CA 5L96A 5F2PA 4HBXA 4MR5A 4TT2A 5CUAA 2I7KA 2DVQA 4NRAA 2OO1A 5HQ6A 1N72A 3LQJA 4J3IA 3S92A 4E96A 5EVAA 3UW9A 2DWWA 5AD2A 3O36A 5EGUA 4UIWA 4NQMA 4QEUA 4QYLA 5LVQA 4A9FA 4Z93A 5ETDA 5D3RA 5CQ6A 4KV4A 5DKHA 2D9EA 4IR4A 3U5JA 4RVRA 5EPBA 5CQAA 4CURA 2YEKA 5E9IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RNXA 5ENCA 5E9VA 5DFDA 4HBWA 5CRZA 4N4IA 5C8GA 3O37A 4CL9A 3P1FA 4F3IA 5FE0A 5EWDA 5FE5A 4MENA 5CQ7A 5A5PA 5I7XA 3VKGA 4NRBA 5JI8A 5CFWA 5D25A 4IR5A 5FE7A 2WP2A 5EPRA 5D3NA 4TTEA 3D1DA 4CUTA 4IOQA 5TB6A 4Z6HA 3SVGA 4QYDA 4YYGA 4NR5A 5LKZA 4A9KA 2YDWA 4UIXA 2RS9B 3U5OA 5IGMA 5E9YA 4QNSA 4YYNA 4TQNA 2L84A 1PUOA 4WHWA 3S91A 4YH4A 5E9LA 5L99A 2RO1A 5D3TA 5AMFA 5CZGA 4YBSA 3HMEA 5D3LA 5FB0A 5LUUA 5HLSA 4BW1A 3U5KA 4AKIA 5ENIA 5LKUA 3IU5A 4CFKA 4HXOA 5CUDA 3JVLA 4QUTA 4AKGA 5DYCA 5DKCA 3GG3A 5EP7A 3K2JA 5DYXA 4Q0NA 5FH6A 5BT3A 5LJ0A 5A83A 4UYFA 4ZW1A 4C67A 5FG4A 4LC2A 4MEOA 5FE2A 2RNWA 5EPSA 3U5LA 4XUAA 4HXKA 4UIUA 4NYVA 4Z6IA 4YBMA 5CUGA 4TU6A 3UVYA 5KTWA 5CY9A 4YYJA 4YC9A 5I7YA 3LXJA 4HXSA 4O71A 5AMEA 5CUBA 4YY4A 2DATA 5FE1A 5DX4A 4UYHA 4UYFB 5TCMA 5DLZA 3ONIA 3AADA 4NUCA 4LZ2A 4YH3A 5EK9A 5HFQA 4O7BA 5F3AA 5LJ2A 5I1QA 4TYLA 4XYAA 4NRCA 5C7NA 5F1LA 5I86A 2OUOA 5FFVA 5KO4A 2KTBB 4YBTA 4YYMA 5IGLA 4QB3A 4PCIA 5FE8A 5E7DA 5ENGA 3G0LA 4IOOA 4HBVA 2H60A 4PS5A 5EWVA 4A9JA 5ENHA 5C85A 5A5RA 3U5MA 5EQ1A 5DY7A 2R0VA 4QC3A 5CQTA 5CUCA 5EI4A 5JWMA 4WHUA 5DLXA 4AI6A 2DKWA 3P5OA 4CUPA 4N4GA 3JVMA 4CUUA 5H1TA 5KTXA 5CQ3A 3FKMX 5L8UA 4UIZA 1ZS5A 5FE6A 1JSPB 5FE3A 5E3GA 3Q2EA 5CQ4A 5IGKA 4N3WA 3O33A 5FG5A 2RI7A 4QSQA 5ENFA 2YQDA 5I29A 5E73A 4LR6A 5HQ7A 5DBMA 5I88A 5F61A 3O35A 2F6NA 3UV2A 4YY6A 5L8TA 4HXMA 3D1BA 4MR4A 4O78A 2YW5A 4A9MA 4QSTA 1EQFA 5EWHA 5C87A 5C89A 3DWYA 4J1PA 2E3KA 4YATA 4YAXA 4LYIA 5FFYA 4NR8A 5AD3A 4QR4A 4GPJA 2R10A 5I80A 5IIDA 4ZQLA 3QZTA 4O75A 2EJNA 5ENEA 4J0SA 5CTLA 4UIYA 4KV1A 5A7CA 5J0DA 5KHMA 5CU8A 2RNYA 2GRCA 3MB4A 4HXNA 5HCLA 4O7AA 4LDFA 3JVJA 5EV9A 5HRVA 4HXRA 4YYKA 2YEMA 4TS8A 2YELA 1F68A 5E0RA 3JVKA 4QR3A 4MEPA 4CLBA 4O74A 5D3PA 3U5PA 4NUDA 4QR5A 3LQHA 3G0JA 3MQMA 4TU4A 5EU1A 5D0CA 5A5SA 3SVHA 2OSSA 4IR6A 5K29A 3ERRA 5CGPA 3UVXA 3I3JA 3LJWA 2E7OA 4PTBA 4BW3A 2NXBA 4FLPA 3TLPA 3HMHA 5E3DA 5DYAA 4LYWA 4NS5A 4QSXA 5HRWA 5F60A 5DW2A 5ENBA 4WIVA 5KTUA 5FG6A 2LSPB 2F6JA 3P1EA 4OUFA 4Q0OA 5C4QA 4UIVA 4OGIA 4TT4A 3MULA 4TZ2A 4QEVA 3QZSA 3UV5A 4CFLA 4QUUA 5CRMA 5IBNA 4NYWA 5G4RA 5A5NA 4BW2A 5I89A 4QC1A 4CUSA 5I40A 5EWWA 4TT6A 4ALGA 3UV4A 4QSSA 3UVWA 5D3HA 5F62A 4N4HA 5II2A 3SVFA 5HELA 5H1VA 5CQ8A 4CUQA 4AKNA 4X2IA 3NXBA 4QEWA 4KCXA 4QBMA 3HMFA 5F63A 3MXFA 2R0SA 4IR3A 5FFWA 4A9LA 4HBYA 4HXPA 4XUBA 3DAIA 5IGNA 5EICA 3QZVA 5F25A 4N4FA 5HRXA 4MR3A 1ZKRA 4TZ8A 5DYUA 5F1HA 4BW4A 4LYSA 5F36A 4HXLA 4NR9A 4O72A 5FE9A 4AKHA 2YYNA 4QSWA 5EA1A 5I83A 5FBXA 3U5NA 2RFJA 5E74A 4ALHA 4DONA 5FH8A 5L97A 4Z1SA 4NUEA 5CPEA 5BT5A 4UYGA 5H85A 3MB3A 4XY9A 2FSAA 4QY4A 5H1UA 2N9GA 4NR4A 2E7NA 4C66A 4UYDA 4LZSA 5DFCA 4O7CA 4YABA 5ETBA 4YADA 2D82A 5CQ5A 4UYEA 5F5ZA 4NYXA 4PY6A 4UITA 2R0YA 4PKLA 2L85A 4QSUA 2G4AA 2I8NA 5A82A 5LVRA 5A5QA 1WUMA 4YK0A 5D26A 4PCEA 5L98A 5HQ5A 4Z1QA 2DVRA 5CUEA 3UVDA 5D24A 4NR6A 4A9EA 4NR7A 5HEMA 4YYHA 5FB1A 4A9NA 5A85A 1X0JA 2L5EA 5ENJA 4NXJA 5CP5A 3VKHA 4O7EA 5KU3A 4BJXA 5D7XA 5HFRA 3RCWA 2DVSA 4A9HA 4QSRA 5DFBA 5E9KA 4IORA 4O7FA 4QSPA 4LRGA 3MUKA 4O70A 3ZYUA 4YYIA 4QSVA 5CS8A 5ACYA 5A81A 5FH7A 4A9IA 5DKDA 4YYDA 5IG6A 3IU6A 5COIA 5BT4A 5E9MA 4LZRA 3Q2FA 5FE4A 5HJCA 5II1A 2DVVA 4MEQA 5EISA 4A9OA 5D3SA 4O76A 5HM0A 3P1DA 4XY8A 4MR6A 1E6IA 3AQAA 5EWCA 4OGJA 1WUGA 5LKXA 5FDZA 4NQNA 2WP1A 5DW1A 4BHWA 4ZC9A 2MJVB 4O77A 5D3JA 5G4SA 3O34A 4Y03A 5A5OA 5LKTA 3LQIA 4J0RA 5EM3A 5LJ1A 5HENA 3D7CA 4QZSA 1JM4B 3P1CA 5L96A 5F2PA 4HBXA 4MR5A 4TT2A 5CUAA 2I7KA 2DVQA 4NRAA 2OO1A 5HQ6A 1N72A 3LQJA 4J3IA 3S92A 4E96A 5EVAA 3UW9A 2DWWA 5AD2A 3O36A 5EGUA 4UIWA 4NQMA 4QEUA 4QYLA 5LVQA 4A9FA 4Z93A 5ETDA 5D3RA 5CQ6A 4KV4A 5DKHA 2D9EA 4IR4A 3U5JA 4RVRA 5EPBA 5CQAA 4CURA 2YEKA 5E9IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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