4NRBA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with compound-1 n01197
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nrbA00
4O71A 5C89A 4LR6A 5CQ8A 3FKMX 4FLPA 5CQ3A 5JI8A 5D26A 2F6JA 5D3HA 2DATA 2YQDA 4PS5A 4ALGA 4MEOA 5D3JA 5DLZA 4MR6A 5D3LA 2R10A 4NQNA 3SVFA 5EP7A 3U5MA 4QY4A 4IORA 5CU8A 5HFQA 3IU6A 5FG4A 4CL9A 3O33A 5IG6A 4NR6A 4O7EA 3RCWA 5DW1A 5A82A 4O76A 3TLPA 4MENA 4O77A 5LJ1A 4HXKA 4NYVA 5DY7A 5ENGA 5IGMA 5E0RA 4NXJA 3O36A 5KTUA 5LUUA 5CUBA 5E9MA 2F6NA 4N4HA 5LJ0A 3P1DA 5IGKA 5D3TA 3MUKA 4TYLA 4PCIA 3S91A 5DYUA 5HQ6A 5EVAA 5F3AA 5KTWA 4BW3A 4YYMA 5HM0A 4QEVA 4YBSA 4NS5A 5CTLA 4C66A 3HMFA 4QNSA 5EPBA 5A7CA 4A9HA 4HXLA 4LYIA 4NYWA 4QSWA 5E73A 4QYDA 5II2A 4UYGA 5IGNA 5AMFA 4OUFA 4A9FA 5A5RA 2WP2A 2RI7A 4NR4A 5EQ1A 2R0SA 4QZSA 5EPRA 4YYJA 5CY9A 5G4SA 4ZC9A 5KHMA 3UV5A 5H1TA 3JVLA 2I8NA 4KV1A 5FE5A 5F2PA 2L84A 5H1UA 5EA1A 4QR5A 5I1QA 3Q2EA 5A83A 5EWWA 2R0YA 5CUAA 4UIYA 4CFKA 4XUAA 4A9IA 5D3RA 4YBTA 5DKCA 2E3KA 5CUCA 2H60A 5D3SA 1ZS5A 1WUGA 2NXBA 5LVRA 3MXFA 4IR3A 4F3IA 5DKHA 5E9VA 1JSPB 3SVGA 4CUTA 4YY4A 4QSQA 2D9EA 5CQTA 2OUOA 4NR8A 4CUQA 3NXBA 2LSPB 5LKZA 5LVQA 4A9OA 3P1EA 2L5EA 5L98A 1EQFA 4A9EA 4QSSA 5I29A 4IR5A 4J0RA 2DVQA 4LDFA 4N4GA 5A85A 2RO1A 2D82A 3I3JA 4YYIA 4Z1QA 5KU3A 5FE8A 5EM3A 3G0JA 4NRBA 4YH3A 4YATA 5ENCA 4QR4A 4QEUA 4PY6A 4O7AA 5CRMA 5A5QA 3U5PA 5DYAA 3D7CA 4TZ8A 5I7XA 2YELA 4CLBA 5BT3A 4C67A 3O35A 5HRVA 3MB4A 2RNWA 4YYNA 4YK0A 4HXSA 4WHUA 4NUCA 5CQ7A 5HCLA 4XYAA 5TCMA 2L85A 5HENA 4QUTA 4A9KA 5DKDA 5FB0A 5II1A 4GPJA 3JVJA 3GG3A 4J3IA 5LKTA 5A5OA 3MULA 4HBVA 4BJXA 4CFLA 4A9NA 3JVMA 5F36A 3U5JA 5EWHA 4QSUA 2DVRA 3O34A 3QZTA 4UYEA 5DLXA 2DWWA 4QC3A 5EI4A 4YYDA 2YEMA 3U5LA 5HRXA 4N4IA 5CUDA 4UYHA 4HXRA 5L8UA 3JVKA 4TZ2A 4Z93A 5HLSA 2FSAA 5C4QA 4UYFA 5DFDA 3QZVA 3MQMA 4HBYA 4J1PA 4O7BA 5D24A 5ACYA 5LKXA 4UIVA 3AADA 5EGUA 4YH4A 3MB3A 3UVXA 3LQIA 4YADA 5DYXA 4O70A 5FE1A 2G4AA 5FE9A 3LQHA 4XUBA 5IBNA 5K29A 4IOQA 4WIVA 3P1FA 5L8TA 4QSVA 4OGJA 2DKWA 2WP1A 4YYGA 4X2IA 4TQNA 4O78A 2YYNA 4LYSA 5I40A 4O7FA 4BW1A 4TT2A 4PKLA 2DVVA 5EWCA 4LZSA 5I89A 5D0CA 5ENHA 5HEMA 4CURA 4N3WA 5G4RA 5J0DA 5F1LA 5JWMA 5AD3A 4YBMA 3UV4A 4MEQA 5C7NA 5CRZA 5DX4A 4YY6A 5AD2A 5HQ7A 5HRWA 4TU4A 5FE3A 1N72A 4A9JA 4QC1A 5BT5A 4HXOA 3HMHA 5DW2A 4UYFB 4HXNA 4MR4A 4NUEA 4YC9A 5HJCA 4BW2A 5F62A 2R0VA 4HXMA 5I7YA 5CQ4A 5COIA 5EISA 5FE2A 5L97A 4UIUA 5I83A 2YEKA 4QB3A 4N4FA 5H1VA 5E9YA 3UVWA 4NYXA 2GRCA 5A5PA 4IOOA 3K2JA 4RVRA 3ONIA 4HBXA 4LZ2A 5FB1A 5E3GA 1E6IA 4LRGA 3G0LA 4TU6A 3LJWA 4MEPA 4YABA 2I7KA 1JM4B 5ETDA 5FE0A 5C87A 4QSTA 4QSPA 4UIWA 5ENFA 4QEWA 5C8GA 2OO1A 5F1HA 3S92A 5A5NA 5E9IA 3U5OA 4Y03A 3UVDA 5FDZA 4BW4A 5EPSA 2N9GA 2MJVB 5E9KA 2E7NA 1WUMA 5CZGA 4A9LA 4LYWA 5E3DA 4KV4A 4NR7A 5CQ6A 4NRCA 5L96A 4ALHA 4YAXA 5D3PA 3O37A 5EWDA 5F61A 4Z1SA 5FFWA 5FE4A 5DBMA 4OGIA 4QSRA 5HFRA 5AMEA 5CUGA 4IR4A 5LKUA 5DFCA 4PCEA 4CUUA 5A81A 5IIDA 4O74A 4XY8A 5FBXA 3DWYA 4MR3A 5FE6A 5HELA 4PTBA 5C85A 5L99A 5IGLA 4UIZA 5FG6A 5ENEA 4QSXA 4O7CA 3LQJA 4IR6A 4UIXA 5ETBA 4LC2A 3P5OA 3P1CA 3HMEA 5LJ2A 4Q0NA 5CQAA 3Q2FA 3SVHA 2RNYA 5HQ5A 4QUUA 3QZSA 5D25A 4YYHA 4ZQLA 5ENBA 4UYDA 3ZYUA 5F63A 4NQMA 5ENIA 4WHWA 4MR5A 5F25A 4NR9A 4QR3A 5EK9A 5F60A 5EICA 4TT6A 2RFJA 3U5KA 4XY9A 4NR5A 4Z6IA 3IU5A 4TS8A 4QYLA 5FH8A 5DFBA 3UW9A 5I86A 5D3NA 5BT4A 2OSSA 3DAIA 4KCXA 4HBWA 5CUEA 5EWVA 5FH6A 1X0JA 2KTBB 2E7OA 2DVSA 5CQ5A 3LXJA 5EV9A 4HXPA 5EU1A 5A5SA 5I88A 5E7DA 5FFYA 4DONA 5ENJA 3U5NA 3AQAA 4NRAA 4UITA 4J0SA 4Z6HA 4Q0OA 5CP5A 4TT4A 5FFVA 5FH7A 5DYCA 4NUDA 2YDWA 4CUPA 3UV2A 5E74A 4QBMA 1F68A 5D7XA 5FE7A 4YYKA 5KO4A 5KTXA 4O75A 4CUSA 2RS9B 3UVYA 4ZW1A 5E9LA 4A9MA 4LZRA 4O72A 5CPEA 5I80A 4E96A 5F5ZA 2RNXA 5TB6A 5CGPA 4TTEA 2YW5A 4BHWA 5FG5A 5H85A 5CFWA 5CS8A 4AKNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O71A 5C89A 4LR6A 5CQ8A 3FKMX 4FLPA 5CQ3A 5JI8A 5D26A 2F6JA 5D3HA 2DATA 2YQDA 4PS5A 4ALGA 4MEOA 5D3JA 5DLZA 4MR6A 5D3LA 2R10A 4NQNA 3SVFA 5EP7A 3U5MA 4QY4A 4IORA 5CU8A 5HFQA 3IU6A 5FG4A 4CL9A 3ERRA 3O33A 5IG6A 4NR6A 4O7EA 3RCWA 5DW1A 5A82A 4O76A 3TLPA 4MENA 4O77A 5LJ1A 4HXKA 4NYVA 5DY7A 5ENGA 5IGMA 5E0RA 4NXJA 3O36A 5KTUA 5LUUA 5CUBA 5E9MA 2F6NA 4N4HA 5LJ0A 3P1DA 5IGKA 5D3TA 3MUKA 4TYLA 4PCIA 3S91A 3D1DA 5DYUA 5HQ6A 5EVAA 5F3AA 5KTWA 4BW3A 4YYMA 5HM0A 4QEVA 4YBSA 4NS5A 5CTLA 4C66A 3HMFA 4QNSA 5EPBA 5A7CA 4A9HA 4HXLA 4LYIA 4NYWA 4QSWA 5E73A 4QYDA 5II2A 4UYGA 5IGNA 5AMFA 4OUFA 4A9FA 5A5RA 2WP2A 2RI7A 4NR4A 5EQ1A 2R0SA 4QZSA 5EPRA 4YYJA 5CY9A 5G4SA 4ZC9A 5KHMA 3UV5A 5H1TA 2I8NA 3JVLA 4KV1A 5FE5A 5F2PA 2L84A 5H1UA 5EA1A 4QR5A 5I1QA 3Q2EA 4AKHA 5A83A 5EWWA 2R0YA 5CUAA 4UIYA 4CFKA 4XUAA 4A9IA 5D3RA 4YBTA 5DKCA 2E3KA 5CUCA 2H60A 5D3SA 1ZS5A 1WUGA 2NXBA 5LVRA 3MXFA 4IR3A 4F3IA 5DKHA 5E9VA 1JSPB 3SVGA 4CUTA 4YY4A 4QSQA 2D9EA 5CQTA 2OUOA 4NR8A 4CUQA 3NXBA 2LSPB 5LKZA 5LVQA 4A9OA 3P1EA 2L5EA 3VKHA 5L98A 1EQFA 4A9EA 4QSSA 5I29A 4IR5A 4J0RA 2DVQA 4LDFA 4N4GA 5A85A 2RO1A 2D82A 3I3JA 4YYIA 4Z1QA 5KU3A 5FE8A 5EM3A 3G0JA 4NRBA 4YH3A 4YATA 5ENCA 4QR4A 4QEUA 4PY6A 4O7AA 5CRMA 5A5QA 3U5PA 5DYAA 3D7CA 4TZ8A 5I7XA 2YELA 4CLBA 5BT3A 4C67A 3O35A 5HRVA 3MB4A 2RNWA 4YYNA 4YK0A 4HXSA 4WHUA 4NUCA 5CQ7A 4AKIA 5HCLA 4XYAA 5TCMA 2L85A 5HENA 4QUTA 4A9KA 5DKDA 5FB0A 5II1A 4GPJA 3JVJA 3GG3A 4J3IA 5LKTA 5A5OA 3MULA 4HBVA 4BJXA 4CFLA 4A9NA 3JVMA 5F36A 3U5JA 5EWHA 4QSUA 2DVRA 3O34A 3QZTA 4UYEA 5DLXA 2DWWA 4QC3A 5EI4A 4YYDA 2YEMA 3U5LA 5HRXA 4N4IA 5CUDA 4UYHA 4HXRA 5L8UA 3JVKA 3VKGA 4TZ2A 4Z93A 5HLSA 2FSAA 5C4QA 4UYFA 5DFDA 3QZVA 3MQMA 4HBYA 4J1PA 4O7BA 5D24A 5ACYA 5LKXA 4UIVA 3AADA 3D1BA 5EGUA 4YH4A 3MB3A 3UVXA 3LQIA 4YADA 5DYXA 4O70A 5FE1A 2G4AA 5FE9A 3LQHA 4XUBA 5IBNA 5K29A 4IOQA 4WIVA 3P1FA 5L8TA 4QSVA 4OGJA 2DKWA 2WP1A 4YYGA 4X2IA 4TQNA 4O78A 2YYNA 4LYSA 5I40A 4O7FA 4BW1A 4TT2A 4PKLA 2DVVA 4AKGA 5EWCA 4AI6A 4LZSA 5I89A 5D0CA 5ENHA 5HEMA 4CURA 4N3WA 5G4RA 5J0DA 5F1LA 5JWMA 5AD3A 4YBMA 3UV4A 4MEQA 5C7NA 5CRZA 5DX4A 4YY6A 5AD2A 5HQ7A 5HRWA 4TU4A 5FE3A 1N72A 4A9JA 4QC1A 5BT5A 4HXOA 3HMHA 5DW2A 4UYFB 4HXNA 4MR4A 4NUEA 4YC9A 5HJCA 4BW2A 5F62A 2R0VA 4HXMA 5I7YA 5CQ4A 2EJNA 5COIA 5EISA 5FE2A 5L97A 4UIUA 5I83A 2YEKA 4QB3A 4N4FA 5H1VA 5E9YA 3UVWA 4NYXA 2GRCA 5A5PA 4IOOA 3K2JA 4RVRA 3ONIA 4HBXA 4LZ2A 5FB1A 5E3GA 1E6IA 4LRGA 3G0LA 4TU6A 3LJWA 4MEPA 4YABA 2I7KA 1JM4B 5ETDA 5FE0A 5C87A 4QSTA 4QSPA 4UIWA 5ENFA 4QEWA 5C8GA 2OO1A 5F1HA 3S92A 5A5NA 5E9IA 3U5OA 4Y03A 3UVDA 5FDZA 4BW4A 5EPSA 2N9GA 2MJVB 5E9KA 2E7NA 1WUMA 5CZGA 4A9LA 4LYWA 5E3DA 4KV4A 4NR7A 5CQ6A 4NRCA 5L96A 4ALHA 4YAXA 5D3PA 3O37A 5EWDA 5F61A 4Z1SA 5FFWA 5FE4A 5DBMA 4OGIA 4QSRA 5HFRA 5AMEA 5CUGA 4IR4A 5LKUA 5DFCA 4PCEA 4CUUA 5A81A 5IIDA 4O74A 4XY8A 5FBXA 3DWYA 4MR3A 5FE6A 5HELA 4PTBA 5C85A 5L99A 5IGLA 4UIZA 5FG6A 5ENEA 4QSXA 4O7CA 3LQJA 4IR6A 4UIXA 5ETBA 4LC2A 3P5OA 3P1CA 3HMEA 5LJ2A 4Q0NA 5CQAA 3Q2FA 3SVHA 2RNYA 5HQ5A 4QUUA 3QZSA 5D25A 4YYHA 4ZQLA 5ENBA 4UYDA 3ZYUA 5F63A 4NQMA 5ENIA 4WHWA 4MR5A 5F25A 4NR9A 4QR3A 5EK9A 5F60A 5EICA 4TT6A 2RFJA 3U5KA 4XY9A 4NR5A 4Z6IA 3IU5A 4TS8A 4QYLA 5FH8A 5DFBA 3UW9A 5I86A 5D3NA 5BT4A 2OSSA 3DAIA 4KCXA 4HBWA 5CUEA 5EWVA 5FH6A 1X0JA 2KTBB 2E7OA 2DVSA 5CQ5A 3LXJA 1PUOA 5EV9A 4HXPA 5EU1A 5A5SA 5I88A 5E7DA 5FFYA 4DONA 5ENJA 3U5NA 3AQAA 4NRAA 4UITA 4J0SA 4Z6HA 4Q0OA 5CP5A 4TT4A 5FFVA 5FH7A 5DYCA 4NUDA 2YDWA 4CUPA 3UV2A 5E74A 4QBMA 1ZKRA 5D7XA 5FE7A 1F68A 4YYKA 5KO4A 5KTXA 4O75A 4CUSA 2RS9B 3UVYA 4ZW1A 5E9LA 4A9MA 4LZRA 4O72A 5CPEA 5I80A 4E96A 5F5ZA 2RNXA 5TB6A 5CGPA 4TTEA 2YW5A 4BHWA 5FG5A 5H85A 5CFWA 5CS8A 4AKNA
chains in the Genus database with same CATH topology
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