4NRBA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with compound-1 n01197
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nrbA00
5FH7A 4LRGA 4TQNA 4IORA 5EISA 4QEUA 4YYIA 4CL9A 5CP5A 4WIVA 4CUTA 5E9YA 4UITA 5I40A 4OGJA 4UIYA 5CQAA 4YYDA 4BW1A 2DVSA 5HQ7A 3QZSA 4MEOA 4CFLA 5A5SA 4CURA 3P1EA 4NR5A 5J0DA 5CRZA 2E7OA 3O34A 5EWHA 5E7DA 3JVKA 5D3JA 5EA1A 4NUCA 5ENGA 4UIVA 4O75A 5DYCA 5HJCA 4O76A 5L8TA 4QB3A 4A9KA 4A9NA 2YYNA 5CTLA 5HENA 4A9OA 5FE0A 2RNYA 4TU6A 3DAIA 4DONA 5KO4A 4PCEA 4QSXA 5FH8A 5LKTA 5CUAA 5A82A 5EI4A 4Z6IA 5D26A 5E3DA 4HXNA 4N4IA 1WUMA 4ZC9A 5JI8A 2OSSA 5FE3A 4MR4A 2OUOA 4NR7A 4BW2A 3UV2A 4CLBA 2YDWA 5I86A 4NYXA 5F36A 4PCIA 4IR5A 4NR9A 4TT2A 4YYHA 5A5QA 4LR6A 5EGUA 4A9HA 4MENA 4LZRA 5EU1A 3U5OA 4QNSA 3LQHA 4O70A 4RVRA 1JSPB 3SVGA 5F3AA 4UYFB 4YYMA 5FE7A 5FB0A 4CUUA 5IBNA 4YK0A 5FG6A 5IGNA 5H85A 5F60A 2OO1A 5LVRA 5EVAA 1ZS5A 2I7KA 2WP1A 3MUKA 1E6IA 3P1FA 4FLPA 4LC2A 4YY6A 4MR6A 5I89A 3Q2EA 5F1HA 5A81A 2E7NA 4XY9A 2YW5A 2R0VA 2DKWA 2R0YA 4NR8A 4Y03A 4PY6A 5E9VA 5ENCA 5I7XA 5KHMA 5A7CA 4NXJA 5F2PA 4PS5A 2DWWA 4BJXA 5FE9A 5TB6A 4NYVA 4J0SA 3P5OA 5L8UA 1F68A 3IU5A 4PKLA 4N4GA 3MQMA 4YBMA 4QEVA 4KCXA 4QYLA 4O7EA 4WHUA 4ZQLA 2WP2A 5EK9A 2N9GA 4NQMA 4NUEA 4A9LA 4OGIA 5F25A 4TZ2A 5AMEA 5HQ5A 4QSWA 3UV5A 3JVJA 2L85A 5LUUA 5DYAA 4HXOA 5EV9A 4LZSA 4Q0OA 4CUPA 5FBXA 4IR3A 3G0LA 5HFQA 4QUTA 5FFWA 4XUBA 2YEMA 3HMFA 3IU6A 2NXBA 5CQ3A 5E9IA 5EM3A 4QSQA 4N4HA 3SVFA 2KTBB 5CY9A 4YATA 4Z6HA 5ENIA 4QC1A 5BT5A 3AADA 4TS8A 4IOOA 4NUDA 5C8GA 4HBXA 5D3PA 4HXMA 3LQJA 3QZTA 5FE6A 4Q0NA 5DW1A 4O7FA 3DWYA 4QSPA 5D3HA 5ETBA 5CPEA 4UIXA 5CUCA 5KU3A 5F1LA 3MB4A 3P1CA 4N4FA 5HRWA 3G0JA 3AQAA 4A9MA 5H1VA 4E96A 5CQ6A 3U5MA 4CUQA 5I1QA 5DW2A 4YYJA 5HCLA 4UYDA 5LJ2A 2DATA 4CFKA 5DYXA 5G4RA 5H1UA 5L99A 5EWWA 4C66A 2H60A 5F61A 5HEMA 5C85A 5BT4A 2D82A 5CZGA 5AD2A 2YELA 4HBWA 3D7CA 4O7CA 5A5NA 5FE4A 3TLPA 4O7AA 5CRMA 5D24A 4QBMA 5CQTA 5ACYA 2RS9B 4IR6A 4HXLA 5CUGA 4ZW1A 2R10A 5ENBA 4A9IA 5I88A 5C4QA 5JWMA 5C7NA 4QYDA 2DVQA 5IGMA 3JVMA 4A9JA 5L98A 3U5NA 4YH4A 5CUBA 4IR4A 4Z1QA 5EP7A 3SVHA 1EQFA 5II2A 4NQNA 5E74A 5HRVA 5KTUA 2E3KA 2D9EA 2RFJA 2R0SA 4TTEA 5IGLA 5DYUA 5IGKA 4QC3A 5ENJA 5CQ8A 5E9LA 2RNWA 3UVDA 3U5JA 5FB1A 5FG5A 5LVQA 5DKDA 2L84A 5E0RA 3K2JA 4MEPA 2F6JA 2L5EA 5A5PA 5FE8A 4BW3A 4WHWA 3S91A 1JM4B 4QUUA 5EWCA 3LQIA 4KV1A 4O71A 5D7XA 4YC9A 5K29A 5D0CA 2DVVA 5DLXA 5E9MA 2RI7A 5DY7A 4QR4A 4QY4A 5L96A 5HLSA 4LYSA 5AMFA 5HRXA 5DFCA 4MEQA 5D3NA 3I3JA 5I29A 5LJ0A 3GG3A 4TZ8A 4UIZA 4YAXA 4QR5A 4J3IA 5FH6A 4NRAA 5C87A 4QZSA 3S92A 3U5KA 5IG6A 4UIUA 2DVRA 4CUSA 5AD3A 5LKXA 5EWVA 5CQ4A 4ALHA 5DBMA 4J1PA 5A5RA 2FSAA 5FFVA 5DFDA 1X0JA 4HBVA 5ENHA 4O74A 3O36A 5HFRA 2YQDA 4UYEA 4YH3A 5HM0A 4BHWA 4J0RA 4HXKA 5I7YA 5HELA 4LZ2A 5H1TA 4ALGA 5ENFA 5A5OA 4QR3A 5FFYA 1N72A 4XUAA 5DLZA 4XYAA 4QSSA 4NR6A 4UIWA 5E3GA 5FG4A 5FDZA 5I83A 4BW4A 2MJVB 4HXSA 5I80A 4HXPA 5CGPA 3O33A 4NYWA 4OUFA 5CUDA 5CQ7A 5FE1A 4N3WA 4YY4A 5D3LA 5L97A 4YBTA 5BT3A 4QSUA 5E9KA 5G4SA 5FE5A 3U5PA 5LKZA 5DX4A 4Z1SA 3HMHA 4HBYA 3UVWA 5KTXA 4NS5A 3HMEA 5KTWA 5CQ5A 4YABA 3MXFA 4X2IA 4XY8A 2F6NA 4GPJA 4NRCA 4LYIA 2YEKA 3FKMX 3LXJA 4O7BA 5EICA 5F63A 5ETDA 4MR3A 4HXRA 3MB3A 5CS8A 5EPSA 3Q2FA 4UYFA 3ZYUA 4AKNA 5F5ZA 5CU8A 3UVXA 4YYKA 3MULA 5DFBA 5E73A 4QSTA 3UV4A 2LSPB 4QEWA 4A9EA 5D3RA 5DKHA 3U5LA 4QSRA 4TT6A 5F62A 5COIA 5C89A 3LJWA 5D3TA 4NRBA 3NXBA 5II1A 5A83A 4A9FA 4PTBA 3O35A 5TCMA 3QZVA 4IOQA 4F3IA 5IIDA 5ENEA 4O78A 4NR4A 4UYHA 5EPBA 3UW9A 2I8NA 4TYLA 2RO1A 5EWDA 4YYNA 5LJ1A 5FE2A 4MR5A 4TT4A 5CFWA 4UYGA 3UVYA 4TU4A 4O72A 4KV4A 3P1DA 3RCWA 3O37A 4LYWA 4O77A 5LKUA 4YADA 3JVLA 5D3SA 4LDFA 4QSVA 5EQ1A 5A85A 5HQ6A 2GRCA 4YYGA 2RNXA 5DKCA 4YBSA 5CUEA 2G4AA 1WUGA 3ONIA 5D25A 5EPRA 4Z93A 4C67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FH7A 4LRGA 4TQNA 4IORA 5EISA 4QEUA 4YYIA 4CL9A 5CP5A 4WIVA 4CUTA 5E9YA 4UITA 5I40A 4OGJA 4UIYA 5CQAA 4YYDA 4BW1A 2DVSA 5HQ7A 3QZSA 4MEOA 4CFLA 5A5SA 4CURA 3P1EA 4NR5A 5J0DA 5CRZA 2E7OA 3O34A 5EWHA 5E7DA 3JVKA 5D3JA 5EA1A 4NUCA 3D1BA 5ENGA 4UIVA 4O75A 5DYCA 5HJCA 4O76A 5L8TA 4QB3A 4A9KA 4A9NA 2YYNA 5CTLA 5HENA 4A9OA 5FE0A 2RNYA 4TU6A 3DAIA 4DONA 5KO4A 4PCEA 4QSXA 5FH8A 5LKTA 5CUAA 5A82A 2EJNA 5EI4A 4Z6IA 5D26A 5E3DA 4HXNA 4N4IA 1WUMA 4ZC9A 5JI8A 2OSSA 3VKHA 5FE3A 4MR4A 2OUOA 4NR7A 4BW2A 3UV2A 4CLBA 2YDWA 5I86A 4NYXA 5F36A 4PCIA 4IR5A 4NR9A 4TT2A 4YYHA 5A5QA 4LR6A 5EGUA 4A9HA 4MENA 4LZRA 5EU1A 3U5OA 4QNSA 3LQHA 4O70A 4RVRA 1JSPB 3SVGA 5F3AA 4UYFB 4YYMA 5FE7A 5FB0A 4CUUA 5IBNA 4YK0A 5FG6A 5IGNA 5H85A 5F60A 2OO1A 5LVRA 5EVAA 1ZS5A 2I7KA 2WP1A 3MUKA 1E6IA 3P1FA 4FLPA 4LC2A 4YY6A 4MR6A 5I89A 3Q2EA 5F1HA 5A81A 2E7NA 4XY9A 2YW5A 2R0VA 2DKWA 2R0YA 4NR8A 4Y03A 4PY6A 5E9VA 5ENCA 5I7XA 5KHMA 5A7CA 4NXJA 5F2PA 4PS5A 2DWWA 4BJXA 5FE9A 5TB6A 4NYVA 4J0SA 3P5OA 5L8UA 1F68A 3IU5A 4PKLA 4N4GA 3MQMA 4YBMA 4QEVA 4KCXA 4QYLA 4O7EA 4AI6A 4WHUA 4ZQLA 5EK9A 3D1DA 2N9GA 4NQMA 4NUEA 4A9LA 4OGIA 5F25A 4TZ2A 5AMEA 5HQ5A 4QSWA 3UV5A 3JVJA 2L85A 5LUUA 5DYAA 4HXOA 5EV9A 4AKHA 4LZSA 4Q0OA 4CUPA 5FBXA 4IR3A 3G0LA 5HFQA 4QUTA 5FFWA 4XUBA 4AKIA 2YEMA 3HMFA 3IU6A 2NXBA 5CQ3A 5E9IA 5EM3A 4QSQA 4N4HA 3SVFA 2KTBB 5CY9A 4YATA 4Z6HA 5ENIA 4QC1A 5BT5A 3AADA 4TS8A 4IOOA 4NUDA 5C8GA 4HBXA 5D3PA 4HXMA 3LQJA 3QZTA 5FE6A 4Q0NA 5DW1A 4O7FA 3DWYA 4QSPA 4AKGA 5D3HA 5ETBA 5CPEA 4UIXA 5CUCA 5KU3A 5F1LA 3MB4A 3P1CA 4N4FA 5HRWA 3G0JA 3AQAA 4A9MA 5H1VA 4E96A 5CQ6A 3U5MA 4CUQA 5I1QA 5DW2A 4YYJA 5HCLA 4UYDA 5LJ2A 2DATA 4CFKA 5DYXA 5G4RA 5H1UA 5L99A 5EWWA 4C66A 2H60A 5F61A 5HEMA 5C85A 5BT4A 2D82A 5CZGA 5AD2A 2YELA 4HBWA 3D7CA 3VKGA 4O7CA 5A5NA 3ERRA 5FE4A 3TLPA 4O7AA 5CRMA 5D24A 4QBMA 5CQTA 5ACYA 2RS9B 4IR6A 4HXLA 5CUGA 4ZW1A 2R10A 5ENBA 4A9IA 5I88A 5C4QA 5JWMA 5C7NA 4QYDA 2DVQA 5IGMA 3JVMA 4A9JA 5L98A 3U5NA 4YH4A 5CUBA 4IR4A 4Z1QA 5EP7A 3SVHA 1EQFA 5II2A 4NQNA 5E74A 5HRVA 5KTUA 2E3KA 2D9EA 2RFJA 2R0SA 4TTEA 5IGLA 5DYUA 5IGKA 4QC3A 5ENJA 5CQ8A 5E9LA 2RNWA 3UVDA 3U5JA 5FB1A 5FG5A 5LVQA 5DKDA 2L84A 5E0RA 3K2JA 4MEPA 2F6JA 2L5EA 5A5PA 5FE8A 4BW3A 4WHWA 3S91A 1JM4B 4QUUA 5EWCA 3LQIA 4KV1A 4O71A 5D7XA 4YC9A 5K29A 5D0CA 2DVVA 5DLXA 5E9MA 2RI7A 5DY7A 4QR4A 4QY4A 5L96A 5HLSA 4LYSA 5AMFA 5HRXA 5DFCA 4MEQA 5D3NA 3I3JA 5I29A 5LJ0A 3GG3A 4TZ8A 4UIZA 4YAXA 4QR5A 4J3IA 5FH6A 4NRAA 5C87A 4QZSA 3S92A 3U5KA 5IG6A 4UIUA 2DVRA 4CUSA 5AD3A 5LKXA 5EWVA 5CQ4A 4ALHA 5DBMA 4J1PA 5A5RA 2FSAA 5FFVA 5DFDA 1X0JA 4HBVA 5ENHA 4O74A 3O36A 5HFRA 2YQDA 4UYEA 4YH3A 5HM0A 4BHWA 4J0RA 4HXKA 5I7YA 5HELA 4LZ2A 5H1TA 4ALGA 5ENFA 5A5OA 4QR3A 5FFYA 1N72A 4XUAA 5DLZA 4XYAA 4QSSA 4NR6A 4UIWA 5E3GA 5FG4A 5FDZA 5I83A 4BW4A 2MJVB 4HXSA 5I80A 4HXPA 5CGPA 3O33A 4NYWA 4OUFA 5CUDA 5CQ7A 5FE1A 1PUOA 4N3WA 4YY4A 5D3LA 5L97A 4YBTA 5BT3A 4QSUA 5E9KA 5G4SA 5FE5A 3U5PA 5LKZA 5DX4A 4Z1SA 3HMHA 4HBYA 3UVWA 5KTXA 4NS5A 3HMEA 5KTWA 5CQ5A 4YABA 3MXFA 4X2IA 4XY8A 2F6NA 4GPJA 4NRCA 4LYIA 2YEKA 3FKMX 3LXJA 4O7BA 5EICA 5F63A 5ETDA 4MR3A 4HXRA 3MB3A 5CS8A 5EPSA 3Q2FA 4Z93A 4UYFA 3ZYUA 4AKNA 5F5ZA 5CU8A 3UVXA 4YYKA 3MULA 5DFBA 5E73A 4QSTA 3UV4A 2LSPB 4QEWA 4A9EA 5D3RA 5DKHA 3U5LA 4QSRA 4TT6A 5F62A 5COIA 5C89A 3LJWA 5D3TA 4NRBA 3NXBA 5II1A 5A83A 4A9FA 4PTBA 3O35A 5TCMA 3QZVA 4IOQA 4F3IA 5IIDA 5ENEA 4O78A 4NR4A 4UYHA 5EPBA 3UW9A 2I8NA 4TYLA 2RO1A 5EWDA 4YYNA 5LJ1A 5FE2A 4MR5A 4TT4A 5CFWA 4UYGA 3UVYA 4TU4A 4O72A 4KV4A 3P1DA 3RCWA 3O37A 4LYWA 4O77A 5LKUA 4YADA 3JVLA 5D3SA 4LDFA 4QSVA 5EQ1A 5A85A 5HQ6A 2GRCA 4YYGA 2RNXA 5DKCA 4YBSA 5CUEA 2G4AA 1WUGA 3ONIA 5D25A 1ZKRA 5EPRA 2WP2A 4C67A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5FH7 A;  4LRG A;  4TQN A;  4IOR A;  5EIS A;  4QEU A;  4YYI A;  4CL9 A;  5CP5 A;  4WIV A;  4CUT A;  5E9Y A;  4UIT A;  5I40 A;  4OGJ A;  4UIY A;  5CQA A;  4YYD A;  4BW1 A;  2DVS A;  5HQ7 A;  3QZS A;  4MEO A;  4CFL A;  5A5S A;  4CUR A;  3P1E A;  4NR5 A;  5J0D A;  5CRZ A;  2E7O A;  3O34 A;  5EWH A;  5E7D A;  3JVK A;  5D3J A;  5EA1 A;  4NUC A;  5ENG A;  4UIV A;  4O75 A;  5DYC A;  5HJC A;  4O76 A;  5L8T A;  4QB3 A;  4A9K A;  4A9N A;  2YYN A;  5CTL A;  5HEN A;  4A9O A;  5FE0 A;  2RNY A;  4TU6 A;  3DAI A;  4DON A;  5KO4 A;  4PCE A;  4QSX A;  5FH8 A;  5LKT A;  5CUA A;  5A82 A;  5EI4 A;  4Z6I A;  5D26 A;  5E3D A;  4HXN A;  4N4I A;  1WUM A;  4ZC9 A;  5JI8 A;  2OSS A;  5FE3 A;  4MR4 A;  2OUO A;  4NR7 A;  4BW2 A;  3UV2 A;  4CLB A;  2YDW A;  5I86 A;  4NYX A;  5F36 A;  4PCI A;  4IR5 A;  4NR9 A;  4TT2 A;  4YYH A;  5A5Q A;  4LR6 A;  5EGU A;  4A9H A;  4MEN A;  4LZR A;  5EU1 A;  3U5O A;  4QNS A;  3LQH A;  4O70 A;  4RVR A;  1JSP B;  3SVG A;  5F3A A;  4UYF B;  4YYM A;  5FE7 A;  5FB0 A;  4CUU A;  5IBN A;  4YK0 A; 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