4NRBA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with compound-1 n01197
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
total genus 38
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nrbA00
5EPBA 4NR9A 5A81A 4XUBA 5LJ0A 1JSPB 5L8TA 5FBXA 5EWHA 2E7OA 5FFWA 5KTXA 4YYKA 2DATA 4ALHA 4QEVA 5DKHA 4WHUA 4KCXA 4LYSA 4LRGA 5EV9A 5FE1A 4Y03A 5ENHA 4PCEA 1ZS5A 2RS9B 5EI4A 4O7FA 4A9IA 5BT3A 4NRCA 3U5LA 4IOOA 4NXJA 4MENA 4NRAA 2R0YA 4HBWA 3RCWA 4PKLA 3UV4A 5F61A 4N4IA 4HXRA 5J0DA 5FG4A 3U5OA 3O36A 4YYNA 2WP2A 4YYGA 4TYLA 4UYFB 5FG6A 5FE7A 4NYXA 4NUDA 4XY8A 2N9GA 5DYAA 5I40A 3Q2FA 2F6NA 4TS8A 3O37A 5FE0A 5FFYA 2OSSA 4CLBA 5FB1A 5FE5A 4A9EA 2MJVB 5E3DA 5EPRA 4UIVA 4A9JA 5F5ZA 4ALGA 5E9LA 5HRVA 4YYDA 5AD3A 5ETDA 5F1HA 4NR5A 5E0RA 5LKXA 3MQMA 5FB0A 4O78A 5II1A 2RNXA 5CQ8A 1E6IA 4UIZA 4YY4A 4Z1SA 5CQAA 5DKDA 5HQ7A 5IIDA 5KO4A 5A5SA 5BT5A 5LVQA 4YYIA 3U5JA 5A5QA 5AMEA 4YABA 2DWWA 4NQNA 5HELA 4IR5A 5FE3A 1WUGA 3O35A 4LYIA 4GPJA 3SVFA 5ENBA 5F36A 4KV4A 2YEMA 4CUQA 5I1QA 5H85A 5CUDA 4NR7A 2F6JA 4TTEA 4QYDA 3LQHA 5IBNA 4YYHA 4J3IA 5HQ6A 2RNWA 4YY6A 4YYJA 3LQJA 3U5KA 4HBXA 3U5MA 2YEKA 5DFBA 4O71A 5DFCA 4C66A 5COIA 5HJCA 4AKNA 5EQ1A 5E9YA 4LZ2A 5CFWA 5EVAA 3GG3A 4PTBA 5JI8A 5FDZA 5H1UA 5C87A 5C85A 5DLXA 4BW1A 5IGLA 4ZC9A 4CUTA 5CPEA 4HXMA 5HFQA 1N72A 2L84A 3Q2EA 5CUEA 4HXNA 5IG6A 2YDWA 2YYNA 4UITA 4QR3A 5F25A 4Q0OA 5KTUA 1F68A 5EP7A 4BW2A 5CU8A 4HXPA 4Q0NA 4PCIA 5L96A 4Z93A 5CGPA 5EK9A 5HEMA 5CUGA 5HM0A 2DVQA 5C8GA 5EWWA 4HXSA 4UYEA 3G0JA 4O77A 4UYGA 2NXBA 2I8NA 5L98A 4UYHA 4CFKA 3NXBA 4YBSA 4X2IA 4NUEA 5D3PA 4CUSA 5LVRA 4PS5A 5LJ2A 4OGJA 3O33A 4Z6IA 5KU3A 4Z1QA 3P5OA 4UIXA 5E9VA 4MR4A 4QSRA 4QSTA 5HRXA 4LZRA 4NUCA 2RFJA 4TZ8A 5CUBA 5EGUA 5E73A 5D25A 4OGIA 5DLZA 5HRWA 5KTWA 4E96A 4O75A 4F3IA 5ENJA 5FE9A 4FLPA 5G4SA 2KTBB 5D3SA 5ACYA 5F62A 4XUAA 5DKCA 5D7XA 5FH6A 5D0CA 4YYMA 3JVLA 4HXLA 5D3RA 5H1VA 5FE2A 4QSWA 5CTLA 2RI7A 5JWMA 4N4HA 5FFVA 5II2A 3HMEA 1WUMA 4O7AA 4BHWA 4O7EA 4QNSA 4HBYA 2L85A 5I29A 2RO1A 4CL9A 5D3LA 5ENCA 3P1FA 3U5NA 5LJ1A 4HXKA 4HBVA 5EPSA 2OUOA 4QBMA 5DW2A 5F1LA 3P1EA 3MULA 4TQNA 5I86A 3LQIA 4UIWA 4YAXA 5CQ3A 3IU6A 2E7NA 5EA1A 2I7KA 5CUAA 3QZSA 5CQ5A 3S91A 5HENA 5A85A 5AMFA 5DYXA 5FE6A 3UV5A 5HFRA 1X0JA 5E74A 5I80A 4TT4A 4QC1A 5KHMA 4TU6A 5A5NA 5HCLA 5DX4A 5A83A 4J0RA 5CQ7A 5EM3A 5CRZA 3UW9A 4A9HA 2H60A 4OUFA 5F63A 4MEPA 2YELA 5CRMA 5LKUA 4QSUA 3JVJA 2OO1A 1EQFA 4XY9A 4BJXA 5ETBA 4J0SA 5E9KA 3HMHA 5D3NA 4LDFA 4QY4A 5EISA 4YC9A 5K29A 4N3WA 4O72A 4UYFA 3HMFA 4QR5A 2E3KA 4NRBA 4KV1A 5CUCA 3UVXA 5IGNA 5EWCA 4IOQA 3ZYUA 5AD2A 3IU5A 4QR4A 4O7CA 5ENGA 4LC2A 3I3JA 5I7YA 4NR8A 5A82A 2YW5A 4IR3A 5L8UA 5EICA 4PY6A 4TU4A 4CURA 5ENEA 4IR6A 5LUUA 5HLSA 5DW1A 4YBTA 5F3AA 5LKTA 4LR6A 4NYVA 5C7NA 3JVMA 4YATA 4C67A 4YBMA 4QC3A 5E3GA 4TZ2A 4NR4A 5EWDA 5E9IA 5IGKA 4NQMA 2YQDA 4TT2A 4UYDA 5I88A 5F60A 3TLPA 5A5RA 3P1CA 3LXJA 5I89A 3UVYA 4QSXA 5FH7A 5L97A 4A9OA 5D24A 5FH8A 3QZVA 4A9MA 4QEUA 2DVVA 4QSPA 4QUUA 5TB6A 2R0SA 3QZTA 5A5PA 2RNYA 1JM4B 3MUKA 5ENFA 4WIVA 4N4GA 3P1DA 5D3TA 4Z6HA 4ZW1A 3SVGA 2FSAA 5A7CA 5C89A 3MB4A 3AQAA 4NYWA 4O70A 2WP1A 5DFDA 4J1PA 5CZGA 5CS8A 4MEOA 3MXFA 3SVHA 5A5OA 2L5EA 3O34A 2G4AA 4QB3A 4NS5A 4IR4A 4DONA 4IORA 5C4QA 5TCMA 2DVRA 4O7BA 5D3JA 4XYAA 5F2PA 5E9MA 5CQTA 5BT4A 4LYWA 4ZQLA 4MEQA 4NR6A 4YK0A 4MR5A 5FE8A 3K2JA 5FE4A 5DY7A 5EWVA 4N4FA 5DYUA 3UV2A 3LJWA 5D3HA 5FG5A 5ENIA 5H1TA 3AADA 4A9NA 3U5PA 5L99A 2D9EA 5CY9A 3DWYA 4QSSA 3G0LA 5DYCA 4BW3A 3JVKA 5EU1A 5E7DA 2DVSA 2R10A 3FKMX 3ONIA 4CUPA 2GRCA 3UVDA 4YH3A 5CQ4A 3UVWA 4YH4A 2D82A 4QYLA 5LKZA 4MR6A 5CP5A 4QZSA 4QUTA 2R0VA 4YADA 4LZSA 5CQ6A 4O74A 3DAIA 4WHWA 4O76A 5G4RA 4A9KA 2LSPB 4QEWA 4HXOA 5I83A 4CFLA 4CUUA 4MR3A 5D26A 5IGMA 4QSVA 4A9FA 5DBMA 3MB3A 4UIYA 4TT6A 4A9LA 5I7XA 4BW4A 5HQ5A 4UIUA 3S92A 4QSQA 4RVRA 3D7CA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EPBA 4NR9A 5A81A 4XUBA 5LJ0A 1JSPB 5L8TA 5FBXA 5EWHA 2E7OA 5FFWA 5KTXA 4YYKA 2DATA 4ALHA 4QEVA 5DKHA 4WHUA 4KCXA 4LYSA 4LRGA 5EV9A 5FE1A 4Y03A 5ENHA 4PCEA 1ZS5A 2RS9B 5EI4A 4O7FA 4A9IA 5BT3A 4NRCA 3U5LA 4IOOA 4NXJA 4MENA 4NRAA 2R0YA 4HBWA 3RCWA 4PKLA 3UV4A 5F61A 4N4IA 4HXRA 5J0DA 5FG4A 3U5OA 3O36A 4YYNA 2WP2A 4YYGA 4TYLA 4UYFB 5FG6A 5FE7A 4NYXA 4NUDA 4XY8A 2N9GA 5DYAA 5I40A 3Q2FA 2F6NA 4TS8A 3O37A 5FE0A 5FFYA 2OSSA 4CLBA 5FB1A 5FE5A 4A9EA 2MJVB 5E3DA 5EPRA 4UIVA 4A9JA 5F5ZA 4ALGA 5E9LA 5HRVA 4YYDA 5AD3A 5ETDA 5F1HA 4NR5A 5E0RA 5LKXA 3MQMA 5FB0A 4O78A 5II1A 2RNXA 5CQ8A 1E6IA 4UIZA 4YY4A 4Z1SA 5CQAA 5DKDA 5HQ7A 5IIDA 5KO4A 5A5SA 5BT5A 5LVQA 4YYIA 3U5JA 5A5QA 5AMEA 4YABA 2DWWA 4NQNA 5HELA 4IR5A 5FE3A 1WUGA 3O35A 4LYIA 4GPJA 3SVFA 5ENBA 5F36A 4KV4A 2YEMA 4CUQA 5I1QA 5H85A 5CUDA 4NR7A 2F6JA 4TTEA 4QYDA 3LQHA 5IBNA 4YYHA 4J3IA 5HQ6A 2RNWA 4YY6A 4YYJA 4AKHA 3LQJA 3U5KA 4HBXA 3U5MA 2YEKA 5DFBA 4O71A 5DFCA 4C66A 5COIA 5HJCA 4AKNA 5EQ1A 5E9YA 4LZ2A 5CFWA 5EVAA 3GG3A 4PTBA 5JI8A 5FDZA 5H1UA 5C87A 5C85A 5DLXA 4BW1A 5IGLA 3D1BA 4ZC9A 4CUTA 5CPEA 4HXMA 5HFQA 1N72A 2L84A 3Q2EA 5CUEA 4HXNA 5IG6A 2YDWA 2YYNA 4UITA 4QR3A 5F25A 4Q0OA 5KTUA 1F68A 5EP7A 4BW2A 5CU8A 4HXPA 4Q0NA 4PCIA 5L96A 4Z93A 5CGPA 5EK9A 5HEMA 5CUGA 5HM0A 2DVQA 5C8GA 5EWWA 4HXSA 4UYEA 3G0JA 4O77A 4UYGA 2NXBA 2I8NA 5L98A 4UYHA 4CFKA 3NXBA 4YBSA 4X2IA 4NUEA 5D3PA 4CUSA 5LVRA 4PS5A 5LJ2A 4OGJA 3O33A 4Z6IA 5KU3A 4Z1QA 3P5OA 4UIXA 5E9VA 4MR4A 4QSRA 4QSTA 5HRXA 4LZRA 4NUCA 2RFJA 4TZ8A 5CUBA 5EGUA 5E73A 5D25A 4OGIA 5DLZA 5HRWA 5KTWA 4E96A 4O75A 4F3IA 5ENJA 5FE9A 4FLPA 5G4SA 2KTBB 5D3SA 5ACYA 5F62A 4XUAA 5DKCA 5D7XA 5FH6A 5D0CA 4YYMA 3JVLA 4HXLA 5D3RA 5H1VA 5FE2A 4QSWA 5CTLA 2RI7A 5JWMA 4N4HA 5FFVA 5II2A 3HMEA 1WUMA 4O7AA 4BHWA 4O7EA 4QNSA 4HBYA 2L85A 5I29A 4AI6A 2RO1A 4CL9A 5D3LA 5ENCA 3P1FA 3U5NA 5LJ1A 1PUOA 4HXKA 4HBVA 5EPSA 2OUOA 4QBMA 5DW2A 5F1LA 3P1EA 3MULA 4TQNA 5I86A 3LQIA 4UIWA 4YAXA 5CQ3A 3IU6A 2E7NA 5EA1A 2I7KA 5CUAA 3QZSA 5CQ5A 3S91A 5HENA 5A85A 5AMFA 5DYXA 5FE6A 3UV5A 5HFRA 1X0JA 3D1DA 5E74A 5I80A 4TT4A 4QC1A 5KHMA 4TU6A 5A5NA 5HCLA 5DX4A 5A83A 1ZKRA 4J0RA 5CQ7A 5EM3A 5CRZA 3UW9A 4A9HA 2H60A 4OUFA 5F63A 4MEPA 2YELA 5CRMA 5LKUA 4QSUA 2OO1A 3JVJA 1EQFA 4XY9A 4BJXA 5ETBA 4J0SA 5E9KA 3HMHA 5D3NA 4LDFA 4QY4A 5EISA 4YC9A 5K29A 4N3WA 4O72A 4UYFA 3HMFA 4QR5A 2E3KA 4NRBA 4KV1A 5CUCA 3UVXA 5IGNA 5EWCA 4IOQA 3ZYUA 5AD2A 3IU5A 4QR4A 4O7CA 5ENGA 4LC2A 3I3JA 5I7YA 4NR8A 5A82A 2YW5A 4IR3A 5L8UA 5EICA 4PY6A 4TU4A 4CURA 5ENEA 4IR6A 5LUUA 5HLSA 5DW1A 4YBTA 5F3AA 5LKTA 4LR6A 4NYVA 5C7NA 3JVMA 4YATA 4C67A 4YBMA 4QC3A 5E3GA 4TZ2A 4NR4A 5EWDA 5E9IA 5IGKA 4NQMA 2YQDA 4TT2A 4UYDA 5I88A 5F60A 3TLPA 5A5RA 3P1CA 3LXJA 5I89A 3UVYA 4QSXA 5FH7A 5L97A 4A9OA 5D24A 5FH8A 3QZVA 4A9MA 4QEUA 2DVVA 4QSPA 4QUUA 5TB6A 2R0SA 3QZTA 5A5PA 2RNYA 1JM4B 3MUKA 5ENFA 4WIVA 4N4GA 3P1DA 5D3TA 4Z6HA 4ZW1A 3SVGA 2FSAA 5A7CA 5C89A 3MB4A 3AQAA 4NYWA 4O70A 2WP1A 5DFDA 4J1PA 5CZGA 5CS8A 4MEOA 3MXFA 3SVHA 5A5OA 2L5EA 3O34A 2G4AA 4QB3A 4NS5A 4IR4A 4DONA 4IORA 5C4QA 5TCMA 2DVRA 4O7BA 5D3JA 4XYAA 5F2PA 5E9MA 5CQTA 5BT4A 4LYWA 4AKIA 4ZQLA 4MEQA 4NR6A 4YK0A 4MR5A 5FE8A 3K2JA 5FE4A 5DY7A 5EWVA 4AKGA 4N4FA 5DYUA 3UV2A 3LJWA 5D3HA 5FG5A 5ENIA 5H1TA 3AADA 4A9NA 3U5PA 5L99A 2D9EA 5CY9A 3DWYA 4QSSA 3G0LA 5DYCA 4BW3A 3JVKA 5EU1A 3VKHA 5E7DA 2DVSA 2R10A 3FKMX 3ONIA 4CUPA 2GRCA 3UVDA 4YH3A 5CQ4A 3UVWA 4YH4A 2D82A 4QYLA 5LKZA 4MR6A 5CP5A 4QZSA 4QUTA 2R0VA 4YADA 4LZSA 5CQ6A 4O74A 3DAIA 4WHWA 4O76A 5G4RA 4A9KA 2LSPB 4QEWA 4HXOA 5I83A 4CFLA 4CUUA 4MR3A 5D26A 5IGMA 4QSVA 4A9FA 5DBMA 3MB3A 4UIYA 4TT6A 3ERRA 5I7XA 4A9LA 4BW4A 3VKGA 2EJNA 5HQ5A 4UIUA 3S92A 4QSQA 4RVRA 3D7CA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EPB A;  4NR9 A;  5A81 A;  4XUB A;  5LJ0 A;  1JSP B;  5L8T A;  5FBX A;  5EWH A;  2E7O A;  5FFW A;  5KTX A;  4YYK A;  2DAT A;  4ALH A;  4QEV A;  5DKH A;  4WHU A;  4KCX A;  4LYS A;  4LRG A;  5EV9 A;  5FE1 A;  4Y03 A;  5ENH A;  4PCE A;  1ZS5 A;  2RS9 B;  5EI4 A;  4O7F A;  4A9I A;  5BT3 A;  4NRC A;  3U5L A;  4IOO A;  4NXJ A;  4MEN A;  4NRA A;  2R0Y A;  4HBW A;  3RCW A;  4PKL A;  3UV4 A;  5F61 A;  4N4I A;  4HXR A;  5J0D A;  5FG4 A;  3U5O A;  3O36 A;  4YYN A;  2WP2 A;  4YYG A;  4TYL A;  4UYF B;  5FG6 A;  5FE7 A;  4NYX A;  4NUD A;  4XY8 A;  2N9G A;  5DYA A;  5I40 A;  3Q2F A;  2F6N A;  4TS8 A;  3O37 A;  5FE0 A;  5FFY A;  2OSS A;  4CLB A;  5FB1 A;  5FE5 A;  4A9E A;  2MJV B;  5E3D A;  5EPR A;  4UIV A;  4A9J A;  5F5Z A;  4ALG A;  5E9L A;  5HRV A;  4YYD A;  5AD3 A;  5ETD A;  5F1H A;  4NR5 A;  5E0R A;  5LKX A;  3MQM A;  5FB0 A;  4O78 A;  5II1 A;  2RNX A;  5CQ8 A;  1E6I A;  4UIZ A;  4YY4 A;  4Z1S A;  5CQA A;  5DKD A;  5HQ7 A;  5IID A;  5KO4 A;  5A5S A;  5BT5 A;  5LVQ A;  4YYI A;  3U5J A;  5A5Q A;  5AME A; 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