4O7BA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-284847-bt
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7bA01
5EWWA 4NQMA 4AKNA 5CQAA 4YYNA 4WIVA 5TCMA 5E9YA 5DW2A 4N4IA 2H60A 4LYIA 5EISA 5IBNA 4Z93A 4NS5A 5E3DA 5EP7A 4NYVA 3AADA 3ONIA 2N9GA 4BW2A 5LUUA 5DW1A 1F68A 3UVDA 5A81A 2E3KA 2R10A 4HXNA 4UIXA 4UIZA 4NRAA 5DYCA 3D7CA 5ACYA 5D3HA 5HRWA 4N4GA 4TT6A 5IGLA 4QSPA 5FE7A 1WUMA 4QYLA 3U5OA 5E74A 5EWVA 5DFCA 4WHUA 4A9FA 4QSQA 5KTWA 3FKMX 5FE4A 4O7CA 4UIYA 4XUAA 3JVKA 3Q2EA 2R0VA 5I80A 4IR6A 5II2A 3O36A 5EU1A 5IGMA 4CFLA 5D3RA 5EPSA 5G4RA 5LJ2A 5DYAA 4XY8A 4MEQA 5EWHA 5E9LA 5FE8A 4WHWA 3IU6A 2LSPB 1WUGA 5EPRA 4LZSA 2L84A 3DAIA 4YH4A 4CUUA 4O7FA 5EV9A 4O77A 1JM4B 4N4FA 4O7EA 5F1LA 4YATA 4O70A 5AMFA 5CP5A 3LQJA 4YYGA 5EWCA 4ALGA 2RO1A 2OSSA 2FSAA 2RS9B 4YBMA 5HRXA 4HBYA 3IU5A 4NRCA 4OUFA 4MENA 4O76A 1JSPB 4RVRA 4TT2A 4BHWA 5ENGA 3JVMA 4X2IA 4A9IA 5C89A 2OUOA 4YYKA 4J0RA 4CURA 5LJ1A 4TYLA 4PY6A 4TU6A 3LQHA 3MB3A 3UV4A 4Q0NA 4XUBA 5CQTA 5C85A 4E96A 2R0SA 4BW4A 5HQ7A 4YADA 4LRGA 4J0SA 5FFYA 4LC2A 5D3TA 5BT5A 4CUPA 5CRMA 4QB3A 4QEWA 5D3SA 4YY4A 4MR6A 2YW5A 4A9JA 5CQ5A 5L97A 4OGIA 4ZQLA 5ETBA 2YDWA 5EGUA 5KTXA 4Z6IA 4O72A 4QY4A 5L96A 4YYMA 4J1PA 5I88A 5IGNA 3O35A 5EPBA 4LZRA 5CGPA 2L85A 5L99A 3U5NA 3MQMA 5EK9A 4UYDA 4QNSA 5J0DA 1E6IA 3UV5A 4CUTA 2YQDA 3SVGA 4F3IA 4HXSA 4C66A 2YEKA 5E3GA 5F1HA 4QR5A 5A5OA 5F62A 2WP2A 5DBMA 4O7BA 5I29A 4Z6HA 4QSXA 5C87A 4PCEA 5D25A 1X0JA 5F2PA 4BW3A 2OO1A 5I40A 5DFBA 3O37A 5CUBA 4UYGA 5H1TA 4CFKA 5DLZA 4QEUA 4BJXA 5LKTA 4QEVA 3SVFA 5ENHA 4HXMA 5LKZA 5ENBA 2DKWA 4TU4A 3LXJA 2DATA 5F36A 5L8TA 3G0LA 3LJWA 3U5PA 4QSSA 4MR5A 4O71A 5FFVA 3Q2FA 3UW9A 5I1QA 5CUGA 4YC9A 5CQ8A 5HLSA 4UYEA 5FE9A 4NYXA 5I7YA 5KHMA 3NXBA 2YEMA 4HXRA 5A5PA 4Z1SA 5C7NA 2F6NA 2G4AA 2I8NA 4O78A 4J3IA 3TLPA 4NR8A 5D3JA 4QYDA 4PKLA 4N4HA 5CQ4A 3U5LA 4QSWA 2F6JA 4YYJA 4YYHA 4HXLA 5I86A 5AD3A 5AMEA 5DYUA 4QSRA 3S91A 5CQ3A 3SVHA 4LYWA 5D0CA 5JI8A 4NYWA 4QR4A 4NUEA 4ZC9A 4LYSA 4YBSA 2E7NA 5FG5A 4QZSA 5FG4A 4NRBA 5A5QA 4O75A 5D26A 5EA1A 5DLXA 4NQNA 3MB4A 4NUCA 4NR7A 4LR6A 4NR6A 5E0RA 3UV2A 5DKHA 5ENCA 2RNYA 5CQ6A 5DYXA 4HBXA 3U5MA 4O74A 4MEPA 4IOOA 5HJCA 5ETDA 5EICA 4TZ8A 5E9VA 5LKXA 3U5JA 4QUUA 4QC3A 5KTUA 3S92A 4IOQA 2DVSA 4KCXA 4NR4A 5FE6A 5II1A 4TS8A 5DKDA 4YYIA 4CL9A 3I3JA 4OGJA 5DX4A 4MR4A 4QUTA 4BW1A 4XYAA 5IIDA 4QSVA 4CUQA 3P5OA 1N72A 5F60A 3HMEA 5A5RA 5LJ0A 3O33A 4UYFB 5H1VA 5A82A 5L98A 5ENJA 5CY9A 3G0JA 4IR5A 5FB0A 3HMFA 5E7DA 3P1FA 4A9MA 4YH3A 4A9EA 2D9EA 3MUKA 3O34A 5CPEA 4NR5A 4YK0A 5CS8A 4NUDA 4A9KA 4NR9A 5A7CA 5CUEA 5KU3A 2RNWA 5K29A 4A9NA 5EWDA 5D24A 3RCWA 4YABA 5KO4A 3GG3A 4YBTA 4IR4A 3HMHA 4QR3A 5F3AA 5LVRA 5CRZA 4QSTA 5DKCA 4ALHA 3DWYA 5G4SA 2DVRA 5I83A 2KTBB 5HENA 4YAXA 5JWMA 3UVWA 5CQ7A 2RFJA 5FB1A 4HXPA 3P1CA 4MEOA 5IG6A 4A9OA 2YELA 5HFQA 5CUDA 5CUAA 5A5SA 5D3NA 3P1DA 5HQ6A 5FE1A 4PTBA 4QC1A 4LZ2A 2WP1A 5FBXA 2L5EA 3MXFA 5CU8A 3JVLA 4C67A 2MJVB 2RNXA 5FH8A 4GPJA 5FE3A 4Q0OA 4UYHA 5ENEA 4CLBA 5LVQA 2D82A 3LQIA 5BT4A 5CZGA 4N3WA 5HM0A 4YYDA 5A83A 5HEMA 5FFWA 4Y03A 4IORA 5E9KA 5EI4A 4O7AA 3JVJA 3MULA 5EVAA 3UVXA 5FE0A 5FH7A 4PS5A 4HXKA 5F25A 5FE2A 4UIUA 5A5NA 5CTLA 4UIWA 5FG6A 2DVQA 5E9IA 4QBMA 4HBVA 4A9LA 5D3PA 4A9HA 4HXOA 5E9MA 4UITA 5LKUA 5TB6A 5IGKA 5CFWA 1ZS5A 4IR3A 2RI7A 5I7XA 4KV4A 5HELA 5COIA 3P1EA 2E7OA 4HBWA 4CUSA 4NXJA 2I7KA 4PCIA 5F5ZA 5EQ1A 5HRVA 5FH6A 3K2JA 4TZ2A 3U5KA 2DWWA 2YYNA 5E73A 5CUCA 5H1UA 4FLPA 5FDZA 5A85A 5HCLA 4LDFA 4XY9A 5D7XA 5D3LA 5BT3A 4UIVA 4TT4A 1EQFA 4TTEA 3QZTA 3AQAA 4MR3A 5H85A 3UVYA 2R0YA 2NXBA 4YY6A 2DVVA 5EM3A 5AD2A 5F63A 4TQNA 3ZYUA 5DFDA 4ZW1A 3QZSA 5DY7A 5L8UA 5F61A 5HQ5A 4KV1A 5FE5A 5I89A 3QZVA 4UYFA 4QSUA 5C4QA 4Z1QA 5C8GA 2GRCA 5HFRA 4DONA 5ENIA 5ENFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EWWA 4NQMA 4AKNA 5CQAA 4YYNA 4WIVA 5TCMA 5E9YA 5DW2A 4N4IA 2H60A 4LYIA 5EISA 5IBNA 4Z93A 4NS5A 5E3DA 5EP7A 4NYVA 3AADA 3ONIA 2N9GA 4BW2A 5LUUA 5DW1A 1F68A 3UVDA 5A81A 2E3KA 2R10A 4HXNA 4UIXA 4UIZA 4NRAA 5DYCA 3D7CA 5ACYA 5D3HA 5HRWA 4N4GA 4TT6A 5IGLA 4QSPA 5FE7A 1WUMA 4QYLA 3U5OA 5E74A 5EWVA 5DFCA 4WHUA 4A9FA 4QSQA 5KTWA 3FKMX 5FE4A 4O7CA 4UIYA 4XUAA 3JVKA 3Q2EA 2R0VA 5I80A 4IR6A 5II2A 3O36A 5EU1A 5IGMA 4CFLA 5D3RA 5EPSA 5G4RA 5LJ2A 5DYAA 4XY8A 4MEQA 5EWHA 5E9LA 5FE8A 4WHWA 3IU6A 2LSPB 1WUGA 5EPRA 4LZSA 2L84A 3DAIA 4YH4A 4CUUA 4O7FA 5EV9A 4O77A 1JM4B 4N4FA 4O7EA 5F1LA 4YATA 4O70A 5AMFA 5CP5A 3LQJA 4YYGA 5EWCA 4ALGA 2RO1A 2OSSA 2FSAA 2RS9B 4YBMA 5HRXA 4HBYA 3IU5A 4NRCA 4OUFA 4MENA 4O76A 1JSPB 4RVRA 4TT2A 4BHWA 5ENGA 3JVMA 4X2IA 4A9IA 5C89A 2OUOA 4YYKA 4J0RA 4CURA 5LJ1A 4TYLA 4PY6A 4TU6A 3LQHA 3MB3A 3UV4A 4Q0NA 4XUBA 5CQTA 5C85A 4E96A 2R0SA 4BW4A 5HQ7A 4YADA 3D1BA 4LRGA 4J0SA 5FFYA 4LC2A 5D3TA 5BT5A 4CUPA 5CRMA 4QB3A 4QEWA 5D3SA 4YY4A 4MR6A 2YW5A 4A9JA 5CQ5A 5L97A 4OGIA 4ZQLA 5ETBA 2YDWA 5EGUA 5KTXA 4Z6IA 4O72A 4QY4A 5L96A 4YYMA 4J1PA 5I88A 5IGNA 3O35A 5EPBA 4LZRA 5CGPA 2L85A 5L99A 3U5NA 3MQMA 5EK9A 4UYDA 4QNSA 5J0DA 1E6IA 3UV5A 4CUTA 2YQDA 3SVGA 4F3IA 4HXSA 4C66A 2YEKA 5E3GA 5F1HA 4QR5A 5A5OA 5F62A 2WP2A 5DBMA 4O7BA 5I29A 4Z6HA 4QSXA 5C87A 4PCEA 5D25A 1X0JA 5F2PA 4BW3A 2OO1A 5I40A 5DFBA 3O37A 5CUBA 4UYGA 5H1TA 4CFKA 5DLZA 4QEUA 4BJXA 5LKTA 4QEVA 3SVFA 5ENHA 4HXMA 5LKZA 5ENBA 2DKWA 4TU4A 3LXJA 2DATA 5F36A 5L8TA 3G0LA 3LJWA 3U5PA 4QSSA 4MR5A 4O71A 5FFVA 3Q2FA 3UW9A 5I1QA 5CUGA 4YC9A 5CQ8A 5HLSA 4UYEA 5FE9A 4NYXA 5I7YA 5KHMA 3NXBA 2YEMA 4HXRA 5A5PA 4Z1SA 5C7NA 2F6NA 2G4AA 2I8NA 4O78A 4J3IA 3TLPA 4NR8A 5D3JA 4QYDA 4PKLA 4N4HA 5CQ4A 3U5LA 4QSWA 2F6JA 4YYJA 1PUOA 4YYHA 4HXLA 5I86A 5AD3A 5AMEA 5DYUA 4QSRA 4AI6A 3S91A 5CQ3A 3SVHA 4LYWA 5D0CA 5JI8A 4NYWA 4QR4A 4NUEA 4ZC9A 4LYSA 4YBSA 2E7NA 5FG5A 4QZSA 5FG4A 4NRBA 5A5QA 4O75A 5D26A 5EA1A 5DLXA 4NQNA 3MB4A 4NUCA 4NR7A 4LR6A 4NR6A 5E0RA 3UV2A 5DKHA 5ENCA 2RNYA 3VKHA 5CQ6A 5DYXA 4HBXA 3U5MA 4O74A 4MEPA 1ZKRA 4IOOA 5HJCA 5ETDA 5EICA 4TZ8A 5E9VA 5LKXA 3U5JA 4QUUA 4AKGA 4QC3A 5KTUA 3S92A 4IOQA 2DVSA 4KCXA 4NR4A 5FE6A 5II1A 4TS8A 5DKDA 4YYIA 4CL9A 3I3JA 4OGJA 5DX4A 4MR4A 4QUTA 4BW1A 4XYAA 5IIDA 4QSVA 4CUQA 3P5OA 1N72A 5F60A 3HMEA 5A5RA 5LJ0A 3O33A 4UYFB 5H1VA 4AKHA 5A82A 5L98A 5ENJA 5CY9A 3G0JA 4IR5A 5FB0A 3HMFA 5E7DA 3P1FA 4A9MA 4YH3A 4A9EA 2D9EA 3MUKA 3O34A 5CPEA 4NR5A 4YK0A 4AKIA 5CS8A 4NUDA 4A9KA 4NR9A 5A7CA 5CUEA 5KU3A 2RNWA 5K29A 4A9NA 5EWDA 5D24A 3RCWA 4YABA 5KO4A 3GG3A 4YBTA 4IR4A 3HMHA 4QR3A 5F3AA 5LVRA 5CRZA 4QSTA 5DKCA 4ALHA 3DWYA 5G4SA 2DVRA 5I83A 2KTBB 5HENA 4YAXA 5JWMA 3UVWA 5CQ7A 2RFJA 5FB1A 4HXPA 3P1CA 4MEOA 5IG6A 4A9OA 2YELA 5HFQA 5CUDA 5CUAA 5A5SA 5D3NA 3P1DA 5HQ6A 5FE1A 4PTBA 4QC1A 4LZ2A 2WP1A 5FBXA 2L5EA 3MXFA 5CU8A 2EJNA 3JVLA 4C67A 2MJVB 2RNXA 5FH8A 4GPJA 5FE3A 3VKGA 4Q0OA 4UYHA 5ENEA 4CLBA 5LVQA 2D82A 3LQIA 5BT4A 5CZGA 4N3WA 3ERRA 5HM0A 4YYDA 5A83A 5HEMA 5FFWA 4Y03A 4IORA 5E9KA 5EI4A 4O7AA 3JVJA 3MULA 5EVAA 3UVXA 5FE0A 5FH7A 4PS5A 4HXKA 5F25A 5FE2A 4UIUA 5A5NA 5CTLA 4UIWA 5FG6A 2DVQA 5E9IA 4QBMA 4HBVA 3D1DA 4A9LA 5D3PA 4A9HA 4HXOA 5E9MA 4UITA 5LKUA 5TB6A 5IGKA 5CFWA 1ZS5A 4IR3A 2RI7A 5I7XA 4KV4A 5HELA 5COIA 3P1EA 2E7OA 4HBWA 4CUSA 4NXJA 2I7KA 4PCIA 5F5ZA 5EQ1A 5HRVA 5FH6A 3K2JA 4TZ2A 3U5KA 2DWWA 2YYNA 5E73A 5CUCA 5H1UA 4FLPA 5FDZA 5A85A 5HCLA 4LDFA 4XY9A 5D7XA 5D3LA 5BT3A 4UIVA 4TT4A 1EQFA 4TTEA 3QZTA 3AQAA 4MR3A 5H85A 3UVYA 2R0YA 2NXBA 4YY6A 2DVVA 5EM3A 5AD2A 5F63A 4TQNA 3ZYUA 5DFDA 4ZW1A 3QZSA 5DY7A 5L8UA 5F61A 5HQ5A 4KV1A 5FE5A 5I89A 3QZVA 4UYFA 4QSUA 5C4QA 4Z1QA 5C8GA 2GRCA 5HFRA 4DONA 5ENIA 5ENFA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EWW A;  4NQM A;  4AKN A;  5CQA A;  4YYN A;  4WIV A;  5TCM A;  5E9Y A;  5DW2 A;  4N4I A;  2H60 A;  4LYI A;  5EIS A;  5IBN A;  4Z93 A;  4NS5 A;  5E3D A;  5EP7 A;  4NYV A;  3AAD A;  3ONI A;  2N9G A;  4BW2 A;  5LUU A;  5DW1 A;  1F68 A;  3UVD A;  5A81 A;  2E3K A;  2R10 A;  4HXN A;  4UIX A;  4UIZ A;  4NRA A;  5DYC A;  3D7C A;  5ACY A;  5D3H A;  5HRW A;  4N4G A;  4TT6 A;  5IGL A;  4QSP A;  5FE7 A;  1WUM A;  4QYL A;  3U5O A;  5E74 A;  5EWV A;  5DFC A;  4WHU A;  4A9F A;  4QSQ A;  5KTW A;  3FKM X;  5FE4 A;  4O7C A;  4UIY A;  4XUA A;  3JVK A;  3Q2E A;  2R0V A;  5I80 A;  4IR6 A;  5II2 A;  3O36 A;  5EU1 A;  5IGM A;  4CFL A;  5D3R A;  5EPS A;  5G4R A;  5LJ2 A;  5DYA A;  4XY8 A;  4MEQ A;  5EWH A;  5E9L A;  5FE8 A;  4WHW A;  3IU6 A;  2LSP B;  1WUG A;  5EPR A;  4LZS A;  2L84 A;  3DAI A;  4YH4 A;  4CUU A;  4O7F A;  5EV9 A;  4O77 A;  1JM4 B;  4N4F A;  4O7E A;  5F1L A;  4YAT A;  4O70 A;  5AMF A;  5CP5 A;  3LQJ A;  4YYG A;  5EWC A;  4ALG A;  2RO1 A;  2OSS A;  2FSA A;  2RS9 B;  4YBM A;  5HRX A;  4HBY A;  3IU5 A; 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